Made available in DSpace on 2017-07-21T19:59:55Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Jonathan Pena Castro.pdf: 3378425 bytes, checksum: 726a329ba31e1d12d715441e9de01e5a (MD5) Previous issue date: 2012-02-08 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / The species complex Astyanax scabripinnis are composed by fish with wide geographic distribution. Their populations are often isolated in small streams, separated by thousands of years, making it a very interesting system to study evolution. The use of different markers is crucial, since they allow inferences on the identification of individuals and therefore the study of populations. Thus, three populations isolated from each other of Campos do Jordão - SP, and two of Maringá - PR were analyzed by geometric morphometrics, correlating with data from presence / absence of B chromosomes, karyotypic and cytogenetic data, and reproductive data. Canonical variate analysis (CVA) showed that there are significant differences between populations (p <0.0001). The discriminant function analysis (DFA) between males and females showed intra and interpopulational sexual dimorphism. The separate CVA of males and females from each population also showed significant difference between them. All populations have 2n = 50 chromosomes arranged in 6m+22sm+10st+12a, the only exception was a population from Maringá, where there was 2n = 48 chromosomes, differentiated in 8m+26sm+6st+8a. B chromosome were only found in the population of Campos do Jordão (1850m altitude), confirming previous studies. In a morphometric analysis separated for individuals with and without B chromosomes, the CVA showed difference in body shape. Individuals with B chromosomes have the ventral anterior region less dilated than those without of this chromosomal element. The CVA also showed differences in body shape between 2n = 50 and 2n = 48 populations in Maringa. The fluorescent in situ hybridization showed differences between markers 5S rDNA and 18S rDNA for all populations. The data suggest pre zygotic reproductive isolation between Campos do Jordao populations. The analysis of all data indicates that the populations are differentiated from each other, indicating adaptation to different environments. This reinforces, among other factors, that these populations should represent different species within the species complex A. scabripinnis, followed by independent evolutionary pathways. / O complexo de espécies Astyanax scabripinnis corresponde a peixes com ampla distribuição geográfica. Suas populações encontram-se geralmente isoladas em pequenos riachos, separadas por milhares de anos, tornando esses animais interessantes ao estudo evolutivo. O uso de diferentes marcadores é fundamental, uma vez que permitem inferências na identificação dos indivíduos e consequentemente o estudo das populações. Dessa maneira, três populações isoladas entre si de Campos do Jordão - SP, e duas de Maringá - PR foram analisadas por morfometria geométrica, correlacionando com dados de presença/ausência de cromossomos B, dados cariotípicos e citogenéticos, além de dados reprodutivos. A análise de variáveis canônicas (CVA) mostrou que há diferenças significativas entre as populações (p<0,0001). A análise de função discriminante (DFA) entre macho e fêmea mostrou que há dimorfismo sexual intra e interpopulacional. A CVA separada para machos e fêmeas de cada população também mostrou diferença significativa entre elas. Todas as populações possuem 2n=50 cromossomos organizados em 6m+22sm+10st+12a, a exceção de apenas uma população de Maringá onde foi observado um cariomorfo com 2n=48 cromossomos, diferenciados em 8m+26sm+6st+8a. Não foi encontrada a presença de cromossomos B apenas na população de Campos do Jordão (662m de altitude), corroborando estudos anteriores. Na análise morfométrica associada a indivíduos com e sem cromossomos B, a CVA mostrou que há diferença na forma do corpo, sendo que os indivíduos com cromossomos B possuem a região ventral anterior menos dilatada dos que não possuem este elemento cromossômico. A CVA também apontou diferença na forma do corpo entre o cariomorfo 2n=50 e o 2n=48, em Maringá. A hibridação in situ fluorescente mostrou diferença entre os marcadores de rDNA 18S e rDNA 5S para todas as populações. Os dados reprodutivos sugerem isolamento pré zigótico entre as populações de Campos do Jordão. A análise de todos os dados aponta que as populações encontram-se diferenciadas entre si, indicando indivíduos adaptados a ambientes distintos. Isso reforça, entre outros fatores, que essas populações devem representar espécies diferentes, dentro do complexo de espécies A. scabripinnis, seguindo por caminhos evolutivos independentes.

Orientador: Ricardo Cardoso Benine / Resumo: Atualmente, os reservatórios artificiais de água causam grandes impactos e representam uma grande ameaça à biodiversidade de todo o mundo. Moenkhausia costae é uma espécie de peixe da Família Characidae, amplamente distribuída nos diversos ambientes da bacia do rio São Francisco, sendo presente no reservatório da UHE Três Marias. Observando populações coletadas na lagoa da represa e fora da mesma foram identificadas variações morfológicas notáveis. Trabalhos prévios com peixes demonstraram que populações alocadas em ambientes alterados por barramento de rios apresentavam variações morfológicas com relação à populações que permaneciam em ambiente natural. Neste trabalho avaliou-se a variação morfológica presente entre populações de M. costae que estão sob influência direta da lagoa da UHE Três Marias e populações sob condições naturais, fora da influência do reservatório. Para avaliar a variação morfológica existente entre populações de M. costae de ambos os ambientes, foram levantados caracteres morfológicos através das morfometrias linear e geométrica, sendo estas testadas posteriormente através de análises multivariadas. A morfometria linear demonstrou um padrão morfológico com formas mais limitadas nas populações da represa, concordando com os resultados exibidos pela morfometria geométrica, que também demonstrou formas corporais limitadas para as populações da represa. / Abstract: Currently, artificial water reservoirs are causing impacts and represent a major threat to biodiversity around the world. Moenkhausia costae is a fish species of the Characidae, and is widely distributed in the different environments of the rio São Francisco basin, being present in UHE Três Marias dam. Examining populations collected in and out of the dam influence area, remarkable morphological variations were identified. Previous works with fish showed that populations allocated in environments altered by dam’s construction presented morphological variations in relation to populations that remained in a natural environment. This work evaluated the morphological variation present among populations of M. costae that are under direct influence of UHE Três Marias lagoon and populations that are outside the influence of the dam. For this, morphological characters were collected through linear and geometric morphometry methodologies, which were later tested through multivariate analyzes. Linear morphometry demonstrated a morphological pattern with more limited patterns in dam populations, agreeing with the results exhibited by geometric morphometry, which also demonstrated limited body shapes for dam populations. / Mestre

Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico / O objetivo deste trabalho foi avaliar morfometricamente as modificações ocorridas ao longo de 500 anos nas estruturas maxilo-mandibulares de indivíduos da Costa Central do Peru. Foram utilizadas telerradiografias laterais de 30 crânios secos, sem deformidades esqueléticas e em normoclusão, do período Pré-colombiano (grupo Pré-colombiano) e de 30 peruanos nativos contemporâneos, com características esqueléticas e oclusais semelhantes, provenientes da mesma região geográfica (grupo Contemporâneo). Estas telerradiografias foram digitalizadas e 14 pontos cefalométricos foram marcados e utilizados como marcos anatômicos homólogos para a análise morfométrica. O tamanho do centróide, a forma e a alometria foram comparados entre os grupos para a amostra total, para homens e para mulheres, pelos testes de one-way ANOVA, função discriminante e regressão multivariada, respectivamente. As mesmas avaliações foram realizadas para homens e mulheres do mesmo grupo. O tamanho do centróide foi significativamente maior para o grupo Contemporâneo tanto para a amostra total, quanto para homens e mulheres, demonstrando que as estruturas maxilo-mandibulares dos indivíduos contemporâneos é maior do que de seus ancestrais. Quando homens e mulheres foram comparados intra-grupos o tamanho do centróide foi significativamente maior para os homens do grupo Contemporâneo, com a mesma tendência para os homens pré-colombianos, porém sem significância estatística. Observou-se diferenças significativas entre os grupos para a forma das estruturas maxilo-mandibulares indicando que ao longo do tempo houve um deslocamento posterior da região da pré-maxila e um deslocamento considerável para cima e para trás da apófise coronóide, uma abertura do ângulo na região goníaca e um alongamento no sentido vertical da região da sínfise mandibular. Essas mudanças morfológicas foram mais evidentes nas mulheres do que nos homens, parecendo haver maior efeito das tendências seculares nas mulheres. Não houve diferenças morfológicas entre homens e mulheres quando comparados intra-grupos, demonstrando que os resultados observados não foram influenciados pelo dimorfismo sexual. As diferenças de tamanho existentes intra-grupos foram responsáveis por apenas 6% das diferenças de forma, e portanto não há efeito causal do tamanho sobre as diferenças de forma observadas entre os grupos. Pode-se concluir que as diferenças morfológicas das estruturas maxilo-mandibulares encontradas neste estudo sugerem mudanças nas condições ambientais da população da Costa Central do Peru ao longo de 500 anos e podem contribuir para o melhor esclarecimento dos fatores etiológicos das más oclusões. / The purpose of this study was to perform a morphometric evaluation of the changes in the maxillo-mandibular structures of individuals of the Central Coast of Perualong 500 years.The sample consisted of lateral cephalometric radiographs of 30 dry skullsof the pre-columbian era, without skeletal deformities and in normocclusion (Pre-columbian group) and of 30 contemporaneous native Peruvians, with similar skeletal and occlusal characterisitics, from the same geographical region (Contemporaneous group). These radiographs were digitized and 14 cephalometric points were used as homologous anatomic landmarks for the morphometric analysis. Centroid size, shape and allometry were compared between groups for the whole sample, for males and for females by the one-way Anova, discriminant analysis and multivariate regression, respectively. The same evaluations were performed between males and females of the same groups. Centroid size was significantly larger for the Contemporaneous group for the total sample, as well as for males and for females, demonstrating that the maxilo-mandibular structures of the contemporaneous individuals are larger than those of their ancestors. When males and females were compared in the same group, centroid size was significantly larger for contemporaneous males, with the same tendency for pre-columbian males, but with no statistical significance. Significant differences between groups were found for maxillo-mandibular shape, indicating that there was a posterior displacement of the premaxilla , a considerable backward and upward displacement of the coronoid process, an opening of the gonial angle and a vertical elongation of the mandibular symphisis, along time. These changes were more evident in females than in males, suggesting a greater effect of secular trends in women. There were no morphological differences between males and females of the same group, demonstrating that these results were not influenced by sexual dimorphism. Differences in size for each group were responsible for only 6% of morphological differences, therefore, size has no causal effect on shape differences observed between groups. It can be concluded that the morphological differences of the maxillo-mandibular structures found in this study suggest that in 500 years there were environmental changes in the population of the Central Coast of Peru and these findings can contribute for the better understanding of the etiology of malocclusions.

Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico / O objetivo deste trabalho foi avaliar morfometricamente as modificações ocorridas ao longo de 500 anos nas estruturas maxilo-mandibulares de indivíduos da Costa Central do Peru. Foram utilizadas telerradiografias laterais de 30 crânios secos, sem deformidades esqueléticas e em normoclusão, do período Pré-colombiano (grupo Pré-colombiano) e de 30 peruanos nativos contemporâneos, com características esqueléticas e oclusais semelhantes, provenientes da mesma região geográfica (grupo Contemporâneo). Estas telerradiografias foram digitalizadas e 14 pontos cefalométricos foram marcados e utilizados como marcos anatômicos homólogos para a análise morfométrica. O tamanho do centróide, a forma e a alometria foram comparados entre os grupos para a amostra total, para homens e para mulheres, pelos testes de one-way ANOVA, função discriminante e regressão multivariada, respectivamente. As mesmas avaliações foram realizadas para homens e mulheres do mesmo grupo. O tamanho do centróide foi significativamente maior para o grupo Contemporâneo tanto para a amostra total, quanto para homens e mulheres, demonstrando que as estruturas maxilo-mandibulares dos indivíduos contemporâneos é maior do que de seus ancestrais. Quando homens e mulheres foram comparados intra-grupos o tamanho do centróide foi significativamente maior para os homens do grupo Contemporâneo, com a mesma tendência para os homens pré-colombianos, porém sem significância estatística. Observou-se diferenças significativas entre os grupos para a forma das estruturas maxilo-mandibulares indicando que ao longo do tempo houve um deslocamento posterior da região da pré-maxila e um deslocamento considerável para cima e para trás da apófise coronóide, uma abertura do ângulo na região goníaca e um alongamento no sentido vertical da região da sínfise mandibular. Essas mudanças morfológicas foram mais evidentes nas mulheres do que nos homens, parecendo haver maior efeito das tendências seculares nas mulheres. Não houve diferenças morfológicas entre homens e mulheres quando comparados intra-grupos, demonstrando que os resultados observados não foram influenciados pelo dimorfismo sexual. As diferenças de tamanho existentes intra-grupos foram responsáveis por apenas 6% das diferenças de forma, e portanto não há efeito causal do tamanho sobre as diferenças de forma observadas entre os grupos. Pode-se concluir que as diferenças morfológicas das estruturas maxilo-mandibulares encontradas neste estudo sugerem mudanças nas condições ambientais da população da Costa Central do Peru ao longo de 500 anos e podem contribuir para o melhor esclarecimento dos fatores etiológicos das más oclusões. / The purpose of this study was to perform a morphometric evaluation of the changes in the maxillo-mandibular structures of individuals of the Central Coast of Perualong 500 years.The sample consisted of lateral cephalometric radiographs of 30 dry skullsof the pre-columbian era, without skeletal deformities and in normocclusion (Pre-columbian group) and of 30 contemporaneous native Peruvians, with similar skeletal and occlusal characterisitics, from the same geographical region (Contemporaneous group). These radiographs were digitized and 14 cephalometric points were used as homologous anatomic landmarks for the morphometric analysis. Centroid size, shape and allometry were compared between groups for the whole sample, for males and for females by the one-way Anova, discriminant analysis and multivariate regression, respectively. The same evaluations were performed between males and females of the same groups. Centroid size was significantly larger for the Contemporaneous group for the total sample, as well as for males and for females, demonstrating that the maxilo-mandibular structures of the contemporaneous individuals are larger than those of their ancestors. When males and females were compared in the same group, centroid size was significantly larger for contemporaneous males, with the same tendency for pre-columbian males, but with no statistical significance. Significant differences between groups were found for maxillo-mandibular shape, indicating that there was a posterior displacement of the premaxilla , a considerable backward and upward displacement of the coronoid process, an opening of the gonial angle and a vertical elongation of the mandibular symphisis, along time. These changes were more evident in females than in males, suggesting a greater effect of secular trends in women. There were no morphological differences between males and females of the same group, demonstrating that these results were not influenced by sexual dimorphism. Differences in size for each group were responsible for only 6% of morphological differences, therefore, size has no causal effect on shape differences observed between groups. It can be concluded that the morphological differences of the maxillo-mandibular structures found in this study suggest that in 500 years there were environmental changes in the population of the Central Coast of Peru and these findings can contribute for the better understanding of the etiology of malocclusions.

Theropoda foram os dinossauros mais bem sucedidos durante e Era Mesozoica e mantiveram-se bem diversos até os tempos presentes. Dentre eles, Tyrannosauroidea e Ceratosauria foram amplamente distribuídos entre os hemisférios norte e sul durante os Períodos Jurássico e Cretáceo, respectivamente. Ambos foram predadores de topo, com formas basais possuindo crânios pequenos, pescoços compridos, pernas e caudas alongadas; enquanto as formas mais derivadas eram caracterizadas com crânios maiores, pescoços curtos e membros anteriores e caudas reduzidas. Apesar de Tyrannosauroidea não ser próximo filogeneticamente de Ceratosauria, esse padrão evolutivo é encontrado em ambas as linhagens. Na presente tese a evolução de ambos os clados é testada utilizando morfometria geométrica nos elementos cranianos, além de medidas lineares e descrições qualitativas. Foram visitadas no total 17 coleções paleontológicas distribuídas no Brasil, Argentina, EUA, Mongólia e China a fim de coletar dados sobre terópodes. Os espécimes examinados foram fotografados, medidos e descritos. Os dados morfométricos foram tratados utilizando os softawares da série TPS e MorphoJ resultando em 54 landmarks nos caracteres cranianos. A fim de avaliar a relação entre os crânios e os landmarks, foram excluídos alguns landmarks do conjunto de dados original. Todos os conjuntos de dados resultantes mostraram poucas variações no morfoespaço, independente do número de landmarks. Foi concluído que a parte anterior do crânio desenvolve-se independentemente da região posterior, após a fenestra anterorbital, em ambos os clados. Ceratosauria é o clado com maior disparidade entre os terópodes carnívoros, especialmente Carnotaurus sastrei. Tyrannosauroidea apresentaram crânios mais conservativos. A disparidade morfológica está relacionada à antiguidade das linhagens e ampla distribuição geográfica. A análise de regressão linear demonstrou que Tyrannosaurus rex pode apresentar grande amplitude fenotípica durante o desenvolvimento ontogenético, e sugere que Nanotyrannus e Raptorex sejam sinônimos juniores de Tyrannosaurus e Tarbosaurus baatar respectivamente. O desenvolvimento ontogenético de Ceratosauria é difícil de avaliar, no entanto Limusaurus inextricabilis apresenta diversas mudanças cranianas durante a fase de crescimento, sugerindo perda de todos os dentes, migração posterior da fenestra pró-maxilar, aumento da órbita e rostro. Ceratosauria e Tyrannosauroidea aumentam de tamanho durante o desenvolvimento filogenético, mas apesar da estrutura corporal ser semelhante, não há convergência morfológica e funcional entre os dois clados. A única convergência entre Tyrannosauroidea e Ceratosauria parece ser ecológica. Tyrannosauridae gráceis como Gorgosaurus libratus, Alioramus altai e juvenis de Tyrannosaurus poderiam ter funções ecológicas semelhantes à Abelisauridae. Por outro lado, Tyrannosauridae mais robustos como Tyrannosaurus, Tarbosaurus e Daspletosaurus torosus poderiam xi ter um nicho mais amplo. Acerca da distribuição e funções ecológicas de Abelisauridae, esse clado poderia ter empurrado Carcharodontosauridae para a extinção, uma vez que ambos apresentam similares convergências craniodentárias e mecânicas. / Theropods were the most successful dinosaurs during the Mesozoic Era, being still well diversied until recent times through the clade Aves. Among them, Tyrannosauroidea and Ceratosauria had a wide distribution, being commonly found on the Northern and Southern Hemispheres, respectively, in the Jurassic and Cretaceous Periods. Both were top predators, known in its basal form, to have small heads, long necks, long forelimbs and tails, whereas the most derived forms were characterized by a large head, short neck, short forelimb and tail. Although Tyrannosauroidea is not phylogenetically close to Ceratosauria, a similar developmental pattern is found in both lineages. In the present thesis, I assessed the evolutionary pattern of morphological shape in both clades using landmark-based geometric morphometric techniques on their skulls, along with some linear measurement and qualitative descriptions. Seventeen paleontological collections distributed in Brazil, Argentina, USA, Mongolia, and China were visited to collect data on these theropods. Specimens examined were photographed, measured and described. The morphometric data were treated using the software TPS series and MorphoJ resulting in 54 landmarks on skull characters. To assess different relationships among the landmarks and the skulls I excluded some landmarks in the original dataset. All datasets show few variations in morphospace, independent of the number of landmarks. Here, I conclude that the anterior part of the skull developed independently from the posterior part of the braincase (posterior to the antorbital fenestra) in both groups independently. Ceratosauria is the clade with more disparity among carnivorous theropods, especially when considering Carnotaurus sastrei. Tyrannosauroidea shows signs of having more conservative skulls. The development of morphological disparity is related to old lineages with long geographical distributions. The linear regression showed that Tyrannosaurus rex could have been more phenotypically spread during ontogenetic development, suggesting that Nanotyrannus and Raptorex are junior synonyms of Tyrannosaurus and Tarbosaurus baatar, respectively. Ontogenetic traits in Ceratosauria are difficult to assess, but Limusaurus inextricabilis showed high rates of change on its skull throughout its development, suggesting that they might loose all teeth, and have xii posterior migration of the promaxillary fenestra, increasing the orbit and snout during the ontogenetic development. Ceratosauria and Tyrannosauroidea show a tendency to larger and heaver forms from basal to more derived forms in their phyogeny. Although main body plan is similar in both group, there are neither morphological nor functional convergences between Ceratosauria and Tyrannosauroidea. The only observed convergence between Tyrannosauridae and Ceratosauria appears to be ecological. Gracile Tyrannosauridae such as Gorgosaurus libratus, Alioramus altai and juvenile Tyrannosaurus may have had similar ecological roles with Abelisauridae. On the other hand, Tyrannosauridae such as Tyrannosaurus, Tarbosaurus and Daspletosaurus torosus may have had a broader niche. Concerning distribution and ecological functions of Abelisauridae, this clade may have pushed another southern clade, the Carcharodontosauridae, to extinction since both clades had similar craniodental and mechanical skull morphologies.

Vários estudos sobre ontogenia e assimetria foram e vêm sendo realizados com cetáceos odontocetos através da utilização da morfometria convencional. Frequentemente compara-se o tamanho de estruturas do sistema respiratório de ambos os lados do crânio para avaliar a assimetria de tamanho e analisa-se o aumento de tamanho do corpo com a idade para avaliar ontogenia. Porém, através da morfometria convencional nem sempre é possível descrever ou representar a variabilidade de forma dos organismos, sendo que informações sobre a forma craniana dos odontocetos são bastante escassas. A morfometria geométrica é uma técnica que vem sendo amplamente utilizada em estudos de comparação da forma dos organismos, a qual leva em consideração o caráter geométrico das formas biológicas e analisa estatisticamente sua variação. Além disso, possibilita a realização de descrições independentes de forma e tamanho, o que permite que os mesmos sejam analisados separadamente. Sendo assim, este estudo se propôs a investigar as alterações ontogenéticas na forma e tamanho do crânio do boto-cinza, Sotalia guianensis, buscando alterações cranianas entre indivíduos de diferentes classes etárias, além de verificar a existência e analisar a assimetria direcional na forma e tamanho craniano para esta espécie. Para isso, os crânios foram digitalizados através de um braço digitalizador e depois de um tratamento geométrico as configurações geradas foram analisadas estatisticamente, a partir dos seus componentes de forma e tamanho. Foi observada assimetria de tamanho e forma para muitas das estruturas cranianas estudadas, notando-se diferenças com relação à assimetria entre as subunidades de desenvolvimento do crânio. Com relação à ontogenia, verificou-se um padrão semelhante para a alteração da forma e do tamanho com a idade, evidenciando que, tanto a forma como o tamanho craniano, se estabilizam por volta dos oito anos de idade. / Several studies exploring the ontogeny and asymmetry involving the skull and skeleton of the species of the Suborder Odontoceti have been performed using traditional morphometric techniques. Ontogenetic studies are usually based on the relationship between body size and age, while those focusing on the existence and degree of asymmetry compare the size of skull elements related to the respiratory tract. However, traditional morphometrics can not describe or represent adequately the variability of shape between organisms and therefore information about shape of dolphin skulls are very scarce. Geometric Morphometrics is a toolbox of techniques that is been widely applied in studies comparing the shape of organisms taking into consideration the biological shapes and analyzing their variation statistically. In addition, this technique allows to independently describe both shape and size separately, as well as exploring their relationship. The main objective of this study is to investigate the changes in skull shape and size during the ontogeny for the estuarine dolphin, Sotalia guianensis, characterizing the shape of the skull among different age groups. The second goal is to verify and analyze directional asymmetry in skull size and shape for this species. Dolphin skulls were scanned using a Microscribe-3D digitizer, statistically analyzing size and shape of the configurations created after translating, rotating and rescaling the original variables. Asymmetry in size and shape was detected for some cranial structures. There were also differences in asymmetry degree between the development subunits of the skull. For the ontogenetic trajectory it was detected a similar pattern of changes in shape and in size with age, in which both are stabilizing around eight years old for this species.

Submitted by Mario BC (mario@bc.ufrpe.br) on 2017-10-26T13:52:15Z No. of bitstreams: 1 Sandra Cristina Soares da Luz.pdf: 1930040 bytes, checksum: 36344f947e80a6fe3f4734c7d7126fa1 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-10-26T13:52:15Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Sandra Cristina Soares da Luz.pdf: 1930040 bytes, checksum: 36344f947e80a6fe3f4734c7d7126fa1 (MD5) Previous issue date: 2016-02-29 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - CAPES / Several species of Cichla were supposedly introduced in dams, lakes and reservoirs of Brazil causing serious damage to local wildlife. Cichlids captured in Paulo Afonso hydroelectric complex (BA) have uncertain classification due to the fact of not sharing the morphometric discriminant characters and patterns of colorations. This diversity in the form can be attributed to the introduction of more than one species or to the occurrence of hybrids or even may be associated with different stages of gonadal maturation. For the identification of individuals sampled in this study, we used moleculares tools (COI and microsatellites), in addition to morphometric measurements, meristic counts fish and geometric morphometry. Was also performed an evaluation of the reproduction of individuals. Morphometric measurements and meristic counts of fish confirmed the taxonomy of species, but genetic analyses revealed the occurrence of a single species, Cichla monoculus, in the complex. The haplotype analysis pointed to a population that suffered and bottleneck effect in the process of expansion. The different patterns and colors were evaluated with respect to reproductive parameters such as length of first maturity, gonadal gonadossomatic index, and condition factor, stages of gonadal development, fecundity and reproductive period. It was observed a predominance of females relative to males, a reduction in the size of first maturity relative to the natural habitat of the species and a long reproductive period, with peaks of RGS related to rainy season in the region. The morphometry was not allowed to associate the differences of form and colour to the maturational stages. However, a differentiation was observed between the staining patterns for the sample, with the morphotype "gray" with the more elongated body, and with the mouth a lower position compared to the morphotype "yellow". These changes can be attributed to phenotypic plasticity in the environment occupied by cichlids. These morphotypes might be splitting up, there is a crossing between types, through the choice of partner by color, and if the environmental pressure persist, it can lead to speciation of Cichla monoculus. / Várias espécies de Cichla foram supostamente introduzidas em açudes, lagos e reservatórios do Brasil, causando sérios prejuízos à fauna local. Os ciclídeos (Cichla) capturados no Complexo Hidrelétrico de Paulo Afonso (BA), na bacia do São Francisco, têm apresentado identificação incerta, devido ao fato de não compartilharem caracteres morfométricos discriminantes e padrões de colorações. Essa diversidade na forma pode ser atribuída tanto à introdução de mais de uma espécie, à ocorrência de híbridos ou mesmo associados a diferentes estágios de maturação gonadal. Para a identificação dos indivíduos amostrados neste trabalho, foram utilizadas ferramentas moleculares (COI e microssatélites), além de medições morfométricas, contagens merísticas dos peixes e morfometria geométrica. Também foi realizada uma avaliação da reprodução dos indivíduos, para verificar possíveis relações com os “tipos” encontrados. As medições morfométricas e contagens merísticas dos peixes não confirmaram a taxonomia da espécie, contudo as análises genéticas revelaram a ocorrência de uma única espécie, Cichla monoculus, em todo o Complexo. As análises haplotípicas apontaram para uma população que sofreu efeito gargalo e se apresenta em processo de expansão. Os diferentes padrões de fora e cores foi avaliado com relação a parâmetros reprodutivos como comprimento de primeira maturação gonadal, índice gonadossomático, fator de condição, estádios de desenvolvimento gonadal, período reprodutivo e fecundidade. Observou-se uma predominância de fêmeas com relação aos machos, uma redução do tamanho de primeira maturação em relação ao habitat natural da espécie e um longo período reprodutivo, com picos de RGS relacionados ao período chuvoso da região. A morfometria não permitiu associar as diferenças da forma e coloração aos estádios maturacionais. Contudo, foi observada uma diferenciação entre os padrões de coloração para a forma, com o morfotipo “cinza” com o corpo mais alongado, mais baixo e com a boca uma posição mais inferior em relação ao morfotipo “amarelo”. Estas mudanças podem ser atribuídas à plasticidade fenotípica da espécie em relação ao ambiente que ocupam. Se os cruzamentos forem preferenciais por morfotipo, através da escolha do parceiro por coloração; e se a pressão ambiental persistir, é provável que uma especiação do Cichla monoculus venha a ocorrer nesta bacia .

Submitted by Luciana Ferreira (lucgeral@gmail.com) on 2016-04-18T13:13:09Z No. of bitstreams: 2 Dissertação - Núbia Carla Santos Marques - 2012.pdf: 5302936 bytes, checksum: c25e3aaf227db746b8278612e0607882 (MD5) license_rdf: 23148 bytes, checksum: 9da0b6dfac957114c6a7714714b86306 (MD5) / Approved for entry into archive by Luciana Ferreira (lucgeral@gmail.com) on 2016-04-18T13:14:47Z (GMT) No. of bitstreams: 2 Dissertação - Núbia Carla Santos Marques - 2012.pdf: 5302936 bytes, checksum: c25e3aaf227db746b8278612e0607882 (MD5) license_rdf: 23148 bytes, checksum: 9da0b6dfac957114c6a7714714b86306 (MD5) / Made available in DSpace on 2016-04-18T13:14:47Z (GMT). No. of bitstreams: 2 Dissertação - Núbia Carla Santos Marques - 2012.pdf: 5302936 bytes, checksum: c25e3aaf227db746b8278612e0607882 (MD5) license_rdf: 23148 bytes, checksum: 9da0b6dfac957114c6a7714714b86306 (MD5) Previous issue date: 2012-03-02 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - CAPES / Ecological and behavior species traits could have their origin in ancestor choice or being shaped by the environment. Studies that disassociated ecological and phylogenetic traits of species can be a problem, being the exclusion of one or another perspective weakening the general evolutionary explanation. Thereby, the aim of this study is to dissociate the ecological and phylogenetic effects, allowing to realize inferences about the process that shaped anuran communities. The present thesis was structured in two chapters: i) the aim of the first chapter was to analyze how tadpoles ecological preferences by different guilds (mainly the microhabitat choice) can be explained for ecological interactions (measured by morphological similarities) or evolutionary relationships among species (measured by phylogenetic distance). We found that, both the interspecifics relationships and the evolutionary history were important to explain the tadpoles microhabitat selection. However, the importance of these factors changed in function of the criterion to measure the morphological similarities (traditional or geometric morphometric). ii) The second chapter aims to test if the testes weight in anurans with different temporal mating strategies (prolonged or explosive) are affected by ecological and/or phylogenetic factors, and if the sexual selection acts in different ways according to temporal mating strategies. We didn‟t find associations of phylogeny and testes weight, being the contemporary factors, as the reproductive strategy of anurans, more important to explain the observed variation. Explosive breeders have the testes weight association with males and females size, which suggests sperm competition. Prolonged breeders have the testes weight association just with female size, suggesting that the sperm competition is less likely to occur. / Características ecológicas ou comportamentais das espécies podem ter sua origem na escolha do ancestral em comum, ou serem moldadas pelo ambiente recente. A dissociação dos estudos em filogenéticos ou ecológicos se torna um problema, sendo que a exclusão de uma ou outra perspectiva enfraquece a explicação evolutiva geral. Desse modo, o presente estudo visou quantificar a contribuição de efeitos ecológicos e filogenéticos, permitindo realizar inferências sobre os processos que modelaram as comunidades de anfíbios anuros. No primeiro capítulo o objetivo foi analisar como as preferências ecológicas de girinos de diferentes guildas (principalmente a escolha de microhábitat) podem ser explicadas por interações ecológicas (medidas por similaridade morfológicas) ou por relações evolutivas entre as espécies (medidas por distância filogenética). De modo geral, tanto as interações interespecíficas quanto a história evolutiva foram importantes para explicar a seleção de microambientes das larvas de diferentes espécies de anuros. Entretanto, a importância destes dois fatores variou em função do critério para a medição da similaridade morfológica (Morfometria tradicional ou geométrica). No segundo capítulo o objetivo foi testar se o peso do testículo em anuros com diferentes estratégias temporais de reprodução (prolongada ou explosiva) são afetados por fatores ecológicos e/ou filogenéticos, e se a seleção sexual atua de diferente maneira de acordo com a estratégia temporal de reprodução. Não encontramos associação da filogenia com o peso dos testículos, sendo fatores contemporâneos, como a estratégia reprodutiva de anuros, mais importantes para explicar a variação encontrada. Reprodutores explosivos possuem associação do peso do testículo com o tamanho do macho e da fêmea, o que indica a possibilidade de competição por esperma. Já reprodutores prolongados tiveram associação do peso do testículo apenas com o tamanho da fêmea, indicando que a competição por esperma é menos provável de ocorrer.

Submitted by Marlene Santos (marlene.bc.ufg@gmail.com) on 2016-07-28T16:40:34Z No. of bitstreams: 2 Tese - Núbia Carla Santos Marques - 2016.pdf: 2449653 bytes, checksum: 5c7b386d16140f146b1b891f400d91dc (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) / Approved for entry into archive by Luciana Ferreira (lucgeral@gmail.com) on 2016-08-01T12:57:44Z (GMT) No. of bitstreams: 2 Tese - Núbia Carla Santos Marques - 2016.pdf: 2449653 bytes, checksum: 5c7b386d16140f146b1b891f400d91dc (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) / Made available in DSpace on 2016-08-01T12:57:44Z (GMT). No. of bitstreams: 2 Tese - Núbia Carla Santos Marques - 2016.pdf: 2449653 bytes, checksum: 5c7b386d16140f146b1b891f400d91dc (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Previous issue date: 2016-03-18 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - CAPES / Tadpoles of anuran species that occur in Cerrado can be found in several types of habitats. This habitat plasticity is possible because tadpoles have a high diversification in morphological adaptations that ensure an optimal performance in different ecological contexts. In this study, we were interested to investigate how environmental and spatial factors can explain the patterns of occurrence and distribution of tadpoles in Brazilian Cerrado and the interaction with tadpoles‘ morphological variation. We found that occurrence of tadpoles was explained by environmental variables and seven morphology-environment interactions. The most common tadpoles morphological change is related to body and tail size, and in eyes, nostril and mouth positions. Tadpoles‘ assemblage composition and morphological variation have significantly affected by spatial factors, but local environmental factors also play a major role defining morphological variation, although to a small degree. We discuss ecomorphological guilds of tadpoles and suggest that in larger guild (benthic tadpoles) can have morphology-environment interaction, while in the smaller ones (nektonic tadpoles) changes in feeding behavior and habitat selection is more common. There is a lack of knowledge about amphibian diversity, abundance and occurrence in Brazilian Cerrado and our study provide additional information about environmental and spatial factors that contribute to the patterns of occurrence and distribution of species. Abiotic factors (e.g. vegetation in ponds and land use) and spatial factors can contribute to individuals‘ phenotype changes and play a role in patterns of occurrence and tadpoles‘ assemblage composition. / Girinos de anuros que ocorrem no Cerrado podem ser encontrados em diversos tipos de habitats, sendo essa plasticidade de hábitats possível devido as adaptações morfológicas que asseguram uma boa performance em diferentes contextos ecológicos. Nesse presente estudo, nós investigamos como fatores ambientais e espaciais podem explicar os padrões de ocorrência e distribuição de girinos do Cerrado, além da interação com a variação morfológica dos indivíduos. A ocorrência dos girinos foi explicada por variáveis ambientais e sete interações morfologia-ambiente, sendo as mudanças morfológicas mais comuns: variação no tamanho do corpo e da cauda e mudanças nas posições dos olhos, narina e boca. A composição e a variação morfológica da assembleia de girinos são significativamente afetadas por fatores espaciais, mas fatores ambientais locais também desempenham um importante papel definindo a variação morfológica dos girinos, embora em um menor grau. Abordamos as guildas ecomorfológicas dos girinos e sugerimos que em guildas maiores pode haver variação morfológica atreladas as variáveis ambientais, enquanto nas menores mudanças no comportamento de forrageio e na seleção de hábitat são mais comuns. O presente estudo fornece informações adicionais sobre fatores ambientais e espaciais que contribuem para os padrões de ocorrência e distribuições das espécies de anuros. Fatores abióticos, por exemplo presença de vegetação e uso da terra ao redor da poça, também podem estar agindo mudando o fenótipo dos indivíduos e determinando a ocorrência e a composição das assembleias. Fatores espaciais também são determinantes em assembleias de girinos, sendo um grupo que possui baixa capacidade de dispersão. Girinos estão, em geral, limitados a poça que foi previamente escolhida pelo adulto, e processos neutros como nascimentos e mortes aleatórias na população podem operar nas assembleias.

Submitted by Divisão de Documentação/BC Biblioteca Central (ddbc@ufam.edu.br) on 2016-12-13T13:42:10Z No. of bitstreams: 1 Dissertação Parcial - Gisele C. M. Valdevino.pdf: 1579242 bytes, checksum: ac97271a24c9541ad8b59f219b0a58d5 (MD5) / Approved for entry into archive by Divisão de Documentação/BC Biblioteca Central (ddbc@ufam.edu.br) on 2016-12-13T13:42:45Z (GMT) No. of bitstreams: 1 Dissertação Parcial - Gisele C. M. Valdevino.pdf: 1579242 bytes, checksum: ac97271a24c9541ad8b59f219b0a58d5 (MD5) / Approved for entry into archive by Divisão de Documentação/BC Biblioteca Central (ddbc@ufam.edu.br) on 2016-12-13T13:43:19Z (GMT) No. of bitstreams: 1 Dissertação Parcial - Gisele C. M. Valdevino.pdf: 1579242 bytes, checksum: ac97271a24c9541ad8b59f219b0a58d5 (MD5) / Made available in DSpace on 2016-12-13T13:43:19Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Dissertação Parcial - Gisele C. M. Valdevino.pdf: 1579242 bytes, checksum: ac97271a24c9541ad8b59f219b0a58d5 (MD5) Previous issue date: 2016-05-04 / CAPES - Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / The Amazonian manatee (Trichechus inunguis) is endemic to the Amazon basin and the only freshwater sirenian. Apomorphies features relative to other Trichechidae derived from its adaptation to freshwater environment and it is distributed from the headwaters of rivers in Ecuador, Peru and Colombia to Amazon River estuary in Brazil. While studies of the morphology of this species, no cranial ontogenetic study was developed over its distribution. Morphological studies in Trichechidae have been conducted through the conventional morphometry, which cannot always describe or represent the variability of form from organisms. Geometric morphometrics is a toolbox that is been widely applied in studies comparing the shape of organisms taking into consideration the biological shapes and analyzing their variation statistically. To understand the ontogeny and morphology of this species, the aim of this study is to analyze the variation in size and shape of the Amazonian manatee skull throughout its ontogeny and morphological variations in sexual and geographic levels. A total of 80 skulls and 102 mandibles were used to collect morphometric geometric data in two and three dimensions. These skulls and mandibles were grouped into three age classes: calves, young and adult according to their origin and then were analyzed geometrically, seeking cranial changes between individuals of age groups and between specimens from different rivers of the Amazon basin. For this skulls and mandibles were scanned and after a geometrical treatment, configurations generated were analyzed statistically by components of shape and size. Amazonian manatee skull presents positive allometry and no sexual dimorphism was observed in this species. The morphological changes were observed in shape of the skull and mandible, which is influenced by size of the structures. The observation of the pattern of closure of supraoccipital - exoccipital synchondrosis and the classification proposed by Amaral et al. (unpublished data) were used to determine three age classes from shape of skulls and jaws. Specimens from white water rivers presented themselves different from other rivers from black and clear water. Within the group of specimens from different rivers of white water, the group originating from Japurá river presents different from the other groups, which are: Amazon, Solimões and Javari rivers. / peixe-boi-da-Amazônia (Trichechus inunguis) é endêmico da bacia Amazônica e exclusivo de água doce. Apresenta apomorfias em relação aos outros triquequídeos, derivadas de sua adaptação ao ambiente dulcícola e distribui-se desde as cabeceiras de rios no Equador, Peru e Colômbia até o estuário do Rio Amazonas, no Brasil. Apesar dos estudos sobre a morfologia desta espécie, nenhum estudo ontogenético sincraniano foi desenvolvido ao longo de sua distribuição. Estudos morfológicos em triquequídeos vêm sendo realizados através da morfometria convencional, que nem sempre consegue descrever ou representar a variabilidade de forma dos organismos. A morfometria geométrica é uma técnica de comparação da forma dos organismos e leva em consideração a geometria das formas biológicas, analisando estatisticamente sua variação. Visando compreender a ontogenia e morfologia desta espécie, o objetivo deste estudo é analisar as variações de forma e tamanho do sincrânio do peixe-boi-da- Amazônia ao longo de sua ontogenia e das variações morfológicas sincranianas a níveis sexual e geográfico. Um total de 80 crânios e 102 mandíbulas foram utilizados para a coleta de dados geométricos morfométricos em duas e três dimensões. Estes crânios e mandíbulas foram agrupados em três classes etárias: filhote, jovem e adulto e de acordo com sua proveniência e então foram analisados geometricamente, buscando alterações cranianas entre indivíduos das classes etárias e entre os exemplares provenientes de diferentes rios da bacia amazônica. Para isso os crânios e mandíbulas foram digitalizados e após um tratamento geométrico as configurações geradas foram analisadas estatisticamente, por meio de seus componentes de forma e tamanho. O sincrânio de Trichechus inunguis apresenta alometria positiva e não foi observado dimorfismo sexual nesta espécie. As variações morfológicas foram observadas na forma do crânio e mandíbulas, sendo esta influenciada pelo tamanho das estruturas. A observação do padrão de fechamento da sincondrose supraoccipital - exoccipital e a classificação proposta por Amaral et al. (dados não publicados) foram utilizadas para a determinação das três classes etárias a partir da forma dos crânios e mandíbulas. Os exemplares provenientes de rios de água branca apresentaram-se diferentes dos demais oriundos de rios de água preta e clara. Dentro do grupo de exemplares provenientes dos diferentes rios de água branca, o grupo oriundo do rio Japurá apresenta-se diferente dos demais grupos, sendo estes: rio Amazonas, Solimões e Javari.