Dissertação (mestrado)—Universidade de Brasília, Instituto de Ciências Exatas, Departamento de Matemática, Programa de Mestrado Profissional em Matemática em Rede Nacional, 2016. / Submitted by Fernanda Percia França (fernandafranca@bce.unb.br) on 2016-09-19T17:00:28Z No. of bitstreams: 1 2016_AndréMarcelinoMarques.pdf: 1280075 bytes, checksum: 2c6745927a4cc59860162a2d06a3c9d9 (MD5) / Approved for entry into archive by Raquel Viana(raquelviana@bce.unb.br) on 2016-10-13T17:20:07Z (GMT) No. of bitstreams: 1 2016_AndréMarcelinoMarques.pdf: 1280075 bytes, checksum: 2c6745927a4cc59860162a2d06a3c9d9 (MD5) / Made available in DSpace on 2016-10-13T17:20:07Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2016_AndréMarcelinoMarques.pdf: 1280075 bytes, checksum: 2c6745927a4cc59860162a2d06a3c9d9 (MD5) / No Brasil, o acesso a um curso de graduação exige que o candidato se submeta a algum processo de seleção. Compreender os detalhes desse processo é fundamental para que ele obtenha êxito. Nesse cenário, o professor se insere como um orientador para seus alunos, devendo se apropriar de todas as informações para poder revelar a eles as características intrínsecas inerentes a esses processos de passagem da educação básica para a superior. Nesse sentido, este trabalho contribui como uma compilação dessas características, pois objetiva investigar as convergências entre o Programa de Avaliação Seriada da Universidade de Brasília (PAS/UnB) e o Exame Nacional do Ensino Médio (ENEM). Ambas as avaliações constituem importantes modalidades de acesso à Universidade de Brasília (UnB). O ENEM, de relevância nacional, tem o desempenho dos estudantes associado ao Sistema de Seleção Unificada (Sisu), o qual permite aos participantes optarem por ingressar em cursos de graduação na maioria das Instituições federais de ensino superior (IFES) do Brasil. A partir de 2017, o PAS será a modalidade de acesso à UnB que mais vinculará calouros à instituição. Para encontrar as convergências entre as duas avaliações, foi priorizada uma abordagem qualitativa, utilizando-se análises documental, de dados e de conteúdo. Iniciou-se com uma breve contextualização histórica, seguida de uma comparação das matrizes de referência que dão suporte teórico-metodológico aos dois processos, encontrando-se os pontos comuns referentes a competências, habilidades e objetos de conhecimento avaliados. O trabalho avançou para uma análise criteriosa dos itens das provas aplicadas no subprograma 2013-2015 do PAS/UnB e das questões da prova do ENEM de 2015, no âmbito da Matemática, destacando-se semelhanças e diferenças em termos da abordagem e dos objetivos avaliativos de cada item/questão. Nas perspectivas futuras, infere-se que a UnB fez a opção pelo fortalecimento do PAS como processo de escolha de seus estudantes ingressantes, apontando para uso mais eficaz da tecnologia associada ao Programa, com a implantação de provas adaptativas feitas em ambiente vistual. _________________________________________________________________________________________________ ABSTRACT / In Brazil, the access to anundergraduate course requires the candidate to undergo a selection process. Understanding the details of this process is essential for him to succeed. In this scenario, the teacher is included as a mentor for his students and it is expected that he gets all the information in order to reveal to them the intrinsic characteristics inherent in these processes of transition from basic to higher education. In this sense, this work contributes with a compilation of these characteristics, since it aims to investigate the convergences between the Programa de Avaliação Seriada from University of Brasilia (PAS/UnB) and the Exame Nacional do Ensino Médio (ENEM). Both examsare important ways of access the University of Brasilia (UnB). With national relevance, the ENEM has the performance of students associated with the Sistema de SeleçãoUnificada(SiSU), which allows participants to choose to join undergraduate courses in most public higher education institutions (IFES) in Brazil. From 2017, PAS will be the means of access to UnB that most freshmen bind the institution. To find the convergences between the two assessments forms, it was prioritized a qualitative approach, using documentary analysis, data and content. We start with a brief historical background, followed by a comparison of reference matrices that give theoretical and methodological support to the two exams, finding the commonalities regarding competences, abilities and knowledge objects. The work has progressed to a careful analysis of the mathematics items of the tests applied in the PAS/UnB - Subprogram 2013-2015 and in ENEMduring 2015, highlighting similarities and differences in terms of approach and evaluative goals of each item / question. In future prospects, it is inferred that the UnB has the option for strengthening the PAS as the process of choosing their freshmen students, pointing to more effective use of technology associated with the Program, with the implementation of adaptive tests made in a virtual environment.

Le projet de recherche présente un travail monographique sur l'architecte français Maurice Novarina, originaire de Haute-Savoie, qui a réalisé, tout au long du XXe siècle, d'importantes commandes publiques ; des églises – pour lesquelles il est le plus connu – et plus de 30 000 logements conçus lors des grandes opérations d'urbanisme des Trente Glorieuses. Son œuvre, répartie sur le territoire français et localisée majoritairement en Rhône-Alpes, en région parisienne et en Normandie, illustre l'évolution des commandes, des conceptions et des mises en œuvre architecturales et urbaines. Maurice Novarina fait partie des architectes qui ont marqué le XXe siècle par une production importante en quantité, et remarquée, hier comme aujourd'hui en qualité. En effet, nombreuses de ses réalisations sont considérées comme patrimoine puisqu'elles concernent certains monuments historiques, des bâtiments « Label XXe », ou intégrés dans des chartes patrimoniales et paysagères. Ce travail cherche donc à repositionner l'architecte dans l'histoire de l'architecture et de l'urbanisme du XXe siècle, à préciser le contexte politique, économique et social dans lequel sont nés les projets, et à questionner son œuvre en lumière des théories de la modernité. L'œuvre de Maurice Novarina reprend les caractéristiques architecturales et urbaines de la doctrine moderne : l'influence du compagnon de la modernité qu'est Auguste Perret est sensible dans les projets de reconstruction d'après-guerre, alors que celle de Le Corbusier et de la Charte d'Athènes irradie l'ensemble des projets d'urbanisme, plus particulièrement les ZUP. Ces modèles forts, les architectes les interprètent, les réduisent ou les améliorent. La production de Maurice Novarina, comme celle de nombreux de ses contemporains, concerne alors une architecture ordinaire, qui s'impose dans les réalisations du XXe siècle et se révèle omniprésente dans la presse architecturale de l'époque, alors qu'elle est finalement peu évoquée par l'Histoire. Ces architectures perdurent comme héritage du XXe siècle et résultent, non pas de la banalité, mais d'une forme d'application de la modernité corbuséenne, qui au-delà des grandes théories, a marqué les esprits et formaté notre regard contemporain. Partant de l'hypothèse que les principes architecturaux et urbains de la modernité peuvent prendre des formes de l'ordinaire, nous verrons comment, chez Maurice Novarina, l'architecture relie les deux entités contraires (modernité / ordinaire) et que le processus complexe d'élaboration des projets, reposant sur des associations d'acteurs, des commanditaires récurrents et des équipes pluridisciplinaires, participent également à la richesse des œuvres. / L'auteur n'a pas fourni de résumé en anglais.

Submitted by Automa??o e Estat?stica (sst@bczm.ufrn.br) on 2017-03-20T22:25:46Z No. of bitstreams: 1 FelipeAlvesPauloCavalcanti_DISSERT.pdf: 3259655 bytes, checksum: ded2156d365e16f864324cc53058e9ac (MD5) / Approved for entry into archive by Arlan Eloi Leite Silva (eloihistoriador@yahoo.com.br) on 2017-03-23T23:34:11Z (GMT) No. of bitstreams: 1 FelipeAlvesPauloCavalcanti_DISSERT.pdf: 3259655 bytes, checksum: ded2156d365e16f864324cc53058e9ac (MD5) / Made available in DSpace on 2017-03-23T23:34:11Z (GMT). No. of bitstreams: 1 FelipeAlvesPauloCavalcanti_DISSERT.pdf: 3259655 bytes, checksum: ded2156d365e16f864324cc53058e9ac (MD5) Previous issue date: 2016-09-14 / Coordena??o de Aperfei?oamento de Pessoal de N?vel Superior (CAPES) / No presente trabalho, analisamos a constru??o hist?rica de uma imagem j? consolidada no imagin?rio brasileiro: o espa?o de Pas?rgada. Acreditando que as imagens se constroem por meio dos v?rios investimentos de desejo que lhe s?o destinados, que elas s?o alvo de elabora??es e reelabora??es, intentamos aqui mostrar o surgimento e as sucessivas reformula??es do espa?o de Pas?rgada na obra de Manuel Bandeira. Assim, dividimos nossa investiga??o em quatro momentos: primeiramente, tratamos do decl?nio social da fam?lia Souza Bandeira, marcado pela transi??o entre um regime patriarcal idealizado e um novo tempo de rela??es urbanas e burguesas no Brasil. Em um segundo momento, tra?amos um percurso pelas primeiras duas obras de Bandeira, A Cinza das Horas e Carnaval, compostas ap?s seu adoecimento em 1904, apontando algumas das diretrizes po?ticas a? presentes que futuramente seriam implicadas na cria??o do poema ?Vou-me Embora Pra Pas?rgada?. No terceiro cap?tulo, abordamos o desenvolvimento de novos recursos e procedimentos criativos na obra deste autor durante os anos 1920, ocorrido no contato com tr?s frentes de renova??o ? a boemia intelectual carioca, o modernismo paulista e o regionalismo tradicionalista recifense ?, cujas ideias tornaram poss?vel a cria??o do espa?o nomeado de Pas?rgada. Por fim, no quarto e ?ltimo cap?tulo, discutimos o sentido ?biogr?fico? que Bandeira e outros autores passam a atribuir a este espa?o ap?s o lan?amento de Libertinagem, em 1930, dando in?cio a uma s?rie de textos biogr?ficos e autobiogr?ficos que culmina na publica??o da autobiografia de Manuel Bandeira, o Itiner?rio de Pas?rgada, em 1954. / In this work, we analyze the historical construction of a well-established image in the Brazilian imaginary: Pas?rgada. Believing that images are made of the various investments of desire which incide upon them, that they are elaborated and reelaborated in the course of time, we aim to expose here the birth and the successive reformulations of Pas?rgada in the work of Manuel Bandeira. Hence, we divided our investigation in four chapters: firstly, we approach the social decline of Manuel Bandeira?s family, marked by the transition of an idealized patriarchal regime and a new era of bourgeois and urban social relations in Brazil. In a second moment, we examine Bandeira?s first works, A Cinza das Horas and Carnaval, composed after the poet became ill in 1904, to expose some of the creative procedures that would persist in his later work, also being used in the creation of the poem ?Vou-me Embora Pra Pas?rgada?. In the third chapter, we investigate the development of new creative procedures and resources by Manuel Bandeira during the Brazilian ?roaring 1920s?, acquired in the contact with three different artistic fronts: the bohemian scene, in Rio de Janeiro; the Brazilian modernist movement, in S?o Paulo; and the traditionalist regionalism, led by Gilberto Freyre in Recife, which provided Bandeira with the ideas and the poetical resources he would employ in the creation of the poetical space called ?Pas?rgada?. Lastly, in the fourth chapter, we discuss the ?biographical? sense that Bandeira and other authors would associate to this poetical space after the publication of Libertinagem, in 1930, starting a series of biographical and autobiographical texts that culminate in the publishing of Manuel Bandeira?s autobiography, Itiner?rio de Pas?rgada, in 1954.

Made available in DSpace on 2014-06-12T23:14:46Z (GMT). No. of bitstreams: 2 arquivo5785_1.pdf: 4003014 bytes, checksum: dec645184c56c79c38439d163b33fc08 (MD5) license.txt: 1748 bytes, checksum: 8a4605be74aa9ea9d79846c1fba20a33 (MD5) Previous issue date: 2010 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / No presente estudo, foram pesquisadas as competências profissionais dos assistentes sociais, relacionadas à implementação da Política de Assistência Social (PAS) em 118 municípios com até 20.000 habitantes, no Estado do Rio Grande do Norte, no período de 2004 a 2008. A expansão da PAS, no Brasil, ademais de responder a processos sócio-políticos e econômicos particularizados pela conjuntura do país nos anos 2000, também é responsável pela sua interiorização e pelo crescimento do mercado de trabalho profissional naquele espaço ocupacional. Essa expansão relaciona-se com a ampliação dos programas de combate à pobreza, presentes em quase todos os países da América Latina, por ser um dos principais mecanismos de desigualdades sociais. A implementação e a operacionalização da PAS são marcadas por requerimentos programáticos e técnico-operativos relativos à sua gestão municipal, presentes na Lei Orgânica de Assistência Social (LOAS), na Política Nacional de Assistência Social (PNAS), no Sistema Único de Assistência Social (SUAS) e nas Normas Operacionais Básicas (NOBs) que regulam, orientam e normatizam a PAS. A estes últimos se adensam questões sociopolíticas, particularizadas pelo processo de descentralização do Estado brasileiro e pelas singularidades do poder político municipal, em que se incluem o processo de democratização da sociedade e as práticas sociais desenvolvidas. Essas práticas são saturadas de elementos ideoculturais e expõem os modos históricos mediante os quais os municípios enfrentaram historicamente as demandas relacionadas à assistência social, como é o caso do patrimonialismo, da meritocracia, do nepotismo, do primeiro-damismo, entre outras. Nesse cenário, as contratações de assistentes sociais como integrantes das equipes profissionais dos municípios (exigência imposta pela NOB RH/SUAS, que regula o quadro técnicoadministrativo dos Centros de Referência da Assistência Social CRAS e do Centro de Referência Especial da Assistência Social CREAS) são reveladoras de um novo marco referencial na implementação da PAS, que é balizado pela experiência profissional do Serviço Social, no campo da Assistência Social, pelo conhecimento produzido por meio da profissão, sobre o tema e pelas opções ético-políticas que marcam a trajetória e a cultura profissionais do Serviço Social brasileiro. Todavia, mediações da realidade local, como o processo de descentralização das políticas sociais, as demandas por assistência social e a cultura política municipal, aliadas às condições e relações de trabalho, às quais estão submetidos os profissionais, imprimiram algumas características à interiorização do Serviço Social que afetam as competências profissionais e a direção social estratégica da profissão, referendada pelo projeto ético-político profissional. Essa hipótese orientou a pesquisa objeto desta tese, cujos dados coletados nos CRAS, em 118 municípios do RN, permitiram conhecer: 1) as demandas profissionais do Serviço Social; 2) as atividades profissionais; 3) as relações e condições de trabalho, permitindo-nos identificar o perfil das competências profissionais exigidas e realizadas, tendo por referência o Código de Ética Profissional, a Lei de Regulamentação da Profissão e as competências profissionais presentes nas diretrizes que orientam a formação e o exercício profissional do Serviço Social. Essa análise também foi enriquecida por uma reflexão orientada pelos Parâmetros para Atuação do Assistente Social na PAS, elaborados pelo Conselho Federal de Serviço Social CFESS

Doctorat en Sciences / info:eu-repo/semantics/nonPublished

Dans cette thèse, nous avons exploré différentes méthodes de recalage déformables pouvant être appliquées entre les images IRM et les images ETR acquises pendant la biopsie. Nous avons observé à partir d'une étude de la littérature que les méthodes de recalage déformables existantes pour le recalage des images de prostate multimodales ne fournissent pas de précisions satisfaisantes et que la plupart sont coûteuse [sic] en ressources informatiques, notre méthode proposée n'étant pas une exception à cette tendance. Dans ce contexte, notre objectif secondaire a été de rechercher une méthode de recalage déformable qui puisse être appliquée au cours des interventions (nécessitant du temps réel). Par conséquent, nous proposons un schéma d'apprentissage où les paramètres de déformation sont appris sur une série d'images d'entraînement puis modélisés et une estimation linéaire de ces modèles est ensuite appliquée pour recaler les images ETR-IRM. Cette solution assure une vitesse de calcul sans compromettre beaucoup la précision de recalage.Dans les expérimentations réalisées pour valider nos travaux, la sonde transrectale de biopsie n'était pas équippée pour permettre une localisation 3D (par conséquent, la position spatiale (coordonnée z) des ETR images par rapport au système d'imagerie n'était pas disponible). Toutefois, pour la fusion ETR-IRM, il est important d'identifier la coupe pré-biopsie axiale IRM qui correspond à l'image ETR acquise au cours de la biopsie. Par conséquent, un autre objectif de ce travail a été d'identifier automatiquement la coupe axiale IRM d'un volume pré-biopsie correspondant à l'image ETR en utilisant une méthode qui exploite les métriques de similarité basées sur l'image et la forme. / This thesis investigates the employment of different deformable registration techniques to register pre-operative magnetic resonance and inter-operative ultrasound images during prostate biopsy. Accurate registration ensures appropriate biopsy sampling of malignant prostate tissues and reduces the rate of re-biopsies. Therefore, we provide comparisons and experimental results for some landmark- and intensity-based registration methods: thin-plate splines, free-form deformation with B-splines. The primary contribution of this thesis is a new spline-based diffeomorphic registration framework for multimodal images. In this framework we ensure diffeomorphism of the thin-plate spline-based transformation by incorporating a set of non-linear polynomial functions. In order to ensure clinically meaningful deformations we also introduce the approximating thin-plate splines so that the solution is obtained by a joint-minimization of the surface similarities of the segmented prostate regions and the thin-plate spline bending energy. The method to establish point correspondences for the thin-plate spline-based registration is a geometric method based on prostate shape symmetry but a further improvement is suggested by computing the Bhattacharyya metric on shape-context based representation of the segmented prostate contours. The proposed deformable framework is computationally expensive and is not well-suited for registration of inter-operative images during prostate biopsy. Therefore, we further investigate upon an off-line learning procedure to learn the deformation parameters of a thin-plate spline from a training set of pre-operative magnetic resonance and its corresponding inter-operative ultrasound images and build deformation models by applying spectral clustering on the deformation parameters. Linear estimations of these deformation models are then applied on a test set of inter-operative and pre-operative ultrasound and magnetic resonance images respectively. The problem of finding the pre-operative magnetic resonance image slice from a volume that matches the inter-operative ultrasound image has further motivated us to investigate on shape-based and image-based similarity measures and propose for slice-to-slice correspondence based on joint-maximization of the similarity measures. / En aquesta tesi s'investiga l'ús de diferents tècniques de registre deformable per registrar imatges de ressonància magnètica preoperatòries i imatges d'ultrasò interoperatòries en la biòpsia de pròstata. Un registre correcte garanteix l'adequada presa de mostres de biòpsia dels teixits malignes de la pròstata i redueix la taxa de re-biòpsies. Aquesta tesis inicialment presenta una comparació i resultats experimentals d’uns dels mètodes de registre més utilitzats basats en intensitat i en punts (landmarks): thin-plate splines i deformacions free form utilitzant B-splines. La principal contribució d'aquesta tesi és una nova metodologia de registre per imatges multimodals basada en splines i formulació difeomòrfica. En aquesta metodologia, s’assegura el difeomorfisme de la transformació basada en thin-plate splines mitjançant la incorporació d'un conjunt de funcions polinòmiques no lineals. Per tal de garantir deformacions clínicament significatives també introduïm thin-plate splines aproximants de manera que la solució s'obté mitjançant una minimització conjunta de les similituds de la superfície de les regions de la pròstata segmentades i de l'energia de la curvatura del thin-plate spline. El mètode per establir les correspondències de punts per el registre en thin-plate splines és un mètode geomètric basat en la simetria de la forma de la pròstata. Alhora, es suggereix una millora addicional basada en la utilització de la mètrica Bhattacharyya en la representació de forma (shape context) dels contorns de la pròstata segmentats. La metodologia de deformació proposada inicialment és computacionalment costosa i no està ben adaptada per el registre interoperatiu durant la biòpsia de pròstata. Per tant, s’investiga més a fons un procediment d'aprenentatge off-line per aprendre els paràmetres de deformació dels thin-plate splines a partir d'un conjunt d'entrenament de dades ressonància magnètica preoperatòries i les seves corresponents imatges d'ultrasò interoperatòries i es construeixen models de deformació mitjançant l'aplicació de mètodes d’agrupació espectral (spectral clustering) en els paràmetres de deformació. Les estimacions lineals d'aquests models de deformació s'apliquen després en un conjunt de test de ressonància magnètica i ultrasò. El problema de trobar la llesca del volum de ressonància magnètica preoperatòria que coincideixi amb la imatge d'ultrasò interoperatòria ens ha motivat a investigar sobre les mesures de similitud basades en la forma i contingut de la imatge i ens ha portat a proposar un nou mètode per a la correspondència tall a tall basat en la maximització conjunta de les mesures de similitud esmentades

[...] L’utilisation d’images ETR pour la biopsie est maintenant une norme suivie par les urologues pour le dépistage du cancer de la prostate. Toutefois, l’imagerie par résonance magnétique (IRM) offre un meilleur contraste des tissus mous par rapport aux images ETR. Ainsi, certaines tumeurs malignes visibles par l’IRM ne le sont pas avec les images ETR comme illustré par l’image de la figure 1. En fusionnant les deux modalités IRM et échographie transrectale, il est possible de développer des outils performants de diagnostic. C’est dans ce contexte que s’inscrit le projet PROSCAN qui est une collaboration entre le centre de recherche VICOROB (Computer Vision and Robotics Group) de l’université de Gérone et le Girona Magnetic Resonance Center du CHU de Gérone. [...] .. L’objectif principal de cette thèse est de développer des méthodes de segmentation précises et rapides de la prostate dans les images IRM ET ETR afin de faciliter la fusion d’images multimodales dans le cadre du projet PROSCAN. [...] Nous avons commencé notre travail par une étude approfondie des méthodes de segmentation dans les deux modalités échographie transrectale et IRM. Les principales similitudes et les différences entre les diverses méthodes, leurs forces et faiblesse sont été analysées. Les méthodes de segmentation de la prostate peuvent être regroupées dans quatre catégories différentes, selon les informations utilisées pour guider la segmentation [...] L’analyse des méthodes de segmentation montre que les approches qui combinent les informations de forme et de contour donnent les meilleurs résultats. Aussi, nous proposons d’utiliser le modèle AAM (Actice Appearance Model) qui a prouvé son efficacité pour la segmentation de la prostate dans les image d’échographietransrectale. Le modèle AAM permet de combiner les informations de forme et d’apparence en une unique fonction de coût à optimiser. De plus, l’étape d’optimisation par descente de gradient faite hors-ligne réduit considérablement les temps de calcul.Les images obtenues par échographie transrectale possèdent généralement une faible qualité ainsi qu’un faible contraste. Pour améliorer la robustesse de notre méthode de segmentation, nous introduisons des caractéristiques de texture extraits avec les ondelettes de Haar et des filtres en quadrature. Les résultats obtenus montrent que cette information de texture accroit la précision de la segmentation. Parailleurs, l’augmentation du temps de calcul due à l’utilisation des filtres est compensé par l’augmentation de la précision.Pour une initialisation automatique, nous avons développé un modèle probabiliste basé sur une classification supervisée. Un classifieur est construit à partird’un ensemble d’images d’apprentissage manuellement segmentées. Ce classifieur est utilisé pour obtenir une pré-segmentation de la prostate dans l’image ETR dans laquelle on attribue à chaque pixel une probabilité d’appartenance à la prostate. Unnouveau modèle AAM est ensuite construit dans lequel les intensités sont remplacéespar les probabilités obtenues à l’etape précédente. Les résultats obtenus montrent que cette approche permet une initialisation automatique tout en améliorant laprécision de la segmentation.Enfin, pour obtenir un modèle plus robuste nous avons utilisé la fonctionnelle de Mumford-Shah qui permet de définir une fonction de coût à optimiser comprenant à la fois les informations d’apparence, de forme et de topologie locale de laprostate. Les nombreux résultats qualitatifs et quantitatifs présentés dans la suite de ce manuscrit montrent que notre méthode donne de meilleurs résultats comparé à diverses autres approches. / Prostate segmentation in trans rectal ultrasound (TRUS) and magnetic resonanceimages (MRI) facilitates volume estimation, multi-modal image registration, surgicalplaning and image guided prostate biopsies. The objective of this thesis is to developshape and region prior deformable models for accurate, robust and computationallyefficient prostate segmentation in TRUS and MRI images. Primary contributionof this thesis is in adopting a probabilistic learning approach to achieve soft classificationof the prostate for automatic initialization and evolution of a shape andregion prior deformable models for prostate segmentation in TRUS images. Twodeformable models are developed for the purpose. An explicit shape and regionprior deformable model is derived from principal component analysis (PCA) of thecontour landmarks obtained from the training images and PCA of the probabilitydistribution inside the prostate region. Moreover, an implicit deformable model isderived from PCA of the signed distance representation of the labeled training dataand curve evolution is guided by energy minimization framework of Mumford-Shah(MS) functional. Region based energy is determined from region based statistics ofthe posterior probabilities. Graph cut energy minimization framework is adoptedfor prostate segmentation in MRI. Posterior probabilities obtained in a supervisedlearning schema and from a probabilistic segmentation of the prostate using an atlasare fused in logarithmic domain to reduce segmentation error. Finally a graphcut energy minimization in the stochastic framework achieves prostate segmentationin MRI. Statistically significant improvement in segmentation accuracies areachieved compared to some of the works in literature. Stochastic representation ofthe prostate region and use of the probabilities in optimization significantly improvesegmentation accuracies / La segmentació de la pròstata en imatges d’ecografia transrectal (TRUS) i en imatgesde ressonáncia magnètica (RM) facilita l’estimació del volum d’aquesta glàndula,el registre d’imatges entre ambdues modalitats, així com la planificació quirrgica debiòpsies guiades per imatge. L’objectiu d’aquesta tesi, doncs, és el desenvolupamentd’eines automàtiques per a una segmentació de la pròstata de manera precisa,robusta i computacionalment eficient en ambdues modalitats d’imatges.La contribució principal d’aquest tesi és la segmentació de les imatges ecogràfiquesde la pròstata. El mètode proposat es basa en dos passos ben diferenciats. Primer, através d’un aprenentatge probabilístic inicial, s’aconsegueix una primera localitzacióaproximada de la pròstata i que serveix per, en un segon pas, inicialitzar i permetreevolucionar de manera automàtica dos models deformables independents, guiats apartir de la informació de forma i regió de la pròstata estimada en el primer pas. Elprimer model deformable s’obté explícitament a partir de l’anàlisi de componentsprincipals (PCA) d’un conjunt de punts del contorn, que permet modelar la formade la pròstata, i de l’anàlisi PCA de la distribució de probabilitat dins de la regióprostàtica, que permet modelar la textura d’aquesta. Un tercer anàlisi PCA permetcorrelacionar ambdues distribucions. D’altra banda, un segon model deformable esderiva implícitament de l’anàlisi PCA de la funció distància obtinguda amb el conjuntde dades d’entrenament etiquetades. La consegüent evolució d’aquesta corbas’obté mitjanant la minimització del funcional Mumford-Shah, el qual es basa en unconjunt d’estadístics regionals obtinguts a partir de l’estimació de les probabilitatsa posteriori de les regions internes i externes de la pròstata.La segona contribució d’aquesta tesi és la segmentació automàtica de la pròstataen imatges 3D de RM. De manera similar a les imatges ecogràfiques, el sistemacombina les probabilitats d’un aprenentatge supervisat amb una segmentació inicial,en aquest cas, obtinguda a partir d’un atles probabilístic creat amb els volumsd’entrenament. La segmentació final s’obté a través d’una minimització basada engrafs.El resultat final és, doncs, el desenvolupament d’eines que permeten una segmentació acurada i robusta de la pròstata tant en imatges ecogròfiques com deressonòncia magnètica, millorant de forma substancial i significant la precisió delsmètodes desenvolupats fins a l’actualitat

Les protéines de choc thermique Hsp70 [70 kDa Heat Shock Protein] sont considérées comme des chaperons moléculaires très importants qui assistent au repliement des protéines naissantes ainsi qu’au repliement des protéines dénaturées en condition de stress dans le milieu intracellulaire. Les protéines Hsp70 sont présentes chez tous les organismes, tels que l’humain, la bactérie ou encore la levure et ont pour propriété d’avoir une séquence d’acides aminés hautement conservée entre les différentes espèces. [...] Ainsi la connaissance à l’échelle atomique des structures de la protéine hHsp70 dans ses conformations ouverte et fermée est un prérequis essentiel pour comprendre les interactions entre les deux domaines NBD et SBD de la protéine et pour élucider les mécanismes de communication inter-domaine. Cependant, il n’existe pas de structure expérimentale complète de la protéine hHsp70. Dans cette thèse, nous présentons les structures « tout-atome » des conformations ouverte et fermée de la protéine hHsp70, qui ont été modélisées par homologie à partir de la structure par diffraction des rayons X [DRX] de la protéine Hsp110 de la levure Sacharomyces cerevisae [dans la conformation ouverte] et à partir de la structure résolue par Résonance Magnétique Nucléaire [RMN] de la protéine Hsp70 de la bactérie E. coli [dans la conformation fermée]. Ces deux modèles structuraux de la protéine humaine Hsp70, dans les états ouvert et fermé, ont ensuite été relaxés par dynamique moléculaire non biaisée à la température de 300K en utilisant un solvant explicite sur une échelle de temps respectivement de 2.7 et 0.5 μs. L’hétérogénéité conformationelle de la protéine hHsp70 observée dans les simulations de dynamique moléculaire a été comparée à celle extraite d’expériences de resonance par transfert d’énergie entre fluorophores [FRET pour Förster resonance energy transfer] et de diffraction aux petits angles [SAXS pour Small Angle X-ray Scattering] effectuées sur des protéines homologues à hHsp70. [...] Une fois les structures 3D « tout-atome » résolues, la transition entre la conformation ouverte et la conformation fermée [et vice-versa] des protéines Hsp70 a été étudiée en utilisant deux techniques de simulations numériques : une analyse des modes normaux [Normal Mode Analysis où NMA] de la protéine Hsp70 dans chacune de ces deux conformations et une nouvelle méthode développée au cours de cette thèse, basée sur le concept de paysage d’énergie libre [Free-Energy Landscape où FEL]. [...] Cette étude a également permis d’identifier les sous-domaines et résidus clés qui apparaissent comme jouant un rôle important dans la dynamique conformationelle de la protéine Hsp70 dans l’approximation harmonique. Pour comprendre comment la fixation du nucléotide dans le domaine NBD peut engendrer un changement important de conformation de la protéine Hsp70, nous avons réalisé des simulations de dynamique moléculaire tout-atome non biaisée [sur une échelle de temps de 2 μs] de la protéine Hsp70 de la bactérie E. coli [appelée E. coli DnaK], dans trois conditions de nucléotides différentes [liée à l’ATP, liée à l’ADP et sans nucléotide]. [...] Finalement, en combinant l’analyse des modes normaux et du paysage d’énergie libre de la protéine Hsp70, nous avons pu établir une liste de résidus et de structures locales impliqués dans la dynamique conformationelle et dans les mécanismes de communication de la protéine hHsp70. La plupart de ces résidus ont été identifiés expérimentalement comme jouant un rôle crucial dans la communication entre les domaines NBD et le domaine SBD de protéines Hsp70 homologues. Notre étude nous a également permis d’identifier de nouveaux résidus clés. Ces nouveaux résidus pourraient être testés expérimentalement par mutagénèse et leurs positions pourraient être de nouvelles cibles pour la fixation d’inhibiteurs de fonctions biologiques de Hsp70, notamment dans le cas de tumeurs cancéreuses. / The 70 kDa heat shock proteins [Hsp70s] are key molecular chaperones which assist in the correct folding of nascent proteins and refolding of proteins under stress conditions in the intracellular environment. Hsp70s are present in all organisms and are highly conserved between the different species. [...] The conformational dynamics between the two conformations is governed by the ATP binding, ATP hydrolysis and by nucleotide exchange through an allosteric mechanism which is not fully understood.Knowledge of the conformations of hHsp70 at the atomic level is central to understand the interactions between its NBD and SBD. However, no complete structure of hHsp70 is known. In the present thesis, we report two conformations of hHsp70, constructed by homology modeling from the yeast Saccharomyces cerevisiae co-chaperone protein Hsp110 [openconformation] and from the bacteria Escherichia coli Hsp70 [closed conformation]. The open and closed conformations of hHsp70 built by homology were relaxed by using unbiased all-atom molecular dynamics [MD] simulations at 300 K in explicit solvent on a timescale of 2.7 and 0.5 μs, respectively. The conformational heterogeneity of hHsp70 observed in MD simulations was comparedwith those extracted from single-molecule Forster resonance energy transfer [FRET]experiments and to small-angle X-ray scattering [SAXS] data of Hsp70 homologs. [...] In the present thesis, the transitions between the open and closed conformation of Hsp70s were studied by using two different computational methods: the Normal Mode Analysis [NMA] and a new method developed in the present thesis based on the Free-Energy Landscape [FEL] concept.[...] These collective modes provide a mechanistic representation of the communication between the NBD and the SBD and allow us to identify subdomains and residues that appear to have a critical role in the conformational dynamics of Hsp70s in the harmonicapproximation. Second, in order to understand how the nucleotide binding in the NBD of Hsp70 induces a conformational change of the whole protein, we performed unbiased all-atom MD simulations [2 μs] of E. coli Hsp70 [named E. Coli DnaK], in three different nucleotide-binding states [ATPbound,ADP-bound and nucleotide free]. [...] Finally, by combining the NMA and the FEL analysis, we established a list of the local structures and of the residues relevant for the conformational dynamics and for the interdomain communication in hHsp70. Most of these residues could be related to previous experimental evidences of their role in the interdomain communication between the NBD and SBD domains of Hsp70 homologs but other were never identified before. All the relevant residues found in MD could be tested experimentally by mutational analysis and could be crucial locations to dock small peptides and for the design of inhibitors for the cancer therapy

Pas de résumé / In this thesis, we study the problem of registering 2D image sets and 3D point clouds under threedifferent acquisition set-ups. The first set-up assumes that the image sets are captured using 2Dcameras that are fully calibrated and coupled, or rigidly attached, with a 3D sensor. In this context,the point cloud from the 3D sensor is registered directly to the asynchronously acquired 2D images.In the second set-up, the 2D cameras are internally calibrated but uncoupled from the 3D sensor,allowing them to move independently with respect to each other. The registration for this set-up isperformed using a Structure-from-Motion reconstruction emanating from images and planar patchesrepresenting the point cloud. The proposed registration method is globally optimal and robust tooutliers. It is based on the theory Sum-of-Squares polynomials and a Branch-and-Bound algorithm.The third set-up consists of uncoupled and uncalibrated 2D cameras. The image sets from thesecameras are registered to the point cloud in a globally optimal manner using a Branch-and-Prunealgorithm. Our method is based on a Linear Matrix Inequality framework that establishes directrelationships between 2D image measurements and 3D scene voxels.

La pulsion, concept fondamental de la psychanalyse, doit-elle être conceptualisée en termes dualistes ou monistes ? À partir de deux principes premiers essentiellement irréductibles et antagonistes, Freud cherchait toujours à conceptualiser la pulsion en termes dualistes : pulsion d’autoconservation vs pulsion sexuelle partielle, libido de moi vs libido d’objet, pulsion de vie vs pulsion de mort. Interprétation biologique de la pulsion de mort, compulsion de répétition comme tendance restitutive, et dualisme pulsionnel – je propose que ces choix théoriques de Freud soient en effet liés.Quant à Lacan, mon hypothèse est qu’il était propulsé par un « pousse-à-l’unarisme » ; à partir de la topologie et le modèle de ratage, son intuition fondamentale était que la pulsion doit être conceptualisée en termes monistes. Lacan parvient ainsi à injecter non seulement plaisir, mais jouissance, cette satisfaction paradoxale qui fait souffrir, dans la structure fondamentale – dans le but – de la pulsion. Ceci implique que la pulsion de mort ainsi que le masochisme sont des aspects de chaque pulsion.Pendant un certain temps, le concept de pulsion sera pourtant éclipsé par le concept de répétition, répétition de jouissance en tant que plus-de-jouir. Or la pulsion moniste fait finalement un retour discret lorsque la question du symptôme se met en avant dans le dernier enseignement de Lacan. Je propose qu’un monisme pulsionnel soit une condition de possibilité pour le sinthome, et qu’à partir d’une revalorisation du versant de la pulsion de vie du point de vue de l’Un discret, le sinthome comporte une homéostasie supérieure, c’est-à-dire une satisfaction qui inclut ce qui la dérange. / Should the drive, which is fundamental concept of psychoanalysis, be conceptualized in monistic or dualistic terms? With two essentially irreconcilable and antagonistic principles as his point of departure, Freud always sought to conceptualize the drive in dualistic terms: drives of self-preservation vs. partial sexual drives, ego-libido vs. object-libido, life drive vs. death drive. A biological interpretation of the death drive, the repetition compulsion conceptualized as a restitutive tendency, and a drive dualism – I propose that these theoretical choices of Freud are in fact related.As for Lacan, my hypothesis is that he is driven by a “push-to-unarisme”; with topology and the model of misfiring / failure as his point of departure, his fundamental intuition is that the drive ought to be conceptualized in monistic terms. Lacan is thereby able to inject not only pleasure, but jouissance, this paradoxical satisfaction which entails suffering, in the basic structure – in the aim – of the drive. This implies that the death drive as well as masochism are aspects of each drive.For a time, the concept of the drive will however be overshadowed by the concept of repetition, repetition of jouissance qua plus-de-jouir. Yet the drive qua monism finally makes a discreet return when the question of the symptom comes to the fore in Lacan’s later teaching. I propose that a drive monism is a condition of possibility for the lacanian sinthome, and that on the basis of a reassessment of the different aspects of the life drive from the point of view of the One discrete, the sinthome entails a second-order homeostasis, that is to say a satisfaction that includes what unsettles it.