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Análise funcional de genes de Phakopsora pachyrhizi candidatos a efetores utilizando o sistema EDV / Functional analysis of Phakopsora pachyrhizi effector candidates using the EDV system

Möller, Priscilla Aguiar 29 July 2014 (has links)
Made available in DSpace on 2015-03-26T13:37:55Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 1312640 bytes, checksum: f59984d596fc23251bdcc4b712cc574a (MD5) Previous issue date: 2014-07-29 / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico / Rust fungi are obligate parasites that secrete diverse proteins during their interaction with host plants. These proteins promote parasitism by manipulating the host metabolism and interfering with its defense responses. Effector proteins can be recognized by proteins coded by plant resistance genes, in which case they are called avirulence proteins. Six loci containing genes that confer varying degrees of resistance to P. pachyrhizi (Rpp) have been reported, and several genes encoding proteins secreted by the fungus have been identified. However, effector proteins (Avr proteins) recognized by soybean Rpp proteins have not yet been identified. Thus, the objective of this study was to identify proteins secreted by P. pachyrhizi (PPUFV02) able to activate or suppress defense responses in soybean, through the functional analysis of ten candidate effector genes using the TTSS of P. savastanoi pv. glycinea 1462 (EDV system). Among the ten effectors tested in 11 soybean genotypes resistant to the mono-pustule isolate PPUFV02 of P. pachyrhizi, source of candidate genes, PHPA_RSP_71 stood out for contributing to greater disease severity in genotype PI 594538- A and lower in genotype PI 594754. The PHPA_RSP_23 effector was also interesting for additional functional studies on soybean and tobacco, since the results indicated a possible activation of defense response in soybean, in general (all genotypes), and a possible suppression of cell death in tobacco. The effector activity of these candidate genes was not confirmed by analysis of bacterial growth in soybean and tobacco (non-host plant). On the other hand, it is possible that these effects are due to an interference of the effector with the function of the TTSS, making it necessary to conduct protein secretion assays to confirm or reject these hypotheses. Overall, the genotype Williams 82 showed resistance to Psg 1462 and can be used as negative control for disease in functional analysis in soybean. It was not possible to confirm N. benthamiana as an appropriate plant for functional studies of induction/suppression of HR when using Psg 1462, since it is possible that the bacterial isolate is pathogenic to this species. The pEDV6 vector in general was stable in the Psg1462(pEDV6::PHPA_RSP) clones and did not alter the ability of the bacteria to multiply in planta, confirming the EDV as a good system for functional analysis of P. pachyrhizi candidate effector genes in soybean using TTSS of Psg 1462. The inoculation method by dipping was not suitable for functional analysis in soybean because, in general, showed highly variable results. The inoculation method by vacuum was the best suited for this purpose, since it introduced greater uniformity in the severity of symptoms observed. / Os fungos causadores de ferrugens são parasitas obrigatórios que secretam diversas proteínas durante sua interação com plantas hospedeiras. Essas proteínas promovem o parasitismo por meio da manipulação do metabolismo do hospedeiro e interferência em suas respostas de defesa. As proteínas efetoras podem ser reconhecidas pelas proteínas codificadas pelos genes de resistência da planta, sendo, neste caso, denominadas proteínas de avirulência. Seis locos contendo genes que proporcionam diferentes graus de resistência à P. pachyrhizi (Rpp) já foram relatados e vários genes que codificam proteínas secretadas por esse fungo já foram identificados. No entanto, ainda não foram identificadas as proteínas efetoras (proteínas Avr) reconhecidas pelas proteínas Rpp de soja. Desse modo o objetivo deste trabalho foi identificar proteínas secretadas por P. pachyrhizi (PPUFV02), capazes de ativar ou suprimir respostas de defesa em soja, através de uma análise funcional de 10 genes candidatos a efetores, utilizando o SST3 de P. savastanoi pv. glycinea 1462 (sistema EDV). Dos dez efetores testados nos 11 genótipos de soja resistentes ao isolado monopostular de P. pachyrhizi PPUFV02, fonte dos genes candidatos, PHPA_RSP_71 se destacou por contribuir para uma maior severidade da doença no genótipo PI 594538-A e menor no genótipo PI 594754. O efetor PHPA_RSP_23 também se mostrou interessante para novos estudos funcionais em soja e tabaco, uma vez que os resultados indicaram possível ativação de resposta de defesa em soja de forma geral (em todos os genótipos) e possível supressão de morte celular em tabaco. A atividade efetora desses genes candidatos não foi confirmada pela análise de crescimento bacteriano em soja e em tabaco (planta não hospedeira). Por outro lado, há uma possibilidade de esses efeitos serem devido a uma interferência do efetor com a funcionalidade do SST3, necessitando-se de estudos de secreção da proteína para confirmar ou refutar estas hipóteses. De forma geral o genótipo Williams 82 se mostrou resistente à Psg 1462, podendo ser utilizado como controle negativo para doença nas análises funcionais. Não foi possível confirmar N. benthamiana como uma planta adequada para estudos funcionais de indução/supressão de HR ao se utilizar Psg 1462, uma vez que é possível que este isolado bacteriano seja patogênico a esta espécie. O vetor pEDV6 de forma geral apresentou estabilidade nos clones Psg1462(pEDV6::PHPA_RSP) e não alterou a capacidade de multiplicação da bactéria in planta, confirmando o EDV como um bom sistema para análise funcional de genes de P. pachyrhizi candidatos a efetores em soja, utilizando o SST3 de Psg 1462. O método de inoculação por mergulho não se mostrou adequado para as análises funcionais em soja, uma vez que apresentou de forma geral alta variabilidade nos resultados, sendo o método de inoculação a vácuo mais indicado para este fim por ter apresentado maior uniformidade na severidade dos sintomas observados.
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Herança e mapeamento genético da resistência do acesso PI 587905 ao isolado monopustular PPUFV02 de Phakopsora pachyrhizi, agente causal da ferrugem asiática da soja / Inheritance and molecular mapping of the resistance from PI 587905 to Phakopsora pachyrhizi monopustular isolate PPUFV02

Alves, Daniel Pedrosa 16 February 2012 (has links)
Made available in DSpace on 2015-03-26T13:42:25Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 1631185 bytes, checksum: 1a2583b9096adafba72549267dc3ce2e (MD5) Previous issue date: 2012-02-16 / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico / Asian soybean rust (ASR) caused by Phakopsora pachyrhizi fungus is the most important fungal disease that threatens soybean cultivation. Nowadays the main disease control procedure is administering fungicides from the triazole and strobilurin groups. However, using rust resistant or tolerating varieties is the best alternative for controlling the disease, as it reduces production costs, facilitates dealing with the disease and reduces possible environmental impact caused by usage of fungicides. Until now, five genes were identified in soybean (Rpp1 to 5) that are resistant to P. pachyrzi. However, there are new accesses that feature resistance and which inheritance is unknown. The objective of this work was studying the resistance inheritance of the PI 587905 access to the monopustular isolate PPUFV02 and demonstrating its relationship of the identified gene(s) to already described genes through genetic mapping by using microsatellite markers. A segregating F2 population was obtained for resistance by crossing access PI 587905 with the susceptible cultivar Conquista; this population was made of five subpopulations (23C 1 to 5) from different F1 plants. Plants from 23C-1 F2 population were inoculated in the V2-V3 stage in controlled conditions, with monopustular isolate PPUFV02 of P. pachyrizi and evaluated eight, ten, twelve and fourteen days after inoculation. Segregation pattern indicated that resistance is governed by a gene with partial dominance (χ2 = 1.86 p= 39.48%). Analysis with microsatellite markers indicated that the resistance gene is located in the linkage group G (LG-G) in the interval Sct_187-Sat_064 that contains the Rpp1 locus, suggesting that the resistance gene in access PI 587905 is a part of Rpp1 gene or another linked gene. Subpopulations 23C-2 to 5 were planted with the purpose of obtaining more plants with informative recombination events between the loci Sct_187 and Sat_064. Fenotyping of these plants was made in an identical way to the 23C-1 subpopulation; however genotyping was performed only in susceptible plants. From the group analysis of all subpopulations four F2 plants were obtained. They featured informative recombination events between the loci Sct_187 and Sat_064. Those can be used for deep mapping in this region, aiming to precisely locate the resistance gene and its future positional cloning. Markers Sct_187r2 and Sat_064 will also be suitable for use in assisted selection programs with molecular markers aiming introgression of the resistance gene in PI 587905 and its pyramid connection with other genes resistant to ASR in commercial soybean cultivars. / A ferrugem asiática da soja (FAS) causada pelo fungo Phakopsora pachyrhizi é a principal doença fúngica da cultura da soja. Atualmente a principal medida de controle da doença é a aplicação de fungicidas dos grupos dos triazóis e estrobilurinas. Todavia, a utilização de variedades resistentes ou tolerantes à ferrugem é a melhor alternativa para o controle da doença, por reduzir os custos de produção, facilitar o manejo da doença e reduzir os possíveis impactos ao ambiente ocasionados pelo uso de fungicidas. Na soja, até o momento, foram identificados cinco genes (Rpp1 a 5) de resistência a P. pachyrhizi. Contudo, existem novos acessos que apresentam resistência à FAS e cuja herança não é conhecida. Este trabalho teve por objetivo estudar a herança da resistência do acesso PI 587905 ao isolado monopustular PPUFV02 e demonstrar a relação do(s) gene(s) identificado(s) com os genes já descritos, por meio do mapeamento genético, utilizando marcadores microssatélites. Foi obtida uma população segregante F2 para a resistência pelo cruzamento do acesso PI 587905 com a cultivar suscetível Conquista. Essa população foi constituida de cinco subpopulações (23C- 1 a 5) oriundas de plantas F1 distintas. As plantas da subpopulação 23C-1 F2 foram inoculadas no estágio V2-V3, em condições controladas, com o isolado monopustular PPUFV02 de P. pachyrhizi, e avaliadas aos oito, dez, doze e quatorze dias após a inoculação. O padrão de segregação obtido revelou que a resistência é governada por um gene com dominância parcial (χ2= 1,86 p= 39,48%). As análises com marcadores microssatélites revelaram que o gene de resistência está localizado no grupo de ligação G (LG-G), no intervalo Sct_187- Sat_064 que contém o loco Rpp1, sugerindo que o gene de resistência do acesso PI 587905 é um alelo do gene Rpp1 ou de um novo gene ligado. As subpopulações 23C-2 a 5 foram plantadas com o intuito de se obterem mais plantas com eventos de recombinação informativos entre os locos Sct_187 e Sat_064. A fenotipagem dessas plantas foi realizada de maneira idêntica à da subpopulação 23C-1, contudo foi realizada a genotipagem apenas das plantas suscetíveis. Da análise conjunta de todas as subpopulações foram obtidas quatro plantas F2 que apresentaram eventos de recombinação informativos entre os locos Sct_187 e Sat_064, que podem ser utilizadas para o mapeamento fino nessa região, visando à localização precisa do gene de resistência e sua futura clonagem posicional. Os marcadores Sct_187r2 e Sat_064 também poderão ser utilizados em programas de seleção assistida por marcadores moleculares visando à introgressão do gene de resistência do PI 587905 e à sua piramidação com outros genes de resistência à FAS em cultivares comerciais de soja.
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Análise da tolerância à ferrugem asiática em dialelo parcial com genitores transgênicos e convencionais de soja / Analysis of the tolerance to Asian rust in partial diallel with transgenic and conventional soybean parents

Felipe Maniero Nazato 14 January 2015 (has links)
Essa pesquisa buscou comparar as tecnologias transgênica (soja RR e manejo com glifosato) e convencional (soja e manejo convencionais) quanto à maior tolerância à ferrugem asiática (Phakopsora pachyrhizi) e obtenção de genótipos promissores para produtividade de grãos (PG) e tamanho das sementes (representado pelo peso de cem sementes, PCS). Foram avaliadas 200 progênies F2:5 e F2:6 oriundas de dois dialelos parciais 5 x 2, ambos com cinco genitores de alta produtividade de óleo (USP 70.108, USP 70.010, USP 70.113, USP 70.007 e USP 70.042) em cruzamentos com: (1) duas cultivares elites convencionais (BRS 133 e Conquista); (2) suas versões essencialmente derivadas transgênicas (BRS 245 RR e BRS Valiosa RR). Os experimentos envolveram: a) dois manejos com herbicidas, manejo convencional para soja convencional e manejo com glifosato para a soja RR; b) dois manejos de fungicidas, sendo um experimento com aplicações sucessivas de Opera & Nativo (O&N, para controle da ferrugem e das doenças de final de ciclo, DFC) e outro experimento com aplicações de Derosal para controle apenas das DFC. O efeito da ferrugem para cada genótipo foi expresso pela taxa de reação da ferrugem sobre a produtividade (FP) e o tamanho das sementes (FT), calculados pelas diferenças entre médias ajustadas de PG e PCS nos dois experimentos com fungicidas. As comparações foram feitas em análises de variância, testes de médias e de parâmetros de capacidade de combinação. O controle da ferrugem com fungicidas (O&N) resultou em maiores médias de PG e PCS. Houve grande variação entre os efeitos de capacidades geral e específica, com destaque dos genitores USP 70.108, USP 70.010 e BRS 133 para PG e FP. O genitor mais divergente e com dominância positiva para PG foi USP 70.042. As duas tecnologias foram numericamente semelhantes para tolerância à ferrugem (FP e FT). A tecnologia convencional apresentou a vantagem de ser estatisticamente mais produtiva (PG e PCS) do que a tecnologia transgênica. Por outro lado, a tecnologia transgênica tem a vantagem de ter uso mais fácil e menor custo de cultivo aos produtores. / This research aimed to compare the performance of transgenic (RR soybean and management with glyphosate) and conventional (conventional soybean and herbicides) technologies for tolerance to rust (Phakopsora pachyrhizi ) and obtaining promising genotypes for seed yield and size (represented by the weight of one hundred seeds, PCS). A total of 200 progenies were evaluated in F2:5 and F2:6 generations; these progenies were obtained in two partial diallel 5 x 2, both involving five parents with high oil yield (USP 70.108, USP 70.010, USP 70.113, USP 70.007 and USP 70.042) in crosses with: (1) two elites conventional cultivars (BRS 133 and Conquista); (2) their essentially derived transgenic versions (BRS 245 RR and BRS Valiosa RR). The experiments involved: a) two managements with herbicides: conventional management for conventional soybean and management based in glyphosate herbicide to RR soybean; b) two managements with fungicides: an experiment with successive applications of Opera & Native (O&N, fungicides that control rust and late season leaf diseases, DFC), and another experiment with Derosal applications (fungicide that controls only DFC). The effect of rust for each genotype was expressed by the rate of reaction to rust on seed yield (FP) and on seed size (FT) as calculated from the differences in seed yield (PG) and seed size (PCS) between adjusted means in the two experiments with different fungicides. The soybean genotypes were compared by analysis of variance, multiple comparisons and parameter estimation of combining ability. In general, the control of rust with fungicides (O&N) resulted in higher means of PG and PCS. There was great variation among the effects of general and specific combining abilities, with major outstanding of USP 70.108, USP 70.010, and BRS 133 parents for PG and FP. The parent USP 70.042 was the most divergent and showed positive dominance for PG. Both technologies were numerically similar for FP and FT. The conventional technology has the advantage to be statistically more productive (PG and PCS) than transgenic technology. However, the transgenic technology has the advantage to be easier to use and less expensive to soybean producers.
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Fungicidas no controle da ferrugem asiática e sua influência na qualidade de sementes de soja / Fungicide for controlling the asian rust and its influence on the quality of soybean seeds

Olsen, Danielli 16 February 2012 (has links)
Made available in DSpace on 2014-08-20T13:44:26Z (GMT). No. of bitstreams: 1 dissertacao_danielli_olsen.pdf: 683196 bytes, checksum: b6ecdfb44d970916b05ba6edacbc27ea (MD5) Previous issue date: 2012-02-16 / The chemical control is the main strategy for controlling the soybean asian rust. Thus, information about the efficiency of fungicides as well as the residual effect on seeds are needed to guide its correct use in the field. The aim of this work was to evaluate the efficiency of different active ingredients to control the asian rust, as well as their influence on the physiological and sanitary quality of soybean seeds. The experiment was conducted in Mafra, SC, in the 2010/2011 growing season, using the cultivars Syngenta 3358 RR and Nidera 6411 RR. The experimental design was randomized blocks with four replications of 14 treatments for the Syngenta cultivar and 15 treatments for the Nidera cultivar. The evaluated active ingredients were: tebuconazole (0,5 L p.c. ha-1), cyproconazole (0,3 L p.c. ha-1), azoxystrobin + cyproconazole (0,3 L p.c. ha-1) + Nimbus 0,5%v/v, pyraclostrobin + epoxiconazole (0,5 L p.c. ha-1) + Assist 0,5 L.ha-1, trifloxystrobin + tebuconazole (0,5 L p.c. ha-1) + Aureate 0,5 L.ha-1, picoxystrobin + cyproconazole (0,3 L p.c. ha-1) + Nimbus 0,45 L.ha-1, trifloxystrobin + cyproconazole (0,15 L p.c. ha-1) + Aureate 0,5 L.ha-1, azoxystrobin + tetraconazole (0,5 L p.c. ha-1) + Nimbus 0,5 L.ha-1, trifloxystrobin + prothioconazole (0,4 L p.c. ha-1) + Aureate 0,4 L.ha-1, pyraclostrobin + metconazole (0,5 L p.c. ha-1) + Assist 0,5 L.ha-1, pyraclostrobin + epoxiconazole (0,6 L p.c. ha-1) + Lanzar 0,3%v/v, azoxystrobin (0,35 L p.c. ha-1) + Assist 0,5%v/v, azoxystrobin + tebuconazole (0,5 L p.c. ha-1) + Assist 0,5%v/v, oxicarboxim (1,2 L p.c. ha-1) + Silwett 0,05%. The fungicides were applied at flowering (R2 stage) and at the beginning of the grain formation (R5.2 stage). It was evaluated: rust severity at seven and 14 days after the second fungicide application; yield (kg ha-1), thousand seed weight (g), germination (%), electrical conductivity (µS.cm-1.g-1), accelerated aging (%), and seed health, through the Blotter Test. The results indicate that the triazole fungicides combined with strobilurins are more effective in controlling the asian rust. Fungicides do not affect in the physiological and sanitary quality of seeds of both cultivars. / O controle químico é a principal estratégia de controle da ferrugem asiática da soja, assim informações sobre a eficiência dos fungicidas bem como o efeito residual nas sementes são necessárias para orientar sua correta utilização no campo. O objetivo do trabalho foi avaliar a eficiência de diferentes ingredientes ativos no controle da ferrugem asiática, bem como a sua influência na qualidade fisiológica e sanitária de sementes de soja. O experimento foi conduzido em Mafra, SC, na safra 2010/2011, utilizando-se as cultivares Syngenta 3358 RR e Nidera 6411 RR. O delineamento experimental foi o de blocos ao acaso com quatro repetições de 14 tratamentos para a cultivar Syngenta e 15 tratamentos para a cultivar Nidera. Os ingredientes ativos avaliados foram: tebuconazol (0,5 L p.c. ha-1), ciproconazol (0,3 L p.c. ha-1), azoxistrobina + ciproconazol (0,3 L p.c. ha-1) + Nimbus 0,5%v/v, piraclostrobina + epoxiconazol (0,5 L p.c. ha-1) + Assist 0,5 L.ha-1, trifloxistrobina + tebuconazol (0,5 L p.c. ha-1) + Áureo 0,5 L.ha-1, picoxistrobina + ciproconazol (0,3 L p.c. ha-1) + Nimbus 0,45 L.ha-1, trifloxistrobina + ciproconazol (0,15 L p.c. ha-1) + Áureo 0,5 L.ha-1, azoxistrobina + tetraconazol (0,5 L p.c. ha-1) + Nimbus 0,5 L.ha-1, trifloxistrobina + protioconazol (0,4 L p.c. ha-1) + Áureo 0,4 L.ha-1, piraclostrobina + metconazol (0,5 L p.c. ha-1) + Assist 0,5 L.ha-1, piraclostrobina + epoxiconazol (0,6 L p.c. ha-1) + Lanzar 0,3%v/v, azoxistrobina (0,35 L p.c. ha-1) + Assist 0,5%v/v, azoxistrobina + tebuconazol (0,5 L p.c. ha-1) + Assist 0,5%v/v, oxicarboxim (1,2 L p.c. ha-1) + Silwett 0,05%. Os fungicidas foram aplicados no florescimento (estádio R2) e no início da formação dos grãos (estádio R5.2). Foram avaliados: severidade da ferrugem aos sete e 14 dias após a segunda aplicação dos fungicidas; produtividade (Kg.ha-1), peso de mil sementes (g), germinação (%), condutividade elétrica (µS.cm-1.g-1), envelhecimento acelerado (%), e sanidade através do método do papel de filtro. Os resultados indicam que os fungicidas triazóis combinados com estrobilurinas são mais eficientes no controle da ferrugem asiática. Os fungicidas não afetam a qualidade fisiológica e sanitária das sementes de ambas as cultivares.
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Crescimento e produtividade da soja e progresso de ferrugem asiática em diferentes condições de disponibilidade de nitrogênio / Growth and yield of soybean rust and progress of asian rust in different conditions of nitrogen availability

Ramos, Juliano Perlin de 31 March 2014 (has links)
Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / The objective of this work was to determine the effect of mineral nitrogen fertilization rates on nodulation, plant growth, yield and the effect of nitrogen rates on the progress of Asian soybean rust (Phakopsora pachyrhizi Sydow) of two short cycle soybean cultivars. Experiments were carried out in greenhouse and in the field, in 2011/12 and 2012/13. In the greenhouse, plants were grown in sand and supplied with five nutrient solutions and also grown in a mixture of sand plus soil and supplied by six mineral nitrogen rates. In the field, plants were fertilized with six mineral nitrogen rates. For determinations of Asian soybean rust, experiments were doubled and Phakopsora pachyrhizi was inoculated. In all experiments, active nodules, growth, grain yield and plant N concentration was determined. In Asian soybean rust experiments, defoliation and the area under rust progress curve (AURPC) was determined. In the field, nitrogen rates increased plant growth only in 2011/12. Active nodules per plant decreased in all experiments. Grain yield was not affected by N rates in the field. In the greenhouse, nitrogen rates increased plant growth and the disease progress. In 2011/12 field experiment, a slight decrease of rust progress and a slight increase in yield was recorded. Mineral nitrogen fertilization can increase plant growth and grain yield under optimal supply of water and nutrients. However, under favorable environmental conditions for the Asian rust, the increase in grain yield by effect of high N rates might not be attained due to the damage caused by the disease. / O objetivo deste trabalho foi determinar o efeito de taxas de adubação nitrogenada sobre a nodulação, crescimento da planta, rendimento e progresso da ferrugem asiática (Phakopsora pachyrhizi Sydow) de duas cultivares de soja de ciclo curto. Os experimentos foram realizados em casa de vegetação e no campo, em 2011/12 e 2012/13. Na casa de vegetação, as plantas foram cultivadas em areia com cinco soluções nutritivas e também em uma mistura de areia mais solo com seis doses de nitrogênio mineral. No campo, as plantas foram adubadas com seis doses de nitrogênio mineral. Para as determinações de ferrugem asiática, os experimentos foram duplicados e o patógeno (Phakopsora pachyrhizi) foi inoculado. Em todos os experimentos foi determinado o número de nódulos ativos, o crescimento, a produção de grãos e a concentração de N na planta. Nos experimentos de ferrugem da soja, a desfolha e a área abaixo da curva de progresso da doença (AACPF) foram determinados. No campo, as doses de nitrogênio aumentaram o crescimento das plantas apenas em 2011/12. O número de nódulos ativos por planta diminuiu em todos os experimentos. O rendimento de grãos no campo não foi afetado pelas doses de N. Na casa de vegetação, as doses de nitrogênio aumentaram o crescimento das plantas e o progresso da doença. Em 2011/12 no experimento de campo, houve um pequeno decréscimo no progresso da ferrugem e um ligeiro aumento na produtividade. Concluiu-se que a adubação nitrogenada mineral pode aumentar o crescimento da planta e a produção de grãos em condições ideais de água e nutrientes. No entanto, sob condições ambientais favoráveis para a ferrugem asiática, o aumento da produção de grãos obtido pelo uso de altas doses de N pode ser anulado pelos danos causados pela doença. Em condições de campo, os efeitos do N sobre o rendimento de grãos são de pequena importância em ambas as cultivares.
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Caracterização epidemiológica da resistência parcial e análise da tolerância de genótipos de soja à ferrugem asiática / Epidemiological characterization of partial resistance and evaluation of tolerance to Soybean Asian Rust on soybean genotypes

Carneiro, Luciana Celeste 28 August 2007 (has links)
O objetivo deste trabalho foi avaliar a resistência parcial e a tolerância à ferrugem asiática, em sete cultivares comerciais e três linhagens de soja. Os ensaios foram conduzidos no município de Jataí, GO, no ano agrícola de 2005/2006. Ensaios distintos foram realizados para avaliação da resistência parcial e para avaliação da tolerância, todos repetidos em três épocas de plantio, a fim de se obter intensidade variável da doença em diferentes estádios fenológicos da cultura. Nos ensaios para avaliação da resistência parcial, o delineamento experimental foi o de blocos cazualizados com cinco repetições e cada parcela experimental foi composta por cinco linhas de seis metros de comprimento. A severidade da doença foi estimada em intervalos semanais, a partir do surgimento dos primeiros sintomas até a desfolha completa. Os dados foram analisados por meio de regressão não linear e o modelo logístico foi o que apresentou melhor ajuste. As curvas de progresso da doença para os cultivares EMGOPA-315, Luziânia, Pintado, Conquista, COODETEC-219 e para as linhagens 1, 2, e, 3 não apresentaram estabilização assintótica da severidade em função da desfolha precoce, ficando evidente apenas a fase exponencial de crescimento da doença. As epidemias apresentaram comportamento explosivo e foram muito semelhantes, demonstrando que esses genótipos foram igualmente susceptíveis ao patógeno. Os cultivares Tianá e EMGOPA-313 foram os únicos que apresentaram estabilização assintótica da severidade, em níveis muito abaixo de 1, o que evidenciou a presença de resistência parcial nesses cultivares. Nos ensaios para avaliação da tolerância, o delineamento experimental foi o de blocos casualizados com cinco repetições, com delineamento dos tratamentos em parcelas subdivididas. As parcelas (5 linhas de 12 m de comprimento) foram compostas pelos genótipos, e as subparcelas (5 linhas de 6 m de comprimento), pelo tratamento ou não com fungicida tebuconazole (0,5 L.ha-1) para controle da ferrugem. A severidade da doença foi estimada uma única vez e a tolerância foi avaliada pela análise estatística da diferença de produtividade, peso de mil grãos e de número de vagens e grãos por planta, entre subparcelas tratadas e não tratadas com fungicida, em cada época de plantio. Nenhum genótipo avaliado mostrou-se tolerante à ferrugem asiática da soja. / This work aimed the evaluation of partial resistance and tolerance to soybean asian rust on seven soybean genotypes and 3 lines. The research was conducted at Jataí, GO, during the growing season of 2005/2006. Experiments for partial resistance evaluation were carried out separately from experiments to evaluate tolerance, and in order to have different levels of disease severity, on different soybean growth stages, three trials for each experiment were carried out, each one with a different planting date during the season. Experiments for partial resistance evaluation were arranged on a randomized block design and each experimental unit was made by five soybean lines, 6 m long. The disease severity was estimate on week intervals from the first pustules appearance to the total defoliation. Analyses were done by non linear regression and the logistic model presented the best fitness to the observed data. The early defoliation on cultivars EMGOPA-315, Luziânia, Pintado, Conquista, COODETEC-219 and on lines 1, 2, e, 3 did not allowed the disease progress curves to reach asymptotical stabilization and for such genotypes, just the exponential part of the disease growth could be seen. Epidemics presented an explosive growth and the disease progress curves for such genotypes were similar, suggesting that they were similarly susceptible to the pathogen. The cultivars Tianá e E-313 were the only ones that presented asymptotical stabilization of disease and that happened on severity levels much smaller than 1, what was considered an evidence of partial resistance on those cultivars. Experiments conducted for tolerance evaluation were arranged in a split plot design with five replicates. The main plots (5 soybean rows, 12 m long) were composed by the soybean genotypes and the subplots (5 soybean rows, 6 m long) were those with or without fungicide (tebuconazole 500 mL.ha-1) application for rust control. Disease severity was estimate only once and tolerance was evaluated by the statistical analyses of difference of yield, thousand grain weight and pod and grain numbers, between treated and untreated subplots. None soybean genotypes analyzed presented tolerance to soybean asian rust.
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Virulencia de aislamientos de <i>Phakopsora pachyrhizi</i> Sydow & Sydow en soja (<i>Glycine max</i> L. Merr.) en Argentina

Lavilla, Miguel Ángel January 2013 (has links)
La soja (<i>Glycine max</i> L. Merr.) es actualmente, el principal cultivo agrícola de la zona pampeana y el más importante rubro de exportación en Argentina. La soja es afectada por diversas enfermedades, las cuales pueden reducir el rendimiento entre un 8 a un 10% con un máximo del 30%. Dentro de las diversas enfermedades que afectan al cultivo de soja se encuentran las denominadas Enfermedades de Fin de Ciclo (EFC) que aumentan su intensidad después del estado de desarrollo R3-4. En marzo de 2002, la roya asiática de la soja (RAS) causada por el patógeno biotrófico <i>Phakopsora pachyrhizi</i>, fue detectada por primera vez en la provincia de Misiones, incorporándose al complejo de EFC en Argentina, que por sus características distintivas de fácil propagación y de alta esporulación, en menos de 21 días llega a afectar el 90% del cultivo y puede reducir el rendimiento significativamente, convirtiéndola en la enfermedad más temidas por los productores de soja en el mundo. Esta tesis hace referencia sobre la virulencia de <i>P. pachyrhizi</i> en Argentina, mediante la recolección de poblaciones de uredinios y urediniosporas de roya en diferentes regiones del país, Cerro Azul (Misiones), Ledesma (Jujuy), Rosario (Santa Fe) y Pergamino (Buenos Aires) durante el ciclo 2011/2012. Para determinar la virulencia patogénica se utilizaron 16 variedades diferenciales (V.D.) de soja que presentan distintos genes de resistencia, ayudando a identificar la presencia de virulencia de <i>P. pachyrhizi</i> en Argentina. Los resultados de este trabajo han demostrado diferente virulencia de <i>P. pachyrhizi</i> en Argentina entre los cuatro aislamientos de <i>P. pachyrhizi</i> analizados. Diversos trabajos sugieren que el locus Rpp5 que se encuentra en la V.D. Shiranui (PI 200526) es el que más contribuyó para todos los caracteres de resistencia y que puede ser considerado como el principal factor para la resistencia a <i>P. pachyrhizi</i>. En esta experiencia se ha encontrado diferencia en la virulencia de los aislamientos en <i>P. pachyrhizi</i>, entre las diferentes provincias de Argentina, durante el año 2012. Ninguna de las Variedades Diferenciales (V.D.) fueron resistentes a los cuatro aislamientos analizados. La V.D. Shiranui (PI 200526) que contiene el gen Rpp5 presentó reacción de susceptibilidad frente al aislamiento de Pergamino (Buenos Aires). Las variedades PI 594767 A y PI 587855 de genes desconocidos, resistente a todos los aislamientos anteriores analizados en el país, resultaron ser susceptible al aislamiento de Cerro Azul (Misiones) y la V.D. PI 587855 también susceptible al aislamiento de Pergamino (Buenos Aires) en el año 2012.
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Efeito do aumento da concentração de co2 atmosférico sobre o oídio, a ferrugem e o desenvolvimento de plantas de soja

Lessin, Ricardo Contreira [UNESP] 18 August 2008 (has links) (PDF)
Made available in DSpace on 2014-06-11T19:28:36Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2008-08-18Bitstream added on 2014-06-13T19:37:27Z : No. of bitstreams: 1 lessin_rc_me_botfca.pdf: 518732 bytes, checksum: 7e4d555398ff650c409d95422bc6f7ea (MD5) / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) / Os níveis de concentração de CO2 atmosférico estão se elevando nas últimas décadas devido principalmente à queima de combustíveis fósseis. Essa alteração atmosférica, além de intensificar o fenômeno do efeito estufa, pode afetar o comportamento de algumas plantas e microrganismos de interesse agrícola. O CO2, por ser um componente básico da fotossíntese, em alta concentração, pode causar alterações na morfologia e nos processos fisiológicos das plantas, assim como na interação destas com fitopatógenos. Sendo assim, o presente estudo teve por objetivo avaliar o efeito da alta concentração de CO2 atmosférico na severidade do oídio, causado por Microsphaera diffusa, e da ferrugem asiática, causado por Phakopsora pachyrhizi, na soja e também em alguns fatores relacionados ao desenvolvimento da planta que podem exercer influência na doença, como o crescimento, peso da matéria seca e nodulação. Foram realizados três ensaios em estufas de topo aberto com (E+CO2) ou sem (E) injeção de CO2 e sem estufa (T), correspondendo às concentrações de, aproximadamente, 647 ppm, 474 ppm e 453 ppm, respectivamente. No primeiro ensaio, foram avaliadas características de desenvolvimento da planta; no segundo, a severidade da ferrugem asiática, que ocorreu de forma espontânea; e no terceiro, a severidade do oídio em quatro cultivares com diferentes níveis de resistência. As cultivares foram: FT-Estrela, altamente suscetível (AS); Embrapa 48, suscetível (S); FT-Cometa, moderadamente resistente (MR) e FT-5 (Formosa), resistente (R). Nos resultados obtidos, foi verificado um aumento significativo na severidade do oídio, no tratamento com injeção de CO2,em folhas primárias e na planta inteira das cultivares analisadas em conjunto, mas não houve alteração na expressão de resistência das cultivares. Para a ferrugem asiática, houve redução da severidade... / The concentration of atmospheric CO2 is increasing in recent decades, mainly due to burning of fossil fuels. This atmospheric change can intensify the phenomenon of the greenhouse effect, and can affect the behavior of important agricultural plants and microorganisms. The CO2, as a basic component of photosynthesis, in high concentrations, can cause changes in morphological and physiological processes of plants, as well as interaction with plant pathogens. Therefore, this study aimed to assess the effect of high concentrations of atmospheric CO2 on the severity of powdery mildew in soybean, caused by Microsphaera diffusa, and also in some characteristics related to the development of the plant that may influence the disease, such as growth, weight of dry matter and nodulation. Three trials were developed under open-top chambers with (E+CO2) or without (E) injection of CO2 and without greenhouse (T), with the approximate concentrations of 647 ppm, 474 ppm, and 453 ppm, respectively. On the first trial, growth characteristics were evaluated, on the second, the severity of rust, caused by Phakopsora pachyrhizi, which occurred spontaneously; on the third, the severity of powdery mildew on four cultivars with different levels of resistance: FT-Estrela, highly susceptible (AS); Embrapa 48, ...(Complete abstract click electronic access below)
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Photosynthetic performance in soybean leaves caused by Epoxiconazole + Pyraclostrobin and Acibenzolar-S-Methyl and Phakopsora pachyrhizi infection / Photosynthetic performance in soybean leaves caused by Epoxiconazole + Pyraclostrobin and Acibenzolar-S-Methyl and Phakopsora pachyrhizi infection

Barros, Aline Vieira de 16 February 2016 (has links)
Submitted by Marco Antônio de Ramos Chagas (mchagas@ufv.br) on 2018-01-22T17:24:08Z No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 1001213 bytes, checksum: 6e669d036943dcd0ba8454e8d4728199 (MD5) / Made available in DSpace on 2018-01-22T17:24:08Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 1001213 bytes, checksum: 6e669d036943dcd0ba8454e8d4728199 (MD5) Previous issue date: 2016-02-16 / A ferrugem asiática da soja (FAS), causada pelo fungo Phakopsora pachyrhizi, é uma das doenças foliares mais importantes que afetam a produção de soja em todo o mundo. Este estudo teve como objetivo investigar o desempenho fotossintético (trocas gasosas, imagens da fluorescência da clorofila (Chl) a e concentração de pigmentos fotossintéticos) de plantas de soja pulverizadas com Acibenzolar-S-Metil (ASM) e com o fungicida Epoxiconazol + Piraclostrobina (Epo + Pyr) e inoculadas com P. pachyrhizi. Os sintomas da FAS progrediram muito mais rapidamente nas folhas das plantas do tratamento controle (inoculadas com água) em comparação com os tratamentos ASM e Epo + Pyr. Em geral, os valores para os parâmetros de trocas gasosas taxa líquida de assimilação de carbono, condutância estomática, concentração interna de CO 2 e taxa de transpiração aumentaram para as plantas infectadas pulverizadas com ASM ou Epo + Pyr em relação às plantas do tratamento controle. Os valores para os parâmetros de fluorescência inicial, fluorescência máxima, eficiência quântica máxima do fotossistema II, rendimento quântico efetivo do fotossistema II Y (II) e rendimento quântico de dissipação de energia regulado Y (NPQ) foram mantidos sempre superiores para os tratamentos ASM e Epo + Pyr em comparação ao tratamento controle nos estágios mais avançados da infecção pelo fungo. Em contraste, os valores para o parâmetro de rendimento quântico de dissipação de energia não regulado (Y(NO) reduziu significativamente para os tratamentos ASM e Epo + Pyr. As curvas para Y(II) diminuíram enquanto que as curvas para Y(NPQ) e Y(NO) aumentaram para as plantas dos tratamentos controle, ASM e Epo + Pyr em função da densidade de fluxo de fótons fotossintéticos. As concentrações de clorofilas e de carotenóides aumentaram significativamente para as plantas infectadas dos tratamentos ASM e Epo + Pyr em comparação com as plantas do tratamento de controle. Em conclusão, os resultados do presente estudo demonstram que a aplicação de ASM ou Pyr + Epo em pantas de soja, mas especialmente do fungicida, contribuíram para reduzir os efeitos negativos causados pela infecção por P. pachyrhizi e permitiu a manutenção do desempenho fotossintético das plantas infectadas. / Asian soybean rust (ASR), caused by Phakopsora pachyrhizi, is one of the most important foliar diseases affecting soybean production worldwide. This study aimed to investigate the photosynthetic performance (leaf gas exchange, chlorophyll (Chl) a fluorescence images and photosynthetic pigment pools) of soybean plants sprayed with Acibenzolar-S-Methyl (ASM) and with the fungicide Epoxiconazole + Pyraclostrobin (Epo + Pyr) and further inoculated with P. pachyrhizi. The ASR symptoms progressed much faster on the leaves of plants from the control treatment (water spray) in comparison to the ASM and Epo +Pyr treatments. In general, the values for the leaf gas exchange parameters net carbon assimilation rate, stomatal conductance to water vapor, internal CO 2 concentration and transpiration rate increased for the infected plants sprayed with ASM or Epo +Pyr in comparison to plants from the control treatment. The values for the parameters initial fluorescence, maximal fluorescence, maximal photosystem II quantum efficiency, effective photosystem II quantum yield (Y(II)) and quantum yield of regulated energy dissipation (Y(NPQ)) were consistently higher for the ASM and Epo +Pyr treatments in comparison to the control treatment at advanced stages of fungal infection. By contrast, the values for the parameter quantum yield of non-regulated energy dissipation (Y(NO) were significantly lower for the ASM and Epo +Pyr treatments. The curves for Y(II) decreased while the curves for Y(NPQ) and Y(NO) increased for plants from the control, ASM and Epo +Pyr treatments as a function of the photosynthetic photon flux density. The concentrations of total Chl and carotenoids significantly increased for the infected plants from the ASM and Epo +Pyr treatments in comparison to plants from the control treatment. In conclusion, the results of the present study demonstrat that the spray of either soybean plants with Epo + Pyr or ASM, but especially the former, contributed to reduce the negative effects caused by P. pachyrhizi infection and allowed a good photosynthetic performance of the infected plants. / Dissertação liberada do sigilo em 17/01/2018 pelo Orientador Prof. Fabrício de Ávila Rodrigues. Autorização anexada ao Termo.
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Fertilização do solo na severidade da ferrugem asiática da soja / Soil fertility in the severity of asian soybean rust

Mochko, Ana Claudia Ruschel 15 July 2017 (has links)
Submitted by Marco Antônio de Ramos Chagas (mchagas@ufv.br) on 2018-01-23T11:38:43Z No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 697210 bytes, checksum: ae7d1ddf560696fc657cd4114f466886 (MD5) / Made available in DSpace on 2018-01-23T11:38:43Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 697210 bytes, checksum: ae7d1ddf560696fc657cd4114f466886 (MD5) Previous issue date: 2017-07-15 / A ferrugem asiática causada pelo fungo Phakopsora pachyrizi, é uma das principais doenças da soja. Em condições favoráveis, a doença pode ser um fator limitante para a produção. Atualmente, o controle da doença é realizado por meio da aplicação de fungicidas, vazio sanitário, plantio de cultivares precoces e adubação equilibrada. Dessa forma, o objetivo deste trabalho foi avaliar o efeito do incremento da adubação fosfatada, potássica e nitrogenada sobre a ferrugem asiática da soja. Foram conduzidos 2 experimentos em condições de campo, com delineamento de blocos ao acaso, com 6 doses de N, P e K (0, 25, 50, 100, 200 e 400 mg/dm3) e 2 experimentos em vasos sobre condições de campo, sendo um deles com 6 doses de N, P e K (0, 50, 100, 200, 400 e 800 mg/dm3), e o outro com 4 doses de P e K (0, 100, 200 e 400 mg/dm3) e 4 doses de N (0, 50, 100 e 200 mg/dm3). A aplicação de fungicida (Azoxistrobina + Ciproconazol) foi realizada aos 45, 60 e 75 dias após a emergência (DAE) nos tratamentos com controle químico. Foram avaliados severidade, porcentagem de controle, área abaixo da curva de progresso da doença (AACPD), taxa de progresso da doença (r), produtividade e teor de clorofila a e b. A severidade, a AACPD e a taxa de progresso da doença reduziram conforme o incremento na adubação fosfatada e potássica e a aplicação de fungicida, enquanto a porcentagem de controle e a produtividade aumentaram. Os teores de clorofila a e b também apresentaram maiores valores conforme o incremento na dose de P e K. No experimento de N, o incremento da adubação nitrogenada aumentou a severidade, a AACPD, a taxa de progresso da doença, os teores de clorofila a e b, e a produtividade. Com bases nos dados obtidos, concluiu-se que a adubação equilibrada com fósforo e potássio e a aplicação de fungicida são estratégias que podem ser implementadas no manejo integrado, possibilitando maior eficiência no controle da ferrugem asiática da soja, enquanto o nitrogênio apesar de aumentar produtividade, aumenta a severidade da ferrugem da soja. / The Asian rust caused by the fungus Phakopsora pachyrizi, is one of the major diseases of soybean. Under favorable conditions, disease can be a limiting factor for production. Currently, the control of the disease is carried out through the application of fungicides, sanitary void, planting of early cultivars and balanced fertilization. Thus, the objective of this work is to evaluate the effect of phosphate, potassium and nitrogen fertilization on an asian soybean rust. Two trials were received in field conditions, with a randomized block design, with 6 doses of N, P and K (0, 25, 50, 100, 200 and 400 mg / dm3) and 2 potting experiments on field conditions (0, 100, 200, 400 and 800 mg / dm3), the other with 4 doses of P and K (0, 100, 200 and 400 mg / dm3) and 4 doses of N (0, 50, 100 and 200 mg / dm3). The application of fungicide (Azoxystrobin + Ciproconazole) was performed at 45, 60 and 75 days after emergence (DAE) in the treatments with chemical control. The severity, percentage of control, area below the disease progress curve (AACPD), rate of disease progression (r), productivity and chlorophyll content a and b were evaluated. The severity, AACPD and rate of progress of the disease reduced as the increase in phosphate and potassium fertilization and a fungicide application, while a percentage of control and a production increased. Nitrogen testing, nitrogen fertilization increased severity, AACPD, rates of disease progression, chlorophyll content and yield, and yield. Based on the data obtained, it was concluded that it is a balanced fertilization with phosphorus and potassium and application of fungicide are structures that can be implemented without integrated management, allowing greater efficiency in the control of soybean asian rust, while nitrogen, despite increasing the productivity, increase the severity of soybean rust.

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