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Sobrevivência de Ralstonia solanacearum em resto de cultura de pimentão e diferentes tipos de solo de Pernambuco, Brasil

FELIX , Kátia Cilene da Silva 18 February 2009 (has links)
Submitted by (lucia.rodrigues@ufrpe.br) on 2017-03-14T15:38:58Z No. of bitstreams: 1 Katia Cilene da Silva Felix (1).pdf: 376089 bytes, checksum: 45b421012fb39c4ea534d1182006970e (MD5) / Made available in DSpace on 2017-03-14T15:38:58Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Katia Cilene da Silva Felix (1).pdf: 376089 bytes, checksum: 45b421012fb39c4ea534d1182006970e (MD5) Previous issue date: 2009-02-18 / Conselho Nacional de Pesquisa e Desenvolvimento Científico e Tecnológico - CNPq / Bacterial wilt caused by Ralstonia solanacearum, race 1, biovars 1 and 3 causes severe damage to pepper growth in Agreste region of state of Pernambuco in Brazil. The pathogen survival in infected tissues of stem and roots incorporated to the soil at 0, 5 and 15 cm; and at 10 different soil types of Pernambuco without host plant was studied by using a spontaneous mutant resistant to 100 mg l-1 of rifampicin (R. solanacearum A1-9Rif). Pathogen survival only showed difference (P<0.05) in relation to vegetal tissue. Pepper root tissues showed higher survival duration (DUR) (17.1 d), area under population curve (AACPOP) (430x104) and population at 7 (POP7) (5.0x104 UFC g-1 tissue) and 21 days (POP21) (3.1x104 UFC g-1 tissue) than stem tissues, which were respectively, 7.0 d; 3.8 x104; 0.35 and 3.1x104 UFC g-1 tissue. On the other hand stem tissues presented higher decomposition index (81.3%) and pH (7.7) than root tissues, respectively 68.9% and 6.8. The previous soil microbiological analysis did not finddifferences among populations of actinomycetes, copiotrophic, bacteria, total bacteria and total fungi respectively 5.02; 3.63; 5.23 and 4.19 log UFC g-1 dry soil. Populations of oligotrophyc bacteria, Bacillus spp., fluorescent Pseudomonas spp. and Trichoderma spp. were not detected. The pathogen was isolated from the soil adjacent to infected tissues of stem and roots at the three depths six weeks after experiment establishment. The analysis of AACPOP in relation to locals (counties) of soil sampling, type of soil coverage at the sampling time and soil texture was not significant by Kruskal-Wallis test (P≤0.05). Among the 10 studied soils, seven were classified as suppressive showing low intervals of DUR (42 to 49 days), AACPOP (0.77 to 4.05), POP14 (5.59 to 6.18 log UFC g-1 soil) and POP42 (5.44 to 6.31 log UFC g-1 soil). The soils S3, S4 and S6 were evaluated as conducive. Considering all soils together or only the suppressive, DUR,AACPOP and POP42 only showed significant correlation with soil physical and chemical characteristics, positive for clay, residual humidity and useful water and negative for pH. The population of copiotrophic bacteria, actinomycetes, total bacteria, total fungi (Fusarium spp., Aspergillus spp., Penicillium spp. and Rhizopus spp. were identified) and Bacillus spp. did not differ among the 10 soil types. / A murcha-bacteriana do pimentão é causada por Ralstonia solanacearum, raça 1, biovares 1 e 3 e causa grandes prejuízos à cultura desta solanácea. Este trabalho teve por objetivo estudar a sobrevivência do patógeno em tecidos infectados de caule e raiz incorporados ao solo às profundidades de 0, 5 e 15 cm; e em 10 diferentes tipos de solo na ausência da planta hospedeira. Foi utilizado um mutante resistente a 100 mg l-1 de rifampicina (R. solanacearum A1-9Rif). A sobrevivência do patógeno diferiu significativamente (P<0,05) apenas em relação aos tecidos vegetais analisados isoladamente. Desta forma, tecidos de raiz de pimentão apresentaram maior duração da sobrevivência (17,1 d), área abaixo da curva da população (AACPOP) (430x104) e população aos 7 (POP7) (5,0 x 104 UFC g-1 tecido) e 21 dias (POP21) (3,1 x 104 UFC g- 1 tecido) que os de caule, que foram respectivamente, 7,0 d; 3,8; 0,35 x104 e 0,48 x 104UFC g-1 tecido. Por outro lado, os tecidos do caule apresentaram maior índice de decomposição (81,3%) e pH (7,7) do que os de raízes, respectivamente 68,9% e 6,8. A análise microbiológica prévia deste solo não evidenciou diferenças significativas entre as populações de actinomicetos, bactérias copiotróficas, bactérias totais e fungos totais, que foram de 5,02; 3,63; 5,23 e 4,19 log UFC g-1 solo seco, respectivamente. Não foram encontradas populações de bactérias oligotróficas, Bacillus spp., Pseudomonas spp. fluorescentes, e Trichoderma spp. Entre os 10 tipos de solos estudados, sete foram classificados como supressivos por apresentarem baixas duração da sobrevivência (42 a 49 dias), AACPOP (0,77 a 4,05), POP14 (5,59 a 6,18 log UFC g-1 solo) e POP42 (5,44 a 6,31 log UFC g-1 solo). Os solos S3, S4 e S6 foram avaliados como conducivos. Neste estudo, apenas algumas características físicas e químicas apresentaram correlaçãosignificativa com duração da sobrevivência, AACPOP e POP42, considerando todos ossolos em conjunto ou apenas os supressivos, destacando-se argila, umidade residual e água disponível que apresentaram correlação positiva e o pH com correlação negativa.
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Avaliação da agressividade e caracterização genética de linhagens de Ralstonia Solanacearum isoladas de diferentes plantas hospedeiras

Rodrigues, Lucas Mateus Rivero [UNESP] 28 May 2010 (has links) (PDF)
Made available in DSpace on 2014-06-11T19:28:36Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2010-05-28Bitstream added on 2014-06-13T20:37:45Z : No. of bitstreams: 1 rodrigues_lmr_me_botfca.pdf: 618458 bytes, checksum: cb654c56905a6abeae0bdd7484f37739 (MD5) / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) / O presente trabalho teve como objetivo avaliar a agressividade de linhagens de Ralstonia solanacearum provenientes de solanáceas, plantas ornamentais e eucalipto, em plantas de batata, tomate e fumo, bem como caracterizar as linhagens por meio de técnicas moleculares. Vinte e duas linhagens foram utilizadas nos ensaios de avaliação da agressividade, em experimentos conduzidos em casa-de-vegetação evidenciaram alta severidade da doença pelas linhagens de R. solanacearum quando inoculadas em plantas de tomate e batata, sendo a batata mais afetada nas inoculações. Todas as linhagens mostraram-se agressivas, sendo que o fumo mostrou baixa suscetibilidade ao ataque das bactérias. As linhagens mais agressivas em plantas de tomate foram IBSBF 309, IBSBF 1712, IBSBF 1839, IBSBF 1882, IBSBF 1883 e IBSBF 2000, pertencentes às biovares I, II e III. As linhagens mais agressivas às plantas de fumo foram IBSBF 309, IBSBF 2131 e IBSBF 292T, pertencentes à biovar I. Foi efetuado também ensaio de microbiolização in vitro em sementes de eucalipto, a fim de se identificar possíveis linhagens patogênicas a esta espécie vegetal e concluiu-se que todas as linhagens utilizadas infectaram plantas de eucalipto ou afetaram seu crescimento. A caracterização molecular de 41 linhagens de Ralstonia solanacearum, provenientes de diversas plantas hospedeiras, incluindo solanáceas, bananeira, helicônia, plantas ornamentais e eucalipto, foi efetuada empregando-se ERIC e BOX-PCR e os resultados mostraram grande diversidade genética entre as linhagens. A análise de PCR-RFLP da região espaçadora 16S-23S DNAr permitiu distinguir os isolados pertencentes à biovar III das demais biovares (I, II, IIA e IIT), quando digeridos com as enzimas Taq I e Hin6 I. A análise de sequenciamento de parte dos genes Endoglucanase (Egl) e MutS possibilitou a classificação em filotipos e os resultados... / This study aimed to evaluate the aggressiveness of strains of Ralstonia solanacearum from solanaceus, ornamental and eucalyptus plants, on potato, tomato and tobacco, and to characterize the strains through molecular techniques. Twenty-two strains were used in this study to evaluate the aggressiveness and, the experiments conducted in a greenhouse revealed the high susceptibility of tomato and potato plants, with the potato being the most affected on through the inoculations. All isolates proved to be aggressive and higher tolerance to the attack of bacteria was verified on tobacco plants. Strains more aggressive on tomato were IBSBF 309, IBSBF 1712, IBSBF 1839, IBSBF 1882, IBSBF 1883 and IBSBF 2000, belonging to biovars I, II and III. The more aggressive strains on the tobacco plants were IBSBF 309, IBSBF 292T and IBSBF 2131 belonging to biovar I. Tests in vitro of microbiolization of eucalyptus seeds were also performed in order to identify possible pathogenic strains to this species and the results showed that all strains used cause infection on emerging plants or affected their growth. To molecular characterization of 41 strains of Ralstonia solanacearum from several host plants including solanaceous, banana, heliconia, ornamentals and eucalyptus were employed to ERIC and BOX-PCR, and the results showed high genetic diversity among strains. The analysis of PCR-RFLP of 16S-23S spacer region rDNA allowed us to distinguish the isolates belonging to biovar III from the others (biovars I, II, IIA and IIT) when digested with enzymes Taq I and Hin6 I. The sequence analysis of the partial of Endoglucanase (Egl) and MutS genes allowed the classification in phylotypes and the results revealed a predominance of the phylotype II in Brazil, and four isolates were classified in the phylotype I, all belonging to biovar III
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Caracterização molecular e avaliação da patogenicidade em gerânio de isolados brasileiros da biovar 2 de Ralstonia solanacearum / Molecular characterization and pathogenicity evaluation on geranium of Brazilian strains of biovar 2 of Ralstonia solanacearum

Rossato, Maurício 10 February 2012 (has links)
Made available in DSpace on 2015-03-26T13:37:48Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 1802890 bytes, checksum: 0b75928115b5c4403a010430868a5dbc (MD5) Previous issue date: 2012-02-10 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / Ralstonia solanacearum (RS) is a bacterial complex species that causes the bacterial wilt in hundreds of plant hosts, inducing heavy losses mainly on cultivated solanaceus species in tropical and subtropical countries. The race 3 biovar 2 (R3B2) of the pathogen causes not only direct losses but latent infections in many hosts, like the geranium, which facilitates its dissemination in and between countries. In the last decade, it was introduced in USA by infected geranium from Kenya and Guatemala, causing great concerns due the adaptation of this variant to the potato crop. In USA, the R3B2 of RS acquired the status of bioterrorism agent and now faces strong quarantine restrictions in the country. In this work we evaluated the pathogenicity of 36 Brazilian RS strains to geranium, most of them of R3B2. These strains were evaluated to their capacity of infecting geranium (Pelargonium peltatum and P. hortorum), potato and tomato. Seedlings were inoculated by xylem penetration with a pin contaminated at the time of inoculation by touching it onto the selected colony. Ten strains of biovar 1, 22 of biovar 2 and two of biovar 3 were used for comparison proposes. The disease incidence was measured every two days by the percentage of symptomatic plants. The strains were identified in order to analyze the eventual correlations among host of origin, biovar and phylotype. All the five geranium cultivars tested were susceptible, but with different responses among strains. The geraniums were less susceptible than solanaceous hosts tested. Nineteen strains infected one or two of the hosts and 17 infected at least one of the three hosts. The races 1 and 3, biovars 1, 2 and 3, phylotypes I and II, were all capable of infecting geranium. The capacity of R3B2 Brazilian strains to infect the geranium requires special methods for identification and detection of the bacteria in greenhouses for plants produced for export. It was not possible to group the strains according to pathogenic and molecular characteristics; therefore, it is proposed that complete genome analysis be performed to unveil eventual host specificity for some isolates. / Ralstonia solanacearum (RS) é uma espécie bacteriana complexa que causa a murcha bacteriana em centenas de plantas hospedeiras, provocando grandes perdas principalmente em solanáceas cultivadas em países de clima tropical e subtropical. Especificamente a raça 3 biovar 2 (R3B2) do patógeno, além de causar perdas diretas, causa infecções latentes em diversas hospedeiras, como o Pelargonium sp., o que facilita sua disseminação dentro e entre países. Por exemplo, na última década, esta bactéria foi introduzida nos EUA desta forma, causando preocupação em virtude da adaptação dessa variante à cultura da batata. Face à sua forte restrição quarentenária principalmente em países da América do Norte, onde adquiriu status de agente de bioterrorismo, avaliou-se a patogenicidade a gerânio de 36 isolados brasileiros, com ênfase na R3B2 de RS. Esses isolados foram avaliados quanto à sua capacidade de infectar gerânios (P. peltatum, P. hortorum), batata e tomate. Plantas jovens foram inoculadas pela penetração do xilema com um alfinete esterilizado contaminado pelo toque em colônia de RS de cada isolado. Foram usados 36 isolados, sendo 10 da biovar 1, 22 da biovar 2, dois da biovar 3 e dois de gerânio. A incidência da doença foi medida a cada dois dias pela porcentagem de plantas com sintomas da doença. Além do teste de patogenicidade a gerânio, os isolados foram identificados em filotipos com a finalidade de verificar se os isolados capazes de infectar estas hospedeiras se agrupavam de maneira a explicar alguns dos comportamentos. Todas as cinco cultivares de gerânio foram suscetíveis, porém ocorreram variações quanto à resposta entre isolados. Os gerânios, em geral, são menos suscetíveis a todos os isolados quando comparados com batata e tomate. Dezenove dos 36 isolados infectaram uma ou duas das espécies testadas e 17 infectaram ao menos uma planta de todas as espécies hospedeiras avaliadas. Isolados das raças 1 e 3, biovares 1, 2 e 3, filotipos I e II, foram capazes de infectar o gerânio. A capacidade de isolados brasileiros da R3B2 de RS de infectar o gerânio faz com que sejam necessários métodos especiais para identificação e detecção da bactéria em viveiros de plantas visando a exportação. Não foi possível agrupar os isolados segundo suas características patogênicas e moleculares; então, é proposto que análises de genoma completo sejam realizadas para que pequenos deste, possam revelar a gama de hospedeiras.
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Seleção fenotípica em populações segregantes de feijão visando resistência à murcha de curtobacterium (Curtobacterium flaccumfaciens pv. flaccumfaciens) / Phenotypic selection in bean&#8223;s segregating populations for bacterial wilt resistance (Curtobacterium flaccumfaciens pv. flaccumfaciens)

Morais, Pedro Patric Pinho 10 July 2012 (has links)
Made available in DSpace on 2016-12-08T16:44:37Z (GMT). No. of bitstreams: 1 PGPV12MA064.pdf: 1012596 bytes, checksum: c4f66f0fa2a1b45c1ad39219f45c6b2d (MD5) Previous issue date: 2012-07-10 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / The bacterial wilt (Curtobacterium flaccumfaciens pv. flaccumfaciens) has showed one of the most important diseases in the bean crop. Its symptoms occur from wilts at leaves to death of the infected plant. The control is based on the use of healthy seeds, crop rotation and especially resistant cultivars. The goal of this study was to estimate the efficiency of selection in segregating populations of beans for bacterial wilt resistance and indicate the best time of the cycle to make the selection of resistant plants and also to test in field the effectiveness selection at greenhouse for resistance to this disease. To achieve these objectives were used converging crosses between Aruã x Guará, Pyatã x Guará and Pyatã x Pérola, originating F2, F2:3, F3:4 which were subsequently inoculated with Curtobacterium flaccumfaciens pv. flaccumfaciens cff 2634 and evaluated according to a scale related to the common symptoms of the disease at 20, 40 and 60 days after inoculation. The field test of the effectiveness selection at greenhouse was used the same crosses, however, the populations used were in the generations F2:3, F3:4 and F4:5, subsequently measured the agronomic traits such as plant height, first pod, stem diameter, number of pods per plant, number of grains per plant, grain weight in grams per line and resistance to bacterial wilt. Through the data can be established that the populations of Aruã x Guará, Pyatã x Guará and Pyatã x Pérola have similar behavior in relation to resistance to the bacterial wilt symptoms. The selection was effected for the coming populations of Aruã x Guará and Pyatã x Pérola. The favorable time for distinguishing and selecting reliably segregating plants is between 40 and 60 days after inoculation. It was likewise observed that there is genetic diversity and superiority of selected plants on not select plants and their parents, indicating in the field that the greenhouse selection for resistance to bacterial wilt was effective / A murcha de curtobacterium (Curtobacterium flaccumfaciens pv. flaccumfaciens) tem se mostrado uma das doenças emergentes mais importantes na cultura do feijão. Seus sintomas ocorrem desde murchas nas folhas até à morte da planta infectada. O controle está baseado em uso de sementes sadias, rotação de cultura e principalmente cultivares resistentes. Assim, o objetivo deste trabalho foi estimar a eficiência da seleção em populações segregantes de feijão para resistentes à murcha de curtobacterium e indicar o melhor período do ciclo da cultura para proceder a seleção das plantas resistentes e também testar a campo a efetividade da seleção em casa de vegetação. Para atingir estes objetivos foram usados cruzamentos convergentes entre Aruã x Guará, Pyatã x Guará e Pyatã x Pérola, dando origem a populações segregantes que nas das gerações F2, F2:3 e F3:4 foram inoculadas com Curtobacterium flaccumfaciens pv. flaccumfaciens cff 2634 e avaliadas segundo uma escala de notas referentes aos sintomas comuns da doença aos 20, 40 e 60 dias após a inoculação. O teste a campo da efetividade da seleção em casa de vegetação usou os mesmos cruzamentos, entretanto as populações avaliadas são relativas às gerações F2:3, F3:4 e F4:5 sendo posteriormente mensurados os caracteres agronômicos como altura de planta, inserção do primeiro legume, diâmetro do caule, número de legumes por planta, número de grãos por planta, peso em gramas de grãos por linha e resistência à murcha de curtobacterium. Através dos dados pôde se estabelecer que as populações segregantes de Aruã x Guará, Pyatã x Guará e Pyatã x Pérola possuem comportamento semelhante em relação à resistência aos sintomas da murcha de curtobacterium. A seleção foi efetiva para as populações oriundas de Aruã x Guará e Pyatã x Pérola e o período propício para distinguir e selecionar de maneira confiável as plantas segregantes ocorre entre 40 e 60 dias após a inoculação. Foi da mesma forma observado que existe divergência genética e superioridade de plantas selecionadas sobre plantas não selecionadas e genitores, indicando a campo que a seleção em casa de vegetação visando resistência à murcha de curtobacterium foi efetiva
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Resistência à murcha bacteriana em linhagens e híbridos de tomateiro

MENDES, Adônis Queiroz 28 July 2017 (has links)
Submitted by Mario BC (mario@bc.ufrpe.br) on 2017-10-03T14:14:43Z No. of bitstreams: 1 Adonis Queiroz Mendes.pdf: 1093724 bytes, checksum: bc45e45f52c149dd3de62f8015c94732 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-10-03T14:14:43Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Adonis Queiroz Mendes.pdf: 1093724 bytes, checksum: bc45e45f52c149dd3de62f8015c94732 (MD5) Previous issue date: 2017-07-28 / Among the Solanaceae family, tomato plant is the second most produced in the world, behind only the potato. In Northeast of Brazil, its cultivation has been limited to sub regions of the Agreste and the Sertão, as a result of plant diseases problems, especially bacterial wilt. It is a disease caused by a complex of Ralstonia solanacearum species, and it has been reported in more than 450 species of plants. The losses caused by this disease are severe in plantations occurred during rainy summers and inside of greenhouses. This study aims to identify and obtain tomato germplasms resistant to bacterial wilt from 23 lines of tomato and 24 experimental hybrids. It was utilized the isolates CRM 74, CRM 76 and CRM 77 of Ralstonia pseudosolanacearum for the evaluation of lines, and the isolates CRM 74 and CRM 77 for evaluation of the hybrids. The 23 lines, with seven controls, were sowed, transplanted after 21 days and inoculated with 15 ml of the bacterial suspension with 5x108 CFU ml-1 per vase of 500 ml. The experiment had a completely randomized with three repetitions and every parcel had four vases with one plant each. Evaluations were carried out observing the incidence and severity of the disease and based on the result it was calculated: bacterial wilt index (IMB), incidence (INC), latency period (PL 50) and area below the curve of disease progression (AACPD). The data were submitted to analysis of variance and the means were grouped by the Scott-Knott test at 5% probability. Besides that estimating the phenotypic, genotypic and environmental correlation coefficients between the resistance components and calculating the dissimilarity of the Mahalanobis distance (D) to determine the genetic divergence among the lines. The Yoshimatsu and Hawaii 7996 were used as testers in crosses with the 10 lines of best results tomatoes and cultivars IPA-6 and Santa Clara. Subsequently, F1 hybrid was evaluated for bacterial wilt resistance during 15 days, analyzing the incidence and disease severity (SEV) using a descriptive scale notes from 0 to 4. The data were used to determine the general (CGC) and specific combining (CEC) capacities to four resistance components, estimating genetic parameters such as heritability, phenotypic, genotypic and environmental variance. The interaction genotypes x isolates presented significant difference at 1% probability only for the variables latency period and area below the disease progress curve. Considering bacterial wilt index, lines L04, L42, L49, L53, L82, L120, L125 and L128 were classified as resistant, but for incidence there were no lines that behaved similarly to the resistant controls Hawaii 7996, Yoshimatsu and Woodstock. As for genotype correlations, in 100% of the pairs of characters, values equal to or slightly higher than the phenotypic correlations were observed. Similar to these two, in 50% of the cases, were slightly higher than the environmental correlations, showing that the environment favored as the same form for IMB x PL 50, IMB x AACPD and PL 50 x AACPD. For the analysis of the dendrogram, a cut around 15.2% dissimilarity allowed the formation of four distinct groups and four subgroups. Group I was composed of resistant genotypes containing: Hawaii 7996, Woodstock, Yoshimatsu, Tropithai, L04, L42, L49, L53, L82, L125, L120 and L128, in addition to lines with moderate resistance. Considering the combining abilities of the experimental hybrids, the crosses that showed the greatest potentials for resistance were the YOS x L04 with the two isolates, and the HAW x L125 with the isolate CRM 74, since they were the only ones with a positive CEC for PL 50 and negative for the others characters. Also, presenting values from intermediate to superior that highlighted for the character PL 50, besides a high value for CEC, and at least one of the parents presented a high CGC value, which it is desirable. Observing the genetic parameters, the estimated values of the genetic variance were higher than the environmental variance for all the resistance components studied for the two bacterial isolates. However, it was observed in this study that the gene expression of the tomato resistance phenotype is resulted from the action of additive and non-additive gene effects, where the non-additive gene effects are involved in the four resistance components and that the additive effects are involved in the IMB, INC and AACPD. / Dentre as solanáceas o tomateiro é a segunda mais produzida no mundo, perdendo apenas para a batata. No Nordeste brasileiro o seu cultivo tem se limitado às mesorregiões do Agreste e do Sertão, tendo como um dos fatores para os problemas fitossanitários, principalmente a murcha bacteriana. Trata-se de uma doença causada pelo complexo de espécies Ralstonia solanacearum, sendo já relatada em mais de 450 espécies de plantas. As perdas causadas por essa doença são severas em plantios realizados durante verões chuvosos e em cultivo protegido. Este estudo teve como objetivo identificar e obter germoplasmas de tomateiro resistentes à murcha bacteriana entre 23 linhagens e 24 híbridos experimentais de tomateiro. Foram utilizados os isolados CRM 74, CRM 76 e CRM 77 de Ralstonia pseudosolanacearum para avaliação das linhagens e os isolados CRM 74 e CRM 77 para avaliação dos híbridos experimentais. As 23 linhagens, juntamente com sete testemunhas, foram semeadas, transplantadas após 21 dias e inoculadas com 15 ml de suspensão bacteriana na concentração de 5x108 UFC ml-1 para cada vaso de 500 ml. O experimento foi realizado em delineamento inteiramente casualizado com três repetições e cada parcela foi constituída por quatro vasos com uma planta cada. As avaliações foram realizadas observando a incidência e a severidade da doença e a partir dessas medidas foram calculados: índice de murcha bacteriana (IMB), incidência (INC), período de latência (PL 50) e área abaixo da curva de progresso da doença (AACPD). Os dados foram submetidos à análise de variância e as médias agrupadas pelos testes de Scott-Knott, a 5% de probabilidade, além de estimar os coeficientes de correlações fenotípicas, genotípicas e ambientais entre os componentes de resistência e calcular a dissimilaridade através da distância de Mahalanobis (D2) determinando a divergência genética entres as linhagens. As cultivares Yoshimatsu e Hawaii 7996 foram utilizadas como testadoras em cruzamentos com as cultivares IPA-6 e Santa Clara, além de 10 linhagens de tomateiro que apresentaram os melhores resultados na etapa anterior. Posteriormente, os híbridos F1 foram avaliados quanto à resistência à murcha bacteriana durante 15 dias, quanto à incidência e a severidade da doença (SEV) com auxílio de escala descritiva de notas variando de 0 a 4. Os dados foram utilizados para determinar a capacidade geral (CGC) e específica (CEC) de combinação para os quatro componentes de resistência, além de estimar parâmetros genéticos, tais como herdabilidade, variância fenotípica, genotípica e ambiental. A interação genótipos x isolados apresentou diferença significativa a 1% de probabilidade apenas para as variáveis período de latência e área abaixo da curva de progresso da doença. Considerando o índice de murcha bacteriana, as linhagens L04, L42, L49, L53, L82, L120, L125 e L128 foram classificadas como resistentes, mas para incidência não houve linhagem que se comportasse de forma semelhante às testemunhas resistentes Hawaii 7996, Yoshimatsu e Woodstock. No tocante às correlações genotípicas, em 100% dos pares de caracteres, foram observados valores iguais ou ligeiramente superiores às correlações fenotípicas, assim como essas duas, em 50% dos casos, foram ligeiramente superiores às correlações ambientais, mostrando que o ambiente favoreceu da mesma forma para IMB x PL 50, IMB x AACPD e PL 50 x AACPD. Para análise do dendrograma, um corte em torno de 15,2% de dissimilaridade possibilitou a formação de quatro grupos distintos e quatro subgrupos. O grupo I foi constituído por genótipos considerados resistentes: Hawaii 7996, Woodstock, Yoshimatsu, Tropithai, L04, L42, L49, L53, L82, L120, L125 e L128, além de linhagens com resistência moderada. Considerando as capacidades de combinação dos híbridos experimentais, os cruzamentos que apresentaram os maiores potenciais para resistência foram os YOS x L04 com os dois isolados e o HAW x L125 com o isolado CRM 74, pois foram os únicos com CEC positiva para PL 50 e negativa para os demais caracteres, apresentando valores de intermediário a superior e que se destacaram para a variável PL 50, além de alto valor para CEC, pelo menos um dos genitores apresentou alto valor de CGC, o que é desejável. Observando os parâmetros genéticos, os valores estimados da variância genética foram superiores aos da variância ambiental para todos os componentes de resistência estudados para os dois isolados bacterianos. Todavia, observou-se neste estudo que a expressão gênica do fenótipo resistência em tomateiro é resultante da ação de efeitos gênicos aditivos e não aditivos, em que os efeitos gênicos não aditivos estão envolvidos nos quatro componentes de resistência e que os efeitos aditivos estão envolvidos no IMB, INC e AACPD.
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Controle genético da resistência do tomateiro 'yoshimatsu' à Ralstonia pseudosolanacearum e Ralstonia solanacearum

COSTA, Kleyton Danilo da Silva 14 July 2017 (has links)
Submitted by Mario BC (mario@bc.ufrpe.br) on 2017-10-03T14:42:11Z No. of bitstreams: 1 Kleyton Danilo da Silva Costa.pdf: 1289095 bytes, checksum: 9861fbf632f584701f964a72b5670215 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-10-03T14:42:11Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Kleyton Danilo da Silva Costa.pdf: 1289095 bytes, checksum: 9861fbf632f584701f964a72b5670215 (MD5) Previous issue date: 2017-07-14 / The bacterial wilt in the tomato crop is a disease that has local, national and world importance. This disease is difficult to control and can cause damage that can compromise the entire crop. Genetic resistance within integrated management is the primary measure of bacterial wilt control. In this sense, the knowledge of the genetic control of resistance in breeding programs tends to improve the efficiency in its planning and in the choice of the best method to be adopted. The objective of this thesis was to study the genetic control of resistance of 'Yoshimatsu' tomato to Ralstonia pseudosolanacearum and Ralstonia solanacearum. In the first stage two experiments were conducted with Yoshimatsu, IPA-7 and the F1, F2, RC11 and RC21 generations, using a randomized block design with four replicates. In the second stage two experiments were conducted with 43 progenies F2:3 and their parents with the same experimental design of the first stage. At each stage the two species of the R. solanacearum complex were inoculated in independent experiments. The incidence and severity of bacterial wilt were evaluated by means of a descriptive scale of notes at 10 and 20 days after inoculation. Genetic control of the resistance of tomato 'Yoshimatsu' to R. pseudosolanacearum involves two genes of greater effect with independent segregation of additive effects only, plus polygenes with additive and dominance effects, in which resistance is associated with recessive alleles. On the other hand, the genetic control of the resistance of the tomato 'Yoshimatsu' to R. solanacearum involves two genes of greater effect with independent segregation of additive effects and dominance, plus polygenes with additive and dominance effects, in which resistance is also associated To recessive alleles. In this study, the selection of plants resistant to R. pseudosolanacearum and R. solanacearum is indicated mainly at 20 days after inoculation. / A murcha bacteriana na cultura do tomateiro é uma doença que tem importância local, nacional e mundial. Esta doença é de difícil controle e pode provocar prejuízos que podem comprometer toda a lavoura. A resistência genética dentro do manejo integrado é a principal medida de controle da murcha bacteriana. Neste sentido, o conhecimento do controle genético da resistência em programas de melhoramento tende a aprimorar a eficiência em seu planejamento e na escolha do melhor método a ser adotado. O objetivo com esta tese foi estudar o controle genético da resistência do tomateiro ‘Yoshimatsu’ à Ralstonia pseudosolanacearum e Ralstonia solanacearum. Na primeira etapa dois experimentos foram conduzidos com os genitores Yoshimatsu, IPA-7 e as gerações F1, F2, RC11 e RC21, utilizando o delineamento em blocos casualisados com quatro repetições. Na segunda etapa dois experimentos foram conduzidos com 43 progênies F2:3 e seus genitores com o mesmo delineamento experimental da primeira etapa. Em cada etapa foram inoculadas as duas espécies do complexo R. solanacearum, em experimentos independentes. Foram avaliadas a incidência e severidade da murcha bacteriana por meio de escala descritiva de notas aos 10 e 20 dias após a inoculação. O controle genético da resistência do tomateiro ‘Yoshimatsu’ à R. pseudosolanacearum envolve dois genes de efeito maior com segregação independente de efeitos aditivos apenas, mais poligenes com efeitos aditivos e de dominância, em que a resistência está associada a alelos recessivos. Por outro lado, o controle genético da resistência do tomateiro ‘Yoshimatsu’ à R. solanacearum envolve dois genes de efeito maior com segregação independente de efeitos aditivos e de dominância, mais poligenes com efeitos aditivos e de dominância, em que a resistência também está associada a alelos recessivos. Neste estudo, a seleção de plantas resistentes a R. pseudosolanacearum e R. solanacearum é indicada principalmente aos 20 dias após a inoculação.
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Uso da enxertia para o controle da murcha bacteriana [Ralstonia solanacearum Smith (1896) (Yabuuchi) et al. 1996] no tomateiro

Fernandes, Brunno dos Santos, 92-98151-6333 29 January 2016 (has links)
Submitted by Divisão de Documentação/BC Biblioteca Central (ddbc@ufam.edu.br) on 2017-12-19T15:11:24Z No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Dissertação - Brunno dos Santos Fernandes.pdf: 1141872 bytes, checksum: 677ea8ad97b157d84045b98ea4db976d (MD5) / Approved for entry into archive by Divisão de Documentação/BC Biblioteca Central (ddbc@ufam.edu.br) on 2017-12-19T15:11:37Z (GMT) No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Dissertação - Brunno dos Santos Fernandes.pdf: 1141872 bytes, checksum: 677ea8ad97b157d84045b98ea4db976d (MD5) / Made available in DSpace on 2017-12-19T15:11:37Z (GMT). No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Dissertação - Brunno dos Santos Fernandes.pdf: 1141872 bytes, checksum: 677ea8ad97b157d84045b98ea4db976d (MD5) Previous issue date: 2016-01-29 / CAPES - Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / The bacterial wilt (Ralstonia solanacearum) is a major disease of tomato (Solanum lycopersicum). The control is difficult because there are no resistant cultivars not recommended chemicals. The objective of this study was to evaluate the use of cubiu (Solanum sessiliflorum), jurubeba (Solanum viarum) and cultivar of tomato Yoshimatsu (tolerant) as rootstocks to control bacterial wilt. The experiment was conducted in a greenhouse was set up in a completely randomized design with five replicates, consisting of the treatments „Santa Cruz Kada Gigante‟/cubiu, „Santa Cruz Kada Gigante‟/jurubeba, „Santa Cruz Kada Gigante‟/‟Yoshimatsu‟, „Santa Cruz Kada Gigante‟ autograft and „Santa Cruz Kada Gigante‟ ungrafted, inoculated with 10 mL of the bacterial suspension at a concentration of 108 ufc.mL-1 race 1 (biovar 1) of Ralstonia solanacerum, the substrate around plant lap, whose roots were slightly injured with a scalpel. The witness consisted of plants treated with all combinations sterile distilled water. The experiment conducted in the field was set up in soil infested with Ralstonia solanacearum in a randomized block design with five replications, consisting of the same treatments used in the greenhouse. For both experiments, the assessment was made on a daily basis according to the incidence of the disease and the development of symptoms. It was also rated the stem diameter (mm) at the time of the colon, stem diameter 2 cm above the grafting point and plant height of the neck to the pointer (cm), these every seven days using digital calipers and tape measure, respectively . Still it was quantified the number of flowers per plant, number of flowers per inflorescence, number of fruits per plant, number of fruits per inflorescence, early flowering, early fruiting and designated rig plants above the eighth inflorescence of weeks after grafting. Data were statistically analyzed by Assistat version 7.7 program, and the averages compared by Tukey test at 5% probability. Tomato plants grafted on cubiu not developed symptoms of bacterial wilt and may be suitable for the production of seedlings and planting in areas contaminated with R. solanacearum. Cultivar yoshimatso showed the greatest growth and productivity of plants, providing partial resistance in grafted plants with this rootstock and can be used within a management program of the disease in tomato cultivation. / A murcha bacteriana (Ralstonia solanacearum) é uma das principais doenças do tomateiro (Solanum lycopersicum). O controle é difícil, pois não existem cultivares resistentes nem produtos químicos recomendados. O objetivo deste trabalho foi avaliar o uso de cubiu (Solanum sessiliflorum), jurubeba (Solanum viarum) e da cultivar de tomateiro Yoshimatsu (tolerante) como porta-enxertos para o controle da murcha bacteriana. O experimento foi conduzido em casa de vegetação em delineamento inteiramente casualizado com cinco repetições, constituído dos tratamentos „Santa Cruz Kada Gigante‟/cubiu, „Santa Cruz Kada Gigante‟/jurubeba, „Santa Cruz Kada Gigante‟/‟Yoshimatsu‟, „Santa Cruz Kada Gigante‟ auto-enxerto e „Santa Cruz Kada Gigante‟ pé-franco. As plantas foram inoculadas com 10 mL da suspensão bacteriana na concentração de 108 ufc.mL-1 da raça 1 (biovar 1) de R. solanacerum, depositada no substrato ao redor do colo da planta, cujas raízes foram levemente feridas com um bisturi. A testemunha constou de plantas de todas as combinações tratadas com água destilada esterilizada. O experimento conduzido em campo foi montado em solo naturalmente infestado com R. solanacearum, com delineamento em blocos casualizados com cinco repetições, constituído dos mesmos tratamentos utilizados em casa de vegetação. Para ambos os experimentos, a avaliação foi feita diariamente em função da incidência da doença e do desenvolvimento dos sintomas. Foi avaliado também o diâmetro do caule (mm) na altura do colo, diâmetro do caule 2 cm acima do ponto de enxertia e a altura das plantas do colo ao ponteiro (cm), a cada sete dias utilizando paquímetro digital e trena, respectivamente. Foi quantificado o número de flores por planta, número de flores por inflorescência, número de frutos por planta, número de frutos por inflorescência, início da floração, início da frutificação e capação das plantas acima da oitava inflorescência, em semanas após a enxertia. Os dados foram analisados estatisticamente pelo programa Assistat versão 7.7, e as médias comparadas pelo teste de Tukey a 5% de probabilidade. Plantas de tomate enxertadas em cubiu não desenvolveram sintomas de murcha bacteriana, podendo ser indicada para produção de mudas e plantio em áreas contaminadas com R. solanacearum. A cultivar yoshimatso apresentou o maior crescimento e produtividade das plantas, proporcionando resistência parcial em plantas enxertadas com este porta-enxerto, podendo ser usada dentro de um programa de manejo da doença em cultivo de tomateiro.
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Variabilidade genética de Ralstonia solanacearum (smith) Yabucchi et al. utilizando marcadores AFLP e avaliação de respostas bioquímicas de defesa à murcha bacteriana em capsicum spp. nativo

Demosthenes, Liane Cristine Rebouças 17 December 2013 (has links)
Submitted by Izabel Monteiro (izabel_22@hotmail.com) on 2016-08-03T13:35:08Z No. of bitstreams: 1 Liane Cristine Rebouças Demosthenes - Tese.pdf: 1077147 bytes, checksum: b3915a604b50db5ab23367233a0eb874 (MD5) / Approved for entry into archive by Divisão de Documentação/BC Biblioteca Central (ddbc@ufam.edu.br) on 2016-08-15T18:05:22Z (GMT) No. of bitstreams: 1 Liane Cristine Rebouças Demosthenes - Tese.pdf: 1077147 bytes, checksum: b3915a604b50db5ab23367233a0eb874 (MD5) / Approved for entry into archive by Divisão de Documentação/BC Biblioteca Central (ddbc@ufam.edu.br) on 2016-08-15T18:10:39Z (GMT) No. of bitstreams: 1 Liane Cristine Rebouças Demosthenes - Tese.pdf: 1077147 bytes, checksum: b3915a604b50db5ab23367233a0eb874 (MD5) / Made available in DSpace on 2016-08-15T18:10:39Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Liane Cristine Rebouças Demosthenes - Tese.pdf: 1077147 bytes, checksum: b3915a604b50db5ab23367233a0eb874 (MD5) Previous issue date: 2013-12-17 / CAPES - Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / Bacterial wilt caused by Ralstonia solanacearum is one of the most important diseases of solanaceous. Present in all national territory, causes rapid wilting of plants and affects several crops of agronomic interest. In Amazonas, the high temperature and humidity combined with the genetic diversity of this pathogen diversity of hosts favor the development and aggressiveness of the pathogen and complicate the management of this disease. The aim of this study was to evaluate the genetic diversity of R. solanacearum using AFLP markers and evaluate defense responses submitted by Capsicum spp. natives of the Amazon region, verifying the expression of pathogenesis-related proteins, resulting from infection by the pathogen. Samples were collected in four counties vegetable growers in the metropolitan area of Manaus to establish a collection of 30 isolates of the pathogen. We performed classical biochemical characterization of the isolates and characterization of genetic diversity using AFLP molecular markers. The 24 primer combinations were tested and selected the six best informative combinations . The six combinations of primers generated a 432 bands , ranging from 47 to 103 loci in the combination E + AT / M + C. The Jaccard similarity coefficient estimated between 30 isolates ranged from 0.01 to 0.98. From the similarity matrix a dendrogram was generated by UPGMA method being possible separate the isolates into six groups with cophenetic correlation coefficient of r = 0.98. The defense response submitted by Capsicum spp. were also evaluated by biochemical methods for the determination of total protein, phenylalanine ammonia lyase activity and peroxidase activity phenoloxidases. The enzymatic activity varied according to the level of resistance of the evaluated accessions, being higher in the first hours after inoculation and decreased after 72 hours. It was possible to identify two resistant accessions ( BC 05 and NT ) showed that grade point average of 1.17 xi and 0.94 . The BC had access resistance of accessions was associated with increased activity of PPO and FAL, indicating that these enzymes make up the defense mechanism in plants of Capsicum. The POX activity was lower when compared with the activity of PPO and FAL / A murcha bacteriana causada por Ralstonia solanacearum é uma das doenças mais importantes das solanáceas. Presente em todo o território nacional, causa murcha rápida das plantas e afeta várias culturas de interesse agronômico. No Amazonas, as condições de altas temperatura e umidade do ar aliados à ampla diversidade genética deste patógeno, diversidade de hospedeiros e agressividade favorecem o desenvolvimento do patógeno e dificultam o manejo desta doença. O objetivo deste trabalho foi avaliar a variabilidade genética de R. solanacearum utilizando marcadores AFLP e avaliar as respostas bioquímicas de defesa apresentadas por acessos de Capsicum spp. nativos da região Amazônica, verificando a expressão de proteínas relacionadas com a patogênese, decorrentes da infecção pelo patógeno. Foram realizadas coletas em quatro municípios produtores de hortaliças da área metropolitana de Manaus para estabelecer uma coleção com 30 isolados do patógeno. Foi realizada a caracterização bioquímica clássica dos isolados, testes de patogenicidade e caracterização da diversidade genética utilizando marcadores moleculares AFLP. Foram testadas 24 combinações de primers e seleciondas as seis combinações mais informativas. As seis combinações de primers utilizadas apresentaram um total de 432 bandas, variando de 47 loci à 103 na combinação E+AT/M+C. O coeficiente de similaridade de Jaccard estimado entre os 30 isolados avaliados variou de 0,01 à 0,98. A partir da matriz de similaridade foi gerado o dendrograma pelo método UPGMA sendo possível separar os isolados em seis grupos com coeficiente de correlação cofenética no valor de r = 0,98. Também foram avaliadas as resposta de defesa apresentadas por acessos de Capsicum spp. através de métodos bioquímicos de determinação de proteínas totais, atividade da fenilalanina amônia liase, atividade de fenoloxidases e peroxidases. A atividade enzimática variou conforme o nível de resistência ix dos acessos avaliados, sendo maior nas primeiras horas após a inoculação e decrescendo após 72 horas. Foi possível identificar dois acessos resistentes (BC 05 e NT) que apresentaram média de notas de 1,17 e 0,94. O acesso BC apresentou A resistência dos acessos foi associada com a maior atividade da PPO e FAL, indicando que estas enzimas compõem o mecanismo de defesa em plantas de Capsicum. A atividade da POX foi menor quando comparada com a atividade da PPO e FAL.
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Caracterização molecular e inoculação de Ralstonia solanacearum em Eucalyptus spp / Molecular characterization and inoculation of Ralstonia solanacearum in Eucalyptus spp

Fonseca, Natália Risso 18 July 2012 (has links)
Made available in DSpace on 2015-03-26T13:37:49Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 1080649 bytes, checksum: 0b734c22ca6fdd3994db4802005b6004 (MD5) Previous issue date: 2012-07-18 / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico / The Ralstonia wilt of eucalyptus, caused by Ralstonia solanacearum, is potentially one of the major disease of culture. Because of its high genetic and phenotypic variability, currently R. solanacearum is considered a "species complex", subdivided into four taxonomic levels: species, filotipo, sequevar and clone. In order to understand the variability among isolates of R. solanacearum from eucalyptus and develop a protocol for inoculation and screening of resistant clones of eucalyptus to Ralstonia wilt this work was performed. The work was divided into two articles: (i) Molecular characterization of isolates of Ralstonia solanacearum in Eucalyptus spp. and (ii) Method of inoculation and evaluation of resistant clones of Eucalyptus spp. to Ralstonia wilt caused by Ralstonia solanacearum. In Article 1, 19 isolates were analyzed from different regions of eucalyptus in Brazil based on new classification (filotipo and sequevar) and its genetic variability. A product of 372 bp generated by multiplex-PCR amplification using primers Nmult permitted the identification of all isolates analyzed as pertaining to filotipo II. Eighteen isolates were grouped in subclade IIA and just one isolate in IIB. The phylogenetic tree generated from the endoglucanase (egl) gene sequences confirmed the classification of the isolates in filotipo II and separated them into sequevares. The strains AMC22, IBSBF2568 and IBSBF2576 were grouped into a single clade, as well as isolates UFV18 and UFV20, with 89% and 78% posterior probability, respectively, forming two new possible sequevares not defined yet. We also identified isolates belonging to sequevar 41 (100% probability) and 37 (88% probability). However, most of the isolates did not fit in any of previously described sequevar, or formed defined clades. The analysis of results of obtained fragments amplified by ERIC-PCR technique suggested a great genetic diversity among the isolates analyzed in this work. In addition, a high correlation between the geographical origin of isolates and the similarity showed by them was observed. In Article 2, three methods of inoculation and resistant of Eucalyptus spp. clones to Ralstonia wilt was evaluated: (i) soil infestation with R. solanacearum, (ii) dipping of sectioned roots in bacterial suspension, and (iii) injection of a bacterial suspension in the base of the stem. The injection method of a bacterial suspension at the stem base was the most efficient inoculation method of R. solanacearum on eucalyptus. Four, out of 21 clones tested for Ralstonia wilt resistance by this method, were classified as resistant by not showing symptoms of wilt and bacterial exudation up to 30 days after inoculation. / A murcha-de-Ralstonia do eucalipto, causada por Ralstonia solanacearum, constitui potencialmente, uma das principais doenças da cultura. Devido à sua ampla variabilidade, atualmente R. solanacearum é considerada um complexo de espécies , subdividida em quatro níveis taxonômicos: espécie, filotipo, sequevar e clone. Com o intuito de entender a variabilidade entre isolados de R. solanacearum provenientes de eucalipto e desenvolver um protocolo de inoculação e avaliação da resistência de clones de eucalipto à murcha-de-Ralstonia realizou-se este trabalho. Ele foi dividido em dois artigos: (i) Caracterização molecular de isolados de Ralstonia solanacearum de Eucalyptus spp. e (ii) Método de inoculação e avaliação de resistência de clones de Eucalyptus spp. à murcha-de-Ralstonia causada por Ralstonia solanacearum. No artigo 1, foram analisados 19 isolados de R. solanacearum obtidos de eucalipto de diferentes regiões do Brasil quanto à nova classificação (filotipo e sequevar) e quanto à variabilidade genética. Um produto de 372 pb gerado pela amplificação por PCR-multiplex, utilizando primers Nmult, permitiu identificar todos os isolados analisados no filotipo II. Dezoito isolados foram agrupados no subclado IIA e apenas um no IIB. A árvore filogenética gerada a partir das sequências do gene da endoglucanase (egl) confirmou a classificação dos isolados no filotipo II e os separou em sequevares. Os isolados AMC22, IBSBF2568 e IBSBF2576 agruparam-se em um único clado, assim como os isolados UFV18 e UFV20, com 89% e 78% de probabilidade posteriori, respectivamente, compondo dois novos possíveis sequevares, ainda não definidos. Foram identificados também isolados pertencentes ao sequevar 41 (100% de probabilidade) e 37 (88% de probabilidade). Entretanto, a maioria dos isolados não se enquadrou em nenhum sequevar descrito, nem formaram clados definidos. O resultado da análise de fragmentos amplificados pela técnica de ERIC-PCR indicou grande diversidade genética entre os isolados avaliados neste trabalho, havendo, em geral, uma alta correlação entre a origem geográfica dos isolados e a similaridade entre eles. No artigo 2, avaliaram-se três métodos de inoculação e a resistência de clones de Eucalyptus spp. à murcha-de-Ralstonia: (i) infestação do solo com R. solanacearum; (ii) imersão de raízes seccionadas em suspensão bacteriana; e (iii) injeção de suspensão bacteriana na base do caule. O método de inoculação de injeção de suspensão bacteriana na base do caule destacou-se como o mais eficiente para inoculações de R. solanacearum em eucalipto. De 21 clones avaliados quanto à resistência à murcha-de-Ralstonia por esse método, apenas quatro foram classificados como resistentes por não apresentarem sintomas de murcha e exsudação bacteriana até 30 dias após a inoculação.
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Efeito da compostagem na sobrevivência de Ralstonia pseudosolanacearum em restos culturais de tomateiro e qualidade do composto orgânico

SANTOS, Liliana Andréa dos 31 July 2015 (has links)
Submitted by (lucia.rodrigues@ufrpe.br) on 2016-10-19T14:01:53Z No. of bitstreams: 1 Liliana Andrea dos Santos.pdf: 813903 bytes, checksum: 14125d7515e4b40b82521f950f227906 (MD5) / Made available in DSpace on 2016-10-19T14:01:53Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Liliana Andrea dos Santos.pdf: 813903 bytes, checksum: 14125d7515e4b40b82521f950f227906 (MD5) Previous issue date: 2015-07-31 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - CAPES / The composting process is a microbial biotransformation used as an alternative for the adequate destination of the crop residues. It is a simple, economic and efficient technique for the treatment and stabilization of these residues and minimizes the environmental impacts in soil, air and water besides eliminates plant and human pathogens. The goals of this work were to investigate the survival of a mutant of phytobacteria Ralstonia pseudosolanacearum (CRMRS74Rif) in tomato crop residues during composting process and analyze the quality of the organic compound in relation to physical, chemical and microbiological variables. Three composting piles were made of tomato and napier grass crop residues plus ovine manure. Then, nine mesh bags with 10 g of infected tomato plants were placed in each pile, three at each depth of 20, 40 and 60 cm. Piles were turned over after 10, 20 and 30 days when evaluations of bacterial survival were made. At the end of the composting process, we quantified microbial population, antagonism against R. pseudosolanacearum, total phenolic content and compost quality. At the first evaluation (10 days) CRMRS74Rif were not recovered in culture medium, indicating that it was already eliminated of the infected material. Total bacteria were present in high populations in the compound, ranging from 7.0 x 1012 to 2.0 x 1016 CFU/g of compound, and the fluorescent Pseudomonas were the most frequent. Sixty-two isolates showed antagonistic activity against R. pseudosolanacearum CRMRS74Rif, detected by the inhibition halo formation. However, only 32 isolates maintained the antagonism in a second in vitro assay. The fungal population ranged from 3.2 x 102 to 1.2 x 103 CFU/g of compound. Based on morphological structures 40 isolates were identified at genus level: Aspergillus spp., Cladosporium spp., Curvularia spp., Fusarium spp., Paecilomyces spp., Trichoderma spp., and the Oomycete Pythium sp. Among these isolates, nine produced toxic metabolites and inhibited the pathogen growth with halos ranging from 15 to 23 mm. The total population of actinomycetes in compound ranged from 3.8 to 9.5 x 104 CFU/g of compound and based on cultural characteristics 33 isolates were selected for the antagonistic tests. Among them, four produced toxic metabolites against R. pseudosolanacearum CRMRS74Rif with halos ranging from 23 to 33 mm. Total phenolic content found in composting pile averaged 0.0065%. The high temperatures generated in the piles during the termophylic phase (media 50oC), the presence of antagonistic microbial populations and the phenolic compounds might be the cause of the quick elimination of R. pseudosolanacearum from the compound. The results of the physico-chemical and microbiological analysis attended the established limits of the current Brazilian legislation for using and comercialization of an organic compound, indicating that the obtained product has good quality. / A compostagem é um processo microbiano de biotransformação, considerada uma alternativa para a destinação adequada dos resíduos culturais, sendo uma técnica simples, viável economicamente e eficiente no tratamento e estabilização dos resíduos, minimizando os impactos ambientais no solo, no ar e na água, além de eliminar micro-organismos patogênicos aos vegetais e aos seres humanos. Os objetivos da pesquisa foram investigar a sobrevivência de um mutante da fitobactéria Ralstonia pseudosolanacearum (CRMRS74Rif) em restos culturais de tomateiro durante a compostagem e verificar a qualidade do composto orgânico em relação a variáveis físicas, químicas e microbiológicas. Três pilhas de compostagem foram constituídas de restos culturais de tomateiro e capim elefante, e esterco de ovino. Nove bolsas contendo 10 g de tecidos de tomateiro infectado foram depositadas em cada pilha, três em cada profundidade (20, 40 e 60 cm). Os revolvimentos das pilhas foram feitos aos 10, 20 e 30 dias de compostagem, quando então foram realizadas as avaliações da sobrevivência da fitobactéria. Ao final do processo (30 dias) foram quantificados os micro-organismos presente no composto e o antagonismo a R. pseudosolanacearum, os compostos fenólicos totais e variáveis da qualidade do composto. Na primeira avaliação realizada aos 10 dias o mutante não foi recuperado em meio de cultura, indicando que já havia sido eliminado do material infectado. As bactérias totais foram quantificadas em elevadas populações no composto, variando de 7,0 x 1012 a 2,0 x 1016 UFC/g de composto, com predominância de Pseudomonas do grupo fluorescente. Sessenta e dois isolados apresentaram atividade antagônica a R. pseudosolanacearum CRMRS74Rif, detectada através da formação de halo de inibição do crescimento bacteriano. No entanto, apenas 32 isolados mantiveram o antagonismo em novo teste realizado in vitro. A população de fungos variou de 3,2 x 102 a 1,2 x 103 UFC/g de composto. Com base nas estruturas morfológicas, foram identificados 40 isolados ao nível de gênero: Aspergillus spp., Cladosporium spp., Curvularia spp., Fusarium spp., Paecilomyces spp. e Trichoderma spp., e também o Oomiceto Pythium sp., e destes, nove produziram metabólitos tóxicos e inibiram o crescimento bacteriano, com halos variando de 15 a 23 mm. A população total de actinomicetos no composto variou de 3,8 a 9,5 x 104 UFC/g de composto, e com base em características culturais foram selecionados 33 isolados para teste de antagonismo, dois quais, quatro produziram metabólitos tóxicos contra R. pseudosolanacearum CRMRS74Rif, com halos variando de 23 a 33 mm. Compostos fenólicos totais foram encontrados nas pilhas de compostagem em uma concentração média de 0,0065%. As altas temperaturas geradas nas pilhas durante a fase termofílica (em média 50oC), a presença de micro-organismos antagonistas e compostos fenólicos foram responsáveis pela rápida eliminação de R. pseudosolanacearum do composto. Os resultados das análises físico-químicas e microbiológicas atenderam aos limites estabelecidos pela legislação vigente para uso e comercialização de composto orgânico, indicando que o composto obtido é de boa qualidade.

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