Submitted by Fernanda Rodrigues de Lima (fernanda.rlima@ufpe.br) on 2018-07-12T20:00:24Z No. of bitstreams: 2 license_rdf: 811 bytes, checksum: e39d27027a6cc9cb039ad269a5db8e34 (MD5) DISSERTAÇÃO Mariana Barros Souto Souza.pdf: 2334625 bytes, checksum: a0fef77124581c4602c777533df38447 (MD5) / Approved for entry into archive by Alice Araujo (alice.caraujo@ufpe.br) on 2018-07-18T17:19:44Z (GMT) No. of bitstreams: 2 license_rdf: 811 bytes, checksum: e39d27027a6cc9cb039ad269a5db8e34 (MD5) DISSERTAÇÃO Mariana Barros Souto Souza.pdf: 2334625 bytes, checksum: a0fef77124581c4602c777533df38447 (MD5) / Made available in DSpace on 2018-07-18T17:19:45Z (GMT). No. of bitstreams: 2 license_rdf: 811 bytes, checksum: e39d27027a6cc9cb039ad269a5db8e34 (MD5) DISSERTAÇÃO Mariana Barros Souto Souza.pdf: 2334625 bytes, checksum: a0fef77124581c4602c777533df38447 (MD5) Previous issue date: 2017-02-23 / CNPQ / A osteonecrose é uma complicação crônica e progressiva da doença falciforme (DF) e ocorre devido à vaso-oclusão na microcirculação óssea, com infarto das superfícies articulares. Sabendo que a ocorrência da osteonecrose possui uma base multifatorial, polimorfismos de diversos genes, dentre eles o BMP6 e o VDR, têm sido bastante estudados. Pois participam diretamente do metabolismo ósseo. Assim o objetivo do nosso trabalho foi avaliar se existe associação entre polimorfismos nos genes BMP6 e VDR com o desenvolvimento da osteonecrose nos pacientes com DF. O estudo foi conduzido por comparação de grupos numa amostra de 303 pacientes com DF, divididos em 105 casos (83 HbSS, 11 HbSC, 11 HbSβ), os pacientes com osteonecrose e 198 controles (114 HbSS, 51 HbSC e 33 HbSβ) pacientes acima de 18 anos e que não apresentaram manifestações clínicas. Foram selecionados seis polimorfismos do BMP6 (rs3812163, rs270393, rs1225934, rs449853, rs267196, rs267201) e dois do VDR (FokI e Cdx2). A genotipagem dos polimorfismos foi realizada por PCR em tempo real utilizando sondas TaqMan®. Apenas os rs3812163 (T>A) e rs267201 (A>G) do BMP6 mostraram-se associados ao desenvolvimento de osteonecrose (P<0,0001). Juntamente com o FokI (P= 0,024) e com o Cdx2 (P= 0,046), aparecem como fatores de proteção contra o desenvolvimento da osteonecrose. A compreensão desses fatores de risco genéticos para o desenvolvimento da osteonecrose torna-se necessária para fornecer novos conhecimentos sobre a patogênese desta doença e, oferecer oportunidades para seu tratamento, que atualmente é limitado. / Osteonecrosis is a chronic and progressive complication of sickle cell disease (SCD) and occurs due to vaso-occlusion in the bone microcirculation, with infarction of the articular surfaces. Knowing that the occurrence of osteonecrosis has a multifactorial basis, polymorphisms of several genes, among them BMP6 and VDR, have been well studied. Because they participate directly in bone metabolism. Thus the objective of our study was to evaluate if there is an association between polymorphisms in BMP6 and VDR genes with the development of osteonecrosis in patients with SCD. The study was conducted by comparing a sample group of 303 patients with SCD divided in 105 cases (83 HBSS 11 HbSC, 11 HbSβ), patients with osteonecrosis and 198 controls (114 HBSS HbSC 51 and 33 HbSβ), patients over 18 years of age and who did not present clinical manifestations. Six BMP6 polymorphisms (rs3812163, rs270393, rs1225934, rs449853, rs267196, rs267201) and two within VDR (FokI and Cdx2) were selected. Polymorphism genotyping was performed by real-time PCR using TaqMan®. Only rs3812163 (T> A) and rs267201 (A> G) of BMP6 were shown to be associated with the development of osteonecrosis (P <0.0001). Together with FokI (P = 0.024) and Cdx2 (P = 0.046), they appear as protective factors against the development of osteonecrosis. Understanding these genetic risk factors for the development of osteonecrosis becomes necessary to provide new insights into the pathogenesis of this disease and provide opportunities for its treatment, which is currently limited.

Orientador: Anete Pereira de Souza / Dissertação (mestrado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Biologia / Made available in DSpace on 2018-07-22T03:36:39Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Sibov_SergioTadeu_M.pdf: 5824914 bytes, checksum: 8896a28962fac411d1c8fc12f2bcf7fb (MD5) Previous issue date: 1997 / Mestrado / Genetica / Mestre em Ciências Biológicas

Orientadores: Joyce M. Annichino-Bizzacchi, Christine Hackel / Dissertação (mestrado) - Universidade Estadual de Campinas, Faculdade de Ciências Médicas / Made available in DSpace on 2018-07-23T08:15:34Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Mendes_ChristianePatriciadeOliveira_M.pdf: 3747507 bytes, checksum: 314473a43a2b60b23c30e4583bb31f97 (MD5) Previous issue date: 1997 / Resumo: A cascata da coagulação sanguínea humana, em condições normais, é regulada por vários mecanismos naturais de anticoagulação. Entre esses mecanismos está a chamada Via da Proteína c (PC) Anticoagulante. A PC é uma proteína hepática dependente da vitamina K, que, quando ativada, exerce uma potente atividade anticoagulante e pró-fibrinolítica. Os pacientes com deficiência de PC apresentam quadro clínico caracterizado por fenômenos tromboembólicos Apenas 2-5% dos pacientes com trombose venosa apresentam deficiência de Pc. Contudo, devido à importância desse anticoagulante natural, a diminuição de sua concentração, mesmo que ainda dentro dos limites da normalidade, talvez possa ser um fator de risco a mais, que contribua para a trombose nesses pacientes. Recentemente foram descritos três polimorfismos na região promotora do gene da PC; um polimorfismo C/T, na posição -1654 e um polimorfismo A/G, : um polimorfismo na posição 1641 A/T, na posição -1476 (REITSMA, 1993). A análise desses três polimorfismos, em 24 famílias normais da Holanda, demonstrou que os três haplótipos mais freqüentes eram CAA, CGT e T AA, e representavam 88% dos casos. Segundo os autores os polimorfismos CGT e T AA tinham relação com a concentração da atividade plasmática de PC, na qual o genótipo CGT está associado a um risco elevado de trombose venosa, uma vez que foi mais freqüente nos indivíduos com trombose (risco relativo associado a doença de 1.9 ou OR de 1.9) frente ao genótipo T AA (OR de 1.6). Neste trabalho determinamos a freqüência destes 3 polimorfismos em três grupos étnicos da população brasileira (caucasóide, negróide e indígena), e em pacientes com trombose venosa mas sem deficiência congênita de Pc. Analisamos se em nossa população havia uma correlação entre o genótipo e a concentração da atividade de PC, ou se algum dos genótipos estava associado ao risco de trombose. A população indígena foi constituída por 87 indivíduos. Observou-se uma maior freqüência de homozigotos nos três genótipos estudados (CC - 52,9%; GG - 54% e AA 70,1 %), que também se manteve na análise considerando os três genótipos, simultaneamente (CC/GG/ AA -21,8%). Tal resultado leva-nos crer que os índios brasileiros estudados no presente trabalho ainda não sofreram folie influência da miscigenação, bastante comum em nosso país. Esse grupo indígena tem sua tribo em localização razoavelmente isolada do convívio do homem civilizado, o que resulta na pouca variação genômica (baixo fluxo gênico). A população de doadores caucasóide e negróide foi constituída por 216 homens e 50 mulheres. A população caucasóide foi constituída por 188 indivíduos (147 homens e 41 mulheres) e a negróide por 78 indivíduos (69 homens e 9 mulheres). Quando esses grupos foram analisados em conjunto, observou-se uma maior freqüência de heterozigotos nos 3 polimorfismos (CT 59,4% e AG - 59,4%; AT-70,7%). A análise conjunta dos 3 polimorfismos revelou uma predominância do genótipo heterozigoto (CT/AG/AT - 27,4%). Isto sugere um elevado fluxo gênico, o que é esperado, visto a alta taxa de miscigenação em nossa população. A freqüência dos polimorfismos na raça caucasóide foi CT-57%, AG-59%; e AT-64%; e na raça negróide CT -65%, AG-60% e A T -77%. A conjugação dos 3 polimorfismos mostrou que na raça caucasóide houve predominância do genótipo CT/AG/AT (28,3%) assim como na raça negróide (30,1 %). Sendo que as populações caucasóide e negróide não apresentaram diferença significativa. A dosagem da atividade de PC na população de doadores variou de 70 a 150%, com uma média de 102%. Contudo, não se evidenciou nenhuma relação entre os níveis de PC e os genótipos, exceto para o polimorfismo A/T, conforme descrito na população holandesa. Também, o genótipo CC/GG/TT, associado a níveis diminuídos de PC naquela população foi praticamente nulo (menor que 1%) em nossa população de brasileira, não permitindo qualquer análise. A média da atividade de PC dos 2 genótipos mais freqüentes (CT/AG/AT e CC/AG/AT) na população de doadores caucasóide e holandesa foi semelhante (p=0,039). Verificou-se nos doadores uma diferença significativa nos níveis de PC no polimorfismo 3, entre AA e A T com uma concentração da atividade de 108% e 99% (p=O, 015), respectivamente, associada a homozigose CC, que também mostrou uma diferença significativa entre CC/ AA e CC/AT com uma concentração da atividade de 112.76% e 99.96% (p=0,004), respectivamente). Isto poderia sugerir que o polimorfismo AT em homozigose para o C influencia na diferença dos níveis de PC, em relação ao polimorfismo 3. Como os resultados na população holandesa são opostos aos nossos, pois aqueles indivíduos com o genótipo CC/ A T exibem níveis de PC mais elevados, não permitem que se faça qualquer afirmativa com segurança. Na população com trombose, houve predominância do sexo feminino, sendo 35 homens e 88 mulheres. Quanto à raça, também houve uma predominância de indivíduos caucasóides (n=108) sobre os negróides (n=15). Verificou-se uma maior freqüência de heterozigosidade dos 3 Polimorfismos (CT-65,5%; AG-54% e AT-55,5%), assim como do genótipo heterozigoto (CT/AG/AT-21,1%). Mesmo quando os pacientes foram separados por raça, também verificou-se um maior índice de heterozigozidade, sendo CT -64%;e AG-52,3% e A T -54% no caucasóides e, CT -75%; AG-66,7% e A T - 77,7% nos negróides. Sendo que as populações caucasóide e negróide não apresentaram diferença significativa. o polimorfismo 2 em homozigose para o A foi significativamente mais freqüente na população com trombose (46%), quando comparada à população de doadores (24.4%) (p=0.005). Tais dados sugerem que o genótipo AA é um fator de risco para trombose (aR 1.93, 95% CI, 1.11 a 3.24). Contudo, em nossa população esse genótipo não está associado a níveis Por outro lado, o haplótipo CGT, considerado um fator de risco para trombose nos pacientes holandeses, foi encontrado em apenas 1 % dos nossos pacientes. Apesar de serem 2 populações diferentes, caso esse genótipo fosse um fator de risco, esperaríamos uma maior freqüência em nossos pacientes, assim como verificamos um aumento da prevalência de outras alterações genéticas associadas à trombose, como o fator V de Leiden, a mutação da protrombina e a mutação no gene da metilenotetrahidrofolatoredutase. A freqüência dos genótipos com maior e menor concentração da atividade de PC não é diferente entre doadores e pacientes com trombose, sugerindo que esses polimorfismos parecem não estar diretamente ligados ao risco de trombose. Portanto, nossos resultados demostraram que em nossa população, tanto de doadores como de pacientes com trombose, esses 3 polimorfismos praticamente não estão associados com os níveis de atividade plasmática de PC. Esses resultados mais uma vez ilustram a grande diversidade genética, nas populações humanas, mesmo entre grupos étnicos semelhantes, apontando para a importância de se analisar individualmente cada população, para que as conclusões possam ser bem fundamentadas / Abstract: Protein C (PC) is one of the major inhibitors of blood coagulation. After activation by thrombin-thrombomodulin complex in the endothelium, PC inhibites activated factors V and VIII. It also exerts a profibrinolytic activity, trough neutralization of plasminogen activator inhibitor-l (PAI-I). PC deficiency is associated with clinical thromboembolic disease. The incidence of PC deficiency in patients with thrombosis is 2-5%. However, since the physiological significance of the PC anticoagulant activity, a decreased plasmatic concentration, even in the normal range, could be a factor contributing for thrombosis in patients without a congenital PC deficiency. Recently, Spek et aI (1993) described 3 polymorphisms in the promoter region of PC gene: AlT in the position 1476; C/T in the position 1654 and AlG in the position 1641. The genotypic variation of these polymorphisms were associated with plasma PC levels and thrombotic risk (Spek et aI 1995). We determined the frequency of these polymorphisms in 3 ethinic groups of the Brazilian population (caucasian, black and indian) and in patients with thrombosis disease, without PC deficieI1cy. We also verified ifthere is an association between genotype and PC concentration, and with thrombotic risk. The indian group comprised 87 individuais. Homozigosity was prevalent in all polymorphisms (CC-52.9%, GG-54% and AA-70.1%) and in the genotype (CC/GG/AA-21.8%). These results suggest that this group was not miscegeneous, a finding very common in Brazilian population, probably because the tribe of these indians is isolated from the civilization. Caucasian and black population comprised 216 men and 50 women; there was 188 Caucasians (147 men and 41 women) and 78 Blacks (69 men and 9 women). Heterozigous polymorphism was more frequent in caucasian and black, as well as complete heterozygote CT/AG/AT (26.1% and 30.1%, respectively). Although before blood collection the individuaIs were selected only if untill the third ancestry were from the same origin, our results favour a high genetic flow. Mean PC activity levels in caucasian and blacks was 102%. However there was no correlation between the genotypic variation and PC concentration. IndividuaIs with the 2 more frequent genotype (CT/AG/AT and CC/AG/AT) had mean PC levels similar to that described in the Dutch study. There was a difference in mean PC levels in A/T polymorphism, between AA and A T (p=0.015), that also was significative between CC/AA and CC/AT (p=0.004). This could suggest that the first polymorphism homozigous for C influence the difference in PC concentration related to A/T polymorphism. However, in the Dutch population the results are in opposite, since the individuaIs with CC/ A T genotype showed increased PC levels. Thrombotic population comprised 35 men and 88 women, 108 caucasian and 15 black. The complete heterozigous CT/AG/AT was the more frequent genotype (21-1%), and not differ from the black and caucasian population. Even when they were separated according to the race, there was no difference between the frequency in the groups. When the polymorphisms were analysed individually, the second polymorphism homozigous for A was significantly more frequent in caucasian patients with thrombosis related to the caucasian normal population (p=0.005). To ascertain whether this polymorphism genotype was associated with a higher risk for thrombosis, we compare the number of patients and control caucasian subjects with the AA and ATor TT genotypes. The results indicated that having the AA genotype yields an OR of 1.93 (95% CI, 1.11 to 3.24) compared to the other genotypes. However, AA genotype is not associated with decrease in PC levels. Indeed, this finding was not verified in Dutch population. On the other hand, in Dutch study a clear correlation between PC promoter genotype and PC plasma levels was found; individuaIs with CGT haplotype exibited a PC activity 22% lower than individuaIs with T AA haplotype. They also considered CGT haplotype a risk factor for thrombosis. Although Brazilian and Dutch populations, we should expected that CGT genotype being a risk factor for thrombosis was more prevalent in our population, like factor V Leiden, variant prothrombin gene and methylene tetrahydrofolate reductase mutation, wich were increased in our and in Europe thrombotic patients, In conclusion, our results demonstrated that in our population these polymorphisms were not related to PC concentration. It is also important to point out the great genetic variety in human populations, even in the same ethynic groups, rising the 'importance to analyse individually each population / Mestrado / Farmacologia / Mestre em Ciências / FAPESP

Orientador: Shirlei Maria Recco-Pimentel / Dissertação (mestrado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Biologia / Made available in DSpace on 2018-07-27T05:52:07Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Medeiros_LilianRicco_M.pdf: 2806210 bytes, checksum: 5fcc0121fdf8339334ff0b102682d87f (MD5) Previous issue date: 2000 / Mestrado

Orientador : Christine Hackel / Dissertação (mestrado) - Universidade Estadual de Campinas, Faculdade de Ciências Médicas / Made available in DSpace on 2018-07-28T10:22:08Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Ribeiro_MarceloLima_M.pdf: 25882676 bytes, checksum: 47051f9bf317354ef0825ee8d0068829 (MD5) Previous issue date: 2001 / Resumo: Dentre os fatores predisponentes ao câncer de próstata, existem evidências que suportam a hipótese de etiologia hormonal decorrente da ação dos andrógenos. A testosterona, sintetizada a partir do colesterol por uma série de reações envolvendo enzimas do citocromo P450, é convertida em dihidrotestosterona (DHT) sob ação enzimática da 5a-redutase (8RD5A2), em alguns tecidos andrógenos dependentes. A DHT liga-se ao receptor de andrógenos (AR), e o complexo DHT-AR promove a transcrição dos genes que contém elementos responsivos aos andrógenos. O objetivo desse trabalho foi avaliar a distribuição de polimorfismos nos genes AR (CAG, 81/82, GGN) e SRD5A2 (Ala49Thr, VaI89Leu), de considerada relevância no estabelecimento do risco de câncer de próstata, em 200 doadores de sangue de duas cidades do estado de São Paulo e 92 pacientes com câncer de próstata, por PCR, PCR-RFLP e A80H. Nossos dados indicam que as freqüências desses marcadores assemelham-se aos resultados ob servados em populações Norte Americanas e Européias. Dessa forma, pode-se concluir que os fatores genéticos relacionados ao risco de câncer de próstata, considerados relevantes na maioria das populações, também podem ser aplicados a essas populações urbanas brasileiras, onde contribuições significativas de "pools" gênicos de europeus e de africanos podem ser encontradas. Em relação aos pacientes, os resultados obtidos sugerem que o número de repetições GGN parece ser o melhor marcador molecular para o risco de câncer de próstata / Abstract: There is evidence to support the hypothesis of hormonal etiology of prostate cancer involving androgen action. Testosterone is synthesized from cholesterol by a series of reactions involving cytochrome P450 enzymes and is converted to dihydrotestosterone (DHT), a more potent androgen, by 5a-reductase type 2 (SRD5A2) in many androgen-dependent target tissues. DHT binds to androgen receptor (AR), and the DHT-AR complex transactivates a number of genes with AR-responsive elements. The aim of this study was to evaluate the distribution of polymorphisms for the AR (CAG, S1/S2, GGN), and SRD5A2 (Ala49Thr, Val89Leu) genes that are considered of relevance for prostate cancer risk, among 200 individuais from two cities of the Sao Paulo state, and in 92 prostate cancer patients by PCR, PCRRFLP and ASOH techniques. Our data shows that the allelic frequencies of these markers are very similar to those described in North American and European populations. Thus, the prostate cancer genetic risk factors that are considered of relevance in most populations can also be taken into account in Brazilian urban populations, where significant contributions from European and African gene pools can be found. Concerning the prostate cancer patients, our results suggest that the number of GGN repeats seems to be the most reliable marker for prostate cancer risk / Mestrado / Ciencias Biomedicas / Mestre em Ciências Médicas

Orientadores : Vanderlei Rodrigues, Luiz Candido de Souza Dias / Tese (doutorado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Biologia / Made available in DSpace on 2018-07-28T23:40:40Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Melo_ClaudiaMourade_D.pdf: 21271243 bytes, checksum: e521441608321ceb6dde5db11e7107b2 (MD5) Previous issue date: 2001 / Resumo / Resumo: Variações fenotípicas intra e inter-populacionais de Schistosoma mansoni ocorrem em várias áreas geográficas. A heterogeneidade genética do parasita contribui para a observada variação fenotípica na interação parasita-hospedeiro, desempenhando um importante papel na epidemiologia da doença. A diferença fenotípica mais estudada, no entanto, é a resposta a quimioterapia, visto que ela é bastante relevante para o controle da esquistossomose. Com o objetivo de observar e avaliar a variabilidade genética entre linhagens brasileiras com características distintas e inferir relações filogenéticas entre elas, o DNA foi isolado de um " pool " de vermes das linhagens BH, SJ1, SJ2, 000, LE e MAP. O RAPD foi processado com 5 iniciadores com seqüências de nucleotídeos aleatórias. O RAP-PCR , por sua vez, foi realizado com o intuito de observar a variabilidade em regiões codificadoras do genoma. Os dois métodos se mostraram capazes de distinguir linhagens gerando marcadores moleculares intra-específicos. Um desses marcadores foi seqüenciado e mostrou alta homologia de nucleotídeo (99%) com uma sequência humana e 89% com gliceraldeído-3-fosfato desidrogenase humana, proteína já correlacionada com a indução de resistência a reinfecção com S. mansoni e S. haematobium. O marcador G400-9 mostrou alta homologia de nuc1eotídeo, confirmada pela alta homologia de aminoácido com transposase de TNIO. Outro marcador sequenciado foi o CBH300-IO que apresentou alta homologia de nucleotídeo com o gene do ribossomo 28S. Outros marcadores interessantes foram observados na linhagem tolerante 000: 0uh250-IO e 0uh200-II, com os iniciadores RdIO (GGGTAACGCC) e RdII (GTGACTGCAG). Não detectamos marcadores específicos para a linhagem MAP, resistente ao oxamniquine, e sim um perfil eletroforético distinto com o iniciador Rd7 (TGCCGAGCTG). Na construção de árvores filogenéticas Neighbor-joining, quando foram inferidas as áreas geográficas das linhagens, obteve-se um dendograma formado por dois grupos distintos, um de linhagens paulistas e outro de mineiras. O dendograma obtido quando inferiu-se o tipo de hospedeiro intermediário revelou a formação de 3 grupos. A linhagem LE, mantida em laboratório sem retro-alimentação, pertence a um grupo externo bastante diferente dos demais. As linhagens BH, SJ1 e SJ2 foram agrupadas entre si, possivelmente em função do fluxo gênico existente entre elas, e a linhagem 000 foi estabelecida em um terceiro grupo. Estes dois últimos grupos (um formado pelas linhagens BH, SJ1 e SJ2, e outro pela linhagem 000), com linhagens de manutenção recente em laboratório ou com retroalimentação, são mais relacionadas entre si que com a LE. Acreditamos que a maior distância genética desta linhagem em relação as outras se deva a sua longa manutenção em laboratório com fixação de determinados alelos. As relações filogenéticas observadas nas árvores Neighborjoining corroboram as características fenotípicas distintas das linhagens e estas podem ser distinguidas e diagnosticadas por marcadores moleculares obtidos por RAPD e RAP-PCR / Abstract: Phenotypical variation intra and inter-populational of Schistosoma mansoni ocurred in several geographic areas. The genetic heterogenicity of the parasite contributes for phenotypic variation in the parasite-host interaction, representing an important role in the disease epidemiology. The more studied phenotypic difference, however, is the response to chemotherapy, so that is very relevant in the schistosomiasis contro!. The DNA was isolated fiom a pool of worms of the strains: BH, SJ1, SJ2, 000, LE and MAP, with the finality to observe and evaluate the genetic variability among brazilian strains, with different characteristics, and infer phylogenetic relations among them. The RAPD was processed with 5 random primers. The RAPD-PCR was realized with the fmality to observe the variability in codificators regions of genome. The two methods showed to be able to distinguish, generating molecular markers of strains. One of this markers was sequenced and showed high homology of nucleotides (99%) comparing to a human sequence and 89% with human glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase, protein already relationed to the induction of resistance to the reinfection with S. mansoni and S. haematobium. The marker G400-9 showed high homology of nucleotides confirmaded for high homology of amino acid with transposase of TNI0. Other marker (CBH300-l0) was sequenced and apresented high homology with ribosomal 28 S gene Other interesting markers were observed in tolerant strain 000: 000250-10 and 000200-11, with the primers RdlO (GGGTAACGCC) and Rdll (GTGACTGCAG). Specific markers were not detected by us for MAP strain, resistant to oxamniquine, and a distinct PCR product profile with the primer Rd7 (TGCCGAGCTG). In the construction of phylogenetic trees Neighbor-joining, afier the geographic areas of strains were infered, a dendogram was obtained formed by two differents groups, one of paulistas strains and another of mineiras. When the type of intermediate host was infered the obtained dendogram revealed the formation of three groups. The LE strain kept in laboratory without retro-feed, belong to a external group very different fiom the others. The BH, SJ1 and SJ2 strains were grouped among them, possibly, in fimction of the genic flux existent among them, and the strain 000 was established in other group. This last two groups, with recent laboratory maintenance strains or with retro-feed, are more related among them, than to LE strain. We believed that the major genetic distance from this strain in relation to the others should be because the long maintenance in laboratory with the establishment of the allels. The phylogenetic relations observed in trees Neighbor-joining corroborate the different phenotypic characteristics of strains and this should be distinguished and diagnosed by molecular markers obtained by RAPD and RAP-PCR / Doutorado / Doutor em Parasitologia

Orientador : Jose Francisco Hofling / Dissertação (mestrado) - Universidade Estadual de Campinas, Faculdade de Odontologia de Piracicaba / Made available in DSpace on 2018-08-03T10:51:08Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Bernardo_WagnerLuisdeCarvalho_M.pdf: 2429332 bytes, checksum: a7ff41b9ee08009e5e89f77a870775ef (MD5) Previous issue date: 2002 / Resumo: Nos últimos anos, ocorreu um grande aumento na incidência de infecções hospital-associadas (nosocomiais). Dentre as espécies bacterianas, o Staphylococcus aureus tem merecido uma atenção especial, tanto pela importância da sua disseminação, quanto por sua resistência a diversos tipos de antimicrobianos. Por sua vez, o ambiente clínico odontológico possui um alto índice de contaminação bacteriana, incluindo o S. aureus, sendo assim, o objetivo dessa pesquisa foi detectar o polimorfismo genético de Staphylococcus aureus resistentes a antimicrobianos, obtidos na clínica odontológica. Para tanto, foram realizadas 24 coletas. As linhagens foram identificadas pelo Gram, catalase, coagulase e meio cromogênico. Após a identificação as mesmas foram submetidas ao teste de susceptibilidade antimicrobiana, a análise plasmidial e ao MLEE. Foram identificadas 44 linhagens de S. aureus, desses 80% foram resistentes ao antibiótico ampicilina e todas foram oxacilina sensíveis - OSSA. Na análise plasmidial foram detectados três agrupamentos de diferentes perfis plasmidiais. O estudo do perfil enzimático mostrou a presença de agrupamentos clonais entre os isolados. Os dados obtidos demonstraram a disseminação das linhagens de S. aureus resistentes no ambiente odontológico. A análise plasmidial sugere que essa resistência está relacionada ao cromossomo (DNA) e a análise dos perfis enzimáticos revelou o polimorfismo genético de S. aureus isolados dentro desse ambiente / Abstract: In the last years, an increase occurred in the incidence of hospital-associated infections. Among the bacterial species, Staphylococcus aureus has deserved a special attention, so much for the importance of spread, as for resistance to several antibiotics. For this time, the dental clinical possesses a high index of bacterial contamination, including the S. aureus. The objective of that research was to detect the genetic polymorphism of Staphylococcus aureus resistant, obtained in the dental clinic. Twenty-four collections were accomplished. The lineages were identified for Gram, catalase, coagulase and chromogenic medium. After the identification, the microorganisms were submitted to the test of antibiotic susceptibility, the plasmidial analysis and to MLEE. They were identified 44 lineages of S. aureus, 80% they were resistant to ampicillin and 100% oxacillin sensitive - OSSA. In the plasmidial analysis, three clusters were formed of different plasmidial profiles. The study of the enzymatic profile showed the formation of groupings of clones among the isolates. The spread of lineages of S. aureus resistant was observed in the dental clinic. The analysis plasmidial suggests that that resistance is related to the chromosome and analysis of the enzymatic profiles detected the genetic polymorphism of S. aureus isolated inside of that environment / Mestrado / Microbiologia e Imunologia / Mestre em Biologia Buco-Dental

Orientador: Mohamed E. M. Habib / Dissertação (mestrado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Biologia / Made available in DSpace on 2018-07-15T04:12:00Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Paleari_LuciaMaria_M.pdf: 6962566 bytes, checksum: c6e4ce0036b429c6b4de1cc107053303 (MD5) Previous issue date: 1987 / Resumo: Agonosoma flavolineatum (Hemiptera, Scutellerinae), é uma espécie policromática e fitófaga, cujas fêmeas apresentam três fenótipos distintos, sendo um deles comum ao macho. Essas várias colorações dos indivíduos, são semelhantes às de outras espécies do gênero, o que tem levado a problemas na classificação e identificação das espécies. Uma revisão do gênero foi feita na tentativa de esclarecer as denominações das espécies, caracterizando-as através dos padrões de coloração, e de algumas estruturas como antenas e esternitos. No caso específico de A. flavolineatum, a caracterização foi reforçada com os estudos de biologia e do cariótipo da espécie, que possui 10 autossomos e um par de cromossomos sexuais, sendo o macho o sexo heterogamético XY. Como acontece com muitos pentatomídeos, esses cromossomos são do tipo que não apresenta centrômero localizado. De acordo com os critérios utilizados foram propostas 4 espécies para o gênero: A. flavolineatum, A. trillineatum, A. bicolor e A. dohrni. Os estudos de biologia de A. flavoloneatum demonstraram que os machos acasalam-se indistintamente com fêmeas dos diferentes padrões tendo em todos os casos, descendentes férteis. Sob médias mensais de temperatura e Umidade Relativa do ar que variaram de '18,6 GRAUS¿C a '27,4 GRAUS¿C e 57,7% a 70,8%, respectivamente, a duração média em dias, + o erro padrão, do ciclo de vida das fêmeas foi de 156,90¿+ OU ¿'10,74, e dos machos de 166,08¿+ OU ¿'10,62 dias, com intervalos de 59 a 392 e 91 a 354 dias, respectivamente. ...Observação: O resumo, na íntegra, poderá ser visualizado no texto completo da tese digital / Abstract: Agonossoma flavolineatum (Hemiptera, Scutellerinae), is a polychromatic and phytophagous specie, whose females show three distinct phenotypes, and only one of them is similar to that of the male. These differentiation on color among the individuaIs, are analogous to other species of the same genus resulting in problems for classification and identification. A revision of the genus was made in order to clarify the species denomination, characterizing them throw the coloration patterns, and throw some other structures like antennae and sternites. In the specific case of A. flavolineatum, the characterization was reforced by biological studies and species cariotype, which has 10 autosomes and a par of sexuaI chromosomes, being the male the heterogametic XY sex. How lt's usual to happen with several pentatomides, these chromosomes are of the type that doesn't present a localized centromer. According to the utilized criteria, 4 species were proposed for the genus: A. flavolineatum, A. trilineatum, A. bicolor, and A. dohrni. The biological studies of A. flavolineatum showed that males couple with the different female patterns, having in all cases, fertile offspring. Under monthly temperature and relative air humidity means that change between '18,6 DEGREES¿C and '27,4 DEGREES¿C, and 57,7% and 70,8% respectIvely, the medium duration, 10 days more or less the standard deviation of the female life cycles were found to be 156,9 '+ OU ¿' 10,74, and the males 166,08 '+ OU ¿' 10,62 days, with intervals of 59 to 392 days and 91 to 354 days, respectively. ...Note: The complete abstract is available with the full electronic digital thesis or dissertations / Mestrado / Ecologia / Mestre em Ciências Biológicas

Orientador: Antonio Sergio Ramalho / Tese (doutorado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Biologia / Made available in DSpace on 2018-07-24T04:22:30Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Silva_IaraDuchovni_D.pdf: 5750673 bytes, checksum: 67b0d413b6aafc2f92c4f2138b0f51d6 (MD5) Previous issue date: 1998 / Doutorado / Biologia Celular / Doutor em Biologia Celular e Estrutural

Orientador: Luiz Eduardo Blumer Rosa / Banca: Fábio Daumas Nunes / Banca: Francisco Gorgônio da Nóbrega / Banca: Adriana Aigotti Haberbeck Brandão / Banca: Yasmin Rodarte Carvalho / Resumo: Para que ocorra a invasão das células epiteliais neoplásicas é necessário o rompimento da membrana basal, sendo que este processo depende, em grande parte, da ação enzimática realizada pela metaloproteinase-9 (MMP-9). O objetivo deste trabalho foi testar a hipótese que variações no gene da MMP-9 influenciam as características clínicas e histopatológicas do carcinoma espinocelular. Noventa e quatro camundongos hairless foram submetidos à carcinogênese química (DMBA 0,5%) induzida em pele, durante 16 semanas. Na 17ª semana, os animais foram sacrificados e as lesões fotografadas e avaliadas clinicamente (com relação ao tamanho e à presença de ulceração). As lesões foram então biopsiadas e fixadas em formaldeído 10%, para posterior avaliação histopatológica (padrão de invasão, estágio de invasão e diferenciação celular). No momento da biópsia, foi retirado 0,5 cm da cauda de cada animal, para extração do DNA e avaliação da presença de polimorfismos de repetição CA no promotor do gene da MMP-9. Foi utilizado o teste qui-quadrado (p<0,05) para avaliar a associação dos alelos e dos genótipos com as características clínicas e histopatológicas. Verificou-se uma associação entre o alelo com 25 repetições e o grau moderado de diferenciação celular. Concluiu-se que a presença de maior número de repetições CA no gene da MMP-9 pode estar relacionada com a redução na diferenciação celular do carcinoma espinocelular induzido quimicamente na pele de camundongos hairless. / Abstract: The metalloproteinase-9 (MMP-9) is an important enzyme during the basement membrane degradation, an essential step for cancer invasion. The aim of this study was to test the hypothesis that the CA repeat polymorphism in the MMP-9 gene promoter interferes on clinical and histopathological features of the squamous cell carcinoma. Ninety-four hairless mice were submitted to chemically induced skin carcinogenesis (DMBA 0,5%), once a week, during 16 weeks. At 17 th week, the animals were photographed and the lesions were clinically evaluated (for size and ulceration presence). Then, the lesions were biopsed and, after the routine laboratorial processing, the histopathological evaluation (stage of invasion, pattern of invasion and differentiation grade) was performed. At the biopsy, 0.5cm of each animal tail was collected for DNA extraction and evaluation of the CA repeat polymorphism in the MMP-9 gene promoter. The data was analyzed by chi-square test to evaluate whether the MMP-9 alleles or genotypes were associated with clinical and histopathological features. There was an association of the allele with 25 CA repeats with moderately differentiated lesions. The data suggest that the MMP-9 gene polymorphism is related to the reduction on histological differentiation in squamous cell carcinoma induced by DMBA in hairless mice skin. / Doutor