Resumo: Foram analisadas seis espécies/citótipos de peixes do gênero Eigenmannia, Eigenmannia sp1, Eigenmannia sp2, E. cf. trilineata, Eigenmannia sp e dois citótipos de E. virescens de diferentes bacias hidrográficas brasileiras, com o uso de técnicas citogenéticas básicas (coloração com Giemsa, localização das RONs pela marcação com nitrato de Prata e bandamento C) e moleculares (hibridação fluorescente in situ com sondas de DNAr 18S e 5S, com sondas teloméricas (TTAGGG)n, com sondas para elementos retrotransponíveis Rex 1 e Rex 3 e também por microdissecção, amplificação e hibridação in situ fluorescente com sonda produzida a partir do cromossomo sexual Y de Eigenmannia sp2). As espécies/citótipos analisados apresentaram intensa variação em seus números diploides, de 2n=28 cromossomos em Eigenmannia sp1, 2n=31/32 em Eigenmannia sp2, 2n=34 em E. cf. trilineata, 2n=36 em Eigenmannia sp e 2n=38 em E. virescens, além da ocorrência de sistema sexual XX-XY no citótipo de E. virescens do rio Ribeirão Claro (chamado de E. virescens-XY) e ausência desse sistema no citótipo do rio Mogi-Guaçu (chamado de E. virescens), bem como a ocorrência de sistema múltiplo do tipo X1X1X2X2-X1X2Y em Eigenmannia sp2 do rio Araquá. O DNAr 5S está organizado em duas classes distintas e foi localizado em diferentes cromossomos entre estas espécies/citótipos, mas sempre em posição terminal dos cromossomos, com exceção apenas do par cromossômico 7 de Eigenmannia sp1, que possui DNAr 5S em posição intersticial. Ainda, sequências de DNAr 5S foram localizadas no par sexual XY do citótipo de E. virescens-XY, evidenciando uma nova característica dos cromossomos sexuais deste grupo. As RONs, identificadas pelo tratamento com nitrato de Prata e pela sonda de DNAr 18S, foram sempre localizadas em compartimentos cromossômicos distintos do DNAr 5S e, apesar de serem localizadas... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: Conventional (Giemsa, Ag-NOR, C-banding) and molecular (Fluorescent in situ hybridization with 18S and 5S rDNA probes, telomeric repeats (TTAGGG)n, Rex1 and Rex3 retrotransposable elements and microdissection, amplification and fluorescent in situ hybridization with probes produced from the Y sex chromosome of Eigenmannia sp2.) cytogenetic studies were carried out in six fish species/cytotypes of the genus Eigenmannia from different Brazilian hydrographic basins. The analyzed species/cytotypes presented an intense variation in diploid number, ranging from 2n=28 chromosomes in Eigenmannia sp1, 2n=31/32 in Eigenmannia sp2, 2n=34 in Eigenmannia cf. trilineata, 2n=36 in Eigenmannia sp to 2n=38 in E. virescens, besides the occurrence of a sex chromosome system XX-XY in the cytotypes of E. virescens from Ribeirão Claro river (named as E. virescens-XY) and absence of this sex chromosome system in the cytotypes of Mogi-Guaçu river (named E. virescens), as well as the occurrence of a multiple sex chromosome system X1X1X2X2-X1X2Y in Eigenmannia sp2 from Araquá river. The 5S rDNA is organized in two distinct classes and was located in different chromosomes between these species/cytotypes; on the other hand, the location in the terminal position of chromosomes was a conserved feature, with exception of chromosome pair 7 in Eigenmannia sp1, which had 5S rDNA sites in an interstitial position. Yet, 5S rDNA signals were detected on the XY sex chromosome of E. virescens-XY, showing some new characteristics of sex chromosomes in this group. The NORs, identified by silver nitrate staining and 18S rDNA probes, were always located in distinct chromosome compartments of 5S rDNA and besides located in different chromosomes in all analyzed samples, they remained conserved through the karyotypic differentiation process in this group. The analysis of constitutive heterochromatin... (Complete abstract click electronic access below) / Orientador: Fausto Foresti / Coorientador: José Carlos Pansonato Alves / Banca: Daniela Cristina Ferreira / Banca: Orlando Moreira Filho / Mestre

Orientador: Fausto Foresti / Banca: Paulino Martinez Portella / Banca: Roberto Ferreira Artoni / Banca: Luciana Bolsoni Lourenço / Banca: Lígia Souza Lima Silveira da Mota / Resumo: Uma grande fração do genoma dos eucariotos é constituída de sequências repetitivas, que estão divididas em duas classes. Na primeira classe estão as sequências repetidas em cadeia, (satélites, minissatélites e microssatélites) e na segunda estão as sequências repetidas dispersas, que podem ser divididas em transposons e retrotransposons. Poucos estudos têm sido realizados acerca dessas sequências para elucidar sua função no genoma, que até pouco tempo eram conhecidas como DNA egoísta ou lixo. Porém, estudos recentes tem revelado que essas sequências estão envolvidas na diferenciação cromossômicas sexuais e na organização funcional e estrutural do genoma, além dessas sequências repetitivas constituírem bons marcadores cromossômicos. A subfamília Hypoptopomatina é caracterizada citogeneticamente por apresentar-se conservada quando ao número diplóide, que é de 2n=54 cromossomos para a maioria das espécies analisadas e uma distribuição da hetecocromatina bastante heterogênea, o que torna as espécies dessa subfamília bastante interessantes para os estudos das sequências repetidas, uma vez que essas sequências se localizam preferencialmente em regiões heterocromáticas. No presente trabalho foi estudada a localização de sequências repetidas dispersas Rex1, Rex3 via PCR em quatorze espécies da subfamília Hypoptopomatinae e do elemento disperso HLBa isolado do genoma de Hisonotus leucofrenatus por digestão enzimática. Os elementos Rex1 e Rex3 apresentaram-se conservados no genoma da subfamília Hypoptopomatinae, bem como em espécies distantes filogeneticamente. Tanto Rex1 e Rex3 quanto HLBam se encontram dispersos no genoma, porém este forma blocos em regiões heterocromáticas. Além disso, foi isolado o satélite PTHind do genoma de Pseudotocinclus tientensis, que encontra-se exclusivamente no genoma da espécie isolada, constituindo... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: A great fraction of eukaryotic genomic is based on repeated sequences, which are divided in two classes. The first are in tandem (satellites , minisatellites and micro satellites and in the second class are diverse repeated sequences, that can be divided in transposons and retrotransposons. Only few studies had been conducted with these sequences to bring into the light its genomic function, known by the moment as "selfish DNA" or "junk DNA". However, the few researches conducted may indicate that these sequences are related to sexual chromosome deferential and functional and structural genomic organization. In addition, repeated sequences can be used as effective chromosome markers. The subfamily Hypoptopomatinae's cytogenetic characteristics are the conservation of diploid number, which are 2n=54 chromosomes and heterogenic heterochromatic distribution. Based on that, the species of this subfamily became very interesting for analyze and study repeated sequences and also by the fact of these sequences are mostly located in heterochromatic regions. In the present study, Rex1 and Rex3 dispersed repeated sequences were isolated by PCR in fourteen species of Hypoptomatinae subfamily and the dispersed HLBam element was isolated in Hisonotus leucofrenatus genomic by enzymatic digestion. The Rex1 and Rex3 elements are conserved in Hypoptopomatinae subfamily genomic, likewise in phylogenetic distant species. Either Rex1, Rex3 or HLBam are dispersed in genomic, however, in block form inside heterochromatic regions. Moreover, the PTHind satellite was isolated from Pseudotocinclus tientensis genomic, which is exclusively encountered in the genomic of this isolate specie and may be a good marker for the specie. Additionally, sex-specific sequences were isolated by the AFLP technique from the genomic of Hisonotus leucofrenatus females. In Hypoptopomatinae subfamily the major part of current... (Complete abstract click electronic access below) / Doutor

Orientador: Fabio Porto-Foresti / Banca: Daniela Cristina Ferreira / Banca: José Carlos Pansonato Alves / Resumo: A hibridação interespecífica é considerada por diversos autores um método de melhoramento genético de difícil compreensão, uma vez que os produtos obtidos do acasalamento de diferentes espécies podem originar diversos produtos genéticos tais como Ginogenéticos e Androgenéticos Haplóides ou Diplóides, Híbridos Diplóides simples, Triplóides ou até indivíduos Tetraplóides. A aplicação da hibridação Interespecífica é utilizada no sistema de manejo nas grandes Pisciculturas que visa produzir animais que possuam melhor desempenho que as espécies parentais (vigor híbrido), como o aumento da taxa de crescimento, melhor qualidade da carne, resistência a doenças e capacidade de tolerar variações ambientais, além do aperfeiçoamento de diversas outras características a fim produzir peixes mais proveitosos para o cultivo. Dentre aproximadamente 40 espécies de peixes de interesse comercial no Brasil, destaca-se o gênero Brycon, de grande interesse nos centros de Pisciculturas devido à qualidade da carne, ao hábito alimentar, ao rápido crescimento e ganho de peso.Com o objetivo de compreender o mecanismo de hibridação, foram analisados 10 exemplares de cada espécie parental B.amazonicus (Matrinxã) e B.hilarii (Piraputanga) e 10 exemplares da respectiva geração Filial. Através da técnica de coloração com Giemsa, observou-se um conjunto diplóide 2n = 50 cromossomos em todos os indivíduos analisados das espécies parentais e da geração Filial. No entanto, houve diferenciação na formação cariotípica dos parentais e da geração filial.O parental Matrinxã (B.amazonicus) e sua geração Filial apresentaram uma constituição cariotíca de seis cromossomos do tipo metacêntrico, nove cromossomos submetacêntrico e dez cromossomos subtelocêntrico, enquanto que o parental Piraputanga (B.hilarii) apresentou uma constituição cariotípica de dez pares... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: Interspecific hybridization is considered by many authors as a method of breeding that is difficult to understand, since the mating products obtained from different species can cause many genetic products, such as gynogenetic and androgenetic haploid or diploid, diploid hybrid simple, triploid or even individuals tetraploids. The application of Interspecific hybridization is used in the management system in major fisheries that aims to produce animals that have better performance than the parental species (hybrid vigor), as increased growth rate, meat quality, disease resistance and ability to tolerate environmental changes besides the improvement of several other characteristics in order to produce more profitable fish farming.Out of approximately 40 fish species of commercial interest in Brazil, there is the genus Brycon, of great interest in the centers of fish farms due to meat quality, the feeding habits of the rapid growth and weight gain. Aiming to understand the mechanism of hybridization, we analyzed 10 specimens of each parental species B.amazonicus (Matrinxã) and B.hilarii (Piraputanga) and 10 of filial generation. By staining with Giemsa, all specimens analyzed have a number diploid with 2n = 50 chromosomes. However, there was karyotypic differentiation in the formation of parental and filial generation. The parental Matrinxã (B.amazonicus) and his generation branch had a karyotype constitution of six chromosomes of metacentric type, nine submetacentric chromosomes and ten subtelocêntric chromosomes, while the parental Piraputanga (B.hilarii) showed a karyotype constitution of ten pairs of chromosomes metacentric, nine pairs of chromosomes submetacentric and six subtelocentric chromosomes pairs.The detection of Nucleolar Organizer Regions (RONs) was obtained by the technique of impregnation by silver nitrate (Ag-NORs) that showed markings on the telomeric region... (Complete abstract click electronic access below) / Mestre

Orientador: Claudio de Oliveira / Banca: Guaracy Tadeu Rocha / Banca: Daniela Calcagnotto / Banca: Anderson Luis Alves / Banca: Ricardo Cardoso Benine / Resumo: Os Characiformes são peixes exclusivamente de água doce e encontram-se distribuídos nas Américas e na África, atingindo maior diversidade nas principais drenagens neotropicais. A família Characidae é o grupo mais especioso entre os Characiformes, porém, a relação dessa família com outras famílias é ainda incerta. São conhecidas cerca de 1000 espécies de Characidae das quais cerca de um terço estão distribuídas em 14 subfamílias, e as demais não tem uma posição filogenética clara, sendo incluídas em um grande grupo considerado incertae sedis em Characidae. A subfamília Cheirodontinae compreende cerca de 60 espécies, sendo um grupo de characídeos amplamente distribuídos nas bacias hidrográficas da América do Sul e Central, incluindo espécies trans-andinas. Os gêneros de Cheirodontinae atualmente estão divididos e, três tribos: Cheirodontini, Compsurini e Odontostilbini. No presente estudo, o principal objetivo foi investigar as relações de Cheirodontinae com as subfamílias de Characidae e as relações internas dos membros de Cheirodontinae através da análise de sequências de DNA mitocondrial (16S e Citocromo b) e nuclear (RAG1, RAG2 e Myh6). As análises mostraram que Spintherobolus não pertence à subfamília e Cheirodon stenodon, que era considerado incertae sedis em Characidae, deve fazer parte da mesma. Diversos gêneros apareceram polifiléticos, principalmente Odontostilbe. As espécies trans-andinas e andinas, são as espécies mais antigas da subfamília. As relações observadas nas análises são bastante diferentes das correntemente aceitas para Cheirodontinae e assim é proposta uma nova classificação para o grupo. O gênero Holoshesthes é considerado válido e pertencente a um clado juntamente com o gênero Aphyocheirodon e Acinocheirodon. Odontostilbe forma um clado monofilético com as espécies antes pertencentes à Serrapinnus... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: The Characiformes are exclusively freshwater fishes and they are found distributed in Americas and Africa, reaching more diversity in the major Neotropical drainages. The family Characidae is the most specious group among characiforms, but the relationships among this family and other families remains unclear. It is known about 1,000 species belonging to Characidae, one third distributed in 14 subfamilies, and the remaining does not have a clear phylogenetic position, and currently are included in a large group considered incertae sedis in Characidae. The subfamily Cheirodontinae comprises about 60 species, being a characid group widely distributed in the South and Central America hydrographic basins, including trans-Andean species. The genera of Cheirodontinae are currently divided in three tribes: Cheirodontini, Compsurini, and Odontostilbini. In the present work, the main goal was investigate the internal relationships of the members of Cheirodontinae through sequencing and analysis of mitochondrial (16S rRNA and Cytochrome b) and nuclear (RAG1, RAG2, and Myh6) genes. These analyses shown that Spintherobolus does not belong to the subfamily and Cheirodon stenodon, which was considered incertae sedis in Characidae, belongs to the same. Several genera are polyphyletic, mainly Odontostilbe. The trans-Andean and Andean species are the older species of the subfamily. The relationships observed in the analyses are very different of the currently accepted to Cheirodontinae and thereby it is suggested a new classification to the group. The genus Holoshesthes is considered valid and belonging to a clade jointly with the genus Aphyocheirodon and Acinocheirodon. Odontostilbe form a monophyletic clade with the species currently belonging to Serrapinnus, a new species, and Compsura heterura. The tribes Cheirodontini, Compsurini and Odontostilbini are preserved, with different compositions and a new tribe is suggested (Pseudocheirodontini) / Doutor

Orientador: Cesar Martins / Banca: Luis Antonio Carlos Bertollo / Banca: Eliana Feldberg / Banca: Ligia Souza Lima Silveira da Mota / Banca: André Luis Laforga Vanzella / Resumo: A família Cichlidae tem despertado um grande interesse científico devido à rápida e extensa radiação adaptativa sofrida em alguns de seus grupos e por conter espécies com grande potencial para a aqüicultura, como a tilápia do Nilo, Oreochromis niloticus. O mapeamento físico cromossômico mostra-se promissor como ferramenta para os estudos comparativos e evolutivos entre diferentes espécies. Diante disto, o presente trabalho teve como objetivo realizar mapeamento cromossômico comparativo em ciclídeos utilizando seqüências repetitivas de DNA como sondas. Elementos transponíveis, DNA satélite e seqüências repetidas inseridas em BACs foram utilizados como sondas, através da técnica de FISH, em espécies de ciclídeos africanos e sul-americanos. Os retrotransposons Rex localizaram-se principalmente nas regiões centroméricas de espécies africanas e sul-americanas, com exceção de O. niloticus que demonstrou um padrão de localização disperso destes elementos. O acúmulo de Rex nos centrômeros destas espécies é coincidente com as regiões heterocromáticas, que representam um refúgio para seqüências repetitivas, devido à baixa taxa de recombinação. O DNA satélite SATA hibridou nos centrômeros de todas as espécies analisadas. Esta conservação centromérica mostra um papel importante destas seqüências na organização estrutural e funcional destas regiões nas diferentes espécies. Além disto, em O. karongae, foram observados sinais intersticiais em três pares cromossômicos, corroborando a hipótese de fusões cromossômicas que levaram à redução do número diplóide nesta espécie. O elemento transponível ROn-1 localizou-se intersticialmente no braço longo do par maior de O. niloticus e em posição próxima ao telômero também no braço longo do par meta-submetacêntrico (m/sm) maior dos haplocromíneos e hemicromíneos... (resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: The Cichlidae family is one of the most species-rich families of fishes. This family has attracted the attention of the evolutionary biologists due the rapid radiation occurred in some species. Moreover, some cichlid species are important for the world aquaculture, such as Nile tilapia, Oreochromis niloticus. The chromosome mapping is useful for comparative and evolutionary studies among different species. To further understand the mechanisms of chromosome evolution in cichlids, repeated sequences were used for the comparative chromosome mapping in cichlid species. Probes containing the transposable elements (TEs) Rex1, Rex3, Rex6 and ROn-1, the SATA satellite DNA, and a BAC-clone enriched of several types of repeated DNAs were used through FISH in the chromosomes of African and South-American cichlids. The TEs Rex were mainly distributed in the centromeric region of all chromosomes in all cichlids, with the exception of O. niloticus, that presented TEs distributed overall in the chromosome arms. The localization of TEs Rex are in coincidence with heterochromatic regions, which can represent an perfect environment for the accumulation of repeated sequences. The satellite DNA was mapped in the centromeres of all cichlid species. The maintenance and centromeric distribution of the SATA satellite DNA in African cichlids suggest that this sequence can play an important role in the organization and function of the centromere in these species. Moreover, in O. karongae, the SATA have shown interstitial signals in three chromosome pairs, corroborating that chromosome fusions were involved in the reduction of diploid number in this species. The transposable element ROn-1 was localized in just one cluster in the largest chromosome of African cichlids, but in different positions, suggesting that different chromosomal rearrangements could have occurred in the origin of the largest chromosomes... (Complete abstract click electronic access below) / Doutor

Resumo: O objetivo deste trabalho é analisar as espécies do gênero Trichomycterus presentes na sub bacia do rio Cuiabá, drenagem do rio Paraguai, através de analises morfológicas e moleculares, e um breve ensaio sobre o complexo de espécies T. brasi/iensis através de análises moleculares. Os resultados obtidos foram divididos em duas partes: na primeira parte são apresentados os resultados das análises morfológicas e moleculares dos exemplares de Trichomycterus, e uma análise da morfologia externa de T. johnsoni; e na segunda parte são apresentadas as análises moleculares de alguns espécimes que pertencem ao complexo de espécies T. brasi/iensis. Foram identificadas quatro novas espécies, T. sp. n1, T. sp. n2, T. sp. n3, T. sp. n4 que divergem entre elas pelo seguintes conjuntos de caracteres, respectivamente: Número de odontóideos na placa pré-opercular (9 versus 20-22 versus 17-18 versus 14); número de odontóideos na placa inter-opercular (16-17 versus 27-31 versus 21-25 versus 22-25); T. sp. n1 diverge de seus congêneres pelo número de raios na nadadeira peitoral (i+6 versus i+5). O número de raios da nadadeira anal permite diferenciar T. sp. n1 (ii+4) de T. sp. n2 (ii+5) e T. sp. n3 (ii+5) e T. sp. n4 (ii+6), sendo essa caráter compartilhado entre T. sp. n2 e T. sp. n3. As espécies compartilham o número de raios da nadadeira dorsal (ii+7), o número de raios da nadadeira caudal (i+11 +i), e o número de raios na nadadeira pélvica. Com relação aos canais laterosensorias, T. sp. n1 e T. sp. n3 apresentaram a ausência do canal infra-orbital i1 e i3. Nas análises osteológicas, a única variação encontrada entre as espécies citadas (com exceção de T. sp. n4) foi a formação da nadadeira pélvica, em relação a estruturas dos ossos pélvicos e do processo mesial. Nas análises moleculares foi amplificado e sequenciado parte do gene mitocondrial Citocromo... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: The objective of this work is analyze the Trichomycterus species presents in the Cuiabá river sub basin, Paraguay river drainage, through morphologic and molecular analyze, and make a briefing essay species complex of T. brasi/iensis with molecular analyses. The results had been divided in two parts: in the first part are presented the results of the morphologic and molecular analyses of Trichomycterus, and an analysis of the external morphology of T. johnsoni; e in the second part is presented the molecular analyses of some specimens that comprise to the species complex of T. brasiliensis. The species had been identified to four new species, T. sp. n1, T. sp. n2, T. sp. n3 and T. sp. n4, that they diverge between them for the following characters: Number of odontodes in the opercular plate (9 versus 20-22 versus 17-18 versus 14); number of odontodes in the Interopercular plate (16-17 versus 27-31 versus 21-25 versus 22-25); T. sp. n1 diverge of ali species for the number of rays in the pectoral fins (i+6 versus i+5). The number of rays of the anal fins allows differente in T. sp. n1 (ii+4) of T. sp. n2 (ii+5) and T. sp. n3 (ii+5) and T. sp. n4 (ii+6), being this character shared between T. sp. n2 and T. sp. n3. Ali species share the number of rays of the dorsal fins (ii+ 7), the number of caudal fins rays (i+11 +i), and the number of the pelvic fins rays. With regard to the laterosensory canais, T. sp. n1 and T. sp. n3 had presented the absence of the infra-orbital canais i1 and i3. In the osteology analyses, the only variation of ali species cited (with exception of T. sp. n4) was the pelvic fins, where the variation of the pelvic bones structures and the mesial process diverge between them. In the molecular analyses it was amplified and sequence part of the mitochondrial gene Citocromo Oxidase I sub-unit, and was elaborated a matrix with 634 pb. The dendogram with method UPGMA with... (Complete abstract click electronic access below) / Orientador: Claudio de Oliveira / Coorientador: Flávio Alicino Bockmann / Banca: Francisco Langeani Neto / Banca: Ricardo Cardoso Benine / Banca: Edmir Daniel Carvalho / Banca: Fausto Foresti / Mestre

Orientador: Fausto Foresti / Banca: Cláudio de Oliveira / Banca: Luis Antonio Carlos Bertollo / Banca: Artur Antonio Andreata / Banca: Roberto Ferreira Artoni / Resumo: Foram analisadas onze espécies de peixes do gênero Characidium, Characidium cf. zebra, Characidium cf. gomesi, Characidium lauroi, Characidium oiticicai, Characidium lanei, Characidium pterostictum, Characidium schubarti, Characidium alipioi, Characidium sp1, Characidium sp2 e Characidium sp3 de diferentes bacias hidrográficas brasileiras, com o uso de técnicas citogenéticas básicas (coloração com Giemsa, localização das RONs pela marcação com nitrato de Prata e bandamento C) e moleculares (marcação por fluorocromos base-específicos, hibridação in situ fluorescente com sondas de DNAr 18S e 5S, com sondas teloméricas (TTAGGG)n e com sondas para histona H1 e também microdissecção, amplificação e hibridação in situ fluorescente com sondas produzidas a partir do cromossomo sexual W e dos cromossomos B). Todas as espécies apresentaram número diplóide de 2n=50 cromossomos, com predominância dos cromossomos dos tipos meta e submetacêntricos, além da ocorrência de cromossomos supranumerários em C. pterostictum, C. oiticicai, C. cf. gomesi e Characidium sp3. Foi observada também a ocorrência de um sistema ZZ-ZW de cromossomos sexuais representado pelo par heteromórfico número 2 em todas as espécies, com exceção apenas de Characidium cf. zebra, que não apresentou cromossomos sexuais diferenciados. O DNAr 5S foi localizado em diferentes cromossomos entre estas espécies, mas sempre em posição intersticial dos cromossomos, reforçando a idéia de que esta localização cromossômica poderia representar alguma vantagem relacionada à organização destes genes no genoma. As RONs, identificadas pela prata, pela CMA3 e pela sonda de DNAr 18S, foram sempre localizadas em compartimentos cromossômicos distintos do DNAr 5S e estão diretamente relacionadas ao processo de diferenciação dos cromossomos Z e W,... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: Eleven species of fish of the genus Characidium comprised by Characidium cf. zebra, Characidium cf. gomesi, Characidium lauroi, Characidium oiticicai, Characidium lanei, Characidium pterostictum, Characidium schubarti, Characidium alipioi, Characidium sp1, Characidium sp2, and Characidium sp3 from different Brazilian hydrographic basins were analyzed using basic cytogenetic (coloration with Giemsa, localization of NORs for silver nitrate marking and C-banding) and molecular techniques (for base-specific fluorochrome markings, fluorescent in situ hybridization with 18S and 5S rDNA probes, telomere probes (TTAGGG)n, and H1 histone, as well as microdissection, amplification and in situ fluorescent hybridization using probes prepared from both sex W and B chromosome). All the species presented a diploid number of 2n=50 chromosomes, with a predominance of the meta- and submetacentric types, besides the occurrence of supranumerary chromosomes in C. pterostictum, C. oiticicai, C. cf. gomesi, and Characidium sp3. The occurrence of a ZZ-ZW sex chromosome system represented by the heteromorphic pair number 2 in all species was observed, with the exception of Characidium cf. zebra, which did not presented differentiated sex chromosomes. The 5S rDNA marks were observed in different chromosomes among these species, but always located in an interstitial position, strengthening the idea that this chromosome location might represent some advantage related to the organization of these genes in the genome. NORs identified using Silver and CMA3, staining and 18S rDNA probe have always been located in distinct chromosome compartments when compared to 5S rDNA, showed to be directly related to the Z and W chromosome differentiation process, and is considered to play an important role in their evolution, considering that they could... (Complete abstract click electronic access below) / Doutor

Orientador: Fábio Porto-Foresti / Banca: Roberto Ferreira Artroni / Banca: Luis Antonio Carlos Bertollo / Resumo: Prochilodus lineatus constitui-se em uma espécie de grande ocorrência na bacia superior do rio Paraná, envolvendo, sobretudo, os rios Grande, Pardo e Mogi-Guaçu. Citogeneticamente, essa espécie apresenta número diploide de 54 cromossomos dos tipos meta/submetacêntricos e apresenta um interessante sistema de microcromossomos B, que pode ocorrer variação interindividual de zero a nove supranumerários, além de apresentar polimorfismo, sendo encontrados diferentes morfotipos. P. lineatus pode ser considerada uma espécie modelo de peixe neotropical, sendo muito utilizada para estudos concernentes à origem, comportamento meiótico e evolução dos cromossomos B, devido à facilidade de captura, manejo, alta frequência de supranumerários e polimorfismo. Atualmente existem muitas especulações a respeito de sua função, origem e herança, o que torna a análise da estrutura do DNA deste tipo cromossômico, assim como o estudo do seu padrão de herança de extrema importância. Diante disto, o presente trabalho teve como objetivo estudar a origem, manutenção e herança das variantes de cromossomos B encontradas em P. lineatus do rio Mogi-Guaçu, a partir da análise da composição do DNA, frequência na população natural e padrão de transmissão destes elementos genômicos. Os resultados obtidos a partir da análise da herança destes supranumerários mostrou dinamismo entre as variantes de supranumerários para prevalecerem nos genomas hospedeiros, por meio do padrão de transmissão (kB), onde o morfotipo B-metacêntrico apresentou kB acima da taxa Mendeliana, indicando um possível mecanismo de acúmulo (drive), enquanto que os morfotipos B-acro e B-submetacêntrico apresentaram kB abaixo da taxa Mendeliana, indicando estarem em estágio de extinção. Ao realizar a técnica de pintura cromossômica, utilizando as sondas B-específicas obtidas a partir da microdissecção de cada morfotipo, observou-se ... / Abstract: Prochilodus lineatus is a species of high incidence in the upper Paraná River basin, involving mainly the Grande, Pardo and Mogi-Guaçu Rivers. Cytogenetically, this species has a diploid number of 54 meta/submetacentric chromosomes and presents an interesting system of B microchromosomes, which can occur interindividual variation from zero up to nine supernumeraries, also it presents polymorphism and can be found in different morphotypes. P. lineatus can be considered a model species of neotropical fish, commonly used for studies concerning the origin, behavior and evolution of B chromosomes, due to ease of capture, handling, high frequency of supernumerary and polymorphism. Currently, there are only speculations about its function, origin and inheritance, which make the analysis of the DNA structure of this chromosomal type, as well as the study of the inheritance pattern, of the utmost importance. Faced with this, the present work aimed to study the origin, maintenance and inheritance of the B chromosomes variants found in P. lineatus from Mogi-Guaçu River, from DNA composition analysis, frequency in natural population and transmission pattern of these genomic elements. The results obtained from the inheritance analysis of these supernumerary showed a dynamism between supernumerary variants to prevail in the host genome through the transmission pattern (kB), in which the B-metacentric morphotype presented kB above Mendelian ratio, indicating a possible accumulation mechanism (drive), while the B-acro and B-submetacentric variants presented kB below Mendelian ratio, indicating that they were in extinction stage. When performing the chromosome painting technique, using B-specific probes obtained from each microdissected morphotypes, it was observed a homology between the B chromosome variants, indicating a common ancient variant origin. However, only the B-submetacentric chromosome probe (Bsm) showed ... / Mestre

Made available in DSpace on 2014-06-11T19:30:12Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2010-02-26Bitstream added on 2014-06-13T20:39:52Z : No. of bitstreams: 1 henriques_jm_me_botib.pdf: 1169724 bytes, checksum: 897f2a369c2b125057309094236f0fc6 (MD5) / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP) / O rio Ribeira de Iguape e os rios litorâneos drenam uma importante faixa de terras da região leste de São Paulo e sua ictiofauna de água doce tem algumas semelhanças e muitas diferenças em relação às drenagens continentais. Os levantamentos ictiofaunísticos realizados nesses rios, como nas outras grandes bacias hidrográficas brasileiras, são ainda incompletos. Além disso, não existe consenso acerca do status taxonâmico de muitas espécies listadas nesses levantamentos. As estimativas disponíveis sugerem que existam cerca de 100 espécies de água doce na bacia do Ribeira de Iguape e 50 nos rios litorâneos. Estudos recentes têm proposto o uso do gene mitocondrial Citocromo Oxidase subunidade I (Cox 1) como um sistema global de identificação para as plantas e animais. Essas sequências têm sido interpretadas como um código de barras (barcode), com as espécies sendo delimitadas por uma sequência particular ou por um conjunto de sequências muito similares. Foram obtidas e analisadas 400 sequências do gene Citocromo Oxidase subunidade I (Cox1) de 68 espécies para a bacia do Ribeira de Iguape e 315 sequências de 58 espécies pertencentes aos rios costeiros do estado de São Paulo. A distância K2P média encontrada entre indivíduos dentro das espécies do Ribeira de Iguape foi de 0,41 %, e 6,32% entre espécies dentro de um mesmo gênero, similar ao encontrado nos rios costeiros onde a distância K2P foi de 0,77% dentro de espécies, em comparação à 6,16% entre espécies dentro de um mesmo gênero. Todas as espécies puderam ser diferenciadas por sua sequência Cox1, embora alguns indivíduos isolados de espécies distintas apresentaram haplótipos característicos de uma espécie do mesmo gênero. O presente estudo evidenciou que as espécies de peixes analisadas puderam ser identificadas de forma eficiente através da utilização do barcode, e pode ser usada para aplicações / The Ribeira Iguape river and coastal rivers drain a large range of land east of São Paulo and its freshwater fishes has some similarities and many differences frem the continental drainage. Surveys conducted ichthyofauna in these rivers, as in other large river basins in Brazil, is still incomplete. Moreover, there is no consensus on the taxonomic status of many species Iisted in these surveys. Available estimates suggest that there are about 100 freshwater fishes species in the Ribeira Iguape basin and 50 in coastal rivers. Recent studies have proposed the use of mitochondrial gene cytochrome oxidase subunit I (Cox 1) as a global system of identification for plants and animais. These sequences have been interpreted as a barcodes, with species being bounded by a particular sequence or a set of very similar sequences. Were obtained and analyzed 400 sequences of the gene cytochreme oxidase subunit I (Cox1) from 68 species of Ribeira de Iguape basin and 315 sequences of 58 species of coastal rivers from Sao Paulo state. The average K2P distance between individuais within species of Ribeira Iguape basin was 0.41 % and 6.32% between species within a genus, similar to that found in coastal rivers where the K2P distance was 0.77% within species, compared to 6.16% between species within the same genus. Ali species were differentiated by their sequence Cox1, although some isolated individuais of different species had haplotypes of species of the same gender. The present study showed that fish species analyzed could be identified efficiently using barcode, and can be used for subsequent applications in ecology and systematics

Orientador: Diogo Teruo Hashimoto / Banca: Rafael Yutaka Kuradomi / Banca: George Shigueki Yasui / Resumo: No presente estudo avaliou-se a eficiência da indução à triploidia em duas espécies (pacu Piaractus mesopotamicus e tambaqui Colossoma macropomum) e seu respectivo híbrido interespecífico tambacu (♀ tambaqui x ♂ pacu). O principal objetivo foi avaliar a indução por choque de temperatura quente e frio e a forma de identificação da ploidia dos peixes. Além disso, foi padronizado um protocolo de obtenção de cromossomos mitóticos a partir de larvas (citogenética de larvas). Nas avaliações de quantidade e qualidade das metáfases, observaram-se melhores resultados para o protocolo de citogenética de larvas utilizando a concentração de colchicina a 0,007% (4 h). Inicialmente, nos experimentos pilotos, foram avaliados choque quente e frio em pacu e tambaqui, os quais apresentaram melhores resultados de taxa de eclosão e índice de triploides nos tratamentos quentes. Dessa forma, apenas tratamentos quentes foram avaliados nos experimentos seguintes. Na indução do pacu, foram detectados 11,8% de triploides por citogenética em juvenis no choque a 43 ºC (2 min), 2 min após a fertilização. Para o tambaqui, em análise por citogenética de larvas, foram detectados 80% de triploides no choque a 43 °C (2 min), 2 min após a fertilização; entretanto, quando analisado na fase juvenil, este tratamento apresentou 29,4% de triploides. Já para o híbrido tambacu, foram detectados 33,3% de triploides na fase larval no choque a 43 °C (2 min), 2 min após a fertilização; e 8,7% na fase de juvenil. Entretanto, no choque a 41°C (2 min), 1 min após na fertilização, foram detectados 57,8% de triploides na fase juvenil. Quando o nível de ploidia foi analisado por meio da análise das Regiões Organizadoras do Nucléolo (NOR) nos cromossomos metafásicos, verificou-se variação intra-individual (NORs múltiplas) para o pacu, tambaqui e tambacu, assim como na análise dos núcleos interfásicos do tambaqui, inviabilizando essa... / Abstract: In the present study, we evaluated the triploidy induction efficiency in two species (pacu Piaractus mesopotamicus and tambaqui Colossoma macropomum) and their respective interspecific hybrid tambacu (♀ tambaqui x ♂ pacu). The main objective was to evaluate the heat and cold shock temperatures and the form of identification of the fish ploidy. Furthermore, a protocol has been standardized to obtain mitotic chromosomes from larvae (larvae cytogenetics). In the evaluations of quantity and quality of metaphases, we observed better results for larvae cytogenetics using the concentration of 0.007% (4 hours). Initially, in the pilot experiments, we analyzed heat and cold shock treatments in pacu and tambaqui, which showed better results from hatching rate and triploid index in heat temperatures. Thus, only heat shocks were evaluated in the final experiments. In pacu, 11.8% of triploid juveniles were detected by cytogenetic method in the shock induction at 43 °C (2 min), 2 min after fertilization. For tambaqui, 80% of triploid were detected in larvae cytogenetic analysis for the shock at the 43 °C (2 min), 2 min after fertilization; however, when analyzed in the juvenile stage, we observed 29.4% of triploids. For the hybrid tambacu, we detected 33.3% of triploids in the larval stage at the shock at 43 °C (2 min), 2 min after fertilization; and 8.7% in the juvenile stage. However, in the shock at 41 °C (2 min), 1 min after fertilization, we detected 57.8% of triploid in the juvenile stage. When the ploidy level was analyzed by Nucleolar Organizer Regions analysis (NOR) on metaphase chromosomes, intra-individual variation was found (multiple NOR) for pacu, tambaqui and tambacu, as well as the analysis of interphase nuclei tambaqui, preventing this technique for verification of ploidy. In conclusion, although this study did not reach 100% triploidy, this work enables the triploid production for future studies and identifies them in the ... / Mestre