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Caracterizações topologica, geometrica e algebrica dos produtos da recombinação do DNA atraves dos modelos Tangle e frações continuas

Faria, Luzinete Cristina Bonani de 29 July 2004 (has links)
Orientador: Reginaldo Palazzo Junior / Dissertação (mestrado) - Universidade Estadual de Campinas, Faculdade de Engenharia Eletrica e de Computação / Made available in DSpace on 2018-08-04T00:09:27Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Faria_LuzineteCristinaBonanide_M.pdf: 3925570 bytes, checksum: 2aed52215bf626bef90df6f45edf1f51 (MD5) Previous issue date: 2004 / Resumo: Nesta dissertação ao apresentamos um procedimento para a determinação rigorosa das estruturas topologica, geometrica e algebrica das moleculas de DNA formando Nos e Catenanes, que surgem como produtos de recombinação, e com isso indicando a estrutura das moleculas relacionadas. Este procedimento faz uso dos conceitos da classificação de tangles e Nos racionais. A partir destas aplicações, apresentamos uma proposta de modelos matematicos, o modelo tangle e a descrição algebrica via frações continuas, capazes de prever os produtos da recombinação com sitios repetidos inversamente, baseando-se nas experiencias realizadas por Cozzarelli et. ali. com as enzimas resolvase Tn3 e integrase / Abstract: In this work we present a technique to determine rigorously the topologic, geometric and algebraic structure of the DNA molecules forming knots e catenanes that arise as products of the recombination, and so indicating the structure of related molecules. This procedure is based on the concepts of rational knots and rational tangles classification. From these applications, we propose two mathematical models, the tangle model and the algebraic description via continued fractions, which are capable to predict the products of the recombination with inversely repeated sites based on laboratory experiments realized by Cozzarelli et. ali., using resolvase tn3 and integrase enzymes / Mestrado / Telecomunicações e Telemática / Mestre em Engenharia Elétrica
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Modelos matemáticos para Esquistossomose

RIBEIRO, Joilson Oliveira 31 January 2008 (has links)
Made available in DSpace on 2014-06-12T18:28:19Z (GMT). No. of bitstreams: 2 arquivo4253_1.pdf: 461782 bytes, checksum: d1f9bac071851a0ed549ea005cc9472d (MD5) license.txt: 1748 bytes, checksum: 8a4605be74aa9ea9d79846c1fba20a33 (MD5) Previous issue date: 2008 / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico / Nesta dissertação apresentamos alguns modelos matemáticos para esquistossomose. Foram estudados a existência de equilíbrios dos sistemas de E.D.O., assim como suas estabilidades. O principal modelo estudado leva em conta a dependência de idade do caramujo infectado. Foi definido um valor para o número reprodutivo básico, R0, e mostrado a existência de um valor limite tal que a estabilidade do equilíbrio livre dos parasitas depende diretamente deste valor. Além disso, mostramos a existência e unicidade do equilíbrio endêmico, e que o mesmo é localmente assintoticamente estável sob certas condições na taxa de mortalidade do homem induzida pelo parasita. Fizemos uma análise da sensibilidade do número médio de parasitas por pessoa. Várias estratégias de controle foram discutidas, além de avaliações de custo-benefício. Foi ainda mostrado que esse modelo é a generalização de um modelo mais simples
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Modelagem e simulação de colunas de destilação com reação quimica : uma aplicação ao processo do nylon 6,6

Thomaz, Vanessa Gesuato 20 November 1998 (has links)
Orientador: Sergio Persio Ravagnani / Dissertação (mestrado) - Universidade Estadual de Campinas, Faculdade de Engenharia Quimica / Made available in DSpace on 2018-07-24T14:00:13Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Thomaz_VanessaGesuato_M.pdf: 2441045 bytes, checksum: de2838b7a28dc307df5fb08edec50b63 (MD5) Previous issue date: 1998 / Resumo: o trabalho consta do estudo da modelagem matemática e simulação de colunas de destilação com reação química, aplicado ao processo de polimerização do nylon 6,6. Para tanto, o método da colocação ortogonal foi utilizado, reduzindo a ordem do modelo Foram revistas informações da literatura a respeito de processos utilizando reação para obtenção de melhores separações em colunas de destilação, bem como estudos relacionados à polimerização do nylon 6,6. Na última década, a tecnologia de destilação reativa atraiu a atenção da indústria de processo químico, conduzindo simultaneamente reação na fase líquida e separação líquido-vapor. Esta tecnologia tem o potencial de melhorar os processos através de uma ou mais das seguintes etapas: aumentando seu potencial econômico através da redução do capital de investimento e um melhor uso da matéria-prima; reduzindo a formação de subproduto; e melhorando a integração de energia utilizando diretamente o calor de reação na separação. Todas estas etapas contribuem para o aumento da competitividade industrial ...Observação: O resumo, na íntegra, poderá ser visualizado no texto completo da tese digital / Abstract: The present work consists of a study on mathematical modeling and simulation of reactive distillation systems, applied to the process of nylon 6,6 polymerization. For this purpose, the orthogonal colIocation method was used, reducing the model's order. A review in literature information was made comprising processes using reaction for the obtaining of betters separations in distillation columns, as welI as studies related with nylon 6,6 polymerization. In the last decade, reactive distillation technology has captured the attention of the chemical process industry as a means of simultaneously conducting liquid-phase reaction with vapor-liquid separation. This technology has the potential to improve processes via one or more of the folIowing routes: increasing their economic potential through reduced capital investment and improved raw materiaIs usage, reducing by-product formation; and improving energy integration by direct1y using the heat of reaction for the purpose of separation. AlI ofthese routes contribute to increasing the manufacturer's competitiveness...Note: The complete abstract is available with the full electronic digital thesis or dissertations / Mestrado / Ciencia e Tecnologia de Materiais / Mestre em Engenharia Química
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Dimensionamento de redes em malha da hierarquia digital sincrona com restabelecimento de enlace

Sousa Filho, Argemiro O 06 October 1999 (has links)
Orientador: Hermano M. F. Tavares / Dissertação (mestrado) - Universidade Estadual de Campinas, Faculdade de Engenharia Eletrica e de Computação / Made available in DSpace on 2018-07-24T20:26:50Z (GMT). No. of bitstreams: 1 SousaFilho_ArgemiroO_M.pdf: 4957650 bytes, checksum: 2791a19c6c2ce83b313be32fdfa4f00d (MD5) Previous issue date: 1999 / Resumo: Este trabalho trata do dimensionamento otimizado de redes em malha da Hierarquia Digital Síncrona com restabelecimento de enlace. Um modelo matemático é desenvolvido com o objetivo de minimizar o custo dos sistemas STM-N entre nós da rede. Através do modelo proposto são determinados conjuntamente o roteamento do tráfego principal e a alocação de capacidade de reserva requerida para o restabelecimento pleno da demanda de tráfego afetada por falha simples de enlace. Algumas considerações práticas foram incluídas, tais como integralidade de fluxo de tráfego entre nós e modularidade dos sistemas STM-N. O problema é modelado usando técnicas de Programação Linear Inteira (PLI) e o número de variáveis inteiras cresce exponencialmente com o tamanho (número de nós e enlaces) da rede. Como o tempo de execução do PLI depende diretamente do número de variáveis inteiras, um procedimento heurístico que trabalha com o PLI relaxado foi desenvolvido, o qual obtém uma solução inteira sub-ótima após uma seqüência de arredondamentos. Aplicações práticas são apresentadas ao final do trabalho, permitindo uma avaliação da heurística adotada / Abstract: This paper concerns optimized dimensioning of SDH meshed networks with line restoration. A mathematical model of the network is presented with purpose of minimizing the total cost of STM-N systems between nodes. The model jointly determines the routing of the working traffic and the spare capacity allocation required for full restoration of the demand affected by any single link failure at a time. Some practical features have been included, such as flow integrality between network nodes and STM-N system modularity. The problem is modeled using Integer Linear Programming techiques and the number of integer variables grows exponentially according to the size of the network. Since the execution time depends greatly on number of integer variables, a heuristic has been developed that relaxes integer variables and, after iterative rounding off procedures obtains the solution integrality. Practical applications are presented, which allow the heuristic evaluation / Mestrado / Mestre em Engenharia Elétrica
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Estudo e modelagem de job shops ciclicos com jobs distintos

Portugal, Denise Sodero Vinhas 19 July 1999 (has links)
Orientador: Rafael Santos Mendes / Dissertação (mestrado) - Universidade Estadual de Campinas, Faculdade de Engenharia Eletrica e de Conputação / Made available in DSpace on 2018-07-25T01:26:28Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Portugal_DeniseSoderoVinhas_M.pdf: 4601014 bytes, checksum: 6c5d47e08ef85485b21b3c75f560cb1d (MD5) Previous issue date: 1999 / Resumo: Um problema de escalonamento cíclico com recursos disjuntivos e múltiplos jobs, denominado job shop cíclico com jobs distintos, é investigado. Para a resolução deste problema duas modelagens em programação inteira mista são adaptadas de modelos encontrados na literatura. Os modelos são implementados no software GAMS. O comportamento dos modelos face a múltiplos variações paramétricas é analisado graficamente. Finalmente a equivalência entre os modelos é mostrada analítica e empiricamente / Abstract: A cyclic scheduling problem with disjunctive resources and multiples jobs called cyclic job-shop with differents jobs is investigated. The adaptation of two models in mixed integer programming, found in the literature, solve the problem. The models are implemented using software GAMS. The behavior of the models in face of multiple parameter variations is shown graphically. Finally the equivalence between models is shown analytically and empirically / Mestrado / Mestre em Engenharia Elétrica
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Simulação numerica composicional com formulação implicita e efeitos gravitacional e capilar

Caminha, Romulo de Athayde 03 September 1999 (has links)
Orientador: Antonio Claudio de França Correa / Dissertação (mestrado) - Universidade Estadual de Campinas, Faculdade de Engenharia Mecanica / Made available in DSpace on 2018-07-25T16:29:45Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Caminha_RomulodeAthayde_M.pdf: 6147980 bytes, checksum: df68f12f57bbca5b9ef1b113128fa590 (MD5) Previous issue date: 1999 / Resumo: Este trabalho tem como objetivo apresentar um simulador numérico composicional, unidimensional e isotérmico, no qual um escoamento bifásico (óleo e gás) e multicomponente é tratado implicitamente para pressão, saturação e composição dos fluidos. Considera-se também a ação gravitacional nos termos de fluxo, o que permite a análise de escoamento com inclinação. As equações envolvidas apresentam fortes não linearidades, requisitando uma solução numérica do sistema pelo método de Newton-Raphson. O tratamento unidimensional dado ao problema resulta na obtenção de uma matriz Jacobiana tridiagonal em blocos. É considerado um fluxo bifásico por convecção, no qual os efeitos de dispersão são desprezíveis. Não se considera a existência de água móvel no meio poroso e a curva de pressão capilar gás-óleo original, obtida em laboratório, é atualizada em função das variações de tensão interfacial dos fluidos. Supõe-se um equilíbrio termodinâmico instantâneo, cujo cálculo é feito com o auxílio da equação de estado de Peng e Robinson. O cálculo das densidades e pesos específicos das fases é feito usando-se a própria equação de estado. As viscosidades do óleo e do gás são obtidas pela correlação de Lohrenz. Considera-se ainda o meio poroso incompressível, homogêneo e isotrópico, mecânica e quimicamente inerte aos fluidos / Abstract: This work aims to present an isothermal, one-dimensional, compositional numerical simulator. A two-phase (oil and gas) multicomponent flow is treated implicitly in pressure, saturation and compositions. Flow terms consider gravitational effect, which allows the study of flow in inclined reservo ir. The highly non-linear equations, which are necessary to equate the problem, require a numerical solution, which is obtained by the Newton-Raphson method. The one-dimensional treatment given to the problem yields a tridiagonal block Jacobian matrix. It is assumed that the two-phase flow is dominated by convection and that the dispersive effects are neglected. No mobile water is considered in the porous media, and the original gas-oil capillary pressure curve, obtained from the laboratory, is modified to include the variations of interfacial tensions. Instantaneous thermodynamic equilibrium is admitted and it is computed by means of the Peng and Robinson equation of state. The fluids densities are calculated with the equation of state. Gas and oil viscosities are computed using the Lohrenz method. The medium is considered incompressible, homogeneous and isotropic, chemically and physically inert to the fluids / Mestrado / Mestre em Engenharia de Petróleo
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Heterogeneidade populacional e fatores abioticos na dinamica de um epidemia

Leite, Maria Beatriz Ferreira 25 July 2018 (has links)
Orientador: Rodney C. Bassanezi / Tese (doutorado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Matematica, Estatistica e Computação Cientifica / Made available in DSpace on 2018-07-25T16:34:11Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Leite_MariaBeatrizFerreira_D.pdf: 13532575 bytes, checksum: cb4649e666d3c23817a60ac0b3e36b41 (MD5) Previous issue date: 1999 / Resumo: A análise de modelos matemáticos em epidemiologia é de fundamental importância em questões relacionadas à medidas de prevenção e controle de doenças transmissíveis. Neste trabalho apresentamos e analisamos modelos matemáticos que incorporam fatores heterogêneos da população. Tal heterogeneidade refere-se, por exemplo, aos diferentes graus de infecciosidade, de suscetibüidade e dos padrões comportamentais dos indivíduos. A análise dos modelos visa, principalmente, determinar sob quais condições uma doença se torna endêmica. Os modelos foram classificados de acordo com o tipo de taxa de incidência (taxa com a qual novas infecções ocorrem) considerada. Na Parte I os modelos propostos assumem taxa de incidência bilinear e na Parte II a taxa de incidência considerada é não-bilinear. / Abstract: Not informed. / Doutorado / Doutor em Matemática Aplicada
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Modelagem e simulação da etapa de estabilização termo-oxidativa de fibras de poliacrilonitrila (PAN) percursoras na fabricação de fibras de carbono

Rosa, Andrea Milene Apolinario 28 October 1999 (has links)
Orientador: Sergio Persio Ravagnani / Dissertação (mestrado) - Universidade Estadual de Campinas, Faculdade de Engenharia Química / Made available in DSpace on 2018-07-25T18:42:17Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Rosa_AndreaMileneApolinario_M.pdf: 2528475 bytes, checksum: 0beb202471c0196e9d5a236b08fe976b (MD5) Previous issue date: 1999 / Resumo: Os estudos relacionados ao processo de fabricação de fibras de carbono indicam que a etapa de estabilização termo-oxidativa das fibras precursoras é a limitante, envolvendo reações complexas e mudanças na estrutura fisica das fibras. Com o objetivo de se conhecer melhor a etapa de estabilização e eliminar gastos em testes experimentais, a modelagem e a simulação surgiram para otimizar com eficiência nesta etapa. Apresenta-se neste trabalho uma modelagem matemática para o processo de estabilização. O feixe de fibras de poliacrilonitrila (PAN) é modelado como um sólido homogêneo, com as principais reações químicas de estabilização: a ciclização do grupo nitrila, a desidrogenação da ligação carbono-carbono e a oxidação. As equações que descrevem o modelo são baseadas nas velocidades das reações químicas, nos balanços de massa em espécies reagindo, na difusão de oxigênio radial e na transferência de calor radial no feixe. O sistema de equações do modelo foi resolvido com a aplicação do Método de Colocação Ortogonal, que discretiza a variável espacial e o Método de Runge-Kutta Semi- Implícito, que integra as equações na dimensão de tempo. Os resultados de concentrações e temperaturas obtidos pela simulação apresentaram um comportamento coerente com os resultados experimentais da literatura. Finalmente, utilizou-se o modelo para verificar os parâmetros que influenciam a estabilização. O processo foi otimizado com boas co ndiçõesde transferência de calor, menor número de filamentos no feixe ou baixas temperaturas de estabilização / Abstract: Studies related to the rnanufacture of carbon fibers indicate that the thermo-oxidative stabilization of precursor fibers is the slowest step, due to the complex reactions and changes in the physical structure of fibers. In order to know the stabilization step and eliminate expenses in experimental tests, modeling and simulation have been efficiently used to optimize this step. This work reports a mathematical modeling for the process of stabilization. The undle of polyacrylonitrile fibers (PAN) is modeled as a homogeneous solid, with the following chemical reactions: cyclization of the nitrile groups, dehydrogenation of carbon-carbon bonds and oxidation. The equations that describe the model are based on the chemical reactions rates, reacting species mass balances, radial mass and heat transfer rate within the bundle. The resulting system of equations was solved by the Orthogonal Collocation Method, and the Semi-implicit Runge-Kutta Method. The obtained results of concentrations and temperatures presented a coherent behavior with the literature experimental results. Finally, the model has been utilized to find which parameters influence the stabilization, and determine obtaining the best operation conditions / Mestrado / Ciencia e Tecnologia de Materiais / Mestre em Engenharia Química
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Simulação e sensitividade parametrica para um reator de pirolise de fino de xisto em leito de arraste

Gontarski, Carlos Alberto Ubirajara 25 March 1991 (has links)
Orientador: Milton Mori / Dissertação (mestrado) - Universidade Estadual de Campinas, Faculdade de Engenharia Quimica. / Made available in DSpace on 2018-07-13T23:49:45Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Gontarski_CarlosAlbertoUbirajara_M.pdf: 9573178 bytes, checksum: eafb4a03370b8fa1a273f89c51d6d3c0 (MD5) Previous issue date: 1991 / Resumo: O trabalho consiste na utilização de um modelo matemático baseado em equações gerais de balanço e cinéticas, simplificadas para o caso unidimensional e um regime permanente de um reator para a pirólise de finos de xisto. O processo ocorre com o transporte pneumático das partículas de xisto, no sentido ascendente, e com o aquecimento simultâneo através dos gases quentes, provenientes de um queimador e que escoam no espaço anular entre a parede do reator e o material isolante. O modelo matemático proposto envolve as dez equações diferenciais que representam os balanços de massa, energia e quantidade de movimento nos meios fluidos, e a cinética da reação. Com mais duas equações referentes aos balanços de energia nas paredes do reator e do isolamento determinam-se as temperaturas de parede. Na simulação do reator em um microcomputador, as equações são resolvidas com o auxílio de métodos numéricos, principalmente o da colocação ortogonal em elementos finitos e o algoritmo de Broyden. A programação é apresentada em linguagem FORTRAN [27]. Os resultados obtidos na simulação são comparados com os dados experimentais coletados na planta piloto localizada nas instalações de Petrobrás-SIX, em São Mateus do Sul, Paraná. A análise da sensitividade dos principais parâmetros do modelo permite tirar conclusões a respeito da precisão necessária para a leitura de dados da planta e para a estimativa de algumas propriedades utilizadas no modelo matemático. Além disso, por este procedimento também podem ser identificadas as principais variáveis que afetam a simulação / Abstract: This work presents a mathematical model based on kinetics and general balance equations, for the one dimendional and steady state reactor to the pyrolysis of o shale fine-grained. The process occur with the vertical pneumatic conveying of the particles. The system is heated by a hot gas, originated in the burner, that flows through the annular space between the reactor wall and insulating material. The proposed balances in moving phases, and reaction kinetics. In addition, two equations obtained by wall energy balances are necessary to determine the value of wall temperatures. The orthogonal collocation on finite elements method is applied to solve the stiff system of ordinary differential equations. The numerical results show a very good agreement with the experimental data obtained on the Petrobrás-Six pilot plant at São Mateus do Sul, Paraná. The parametric sensitivity analysis allows important conclusions abut the precision of measurement instruments and the validity of the estimation of some properties used in the mathematical model. Furthermore, by taking this procedure, the main variables which affect the simulation are also identified. / Mestrado / Mestre em Engenharia Química
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Analise numerica e experimental de conjunto concentrador com tubo de calor

Zanardi, Mauricio Araujo 10 November 1989 (has links)
Orientador: Kamal A. R. Ismail / Tese (doutorado) - Universidade Estadual de Campinas, Faculdade de Engenharia de Campinas / Made available in DSpace on 2018-07-14T03:56:52Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Zanardi_MauricioAraujo_D.pdf: 2113594 bytes, checksum: bcf2ee17a7e8d2aecf2251f0c2ab7992 (MD5) Previous issue date: 1989 / Resumo: Neste trabalho faz-se a modelagem hidrodinâmica e térmica de um tubo de calor levando-se em consideração o acoplamento entre as equações de movimento.o e de energia e essa formulação é usada para se fazer a modelagem de um conjunto o coletor-tubo de calor. É usado um método de volume de controle para a obtenção das soluções numéricas com discretização das equações feita.a através do esquema "LOAD". Os resultados teóricos são comparados com resultados experimentais obtidos por Mc Kinney e com dados obtidos com um coletor construído no Laboratório de Armazenadores Térmicos e Tubos de Calor da UNICAMP, mostrando boa concordância entre eles. O modelo é então utilizado para simular o funcionamento anual de um sistema de aquecimento e como exemplo são mostrados os resultados para uma potência de 15 kW. / Abstract: Not informed. / Doutorado / Doutor em Engenharia Mecânica

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