Submitted by Gizele Lima (gizele.lima@inpa.gov.br) on 2017-11-06T13:49:36Z No. of bitstreams: 2 Versão Final da dissertaçãoRaize.pdf: 1140529 bytes, checksum: 5107cfb58cf08154fdb1ba06343700e6 (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) / Made available in DSpace on 2017-11-06T13:49:36Z (GMT). No. of bitstreams: 2 Versão Final da dissertaçãoRaize.pdf: 1140529 bytes, checksum: 5107cfb58cf08154fdb1ba06343700e6 (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Previous issue date: 2017-03-31 / Conselho Nacional de Pesquisa e Desenvolvimento Científico e Tecnológico - CNPq / The lake Tupé, which is located near Manaus, in the Amazonas state, is a black-water lake of great richness of phytoplanktonic and zooplanktonic species. The zooplanktonic organisms may belong to different size categories: microplankton, mesoplankton, and macroplankton; but the phytoplanktonic organisms may belong to picoplankton, nanoplankton, and microplankton. Because of the size difference, the zooplanktonic organisms might be feeding on phytoplanktonic organisms of different sizes. The goal of this research was to evaluate the importance of phytoplankton different fractions as food for microcrustaceans and planktonic rotifers in the low waters period (2015) and rising waters (2016) at the lake Tupé, Manaus-AM. The samples were conducted in two months at the low Waters period and two months in the rising Waters period at the lake Tupé (Reserve of Sustainable Development of Tupé). As sampling criteria, the estimated photic zone extension was used with the assistance of transparency measures by the Secchi disc. A PVC tube of 50 mm in diameter and 3 m in length with a water retention valve which was inserted in this extension and its content was placed in a bucket, homogenized and 2 L samples were taken. At the laboratory, the samples were fractionated in order to obtain the picoplankton, nanoplankton, and microplankton and later the biomass of each fraction was measured through the Chlorophyl-a. An experiment was placed at lake Tupé during 24 hours in the low Waters period and rising water period. The zooplanktonic and phytoplanktonic samples were collected with a PVC tube of 4 m in length, later they were taken to the laboratory to be analyzed. The zooplanktonic organisms. The zooplanktonic organisms were counted and measured. The phytoplankton samples were fractionated in order to obtain the differences in size fraction, and later, the biomass of each fraction was measured. The total low Waters period biomass was 27,03 μg/L, and the total rising Waters biomass was 36,59 μg ̸ L. There were no statistically significant differences between the biomass of the picoplankton, nanoplankton and microplankton in the two periods. The zooplanktonic organisms did not exercised selective predation pressure on just one of the phytoplankton size fractions. Instead, they exercised predation pressure on phytoplankton three size fractions. / O lago Tupé, localizado próximo a Manaus no Amazonas, é um lago de água preta de elevada riqueza de espécies fitoplanctônicas e zooplanctônicas. Os organismos do zooplâncton podem pertencer a diferentes categorias de tamanhos: microplâncton, mesoplâncton e macroplâncton; já os organismos fitoplanctônicos podem pertencer ao picoplâncton, nanoplâncton e microplâncton. Por terem tamanhos diferentes os organismos zooplanctônicos podem estar se alimentando de tamanhos diferentes de organismos fitoplanctônicos. O objetivo dessa pesquisa foi avaliar a importância de diferentes frações do fitoplâncton como alimento para microcrustáceos e rotíferos planctônicos nos períodos de seca (2015) e enchente (2016) no lago Tupé, Manaus-AM. As coletas foram realizadas em dois meses da seca e dois meses da enchente no lago Tupé (RDS do tupé). Como critério de amostragem utilizou-se a extensão da zona eufótica estimada com auxílio de medidas de transparência por disco de Secchi. Um tubo de PVC de 50 mm de diâmetro e 3 m de comprimento com uma válvula para retenção da água foi inserido nessa extensão e seu conteúdo foi colocado em um balde, homogeneizada e amostras de 2 L foram retiradas. Em laboratório, as amostras foram fracionadas para se obter o pico, nano e microfitoplâncton e depois a biomassa de cada fração foi medida através da clorofila-a. Um experimento foi colocado durante 24 horas no período de seca e enchente no lago Tupé. Amostras de zooplâncton e fitoplâncton foram coletadas com um tubo de PVC de 4 m de comprimento, depois foram levadas ao laboratório para serem analisadas. Os organismos zooplanctônicos foram contados e medidos. A amostra de fitoplâncton foi fracionada para se ter as diferentes frações de tamanho e, depois foi medida a biomassa de cada fração. A biomassa total da seca foi de 27,03 μg/L e a biomassa total da enchente foi de 36,59 μg ̸ L. Não houve diferença estatisticamente significativa entre a biomassa do pico nano e microfitoplâncton nos dois períodos. Na seca e na enchente houve diferença estatisticamente significativa entre microplâncton e mesoplâncton da amostra inicial e também da amostra final do experimento. A maior densidade dos organismos foi encontrada no experimento do período de seca. Os organismos zooplanctônicos não exerceram pressão de predação seletiva sobre apenas uma das frações de tamanho do fitoplâncton, exerceram pressão de predação sobre as três frações de tamanho do fitoplâncton. Estudos que levem em conta a pressão de predação sofrida pelos organismos zooplanctônicos e destes sobre organismos fitoplanctônicos são necessários para entender se os controles na cadeia trófica são top down ou bottom up.

A filosofia de Arthur Schopenhauer se caracteriza por um esforço contínuo de reflexão para decifrar um antigo enigma, qual seja, a analogia entre o homem e o universo ou entre o micro e o macrocosmo. Schopenhauer postulou o primado da vontade cega sobre o intelecto como o seu dogma fundamental, isto é, como a chave interpretativa que permite solucionar o problema em questão. O filósofo desenvolveu uma monumental metafísica, qualificada por ele de imanente, em cujas bases estão a sua complexa concepção de vontade e uma articulada compreensão da analogia como método de reflexão filosófica. Apesar de tal esforço, o próprio Schopenhauer explicitamente reconheceu que uma solução absoluta e exaustiva do problema seria uma doutrina da onisciência, algo realmente impossível para a razão humana, já que não há entendimento pleno e absoluto da essência e origem do mundo. Assim, o horizonte da experiência humana permanecerá sempre na mais profunda e completa obscuridade. A filosofia de Schopenhauer apresenta, portanto, uma tensão originária, a saber, a consciência de que conhecer o ser absoluto é tão impossível quanto é incansável a busca pela compreensão metafísica do mundo. O texto que se segue consiste, portanto, no esforço para resgatar algumas fontes históricas, observar o sentido e as referências originárias dos conceitos, para interpretar, no interior da dinâmica teórica da obra de Schopenhauer, o significado propriamente filosófico da analogia da vontade. A hipótese de orientação consistiu em supor que a obra do autor se caracteriza por uma peculiar articulação da reflexão metafísica com os conhecimentos produzidos pelas ciências biológicas, sobretudo, a partir do estudo da fisiologia dos impulsos orgânicos vitais e inconscientes, para, desse modo, elaborar uma imagem conceitual do mundo compreendido como um macroantropo, cuja significação moral mais profunda se traduz no sentimento universal do sofrimento e na negação da vontade de viver. Neste sentido, a vontade, segundo o próprio autor, constitui o último marco-limite do conhecimento possível e o mundo nada mais é do que o multifacetado reflexo físico de um mal metafísico que em si é imanente, uno e indivisível em cada ser. Foi necessária uma reconstrução introdutória do problema da analogia entre o micro e o macrocosmo, bem como a busca pelo significado originário do conceito de vontade que acompanha o seu desenvolvimento histórico para compreender a filosofia de Schopenhauer como a solução peculiar de um problema que lhe é próprio. O texto apresenta os valores que a analogia assume em cada etapa do pensamento schopenhaueriano, destacando uma tensão constitutiva entre as diferentes funções que ela desempenha. A interpretação que aqui se expõe, consistiu no esforço para compreender a pertinência genuinamente filosófica da analogia da vontade em alguns aspectos de sua complexidade intrínseca, incluindo as suas limitações e fragilidades sem, no entanto, ignorar o seu poder de alcance, a coerência própria e a sua singular capacidade explicativa. / The philosophy of Arthur Schopenhauer is characterized by the constant effort of reflection to decipher an old enigma, which is the analogy between the man and the universe or the micro and macrocosm. Schopenhauer postulated that the primacy of will blinds the intellect as its fundamental dogma, that is, as an interpretative key that enables to solve the problem focused. The philosopher developed a monumental metaphysics, qualified as immanent by him, whose bases are his complex concept of will and an articulated comprehension of analogy as a philosophical reflection method. Despite such effort, Schopenhauer himself has explicitly recognized that an absolute and exhaustive solution of the problem would be an omniscience doctrine, something really impossible to human reason, as there is no full and absolute understanding of the world\'s essence and origin. This way, the horizon of human experience will always remain in the most deep and complete obscurity. The philosophy of Schopenhauer presents, though, a primary tension, namely: the consciousness of knowing the absolute individual is as impossible as the tireless search for the world\'s metaphysics comprehension. Therefore, the following text consists of the effort to rescue some historical sources, observe the sense and the original references of concepts, to interpret, from the inside of the theoretical dynamics of Schopenhauer\'s work, the proper philosophical meaning of the analogy of will. The guidance hypothesis constitutes of supposing that the author\'s work is characterized by a particular articulation of metaphysical reflection with the concepts produced by the biological sciences, mainly from the physiology study of vital and organic impulses, in order to create a conceptual image of the world seen as a macranthropos, whose most profound moral significance is translated to the universal suffering and the denial of the Will to life. In this sense, the will, according to the author, constitutes the last boundary of possible knowledge and the world is nothing more than a multifaceted physical reflection of a metaphysical evil which is immanent in itself, unified and inseparable to each individual. It was necessary an introductory reconstitution of the analogy problem between micro and macrocosm, as well as the search for the original meaning of the concept of will that follows its historical development to understand Schopenhauer\' philosophy as a peculiar solution to its own problem. The text presents the values assumed by the analogy in each step of schopenhauerian thought, highlighting the constitutive tension between the functions that it develops. This present interpretation constitutes of the effort to comprehend the genuinely philosophical pertinence of the analogy of will in some aspects of its intrinsic complexity, including its limitations and fragilities without ignoring its reach power, own coherence and singular explanatory capacity.

Submitted by Márcio Ropke (ropke13marcio@gmail.com) on 2017-06-12T14:24:50Z No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Potencial cariogênico do biofilme originado de inóculos de origem salivar e da.pdf: 1557184 bytes, checksum: 05a976493bb42a87794051f4a3bd098e (MD5) / Made available in DSpace on 2017-06-12T14:24:50Z (GMT). No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Potencial cariogênico do biofilme originado de inóculos de origem salivar e da.pdf: 1557184 bytes, checksum: 05a976493bb42a87794051f4a3bd098e (MD5) Previous issue date: 2015-02-19 / Conselho Nacional de Pesquisa e Desenvolvimento Científico e Tecnológico - CNPq / Modelos de biofilmes de microcosmos in vitro originados de inóculos salivares ou da placa dental demonstraram que o tipo de inóculo leva a diferentes microcosmos, o que poderia influenciar o potencial cariogênico dos biofilmes in vitro. Dessa forma, o presente estudo investigou o potencial cariogênico de biofilmes originados de diferentes tipos de inóculo (saliva e placa dental), de indivíduos cárie-ativos e livres de cárie, em um modelo de biofilme de microcosmos. Dez voluntários foram selecionados de cada condição de cárie (livres de cárie e cárie-ativos) para coleta pareada de placa dental e saliva. Biofilmes de microcosmos foram iniciados, a partir do inóculo, sobre espécimes de esmalte individualmente dispostos em placas de 24 poços. Os biofilmes cresceram em meio definido enriquecido com mucina (DMM), e foram submetidos a desafio cariogênico (DMM suplementado com sacarose à 1%) por 6h/dia. Após 10 dias, os biofilmes foram coletados para análise das variáveis de desfecho: perda mineral (porcentagem de mudança de dureza de superfície) e composição microbiológica dos biofilmes (contagem das UFCs – Unidades Formadoras de Colônias). Análise estatística foi realizada com testes T, Modelo de Análise Multivariada Linear e coeficiente de correlação de Pearson. A análise comparativa entre os dados microbiológicos de baseline para os tipos de inóculos (saliva e placa dental) não mostrou diferença estatística para os indivíduos livres de cárie, já para cárie-ativos foi estatisticamente significante somente para estreptococos mutans. Quanto à comparação entre indivíduos com diferentes condições de cárie, houve diferença estatisticamente significante para estreptococos mutans e microrganismos ácido-tolerantes nas amostras de placa dental, e para ácido-tolerantes na saliva. Após 10 dias de crescimento dos biofilmes, sob desafio cariogênico, os valores para microrganismos totais, lactobacilos, estreptococos mutans, ácido-tolerantes; e ainda, para a perda de dureza de superfície (%PDS), não foram estatisticamente significantes, considerando o tipo de inóculo e a condição de cárie. Correlação positiva foi encontrada para %PDS e contagem de UFCs das bactérias ácido-tolerantes (r=0.406) e lactobacilos (r=0.379). Dentro das limitações do presente estudo pode-se concluir que, independente de diferenças iniciais entre a origem e o tipo de inóculo, o potencial cariogênico de biofilmes formados sob condições idênticas neste modelo de biofilme de microcosmos é similar. / In vitro microcosm’s biofilm models originated from salivary or plaque inoculum demonstrated that the type of inoculum leads to different microcosms, which could influence the cariogenic potential of in vitro biofilms. Thus, the aim of this study was to investigated the cariogenic potential of biofilms originating from different types of inoculum (saliva and dental plaque) from individuals with active caries and caries-free, in a microcosm biofilm model. Ten volunteers were selected from each caries condition (caries-free and caries-active) for paired collecting of saliva and dental plaque. Biofilm microcosms were originated from the inoculum on enamel specimens arranged individually in 24-well plates. Biofilms grown in defined medium enriched with mucin (DMM), and were subjected to cariogenic challenge (DMM supplemented with sucrose at 1%) for 6h/day. After 10 days, the biofilms were collected for analysis of outcome variables: mineral loss (percentage of surface hardness change) and microbiological composition of biofilms (count of CFUs - Colony Forming Units). Statistical analysis was performed using t-test, Linear Multivariate Analysis Model and Pearson's correlation coefficient. The comparative analysis between microbiological baseline data for types of inoculum (saliva and dental plaque) was not significantly different for individuals free of caries, and for caries-active was statistically significant only for mutans streptococci. Comparison between individuals with different caries conditions, was statistically significant for mutans streptococci and acid-tolerant microorganisms in dental plaque samples, and acid-tolerant in saliva. After 10 days of growth of biofilms under cariogenic challenge, the values for total microorganisms, lactobacilli, streptococci mutans, acid-tolerant; and also to the surface hardness change (% SHC), were not statistically significant, considering the type of inoculum and the caries condition. Positive correlation was found for % SHC and CFUs counts of acid-tolerant bacteria (r=0.406) and lactobacilli (r=0.379). Under the limits of this study, the cariogenic potential of biofilms, formed under identical conditions in vitro on this microcosm biofilm model is similar, regardless of initial differences found between the source and type of inoculum.

Submitted by Márcio Ropke (ropke13marcio@gmail.com) on 2017-06-19T11:58:50Z No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Estabelecimento e validação de um modelo de biofilme complexo em um.pdf: 3065681 bytes, checksum: c943a9b1e2156dc6df11892586317534 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-06-19T11:58:50Z (GMT). No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Estabelecimento e validação de um modelo de biofilme complexo em um.pdf: 3065681 bytes, checksum: c943a9b1e2156dc6df11892586317534 (MD5) Previous issue date: 2015-02-25 / Conselho Nacional de Pesquisa e Desenvolvimento Científico e Tecnológico - CNPq / O biofilme está diretamente relacionado a etiologia da doença cárie. Metodologias que permitem investigar as interações presentes no conjunto formado pelo tecido dental e biofilme cariogênico são essenciais para o avanço em pesquisa pré-clínica. O objetivo desse trabalho foi i) realizar uma revisão sistemática sobre modelos de biofilme para cárie dental avaliando seus aspectos metodológicos, risco de viés, reprodutibilidade e e validação dose-resposta à anticariogênicos ou antimicrobianos; ii) desenvolver um modelo complexo de biofilme de microcosmos, em um simulador multifuncional de cavidade oral (MOCS). Pubmed, Isi Web of Science e Scopus foram consultadas para inclusão de artigos em inglês de 1990 até 2015. Foram selecionados 381 artigos e 59 artigos foram incluídos para a revisão. Conclui-se que diversos são os modelos de biofilme disponíveis para pesquisa relacionada a cárie dentária, no entanto, a maioria deles carecem de experimentos de validação como dose-resposta e reprodutibilidade para cada protocolo proposto. Para o estudo in vitro, os biofilmes foram formados sobre discos de esmalte, tendo como inóculo saliva humana. Realizou-se 3 experimentos independentes em que os biofilmes foram crescidos por até 21 dias. O 1º e o 2º experimento relacionaram-se ao desenvolvimento do modelo [adequação do protocolos experimentais (PE) 1 e 2] e o 3º para validação dose-resposta à clorexidina (CLX) e avaliação da reprodutibilidade do modelo. Para PE1 utilizou-se regime intermitente de 10% sacarose (1,2 mL/min, 5 min, 5x/dia) em associação a fluxo contínuo de saliva artificial (DMM, 0,04 mL/min), e os biofilmes foram crescidos por até 14 dias. Para o PE2 utilizou-se DMM em fluxo contínuo (0,06 mL/min) e 5% sacarose (0,25 mL/min, 6 min, 3X/dia) e houve crescimento por até 21 dias. Nos tempos experimentais de 4, 7, 14 ou 21 dias, amostras microbiológicas e minerais foram coletadas (n=10) e as variáveis de resposta estudadas foram: porcentagem de perda de dureza superficial, perda de dureza integrada e contagem de unidades formadoras de colônias microbianas (UFC). Para o experimento 3, utilizou-se o PE2 e os biofilmes foram crescidos por 7 dias em associação a aplicação de 5ml de Clorexidina em diferentes concentrações: 0,012%, 0,03%, 0,06%, 0,12% (n=10) e solução salina como controle (2x/dia a cada 12 h, a partir de 24 h do inóculo). Para esse experimento as variáveis de resposta foram obtidas por porcentagem de perda mineral de superfície e por composição microbiológica do biofilme. Dados do controle foram comparados aos dados do PE2 para avaliação da reprodutibilidade. Ambos PE 1 e 2 desencadearam perda mineral em esmalte e aumento dos micro-organismos acidúricos e lactobacilos em 7 dias de experimento (p < 0,05). Existiu dose-resposta à perda mineral e a microorganismos totais e mutans, assim como correlação positiva e significativa entre os valores minerais e microbiológicos. Por permitir o crescimento de um biofilme cariogênico e por desencadear desmineralização do esmalte e dose-resposta a CLX, a MOCS parece ser um recurso laboratorial válido para pesquisas pré-clínicas relacionadas a cárie dentária. / Biofilm is directly related to dental caries etiology. Methodologies that allow investigating interactions between dental tissues and cariogenic biofilms are essential to pre-clinical research advancement. This study aimed to i) systematically review the literature on dental caries biofilm models and avaluate methodological parameters, bias risk, reproductibilitty and dose-response to anticariogenic or antimicrobial potential ii) develop and establish a complex biofilm model in a multifunctional oral cavity simulator (MOCS). Pubmed, Isi Web of Science and Scopus were searched to potential complete papers from 1990 to 2015. 381 papers were selected to systematic review and 59 papers were included in the sistematic review. It was concluded that despite bias risk found, several in vitro biofilm models are available for caries-related research. However most of complex and simplified models lacked of validation experiments such as dose-response trials and reproducibility for each established and proposed protocol. For the in vitro study, biofilms were formed on enamel bovine discs and human saliva was used as inoculum. Three independent experiments were carried out and biofilms were growth up to 21 days. Experiments 1 and 2 were related to the biofilm model establishment [experimental protocols (EP)] and the third evaluated dose-response to chlorehidine (CHX) and the model reprodutibilitty. EP1 used 10% sucrose in an intermittent pulse (1.2 mL/min, 5 min, 5 x/day) and continuous flow of artificial saliva (DMM, 0.04 mL/min). The biofilms were growth up to 14 days. EP2 used 5% sucrose (0.25 mL/min, 6 min, 3x/day) and DMM in continuos flow (0.06 mL/min) and the biofilm were formed up to 21 days. In the experimental times (4, 7, 14 or 21 days) microbiological and tooth samples were collected (n=10) and the outcomes were evaluated as percentage of superficial hardness change (%SHC), integrated hardness loss and colony forming units (CFU) counts. For the third experiment, the EP2 was used and biofilms were grown up to 7 days in association with CHX 0.012%, 0.03%, 0.06%, 0.12%, or saline solution as control. The treatment was applied twice a day. The outcomes were %SHC and CFU counts. Control data were compared to EP2 data (7 days) to evaluate the reprodutibillity of the model. Both EP1 and 2 showed that enamel demineralization and cariogenic microorganisms increase at 7 and 14 days compared to the initial experimental time (p<0.05). The model showed dose-respose to CHX regarding the mineral loss, total microorganisms and mutans streptococci counts. Also, a positive and significant correlation between hardness loss and microbiological values was observed. The proposed model demonstrated ability for cariogenic biofilm development, enamel demineralization and dose-response to CHX. Therefore, the MOCS seems to be a useful laboratory device to pre-clinical research related to dental caries.

Submitted by Vasti Diniz (vastijpa@hotmail.com) on 2017-09-04T13:42:04Z No. of bitstreams: 1 arquivototal.pdf: 1325395 bytes, checksum: 78cd9c8200516699f0b0083ff622ab87 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-09-04T13:42:04Z (GMT). No. of bitstreams: 1 arquivototal.pdf: 1325395 bytes, checksum: 78cd9c8200516699f0b0083ff622ab87 (MD5) Previous issue date: 2017-06-08 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - CAPES / Several microorganisms have the capacity to produce biosurfactants and to degrade petroleum hydrocarbons, which can be used in the bioremediation strategies for the recovery of environments polluted by petroleum and its derivatives. The present work aimed to evaluate the potential of biosurfactants production and degradation of diesel oil by bacteria isolates, as well as to evaluate the growth dynamics of bacteria introduced into seawater and soil with addition of diesel oil in laboratory conditions (microcosm experiment). Phylogenetic analysis of the isolates was performed on the basis of 16S rRNA sequences. The biosurfactant production capacity was analyzed by diesel oil emulsification, hemolysis and rhamnolipid production tests on the medium with cetyltrimethyl ammonium bromide (CTAB) and methylene blue. The presence of the genes rhlAB, involved in the synthesis of rhamnolipids and alkB, involved in the degradation of alkanes of diesel oil was evaluated by Polymerase Chain Reaction (PCR). The microcosm experiments were carried out using soil and seawater contaminated by diesel oil. Phylogenetic analysis of ten isolates of bacteria revealed that five isolates belonged to the genus Bacillus and five to the genus Pseudomonas. Emulsification of diesel oil was observed in four isolates in the Bushnell and Haas medium and in the nutrient broth. All isolates showed hemolytic activity and eight isolates produced rhamnolipids in medium with CTAB and methylene blue. The rhlAB gene was detected in four isolates, all belonging to the genus Pseudomonas, and the alkB gene in nine isolates. The results of the microcosm experiment with two isolates of P. aeruginosa introduced into soil and seawater containing 1% of diesel oil showed that their density increased from the fifth day of incubation indicating that the presence of diesel oil stimulated the growth of bacteria tested. The bacterial isolates analyzed in this study showed potential of application in bioremediation processes of environments contaminated by petroleum. / Vários microrganismos possuem a capacidade de produzir biossurfactantes e de degradar hidrocarbonetos do petróleo, os quais podem ser utilizados em estratégias de biorremediação para recuperação de ambientes poluídos pelo petróleo e seus derivados. No presente trabalho objetivou-se avaliar a produção de biossurfactantes e potencial de degradação do óleo diesel por bactérias, bem como a dinâmica de crescimento de bactérias introduzidas em água do mar e no solo com adição do óleo diesel em condições laboratoriais (experimento microcosmo). A análise filogenética dos isolados foi realizada com base de sequencias de RNAr 16S. A capacidade de produção de biossurfactantes foi analisada através dos testes de emulsificação do óleo diesel, hemólise e teste de produção de ramnolipídeos no meio com brometo de cetiltrimeltilamônio (CTAB) e azul de metileno. A presença do gene rhlAB, envolvido na síntese de ramnolipídeos e do gene alkB, envolvido na degradação de alcanos do óleo diesel foi avaliada pela Reação de Polimerase em Cadeia (PCR). Os experimentos microcosmo foram realizados utilizando solo e água do mar com adição do óleo diesel. Analise filogenética de dez isolados de bactérias revelou que cinco isolados pertenceram ao gênero Bacillus e cinco ao gênero Pseudomonas. A emulsificação do óleo diesel foi observada em quatro isolados no meio de Bushnell e Haas e no caldo nutriente. Todos os isolados apresentaram atividade hemolítica e oito isolados produziram ramnolipídeos em meio com CTAB e azul de metileno. O gene rhlAB foi detectado em quatro isolados, todos pertencentes ao gênero Pseudomonas, e gene alkB em nove isolados. Os resultados do experimento microcosmo mostraram que os dois isolados de P. aeruginosa introduzidos no solo e na água do mar contendo 1% de óleo diesel apresentaram aumento de densidade a partir do quinto dia de incubação indicando que a presença de óleo diesel estimulou o crescimento das bactérias testadas. Os isolados de bactérias analisados neste estudo exibiram potencial de aplicação em processos de biorremediação de ambientes contaminados por petróleo.

Sistemas de testes biológicos com espécies representativas têm sido utilizados para avaliar os efeitos causados por substâncias tóxicas no meio aquático. Os bioensaios contam com protocolos definidos, porém os organismos estão isolados de seu meio. O objetivo deste trabalho é desenvolver um sistema de testes capaz de avaliar os efeitos adversos, não apenas sobre uma única espécie, mas sobre um ecossistema. Para esta finalidade foi construído em laboratório um ecossistema aquático microbiano experimental capaz de gerar uma comunidade microbiológica e reproduzir em escala reduzida os componentes de um ecossistema natural, formando uma estrutura ecológica. Dois grupos morfológicos foram observados em sequência ecológica na medida em que as condições do meio eram alteradas. Curvas de dinâmicas de crescimento indicaram comportamento típico para o grupo de protozoários ciliados e apresentaram crescimento logarítmico em torno do quarto dia de aeração. Inibição no crescimento fora observada quando concentrações de 12,28 mg/l de cobre (3,12 ppm) e 2,5 ml/l de inseticida DDVP 20 são introduzidos nos sistemas. Não foi observada dinâmica típica para o grupo de bactérias filamentosas. Para análise dos resultados foi aplicado teste estatístico de análise de variância. O método não permitiu o estudo de relações ecológicas que se estabelecem, mas fornece informações sobre aspectos teóricos da ecologia referentes ao funcionamento dos ecossistemas e seus atributos como a capacidade de auto-organização e o processo de sucessão ecológica. Para maior precisão do método, sugere-se estudo da composição da comunidade incluindo métodos de biologia molecular, alongamento do período do experimento e aplicação de modelos populacionais. / Biological testing systems with representative species have been used to assess the effects caused by toxic substances in the aquatic environment. Bioassays rely on defined protocols, but organisms are isolated from their environment. The objective of this work is to develop a test system capable of evaluating adverse effects, not only on a single species, but on an ecosystem. For this purpose an experimental microbial aquatic ecosystem was built in the laboratory capable of generating a microbiological community and reproducing the components of a natural ecosystem in a reduced scale, forming an ecological structure. Two morphological groups were observed in ecological sequence as the conditions of the environment were altered. Growth dynamics curves indicated typical behavior for the group of ciliate protozoa and presented logarithmic growth around the fourth day of aeration. Growth inhibition was observed when concentrations of 12.28 mg / l copper (3.12 ppm) and 2.5 ml / l DDVP 20 insecticide are introduced into the systems. No typical dynamics were observed for the group of filamentous bacteria. Statistical analysis of variance was applied to analyze the results. The method did not allow the study of established ecological relations, but provides information on the theoretical aspects of ecology related to the functioning of ecosystems and their attributes such as the capacity of self-organization and ecological succession process. For better precision of the method, we suggest a study of community composition including methods of molecular biology, elongation of the experiment period and application of population models.

The objective of this study was to evaluate the antimicrobial and anti-caries effects of two plant extracts. The first chapter dealt with a review of the literature whose objective was to discuss the antimicrobial potential of Brazilian natural agents on the biofilm related to dental caries and gingivitis/periodontal disease. The research of the articles was carried out using PubMed. We found a total of 23 papers. Most of the studies were performed using planktonic microorganisms or under clinical trials. Nineteen articles were focused on cariogenic bacteria. From these nineteen articles, eleven were also about periodontopathogenic bacteria. Four studies addressed only periodontopathogenic bacteria. The most tested Brazilian natural agents were green propolis, essential oils of Lippia sidoides and Copaifera sp. Most of the tested agents showed similar results when compared to positive control (essential oils and extracts) or better effect than negative control (green propolis). More studies involving protocols closer to the clinical condition and the use of response variables that allows understanding the mechanism of action of natural agents are necessary before the incorporation of these natural agents into dental products. The second chapter aimed to test the effect of the hydroalcoholic extracts of Myracrodruon urundeuva All. and Qualea grandiflora Mart. leaves on the viability of the microcosm biofilm and on the prevention of enamel demineralization. The microcosm biofilm was produced on bovine enamel, using human saliva pool mixed with McBain saliva (0.2% sucrose) for 14 days. The biofilm was treated daily with the extracts for 1 min. M. urundeuva at 100, 10 and 0.1 g/ml and Q. grandiflora at 100 and 0.1 g/ml reduced cell viability similarly to the positive control and significantly more than negative control. M. urundeuva at 1000, 100 and 0.1 g/ml were able to reduce the counting formation unit-CFU counting of lactobacilli sp. and Streptococcus mutans, while Q. grandiflora at 1000 and 1.0 g/ml significantly reduced the S. mutans CFU counting. On the other hand, the natural extracts did not reduce the production of extracellular polyssacharides, lactic acid and the development of enamel caries lesions. The third chapter aimed to evaluate the effect of hydroalcoholic extracts of M. urundeuva and Q. grandiflora (alone or combined) on the viability of S. mutans biofilm and the prevention of enamel demineralization. S. mutans strain (ATCC 21175) was reactivated in BHI broth. Minimum inhibitory concentration, minimum bactericidal concentration, minimum biofilm inhibitory concentration and minimum biofilm eradication concentration were determined to choose the concentrations to be tested under the biofilm model. S. mutans biofilm (5x105 CFU/ml) was produced on bovine enamel using McBain saliva with 0.2% sucrose for 3 days. The biofilm was treated daily with the extracts for 1 min. M. urundeuva (isolated or combined) at concentrations equal or higher than 0.625 mg/ml was able to reduce the bacteria viability, whereas Q. grandiflora extract alone showed antimicrobial effect at 5 mg/ml only (p<0.05). On the other hand, none of the extracts was able to reduce the development of enamel caries lesions. Despite the tested natural extracts have antimicrobial effect; they are unable to prevent caries in enamel. / O objetivo foi avaliar os efeitos antimicrobiano e anti-cárie de dois extratos de plantas. O primeiro capítulo se referiu a uma revisão da literatura cujo objetivo foi discutir o potencial antimicrobiano dos agentes naturais brasileiros sobre o biofilme relacionado à cárie dentária e à gengivite/doença periodontal. A pesquisa dos artigos foi realizada usando o PubMed. Foram encontrados 23 trabalhos. A maioria dos estudos foi realizada utilizando microorganismos na fase planctônica ou ensaios clínicos. Dezenove artigos foram focados em bactérias cariogênicas. Dos dezenove artigos, onze também eram sobre bactérias periodontopatogênicas. Quatro estudos abordaram apenas bactérias periodontopatogênicas. Os agentes naturais brasileiros mais testados foram própolis verde, óleos essenciais de Lippia sidoides e Copaifera sp. Os agentes testados apresentaram resultados similares quando comparados ao controle positivo (óleos essenciais e extratos) ou melhor efeito que o controle negativo (própolis verde). Mais estudos próximos da condição clínica e o uso de variáveis de resposta que permitam entender o mecanismo de ação são necessários, para permitir a incorporação desses agentes naturais em produtos odontológicos. O segundo capítulo teve como objetivo testar o efeito dos extratos hidroalcoólicos de Myracrodruon urundeuva All. e Qualea grandiflora Mart. sobre a viabilidade do biofilme microcosmo e na prevenção da desmineralização do esmalte. O biofilme microcosmo foi produzido em esmalte bovino, utilizando pool de saliva humana misturada à saliva de McBain (0,2% de sacarose) durante 14 dias. O biofilme foi tratado diariamente com os extratos durante 1 min. M. urundeuva a 100, 10 e 0,1 g/ml e Q. grandiflora a 100 e 0,1 g/ml reduziram a viabilidade dos microrganismos de forma semelhante ao controle positivo e significativamente maior do que o controle negativo. M. urundeuva a 1000, 100 e 0,1 g/ml foi capaz de reduzir a contagem de Unidade formadora de colônia-UFC para Lactobacilos totais e Streptococcus mutans, enquanto a Q. grandiflora a 1000 e 1,0 g/ml reduziu significativamente a contagem de UFC para S. mutans. Os extratos naturais não conseguiram reduzir a produção de polissacarídeos extracelulares-PEC, ácido lático e o desenvolvimento da lesão cariosa em esmalte. O terceiro capítulo teve como objetivo avaliar o efeito dos extratos hidroalcoólicos de M. urundeuva. e Q. grandiflora (sozinhos ou combinados) sobre a viabilidade do biofilme de S. mutans e na prevenção da desmineralização do esmalte. Cepa de S. mutans (ATCC 21175) foi reativada em caldo BHI. Concentração inibitória mínima, concentração bactericida mínima, concentração inibitória mínima de biofilme e concentração de erradicação mínima de biofilme foram determinadas para escolher as concentrações a serem testadas sob o modelo de biofilme. O biofilme de S. mutans (5x105 CFU/ml) foi produzido em esmalte bovino, utilizando saliva de McBain com 0,2% de sacarose durante 3 dias. O biofilme foi tratado diariamente com os extratos durante 1 min. M. urundeuva (isolada ou combinada) nas concentrações iguais ou superiores a 0,625 mg/ml foi capaz de reduzir a viabilidade das bactérias, enquanto que o extrato da Q. grandflora apresentou efeito antimicrobiano somente a 5 mg/ml (p<0,05). Nenhum dos extratos reduziu o desenvolvimento da lesão da cárie. Apesar dos extratos naturais terem efeito antimicrobiano, são incapazes de prevenir o desenvolvimento da lesão cariosa em esmalte.

The objective of this study was to evaluate the antimicrobial and anti-caries effects of two plant extracts. The first chapter dealt with a review of the literature whose objective was to discuss the antimicrobial potential of Brazilian natural agents on the biofilm related to dental caries and gingivitis/periodontal disease. The research of the articles was carried out using PubMed. We found a total of 23 papers. Most of the studies were performed using planktonic microorganisms or under clinical trials. Nineteen articles were focused on cariogenic bacteria. From these nineteen articles, eleven were also about periodontopathogenic bacteria. Four studies addressed only periodontopathogenic bacteria. The most tested Brazilian natural agents were green propolis, essential oils of Lippia sidoides and Copaifera sp. Most of the tested agents showed similar results when compared to positive control (essential oils and extracts) or better effect than negative control (green propolis). More studies involving protocols closer to the clinical condition and the use of response variables that allows understanding the mechanism of action of natural agents are necessary before the incorporation of these natural agents into dental products. The second chapter aimed to test the effect of the hydroalcoholic extracts of Myracrodruon urundeuva All. and Qualea grandiflora Mart. leaves on the viability of the microcosm biofilm and on the prevention of enamel demineralization. The microcosm biofilm was produced on bovine enamel, using human saliva pool mixed with McBain saliva (0.2% sucrose) for 14 days. The biofilm was treated daily with the extracts for 1 min. M. urundeuva at 100, 10 and 0.1 g/ml and Q. grandiflora at 100 and 0.1 g/ml reduced cell viability similarly to the positive control and significantly more than negative control. M. urundeuva at 1000, 100 and 0.1 g/ml were able to reduce the counting formation unit-CFU counting of lactobacilli sp. and Streptococcus mutans, while Q. grandiflora at 1000 and 1.0 g/ml significantly reduced the S. mutans CFU counting. On the other hand, the natural extracts did not reduce the production of extracellular polyssacharides, lactic acid and the development of enamel caries lesions. The third chapter aimed to evaluate the effect of hydroalcoholic extracts of M. urundeuva and Q. grandiflora (alone or combined) on the viability of S. mutans biofilm and the prevention of enamel demineralization. S. mutans strain (ATCC 21175) was reactivated in BHI broth. Minimum inhibitory concentration, minimum bactericidal concentration, minimum biofilm inhibitory concentration and minimum biofilm eradication concentration were determined to choose the concentrations to be tested under the biofilm model. S. mutans biofilm (5x105 CFU/ml) was produced on bovine enamel using McBain saliva with 0.2% sucrose for 3 days. The biofilm was treated daily with the extracts for 1 min. M. urundeuva (isolated or combined) at concentrations equal or higher than 0.625 mg/ml was able to reduce the bacteria viability, whereas Q. grandiflora extract alone showed antimicrobial effect at 5 mg/ml only (p<0.05). On the other hand, none of the extracts was able to reduce the development of enamel caries lesions. Despite the tested natural extracts have antimicrobial effect; they are unable to prevent caries in enamel. / O objetivo foi avaliar os efeitos antimicrobiano e anti-cárie de dois extratos de plantas. O primeiro capítulo se referiu a uma revisão da literatura cujo objetivo foi discutir o potencial antimicrobiano dos agentes naturais brasileiros sobre o biofilme relacionado à cárie dentária e à gengivite/doença periodontal. A pesquisa dos artigos foi realizada usando o PubMed. Foram encontrados 23 trabalhos. A maioria dos estudos foi realizada utilizando microorganismos na fase planctônica ou ensaios clínicos. Dezenove artigos foram focados em bactérias cariogênicas. Dos dezenove artigos, onze também eram sobre bactérias periodontopatogênicas. Quatro estudos abordaram apenas bactérias periodontopatogênicas. Os agentes naturais brasileiros mais testados foram própolis verde, óleos essenciais de Lippia sidoides e Copaifera sp. Os agentes testados apresentaram resultados similares quando comparados ao controle positivo (óleos essenciais e extratos) ou melhor efeito que o controle negativo (própolis verde). Mais estudos próximos da condição clínica e o uso de variáveis de resposta que permitam entender o mecanismo de ação são necessários, para permitir a incorporação desses agentes naturais em produtos odontológicos. O segundo capítulo teve como objetivo testar o efeito dos extratos hidroalcoólicos de Myracrodruon urundeuva All. e Qualea grandiflora Mart. sobre a viabilidade do biofilme microcosmo e na prevenção da desmineralização do esmalte. O biofilme microcosmo foi produzido em esmalte bovino, utilizando pool de saliva humana misturada à saliva de McBain (0,2% de sacarose) durante 14 dias. O biofilme foi tratado diariamente com os extratos durante 1 min. M. urundeuva a 100, 10 e 0,1 g/ml e Q. grandiflora a 100 e 0,1 g/ml reduziram a viabilidade dos microrganismos de forma semelhante ao controle positivo e significativamente maior do que o controle negativo. M. urundeuva a 1000, 100 e 0,1 g/ml foi capaz de reduzir a contagem de Unidade formadora de colônia-UFC para Lactobacilos totais e Streptococcus mutans, enquanto a Q. grandiflora a 1000 e 1,0 g/ml reduziu significativamente a contagem de UFC para S. mutans. Os extratos naturais não conseguiram reduzir a produção de polissacarídeos extracelulares-PEC, ácido lático e o desenvolvimento da lesão cariosa em esmalte. O terceiro capítulo teve como objetivo avaliar o efeito dos extratos hidroalcoólicos de M. urundeuva. e Q. grandiflora (sozinhos ou combinados) sobre a viabilidade do biofilme de S. mutans e na prevenção da desmineralização do esmalte. Cepa de S. mutans (ATCC 21175) foi reativada em caldo BHI. Concentração inibitória mínima, concentração bactericida mínima, concentração inibitória mínima de biofilme e concentração de erradicação mínima de biofilme foram determinadas para escolher as concentrações a serem testadas sob o modelo de biofilme. O biofilme de S. mutans (5x105 CFU/ml) foi produzido em esmalte bovino, utilizando saliva de McBain com 0,2% de sacarose durante 3 dias. O biofilme foi tratado diariamente com os extratos durante 1 min. M. urundeuva (isolada ou combinada) nas concentrações iguais ou superiores a 0,625 mg/ml foi capaz de reduzir a viabilidade das bactérias, enquanto que o extrato da Q. grandflora apresentou efeito antimicrobiano somente a 5 mg/ml (p<0,05). Nenhum dos extratos reduziu o desenvolvimento da lesão da cárie. Apesar dos extratos naturais terem efeito antimicrobiano, são incapazes de prevenir o desenvolvimento da lesão cariosa em esmalte.