CAPES / Para traçar estratégias visando a conservação e uso dos recursos genéticos de espécies arbóreas, como a jaboticabeira, é essencial se fazer a caracterização. Na região Sudoeste do Paraná existem fragmentos florestais contendo jaboticabeiras nativas (Plinia cauliflora), com variabilidade e potencialidade para pomares comerciais ou programas de melhoramento genético. Como a diversidade genética representa o potencial de uma população para produzir diferentes genótipos, poder-se-ia iniciar tal caracterização em um destes fragmentos. O objetivo foi caracterizar frutos de jaboticabeiras (P. caulifora) de fragmento florestal mantido em Clevelândia-PR, quanto a presença de variabilidade fenotípica, buscando-se identificar aquelas denominadas superiores para seleção como futuro cultivar ou genitor masculino, bem como, estimar a divergência genética entre eles, como ferramenta complementar. Além disso, verificar a regeneração e os padrões de distribuição espacial da espécie. Para a realização do estudo foi delimitada parcela de um hectare (10.000 m²), com todos os indivíduos identificados, mapeados, com sistema local de coordenadas, e mensurada altura e diâmetro. Foram caracterizados frutos quanto as características sensoriais e bioquímicas, em dois anos, 70 genótipos em 2013 e 56 em 2014; destes, 33 genótipos nos dois anos. Como critério de pre-seleção foi adotada a escolha de 20% dos genótipos que apresentaram a maior frequência de superioridade nas características avaliadas dos frutos. Foi analisada a divergência genética entre 33 genótipos por ano. O padrão de distribuição e associação espacial foi avaliado pela função K de Ripley. Pela primeira vez classificou-se os estágios ontogenéticos de jaboticabeira, segundo a altura da planta em: plântulas (0,01 a 0,99 m), juvenis (1,0 a 4,99 m), imaturos (> 5,0 m, não reprodutivos), adultos (reprodutivos) em ambiente florestal. Também foi descrita pela primeira vez a ocorrência natural de plântulas justapostas, indicando a poliembrionia. O número de regenerantes identificados na população (plântulas: n = 2163; juvenis: n = 330; imaturos: n = 59) foi muito maior que o número de adultos (n = 132). A espécie apresentou estrutura de tamanho em padrão J-invertido, com alta concentração de regenerantes. A distribuição da regeneração ocorre por padrão agregado e há dependência das plântulas em relação aos adultos, devido dispersão das sementes à curtas distâncias e emergência de plântulas próximo às matrizes. A regeneração de jaboticabeira é suficiente para manter a espécie em longo prazo nesta população, a qual pode servir como referência do sucesso de regeneração para outros estudos desta importante espécie frutífera da Floresta Ombrófila Mista. Foram préselecionadas as jaboticabeiras 7, 42, 43, 47, 54, 91, 97, 104, 105, 118, 134, 153, 154, 157, 163, 169, 177, 186, 212, J7-01 e J7-02, sendo a 16 e 194 as únicas que já podem ser selecionadas pelas características de superioridade entre ambos ciclos. Recomenda-se a realização de hibridação entre os genótipos 79 e 119 e, 96 com 148. A qualidade das frutas analisadas demonstrou potencialidade para uso como dupla finalidade servindo tanto para mercado in natura ou processamento. / To design strategies for the conservation and use of genetic resources of tree species such as jaboticaba tree, it is essential to make the characterization. In southwestern Paraná region, there are several forest fragments containing native jaboticaba tree (Plinia cauliflora), whose materials have broad potential for commercial orchards or breeding programs. As is the potential genetic diversity of a population to produce different genotypes, it would be able to start in such a characterization one of these fragments. The aim was to characterize fruits of jaboticaba tree (P. caulifora) of forest fragment kept in Clevelândia - PR for the presence of phenotypic variability, seeking to identify those superiors named for future selection as farming or male parent, as well as estimate genetic divergence between them, as a complementary tool for this purpose. Also, verify the regeneration and spatial distribution of the species. For the study was defined portion of a hectare (10.000 m²), with all individuals identified, mapped, with local coordinate system, and measured height and diameter. Fruits were characterized by sensory and biochemical characteristics in two years, 70 genotypes at 2013 and 56 at 2014, and of these 33 genotypes in both years. As a pre-selection criteria was adopted the choice of 20% of the genotypes that showed the highest frequency of superiority in the evaluated characteristics of the fruit. Genetic divergence among 33 genotypes per year was analyzed. The distribution pattern and spatial association was evaluated by Ripley's K function. It was classified for the first time the following ontogenetic stages of jaboticaba tree, by plant height, seedling (from 0.01 to 0.99 m), juvenile (1.0 to 4.99 m), immature (> 5.0 m, non-reproductive), adult (reproductive). It was also have been describe for the first time the naturally occurring juxtaposed seedlings, indicating polyembryony. The number of regenerating identified in the population (seedlings: n = 2163; juveniles: n = 330; immature: n = 59) was much larger than the number of adults (n = 132). The species showed reverse J-shaped size structure standard, with high concentration of regenerating. The regeneration distribution occurs in aggregate pattern and there is seedling-adult dependence, due seed dispersal and seedling emergence closest to mothers. The jaboticaba tree regeneration is sufficient to maintain the species for long term in this population, which should serve as reference to regeneration success for other studies of this important fruiting species from Ombrofile Mixed Forests. Has been pre-selected the jaboticaba trees 7, 42, 43, 47, 54, 91, 97, 104, 105, 118, 134, 153, 154, 157, 163, 169, 177, 186, 212, J7-01 and J7- 02, and 16 and 194 the ones that can now be selected by the superior characteristics of both cycles. It was recommended to carry out hybridization between genotypes 79 and 119, and 96 to 148. The quality of fruit analyzed showed potential for use as a dual purpose serving both in natura market or processing.

CAPES / A jabuticabeira apresenta inúmeras potencialidades para sua exploração comercial. Porém, muito pouco é utilizado. Fato que demonstra necessidade de estudos que possibilitem entender seu comportamento de crescimento ao longo do ano, bem como, se a mesma apresenta tolerância a geadas. Para que assim possa se estabelecer estratégias de manejo para seu cultivo em pomar. Aliado a isso, têm-se o fato do longo período juvenil que limita seu uso. Porém, muitas espécies apresentam em suas folhas compostos que caracterizam-nas como compostos funcionais, permitindo sua comercialização. Caso a folha da jabuticabeira apresente também tais compostos nutracêuticos, esta pode se tornar fonte de renda alternativa até que a planta entre em produção. Os objetivos deste trabalho foram analisar o comportamento do crescimento, a ocorrência de florescimento e frutificação, bem como, a tolerância a geadas de genótipos de jabuticabeira presentes na coleção de Fruteiras Nativas da UTFPR - Câmpus Dois Vizinhos. Associado as análises de crescimento fez-se avaliação da divergência genética entre tais genótipos, verificando o comportamento adaptativo em condição de pomar por meio de análises de adaptabilidade e estabilidade com base nas medidas de crescimento de caule e brotações; estimando os coeficientes de repetibilidade dos caracteres de comprimento do caule e das brotações primárias, além de determinar o número mínimo de avaliações capaz de proporcionar níveis de certeza da predição do valor real destes indivíduos. Também determinou-se a divergência genética entre os genótipos quanto a atividade antioxidante de folhas pelos métodos de DPPH e ABTS, bem como, pela determinação dos compostos fenólicos totais. Os genótipos analisados foram implantados a campo em 2009. A resposta de crescimento nos três ciclos foi variável entre os meses e genótipos avaliados, o que pode dificultar o manejo do pomar caso não se utilize clones. Os genótipos ‘Silvestre’ e ‘Açú’ apresentaram maior largura e área foliar em comparação aos demais genótipos, porém tal comportamento não favoreceu para maior crescimento caulinar e das brotações primárias. Os incrementos foliares na maioria dos genótipos, ocorreram no outono para largura da folha, primavera para comprimento e área foliar, apesar do inverno surgir também com genótipos apresentando superioridade para largura e área foliar. A maioria das jabuticabeiras encontram-se em fase juvenil, com apenas quatro iniciando-se seu período de transição entre a fase vegetativa e reprodutiva. A tolerância a geada foi verificada em 26 famílias de jabuticabeira das 29 presentes na coleção. a diversidade entre os genótipos foi alterando-se conforme o passar do tempo, pois em cada ciclo houve a formação de grupos diferentes pelos métodos utilizados. Os métodos testados para adaptabilidade e estabilidade do comportamento de crescimento das jabuticabeiras não apresentaram mesmo padrão nos resultados. O número de medições necessárias para predizer o valor real dos genótipos com base na variáveis avaliadas foi de aproximadamente uma para o comprimento do caule e quatro para o das brotações com base no método de componentes principais de covariância com 90% de probabilidade. A atividade antioxidante dos extratos das folhas dos genótipos de jabuticabeiras demonstraram-se altas quando comparadas a outras espécies pelos métodos de DPPH e ABTS, bem como, a quantidade de compostos fenólicos totais. O genótipo ‘Silvestre’ e ‘IAPAR’ foram os que apresentaram maior atividade antioxidante nas folhas. Porém, a divergência genética entre os genótipos de jabuticabeira da coleção de Fruteiras Nativas da UTFPR - Câmpus Dois Vizinhos em relação a atividade antioxidante de folhas, demonstrou que estas possuem grande homogeneidade entre os mesmos e a baixa divergência entre eles. Todavia, recomenda-se como possíveis cruzamentos o uso como genitores, os genótipos José 4, IAPAR 4 e Fernando Xavier. / The jabuticaba tree has great potential for commercial exploitation. However, its is very little used. This fact shows to be necessary to do studies that allow understand their growth behavior during the year and, if it is tolerant to frost. So that it can establish management strategies for cultivation in orchard. Other point, it is the fact that the long juvenile period of jabuticaba tree limits its use. However, many species have compound leaves that characterize them as functional compounds, what to posible its commercialization. If the leaf jabuticaba tree also present such nutraceutical compounds, this it may become an alternative source of income until the plant to start its yield. The objectives of this study were to analyze the growth behavior, the occurrence of flowering and fruit set, and the frost tolerance of jabuticaba tree genotypes present in the collection of Native Fruit from UTFPR – Câmpus Dois Vizinhos. Associated growth analysis was made evaluation of genetic divergence among these genotypes, checking the adaptive behavior in orchard condition through adaptability and stability analysis based on growth measures to stem and shoots; estimating the repeatability coefficient of stem length of characters and primary shoots, and determine the minimum number of evaluations able to provide certain levels of prediction of the actual value of these individuals. Also determined the genetic divergence among genotypes as the leaves of antioxidant activity by DPPH and ABTS methods, as well as the determination of total phenolics. The genotypes studied were put in orchard in 2009. The growth response in the three cycles was variable between months and genotypes, what it can be difficult the practices in the orchard if it do not use clones. Genotypes 'Silvestre' and 'Açú' showed greater width and leaf area compared with other genotypes, but such behavior is not favored for increased stem growth and primary shoots. Foliar increments in most genotypes occurred in the fall for leaf width, spring for length and leaf area, despite the winter also arise with genotypes, it showed superiority to width and leaf area. Most jabuticabas trees were juvenile stage with only four starting at its transition between the vegetative and reproductive phase. Tolerance to frost was observed in 26 families jabuticabeira of the 29 present in the collection. The diversity among the genotypes was to change with the time, already in each cycle, there was the formation of different groups by the methods used. The methods tested for adaptability and stability of the jabuticaba tree growth behavior did not show the same pattern in the results. The number of measurements needed to predict the actual value of genotypes based on variables evaluated was approximately one to the stem length and four for the shoots based on the method of main components of covariance with 90% probability. he antioxidant activity of the extracts of leaves of jabuticaba tree genotypes were demonstrated high when compared to other species by methods DPPH and ABTS, as well as the amount of phenolic compounds. Genotype 'Silvestre' and 'IAPAR' showed the highest antioxidant activity in the leaves. However, the genetic divergence among genotypes jabuticaba tree from collection of Native Fruit trees at UTFPR - Câmpus Dois Vizinhos for antioxidant activity leaves showed that they have great homogeneity among them and the low divergence. However, it is recommended as possible hybridization the use as parents, José 4, IAPAR 4 and Fernando Xavier genotypes.

Orientadores: Anete Pereira de Souza, Luciana Rossini Pinto / Dissertação (mestrado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Biologia / Made available in DSpace on 2018-08-06T10:12:59Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Teixeira_LauraHelenaMarcon_M.pdf: 776155 bytes, checksum: d0c316ee167c455455a616d2024d8eea (MD5) Previous issue date: 2006 / Resumo: A cana-de-açúcar (Saccharum spp.) está entre as espécies de maior importância econômica no mundo, constituindo uma das principais fontes de produção de açúcar e álcool. Apesar de o Brasil ocupar posição de destaque, como o maior produtor mundial, os níveis de produtividade são considerados baixos. A obtenção de novas variedades de cana-de-açúcar, mais produtivas e resistentes a pragas e doenças, é um processo que consome vários anos até o lançamento para o plantio comercial. O desenvolvimento de mapas de ligação pode contribuir significativamente para os programas de melhoramento, principalmente na localização de genes associados a características agronômicas de interesse. Os bancos de dados de seqüências expressas (ESTs-database) oferecem uma oportunidade para a construção de mapas funcionais, os quais servem de base para a estratégia de genes candidatos (Candidate-gene approach). O projeto de seqüenciamento de ESTs (SUCEST) do programa Genoma da FAPESP já identificou cerca de 40 mil clusters que representam os genes de cana-de-açúcar. Deste modo, o mapeamento de ESTs pode ser conduzido pela análise do polimorfismo no comprimento de restrição (RFLPs) utilizando os ESTs como sondas de hibridização. Tendo em vista os avanços que serão alcançados no melhoramento genético da cana-de-açúcar com a exploração das informações contidas nos bancos de dados de ESTs, este projeto teve como objetivo mapear ESTs relacionados a genes de interesse em cana-de-açúcar, utilizando-os como sondas em ensaios de RFLP em uma progênie derivada do cruzamento entre duas variedades précomerciais de cana-de-açúcar. Assim é importante ressaltar que o presente projeto complementa um programa de mapeamento genético molecular de duas variedades pré-comerciais de cana-de-açúcar, e outro, de mapeamento de QTL¿s associados a características de interesse agronômico, utilizando como marcadores as seqüências produzidas pelo projeto SUCEST / Abstract: Sugarcane (Saccharum spp.) is the species that has the greatest economic importance in the world, as it is one of the main sources of sugar and alcohol production. Although Brazil is the biggest producer of this crop - participating with 25% of world production, the productivity levels are considered low. The acquisition of new sugarcane varieties, which are more productive and resistant to plagues and illnesses, is a lengthy process that takes years until the launching of the commercial crops. Linking map development can contribute significantly towards improvement programs, mainly in the localization of genes associated to the agronomical traits of interest. The expressed sequence tag (ESTs) database offers a chance for the construction of functional maps, which serve as a base for the Candidate-gene approach. The EST sequence project (SUCEST) of the FAPESP Genome program has already identified about forty thousand clusters that represent sugarcane genes. In this way, EST mapping can be led by the restriction fragment length polimorfism (RFLPs) analysis using the ESTs as hibridization probes. In view of the advances that will be reached in sugarcane genetic improvement with the exploration of the information contained in the EST database, the aim of this project is to map ESTs related to sugarcane interest genes using them as probes in the RFLP assays in a lineage derived from the crossing between two sugarcane commercial crosses. The present project complements a molecular genetic mapping program; and another QTL mapping, associates the agronomics traits, using the sequences produced for the SUCEST project as markers / Mestrado / Genetica Vegetal e Melhoramento / Mestre em Genética e Biologia Molecular

Orientadores: Claudio Lopes de Souza Junior, Anete Pereira de Souza / Tese (doutorado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Biologia / Made available in DSpace on 2018-08-06T11:28:57Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Lima_MilenadeLunaAlves_D.pdf: 1291219 bytes, checksum: a3a078e58517d0d64e9051437ce18432 (MD5) Previous issue date: 2006 / Resumo: A maior parte dos caracteres de importância agronômica e econômica do milho estão sob o controle de diversos locos gênicos, denominados locos de caracteres quantitativos (QTL). A possibilidade do uso de marcadores moleculares e o aperfeiçoamento dos modelos estatístico-genéticos possibilitaram o mapeamento desses locos gênicos que afetam tais caracteres. Pouco enfoque no estudo de mapeamento de QTL foi dado em populações derivadas do germoplasma do milho tropical, o qual possui uma base genética ampla com maior diversidade do que o germoplasma temperado. Da mesma forma, pouco se conhece sobre as interações dos QTL nos diferentes ambientes (QTL X E). Duzentos e cinqüenta e seis progênies F2:3, derivadas do cruzamento de duas linhagens de milho tropical, foram avaliadas em cinco ambientes. O mapa genético foi desenvolvido com 139 marcadores microssatélites, utilizando o programa MAPMAKER/EXP versão 3.0b. As análises de mapeamento de QTL e a detecção da interação QTL X E foram realizadas utilizando o procedimento JZmapQTL do programa Windows QTL-Cartographer versão 2.5, que se baseia na análise de mapeamento em ambientes múltiplos (mCIM). A extensão total do mapa genético foi de 1.858,61 cM com intervalo médio entre marcadores de 13,47 cM. Dezesseis QTL foram mapeados para produção de grãos, oito para espiga por planta, seis para acamamento, seis para altura de planta, nove para altura de espiga e dois para número de folhas. Os efeitos genéticos dos QTL mapeados apresentaram variação em sinal e magnitude, demonstrando que cada QTL contribui de forma particular para a expressão dos caracteres. A maioria destes QTL apresentou ação gênica sobredominante, e muitos deles também apresentaram significante interação QTL X E. Esses resultados forneceram dados para uma melhor compreensão da arquitetura genética do genoma do milho tropical. Estas informações podem ser utilizadas em programas de seleção assistida dessa espécie, utilizando marcadores moleculares, gerando mais eficiência nos programas brasileiros de melhoramento / Abstract: Most of important agricultural and economical traits in maize are under the control of several gene loci, named quantitative trait loci (QTL). The possibility of using molecular markers and the statistic-genetic models made possible the mapping of these gene loci that affect such traits. Little focus has been given to QTL mapping study in populations derived from tropical maize germplasm, which has a broad genetic base with greater variability than temperate maize germplasm. Also, not much is known about the interaction of QTL in various environments (QTL X E). Two-hundred and fifty-six F2:3 progenies, derived from a crossing between two tropical maize inbred lines, were evaluated in five environments. The genetic map was developed with 139 microsatellite markers, using the software MAPMAKER/EXP version 3.0b. The analyses of QTL mapping and the detection of QTL X E interaction were performed using the Windows QTL-Cartographer version 2.5, JZmapQTL procedure, which is based on multiple-environment joint analysis (mCIM). The genetic map spanned 1,858.61 cM in length with an internal average of 13.47 cM between markers. Sixteen QTL were mapped for grain yield, eight for ears per plant, six for plant lodging, six for plant height, nine for ear height and two for number of leaves. The genetic effects of the mapped QTL presented varied signal and magnitude, displaying that each QTL contributes in a particular way for trait expression. Most of these QTL displayed gene action overdominance, many of them with significant QTL X E interaction detected. These results provide data for a better comprehension of genetic architecture on tropical maize genome. This information can be used in the marker-breeding selection of this species, leading more efficiency to Brazilian breeding programs / Doutorado / Genetica Vegetal e Melhoramento / Doutor em Genetica e Biologia Molecular

Orientador: Paulo Yoshio Kageyama / Tese (doutorado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Biologia / Made available in DSpace on 2018-08-09T02:11:20Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Rocha_DulceMariaSucenada_D.pdf: 5411414 bytes, checksum: 039b3f3595695af930696a184ea4e0a4 (MD5) Previous issue date: 2006 / Resumo: Este trabalho utilizou marcadores moleculares do tipo RAPD e caracteres morfológicos para estudar a variação encontrada dentro de P. emargiantus sensu Lewis (Fabaceae, Papilionoideae, Dipteryxeae). O objetivo foi verificar se o dimorfismo observado dentro deste taxon pode ser interpretado como variação dentro de uma mesma espécie ou se é indicativo de que P. emarginatus sensu Lewis engloba mais de uma entidade taxonômica, e neste caso, qual a relação entre cada uma dessas entidades bem como qual a melhor forma de nomeá-las. Lewis em uma publicação sobre Legumes da Bahia, considerou P. pubescens (Benth.) Benth. e P. polygalaeflorus (Benth.) Benth. Como sinônimos de P. emarginatus Vog. e, desde então, vêm sendo consideradas como tais em vários bancos de dados botânicos. Entretanto, P.emarginatus, como proposto por Lewis, é uma espécie dimórfica com indivíduos de flores róseas, folhas pubescentes e com folíolos de ápice levemente retuso e indivíduos de flores roxas, folhas glabras e com folíolos de ápice fortemente emarginado. Não foram encontradas populações mistas contendo indivíduos das duas morfos (rósea e roxa) de P. emarginatus sensu Lewis. Os resultados obtidos, tanto para dados moleculares como para os morfológicos são concordantes e separam as duas formas (rósea e roxa) de P.emarginatus sensu Lewis. A análise molecular mostrou que 74% da variância encontrada é explicada pela diferença entre as formas rósea e roxa. A análise canônica discriminante empregada para analisar as diferenças entre as formas baseado em dados morfológicos, permite separar as duas formas (r=0,963 p<0,0001). As análises anteriores, juntamente com os fototipos dos três taxa, permitiram concluir que P. polygalaeflorus é sinônimo de P. emarginatus Vog. e P.pubescens deve ser mantida como espécie distinta / Abstract: RAPD markers and morphological characters were employed in order to study the variation observed in Pterodon emarginatus sensu Lewis (Fabaceae, Papilionoideae, Dipteryxeae). The objective was to verify if the dimorphism observed in this taxon could be interpreted as variation within a species or if it indicates that P. emarginatus sensu Lewis contains more than one taxonomical entity and in this case, what is the relationship of them and how would be the best way to denominate them. In a publication about the legume species of Bahia (Brazil), Lewis has considered both P. pubescens (Benth.) Benth. and P. polygalaeflorus (Benth.) Benth. as synonyms of P. emarginatus Vog.. Since then, these two species have been treated as synonyms of P. emarginatus in many botanical databanks. However, P.emarginatus as proposed by Lewis, is a dimorphic species presenting individuals with pink flowers, pubescent leaves, and retuse folioles apex as well as plants with purple (violet) flowers, glabrous leaves and strong emarginate folioles apex. There is no mixed population of the two morphs (pink and violet) of P.emarginatus sensu Lewis in the field. The results of the AMOVA for RAPD markers showed that 74% of the observed variance was due to the difference between morphs pink and violet. The canonical discriminant analysis for morphological data agrees with molecular data showing a good separation of the two morphs (r= 0,963 p<0,0001). Those analyses together with the phototypes for the three taxa under study indicate that P.polygalaeflorus is a synonym of P.emarginatus and P.pubescens should be maintained as a separate species / Doutorado / Biologia Vegetal / Doutor em Biologia Vegetal

O aspartato é o precursor comum dos aminoácidos essenciais lisina, treonina, metionina e isoleucina. Devido à deficiência em lisina, a via metabólica do ácido aspártico tem sido estudada em cereais e os resultados obtidos indicaram a importância da aspartato quinase (AK), da homoserina desidrogenase (HSDH) e da dihidrodipicolinato sintase (DHDPS) como enzimas chave na regulação da síntese de lisina. Considerando-se a importância do milho e da quinoa como fontes de proteínas para humanos e animais, os objetivos deste trabalho foram: i) estudar as enzimas AK e HSDH nas sementes dos mutantes B77xB79o5; B37o7; W22o10, W22o11 e W22o13 e de seus respectivos tipos selvagens; ii) caracterizar a enzima DHDPS e analisar a composição de aminoácidos solúveis e incorporados nas proteínas das sementes dos mutantes Oh43o1, Oh43o2, Oh43fl1, Oh43fl2 e no respectivo tipo selvagem; iii) estudar nas sementes as enzimas AK, HSDH e DHDPS e alguns aspectos envolvidos na assimilação de nitrogênio e o perfil de aminoácidos de quinoa. Quando os mutantes B77xB79o5; B37o7; W22o10, W22o11 e W22o13 foram estudados, as análises demonstraram importantes variações nas atividades da AK e da HSDH entre os genótipos quando comparados com os respectivos tipos selvagens. A atividade da DHDPS foi fortemente inibida por lisina e não foram observadas variações significativas entre os genótipos Oh43o1, Oh43o2, Oh43fl1 e Oh43fl2, quando comparados com o genótipo Oh43+. A composição de aminoácidos revelou as maiores concentrações de lisina solúvel e incorporada em proteínas no mutante Oh43o2. Os estudos com quinoa demonstraram a presença de pelo menos duas isoenzimas da AK, uma sensível à inibição por lisina e a outra por treonina, duas isoenzimas da HSDH, uma resistente e a outra sensível à inibição por treonina e uma isoenzima da DHDPS sensível à inibição por lisina. As sementes de quinoa também apresentaram altas concentrações de lisina solúvel e incorporada em proteínas. / Aspartate is the common precursor of the essential amino acids lysine, threonine, methionine and isoleucine. Due to the deficiency in lysine, the aspartate metabolic pathway has been studied in cereal crops and the results obtained have indicated the importance of aspartate kinase (AK), homoserine dehydrogenase (HSDH) and dihydrodipicolinate synthase (DHDPS) as the key enzymes involved in the synthesis of lysine. Considering the importance of maize and quinoa as sources of protein for humans and animals, the objectives of this work were: i) to study the enzymes AK and HSDH in the seeds of the maize mutants B77xB79o5; B37o7; W22o10, W22o11 and W22o13 and their respective wild type; II) to characterize the enzyme DHDPS and to analyze the composition of soluble and amino acids incorporated into proteins in the seeds of the maize mutants Oh43o1, Oh43o2, Oh43fl1 and Oh43fl2 and the wild type OH43+; iii) to study the enzymes AK, HSDH, DHDPS in quinoa seeds and some aspects involved in nitrogen assimilation and amino acids profile. When the mutants B77xB79o5; B37o7: W22o10, W22o11 and W22o13 were studied, the analysis revealed important variations on AK and HSDH activities among the genotypes when compared to their respective wild type. The results indicated that DHDPS was strongly inhibited by lysine, and that there was not significant variation among the mutants Oh43o1, Oh43o2, Oh43fl1 and Oh43fl2 when compared to the wild type. The amino acids composition revealed high concentrations of lysine in the soluble form and incorporated into protein in the Oh43o2 mutant. The study of quinoa seeds allowed the identification of at least two AK isoenzymes, one sensitive to lysine inhibition and another sensitive to threonine, two HSDH isoenzymes, one resistant and another sensitive to threonine inhibition and one DHDPS isoenzyme sensitive to lysine inhibition. Quinoa also exhibited high concentration of soluble lysine and lysine incorporated into protein.

Orientadores: Anete Pereira de Souza, Maria Imaculada Zucchi / Tese (doutorado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Biologia / Made available in DSpace on 2018-08-24T01:07:14Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Mori_GustavoMaruyama_D.pdf: 12793055 bytes, checksum: 6364bf6e873c229003959f7098e256c7 (MD5) Previous issue date: 2013 / Resumo: O resumo poderá ser visualizado no texto completo da tese digital / Abstract: The complete abstract is available with the full electronic document / Doutorado / Genetica Vegetal e Melhoramento / Doutor em Genetica e Biologia Molecular

Pattern formation is the process by which undifferentiated cells divide and differentiate to generate complex tissues and organs. In plants, pattern formation begins in embryogenesis and continues post-embryonically with the function of the meristems. microRNAs (miRNAs), which are small regulatory RNAs that repress gene expression, are involved in a variety of patterning processes in plants, including the formation and function of the meristems and establishment of polarity. For example, regulation of the class III HOMEODOMAIN-LEUCINE ZIPPER (HD-ZIP III) transcription factors by miR165/6 is not only involved in the formation and function of the meristems, but also in polarity establishment in the leaf, and in axial patterning during embryogenesis. To gain a better understanding of the role of miRNAs in embryonic patterning, I investigated the tissue-specific functions of the miRNA biogenesis protein SERRATE (SE), which is required for the regulation of the HD-ZIP IIIs via miR165/6. By expressing SE in various domains in se-5 null mutant embryos, I revealed that although SE is expressed throughout the embryonic body, tissue-specific expression of SE from either the upper or lower tier of the embryo is sufficient for correct patterning. This observation suggests a SE-dependent non-cell autonomous and bi-directional mechanism that influences patterning in Arabidopsis embryos. Furthermore, through a suppressor screen of a se-3 loss-of-function mutant allele, I identified mutants in genes that likely function upstream of SE, and downstream or in parallel of the HD-ZIP IIIs. One of those se-3 suppressors is likely to be a mutant in the BELL homeobox gene POUND-FOOLISH (PNF).

Gazania is a small genus of the subtribe Gorteriinae, tribe Arctoteae, that is endemic to southern Africa. The genus was last revised in 1959 by Roessler, who noted that delimitation of the species of Gazania can be “extraordinarily difficult”. Morphometric data was collected to test the reality of the 16 species as delimited by Roessler, who based species boundaries on morphological characters. Only six taxa were found to be morphologically distinct, while the remaining samples showed no species cohesion. DNA sequence data from two nuclear spacer regions (ITS and ETS) and four chloroplast noncoding regions (the trnL and rpS16 introns, and the psbA-trnH and trnL-F spacers) of 43 samples were utilised to create a species level phylogeny and to investigate correlations between genetically delimited units and morphologically defined taxa. DNA sequence data reveal that seven species (as delimited by Roessler) are morphologically and genetically distinct. The remaining nine of Roessler’s species fall into a morphologically and genetically overlapping continuum that forms an ochlospecies. Phylogeographic methods (based on an expanded ITS and ETS DNA sequence data set from 169 samples) were employed to further resolve the limits of species, with special focus on the clades within the ochlospecies. These genetically defined clades were correlated with their geographical distributions, and in combination with molecular dating techniques, used to elucidate the recent climatic or environmental factors that may have shaped the phylogeographic structure of the genus. Phylogeographic patterns and molecular dating reveals that the genus Gazania is an example of a South African endemic clade that has undergone episodic cladogenesis in response to fluctuating climatic conditions over the last seven million years. The ochlospecies within Gazania is a result of repeated cycles of climate driven isolation in refugia and subsequent expansion and hybridization events during the Pliocene and Pleistocene. Comparisons with phylogeographic studies on other organisms reveal a common pattern indicative of the presence and evolutionary importance of an ancestral refugium in the arid Richtersveld / Namib region of southern Africa.

O conhecimento da associação entre plantas carnívoras e a comunidade bacteriana pode mostrar uma diversidade ainda não conhecida, além de proporcionar um melhor entendimento dos mecanismos envolvidos na interação de ambas. O objetivo deste trabalho foi avaliar a diversidade microbiana presente em utrículos de Utricularia foliosa através da análise de bibliotecas do gene 16S rRNA obtida por pirosequenciamento. Os resultados indicam que no ponto 1, Proteobacteria (58%), Firmicutes (11%), Cyanobacteria (11%), Acidobacteria (7%), Verrucomicrobia (5%), Actinobacteria (3%) Chlamidiae (2%) e Bacteroidetes (1%) foram os grupos dominantes. Já no ponto 2 houve uma maior presença de Eukaryota (51%), sendo que os grupos mais presentes foram Streptophyta (88%), Bacillariophyta (7%) e Chlorophyta (2%). A grande presença de algas encontradas pode estar relacionada à disponibilidade de nutrientes nos utrículos e gerar um acréscimo de carbono e nitrogênio à cadeia alimentar no interior da armadilha. / Knowledge of the association between carnivorous plants and the bacterial community can show a diversity not yet known, and provide a better understanding of the mechanisms involved in the interaction of both.The aim of this study was to evaluate the microbial diversity present in utricles of Utricularia foliosa and evaluate the effect of plant growth site in this diversity. For this the 16S rRNA gene library was sequenced by pyrosequencing (454-Roche). The results indicate that in point 1, the dominants groups were composed by Proteobacteria (58%), Firmicutes (11%), Cyanobacteria (11%), Acidobacteria (7%), Verrucomicrobia (5% ) Actinobacteria (3%) Chlamidiae (2%) and Bacteroidetes (1%), while in the point 2, Eukaryota (51%), such as Streptophyta (88%), Bacillariophyta (7%) and Chlorophyta (2%) were dominant. The large presence of algae inside the utricles may be related to the availability of nutrients and increase the Carbon and nitrogen level inside the traps, allowing the growth of the plant and also the microbial community in this structures.