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Classificação de séries temporais via Classificador de Bayes empregando Modelos Lineares Dinâmicos

Aguiar, Diana Dorgam de, 92-99171-6468 09 August 2017 (has links)
Submitted by Divisão de Documentação/BC Biblioteca Central (ddbc@ufam.edu.br) on 2017-12-04T14:17:52Z No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Dissertação_Diana D. Aguiar.pdf: 2526734 bytes, checksum: ef02491a952f20781293fdfd0e5f5052 (MD5) / Approved for entry into archive by Divisão de Documentação/BC Biblioteca Central (ddbc@ufam.edu.br) on 2017-12-04T14:18:04Z (GMT) No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Dissertação_Diana D. Aguiar.pdf: 2526734 bytes, checksum: ef02491a952f20781293fdfd0e5f5052 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-12-04T14:18:04Z (GMT). No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Dissertação_Diana D. Aguiar.pdf: 2526734 bytes, checksum: ef02491a952f20781293fdfd0e5f5052 (MD5) Previous issue date: 2017-08-09 / CAPES - Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / In this work we present a new approach for applications in Discriminant Analysis (DA) to problems whose observations in the training set are from time series, using the Bayes classifier and modeling the classes distributions in with Linear Dynamic Models. Theoretical developments were conducted to obtain an analytic form for the classe posterior probability. The simulation studies have been developed to evaluate the proposed approach, to evaluate different strategies to estimate the model variance and determine the classification error rates (ET) to compare them with other usual approaches in AD. Time series were simulated with different structures of classes separation and with different sizes for the training set. The proposed approach was also applied to data from real problems with different degrees of difficulty with respect to the classes number, the time series size and number of observations in the training set. With real data the proposed classifier was compared with other classifiers in terms of error rate. Although it is needed most complete studies, the results suggest that this parametric approach developed constitutes a promising alternative for problems in AD with time series, particularly in a challenging context when the size time series is much large than the number of observations in the classes. / Na presente dissertação apresentamos uma nova abordagem para aplicações em Análise Discriminante (AD) para problemas cujas observações no conjunto de treinamento são oriundas de séries temporais, empregando o Classificador de Bayes e modelando as distribuições nas classes com o emprego de Modelos Lineares Dinâmicos. Foram realizados os desenvolvimentos teóricos necessários para a obtenção de uma forma analítica para as probabilidades a posteriori das classes. Para avaliar a abordagem proposta foram desenvolvidos estudos de simulação, tanto para avaliar as estratégias da escolha do procedimento da estimação da variância, como também, determinar as taxas de erro (TE) de classificação para compará-las com outras abordagens usuais para classificadores em AD. Foram simuladas observações de séries temporais com diferentes estruturas de separação das classes e com diferentes tamanhos para o conjunto de treinamento. A abordagem proposta também foi aplicada em dados de problemas reais, com diferentes graus de dificuldades com relação ao número de classes, tamanho das séries e o número de observações no conjunto de treinamento, sendo então comparadas suas TE com as de outros classificadores. Embora sejam necessários estudos mais completos, os resultados obtidos sugerem que a abordagem paramétrica desenvolvida se constitui em uma alternativa promissora para esta categoria de problemas em AD, com observações de séries temporais, em particular, em um contexto bastante desafiador na prática quando temos séries com tamanhos grandes com relação ao número de observações nas classes.
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Efeitos da gestÃo escolar e caracterÃsticas individuais do diretor determinantes do desempenho dos estudantes do ensino fundamental brasileiro / Individual characteristic effect of determinative the pertaining to school management and of the director of the performance of the students of brazilian basic education

Leandro Oliveira Costa 13 September 2006 (has links)
Conselho Nacional de Desenvolvimento CientÃfico e TecnolÃgico / Utilizando as metodologias de Modelos Lineares HierÃrquicos e Modelos Estruturais com Dados em Painel sobre os dados do SAEB 2001 e 2003, foram analisados os efeitos da gestÃo escolar e das caracterÃsticas individuais do diretor determinantes ao desempenho cognitivo dos estudantes do ensino fundamental brasileiro. As variÃveis sobre as caracterÃsticas individuais dos alunos apresentaram resultados semelhantes à literatura nacional, ou seja, as condiÃÃes socioeconÃmicas e a raÃa sÃo fatores relevantes para explicar a performance nos exames de proficiÃncia em matemÃtica. Entretanto, constatou-se um resultado distinto quanto à melhor performance dos estudantes do sexo feminino, o qual pode estar relacionado com o que se obteve para a variÃvel repetÃncia, visto que a maioria dos estudantes que repetem sÃo do sexo masculino. Entre as vinte e sete variÃveis ao nÃvel da escola, somente oito divergiram os resultados entre os dois modelos. Verificou-se que a qualidade dos educadores, professores e diretores, pode ser medida tanto pelos seus nÃveis de escolaridade quanto por suas experiÃncias no ambiente escolar. De onde se conclui que a estrutura fÃsica e pedagÃgica deve ser direcionada ao incentivo à alta freqÃÃncia dos alunos e professores, ou seja, ambientes modernamente equipados e bem conservados. No cÃmputo geral dos resultados pode-se concluir que a escola brasileira necessita de recursos financeiros para serem aplicados em salÃrios mais altos para diretores e professores, docentes mais qualificados, e em uma estrutura que incentiva a presenÃa dos estudantes (como computadores com acesso à Internet) para melhorar o desempenho cognitivos dos estudantes. / By using the methodologies of Hierarchic Linear Models and Structural Models with Panel Data on the data of SAEB in 2001 and 2003, it was analyzed the effect of school management and the principalâs individual characteristics determinants to the students cognitive performance in the Brazilian primary schooling. When analyzing the individual characteristics of the students, it has been found similar results to national literature, that is, the socioeconomic conditions and the race are important factors to determine the performance in the examinations of proficiency in math. An interesting result is the best performance of the female students. This apparent contradiction may be related to what it was obtained for the schooling recurrence variable, since the majority of the repeater students are male. Among the twenty seven school variables, only eight of them diverged the results between the two models. The results obtained verified that the quality of the educators, teachers and principals, may be measured by their levels of schooling and experience in the school environment. Also signaling that the physical and pedagogical structure must be directed to the incentive the high frequency of the students and teachers, that is, well conserved and modernly equipped environments. The overall results indicate that the Brazilian schooling system needs financial resources to be applied to higher wages for teachers and principals, teachers more qualified, and a better structure that stimulates the students to go to school (as computers with access to the Internet) to improve the cognitive performance of the students.
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Modelos Birnbaum-Saunders bivariados / Models bivariate Birnbaum-Saunders

Benites Sánchez, Luis Enrique, 1983- 03 July 2014 (has links)
Orientador: Filidor Edilfonso Vilca Labra / Dissertação (mestrado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Matemática Estatística e Computação Científica / Made available in DSpace on 2018-08-24T23:42:51Z (GMT). No. of bitstreams: 1 BenitesSanchez_LuisEnrique_M.pdf: 5806394 bytes, checksum: be4e77277f256bd4832454c572be588c (MD5) Previous issue date: 2014 / Resumo: Vários trabalhos tem sido feitos sobre a distribuição BS univariada e suas extensões. A versão bivariada deste modelo foi apresentada recentemente por Kundu et al. (2010). Eles propuseram uma distribuição BS bivariada com estrutura de dependência e estabeleceram várias propriedades atrativas para a distribuição BS bivariada, que possui uma estreita relação com a distribuição normal bivariada; assim como a distribuição BS univariada tem com a distribuição normal univariada. Este trabalho apresenta um estudo de alguns aspectos de inferência, análise de diagnóstico e análise de tempo de vida baseada na função taxa de falha da distribuição BS bivariada: aspectos de inferência serão através de testes de hipótese considerando as estatísticas de Wald, Razão de Verossimilhança e Escore; o análise de diagnóstico será baseada na metodologia de Cook (1986) e a discussão sobre análise sobrevivência será baseada na idéia de Basu (1971). Finalmente, exemplos numéricos serão apresentados para ilustrar as metodologias propostas e as propriedades das estatísticas serão investigadas por meio de simulações de Monte Carlo / Abstract: Several works have been done on the univariate BS distribution and its extensions, the bivariate version of this model was presented only recently by Kundu et al. (2010). They proposed a bivariate BS distribution with dependence structure and established several attractive properties of that bivariate distribution. It possesses a close relationship with the bivariate normal distribution just as the univariate BS distribution has with the univariate normal. In this work provides a study some aspect of inference, analysis of diagnostics and lifetime analysis based on the failure rate function of bivariate BS distributions: Hypotheses test studies are considered using the Wald, Score and Likelihood Ratios statistics, the analysis of diagnostics is based on the Cook (1986) approach, and the discussion on lifetime analysis is based on the idea of Basu (1971). Finally, numerical examples are given to illustrate our methodology and the properties of the statistics are investigated through Monte Carlo simulations / Mestrado / Estatistica / Mestre em Estatística
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Modelo de regressão linear Sinh-Normal : Aplicações à tempo de vidas / Linear Regression model Sinh-Normal : Applications to life times

Maehara Sánchez, Rocío Paola, 1983- 03 July 2014 (has links)
Orientador: Filidor Edilfonso Vilca Labra / Dissertação (mestrado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Matemática Estatística e Computação Científica / Made available in DSpace on 2018-08-24T22:21:27Z (GMT). No. of bitstreams: 1 MaeharaSanchez_RocioPaola_M.pdf: 3392400 bytes, checksum: 820e10611571e2e9984d25f94c00ced2 (MD5) Previous issue date: 2014 / Resumo: A família de distribuições Sinh-Normal é uma classe de distribuições simétricas com três parâmetros, e devido à presença destes parâmetros esta família é flexível. Quando a distribuição Sinh-Normal é unimodal, esta distribuição pode ser utilizada em lugar da distribuição normal, e consequentemente nos modelos de regressão. Uma subclasse das distribuições é o log-transformação da distribuição de tempo de fadiga Birnbaum-Saunders. Assim, várias propriedades da distribuição Birnbaum-Saunders e algumas generalizações podem ser obtidas. O principal objetivo deste trabalho é estudar alguns aspectos de estimação e análise de diagnóstico no modelo de regressão Sinh-Normal. A análise de diagnóstico baseia-se na metodologia de Cook (1986). Duas análises de dados são realizadas para ver como o modelo proposto pode ser utilizado na prática. Além disso, investigamos um teste de homogeneidade dos parâmetros de forma no modelo de regressão Sinh-Normal. Obtemos as estatísticas de escore para este teste. Finalmente, um exemplo numérico é apresentado para ilustrar a metodologia e as propriedades das estatísticas escore são investigadas através de simulações de Monte Carlo / Abstract: The family of Sinh-normal distributions is a class of symmetric distributions with three parameters, and due to presence of these parameters it is a very flexible distribution. When the Sinh-normal distribution is unimodal, it distribution could be used in place of the normal distribution and consequently in regression model. A subclass de distribution of Sinh-normal distributions is the log-transformation of the Birnbaum-Saunders fatigue-time distribution. So, several properties of the Birnbaum-Saunders distribution and some generalization can be obtained. The main objective of work is to study some aspect of estimation and analysis of diagnostics in the Sinh-Normal regression model. The analysis of diagnostics is based on the Cook (1986) approach. Two data analysis is performed to see how the proposed model can be used in practice. Furthermore, we investigate a test of homogeneity for shape parameters in the Sin-Normal regression model. We obtain the score statistics for such test. Finally, a numerical example is given to illustrate our methodology and the properties of the score statistics is investigated through Monte Carlo simulations / Mestrado / Estatistica / Mestra em Estatística
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Inserção do setor sucroalcooleiro na matriz energetica do Brasil : uma analise de insumo-produto

Cunha, Marcelo Pereira da, 1967- 28 February 2005 (has links)
Orientador: Jose Antonio Scaramucci / Dissertação (mestrado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Matematica, Estatistica e Computação Cientifica / Made available in DSpace on 2018-08-04T02:55:09Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Cunha_MarceloPereirada_M.pdf: 671663 bytes, checksum: 87af7e834b9701c03bd716e529e67ed9 (MD5) Previous issue date: 2005 / Resumo: O objetivo deste estudo é quantificar alguns impactos sobre a economia brasileira decorrentes de uma maior participação do setor sucroalcooleiro na matriz energética, especificamente o aumento da produção de eletricidade a partir da queima do bagaço de cana-de-açúcar (processo de co-geração) e maior oferta de álcool como combustível para a frota leve de veículos. São analisados os impactos sobre a estrutura da economia, emprego, nível de produção e PIB. Para tal, aplicamos o modelo de insumo-produto, utilizando-se uma base de dados estimada referente a 1999, que foi obtida com a desagregação de alguns setores produtivos, como geração de eletricidade, transmissão e distribuição de eletricidade, produção de álcool, produção de gasoálcool e gás natural. Os dados usados foram obtidos das contas nacionais fornecidas pelo IBGE, do Balanço Energético Nacional divulgado pelo Ministério de Minas e Energia e outras fontes diversas. A metodologia empregada parte da descrição tecnológica (bottom-up) dos setores produtores de eletricidade ¿ termoelétricas a gás natural, co-geração a partir da biomassa de cana-de-açúcar e hidroeletricidade. Esses novos setores são inseridos na economia brasileira, em determinadas condições de operação, resultando em mudanças econômicas que são então quantificadas / Abstract: This work aims at investigating the impacts on the Brazilian economy of a greater contribution to the energy matrix of the sugarcane agro-industry, more specifically, of an increase on the production of electricity from bagasse (combined heat and power process) and fuel ethanol as well. The effects on the economy structure, employment, production level and GDP are analyzed. An input-output (I-O) model based on an estimated database for 1999 is used for that. I-O tables were obtained by disaggregating some economic sectors ¿ such as electricity generation, transmission and distribution (treated separately), ethanol, gasoline, and natural gas ¿ from the national accounts provided by IBGE, using energy data from MME and other sources of information. The analysis starts from a bottom-up technological description of the sectors producing electricity from natural gas, sugarcane bagasse and hydro energy. These sectors are inserted in the Brazilian economy, under certain operation conditions, resulting in economic changes that are then quantified. / Mestrado / Matematica Aplicada / Mestre em Matemática Aplicada
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Analise estatistica de polimorfismo molecular em sequencias de DNA utilizando informações filogeneticas

Kiihl, Samara Flamini, 1980- 25 February 2005 (has links)
Orientador: Hildete Prisco Pinheiro / Dissertação (mestrado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Matematica, Estatistica e Computação Cientifica / Made available in DSpace on 2018-08-04T03:26:12Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Kiihl_SamaraFlamini_M.pdf: 1063133 bytes, checksum: 4c4cce349b3bd30501a820e973a44fb2 (MD5) Previous issue date: 2005 / Resumo: Variacao genetica no nivel de nucleotideo e uma fonte poderosa de informacao para o estudo da evolucao de uma populacao. Importantes aspectos da evolucao de populacoes naturais tem sido investigados utilizando sequencias de nucleotideos. A quantidade ? = 4N?, em que N e o tamanho efetivo da populacao e ? e a taxa de mutacao por sequencia (gene, locus) por geracao, e um parametro essencial porque determina o grau de polimorfismo em um locus. O sucesso da inferencia sobre a evolucao de uma populacao e medido pela acuracia da estimacao deste parametro. Esta dissertacao de mestrado apresenta diversos metodos de estimacao do parametro ?, bem como uma comparacao entre eles atraves de simulacoes e aplicacoes a dados reais. Utilizando informacoes filogeneticas de amostras de sequencias de DNA, constr'oi-se um modelo linear onde o coeficiente da variavel independente e a estimativa do parametro ?. Verificou-se que utilizando informacoes filogeneticas dos dados obtem-se estimadores bem mais eficientes / Abstract: Genetic variation at the nucleotide level is a powerful source of information for studying the evolution of a population. Important aspects of the evolution of a population have been investigated by using nucleotide sequences. The quantity ? = 4N?, where N is the effective size of the population and ? is the mutation rate per sequence (gene, locus) per generation, is an essential parameter because it determines the degree of polymorphism at the locus. The degree of success in our inference about the evolution of a population is measured to some extent by the accuracy of estimation of this essential parameter. This work presents some methods of estimation of this parameter, comparisons between the different methods through computational simulations and applications to real data. The evolution of a species can be seen through a phylogenetic tree and a linear model can be constructed by using the phylogenetic information to estimate ?. It has been verified that the use of such information leads us to more accurate estimators of ? / Mestrado / Estatistica / Mestre em Estatística
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Uma Abordagem Híbrida para Estimação de Desempenho de Comunicação em Plataformas Baseadas em Barramentos

ESMERALDO, Guilherme Álvaro Rodrigues Maia 09 March 2012 (has links)
Submitted by Pedro Henrique Rodrigues (pedro.henriquer@ufpe.br) on 2015-03-05T17:24:50Z No. of bitstreams: 2 thesis-garme.pdf: 4355850 bytes, checksum: 99bfb83bbe20bef9c48abe89d91706a0 (MD5) license_rdf: 1232 bytes, checksum: 66e71c371cc565284e70f40736c94386 (MD5) / Made available in DSpace on 2015-03-05T17:24:51Z (GMT). No. of bitstreams: 2 thesis-garme.pdf: 4355850 bytes, checksum: 99bfb83bbe20bef9c48abe89d91706a0 (MD5) license_rdf: 1232 bytes, checksum: 66e71c371cc565284e70f40736c94386 (MD5) Previous issue date: 2012-03-09 / Com o aumento da complexidade e demanda por desempenho dos sistemas embarcados e redução do custo dos microprocessadores, projetistas de sistemas embarcados têm considerado sistemas multiprocessadores como as soluções para suas aplicações. Com o avanço nas tecnologias de integração tornou-se possível integrar em um chip bilhões de transistores. Desde que um microprocessador embarcado utiliza somente alguns poucos milhões de transistores, dez ou mais microprocessadores podem ser integrados em um único chip para formar um Multi- Processor System-on-Chip (MPSoC). No projeto desses sistemas, são necessárias a especificação e validação do comportamento funcional da aplicação do sistema antes da implementação final, através de modelos funcionais executáveis e estruturas de testbenches. Técnicas, como Projeto Baseado em Plataforma (PBP), procuram, através de reuso de componentes, bem como de modelos abstratos em nível de sistema, fornecer mecanismos para simplificar e tornar mais dinâmico o processo de desenvolvimento de MPSoCs, aumentando assim a produtividade dos projetistas. Nesta abordagem, o sistema a ser desenvolvido é, inicialmente, especificado através de uma descrição em alto nível, que sofrerá refinamentos até atingir a implementação final em hardware. As funções do sistema, contidas nessa especificação, são selecionadas para serem implementadas em software ou em hardware. Estes componentes fazem parte de uma arquitetura predefinida, conhecida como plataforma, que pode ser modificada para ser adaptada às restrições de projeto. MPSoCs são compostos por muitos componentes de processamento que executam processo concorrentes que se comunicam, portanto suas arquiteturas de comunicação on-chip devem atender às necessidades de comunicação das aplicações. Assim, enquanto existe uma grande quantidade de trabalhos que suportam as fases de particionamento/mapeamento, comparativamente, pouca pesquisa tem endereçado o problema de análise de comunicação para auxiliar o projeto de arquiteturas de comunicação dessas sistemas. As técnicas existentes para explorar as opções de configuração da estrutura de comunicação são imprecisas, pois fazem estimativas estáticas, descartando efeitos dinâmicos da arquitetura, como contenção de barramento, ou possuem baixa eficiência, pois têm que simular cada configuração do espaço de projeto. O objetivo deste trabalho é oferecer suporte de análise de comunicação nos processos de vi seleção e refinamento das arquiteturas de comunicação, após a aplicação ter sido particionada e mapeada para uma plataforma, de acordo com o PBP. O uso da abordagem proposta permite que o projetista obtenha estimativas precisas de desempenho de comunicação para as configurações de barramento de todo o espaço de projeto, e, consequentemente, possa selecionar uma configuração que melhor atenda às restrições de comunicação do projeto.
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[en] ANALYSIS OF MEDIA E DISPERSION IN UNREPLICATED FACTORIAL EXPERIMENTS FOR THE OPTIMIZATION OF INDUSTRIAL PROCESSES / [pt] ANÁLISE DA MÉDIA E DISPERSÃO EM EXPERIMENTOS FATORIAIS NÃO REPLICADOS PARA OTIMIZAÇÃO DE PROCESSOS INDUSTRIAIS

ANTONIO FERNANDO DE CASTRO VIEIRA 20 December 2004 (has links)
[pt] Esta tese reúne as técnicas estatísticas indicadas para a modelagem da média e da dispersão das características de qualidade de processos e produtos, em experimentos fatoriais não replicados, resultando na definição de um roteiro integrado e detalhado de análise. A motivação vem de que, apesar de haver várias publicações sobre regressão linear clássica, modelos lineares generalizados (MLG), transformação da resposta e planejamento de experimentos, não existe um texto que reúna e descreva em detalhe todos os aspectos da modelagem da média e da dispersão em experimentos fatoriais. Os poucos textos sobre esse assunto não descrevem vários aspectos importantes em estudos dessa natureza, por exemplo, como são aplicados os testes de significância dos coeficientes dos MLG, e quais são as estatísticas e os gráficos indicados para verificar a adequação do modelo. Ademais, nada foi encontrado na literatura sobre a identificação de modelos em experimentos fatoriais. Todos esses aspectos são detalhados nessa tese. Uma vez construído o modelo, é mostrado como usá-lo para obter as condições ótimas de operação dos processos e produtos. Além do cumprimento desse objetivo principal, a tese traz algumas contribuições adicionais; a saber: a) aponta limitações em todos quatro métodos da literatura que se propõem a escolher a transformação mais adequada para a resposta. Esses métodos não produziram resultados satisfatórios quando houve interações significativas entre os fatores; b) propõe a utilização de métodos de transformação da resposta como fonte de indicação da função de ligação a ser usada nos modelos lineares generalizados; e c) propõe a utilização da função de log-verossimilhança para uma escolha conjunta da distribuição de probabilidade e da função de ligação, nos modelos lineares generalizados. / [en] This thesis puts together the statistical techniques indicated for modelling the mean and dispersion of quality characteristics of products and processes via unreplicated factorial experiments, resulting in the definition of an integrated and detailed script for the analysis. It was motivated by the fact that, although there are many publications about classic linear regression, generalized linear models (GLMs), response transformation and design of experiments, there is no one text which put together and describe in detail all the aspects of the modelling of the mean and the dispersion in factorial experiments. The few texts on the subject do not describe a number of important aspects in studies of this nature, e.g. how significance tests for the coefficients in GLMs should be applied and which are the statistics and plots indicated for checking model adequacy. In addition, nothing was found in the literature about model identification in factorial experiments. All these aspects are detailed in this thesis. Once the model is built, we show how to use it in order to obtain the optimal operating conditions for products and processes. Besides achieving this main objective, the thesis brings some additional contributions, namely: a) it points out limitations in all the four methods in the literature which have the purpose of selecting the most adequate transformation of the response; b) it proposes using response transformation methods as a source of indication of the link function to use in GLMs, and c) it proposes using the loglikelihood function for the joint choice of the probability distribution and of the link function in GLMs.
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Modelos lineares generalizados mistos multivariados para caracterização genética de doenças / Multivariate generalized linear mixed models for genetic characterization of diseases

Baldoni, Pedro Luiz, 1989- 24 August 2018 (has links)
Orientador: Hildete Prisco Pinheiro / Dissertação (mestrado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Matemática, Estatística e Computação / Made available in DSpace on 2018-08-24T09:34:36Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Baldoni_PedroLuiz_M.pdf: 4328843 bytes, checksum: 0ab04f375988e62ac31097716ac0eaa5 (MD5) Previous issue date: 2014 / Resumo: Os Modelos Lineares Generalizados Mistos (MLGM) são uma generalização natural dos Modelos Lineares Mistos (MLM) e dos Modelos Lineares Generalizados (MLG). A classe dos MLGM estende a suposição de normalidade dos dados permitindo o uso de várias outras distribuições bem como acomoda a superdispersão frequentemente observada e também a correlação existente entre observações em estudos longitudiais ou com medidas repetidas. Entretanto, a teoria de verossimilhança para MLGM não é imediata uma vez que a função de verossimilhança marginal não possui forma fechada e envolve integrais de alta dimensão. Para solucionar este problema, diversas metodologias foram propostas na literatura, desde técnicas clássicas como quadraturas numéricas, por exemplo, até métodos sofisticados envolvendo algoritmo EM, métodos MCMC e quase-verossimilhança penalizada. Tais metodologias possuem vantagens e desvantagens que devem ser avaliadas em cada tipo de problema. Neste trabalho, o método de quase-verossimilhança penalizada (\cite{breslow1993approximate}) foi utilizado para modelar dados de ocorrência de doença em uma população de vacas leiteiras pois demonstrou ser robusto aos problemas encontrados na teoria de verossimilhança deste conjunto de dados. Além disto, os demais métodos não se mostram calculáveis frente à complexidade dos problemas existentes em genética quantitativa. Adicionalmente, estudos de simulação são apresentados para verificar a robustez de tal metodologia. A estabilidade dos estimadores e a teoria de robustez para este problema não estão completamente desenvolvidos na literatura / Abstract: Generalized Linear Mixed Models (GLMM) are a generalization of Linear Mixed Models (LMM) and of Generalized Linear Models (GLM). The class of models GLMM extends the normality assumption of the data and allows the use of several other probability distributions, for example, accommodating the over dispersion often observed and also the correlation among observations in longitudinal or repeated measures studies. However, the likelihood theory of the GLMM class is not straightforward since its likelihood function has not closed form and involves a high order dimensional integral. In order to solve this problem, several methodologies were proposed in the literature, from classical techniques as numerical quadrature¿s, for example, up to sophisticated methods involving EM algorithm, MCMC methods and penalized quasi-likelihood. These methods have advantages and disadvantages that must be evaluated in each problem. In this work, the penalized quasi-likelihood method (\cite{breslow1993approximate}) was used to model infection data in a population of dairy cattle because demonstrated to be robust in the problems faced in the likelihood theory of this data. Moreover, the other methods do not show to be treatable faced to the complexity existing in quantitative genetics. Additionally, simulation studies are presented in order to verify the robustness of this methodology. The stability of these estimators and the robust theory of this problem are not completely studied in the literature / Mestrado / Estatistica / Mestre em Estatística
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Modelos lineares mistos e generalizados mistos em estudos de adaptação local e plasticidade fenotípica de Euterpe edulis / Linear mixed models and generalized mixed models applied in studies of local adaptation and phenotypic plasticity of Euterpe edulis

Bautista, Ezequiel Abraham López 18 June 2014 (has links)
Este trabalho objetivou a avaliação da presença de plasticidade fenotípica e de adaptação local de três procedências de palmiteiro: Ombrófila Densa, Estacional Semidecidual e Restinga, em três locais no Estado de São Paulo: Parque Estadual da Ilha do Cardoso, Parque Estadual de Carlos Botelho e Estação Ecológica dos Caetetus, em ensaios de adaptação no estabelecimento (ou de semeadura) e de adaptação em juvenis (ou de crescimento). Os conjuntos de dados foram analisados utilizando estruturas de grupos de experimentos, com efeitos cruzados e aninhados. As variáveis relacionadas com a massa de matéria seca das plantas, nos dois ensaios, foram analisadas usando a abordagem de modelos lineares de efeitos mistos, por meio da incorporação de fatores de efeito aleatório, e fazendo uso do método da máxima verossimilhança restrita (REML) para estimação dos componentes de variância associados a tais fatores com um menor viés. Por outro lado, para a proporção de sementes germinadas, no ensaio de adaptação no estabelecimento, a análise estatística foi realizada a partir da abordagem dos modelos lineares generalizados mistos, sob a pressuposição de que a variável segue uma distribuição binomial, com função de ligação logito. O método da pseudo-verossimilhança foi empregado para obtenção da solução das equações de verossimilhança. Os resultados mostraram que as plantas originadas de sementes dos três biomas avaliados apresentaram um comportamento plástico, para todos os caracteres avaliados no ensaio de adaptação no estabelecimento. Com relação ao ensaio de adaptação em juvenis, a característica de plasticidade foi verificada somente para a massa de matéria seca da folha em plantas provenientes do bioma Estacional Semidecidual. A característica de adaptação local, apresentou-se de forma evidente no ensaio de adaptação no estabelecimento. Estes resultados evidenciaram que em cada local avaliado, as plantas originadas das sementes de diferentes procedências apresentaram um comportamento diferenciado nos caracteres relacionados à massa de matéria seca, podendo em alguns casos, tratar-se de adaptação local. Concluiu-se que os locais Carlos Botelho e Ilha do Cardoso são os mais favoráveis para a germinação das sementes de sua mesma procedência. / The aim of this work was to evaluate the presence of phenotypic plasticity and local adaptation of three provenances of the palm specie Euterpe edulis: Atlantic Rainforest, Seasonally Dry Forest and Restinga Forest, in permanent parcels inserted in three forest types of the São Paulo State (Brazil): Parque Estadual da Ilha do Cardoso, Parque Estadual de Carlos Botelho e Estação Ecológica dos Caetetus, in experiments of seedling establishment and juveniles plants growth. The data sets were analyzed using structures of groups of experiments, with crossed and nested effects. The variables related to dry matter content of plants in both assays were analyzed using linear mixed models (LMM) approach, through the incorporation of random effect factors, and using the restricted maximum likelihood method (REML) for estimation of variance components associated with these factors with a minor bias. On the other hand, germination proportion of the seeds at seedling establishment assay was analyzed using the generalized linear mixed models (GLMM) approach, under the assumption that the variable follows a binomial distribution, with logit link function. The pseudo-likelihood (PL) method was used to obtain the numerical solution of the likelihood equations. The results showed that, plants from seeds of the three biomes evaluated presented a plastic behavior for all characters assessed in the seedling establishment assay. In respect to juveniles adaptation assay, the phenotypic plasticity characteristic was observed only to the leaf dry matter content of plants from Seasonally Dry Forest biome. The local adaptation characteristic was clearly observed in the seedling establishment assay. These results showed that at each site evaluated, plants originating from seeds of different provenances exhibited different behavior on characters related to the dry matter content and may in some cases be local adaptation. It was concluded that locations Carlos Botelho and Ilha do Cardoso are the most favorable for seed germination of its same provenance.

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