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Identificação molecular de fitoplasmas associados ao enfezamento do repolho e análise epidemiológica da doença / Molecular identification of phytoplasmas associated to cabbage stunt and epidemiological analysis of disease

Ana Paula de Oliveira Amaral Mello 28 November 2007 (has links)
Uma doença, denominada de enfezamento, de etiologia desconhecida, tem sido observada nos campos de cultivo de repolho da região do cinturão verde de São Paulo. A doença tem causado sérios danos à cultura nos últimos anos. A sintomatologia apresentada pelas plantas afetadas tem sido caracterizada por clorose foliar, avermelhamento das nervuras e do limbo, enfezamento generalizado, proliferação de brotos e má formação da cabeça, de folhas e órgãos florais. A presença destes sintomas levou à suspeita da ocorrência de fitoplasma associado à doença. Com o objetivo de investigar o possível agente etiológico, plantas de repolho naturalmente infectadas foram coletadas em São Paulo e também nos Estados do Paraná e Rio Grande do Sul, onde a doença, recentemente, tem ocorrido com alta intensidade. Cigarrinhas que ocorrem em cultivos comerciais também foram amostradas em campos de Ibiúna/SP. Após a extração, o DNA total foi submetido ao teste de duplo PCR empregando-se os pares de primers universais P1/Tint e R16F2n/R2 e os pares específicos para identificação de fitoplasmas. Análises de PCR mostraram a amplificação consistente de fragmentos de DNA de 1,2 kb, evidenciando a associação constante de fitoplasma com tecidos das plantas sintomáticas e de insetos. O uso de primers específicos para identificação demonstrou a ocorrência de fitoplasmas afiliados ao grupos 16SrI e 16SrIII, tanto em repolho como nas cigarrinhas. Análises de RFLP, usando as enzimas de restrição AluI, Bsh 12361, HhaI HpaII, KpnI, MboI, MseI e RsaI confirmaram a ocorrência de fitoplasmas pertencentes aos referidos grupos no material vegetal e nos insetos. O padrão espacial de plantas sintomáticas no campo foi do tipo agregado e não houve evidência da disseminação planta a planta, indicando um papel mais importante do comportamento do vetor no arranjo espacial da doença do que de influências do patógeno ou do hospedeiro. / A disease called stunt, of unknown etiology, has occurred in cabbage crops located in the green belt region of the São Paulo State (Brazil). The disease has caused serious yield losses in the last years. The symptomatology exhibited by the affected plants has been characterized by foliar chlorosis, intense red coloration of leafs, general stunt, shoot proliferation and malformation of heads, leaves and floral parts. The presence of those symptoms suggested the occurrence of phytoplasma associated with the disease. In order to investigate the possible agent of the disease, naturally infected cabbage plants were collected from the States of São Paulo, and also from Paraná and Rio Grande do Sul, where the disease has occurred recently with level of intensity. Leafhoppers present in cabbage fields were sampled from Ibiúna, in São Paulo State. Total DNA was extracted and submitted to nested PCR with the universal primer pairs P1/Tint and R16 F2n/R2 and specific primers for phytoplasmas identification. PCR assays revealed the amplification of DNA fragments of 1.2kb, demonstrating consistently the presence of phytoplasma in the tissues from symptomatic plants and insects. Specific primers revealed the occurrence of phytoplasmas affiliated with the groups 16SrI and 16SrIII, both cabbage plants and leafhoppers. RFLP analyses using the restriction enzymes AluI, Bsh 12361, HhaI, HpaII, KpnI, MboI, MseI and RsaI confirmed the occurrence of phytoplasmas belonging to the same groups in plants and insects. Spatial pattern of symptomatic plants in the field was aggregated and there was no evidence of the spread plant-to-plant. This indicates a more important role of the vector behavior on spatial pattern than influences of the pathogen or host.
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Amarelo da ameixeira: caracterização molecular do fitoplasma e modelo de colonização do hospedeiro / Plum yellow: molecular characterization of the phytoplasma and colonization model of the host

Daniela Flores 02 October 2013 (has links)
No Brasil, o cultivo de ameixeira tem atingido significativa importância econômica em termos de rentabilidade. Embora rentável, a cultura exige cuidados constantes em relação aos danos provocados por doenças. Entre elas, o \'amarelo\', causado por fitoplasmas, tem se mostrado como uma doença de relevância nos países produtores desta fruta. Em pomares comerciais localizados em Paranapanema-SP, foram observadas ameixeiras (Prunus salicina) exibindo sintomas típicos de \'amarelos\', caracterizados por superbrotamento de ramos, redução no comprimento de entrenós, além de amarelecimento, deformação e redução do limbo foliar. Com objetivo de identificar o fitoplasma e determinar o modelo de colonização do hospedeiro pelo patógeno foi desenvolvido o presente estudo. Para isto, em três pomares, foram amostradas plantas sintomáticas, assintomáticas e sadias, pertencentes às variedades Gulfblaze e Azteca. O DNA total foi extraído de folhas e ramos e usado em duplo PCR com os iniciadores R16mF2/mR1 e R16F2n/R2, visando a detecção do fitoplasma. Os resultados confirmaram a presença de fitoplasma pela amplificação de fragmentos de DNA de 1,2 kb do gene 16S rRNA. Os produtos de PCR gerados por dez isolados de fitoplasmas de cada variedade foram clonados e três clones de cada isolado foram sequenciados. Uma vez que nenhum polimorfismo foi encontrado, uma sequência consenso foi selecionada para cada isolado e um isolado foi escolhido como representativo para cada variedade. Estas sequências foram designadas por PlY-BR01 e PlY-BR02, com 1.246 pb, e depositadas no GenBank sob os números de acesso KF499086 e KF499087, respectivamente. A sequência do 16S rRNA do fitoplasma da ameixeira apresentou 100% de identidade com o fitoplasma representante do grupo 16SrI-B (AY265208). A análise de RFLP virtual e o cálculo do coeficiente de similaridade, permitiram classificar o fitoplasma da ameixeira no grupo 16SrI-B. A análise filogenética revelou que o mesmo está estritamente relacionado ao subgrupo 16SrI-B. No estudo da colonização das plantas pelo patógeno, amostras da copa e raiz foram coletadas mensalmente, durante um ano, de plantas infectadas das variedades Gulfblaze e Azteca. O DNA total foi extraído e submetido ao PCR em Tempo Real com os iniciadores UniRNAForward/UniRNAReverse, para quantificar o fitoplasma nos tecidos do hospedeiro. O fitoplasma foi detectado tanto em amostras de copa como de raiz, em todas as árvores infectadas de ambas as variedades. A concentração do mesmo nos tecidos vegetais variou de 5,77x105 a 1,93x109 e 6,18x105 a 3,92x109 N°cópias/100 ng de DNA total, na copa e na raiz, respectivamente. O experimento mostrou uma flutuação sazonal na concentração do fitoplasma, sendo as maiores concentrações encontradas no verão, embora o fitoplasma tenha permanecido na parte aérea do hospedeiro mesmo no período mais frio, que compreende a fase de dormência da planta. Com base nestes resultados, ficou evidente que as amostras retiradas da copa e coletadas durante o período mais quente do ano são as mais adequadas para os procedimentos de detecção do fitoplasma, visando confirmar a diagnose feita com base na sintomatologia. / In Brazil, the cultivation of plum trees has achieved significant economic importance in terms of profitability. Although profitable, the culture demands attention in relation to damages provoked by diseases. Among them, the \'yellow\', caused by phytoplasmas, is a relevant disease present in the plum producing countries. In commercial orchards located in Paranapanema-SP region, were observed plum trees (Prunus salicina) exhibiting typical symptoms of \'yellow\', characterized by intense shoot proliferation, shortened internodes, generalized yellowing, leaf malformation and small leaves. The present study was conducted in order to identify the phytoplasma associated with symptomatic plants and determine the pattern of host colonization by the pathogen. Therefore, were sampled symptomatic, asymptomatic and healthy plants of the varieties Gulfblaze and Azteca, grown in three commercial orchards. Total DNA was extracted from leaves and shoots and submitted to nested PCR primed with R16mF2/mR1 and R16F2n/R2, in order to detect phytoplasma. The results confirmed the presence of phytoplasma by amplification of DNA fragments of 1.2 kb from 16S rRNA gene. The PCR products generated by ten phytoplasma isolates of each variety were cloned and three clones of each isolate were sequenced. Since no polymorphism was found, a consensus sequence was selected for each isolate and an isolate was chosen as representative for each variety. These sequences were designated by PlYBR01 and PlY-BR02, with 1,246 bp, and deposited in GenBank under the accession numbers KF499086 and KF499087, respectively. The sequence of the 16S rRNA of the phytoplasma founded in plum trees showed 100% identity with the phytoplasma representative of 16SrI-B group (AY265208). The virtual RFLP analysis and the calculation of the similarity coefficient, allowed classify the phytoplasma present in plum trees as a member of 16SrI-B group. Phylogenetic analysis supported that this phytoplasma is closed related to the 16SrI-B subgroup. In the study about plant colonization, the samples from leaves, shoots and root were monthly collected, for one year, from the infected plants of the varieties Gulfblaze and Azteca. Total DNA was extracted and submitted to the Real Time PCR with primers UniRNAForward/UniRNAReverse, in order to quantify phytoplasma in host tissues. The phytoplasma was detected in both aerial parts and roots in all infected trees of the two varieties. The concentration of the pathogen in plant tissues ranged from 5.77 x105 to 1.93 x109 and 6.18 x105 to 3.92 x109 N°copies/100ng total DNA in aerial parts and roots, respectively. The experiment showed a seasonal fluctuation in the concentration of the phytoplasma in plants, with the highest concentrations found in summer, although the phytoplasma have remained in the shoots of the host even in the coldest period, comprising the dormant phase of the plant. Based on these results, it was evident that the samples collected from the aerial parts and during the hottest period of the year are the most appropriate for detection of phytoplasma to confirm the diagnosis based on symptomatology.
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Estudo da freqüência de micoplasma no trato urogenital, conjuntiva e orofaringe de macacos silvestres (Cebus). / Study of mycoplasma frequency in the urogenital tract, ororpharynx, and conjunctiva of wild monkeys.

Renata Lopes Neto 03 September 2007 (has links)
Pesquisou-se a freqüência de Mollicutes na orofaringe, conjuntiva e trato urogenital de 58 macacos. Na orofaringe detectou-se Mollicutes em 55,17 % e Ureaplasma spp em 43,10%. As espécies identificadas nesta região foram: M. arginini (43,10%), M salivarium (41,37%), e M. pneumoniae (18,96%). No trato genital detectou-se Mollicutes em 27,58% sendo identificado M. arginini em 8,62%, A. laidlawii em 1,72 % e Ureaplasma spp em 32,75%. Na conjuntiva detectou-se Mollicutes em 29,31 % e A. laidlawii em 1,72 %. Os cultivos apresentaram limitações pelo alto índice de contaminação e obtiveram-se apenas dois isolamentos da conjuntiva. As espécies detectadas constituem-se o achado inicial destas bactérias em macacos no Brasil. / The frequency of Mollicutes in oropharynx, conjunctiva, and urogenital tract were accessed in 58 monkeys. In oropharynx, Mollicutes and Ureaplasma spp were detected in 55.17% and 43.01% of the samples, respectively. The identified species in this site included: M. arginini (43.10%), M. salivarium (41.37%), and M. pneumoniae (18.96%). In the urogenital tract, Mollicutes were detected in 27.58% of the samples; including M. arginini (8.62%), A. laidlawii (1.72%) and Ureaplasma spp (32.75%). In the conjunctiva, Mollicutes were detected in 29.31% and A. laidlawii in 1.72% of the animals. Mollicutes culture showed technical limitations because of the high level of contamination and only two isolates were obtained; both from conjunctival sites. The Mollicute specie surveillance of this study provided initial and new insights about these bacteria in Brazilian monkeys.
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Metabolic Investigation of the Mycoplasmas from the Swine Respiratory Tract / Investigation métabolique des mycoplasmes dans le tractus respiratoire des cochons

Galvao Ferrarini, Mariana 10 December 2015 (has links)
L'appareil respiratoire des porcs est colonisé par plusieurs bactéries, parmi lesquelles trois espèces de mycoplasmes : Mycoplasma flocculare, Mycoplasma hyopneumoniae et Mycoplasma hyorhinis. Lors de ce doctorat, notre principal objectif était de mieux comprendre le métabolisme différentiel dans chacune des espèces à l'aide de différentes approches. Nous avons reconstruit les réseaux métaboliques complets pour toutes les souches séquencées de ces trois espèces de mycoplasmes afin d'y détecter des caractéristiques distinctes. Nous avons pu montrer que, bien que les trois espèces de mycoplasmes du porc ont des capacités métaboliques semblables, certaines différences existent qui incluent, d'une part, le catabolisme de myo-inositol et un système plus complet pour l'absorption du glycérol, et d'autre part, une large gamme de moyens d'absorption de carbohydrates chez M. hyorhinis. L'utilisation de glycérol comme source de carbone, une activité qui est absente uniquement dans M. flocculare, produit du peroxyde d'hydrogène qui est toxique, ce qui peut expliquer l'absence de pathogénicité de cette espèce. L'absorption d'un plus large éventail de sources de carbone chez M. hyorhinis peut également expliquer pourquoi cette espèce est un contaminant largement connu des cultures cellulaires. Des expériences de croissance ont montré que les milieux définis décrits pour d'autres espèces de mycoplasmes ne sont pas appropriés pour la croissance de mycoplasmes du tractues respiratoire de porcs, et que la peptone est essentielle pour le maintien de la viabilité des cellules à la fois de M. hyopneumoniae et de M. flocculare dans des milieux définis. Dans ce travail, nous proposons également de nouveaux média définis qui, in silico, sont extrêmement appropriés pour les mycoplasmes du porc. Les données de métabolomique suggèrent que même si ces espèces sont extrêmement similaires du point de vue de leurs génomes et des métabolismes, les produits et les taux de réaction diffèrent et la régulation des gènes peuvent interférer directement dans le métabolisme. Pour expliquer ces différences ainsi que d'autres décrits dans la littérature qui suggèrent que certains types de régulation de l'expression du gène existent en effet dans ces espèces, nous avons également essayé de recueillir des informations sur de nouvelles séquences promotrices. Ainsi, cette thèse servira de base pour l'étude du métabolisme différentiel et des pathologies causées par les mycoplasmes du tractus respiratoire du porc et pourra aider à proposer des façons de prévenir à l'avenir le développement des maladies associées / In this PhD thesis, we presented three main types of analyses of metabolism, and in most cases involving symbiosis: metabolic dialogue between a trypanosomatid and its symbiont, comparative analyses of metabolic networks and exploration of metabolomics data. The respiratory tract of swines is colonized by several pathogenic bacteria, among which are three mycoplasma species: Mycoplasma flocculare, Mycoplasma hyopneumoniae, and Mycoplasma hyorhinis. In this work, we created whole-genome metabolic network reconstructions for all sequenced strains from these three Mycoplasma species. Similar to other Mycoplasma models all reconstructed networks exhibit low connectivity due to the simplicity of the biological model. We were able to show that the three swine mycoplasma species have similar metabolic capabilities. Interesting metabolic differences include the myo-inositol catabolism and a more complete system for glycerol uptake in M. hyopneumoniae and a wide range of carbohydrate uptake in M. hyorhinis. Glycerol conversion to DHAP, a missing activity only in M. flocculare, produces toxic hydrogen peroxide and may explain the lack of pathogenicity of this species. The uptake of a wider range of carbon sources in M. hyorhinis may also explain why this species is a wide-known contaminant in cell cultures. Growth experiments showed that defined media described for other Mycoplasma species are not suitable for the growth of respiratory tract swine mycoplasmas and that peptone is essential for the maintenance of cell viability of both M. hyopneumoniae and M. flocculare in defined media. Metabolomic data suggests that even though these species are extremely similar from a genomic and metabolic point of views, the products and reaction rates differ and gene regulation may interfere directly in metabolism. This, in turn, may account for many aspects still unknown that influence directly different levels of pathogenicity in each of them
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Detecção de Ureaplasma spp. e Mycoplasma agalactiae pela técnica da Reação em Cadeia da Polimerase (PCR) em sêmen de reprodutores ovinos

SOUSA, Francisco David Nascimento 08 February 2013 (has links)
Submitted by (lucia.rodrigues@ufrpe.br) on 2017-02-09T12:22:55Z No. of bitstreams: 1 Francisco David Nascimento Sousa.pdf: 1748878 bytes, checksum: f75f899a3117c09975b8cfcef18e67a6 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-02-09T12:22:55Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Francisco David Nascimento Sousa.pdf: 1748878 bytes, checksum: f75f899a3117c09975b8cfcef18e67a6 (MD5) Previous issue date: 2013-02-08 / The objective of this study was to detect the DNA of Ureaplasma spp. and Mycoplasma agalactiae in sheep semen by the technique of Polymerase Chain Reaction (PCR). Were analyzed 240 samples, 120 frozen semen obtained from central artificial insemination (AI) and 120 fresh semen of breeding sheep from the states of Alagoas, Ceará, Paraíba, Pernambuco and Rio Grande do Norte collected during the Northeastern Exposure animals in Recife. After collection of the samples were carried out DNA extraction and detection of genomic DNA of the agents studied. For the first time in Brazil, was detected the presence of agents Ureaplasma spp. and Mycoplasma agalactiae in samples of frozen semen of sheep. Samples of frozen semen, DNA was detected Ureaplasma spp. in 2.5% (3/120) and Mycoplasma agalactiae of 4.2% (5/120). For fresh semen was detected DNA of Ureaplasma spp. in 8.3% (10/120) of the samples and 6.7% (8/120) of Mycoplasma agalactiae When evaluating the association between the type of semen and DNA detection for Ureaplasma spp. and Mycoplasma agalactiae, a significant association was observed only for Ureaplasma spp. (p = 0.046), being more common detection of this micro-organism in fresh semen samples. We also observed positive samples Ureaplasma spp. and Mycoplasma agalactiae from the states of Paraíba, Pernambuco and Rio Grande do Norte. All samples from the states of Alagoas and Ceará results were negative. Results obtained in this study, there is the presence of DNA of these microorganisms in semen of the breedings sheep. Thus, it is suggested that techniques for detecting these agents must be used in insemination centers and breeding sheep with high genetic potential to maximize the efficiency of the sheep reproduction by preventing the spread of these pathogens. / Objetivou-se com este estudo detectar o DNA de Ureaplasma spp. e Mycoplasma agalactiae em sêmen de ovinos pela técnica da Reação em Cadeia da Polimerase (PCR). Foram analisadas 240 amostras, sendo 120 de sêmen congelado obtidas de centrais de inseminação artificial (IA) e 120 de sêmen fresco de reprodutores ovinos provenientes dos estados de Alagoas, Ceará, Paraíba, Pernambuco e Rio Grande do Norte coletados durante a realização da Exposição nordestina de animais em Recife,PE. Após a colheita das amostras, foram realizadas a extração de DNA e detecção de DNA genômico dos agentes estudados. Pela primeira vez no Brasil, foi detectada a presença dos agentes Ureaplasma spp. e Mycoplasma agalactiae em amostras de sêmen congelado da espécie ovina. Nas amostras de sêmen congelado, detectou-se DNA de Ureaplasma spp. em 2,5% (3/120) e de Mycoplasma agalactiae em 4,2% (5/120). Para o sêmen fresco, detectou-se DNA de Ureaplasma spp. em 8,3% (10/120) das amostras analisadas e 6,7% (8/120) de Mycoplasma agalactiae Ao avaliar a associação entre o tipo de sêmen e a detecção de DNA para Ureaplasma spp. e Mycoplasma agalactiae, observou-se associação significativa somente para Ureaplasma spp. (p= 0,046), sendo mais comum a detecção deste micro-organismo em amostras de sêmen fresco. Foram observadas ainda, amostras positivas para Ureaplasma spp. e Mycoplasma agalactiae provenientes dos estados da Paraíba, Pernambuco e Rio Grande do Norte. Todas as amostras oriundas dos estados de Alagoas e do Ceará obtiveram resultados negativos. Diante dos resultados obtidos neste estudo, constata-se a presença de DNA destes micro-organismos em sêmen de reprodutores ovinos. Desta forma, sugere-se que técnicas para detecção desses agentes sejam utilizadas em centrais de inseminação e em reprodutores ovinos com alto potencial genético, maximizando a eficiência da prática na reprodução de ovinos, evitando a disseminação destes patógenos.
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Exopolysaccharides of Mycoplasma pulmonis

Daubenspeck, James M. January 2009 (has links) (PDF)
Thesis (Ph.D.)--University of Alabama at Birmingham, 2009. / Title from PDF title page (viewed on Feb. 2, 2010). Includes bibliographical references (p. 64-72).
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Insect transmitted plant pathogenic mollicutes, Spiroplasma kunkelii and aster yellows witches' broom phytoplasma: from structural genomics to functional genomics

Bai, Xiaodong 22 December 2004 (has links)
No description available.
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Avaliação clínica e estudo da ocorrência de broncopneumonia em bovinos / Clinical evaluation and study of the occurence of bronchopneumonia in cattle

Oliveira, Bernardo Augusto França Dias de 27 July 2015 (has links)
As doenças respiratórias são consideradas um sério problema de sanidade, causando grandes perdas econômicas devido aos altos índices de morbidade e mortalidade, sendo responsáveis por 10 a 40% das mortes em animais adultos e por 17% das mortes durante o período perinatal. O objetivo deste trabalho foi determinar a ocorrência de agentes e buscar associações entre agentes e a broncopneumonia e a associação de sinais clínicos com os agentes presentes. Foram avaliados clinicamente e os dados coletados em ficha própria 96 animais de dois rebanhos da região de Bragança Paulista e Mococa ambas no Estado de São Paulo. Sangue total e lavado traqueobrônquico instilado em haste flexível e o restante da alíquota criopreservada, foram colhidos em animais jovens e adultos, com e sem raça definida e a ocorrência dos principais agentes etiológicos virais (BVDV, VSRB e BoHV) e bacterianos (Mannheimia haemolytica, Pasteurella multocida e micoplasma sp.) causadores de broncopneumonia em bovinos foram pesquisadas. Dos cultivos bacterianos específicos, as aliquotas criopreservada apresentaram 12/96 amostras positivas para mollicutes enquanto os cutivos utilizando as hastes foram 11/96 amostras positivas para P. multocida. No cultivo da P. multocida também foram encontradas Bacillus sp., Staphylococcus sp., Escherichia coli, Klebsiella oxytoca, Pseudomonas aeruginosa e Klebsiella pneumoniae sem que houvesse a ocorrência de M. haemolytica. PCR foi utilizada para detectar a classe mollicutes (68/96) e as espécies M. bovis (2/68), M. dispar (26/68) e M. mycoides subsp. mycoides (0/68). A técnica de vírus neutralização mostrou os seguintes resultados: 31/56 animais soreagentes para BVDV, 35/57 com BoVH e 54/58 com VSRB. Para análise estatística foi utilizado o teste do qui-quadrado em blocos ao acaso. Houve associação entre a presença de broncopneumonia em animais com BVDV (P=0,080) e com P. multocida (P=0,076). Animais da raça holandesa foram associados a presença de broncopneumonia (p= 0,095). Jovens com menos de 12 meses foram associados a presença de mollicutes (P=0,0177). A presença de som submaciço a percussão do gradil toráxico foi associado a ausência de mollicutes (P=0,025). A ausência de M. dispar foi associado a presença de sibilo (P=0,076) e de estertor úmido (P=0,046) na ausculta pulmonar. Houve uma chance maior de 5,5 vezes de apresentar tosse na presença de P. multocida enquanto na sua ausência hà uma maior chance dos animais apresentarem secreção mucosa (7,3) e mucopurulento (5,8), som submaciço (9,6), crepitação fina (13) e estertor úmido (5). Houve associação entre a ausência de M. bovis e a presença de som claro a percussão do gradil toráxico dos bovinos examinados. / Respiratory diseases are considered a serious problem of sanity, causing huge economic losses due to high rates of morbidity and mortality, accounting for 10-40% of deaths in adults and 17% of deaths during the perinatal period. The objective of this study was to determine the occurrence of agents and seek associations between agents and bronchopneumonia and the association of clinical signs with these agents. They were evaluated clinically and data collected in own record 96 animals of two herds of Bragança Paulista region and Mococa both in São Paulo. Whole blood and washed tracheobronchial were harvested in young and adult animals, Holstein and undefined breed and the occurrence of major viral etiologic agents (BVDV, BRSV and BoHV) and bacterial (Mannheimia haemolytica, Pasteurella multocida and Mycoplasma sp.) causing bronchopneumonia in cattle were surveyed. The specific bacterial cultures showed positive samples Mollicutes 12/96 and 11/96 samples positive for P. multocida. In the cultivation of P. multocida were also found Bacillus sp., Staphylococcus sp., Escherichia coli, Klebsiella oxytoca, Klebsiella pneumoniae, Pseudomonas aeruginosa and there was no occurrence of M. haemolytica. PCR was used to detect the class Mollicutes (68/96) and the species M. bovis (2/68), M. dispar (26/68) and M. mycoides subsp. mycoides (0/68). The virus neutralization technique showed the following results: 31/56 animals BVDV positive, 35/57 and 54/58 with BoVH with BRSV. Statistical analysis was performed using the chi-square test in blocks. There is an association between bronchopneumonia in animals and the presence of BVDV (p = 0.080) and P. multocida (P = 0.076). Holstein animals were associated with the presence of bronchopneumonia (p = 0.095). Calves under 12 months were associated with the presence of Mollicutes (P = 0.0177). The sound submassive present during percussion of the thoracic cage was associated with the absence of Mollicutes (P = 0.025). The absence of M. dispar was associated with presence of wheezing (P = 0.076) and wet rattle (P = 0.046) in lung auscultation. There was a greater chance of 5.5 times to present cough in the presence of P. multocida as in its absence there is a greater chance of the animals show mucous secretion (7.3) and mucopurulent (5.8), submassive sound (9.6 ), thin crackling (13) and wet rattle (5). There was an association between the absence of M. bovis and the presence of clear sound of chest cage percussion of the examined cattle.
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Avaliação clínica e epidemiológica das enfermidades da reprodução nos assentamentos de Presidente Epitácio e Mirante do Paranapanema / Clinical and epidemiological assement of reprodutive diseases in settlements from Presidente Epitacio and Mirante do Paranapanema

Aleman, Mario Augusto Reyes 18 October 2016 (has links)
A agropecuária familiar brasileira produz 70% da alimentação da população, possuindo importante papel social e econômico neste país. Os assentamentos do Pontal do Paranapanema produzem alimentos que são ofertados ao estado de São Paulo, sendo atividade leiteira a mais importante. As doenças infecciosas reprodutivas dos bovinos, causados por Leptospira spp., Herpes Virus Bovino Tipo 1(BoHV-1), Diarreia Viral Bovina (BVD), agentes da classe Mollicutes são importantes para a rentabilidade das produções agropecuárias do mundo inteiro. Dados epidemiológicos nos assentamentos do estado de São Paulo não existem. Este estudo teve como objetivo analisar a prevalência das enfermidades reprodutivas bacterianas e virais em bovinos de leite criados nos assentamento de Presidente Epitácio e Mirante do Paranapanema. Todos os animais foram submetidos ao exame específico do sistema reprodutivo e colheram-se amostras de soro e swab vaginal. A prevalência para BoHV-1, BVDV, Leptospira spp., e classe Mollicutes foi de 69,05%, 57,74%, 58,93% e 50%, respectivamente. Foi observado uma relação entre vacas multíparas e a presença de BoHV-1 e Leptospira spp. Foi observado também uma relação de animais com retenção de placenta com a presença de bactérias da classe Mollicutes e animais reagentes a anticorpos contra Leptospira spp. A prevalência destas enfermidades prova a existência destas em assentamentos na região do Pontal do Paranapanema, faz-se necessário o desenvolvimento de programas de políticas públicas para o monitoramento desta região / Brazilian\'s family settlements are responsible for 70% of total population feeding. It has an important social and economic role in Brazil. Settlements from Pontal do Paranapanema offering feed to the state of São Paulo and milk production is the most important activity. Bovine reproduction infectious diseases caused by Leptospira spp., Bovine Herpesvirus Type 1(BoHV-1), Bovine viral Diarrhoea (BVD) and Mollicutes are important to the dairy cattle industry all over the world. Epidemiological datas from settlements located in the state of São Paulo are not available. The aim of this study was to evaluate the prevalence of bacterial and viral reproductive infectious diseases dairy cattle raised in settlements from Presidente Epitácio e Mirante do Paranapanema. Specific physical examination of reproduction female system was performed and after that vaginal swabs samples and serum samples were collected. The prevalence of BoHV-1, BVDV, Leptospira spp., and Mollicutes was 69,05%, 57,74%, 58,93%, and 50%, respectively. An association between multiparous cows and the presence of BoHV-1 and Leptospira spp., was detected. Also an association between females with retained placenta and Mollicutes and cows with antibodies against Leptospira spp. was observed. The results showed the presence of reproduction diseases in settlements in Pontal do Paranapanema and it is necessary the development of public politics programs to control them
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Avaliação da participação dos Mollicutes e outros microrganismos de interesse genital na endometriose humana. / Participation of Mollicutes and genital interest microrganisms on human endometriosis.

Campos, Guilherme Barreto 14 September 2016 (has links)
A endometriose é uma doença caracterizada pela presença de endométrio fora do útero. O estudo objetivou detectar Mollicutes (M. genitalium, M. hominis, U. urealyticum e U. parvum), HPV e N. gonorrhoeae em amostras de swab endocervical, fluido peritoneal e tecido de biópsia de mulheres com (grupo caso) e sem endometriose (grupo controle) e avaliar os achados com a endometriose. No swab endocervical, prevalências de M. hominis (Mh), M. genitalium (Mg), U. urealyticum (Uu) e HPV foram maiores no grupo caso (43,7%, 14,1%, 8,5% e 5,9% respectivamente) que no grupo controle. No fluido peritoneal também foi maior no grupo caso (Mh: 27,8%; Mg: 40,7%; Uu: 3,7% e HPV: 9,6%) do que o grupo controle. No tecido de biópsia, Mh (5,9%) e Mg (13,2%) foram maiores no grupo caso. M. genitalium no fluido peritoneal foi associado à maior produção de IFN-&#947; e IL-1&#946; (p < 0,05). O perfil de downregulation de genes da inflamação foi acentuado na presença de M. genitalium. Upregulation ocorreu na presença de M. hominis. Mollicutes podem influenciar na resposta imune na endometriose. / Endometriosis is a disease characterized by the presence of endometrium outside of uterus. This study aimed to detect Mollicutes (M. genitalium, M. hominis, U. urealyticum and U. parvum), HPV and N. gonorrhoeae in samples of endocervical swab, peritoneal fluid and biopsied tissue from women with (case group) and without endometriosis (control group) and evaluate the finds with endometriosis. In swab samples the prevalence of M. hominis (Mh), M. genitalium (Mg), U. urealyticum (Uu) and HPV were higher in case group (43.7%, 14.1%, 8.5% e 5.9% respectively) than the control group. In the peritoneal fluid it was higher in the case group as well (Mh: 27.8%; Mg: 40.7%; Uu: 3.7% e HPV: 9.6%).In the biopsied tissue, Mh (5.9%) and Mg (13.2%) were higher in the case group. M. genitalium in the peritoneal fluid was associated to a higher production of IFN-&#947; and IL-1&#946;. Downregulation of inflammatory genes were accentuated when M. genitalium was detected. Upregulation occurred when M. hominis was detected. Mollicutes could influence in the immune response on endometriosis.

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