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Caracterização de polimorfismos em genes associados à imunopatogênese da infecção pelo Mycobacterium tuberculosisLeandro, Ana Cristina Camara Santiago January 2009 (has links)
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Previous issue date: 2014-05-07 / Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Nacional de Infectologia Evandro Chagas. Rio de Janeiro, RJ, Brasil. / A tuberculose (TB) é a principal causa de morbi-mortalidade por doença infecciosa no mundo. A cada ano ocorrem cerca de 9 milhões de novos casos com aproximadamente 2 milhões de mortes, sendo que, somente 1 em cada 10 indivíduos desenvolvem a doença. Fatores genéticos do hospedeiro podem influenciar no controle da susceptibilidade à doença. Desta forma, este trabalho teve como objetivo a caracterização de polimorfismos genéticos associados à imunopatogênese da TB. Para tanto, foram incluídos 172 pacientes com TB pulmonar ativa e 173 indivíduos controle sadios. Foi realizada a extração de DNA em todos os participantes deste estudo e os polimorfismos foram caracterizados para: NOS2A (-954G\2192C), IFNG (+874T\2192A), receptor de vitamina D (VDR) (TaqI, FokI, BsmI e ApaI) e proteína transportadora da vitamina D (DBP) (HaeIII e StyI). Não foi possível determinar nenhuma associação com o desenvolvimento da TB em relação aos polimortismos genéticos descritos neste estudo
No entanto, quando ajustamos a casuística em relação ao sexo e raça podemos verificar que o polimorfismo no gene VDR determinado pela enzima de restrição TaqI foi associado com o desenvolvimento da TB em nossa população. Apesar de não observarmos significância estatística em relação aos outros polimorfismos deste gene VDR (FokI, BsmI e ApaI), foi possível obervar que cinco das dezesseis possíveis combinações genéticas foram consideradas raras, sendo seis delas encontrados em cerca de 74,8%, tanto nos pacientes com TB quanto nos indivíduos controle. Apesar de não terem sido observadas diferenças estatísticas nos polimorfismos dos genes avaliados neste estudo, estes devem ser considerados de extrema importância na compreensão da ação do sistema imune bem como a expressão de seus produtos no desenvolvimento da TB, em células infectadas ou não pelo Mtb. Desta forma, análises funcionais em relação a estes genes e seus produtos estão em andamento para tentarmos esclarecer esta associação e possivelmente assegurar seu papel no desenvolvimento da tuberculose em nossa população / Tuberculosis (TB) is the main cause of morbid-mortality by an infection
disease worldwide. Each year 9 million new cases occur with approximately 2 million
deaths, and among them, only 1 in each 10 persons will develop the disease. Host
genetic factors can influence the control of the disease susceptibility, thus, the
objective of this study was to characterize the genetic polymorphisms associated
with the immunopathogenesis of TB. We included 172 active TB patients and 173
health control individuals. The DNA extraction was carried out in all the participants
of this study and the polymorphisms were characterized for: NOS2 (-954G→C),
IFNG (+874T→A), vitamin D receptor (VDR) (TaqI, FokI, BsmI e ApaI) and vitamin D
binding protein (DBP) (HaeIII and StyI). It was not possible to demonstrate any
association with the development of the TB regarding the genetic polymorphisms
described in this study. However, when we adjusted the cases and healthy controls
by matching sex and race we could verify statistical significance in the TaqI
restriction site in the VDR gene, meaning that this restriction site may be associated
with TB susceptibility in our population. Besides the lack of association among the
other polymorphisms sites in theVDR gene (FokI, BsmI e ApaI), we could observe
that five of sixteen genotype combinations were rare, although, six of them were
found in aproximatelly 74,8% of TB cases and control individuals. Regardless of
statistical differences among the evaluated polymorphisms in this study not being
observed, those genes must be considered of extreme importance to understand the
immune system actions as well as its product expression on TB development, in
cells infected or not by Mtb. Thereby, studies in our population are in progress to try
to identify the functional role of IFNG, NOS2A, VDR e DBP SNPs since their
secreted products are relevant to the innate and adaptive immune response against
Mycobacterium tuberculosis.
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Helicobacter pylori : importância dos genes da ilha e de adesão no câncer gástrico (Intestinal e Difuso) e em estudos de riscoPereira, Eliane dos Santos January 2015 (has links)
PEREIRA, Eliane dos Santos. Helicobacter pylori : importância dos genes da ilha e de adesão no câncer gástrico (Intestinal e Difuso) e em estudos de risco. 2015. 109 f. Tese (Doutorado em Microbiologia Médica) – Faculdade de Medicina, Universidade Federal do Ceará, Fortaleza, 2015. / Submitted by denise santos (denise.santos@ufc.br) on 2015-11-19T12:51:50Z
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Previous issue date: 2015 / Gastric cancer (GC) is the third cause of cancer death worldwide. The etiology of gastric
cancer is multifactorial and it i
s being well established an association with infection by
Helicobacter pylori
. The genetic susceptibility to GC is postulated by exposure of a large
proportion of the population to risk factors, but only part of this people develops the
neoplasia.
Furtherm
ore, the
H. pylori
pathogenic character is given by the presence of cag
-
PAI pathogenicity island (cytotoxin associated gene pathogenicity island
-
cagPAI
) as well as
allelic variation
vacA s1m1
. About the host, genetic polymorphisms have been associated wi
th
the risk of GC, indicating these changes are potential genetic susceptibility markers in these
tumors, however, few repair enzymes SNPs are studied. In the context of gastric
carcinogenesis, it is necessary to consider the differences about histopatholo
gy, age and
gender. So, the aim of this study is to investigate the association of SNPs in DNA repair
genes,
APE1
2197 (T>
G) and
MLH1
-
93 (G>A), added to
CDH1
-
160 (C>A) and
-
347
(G>GA) SNPs. The CDH1 protein is associated with hereditary diffuse cancer an
d genetic
susceptibility. The histological subtypes, age and sex were importante data considered to the
analyses.
H. pylori
genotype was determined by the presence of genes.
cagA
,
cagE, cagG,
cagT, virB11, vacA, oipA
and
hopQII.
The
H. pylori
genotypes con
sidered at risk study and
individualized in the latest study. For this, it were included 285 patients with gastric cancer
and 391 healthy controls matched for age and sex (1: 1 or 1: 2) from two different regions in
Brazil: Ceará and Pará. The positivity f
or
H. pylori
was observed in 87.71% of cases. In a risk
study was observed a protection for intestinal tumors and it was associated with the G allele
of APE1 (T> G) in women <55 years and GA allele
CDH1
-
347 (G>GA) for men aged
≥
55
years. In diffuse tumors, the group aged <55, the A allele of
MLH1
-
93 (G>A) was associated
with protection and the G allele of
APE1
(T>G) was associated with risk in men in this age
group. The G allele of
APE1
(T>G) was also
associated with the absence of distant metastases
and the A allele of
MLH1
(G>A) with absence of lymph nodes commitment. In the intestinal
subtype, carriers patients G allele of
APE1
(T>G were infected with significantly less
virulent strains. In the stu
dy with
H. pylori
strains, most cases had the full island regardless of
histologic subtype. The
cagA
and
cagE
genes were present in most strains. According to the
classification tree method analysis, some genes as
cagG
and
cagE
(in
vacAs1
strains) proved
f
undamental in the separation of GC histological subtypes. The presence of
cagG
and
cagE
genes concomitantly or absence of
cagG
in
H. pylori
looks like classifies the intestinal tumor.
While the presence of the
cagG
gene associated with the
cagE
absence cla
ssifies the diffuse
tumors. The
cagM
(+)
cagG
(+) genotype with the presence of the
cagE
gene classifies the
intestinal tumor, since in the absence of
cagE
the tumors are classified by diffuse type.
Regarding adhesion genes, there was a greater frequency o
f
oipA
gene, followed by
hopQI
and
hopQII
. In summary, these data indicate that
H. pylori
genotype, histological subtype
tumors, age and gender are important factors to be considered in polymorphisms analyzes.
Despite the complexity to explain what are the
factors that contribute to the separation of
strains in intestinal and diffuse subtypes, it is clear that there are different pathways associated
with these strains. And these genes may be potential markers of different histological
subtypes. / O câncer gástrico (CG) é a terceira causa de morte por câncer no mundo. A etiologia do CG é multifatorial sendo bem estabelecida a associação com a infecção por Helicobacter pylori. A susceptibilidade genética ao CG é postulado pela exposição de uma grande proporção da população a fatores de risco, mas somente um grupo desenvolve essa neoplasia. Por outro lado, o caráter patogênico de H. pylori é dado pela presença da ilha de patogenicidade cag-PAI (cytotoxin associated gene pathogenicity island - cagPAI) bem como a variação alélica vacA s1m1. Pelo lado do hospedeiro, polimorfismos genéticos têm sido relacionados com o risco de CG, indicando que estas alterações são marcadores potenciais de susceptibilidade genética nestes tumores, entretanto, poucos SNPs de enzimas de reparo são estudadas. No contexto da carcinogenêse gástrica, há ainda que se considerar as diferenças com respeito a histopatologia, idade e gênero. Assim o objetivo deste trabalho é verificar a associação dos SNPs em genes de reparo do DNA, APE1 2197(T>G) e MLH1 -93(G>A), adicionadas aos SNPs de CDH1 -160 (C>A) e -347 (G>GA) por ser uma proteína associada ao câncer difuso hereditário, com a susceptibilidade genética. Os subtipos histológicos, idade e sexo foram dados importantes considerados para as análises. O genótipo de H. pylori, foi determinado pela presença dos genes cagA, cagE, cagG, cagT, virB11, vacA, oipA e hopQII sendo os genótipos de H. pylori considerado no estudo de risco e individualizada no último estudo. Para isso, foram incluídos 285 pacientes com câncer gástrico e 391 controles saudáveis pareados por idade e sexo (1:1ou 1:2) de duas regiões diferentes do Brasil: Ceará e Pará. Positividade para H. pylori em 87,71% dos casos. Foi observado no estudo de risco uma proteção para os tumores intestinais foi associado ao alelo G de APE1 (T>G) em mulheres com <55 anos e o alelo GA de CDH1 -347 (G>GA) para homens com ≥ 55 anos de idade. Nos tumores difusos, o grupo com < 55 anos, o alelo A de MLH1 -93 (G>A) foi associado à proteção e o alelo G de APE1 (T>G) foi associado com o risco em homens neste grupo de idade. O alelo G de APE1 (T>G) também foi associado à ausência de metástase a distância e o alelo A de MLH1 (G>A) com ausência de metástase em linfonodos regionais. No subtipo intestinal, pacientes portadores do alelo G de APE1(T>G) foram significativamente infectados por cepas menos virulentas. No estudo com as cepas de H. pylori a maioria dos casos possuiu a ilha completa independente do subtipo histológico. Os genes cagA e cagE estavam presentes na maioria das cepas. Segundo as análises através do método da árvore de classificação, alguns genes como cagG e cagE (em cepas vacAs1) se mostraram fundamentais na separação dos subtipos histológicos de CG. A presença dos genes cagG e cagE concomitantemente, ou ausência de cagG in H. pylori parece classificar o tumor em intestinal. Enquanto que a presença do gene cagG associado a ausência de cagE classifica os tumores em difusos. O genótipo cagM (+) cagG (+) com a presença do gene cagE classifica o tumor em intestinal , já na ausência de cagE, classifica os tumores em difusos. Em relação aos genes de adesão houve uma maior frequência do gene oipA, seguido de hopQI e hopQII. Em resumo, estes dados indicam que o genótipo de H. pylori , subtipo histológico, idade e gênero são importantes fatores a serem considerados em análises com polimorfismos. E apesar da complexidade de explicar quais são os fatores que contribuem para a separação das cepas nos subtipos intestinal e difuso, é notório que existem vias diferentes associadas a essas cepas. E que estes genes podem ser potenciais marcadores de diferentes subtipos histológicos.
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Associação de fatores de risco cardiovascular e polimorfismo de apoE com mortalidade em idosos longevos : uma coorte de 18 anosVivian, Lilian January 2012 (has links)
Contexto: Doenças crônicas como as cardiovasculares e demências são mais frequentes na população idosa, especialmente na faixa etária acima dos 80 anos. A despeito desta evidência, são poucos os estudos delineados com indivíduos longevos. E frequentes são os resultados indefinidos ou inversos quando avaliados. Esta lacuna no conhecimento é dificultada pela complexidade de fatores ambientais e genéticos que influenciam a progressão das doenças crônicas. Especificamente, os níveis de pressão arterial e colesterol e o alelo 4 da apolipoproteína E (apoE) tem efeitos divergentes nos idosos longevos comparados aos idosos jovens. O objetivo deste estudo é investigar a relação entre o polimorfismo do gene da apoE e a mortalidade por doença cardiovascular e demência em idosos longevos que vivem em comunidade e avaliar a sobrevida de acordo com este polimorfismo e fatores de risco cardiovascular. Métodos: Uma amostra de 74 idosos com 80 anos ou mais da coorte do Projeto Veranópolis foi selecionada para genotipagem da apoE. Na linha de base, foram coletadas variáveis antropométicas, dosagens sanguíneas de glicose e lipídeos, pressão arterial e variáveis de estilo de vida como tabagismo, consumo de álcool e atividade física. O seguimento médio da coorte foi 16,4 anos e total de 18 anos. As causas de morte foram classificadas de acordo com a CID-10 em cardiovasculares e demenciais. A Escala Bayer de Atividades da Vida Diária foi aplicada aos cuidadores dos idosos para avaliar demência. A sobrevida dos portadores dos genótipos da apoE foi comparada através do método de estimação da curva por Kaplan-Meier e o modelo de azares proporcional da Regressão de Cox foi utilizado na descrição dos fatores associados à mortalidade geral. Resultados: A frequência gênica da apoE presente na amostra foi: 4,1% 2; 85,1% 3 e 10,8% 4. E a frequência genotípica: 1,4% E2E2; 5,4% E2E3; 71,6% E3E3 e 21,6% E3E4. Para a comparação dos desfechos foram formados 2 grupos: portadores do genótipo apoE3E3 (53 idosos) e portadores do genótipo apoE3E4 (16 idosos). A expectativa de vida média foi de 92,3 anos (IC95% 91,2-93,5). Diferenças significativas entre os genótipos foram encontradas com relação à idade média de entrada na coorte, índice de massa corporal e pressão arterial diastólica. Encontramos uma tendência para que os níveis de colesterol total e LDL-colesterol fossem maiores no grupo E3E4. Não encontramos associação entre desfechos de morbidade (AVC, IAM e ICC) ou mortalidade entre os genótipos. Para a amostra no geral, os fatores significativamente associados à mortalidade foram: tabagismo, atividade física, pressão arterial sistólica (PAS), pressão de pulso (PP) e diabetes mellitus. O risco de morte em indivíduos fumantes e ex-fumantes foi 2,83 vezes (IC95% 1,00-7,98) do risco em não fumantes. Indivíduos que praticavam atividade física vigorosa (≥4.000 kcal/semana) tiveram uma redução no risco de óbito em 54% (IC95% 10%-77%). Para o aumento de 1mmHg na PAS ou na PP houve uma redução de 2% (IC95% 1%-3%) no risco de morte. Os idosos diabéticos tiveram 3,43 (IC95% 1,03-11,50) vezes o risco de óbito dos não diabéticos. Conclusão: Não foi encontrada associação entre os dois genótipos da apoE mais frequentes na população e mortalidade cardiovascular ou sobrevida em idosos longevos. Em toda a amostra, os fatores de risco significativamente associados à mortalidade foram tabagismo e diabetes mellitus. Atividade física vigorosa, PAS e PP maiores foram considerados fatores de proteção para mortalidade geral.
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O polimorfismo Val158Met do gene COMT e TDAH : um estudo de suscetibilidade genética e farcogenéticaOliveira, Angélica Salatino de January 2011 (has links)
O transtorno de déficit de atenção e hiperatividade (TDAH) é uma doença psiquiátrica de etiologia complexa, muito comum em crianças e adolescentes. Caracteriza-se pelos sintomas de desatenção, hiperatividade e impulsividade, além de uma alta taxa de comorbidade com transtornos disruptivos do comportamento. Em relação a sua neurobiologia, uma hipótese atualmente aceita é de que crianças com TDAH apresentam um déficit funcional significativo do córtex pré-frontal, com um aparente desequilíbrio de catecolaminas. A enzima Catecol-O-metiltransferase (COMT) atua na degradação de catecolaminas na fenda sináptica e é responsável pela maior parte da degradação de dopamina no córtex pré-frontal. Dessa forma, esta enzima age diretamente no balanço dopaminérgico e noradrenérgico. O polimorfismo Val158Met do gene COMT ocasiona uma troca de aminoácidos, afetando sua termoestabilidade enzimática. Estudos indicam que esta variação enzimática da COMT tem um papel relevante na heterogeneidade fenotípica encontrada no TDAH, podendo estar envolvida no surgimento de transtornos disruptivos do comportamento. Em relação ao tratamento, o fármaco comumente prescrito é o metilfenidato. Este medicamento parece agir diretamente no aumento dos níveis de catecolaminas na fenda sináptica, através do bloqueio do transportador de dopamina e de noradrenalina. Devida a ação direta da COMT na degradação de catecolaminas e a importância do nível desses neurotransmissores na melhora da sintomatologia do TDAH, fazse também necessário o conhecimento sobre o possível efeito farmacogenético do gene no transtorno. Um total de 473 crianças foram genotipadas para o polimorfismo Val158Met. O diagnóstico de TDAH e suas comorbidades foi realizado através de três estágios, previamente descrito na literatura. Dentre esses pacientes, 251 satisfizeram os critérios de inclusão para participar do estudo farmacogenético. Variáveis que poderiam atuar como potenciais confundidores foram analisadas. As dosagens de metilfenidato foram aumentadas até não haver mais melhora clínica ou até existirem efeitos adversos significativos (doses acima de 0,3 mg/kg/dia). A medida dos sintomas foi baseada na Escala de Swanson, Nolan e 4 Pelham versão IV, e aplicada pelos psiquiatras (sem o conhecimento dos genótipos dos pacientes) antes do tratamento e no primeiro e terceiro mês de tratamento Pacientes com o genótipo Val/Val mostraram uma taxa 12% maior de transtornos disruptivos do comportamento quando comparados com indivíduos portadores do alelo Met (2 = 5,729, p = 0,017, OR = 1,62). De acordo com o teste farmacogenético, foi encontrado um efeito significante do tempo de tratamento (n = 112; F2,231 = 5,35, p = 0,005) e do gene COMT (F1,148 = 5,02, p = 0,027) na melhora clínica dos escores de oposição. Além disso, também foi vista uma interação significante entre a presença do alelo Met e o tempo de tratamento nos escores de oposição nesse período (F2,229 = 6,40, p = 0,002). Nossos resultados indicam que existe uma diferença significante na presença de transtorno disruptivo do comportamento em crianças com TDAH, de acordo com o genótipo do polimorfismo Val158Met. O genótipo Val/Val parece predizer a presença desse comportamento antissocial em crianças com TDAH. Além disso, nosso estudo farmacogenético mostrou um efeito prejudicial do genótipo Val/Val na melhora clínica dos sintomas de oposição em meninos com TDAH tratados com metilfenidato. / Attention-Deficit Hyperactivity Disorder (ADHD) is a common psychiatric condition that affects children and adolescents worldwide. This disorder is defined by symptoms of inattention and hyperactivity/impulsivity. Comorbidity with other disorders, such as Disruptive Behaviour Disorders (DBD) is very common. Regarding ADHD‟s neurobiology, there is a hypothesis that children with ADHD have prefrontal cortex (PFC) deficits with inadequate catecholamine transmission. The enzyme catechol-O-methyltransferase (COMT) degrades catecholamines and it has been suggested that it plays a key role in prefrontal cortical functioning. COMT accounts for most of the degradation of dopamine in the PFC. The Val158Met polymorphism is functional. It affects the thermostability of the protein. Several studies suggest that this variation in COMT has a relevant role in ADHD heterogeneity, and it can lead to emergence of DBD. Methylphenidate (MPH) is the most widely used drug to treat ADHD. The effect of MPH on catecholaminergic pathways results in an improvement of the PFC functioning by blockade of dopamine and norepinephrine transporters. Due to action of COMT in catecholaminergic balance, it is necessary to know about the pharmacogenetic effect of COMT in ADHD. A sample of 473 children with ADHD was genotyped for the Val158Met polymorphism. A consensus diagnosis of ADHD with or without comorbidity was achieved through a three-stage process, as previously described in the literature. Around these patients, 251 children with ADHD fulfilled inclusion criteria to participate in the pharmacogenetic study. Potential confounders were evaluated. Dosages of short-acting MPH were augmented until no further clinical improvement was detected or until there were significant adverse events (MPH dose always > 0.3 mg/kg/day). The outcome measure was the parent-rated oppositional subscale of the Swanson, Nolan and Pelham Scale – version IV. The scale was applied by child psychiatrists blinded to genotype at baseline and in the first and third months. Patients homozygous for Val allele showed a higher frequency of DBD (+ 12%) than Met allele carriers (2 = 5.729, p = 0.017, OR = 1.62). We detected 6 significant improvement in SNAP-IV oppositional scores from baseline to the first and three months of treatment (n = 112; F2,231 = 5.35, p = 0.005). A significant effect of the presence of Met allele during three months of treatment (F1,148 = 5.02, p = 0.027), and a significant interaction between the Met allele and treatment over time for the SNAP-IV oppositional scores during this period of treatment (F2,229 = 6.40, p = 0.002) were both observed. Therefore, our results indicate that there is a significant difference in the presence of disruptive behavior disorders in children with ADHD according to Val158Met genotype. This antisocial behavior in children with ADHD seems to be predicted by Val/Val genotype in COMT gene. Moreover, pharmacogenetic results suggest an effect of the COMT genotype on the trajectory of ODD symptoms improvement with MPH treatment in boys with ADHD.
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Polimorfismo do complexo de repetições (TG)n(TA)n(CA)n do gene da enzima 3 -hidroxiesteróide desidrogenase tipo II e risco de câncer de próstata : análise de uma amostra da população do Rio Grande do SulFontanive, Tiago Oselame January 2011 (has links)
Introdução: Diferentes estudos sugerem que a diidrotestosterona (DHT) exerce um importante papel na carcinogênese prostática. A incompleta inativação ou a baixa degradação da DHT na próstata pode levar ao acúmulo de DHT, e talvez, aumento da ação androgênica. A enzima 3 beta-hidroxiesteróide desidrogenase tipo II (HSD3B2) é responsável pela inativação da DHT na próstata. Neste estudo, um complexo polimórfico de repetições dinucleotídicas (TG)n(TA)n(CA)n no gene HSD3B2 foi avaliado em relação ao risco do desenvolvimento do câncer de próstata. Métodos: Amostras de sangue foram coletadas de 169 indivíduos com câncer de próstata e 161 de indivíduos controle. A análise do polimorfismo no gene HSD3B2 foi realizada utilizando PCR para amplificar a região do polimorfismo, os produtos de PCR foram analisados através de eletroforese Capilar. Os alelos do polimorfismo (TG)n(TA)n(CA)n foram dicotomizados em curto (≤285) e longo (>285). Resultados: Um total de 36 alelos, que variam de 267 pb a 361 pb de tamanho foram genotipados em nosso estudo. O alelo com o comprimento de 285 pb foi o mais frequente, representando 36,4% de todos alelos genotipados, sendo seguido pelo alelo 288 pb e 337 pb, representando 17,3% e 15,4%, respectivamente. Na análise de risco, não foi verificado diferença significativa entre os diferentes genótipos em relação ao grupo câncer e controle em relação ao risco no desenvolvimento do câncer de próstata, bem como em relação a sua distribuição nos diferentes grupos (p > 0,05). Conclusões: Estes resultados sugerem que não há correlação na amostra estudada entre o número de repetições do polimorfismo HSD3B2 e o risco de câncer de 9 próstata. Outros dados clínicos, tais como idade, níveis de testosterona total e livre também não estiveram associados com o polimorfismo no presente estudo. / Background: Different studies suggest that dihydrotestosterone (DHT) plays an important role in prostate carcinogenesis. The incomplete inactivation or low degradation of DHT in the prostate can lead to its accumulation, and probable increased androgen action. The enzyme 3 beta-hydroxysteroid dehydrogenase type II (HSD3B2) is responsible for the inactivation of DHT in the prostate. A complex polymorphic dinucleotide repeat (TG)n(TA)n(CA)n in the HSD3B2 gene was evaluated against the risk of developing prostate cancer. Methods: Blood samples were collected from 169 individuals with prostate cancer and 161 control individuals. The analysis of the HSD3B2 gene polymorphism was performed using PCR to amplify the region of polymorphism; the PCR products were analyzed by Capillary electrophoresis. The alleles of the polymorphism (TG)n(TA)n(CA)n were dichotomized into short (≤ 285) and long (> 285). Results: A total of 36 alleles varying from 267 pb to 361 pb were genotyped in our study. The 285 pb allele was the most frequent representing 36.4% of all genotyped alleles, followed by 288 pb and 337 pb, representing 17.3% and 15.4%, respectively. In the risk analysis, there were no significant differences between the different genotypes in relation to cancer and control group in relation to risk in the development of prostate cancer and compared distribution in different groups (p > 0.05). Conclusion: These results suggest that there is no correlation in the sample between the number of repetitions of the HSD3B2 polymorphism and risk of prostate 11 cancer. Other clinical data such as age and levels of total and free testosterone are not associated with polymorphism in this study.
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Busca de associações de polimorfismos nos receptores de hipocretina com fenótipos do sono em voluntários sadios e insones da cidade de São Paulo / Insomnia and Polymorphisms in hypocretin receptors: search for association in a Brazilian population sampleOliveira, Lhoyane de Moraes [UNIFESP] 30 January 2008 (has links) (PDF)
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Publico-Mestrado%20-%20Lhoyane%20de%20Moraes%20Oliveira.pdf: 1350089 bytes, checksum: d6660f748e3e65f1d952f87916135466 (MD5) / Dois processos regulam o ciclo sono/vigília: um circadiano e um homeostático. As hipocretinas (peptídeos neurotransmissores) estão envolvidas na regulação homeostática deste ciclo. A ausência ou redução no funcionamento do sistema hipocretinérgico acarreta em sonolência excessiva, por esta característica, propõe-se que a hiperatividade deste sistema pode resultar em episódios de hipervigília e insônia. As hipocretinas 1 e 2 possuem receptores específicos, amplamente distribuídos no cérebro. No gene do HcrtR1 foi descrito um polimorfismo que ocorre na posição G1222A e no gene do HcrtR2 há uma substituição na posição G922A, ambos provocam mudança de aminoácido. No presente trabalho estes polimorfismos foram analisados a fim de buscar associação com a insônia. Para obtenção dos parâmetros polissonográficos e confirmação da queixa dos pacientes, cento e cinqüenta e sete indivíduos (83 insones) foram submetidos à polissonografia e coleta de amostra de sangue periférico realização de PCR/RFLP. Entretanto, não foram observadas associações entre os polimorfismos estudados (G1222A no receptor 1 de hipocretina e G922A no receptor 2 de hipocretina) e a insônia nesta amostra. As freqüências genotípicas foram acompanhadas de acordo com o esperado para o equilíbrio Hardy-Weinberg usando a análise do χ 2, comparações da variância dos parâmetros de sono individuais foram feitas com os testes estatísticos apropriados. O programa estatístico Statistica 6.1 (StatSoft, Inc.) foi usado para todas as análises. / Hypocretin system has been described as one of the more important neurotransmission system to be involved in the waking process. Lack of function of this system, by mutations or neuron death, leads to pronounced excessive sleepiness in mammals. It is proposed that a hyperactive hypocretin system can result in hyper arousal episodes and insomnia. The hypocretins 1 and 2 bind to two known receptors widely distributed in the brain. In the present we sought to analyze whether polymorphisms in both receptors 1 and 2 are associated with insomnia. We have enrolled 83 insomnia patients, confirmed the complain with polysomnographic recordings and compared the frequencies of the hypocretins receptors polymorphisms with healthy controls with no sleep disorder confirmed by two nights of sleep recording. Our results show no association of any of the polymorphisms in both receptors with insomnia. / TEDE / BV UNIFESP: Teses e dissertações
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Efeito da progesterona no ciclo celular de células endometriais de mulheres com endrometriose pélvica portadoras do polimorfismo progins / Progesterone effect on the cell cycle control in endometrial cells from women with endometriosis harboring the PROGINS polymorphismD'Amora, Paulo [UNIFESP] 28 October 2009 (has links) (PDF)
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Publico-00247.pdf: 1617465 bytes, checksum: 6e919e998ed655de4a47c93b6fab5445 (MD5) / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP) / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) / Alterações no endométrio vêm sendo implicadas na etiopatogenia da endometriose. Dentre os diversos distúrbios já identificados na mucosa uterina destacam-se os regulados pela progesterona, o que implica, de alguma forma, que uma resistência do endométrio ao hormônio pode estar envolvida na gênese da doença. O efeito da progesterona é regulado principalmente por duas isoformas de seu receptor (PRA e PRB) e uma alteração genética (polimorfismo), denominada PROGINS, no gene que codifica este receptor, leva ao desbalanço na expressão dessas subunidades, acarretando alterações enotípicas já detectadas em enfermidades hormônio-dependentes. Em trabalho anterior realizado em nosso laboratório, identificamos que, mulher com esta alteração tem cerca de duas vezes mais chances de desenvolver endometriose. Frente aos dados de que alterações endometriais estão envolvidas na etiopatogenia da endometriose, de que estas alterações são decorrentes da resistência deste tecido a ação da progesterona e de que o polimorfismo PROGINS, prevalente em mulheres com a doença possa estar relacionado à causa desta resistência, nos propusemos, no presente estudo, a avaliar alterações no ciclo celular de células endometriais em cultivo (genotipadas para o polimorfismo PROGINS), de mulheres com e sem endometriose, após tratamentos com estradiol e progesterona. Para tanto foi obtido tecido endometrial das pacientes durante cirurgia videolaparoscópica. Após a cirurgia as pacientes foram divididas, segundo o achado cirúrgico e de acordo com a detecção do polimorfismo PROGINS, em três grupos: pacientes com endometriose, com e sem o polimorfismo PROGINS (E+Alu e E-Alu) e outro formado por mulheres nas quais não foram evidenciadas alterações pélvicas, não portadoras do referido polimorfismo (CP-Alu). Este tecido foi processado para cultura celular e subseqüentemente analisado no que se refere à funcionalidade do receptor de progesterona relacionada aos processos de proliferação celular, apoptose e progressão no ciclo celular. Nossos resultados mostraram que as células de pacientes com endometriose apresentaram diminuição da resposta à progesterona, com conseqüente aumento na proliferação celular com progressão descontrolada do ciclo celular, viabilidade celular sustentada e diminuição da taxa de morte celular por apoptose, especialmente no grupo de portadoras do polimorfismo PROGINS, em comparação ao grupo de não portadoras e grupo controle. Devido à importância da ação da progesterona no endométrio de pacientes com endometriose, nosso estudo apresenta evidências de que o polimorfismo PROGINS possa estar relacionado com a patogênese da endometriose. / FAPESP: 04/09810-6 / CAPES: 130538/2006-3 / TEDE / BV UNIFESP: Teses e dissertações
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Polimorfismo genético da apolipoproteína E e avaliação sociodemográfica em pacientes com periodontite crônicaTeles, Patricia de Barros January 2013 (has links)
TELES, Patricia de Barros. Polimorfismo genético da apolipoproteína E e avaliação sociodemográfica em pacientes com periodontite crônica. 2013. 97 f. Dissertação (Mestrado em Farmacologia) - Universidade Federal do Ceará. Faculdade de Medicina, Fortaleza, 2013. / Submitted by denise santos (denise.santos@ufc.br) on 2014-03-17T12:41:40Z
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2013_dis_pbteles.pdf: 1461989 bytes, checksum: 2ec2d2a056edac264128a2ace887df84 (MD5) / Approved for entry into archive by denise santos(denise.santos@ufc.br) on 2014-03-17T12:42:25Z (GMT) No. of bitstreams: 1
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Previous issue date: 2013 / Chronic periodontitis (CP) is characterized by an inflammation in the supporting tissues of the teeth. It is primarily caused by bacteria, but progression is associated with individual host response. CP is a complex and multifactorial disease. Genetic and environmental factors interacting can modify the clinical cause of the disease. Genetic polymorphisms have been studied to identify possible genetic markers and explain differences in the inflammatory cytokines expression. Apolipoprotein E (apoE) is an important protein in lipid metabolism and is also envolved in pathophysiological processes. The aim of this study was to investigate whether there is an association of the APOE polymorphisms with the CP´s susceptibility in subjects that sought periodontal treatment at Dental School of Federal University of Ceara and evaluate sociodemographic status related with the disease. A sample of 109 subjects between 30 and 70 years (mean age = 44,5 ± 9,64) were grouped into: 53 controls and 56 subjects with CP. DNA was obtained through a mouthwash and oral mucosa scraping and genotyped by PCR-RFLP method (Polimerase Chain Reaction – Restrict Fragment Length Polymorphism). Differences in the allele and genotype frequencies were assessed by Chi-squared test (p˂0.05). The risk associated with alleles and genotypes was calculated as odds ratio (OR) with 95% confidence intervals (CI). Logistic regression was used to associate sociodemographic status with CP and genotypes. No differences were observed in the apoE allelic distribution regarding control and periodontitis groups. Age and socio-economic status increase the risk for having CP, since individuals with lower socio-economic status was about 3-fold more likely to develop periodontitis (OR=3.1) and increase in age enhances the risk in 5.1% to develop disease in each year of age. Hypertension was a factor of clinic importance in development of CP, since subjects who self-reported hypertensive have 2,5-fold more likely to develop disease than individuals who not self-reported hypertension, although no statistic difference was reached. Similarly, CP was also associated with lower education level (OR=3.7). The polymorphism in the APOE gene was not associated with the susceptibility to CP in the studied population. / A periodontite crônica inflamatória (PC) caracteriza-se por um processo inflamatório nos tecidos de suporte dos dentes. É causada inicialmente por bactérias, mas sua progressão está relacionada à resposta individual do hospedeiro. É uma doença multifatorial e complexa, na qual fatores genéticos e ambientais interagem, promovendo e modificando a expressão clínica da doença. Polimorfismos de genes envolvidos no processo inflamatório têm sido estudados no intuito de identificar possíveis marcadores genéticos e elucidar diferenças na expressão de citocinas mediadoras da inflamação. Apolipoproteína E (apoE) é uma proteína de importância no metabolismo lipídico e está envolvida em processos fisiopatológicos. O objetivo deste estudo foi investigar se há associação do polimorfismo do gene da apoE com a susceptibilidade à PC em indivíduos que procuraram o serviço odontológico da clínica de Periodontia da Universidade Federal do Ceará e avaliar achados sociodemográficos relacionados com essa doença. Foram selecionados 109 indivíduos entre 30 e 70 anos (média = 44,5 ± 9,64) de ambos os gêneros e agrupados da seguinte forma: grupo controle n=53 e grupo Periodontite Crônica n=56. Foi extraído DNA a partir de um bochecho e esfregaço da mucosa oral e o polimorfismo da apoE foi identificado pelo método de PCR-RFLP (reação de polimerase em cadeia – polimorfismo com restrição de fragmentos) e submetidos à eletroforese em gel de agarose a 5%. As distribuições da frequência alélica e dos genótipos foram avaliadas pelo teste qui-quadrado (p˂0,05). O risco associado com alelos e genótipos foi calculado como odds ratio (OR) com intervalo de confiança (IC) de 95%. Para relacionar os achados sociodemográficos com a PC em indivíduos com alelos específicos foi utilizada a análise de regressão logística. Os resultados da análise individual do polimorfismo da apoE não evidenciaram associação dos alelos e genótipos com a susceptibilidade à PC. Observou-se associação entre a doença e a renda familiar mensal, de maneira que a chance de adoecer aumenta 3 vezes quando a renda diminui de mais que 3 salários-mínimos para a renda de 1 a 3 salários-mínimos. Ainda, há um aumento significativo na chance de desenvolver a doença em 5,1% a cada ano de vida. Indivíduos que reportaram hipertensão arterial tiveram uma chance quase 2,5 vezes maior de ter a PC do que o grupo controle apesar de não ter dado significado estatístico. Da mesma forma, foi encontrada maior chance de desenvolver a doença em indivíduos com baixo nível de escolaridade (OR=3,7). O polimorfismo da apoE não está associado à PC na população estudada.
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Lipofosfoglicanos (LPGs) de Leishmania braziliensis e Leishmania infantum na ativação de macrófagos murinos e vias de sinalização celularIbraim, Izabela Coimbra January 2012 (has links)
Submitted by Nuzia Santos (nuzia@cpqrr.fiocruz.br) on 2013-01-15T17:01:51Z
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Previous issue date: 2012 / O LPG apresenta variações estruturais que são importantes para os diferentes estágios
de desenvolvimento do parasito. Nas formas procíclicas, o LPG de L. braziliensis (cepa
M2903), não apresenta cadeias laterais enquanto um a dois resíduos de β-glicose podem
aparecer nas unidades repetitivas da forma metacíclica. O LPG de L. infantum (cepa BH46),
apresenta até três cadeias laterais de glicoses nas unidades repetitivas da forma procíclica e
ainda não foi caracterizado nas formas metacíclicas. Esses polimorfismos nas unidades
repetitivas do LPG e seu papel na interação com o hospedeiro vertebrado e invertebrado já
foram amplamente estudados, sobretudo, para as espécies do Velho Mundo. Entretanto, para a
maioria das espécies do Novo Mundo, o papel desses polimorfismos no perfil
imunopatológico da doença é ainda desconhecido. Este projeto teve como objetivo avaliar o
estudo da interação entre os LPGs de duas espécies epidemiologicamente importantes no
Brasil e macrófagos murinos. Estas incluem L. braziliensis e L. infantum, responsáveis pela
forma cutânea e visceral, respectivamente.
Neste estudo, os macrófagos peritoneais de camundongos BALB/c, C57BL/6 e
C57BL/6 knock-out (TLR2 -/- e TLR4 -/-), foram primados com IFN- e estimulados com
LPG de ambas as espécies. A produção de citocinas (IL-1β, IL-2; IL-4, IL-6, IL-10, IL-12p40,
IFN- e TNF-α) foi determinada por citometria de fluxo e a concentração de nitrito pelo
método de Griess. A ativação de ERK e p38 foi avaliada por Western blot. Os macrófagos
estimulados com LPG de L. braziliensis, apresentaram uma maior produção de TNF-α, IL-1β,
IL-6 e NO em comparação aos estimulados com LPG de L. infantum. Também foi observada
uma cinética de ativação diferencial das MAPK entre os LPGs. Leishmania infantum
apresentou uma ativação constante até 45 minutos após estimulação, enquanto L. braziliensis
apresentou um único pico de ativação após 15 minutos. Estes dados sugerem que variações
interespecíficas no LPG de Leishmania podem ter um papel importante nos eventos iniciais
do compartimento imune inato do hospedeiro. / The structural variations observed on LPG are important for the different parasite
developmental stages. The procyclic form of L. braziliensis LPG (strain M2903), is devoid of side chains, while one to two β-glucose side chains are added in the repeat units of the metacyclic LPG. The L. infantum LPG has with up to 3 glucoses residues in the repeat units in the procyclic parasites, while those structures are not known in the metacyclic stage. Those
polymorphisms in the composition and sequence of the sugars branching off the repeat units of the LPG have been assessed in the interaction with vertebrate and invertebrate hosts, especially for the Old World Leishmania species. However, for most of New World species of Leishmania, the role of those polymorphisms in the mmunopathology of the disease is still unknown. This study aimed to evaluate the interaction between the LPGs of two epidemiologically important Brazilian species and murine macrophages. Those include L. braziliensis and L. infantum, causative agents of cutaneous and visceral leishmaniasis, respectivelly. Mice peritoneal macrophages from BALB/c, C57BL/6, and C57BL/6 knock-out (TLR2 -/- e TLR4 -/-) lineages were primed with IFN- and stimulated with LPG from both species. Cytokine production (IL-1β, IL-2; IL-4, IL-6, IL-10, IL-12p40, IFN- and TNF-α)
and nitrite concentration were determined by flow cytometry and Griess reaction,
respectivelly. Western blot was performed to evaluate the activation of the MAPKs ERK and
p38. Macrophages stimulated with L. braziliensis LPG, had a higher TNF-α, IL-1β, IL-6 e NO production than those stimulated with L. infantum’s. A different MAPK activation kinetics between the two species was detected. Leishmania infantum LPG exhibited a gradual activation profile until 45 min after stimulation, whereas L. braziliensis LPG showed an activation peak at 15 min. These data suggest that interpecies variations in Leishmania LPG
may have an important role during initial steps of infection in the host’s innate imune system.
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Sepse neonatal: o impacto da diversidade genética na evolução clínica e sua aplicabilidade na prevenção da mortalidade em recém-nascidos vulneráveisCarvalho, Juliana Kilesse January 2012 (has links)
Submitted by Luis Guilherme Macena (guilhermelg2004@gmail.com) on 2013-04-04T17:18:28Z
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Tese Juliana versão final.pdf: 2723014 bytes, checksum: f642b941dbb148220456d3a6c0aa894d (MD5) / Made available in DSpace on 2013-04-04T17:18:28Z (GMT). No. of bitstreams: 1
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Previous issue date: 2012 / Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Fernandes Figueira. Departamento de Ensino. Programa de Pós-Graduação em Saúde da Criança e da Mulher. Rio de Janeiro, RJ, Brasil / A mortalidade infantil tem sofrido um declínio principalmente no componente
pós-neonatal, que é mais susceptível às ações preventivas, como campanhas de
vacinação, estímulo ao aleitamento materno e controle da doença diarreica. A
mortalidade neonatal, por outro lado, resulta de uma estreita e complexa relação entre
variáveis biológicas, imunológicas, sociais e de assistência à saúde, o que faz com que a
redução seja mais difícil e lenta.
Avanços recentes em estudos genômicos vêm buscando identificar a correlação
entre polimorfismos genéticos de base única (SNPs) em genes reguladores da resposta
inflamatória sistêmica e a suscetibilidade à sepse.
Neste estudo, foram avaliados os polimorfismos de base única nas posições TNF-
308 G>A ;TNF-863 ; IL-6-174; LTA+252 ; MIF-173; IL-10- 819 em relação à gravidade
de evolução clínica na sepse na população neonatal.
Trata-se de um estudo retrospectivo com 58 crianças nascidas na maternidade no
IFF, gravemente enfermas admitidas em UTI Pediátrica (UPG) e história pregressa de
internação em UTI Neonatal (BAR e Neocirúrgica IFF/Fiocruz) com ou sem diagnóstico
de sepse no período neonatal.
A genotipagem de todos foi disponibilizada em banco de dados existente e
resultados foram comparados com dados da evolução clínica desses pacientes no período
neonatal através de medidas de associação regressão logística, sendo ajustadas covariáveis.
Foi observada diferença estatisticamente significativa na distribuição de sepse
neonatal entre crianças nascidas a termo e pré termo, o predomínio de sepse neonatal no
grupo de menor peso ao nascer e a presença de fatores nosocomiais como necessidade
de acesso profundo, uso de nutrição parenteral e permanência em ventilação mecânica
invasiva apresentaram associação estatisticamente significativa entre tais fatores e o
desenvolvimento de sepse neonatal .
Não foi observada associação estatisticamente significativa na análise dos
genótipos, alelos e carreadores dos polimorfismos nas posições TNF-308 G>A ,
LTA+252, IL-6-174, TNF-863, IL-10-819 e MIF-173 e o desenvolvimento de sepse
neonatal na população estudada, nem na população estratificada por prematuridade.
A dificuldade em identificar uma associação entre o desfecho e polimorfismos
nessas citocinas é compatível com os resultados da literatura especializada, revistos em
detalhe a partir de uma revisão sistemática do assunto. Juntos, os nossos dados indicam
que as análises dessas associações já podem ser feitas em nossa instituição, mas que ainda
não é possível definir um painel de biomarcadores que possa ser implementado
rotineiramente como ferramenta prognóstica para a sepse neonatal. / Infant mortality is decreasing, especially in the post-neonatal age group, which is
more amenable to preventive measures, such as vaccination, stimulation of breastfeeding
and control of diarrheal disease transmission. Neonatal mortality, by contrast, results
from a close and complex relationship between biological, immunological, social and
health care factors, which makes the efforts to achieve reduction in disease both timeand
labour-intensive.
Recent progress in genomic studies have focussed on the correlation between
single nucleotide polymorphisms (SNP) affecting genes relevant to the systemic
inflammatory response and susceptibility to sepsis.
In this study, we evaluated SNP in the positions TNF-α-308; TNF-α -863; IL-6 -
174; LTA +252; MIF -173; and IL-10 -819, for their impact on the risk of sepsis and
clinical evolution of sepsis in neonates.
Ours is a retrospective study of 58 children born in Instituto Fernandes Figueira,
which due to serious disease were admitted in the Pediatric Intensive Care Unit of the
same institute, and who had a history of admission in Neonatal Intensive Care Units of
the same institution. All children could be classified as either having presented neonatal
sepsis or having excluded neonatal sepsis as a diagnosis during their passage in the
neonatal ICU.
Genotypic data were obtained from the pediatric ICU data bank, and the results
were compared with data from the clinical evolution of these patients in the neonatal
period through measures of logistic regression, after adjustment for co-variables.
We observed statistically significant differences in the distribution of neonatal
sepsis between term and preterm newborns; a predominance of neonatal sepsis in the
group of low birth weight newborns; and the influence of nosocomial factors, including
the need for deep venous access, use of parenteral nutrition, and length of invasive
mechanical ventilation, which were significantly associated with with neonatal sepsis.
By contrast, we did not observe statistically significant association between
genotypes, alleles or carriers of polymorphisms in positions TNF-308 G>A, LTA +252,
IL-6 -174, TNF -863, IL-10 -819 and MIF -173 and the development of neonatal sepsis in
our study population, even after stratification into term and preterm infants.
Our difficulty in identifying an association between the outcome of interest and
polymorphisms in these cytokine genes is consistent with results from the specialized
literature, which were reviewed in detail on the basis of a systematic review of
publications up to January 2012. Together, our results from reviewing published studies
and patient data show that genomic association studies can be carried out in our
institution, but it is not yet possible to define a panel of SNP that can be routinely applied
as a prognostic tool in neonatal sepsis.
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