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Validação de genes candidatos de arroz de terras altas (Oryza sativa L.) para tolerância à seca / Validation of candidate genes from upland rice (Oryza sativa L.) for drought tolerance

Santos, Fabianna Ferreira dos 31 October 2017 (has links)
Submitted by JÚLIO HEBER SILVA (julioheber@yahoo.com.br) on 2017-11-21T16:58:09Z No. of bitstreams: 2 Dissertação - Fabianna Ferreira dos Santos - 2017.pdf: 2021838 bytes, checksum: b3bb0be06a5e24c873bd447f07705f2e (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) / Approved for entry into archive by Luciana Ferreira (lucgeral@gmail.com) on 2017-11-22T10:22:27Z (GMT) No. of bitstreams: 2 Dissertação - Fabianna Ferreira dos Santos - 2017.pdf: 2021838 bytes, checksum: b3bb0be06a5e24c873bd447f07705f2e (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) / Made available in DSpace on 2017-11-22T10:22:27Z (GMT). No. of bitstreams: 2 Dissertação - Fabianna Ferreira dos Santos - 2017.pdf: 2021838 bytes, checksum: b3bb0be06a5e24c873bd447f07705f2e (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Previous issue date: 2017-10-31 / Conselho Nacional de Pesquisa e Desenvolvimento Científico e Tecnológico - CNPq / Upland rice is grown without irrigation and the availability of water is totally dependent on the occurrence of rainfall. The objective of this study was to evaluate the differential expression of genes previously identified as responsive in drought conditions in upland rice genotypes grown under controlled irrigation and water restriction conditions. Two water treatments were applied, irrigation during the whole experiment and the water restriction, where irrigation was suspended for five days from the beginning of the reproductive stage (R2 / R3), with subsequent replacement of 50% of evapotranspirated water by irrigated plants at the base of the column for 10 days, followed by adequate irrigation until the end of the plant cycle. At the end of the crop cycle, evaluations of the production components (number of full grains, number of empty grains and mass of 100 grains) and yield were performed. Productivity estimates of 24 genotypes ranged from 44 to 170 g column-1 in the irrigated treatment and from 4 to 86 g column-1 in the water deficiency condition. The genotypes Três Meses Branco, BRS Esmeralda, BRSGO Serra Dourada, Casca Branca, BRSMG Curinga, Bico Ganga and Rabo de Burro were among the most productive genotypes both in irrigated condition and in water deficiency condition. Of the 24 genotypes used in the experiment described above, 12 contrasting yields in water treatments were characterized for differential expression for two target genes. One gene integrates the antioxidative defense system (Superoxide dismutase cofactor Manganese - MnSOD) and the other is a glycosyltransferase that promotes the glycosylation of an anthocyanin molecule (anthocyanidin 3-O-beta-D-glucosyltransferase). ANOVA based on the gene expression data revealed genotypes, water treatments and collection time in the gene expression (p≤0.05). The MnSOD gene presented the highest level of expression in all genotypes in the condition of greatest water restriction (five days without irrigation), with higher levels of expression in the less productive genotypes under stress conditions. On the other hand, the glycosyltransferase gene presented a considerably reduced expression in the most critical condition of the stress, without clear indicative of differentiation among the most productive genotypes during stress. The two genes evaluated were clearly responsive (p≤0.05) to the most severe water stress, but did not explain the differences between the genotypes grouped in the productivity estimates with and without dry stress. Therefore, it is possible to conclude that, due to the complexity in the processes adaptive to drought, each genotype uses different mechanisms of molecular responses, and it is not possible to differentiate them only through the genes evaluated in this study. / O arroz de terras altas é cultivado sem irrigação e a disponibilidade de água é totalmente dependente da ocorrência de chuva. O objetivo desse estudo foi avaliar em genótipos de arroz de terras altas cultivados em condições controladas de irrigação e restrição hídrica a expressão diferencial de genes previamente identificados como responsivos em condições de seca. Foram aplicados dois tratamentos hídricos, o irrigado durante todo experimento e o de restrição hídrica, onde a irrigação foi suspensa por cinco dias a partir do início do estádio reprodutivo (R2/R3), com subsequente reposição de 50 % da água evapotranspirada pelas plantas irrigadas na base da coluna por 10 dias, seguido por irrigação adequada até o final do ciclo da planta. Ao término do ciclo da cultura foram realizadas as avaliações dos componentes de produção (número de grãos cheios, número de grãos vazios e massa de 100 grãos) e da produtividade. As estimativas de produtividade dos 24 genótipos variaram de 44 a 170 g coluna-1 no tratamento irrigado e de 4 a 86 g coluna- 1 na condição de deficiência hídrica. Os genótipos Três Meses Branco, BRS Esmeralda, BRSGO Serra Dourada, Casca Branca, BRSMG Curinga, Bico Ganga e Rabo de Burro figuraram dentre os mais produtivos tanto em condição irrigada quanto em condição de deficiência hídrica. Dos 24 genótipos utilizados no experimento descrito acima, 12 contrastantes quanto à produtividade nos tratamentos hídricos foram caracterizados quanto à expressão diferencial para dois genes-alvo. Um gene integra o sistema de defesa antioxidativo (Superóxido dismutase cofator Manganês – MnSOD) e o outro é uma glicosiltransferase que promove a glicosilação de uma molécula de antocianina (anthocyanidin 3-O-beta-D-glucosyltransferase). A ANOVA realizada a partir dos dados de expressão gênica revelou efeito dos genótipos, tratamentos hídricos e época de coleta na expressão gênica (p≤0.05). O gene MnSOD apresentou o maior nível de expressão em todos os genótipos na condição de maior restrição hídrica (cinco dias sem irrigação), com maiores níveis de expressão nos genótipos menos produtivos em condição de estresse. Já o gene glicosiltransferase apresentou uma expressão consideravelmente reduzida na condição mais crítica do estresse, sem indicativo claro de diferenciação entre os genótipos mais produtivos durante o estresse. Os dois genes avaliados foram claramente responsivos (p≤0.05) ao estresse hídrico mais severo, porém não explicaram as diferenças entre os genótipos agrupados quanto às estimativas de produtividade com e sem estresse de seca. Diante disso, é possível concluir que diante da complexidade nos processos adaptativos à seca, cada genótipo utiliza diferentes mecanismos de respostas moleculares, não sendo possível diferencia-los somente através dos genes avaliados nesse estudo.
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Progresso genético para produção de grãos obtido em doze anos de melhoramento da população elite de arroz de terras altas / Genetic progress for grain yield obtained in twelve years of improvement in elite population of upland rice

Barros, Matheus Souza de 10 August 2015 (has links)
Submitted by Luciana Ferreira (lucgeral@gmail.com) on 2017-04-18T14:23:20Z No. of bitstreams: 2 Dissertação - Matheus Souza de Barros - 2015.pdf: 1949086 bytes, checksum: 889a6c45d4ce66700cc7ff366ef3caed (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) / Approved for entry into archive by Luciana Ferreira (lucgeral@gmail.com) on 2017-04-18T14:23:40Z (GMT) No. of bitstreams: 2 Dissertação - Matheus Souza de Barros - 2015.pdf: 1949086 bytes, checksum: 889a6c45d4ce66700cc7ff366ef3caed (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) / Made available in DSpace on 2017-04-18T14:23:40Z (GMT). No. of bitstreams: 2 Dissertação - Matheus Souza de Barros - 2015.pdf: 1949086 bytes, checksum: 889a6c45d4ce66700cc7ff366ef3caed (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Previous issue date: 2015-08-10 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - CAPES / The genetic improvement resulted from plant breeding acts decisively in maintaining the supply of agricultural foods like rice. The contribution of this genetic improvement to increase productivity is expressed in many crops by genetic progress which represents the genetic changes in the course of the selection cycles, and promotes the advance of genotypic average towards selection. Among the strategies adopted to increase the gain by selection, the early generation selection proves to be promising. This work has aimed to evaluate the genetic potential for selecting upland rice progenies and estimate the genetic progress for grain yield. The data used in this study were obtained from the progeny yield trials conducted in the period of eleven agricultural years 2002/03 to 2012/13 conducted by Embrapa Rice and Beans. The traits analyzed were grain yield (kg ha-1), plant height (cm) and days to flowering (day). In each year of the experiment, a group of progeny was tested in four to six sites. It was used Federer's augmented block design without replication per site in seven years and with at least three checks, in four years of the series were used two replications. The experimental data within each year were submitted to joint analysis. A mixedeffects linear model was applied for estimating the components of variance by the method of restricted maximum likelihood (REML). From this estimate of the components, it was calculated the genetic and phenotypic parameters, in addition the selective accuracy, the experimental precision coefficient, the experimental variation coefficient and relative variation coefficient. The genetic progress was estimated by the method of generalized linear regression of the adjusted means of progeny groups evaluated in each year by the mixed model approach. The estimates of the relative annual mean gain and the total relative gain for the three studied traits were also obtained. The estimates of genetic variance among progenies for grain yield were highly significant (p < 0.001), except for the progeny group evaluated in 2007. The heritability estimation ranging from 0.22 to 0.69 that, associated with the selective accuracy, indicates the expected level of efficiency with early generation selection in each group of progenies. For Plant height and daysto- flowering, the genetic variance estimates were significant (p ≤ 0.01) in all groups. The variance components for these traits led to a rather high heritability estimation that suggests favorable conditions for selection in early generations. The genetic progress for grain yield (80.5 kg ha-1 yr-1) was highly significant. This value represents a relative annual mean gain of 2.88%. Throughout the period, the cumulative gain was estimated in 32.86% which indicates an increase of 918 kg ha-1 for grain yield. The response for plant height was not significant, suggesting that the height of progenies remained stable over the period. For days-to-flowering, it was detected significant increase in cycle length, indicated by the cumulative increase of the vegetative period in about five days (6.73%). From these results we conclude that early generation selection, adopted by the breeding program, were effective in promoting the genetic gain for grain yield in the elite populations. / O melhoramento genético de plantas atua de modo decisivo na manutenção da oferta de alimentos de origem agrícola como o arroz. A contribuição do melhoramento para o aumento da produtividade em várias culturas é expressa pelo progresso genético, que representa as alterações genéticas, no decorrer dos ciclos seletivos, promovendo o deslocamento da média genotípica do caráter no sentido da seleção. Entre várias estratégias adotadas para aumentar os ganhos com a seleção merece destaque a seleção precoce, que envolve a avaliação de progênies endogâmicas nas gerações F3 ou F4. Este trabalho teve como objetivo avaliar o potencial genético para a seleção em progênies de arroz de terras altas e estimar o progresso genético para produção de grãos. Foram utilizados dados dos ensaios de rendimento de progênies conduzidos no período de onze anos agrícolas, 2002/03 a 2012/13 pela Embrapa Arroz e Feijão. Foram analisados os caracteres produção de grãos (kg.ha-1), altura de plantas (cm) e dias para a floração (dia). Em cada ano da série um grupo de progênies foi testado em experimentos instalados entre quatro a seis locais. Foi empregado o delineamento blocos aumentados de Federer em sete anos da série sem repetição por local e com no mínimo três testemunhas, e em quatro anos os ensaios foram duplicados. Os dados foram submetidos à análise conjunta dos experimentos dentro de cada ano. Por meio de um modelo linear de efeitos mistos foram estimados os componentes de variância pelo método da máxima verossimilhança restrita ou residual (REML). A partir da estimativa dos componentes foram calculados os parâmetros genéticos e fenotípicos. O progresso genético foi estimado pelo método da regressão linear generalizada das médias ajustadas dos grupos de progênies avaliadas em cada ano, pela abordagem de modelos mistos. Foram obtidas as estimativas do ganho médio relativo anual e do ganho relativo total. As estimativas de variância genética, para produção de grãos, entre progênies foram altamente significativas (p<0,001), exceto pelo grupo de progênie avaliado em 2007. As estimativas de herdabilidade variaram de 0,22 a 0,69, que associadas às estimativas de acurácia seletiva indicam o nível de eficiência esperado com a seleção precoce em cada grupo de progênies. Para os caracteres altura de plantas e dias para floração as estimativas de variância genética foram significativas (p≤0,01) em todos os grupos. Os componentes de variância para esses caracteres conduziram a estimativas de herdabilidade bastante elevadas, sugerindo, por tanto, condições favoráveis para seleção em gerações iniciais. O progresso genético estimado para produção de grãos (80,5 kg.ha-1ano-1) foi altamente significativo, representando um ganho relativo médio anual de 2,88%. Em todo o período o ganho acumulado estimado foi de 32,86%, que equivale ao incremento em produtividade de 918 kg ha-1. A resposta para altura de plantas não foi significativa, sugerindo que a estatura das progênies avaliadas permaneceu estável ao longo do período. Para dias para floração houve aumento significativo na duração do ciclo, expresso pelo acréscimo acumulado de aproximadamente cinco dias (6,73%) na duração do ciclo vegetativo. Conclui-se que a estratégia de seleção precoce, adotada pelo programa de melhoramento, foi eficiente em promover o progresso genético para o caráter produção de grãos nas populações elites.
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Influência de variáveis macroclimáticas sobre as principais doenças do arroz / Influence of macroclimatic variables on the main rice diseases

Aguiar, Jordene Teixeira de 03 March 2016 (has links)
Submitted by Luciana Ferreira (lucgeral@gmail.com) on 2017-06-02T11:41:33Z No. of bitstreams: 2 Dissertação - Jordene Teixeira de Aguiar - 2016.pdf: 3048073 bytes, checksum: b062d30a5cf4c2dd3b7a78ebc8a9e2c6 (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) / Approved for entry into archive by Luciana Ferreira (lucgeral@gmail.com) on 2017-06-02T11:42:03Z (GMT) No. of bitstreams: 2 Dissertação - Jordene Teixeira de Aguiar - 2016.pdf: 3048073 bytes, checksum: b062d30a5cf4c2dd3b7a78ebc8a9e2c6 (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) / Made available in DSpace on 2017-06-02T11:42:03Z (GMT). No. of bitstreams: 2 Dissertação - Jordene Teixeira de Aguiar - 2016.pdf: 3048073 bytes, checksum: b062d30a5cf4c2dd3b7a78ebc8a9e2c6 (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Previous issue date: 2016-03-03 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - CAPES / The influence of climatic variables on rice diseases was assessed in Brazil. Firstly, it was necessary to validate climate data from remote sensoring, retrieved from NASA’s database Prediction of Worldwide Energy Resource (POWER). POWER data were compared to climate records of surface stations from the National Institute of Meteorology (INMET). Climate data consisted of a time series (2004-2014) of monthly average temperatures and rainfall. Validation tests were carried out with Pearson’s coefficient of correlation and adjustment of linear regression models between the satellite data and surface stations. Further, data accuracy was checked according to average absolute error, root mean square deviation and concordance index. Monthly rainfall from most regions satisfactory correlated with Pearson coefficients between 0.75 and 0.95 (P<0.05). In contrast, maximum and minimum temperatures recorded by satellites showed irregular results that vary by region. In these cases, remote sensing did not detect extreme weather events, such as heavy rainfall or drought. Monthly rainfall comparisons also showed the most consistent results for all regions in accuracy tests. The endorsed data supported the next stage of this work, regarding the effects of climate variables on rice diseases. This investigation counted on a historical series of disease severities recorded in field tests, carried out between 1983 and 2014. Climatic data from INMET, EMBRAPA and NASA/POWER was arranged in a matrix of environmental variables, and tested for correspondence with disease severities recorded in 15 sites for at least eight years. Redundant climate variables were eliminated by principal component analysis. With structured data disposed in two datasets of climate (explanatory variables) and disease severity and productivity (response variables), canonical correlation analysis was performed (CCA) by location and by regions. The influence of climate on disease severity was demonstrated in only five sites, according to CCA models significant at 5%, with their first two axes explaining over than 50% of explanatory variables. In such sites, the total variation in disease severity was partially explained by climate variables. In the regional approach, climate variables did not significantly influence rice diseases in the North Region. Nevertheless, significant models demonstrated the correlation between climatic variables and disease in the Center-West and Northeast, despite the small percentage of explanation by the first two axes. In general, higher disease severity was related to rainfall and lower minimum temperatures during the reproductive stage of rice plots. In all cases, yield was not related to environmental variables. / Este estudo foi realizado para se verificar a influência de variáveis climáticas sobre doenças do arroz no Brasil. Inicialmente, foi necessário validar dados climáticos obtidos via sensor remoto orbital, obtidos no banco de dados Prediction of Worldwide Energy Resource (POWER) da NASA. Esses dados foram comparados aos obtidos de estações de superfície brasileiras do Instituto Nacional de Meteorologia (INMET). Os dados foram compostos de séries históricas (2004 a 2014) de médias mensais de temperaturas e precipitação. Para validação, foram estimados os coeficientes correlação de Pearson e modelos de regressão linear entre os dados estimados via satélite e obtidos via estações de superfície. Para verificação da acurácia, foram estimados o erro médio absoluto, o desvio médio quadrático e o índice de concordância. Os dados de precipitação mensal para a maioria das regiões apresentaram coeficientes de correlação satisfatórios, entre 0,75 e 0,95 (P<0,05). Já os dados de temperaturas máxima e mínima obtidos por satélites apresentaram resultados irregulares que variavam conforme a região. Nestes casos, verificou-se que os dados obtidos remotamente não detectaram eventos climáticos extremos, como chuvas ou seca intensas. As médias de precipitação mensal também apresentaram resultados mais consistentes para todas as regiões, em testes de acurácia. Os dados validados subsidiaram a segunda etapa deste trabalho, quando foram avaliados os efeitos das variáveis climáticas sobre as doenças da cultura do arroz. Contou-se com uma série histórica de dados de severidade de doença registrados entre 1983 a 2014. Os dados climáticos do INMET, Embrapa e NASA/POWER foram utilizados para compor uma matriz com variáveis ambientais, e verificação de sua correspondência com a severidade de doenças em 15 locais com séries históricas de pelo menos oito anos. Por meio da análise de componentes principais foram eliminadas as variáveis climáticas redundantes. Com dados estruturados em duas matrizes, clima (variáveis explanatórias) e severidade de doença mais produtividade (variáveis de resposta) foram realizadas análises de correspondência canônicas (CCA) por local e por regiões. Dentre os 15 locais analisados, apenas cinco apresentaram modelos significativos a 5%, com a explicação da variação dos dados pelos dois primeiros eixos acima de 50%, demostrando que, em alguns locais, a variação total da severidade das doenças é explicada parcialmente por variáveis climáticas. De acordo com as CCAs por regiões, observou-se que na região Norte as variáveis climáticas não influenciam significativamente as doenças do arroz. Por outro lado, modelos significativos demonstraram a correspondência entre as variáveis climáticas e doenças para as regiões Centro-Oeste e Nordeste, ainda que com baixa porcentagem de explicação. De modo geral, a maior severidade de doenças foi atribuída á ocorrência de chuvas e menores temperaturas mínimas durante o estádio reprodutivo da cultura. Em todos os casos, a produtividade não foi relacionada ás variáveis ambientais.
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Caracterização físico-química e culinária na predição da qualidade de grãos de arroz de terras altas / Physicochemical and cooking characterization on the prediction the grain quality of upland rice

Moreira, Adriane Maranho 28 August 2012 (has links)
Submitted by Luanna Matias (lua_matias@yahoo.com.br) on 2015-03-25T20:20:19Z No. of bitstreams: 2 Dissertação - Adriane Maranho Moreira - 2012.pdf: 1092932 bytes, checksum: fcc9fe552451e7a08633d5313a1957b8 (MD5) license_rdf: 23148 bytes, checksum: 9da0b6dfac957114c6a7714714b86306 (MD5) / Approved for entry into archive by Luanna Matias (lua_matias@yahoo.com.br) on 2015-03-26T12:46:10Z (GMT) No. of bitstreams: 2 Dissertação - Adriane Maranho Moreira - 2012.pdf: 1092932 bytes, checksum: fcc9fe552451e7a08633d5313a1957b8 (MD5) license_rdf: 23148 bytes, checksum: 9da0b6dfac957114c6a7714714b86306 (MD5) / Made available in DSpace on 2015-03-26T12:46:10Z (GMT). No. of bitstreams: 2 Dissertação - Adriane Maranho Moreira - 2012.pdf: 1092932 bytes, checksum: fcc9fe552451e7a08633d5313a1957b8 (MD5) license_rdf: 23148 bytes, checksum: 9da0b6dfac957114c6a7714714b86306 (MD5) Previous issue date: 2012-08-28 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - CAPES / The evaluation of cooking and sensory characteristics of a particular cultivar is an important attribute for rice grain quality, in order to direct the decisions by the breeding programs and to allow the prediction of its market acceptance. The target population of this study was originated from a cross between two upland rice cultivars, BRS Primavera and Douradão, chosen in order to add to descendent genotypes the desirable grain quality of the first with the favorable agronomic profile of the second. The objective of this research was to propose a methodology for evaluating the quality of grain from that upland rice segregating population under different storage conditions, to optimize line selection in rice breeding programs focused on rice table. The grains were harvested in 2010 in Santo Antonio de Goiás, milled and analyzed for apparent amylose content, gelatinization temperature, rice flour paste viscosity and cooking test. The results were used to calculate the Pearson correlation coefficient (r). The ANOVA was performed by applying the "F" distribution of Fischer- Snedecor, adopting a significance level of 5%. The physicochemical characterization performed showed the existence of heterogeneous families. The observed changes in the physicochemical and cooking characteristics prove that time and temperature of storage promote modifications on chemical and physical properties of the grain, being the grain cohesiveness reduction the most pronounced change. From the use of the proposed methodology, it was possible to perform the pre-selection of accesses in the target population, by reducing at least 76% the number of resulting samples for final selection. Only 5% of the progeny were pre-selected for the five treatments simultaneously. Indirect analysis recommended for the characterization of rice cooking quality for direct consumption did not provide the desired setting with the cooking test, showing the need for greater integration of generated results and the application of more refined sensory test; on the other hand, they present themselves as appropriate to allow the pre-selection of accesses by this methodology. The methodology proposed in this study showed to be a useful tool in the pre-selection of individuals, and may also be adapted in the pre-selection of lines for other purposes in breeding programs of rice culture and even for other cultures. / A avaliação de características culinárias e sensoriais de determinada cultivar é atributo importante para qualidade de grãos em arroz, direcionando decisões para os programas de melhoramento e permitindo predizer sua aceitação no mercado. A população alvo deste estudo originou-se do cruzamento entre duas cultivares de arroz de terras altas, BRS Primavera e Douradão, escolhidas com o propósito de agregar nos genótipos descendentes as características de qualidade de grãos da primeira com o perfil agronômico favorável da segunda. O objetivo desta pesquisa foi propor uma metodologia de avaliação da qualidade de grãos, a partir dessa população segregante sob diferentes condições de armazenamento, para otimizar a seleção de linhagens em programas de melhoramento com foco em arroz de mesa. Os grãos foram provenientes da safra/2010 em Santo Antonio de Goiás, beneficiados e analisados quanto ao teor de amilose aparente, temperatura de gelatinização, perfil viscoamilográfico e teste de cocção. Os resultados foram utilizados para calcular o coeficiente de correlação de Pearson (r). Na análise de variância foi empregada a distribuição "F" de Fischer-Snedecor, adotando-se nível de significância de 5%. A caracterização físico-química realizada mostrou a existência de heterogeneidade nas famílias. As mudanças observadas nas características físico-químicas e culinárias comprovam que o tempo e a temperatura de armazenamento promovem alterações na estrutura físico-química do grão, sendo a redução na pegajosidade a alteração mais pronunciada. A partir do uso da metodologia proposta, foi possível realizar a pré-seleção de famílias da população em estudo, reduzindo pelo menos 76% o número de amostras resultantes para a seleção final. Somente 5% da progênie foram pré-selecionadas simultaneamente nos cinco tratamentos. As análises indiretas recomendadas para a caracterização da qualidade culinária de arroz para mesa não apresentaram o ajuste desejado com o teste de panela, mostrando a necessidade de maior integração dos resultados gerados e da aplicação de teste sensorial mais refinado; por outro lado, apresentam-se como adequadas para possibilitar a pré-seleção de linhagens por essa metodologia. A metodologia proposta neste estudo mostrou-se como ferramenta útil na pré-seleção de famílias, podendo ainda ser adaptada na pré-seleção de genótipos para outros fins em programas de melhoramento da cultura de arroz e, até mesmo, de outras culturas.
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Mapeamento associativo para produtividade em arroz sob déficit hídrico / Association mapping for rice grain yield under drought stress

Pantalião, Gabriel Feresin 26 March 2013 (has links)
Submitted by Luciana Ferreira (lucgeral@gmail.com) on 2015-04-20T14:13:50Z No. of bitstreams: 2 Dissertação - Gabriel Feresin Pantalião - 2103.pdf: 1079775 bytes, checksum: fb08083324cd3c94d9a60fd9eeddd83d (MD5) license_rdf: 23148 bytes, checksum: 9da0b6dfac957114c6a7714714b86306 (MD5) / Approved for entry into archive by Luciana Ferreira (lucgeral@gmail.com) on 2015-04-20T14:15:43Z (GMT) No. of bitstreams: 2 Dissertação - Gabriel Feresin Pantalião - 2103.pdf: 1079775 bytes, checksum: fb08083324cd3c94d9a60fd9eeddd83d (MD5) license_rdf: 23148 bytes, checksum: 9da0b6dfac957114c6a7714714b86306 (MD5) / Made available in DSpace on 2015-04-20T14:15:43Z (GMT). No. of bitstreams: 2 Dissertação - Gabriel Feresin Pantalião - 2103.pdf: 1079775 bytes, checksum: fb08083324cd3c94d9a60fd9eeddd83d (MD5) license_rdf: 23148 bytes, checksum: 9da0b6dfac957114c6a7714714b86306 (MD5) Previous issue date: 2013-03-26 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - CAPES / Drought is an environmental factor which narrows crop production, such as upland rice (Oryza sativa L.). The knowledge of aspects related to drought stress, and plant response to it, may furnish plant breeding programs essential data for the development of tolerant cultivars, and hence with higher yields under such conditions. Association mapping has been a successful approach to elucidate the genetic basis of economically important traits in plants, and afterward in the implementation of marker assisted selection (MAS). Next-generation sequencing (NGS) technologies have been applied in a variety of contexts, including SNP identification and development. Among methodologies for marker discovery and high-throughput genotyping, GBS (Genotyping by Sequencing) points out by its low cost and speed at which samples can be analyzed. The aim of this work was to identify, by GBS, the polymorphism from SNP markers within 283 upland accessions from Embrapa Rice Core Collection (ERiCC) and associate them to yield under drought stress. After filtering the raw data of predetermined stringent parameters, 285.379 SNP were identified in the 12 rice chromosomes. For the association mapping, molecular and phenotypic data were combined for the identification of SNP associated to drought, aiming the subsequent development of a marker set for MAS besides the identification of genes for genetic engineering. The analysis identified 48 SNP associated with the evaluated traits, 13 associated to drought susceptibility index (DSI) and 35 to yield under drought stress. Among the 48 SNP, 35 was anchored in 31 rice genes. Seven genes, out of the 31, possessed SNP associated to DSI, and the other 24 genes to yield under drought stress. These genes may be evaluated to be effectively employed for MAS. If the overexpression of such genes provides an enhanced drought tolerance, they may be used in the development of tolerant rice cultivars. / A seca é um fator ambiental que limita a produção das culturas, como a do arroz de terras altas (Oryza sativa L.). O conhecimento de fatores envolvidos na tolerância à deficiência hídrica e das respostas das plantas a esse estresse podem fornecer subsídios aos programas de melhoramento para o desenvolvimento de cultivares tolerantes, e, consequentemente, com uma maior produtividade sob essas condições. O mapeamento associativo, ou análise de associação, tem sido aplicado com sucesso em plantas, sendo utilizado primeiramente na identificação de genes associados a caracteres de importância econômica, e posteriormente, na implementação de seleção assistida por marcadores (SAM). Tecnologias de sequenciamento de nova geração (NGS) têm sido recentemente utilizadas em projetos de sequenciamento e resequenciamento para identificar, validar e avaliar um grande número de SNPs, os quais podem ser utilizados em estudos de mapeamento associativo. Dentre os métodos desenvolvidos para a descoberta de marcadores moleculares e genotipagem de alto desempenho, destaca-se pela rapidez e baixo custo a genotipagem por sequenciamento (GBS). Esse trabalho objetivou detectar, via GBS, o polimorfismo de marcadores SNPs em 283 acessos de arroz de terras altas componentes da CNAE (Coleção Nuclear de Arroz da Embrapa) e associá-los à produtividade sob déficit hídrico. Após a filtragem dos dados brutos de acordo com parâmetros de estringência pré-definidos, foram contabilizados 285.379 SNPs distribuídos ao longo dos 12 cromossomos do arroz. As informações moleculares foram integradas aos dados fenotípicos derivados do experimento de avaliação de produtividade e Índice de Suscetibilidade à Seca (ISS), conduzido no ano de 2010 em Porangatu (GO) em ambiente com e sem deficiência hídrica, para possibilitar a análise de mapeamento associativo, e com isso, detectar marcadores SNPs relacionados à tolerância à seca e oportunizar o desenvolvimento de um conjunto de marcadores úteis para a seleção assistida para esse caráter, assim como genes para estudos de engenharia genética do arroz. Através da análise de associação, foram detectados 48 SNPs relacionados com os caracteres avaliados, dentre os quais 13 foram relacionados ao ISS e 35 à produtividade em condição de déficit hídrico. Dentre os 48 SNPs, foram identificados 35 SNPs ancorados em 31 genes de arroz. Dentre os genes identificados, sete deles continham SNPs associados ao ISS, enquanto que os restantes 24 genes continham SNPs associados à produtividade dos acessos em ambiente com deficiência hídrica. Esses genes podem ser avaliados para serem efetivamente utilizados na seleção assistida por marcadores. Adicionalmente, esses genes podem ser superexpressos para avaliar sua capacidade de aumentar a tolerância à seca, e em caso positivo, gerar cultivares comerciais de arroz geneticamente modificadas mais tolerantes a esse estresse.
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Rice performance, water and nitrogen efficiency in different irrigation regimes in tropical lowland / Performance do arroz, eficiência de água e nitrogênio em diferentes regimes de irrigação em planícies de inundação tropical

André Fróes de Borja Reis 20 June 2017 (has links)
Rice (Oryza sativa L.) crop has an important role to attend the food demand of a growing world population, and the production increment will come not just from increasing efficiency in the current cropland, but also from expansion to new areas. The tropical lowland plains of northern Brazil are already being converted to rice production, although the lack of scientific knowledge and agricultural practices suited local conditions. This region presents soils with weathered clays with distinct properties from those grown in traditional rice regions, and deploying agricultural practices developed to others agroecosystem lead to instable crop yield inadequate uses of agricultural inputs. Water is the greatest resource that rice crop relies on, and worldwide continuous flooding is broadly used. Alternative irrigations regimes with purpose to save water have been proposed due the threatens of water scarcity, and promising results stimulate this approach, despite grain yield penalties due drought stress and/or decrease of soil N availability. The soil moisture and oxygen amount interfere on nitrogen dynamics, thus can enhance loss process and change crop response to N fertilizer. In tropical lowland region of Brazil water and nitrogen are limited and continuous flooding irrigation is not sustainable due huge water amount used associated to low grain yields. Therefore, this research was performed aiming an integrated assessment of irrigation regimes, nitrogen use and crop performance in rice crop in Brazilian tropical lowland. The field experiment was done during three years in a Plinthaquults soil at Tocantins. The first stage was aimed to identify the irrigation regime which provides the best water use efficiency (WUE), nitrogen use efficiency (NUE) and crop performance with indigenous N soil supply and nitrogen fertilizer. The second stage compared the best observed irrigation regime to continuous flooding, and the nitrogen relationship to crop components along their development and harvest. The first experiment was a split-plot design with 5 irrigation regime (IR) in main plot: alternate wet and dry in short cycle (AWDS); alternate wet and dry in long cycle (AWDL); Continuous flooding (CF); Non-flooding aerobic (NF); saturated soil without ponding water (SS). And subplot was N fertilizer rate: 0 and 150 kg ha-1 of N. Crop performance was affected by IR and N level. In the average of three years nitrogen uptake (NU) was 32% higher in NF than any other irrigation regime. Grain yield across N level was 7.2, 8.8 and 7.5 Mg ha-1 in NF and in CF were 5.6, 8.2 and 6.9 Mg ha-1, respectively in 2014, 2015 and 2016. The isotopic NUE showed total recovery of 81.5 % of 15N in NF and 62, 61, 56, 56% in SS, AWDS, AWDL, CF respectively. The average WUE of delivered water was 0.7 kg grain m-3 in NF, and 0.47, 0.40, 0.35, 0.32 kg grain m-3 water in SS, AWDS, AWDL and CF, respectively. The second experiment was a split-plot design with: continuous flooding (CF) and non- flooding aerobic (NF) in the main plot and fertilizer nitrogen (0, 50, 150 and 250 kg ha-1) in the subplot during the 2014, 2015 and 2016. Biomass (AGB) nitrogen uptake (NU) and leaf area index (LAI) were observed along crop development in the 0 and 150 subplots in 2015 and 2016 growing seasons. As was the relationship between AGB, NU, panicle density (PD), spikelet number (NS) and grain yield (GY) at physiological maturity. The aerobic rice provided higher NU throughout rice development and LAI equal or superior to CF. At harvesting, NU and PD had different relationships to N rates among CF and NF, with NF showing 18% higher NU as 27% PD higher than CF across years and N rate. The grain GY relationship to N rates was also distinct in 2014 and 2015, and GY across N rates in NF was 20% and 12% higher than CF for 2014 and 2015, respectively. This research concludes for such agroecosystem, as long there is no drought stress, rice crop in non-flooding aerobic irrigation regime performs higher efficiency of water and N use, and moreover presents better overall crop performance with less need to nitrogen fertilizer than traditional continuous flooding or any other water saving irrigation regime. / A cultura do arroz (Oryza sativa L.) tem importante papel em fornecer alimento à crescente população mundial, e o incremento da produção virá não só do ganho de eficiência de áreas em uso, mas também da incorporação de novas áreas. As planícies tropicais do norte do Brasil já estão sendo convertidas para cultivo de arroz, apesar da falta de conhecimento científico e práticas agrícolas apropriadas às condições locais. Essa região apresenta solos com minerais de argila intemperizados e propriedades distintas daqueles de regiões tradicionais de cultivo, e a transferência das práticas agrícolas desenvolvidas para outros agroecossistemas têm resultado em produtividades variáveis e uso inadequado de insumos. A água é principal recurso no cultivo do arroz, e a irrigação com inundação constante é largamente disseminada pelo mundo. Regimes alternativos de irrigação a fim de economizar agua tem sido propostos em razão da ameaça de escassez de água, e resultados promissores estimulam a disseminação dessa técnica, apesar de prejuízos à produtividade em razão do estresse por seca e/ou menor disponibilidade de nitrogênio (N) do solo. A umidade do solo e a quantidade de oxigênio interferem na dinâmica de N e podem favorecer processos de perdas e alterar a resposta do cultivo à adubação nitrogenada. Nas planícies tropicais do Brasil a disponibilidade de água e N são limitadas, e a inundação contínua não é sustentável em razão da quantidade de agua requerida associada a baixa produtividade da cultura. Portanto, esta pesquisa foi realizada com o objetivo de estudar de forma integrada o regime de irrigação e o uso de N, e performance da cultura em várzea tropical. O experimento foi realizado durante três anos em Plintossolo no estado do Tocantins. Na primeira etapa da pesquisa procurou-se identificar o regime de irrigação que proporciona maior eficiência de uso da água (WUE), eficiência de uso de nitrogênio (NUE) e performance de cultivo com N nativo do solo e quando aplicado N fertilizante. Na segunda fase comparou-se o regime de irrigação que proporcionou melhores índices de eficiência de água e N ao regime de lâmina contínua com a hipótese que a relação entre aplicação de fertilizante N e componentes de produção seriam diferentes entre os regimes. Na primeira fase adotou-se delineamento de parcela subdividida com 5 regimes de irrigação (IR): lâmina alternada de inundação e drenagem em ciclo curto (AWDS); lâmina alternada de inundação e drenagem em ciclo longo (AWDL); lâmina contínua (CF); sem formação de lâmina e solo aeróbico (NF); e sem formação de lâmina e solo saturado (SS). Nas subparcelas avaliou-se as doses de N fertilizante: 0 e 150 kg ha-1. A performance de cultivo foi afetada pelo IR e dose de N. Na média dos 3 anos, o acúmulo de nitrogênio na parte aérea (NU) foi 32% maior em NF do que em todos os outros regimes de irrigação. A produtividade de grãos média entre as duas doses de N foi 7,2, 8,8 e 7,5 Mg ha-1 em NF e 5,6, 8,2, 6,9 Mg ha-1 in CF, respectivamente em 2014, 2015 e 2016. A NUE foi de 81,5% de recuperação de 15N em NF e 62, 61, 56 e 26% em SS, AWDS, AWDL e CF, respectivamente. A média de WUE em relação a água aplicada foi 0,7 kg grão m-3 em NF e 0,47, 0,40, 0,35, 0,32 kg grão m-3 água em SS, AWDS, AWDL e CF, respectivamente. Na segunda fase adotou-se o delineamento experimental de parcelas subdivididas com inundação contínua (CF) e sem formação de lâmina e solo aeróbico (NF) na parcela principal e aplicação de N fertilizante (0, 50, 150, 250 kg ha-1) nas safras 2014, 2015, 2016. Biomassa (AGB) acúmulo de nitrogênio (NU) e índice de área foliar (LAI) foram avaliados ao longo do desenvolvimento da cultura nas doses de 0 e 150 kg ha-1 nas safras de 2015 e 2016. Assim como a relação entre AGB, NU densidade de panícula (PD), número de espiguetas (NS) e produtividade de grãos (GY) na maturidade fisiológica A condição aeróbica proporcionou maior NU ao longo do desenvolvimento e LAI maior ou igual a CF. Na colheita, NU e PD tiveram diferentes repostas ao nitrogênio fertilizante quando em NF ou CF, mostrando NU 18% maior em NF assim como PD 27%maior em NF do que em CF na média de anos e dose de N. A resposta da GY ao nitrogênio fertilizante também foi diferente quando em NF ou CF, e na médias de dose de N fertilizante, NF proporcionou produtividade 20% e 12% maior do que CF em 2014 e 2015, respectivamente. Conclui-se nessa pesquisa que nesse agroecossistema, desde de que que não ocorra estresse por seca, o arroz cultivado em sistema de irrigação sem formação de lâmina e solo aeróbico é mais eficiente no uso de água e nitrogênio. E ainda, com melhor desempenho de produtividade e menor dependência de N fertilizante em comparação ao cultivado em lâmina contínua ou qualquer outro regime alternativo que economize água.
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Aplicação de cinza da casca de arroz, via solo, como fonte de silício em arroz irrigado sob estresse salino / Application of rice husk ash into the soil as a source of silicon in rice under salt stress

Lemes, Elisa Souza 12 August 2013 (has links)
Made available in DSpace on 2014-08-20T13:44:33Z (GMT). No. of bitstreams: 1 dissertacao_elisa_souza_lemes.pdf: 786855 bytes, checksum: 4ae16c0d73be33f09eab4723a03a9c25 (MD5) Previous issue date: 2013-08-12 / Rice is one of the most cultivated cereals in the world. In some regions, situations of losses in irrigated rice production are common. These losses have been occurred due to the water salinization. Si element for rice is related for increasing in plant growth and productivity. The benefits are positive interactions with nitrogen fertilizers, phosphate and potassium, as well as being involved in metabolic or physiological activities of plants under salt and / or water stress. Accordingly, the utilization of Si may result in increased plant's biological ability to withstand the environment's harsh conditions. Thus the aim of this study was evaluate the effect of silicon fertilization derived from rice hull's ashes, in yield and seed quality of rice cultivated under salt stress. The rice cultivar used was IRGA 424. The experimental design was a randomized block in factorial A x B (Factor A-Five doses of rice husk s ash applied to soil: 0 kg ha-1, 500 kg ha-1, 1000 kg ha-1, 1500 kg ha-1 and 2000 kg ha-1, B-Factor Three salt concentrations: 0 mM, 4 mM and 8 mM), with four replications. Silicon fertilization provides an increase in the seed weight per plant. The physiological quality of rice seeds produced is positively influenced by increased levels of silicon in all salt concentrations. Salinity had a negative effect on yield components and physiological quality of seeds produced. The isoenzyme system glutamate oxaloacetate transaminase (GOT) is a complementary tool to assess the physiological seed. / O arroz é um dos cereais mais cultivados no mundo e em certas regiões são comuns situações de prejuízos na produção de arroz irrigado, decorrentes da salinização da água dos mananciais. Os benefícios do silício para o arroz estão relacionados com o aumento no crescimento e na produtividade, interações positivas com fertilizantes nitrogenados, fosfatados e potássicos, além de estar envolvido em atividades metabólicas ou fisiológicas das plantas sob estresse salino e/ou hídrico. Nesse sentido, a utilização de silício pode acarretar em aumento da capacidade biológica da planta em resistir às condições adversas do meio ambiente. Assim o objetivo do trabalho foi avaliar o efeito do silício oriundo da cinza da casca de arroz carbonizada, via solo, no rendimento e na qualidade fisiológica de sementes de arroz irrigado produzidas sob estresse salino. Foram utilizadas sementes de arroz da cultivar IRGA 424. O delineamento utilizado foi em blocos casualizados, em esquema fatorial A x B (Fator A- Cinco doses de cinza da casca de arroz aplicado via solo: 0 kg ha-1, 500 kg ha-1, 1000 kg ha-1, 1500 kg ha-1 e 2000 kg ha-1; Fator B- Três concentrações salinas: 0 mM, 4 mM e 8 mM), com quatro repetições. A aplicação de silício proporciona acréscimo no peso de sementes por planta. A qualidade fisiológica das sementes produzidas de arroz é influenciada positivamente pelo aumento das doses de silício, em todas as concentrações salinas. A salinidade apresenta efeito negativo sobre os componentes do rendimento e a qualidade fisiológica das sementes produzidas. O sistema isoenzimático glutamato oxaloacetato transaminase (GOT) é uma ferramenta complementar à avaliação do potencial fisiológico de sementes.
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Relações bioquímicas e moleculares da germinação e emergência em arroz / Biochemical and molecular relations of germination and emergence in rice

Malone, Gaspar 09 March 2007 (has links)
Made available in DSpace on 2014-08-20T13:44:39Z (GMT). No. of bitstreams: 1 tese_gaspar_malone.pdf: 1014335 bytes, checksum: f4f5efb929d6388495d76e99a23969c2 (MD5) Previous issue date: 2007-03-09 / In this work, a collection of red rice ecotypes, with promising physiological characteristics associated to seed vigor, was used to conduct three studies to understand the germination/emergence process in rice. In the first study, a biochemical and molecular characterization of the collection was performed to identify the parent s with the best hybrid potential to obtain segregant mapping populations. In the second study, the AMY1 α-amylase gene of rice, involved in the breakdown of endosperm starch during germination, was analyzed by DNA sequencing, to identify mutants to this gene from red rice ecotypes. The mutation effects were analyzed thought physiological performance of ecotypes. In the last study, an segregant population from FFS-45 red rice ecotype (with germination/emergence character) and BRS 7 taim cultivar (without the character), was used to identify molecular markers linked to the trait by DNA Pooling methodology. The molecular markers identified were used to gene prospection in the respective genomics regions. Five SSR markers were identified linked to germination/emergence process. Results of these researches generated a great amount of data that can be contribute to understand the physiological/molecular process involved in rice seed germination/emergence process. / No presente trabalho, uma coleção de ecótipos de arroz vermelho, com promissoras características fisiológicas associadas aos componentes de vigor de sementes, foi utilizada como fonte de trabalho para a execução de três trabalhos de pesquisa que visam melhor entender o processo de germinação/emergência em arroz. Num primeiro trabalho, foi realizada uma caracterização bioquímica e molecular desta coleção com o objetivo de identificar aqueles que apresentaram melhor potencial de hibridização para a obtenção de populações segregantes de mapeamento genético. Num segundo trabalho de pesquisa, um dos genes da α-amilase do arroz, fortemente ligado ao processo de degradação das reservas do endosperma durante o processo de germinação, foi analisado através de estudos de Seqüenciamento de DNA, para a identificação de mutantes para este gene entre os membros da coleção de ecótipos de arroz vermelho. Os efeitos das mutações foram assim, analisados em relação ao desempenho fisiológico dos ecótipos. No terceiro trabalho, uma população segregante proveniente do cruzamento entre o ecótipo de arroz vermelho FFS-45 (com o caráter germinação/emergência em grandes profundidades do solo) e a cultivar BRS 7 taim (sem o caráter), foi utilizada para a realização de estudos de associação de marcadores moleculares ligados ao caráter, utilizando a técnica de análise de DNA em bulk. Ao todo, cinco marcadores foram identificados como associados ao caráter germinação/emergência. Os resultados geraram informações que contribuíram para o entendimento do processo fisiológico/molecular de germinação/emergência em sementes de arroz.
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Caracterização morfofenológica e molecular de mutantes de arroz irrigado / Morphophenological and molecular characterization of irrigated rice mutants

Silva, Aline Scheer da 30 October 2013 (has links)
Made available in DSpace on 2014-08-20T13:59:07Z (GMT). No. of bitstreams: 1 tese_aline_scheer_da_silva.pdf: 990457 bytes, checksum: 3ed714ae04d7f441e614c03031fe7354 (MD5) Previous issue date: 2013-10-30 / Irrigated rice (Oryza sativa L.) presents a great economic and social importance, mainly in Brazil s southern region, which stimulates the search for more productive cultivars and with agronomic characteristics that meet market requirements. Support techniques to improvement programs, as induced mutations and use of molecular markers, are being increasingly used. Induced mutations are considered to be an alternative method in order to create genetic variability, being the use of ionizing radiation an effective technology with which mutants were obtained with characteristics of higher productivity, precocity, smaller, higher resistance to disease and pest infestation in different species, which are used in improvement programs to obtain new cultivars. AFLP is one of the most used molecular markers techniques to analyze genetic divergence in plant populations, mainly in species that present low rate of poliforfism in the DNA. The aim of this work was morphophenological and molecular characterization of mutants of rice derived from the BRS Querência and BRS Fronteira elite cultivars, which can turn into new cultivars or serve to crossings in rice breeding programs. In the 2009/2010 growing season, seeds of M1 plants (originated from seeds exposed to different doses of gamma radiation) were sown in trays containing soil typically found in rice culture, aiming seedling production. From two to three leaves, seedlings were transplanted to the field forming M2 population. In this generation, 59 mutants with agronomic characteristics of interest were selected. In the following growing season (2010/2011), seeds of these 59 mutant plants were sown and transplanted in the same previous conditions and formed M3 population. In all generations, morphophenologic descriptors of rice culture were evaluated. Genetic divergence among the mutant selected in generation M3 and the cultivar witnesses through the AFLP technique were also evaluated. The obtained data were submitted to analysis of variance, compared by means test (Dunnett) to 5% of probability. Multivariate analysis through GENES software were also performed (CRUZ, 2007). In both cultivars, mutants with characteristics of agronomic concern were obtained, such as reduction in culture cycle and in height of the plants, increase in thickness of the stem, greater tillering and panicle number, higher number of grains per panicle and higher 1000-grain weight. AFLP technique showed up to 51% dissimilarity among genotypes of the same origin, being M_CTT/ E_AAC the most informative primer combinations among the 13 combinations tested in this study. Based on the results that were obtained we conclude that some of the mutants obtained can be used in the future for gene action studies, crossings and/or to launch a new cultivar. / O arroz irrigado (Oryza sativa L.) apresenta grande importância econômica e social, principalmente na região sul do Brasil, fato que estimula a busca por cultivares mais produtivas e com características agronômicas que atendam as exigências de mercado. Técnicas de apoio aos programas de melhoramento, como mutações induzidas e uso de marcadores moleculares estão sendo cada vez mais utilizadas. A indução de mutações é considerada um método alternativo para criar variabilidade genética, sendo o uso de radiações ionizantes uma tecnologia eficaz, com a qual foram obtidos mutantes com características de maior produtividade, precocidade, menor porte, maior resistência às doenças e pragas em diferentes espécies, os quais são utilizados nos programas de melhoramento na obtenção de novas cultivares. AFLP é uma das técnicas de marcadores moleculares mais utilizadas para analisar divergência genética em populações de plantas, principalmente em espécies que apresentam baixa taxa de poliforfismo no DNA. O presente trabalho teve como objetivo a caracterização morfofenológica e molecular de mutantes de arroz irrigado oriundos das cultivares elite BRS Querência e BRS Fronteira, os quais poderão se transformar em novas cultivares ou servirem para cruzamentos nos programas de melhoramento de arroz. Na safra 2009/2010 sementes de plantas M1 (originadas de sementes expostas à diferentes doses de radiação gama) foram semeadas em bandejas contendo solo típico da cultura do arroz, visando à produção de mudas. No estádio de duas a três folhas as mudas foram transplantadas para o campo formando a população M2. Nesta geração foram selecionadas 59 mutantes com características agronômicas de interesse. Na safra seguinte (2010/2011), sementes destas 59 plantas mutantes foram semeadas e transplantadas nas mesmas condições anteriores e formaram a população M3. Em todas gerações foram avaliados os descritores morfofenólógicos da cultura do arroz, foi também avaliada a divergência genética entre os mutantes selecionados na geração M3 e as cultivares testemunhas pela técnica de AFLP. Os dados obtidos foram submetidos à análise de variância, comparados pelo teste de médias (Dunnett) a 5% de probabilidade, foi realizada também análises multivariadas através do programa GENES (CRUZ, 2007). Em ambas cultivares foram obtidos mutantes com características de interesse agronômico, como redução no ciclo da cultura e na altura das plantas, incremento na espessura do colmo, maior perfilhamento e número de panículas, maior número de grãos por panícula e maior peso de 1000 grãos. A técnica AFLP mostrou até 51% de dissimilaridade entres os genótipos de mesma origem, sendo M_CTT/E_AAC a combinação de primers mais informativa entre as 13 combinações testadas neste estudo. Com base nos resultados obtidos, conclui-se que alguns dos mutantes obtidos poderão ser utilizados futuramente para estudos de ação gênica, cruzamentos e/ou para o lançamento de uma nova cultivar.
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Crescimento de plantas de arroz sob aplicação de herbicidas do grupo das imidazolinonas e sua atividade residual em plantas bioindicadoras / Growth of rice plants under application of herbicides imidazolinone and its residual activity in bioindicators plants

Sousa, Camila Pinho de 04 October 2010 (has links)
Made available in DSpace on 2014-08-20T13:59:10Z (GMT). No. of bitstreams: 1 dissertacao_camila_sousa.pdf: 1105338 bytes, checksum: 6a0e449f6b57375f68a8ff703e00bf3c (MD5) Previous issue date: 2010-10-04 / The objective of this research was: a) evaluate the effect of imidazolinone chemical group herbicides on the growth of plants and the injuries to the photosynthetic apparatus of three rice types (varieties) exposed to these and b) evaluate the effect of soil residual herbicides imazethapyr+ imazapic on corn, cucumber, radish and tomato are used as bioindicators. At first experiments we used the herbicide Only® and Kifix®, using a randomized split plot design in a factorial 5x3 with six replications, with the first factor rates corresponded to 0, 5, 10, 15 and 20 mg p. c. m-2 of commercial product Only® and 0, 7, 14, 21 and 28 mg p. c. m-2 of commercial product Kifix®, and factor B type of rice (cultivated rice cv. Puitá Inta CL, red rice ecotype sensitive to herbicides Imidazolinone and red rice ecotype with suspected herbicide tolerance imidazolinone). We evaluated the parameters of chlorophyll a fluorescence, phytotoxicity, plant height and dry mass. Analysis of chlorophyll a fluorescence was performed using a portable fluorometer (HandyPEA, Hanstech). It was concluded that cv. Puitá Inta CL is tolerant to herbicides Only® and Kifix® and can be used in the Clearfield® system and the red rice ecotype with suspected tolerance was tolerant to both herbicides, suffering a low phytotoxity compared to the sensitive ecotype, even using higher doses of the commercial products. The application of chemical herbicides of the imidazolinone group in rice plants cause changes in the photosynthetic metabolism of plants that can be detected by evaluating the emission of chlorophyll a fluorescence transient. The second experiment was conducted in a randomized block experimental design (with) four replicates per treatment. The treatments were the residual effect of herbicide Only® in rice CL plants in the 2006/2007 harvest, at 0, 10, 15 and 20 mg p. c. m-2 doses of commercial product, on four bioindicators: corn, cucumber, radish and tomato. The variables evaluated were: height, dry weight of shoot and root dry mass, with the latter doesn t being performed for the corn plants. Data of biometric variables generated in both experiments were subjected to analysis of variance (p ≤ 0.05) were significant in these models were tested by polynomial regression. Activity was detected in the commercial mixture of residual herbicides imazethapyr +imazapic in soil 1100 days after herbicide application, by use of bioindicators plants. / Este trabalho teve por objetivo: a) avaliar o efeito da aplicação de herbicidas do grupo químico das imidazolinonas sobre o crescimento de plantas e as injúrias causadas ao aparelho fotossintético de três tipos de arroz e b) avaliar o efeito residual no solo dos herbicidas imazethapyr + imazapic sobre as plantas de milho, pepino, rabanete e tomate, utilizadas como bioindicadoras. No primeiro ensaio foram utilizados os herbicidas Only® e Kifix®, utilizando-se para cada herbicida um delineamento experimental de parcelas subdivididas, em esquema fatorial 5x3, com seis repetições, sendo o fator A as doses do herbicida correspondentes a 0, 5, 10, 15 e 20 mg p. c. m-2 do produto comercial Only® e 0, 7, 14, 21 e 28 mg p. c. m-2 do produto comercial Kifix®, e o fator B o tipo de arroz (arroz cultivado cv. Puitá Inta CL, ecótipo de arroz-vermelho sensível aos herbicidas do grupo das imidazolinonas e ecótipo de arroz-vermelho com suspeita de tolerância aos herbicidas do grupo das imidazolinonas). Foram avaliados os parâmetros da fluorescência da clorofila a, fitotoxicidade, altura de plantas e massa seca da parte aérea. A análise da fluorescência da clorofila a foi realizada utilizando-se um fluorômetro portátil (HandyPEA, Hanstech).Conclui-se que a cv. Puitá Inta CL é tolerante aos herbicidas Only® e Kifix®, podendo ser utilizada no Sistema de Produção Clearfield® e que o ecótipo de arroz-vermelho com suspeita de tolerância apresentou tolerância a ambos herbicidas, sofrendo baixa fitotoxicidade em comparação ao ecótipo sensível, mesmo utilizando-se doses superiores as comerciais dos produtos. A aplicação de herbicidas do grupo químico das imidazolinonas em plantas de arroz causa alterações no metabolismo fotossintético das plantas que podem ser detectadas através da avaliação da emissão da fluorescência da clorofila a transiente. O segundo experimento foi conduzido em um delineamento experimental casualizado por bloco, totalizando quatro repetições por tratamento. Os tratamentos avaliados foram o efeito residual do herbicida Only® sob as plantas de arroz CL na safra 2006/2007, nas doses de doses de 0, 10, 15 e 20 mg p. c. m-2 do produto comercial, sobre quatro espécies bioindicadoras: milho, pepino, rabanete e tomate. Foram avaliadas as variáveis: altura de plantas, massa seca da parte aérea e massa seca das raízes, sendo esta última não realizada para as plantas de milho. Os dados relativos às variáveis biométricas gerados em ambos os experimentos foram submetidos à análise da variância (p≤0,05); em sendo significativos, estes foram testados por modelos de regressão polinomial. Foi detectada atividade residual da mistura comercial dos herbicidas imazethapyr+imazapic em solo após 1100 dias da aplicação dos herbicidas, pelo uso de plantas bioindicadoras.

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