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Identificação e diferenciação do Mycobacterium tuberculosis pela amplificação do DNA das regiões intergênicas dos operons inhA e pIC

Bica, Claudia Giuliano January 2003 (has links)
Entre as doenças causadas por bactérias do gênero Mycobacterium, a tuberculose por M. tuberculosis é a mais conhecida. O diagnóstico da doença é feito utilizando-se um conjunto de exames que possibilitam a identificação da mesma (WATT, 2000). Contudo, sabe-se que o diagnóstico combinado de microscopia direta e com o posterior isolamento em meio de cultivo é o “padrão-ouro”. A principal desvantagem desse método é que tal bactéria possui um crescimento lento (cerca de 8 semanas). Recentemente, a detecção de doenças através da técnica de reação em cadeia da polimerase (PCR) tem proporcionado avanços significativos no diagnóstico. O uso da amplificação específica de genes, para identificar a M. tuberculosis, tais como rDNA 16S, IS6110 ou a região intergênica senX3-regX3, tem apresentado algumas restrições, ao nível de confiabilidade e sensibilidade, para a aplicação da técnica de PCR. O presente estudo mostra a construção e a aplicação de um novo alvo para a aplicação da PCR no diagnóstico da tuberculose, baseado no ensaio da diferença de organização gênica do operon plcA, B e C diferenciando a M. tuberculosis das demais micobactérias. Neste trabalho, foram examinadas 273 amostras de pacientes com suspeita de tuberculose, sendo estas submetidas ao estudo comparativo da técnica de PCR versus cultivo (padrão ouro). A PCR amplificou fragmentos de 439pb. Os resultados mostram 93,7% de acurácia para PCR/Cultivo (p<000,1), 93,1% de sensibilidade com intervalo de confiança de 88,7-96,0 e especificidade de 96,4% com intervalo de confiança de 96,4-99,4. O valor da estatística Kappa (k) foi de 0,82 com erro padrão de 0,041, demonstrando um alinhamento quase perfeito para a verificação do grau de concordância entre os testes. Desta forma, o uso desta nova região para a amplificação da PCR se mostra uma importante e confiável ferramenta no diagnóstico específico da tuberculose. Outra região que compreende parte dos genes mbaA e inhA foi utilizada para diferenciar o Complexo tuberculosis do Complexo avium. Porém, novos experimentos serão necessários para o emprego desta região como uma ferramenta de diagnóstico.
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Ecologia de graxains (Carnivora : Canidae; Cerdocyon thous e Pseudalopex gymnocercus) em um remanescente de Mata Atlântica na região metropolitana de Porto Alegre - Parque Estadual de Itapuã - Rio Grande do Sul, Brasil

Faria-Corrêa, Mariana January 2004 (has links)
Esse trabalho foi realizado em uma remanescente de Mata Atlântica, na região metropolitana de Porto Alegre, Parque Estadual de Itapuã (PEI), Rio Grande do Sul, Brasil e teve como objetivos avaliar aspectos da ecologia dos graxains do mato Cerdocyon thous e do campo Pseudalopex gymnocercus (horário de atividade, atividade ao longo das estações do ano e fases lunares, ecologia reprodutiva, densidade na área de estudo e simpatria). Além disso, foi proposta desse estudo avaliar o uso de estações-de-cheiro para acessar informações sobre atividade e uso de hábitat de C. thous. Para isso foram utilizados diferentes métodos. Para avaliação de aspectos da ecologia dos canídeos foram realizadas transecções para observação direta dos animais. Esses dados foram georeferenciados e comparados com fatores ambientais (índice de vegetação NDVI, estação do ano, fase lunar e hora). Para o cálculo da densidade, animais foram capturados e marcados durante um ano. Utilizou-se uma estimativa da área amostral e do tamanho populacional médio através do método Jolly-Sebber. Para avaliação da ecologia reprodutiva, foram agrupadas as informações obtidas com os métodos anteriores. Com relação às estações-de-cheiro, foram montados 22 plots de areia com um metro de diâmetro e distancia de 100 metros entre si com um atrativo olfativo ao centro. As estações foram montadas e revisadas duas vezes por mês durante um ano. As informações de visitação foram cruzadas com dados ambientais (NDVI altitude, proximidade de cursos d’água, cobertura vegetal) e temporais (estação-do-ano e lua). Os principais resultados obtidos foram os seguintes: graxains-do-campo e do mato ocorrem em simpatria apenas na metade sul do PEI, sendo que os primeiros utilizam áreas com pouca vegetação e areia, enquanto o graxaim-do-mato ocupa todos os ambientes disponíveis. Ambos têm atividade preferencialmente noturna. O graxaim-do-mato ocorre em uma densidade média estimada de 0,78 ind/km2, estando esse valor dentro do encontrado na literatura. Os graxains-do-mato apresentam maior atividade no outono, diminuindo na primavera, época essa em que ocorrem os nascimentos dos filhotes. A maior atividade foi registrada na lua crescente e a menor na lua nova. Com relação às estações-de-cheiro, estas demonstraram ser um bom método para avaliar atividade de espécies de canídeos em curtos períodos de tempo e, associadas a técnicas de geoprocessamento, podem fornecer informações sobre uso de hábitat.
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Distribuição e conservação do macaco-prego (Cebus nigritus - Goldfuss, 1809) e documentação do conhecimento ecológico local na região do Parque Estadual de Itapeva e arredores, Rio Grande do Sul e Santa Catarina, Brasil

Gonçalves, Candice Salerno January 2006 (has links)
A falta de informações sobre a distribuição e status do macaco-prego (Cebus nigritus) no Estado do Rio Grande do Sul e Santa Catarina, Brasil, dificulta os trabalhos de conservação da espécie. Estudos sobre as relações das populações humanas locais com os animais silvestres são raros, porém interessantes, pois através destes estudos torna-se possível reconhecer o conhecimento e as atitudes dessas populações frente a estes animais. O presente estudo visa contribuir com informações sobre a distribuição de C. nigritus e o conhecimento ecológico local sobre a mastofauna na região do Parque Estadual de Itapeva (PEVA) e arredores, Rio Grande do Sul e Santa Catarina, Brasil. De junho de 2004 a fevereiro de 2006, foram realizadas entrevistas e coletados relatos da população residente no entorno de 36 fragmentos, os quais indicaram: a) presença de C. nigritus em 20 fragmentos; b) ausência do mesmo em 16; c) captura, caça e suplementação alimentar como principais atividades humanas afetando a espécie. De outubro de 2004 a fevereiro de 2006, foram realizadas expedições a campo, nas quais a presença da espécie foi confirmada em 13 fragmentos e o fornecimento de alimentação de origem antrópica foi registrado em dois destes. A interação de C. nigritus com cultivos foi citada por moradores para sete fragmentos, porém não se obteve o registro da mesma em nenhum deles. Oito métricas relacionadas à área, forma, isolamento e matriz dos 36 fragmentos foram analisadas. Para três dessas métricas (área, índice da forma e índice de proximidade) a diferença entre fragmentos onde a espécie está presente e fragmentos onde está ausente foi significativa. A análise multivariada das oito medidas também apresentou diferença significativa entre esses dois grupos de fragmentos. A dinâmica de sobrevivência de C. nigritus na região estudada é complexa e provavelmente a manutenção de suas populações seja dependente do conjunto de fragmentos na paisagem, sendo possível que as mesmas constituam uma metapopulação. Através de visitas a instituições mantenedoras de C. nigritus em cativeiro no Rio Grande do Sul e de informações obtidas através de instrumentos de mídia popular e de divulgação científica, foi realizado um levantamento sobre: a) condições oferecidas em cativeiro; b) ações, em nivel regional, de apreensão e soltura por órgãos de fiscalização ambiental. As principais deficiências nas condições de cativeiro foram a dieta oferecida, a superlotação e a falta de enriquecimento ambiental nos recintos. Parece comum a relocação, sem planejamento e monitoramento, por instituições mantenedoras e órgãos de fiscalização ambiental. Com relação ao conhecimento da população local sobre a mastofauna da região do PEVA e arredores, os resultados revelaram que a comunidade analisada sabe reconhecer as espécies que compunham e/ou ainda compõem a mastofauna local e possui alguns conhecimentos a respeito da biologia geral destes animais. Ainda, as entrevistas e relatos demonstraram que a situação de ocorrência e abundância dessas espécies, no passado e no presente, está relacionada à: pressão de caça, pressão de captura, destruição do habitat e construção da rodovia RS-389. Assim sendo, atividades cruciais para um programa de conservação das populações remanescentes da fauna silvestre incluem: a) o desenvolvimento de ações de educação ambiental na região do PEVA e arredores; b) a revisão do status regional de conservação de C. nigritus; c) a criação e manutenção de unidades de conservação e corredores ecológicos; d) a inibição eficaz do comércio ilegal de animais silvestres; e) a capacitação dos agentes fiscalizadores dos órgãos ambientais para a realização adequada de relocações. Ainda, ressalta-se a importância de considerar os conhecimentos da população humana local no planejamento de ações conservacionistas como passo fundamental para que estas obtenham sucesso.
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Influência da obstrução da vegetação do sub-bosque na abundância de morcegos (Mammalia: Chiroptera) em ambiente de mata atlântica no sul do Brasil

Luciano, Beatriz Fernandes Lima January 2018 (has links)
Dissertação apresentada ao Programa de Pós-Graduação em Ciências Ambientais da Universidade do Extremo Sul Catarinense -UNESC, como requisito parcial para a obtenção do título de Mestre em Ciências Ambientais. / Para os morcegos, a complexidade da vegetação pode limitar ou diminuir a utilização de determinadas áreas. Todavia, a variação da morfologia alar das espécies proporciona distintos padrões de voos, possibilitando a ocupação de diferentes micro-habitats. O objetivo do presente estudo foi avaliar a influência da obstrução da vegetação na abundância de morcegos em um ambiente de Mata Atlântica, no sul do Brasil. O estudo foi realizado no Parque Nacional Aparados da Serra, município de Praia Grande, Santa Catarina, sendo as amostragens realizadas entre setembro de 2016 e abril de 2017, com três noites consecutivas de trabalho de campo em cada mês. Para a captura dos morcegos foram definidos 30 pontos fixos de instalação de redes de neblina no sub-bosque, os quais foram inventariados uma vez em cada mês. Nos mesmos pontos de instalação das redes, foram estimadas a densidade e a complexidade da vegetação do sub-bosque, por meio de fotografias digitais. A composição da assembleia de morcegos foi descrita com base em atributos de riqueza e abundância, sendo a suficiência amostral analisada por meio da curva de acumulação de espécies, construída pelo método de rarefação. Para avaliar a variação na morfologia alar foram analisados 13 atributos, os quais estão relacionados ao tipo e estilo de voo. Para avaliar se a obstrução da vegetação influenciou a abundância dos morcegos (comunidade e espécies), bem como nos grupos com morfologia alar semelhante, foram utilizados dois modelos lineares generalizados (GLM), tendo como algoritmo de análise a distribuição de Poisson e a função de ligação logarítmica. Em 24 noites de amostragens foram obtidas 389 capturas, pertencentes a duas famílias e a oito espécies: Sturnira lilium (n = 115); Artibeus lituratus (n = 99); Artibeus fimbriatus (n = 98); Carollia perspicillata (n = 54); Desmodus rotundus (n = 12); Anoura caudifer (n = 5); Myotis nigricans (n = 4) e; Chrotopterus auritus (n = 2). A abundância da comunidade e das cinco espécies com número suficiente de indivíduos para análise (n = 10), foram menores em ambientes com maior obstrução da vegetação. O mesmo padrão ocorre para os três grupos de morcegos com morfologia alar semelhante. Devido às diferenças eco-morfológicas entre organismos, as métricas de densidade e complexidade explicaram de forma distinta a abundância das espécies no sub-bosque, sendo importante mensurá-las separadamente. Pode-se concluir que as espécies de morcegos respondem diferentemente a pequenas mudanças na complexidade do ambiente, este fator deve ser considerado em políticas de conservação, pois medidas para manutenção dos organismos só serão funcionais se atenderem as necessidades de toda comunidade.
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Distribuição potencial das subespécies de Melipona quadrifasciata Lepeletier, 1836, no Brasil em relação às mudanças climáticas

Teixeira, Karina de Oliveira January 2018 (has links)
Dissertação apresentada ao Programa de Pós-Graduação em Ciências Ambientais da Universidade do Extremo Sul Catarinense - UNESC, como requisito parcial para a obtenção do título de Mestre em Ciências Ambientais. / A perda da biodiversidade é um dos maiores problemas globais. A polinização tem papel chave para a conservação da biodiversidade global, prestando um serviço vital para os ecossistemas. A polinização por abelhas é a mais relevante dentre todas, pois respondem pela polinização da maioria das angiospermas. As abelhas estão em processo acelerado de desaparecimento e, como consequência disso, está causando um grande desequilíbrio ecológico. As mudanças climáticas estão entre as principais pressões globais de declínio das abelhas visto que fornecem as condições gerais para a ocorrência e desempenho de espécies silvestres. As variáveis climáticas, como a temperatura e a precipitação, têm se mostrado como fatores relevantes na interação planta-polinizador. O conhecimento detalhado da ecologia de cada espécie é fundamental para determinar sua potencial distribuição geográfica futura ou até mesmo sua extinção frente às mudanças climáticas. Considerando o cenário de mudanças climáticas futuro, levantamos a hipótese que as duas subespécies de Melipona quadrifasciata Lepeletier, 1836 deslocarão seus nichos climáticos e haverá uma redução espacial na área de ocorrência, acoplada com uma maior sobreposição no futuro. Este trabalho teve por objetivo geral avaliar os efeitos das mudanças climáticas na distribuição das duas subespécies de Melipona quadrifasciata no Brasil nos cenários atual e futuro. Foram utilizadas as subespécies M. quadrifasciata anthidioides com 137 registros e M. quadrifasciata quadrifasciata com 68 registros. As variáveis climáticas atuais e futuras foram extraídas do WorldClim na resolução de 10 arc-min e as variáveis futuras do modelo de circulação acopladas a CCSM4 no cenário de gases de efeito estufa RCP85. Os dados foram modelados no software MaxEnt com inclusão de camada de polarização para redução dos vieses de amostragem, avaliados pela curva ROC e TSS e foi calculada a sobreposição de nicho. Segundo o modelo, no cenário futuro a área de ocorrência potencial da subespécie M. quadrifasciata anthidioides sofre uma redução na região do Cerrado e aumenta na região da Mata Atlântica, além de aumentar sua ocorrência para o sul em direção ao Pampa. A área de ocorrência da subespécie M. quadrifasciata quadrifasciata sofre uma redução em toda sua área de distribuição. Os valores de AUC obtidos excederam 0,7 e o valor de TSS foi igual a 0,85 para todos os modelos. As subespécies mostraram pouca sobreposição de nicho atual (39,9%) e um aumento no futuro (40,6%). Apesar que as duas subespécies terão modificações nas suas distribuições geográficas, para M. quadrifasciata anthidioides o nicho climático poderá ser mais favorável caso esta tenha condições geográficas e ambiente biótico adequadas para migração. Enquanto isso, a subespécie M. quadrifasciata quadrifasciata terá condições climáticas futuras menos favoráveis para manter sua atual distribuição geográfica, sendo sugerido pelos modelos uma maior perda de habitat adequado.
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Diversidade e distribuição de serpentes e lagartos em um mosaico de fisionomias na Serra do Mar, estado de São Paulo /

Batista, Silara Fatima. January 2017 (has links)
Orientador: Otavio Augusto Vuolo Marques / Banca: Renato Silveira Bérnils / Banca: Marco Aurélio de Sena / Resumo: A composição de espécies em uma área pode ser influenciada por diversas variáveis, que também costumam influenciar a estrutura de tal comunidade. Estas variáveis podem ser bióticas, como as interações ecológicas entre as espécies e abióticas, tais como variações climáticas e de topografia, que costumam ocorrer em ambientes heterogêneos. Parece haver uma relação positiva entre heterogeneidade de hábitat e riqueza de espécies, embora essa relação seja de difícil descriminação na natureza, por ser influenciada também por fatores intrínsecos, como a biologia e história evolutiva das espécies e extrínsecos, como a história evolutiva do ambiente. Os campos nebulares, fisionomia singular encontrada em poucas áreas da Serra do Mar, possui uma história evolutiva importante na Mata Atlântica e é praticamente desconhecido quanto sua herpetofauna. Neste estudo, foi inventariada a composição de espécies de serpentes e lagartos do mosaico formado por matas e campos nebulares na área de planalto do Núcleo Curucutu do Parque Estadual da Serra do Mar. Além disso, investigou-se a distribuição e a diversidade beta destes grupos ao longo destas fisionomias. Foram encontradas 19 espécies, incluindo 13 de serpentes e seis de lagartos. A fisionomia florestada apresentou quase o dobro de espécies do que a fisionomia de campo. Do total de espécies, sete ocorrem em ambas. Os resultados obtidos sugerem que é necessário maior esforço amostral para inventariar esta comunidade, uma vez que as curvas de... / Abstract: The species composition in an area may be influenced by many variables, which also tend to influence the structure of such community. These variables can be biotic, like the ecological interactions between species and may also be abiotic, such as climate and topography variations, that usually occur in heterogeneous environments. There seems to be a positive relationship between habitat heterogeneity and species richness, although this relationship is difficult to discriminate in nature, because it is also influenced by intrinsic factors, as the biology and evolutionary history of species and extrinsic, as the evolutionary history of the environment. The nebular fields, singular physiognomy found in few areas of the Serra do Mar, have an important evolutionary history in the Atlantic Forest and its herpetofauna is practilly unknown. In this study, the species composition of snakes and lizards was catalogued for the mosaic formed by forests and nebular fields in the highland area of the Núcleo Curucutu of the Parque Estadual da Serra do Mar. In addition, we investigated the distribution and the beta diversity of these groups along these physiognomies. Nineteen species were found, including 13 of snakes and six of lizards. The forested physiognomy showed almost twice as many species as the field physiognomy presented. Of the total species, seven occur in both. The results obtained so far suggest that a greater sampling effort is needed to inventory this community, since rarefaction curves showed no tendency to stabilize. Moreover, this effort should also be maximized to determine if the substitution of species between the physiognomies is really average and whether the distribution is random or structured, given that the use of statistical tests based on qualitative or quantitative data presented divergent results / Mestre
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Some contributions to population genetics via Fleming-Viot processes / Contribuições à genética populacional via processos de Fleming-Viot

Telles Timóteo da Silva 14 July 2006 (has links)
O processo de Fleming-Viot é um processo de Markov cujo espaço de estado é um conjunto de medidas de propabilidade. As funções-amostras do processo representam as prováveis possibilidades de transformação das freqüencias de tipos genéticos presentes numa população ao longo do tempo. Obtido como solução de um problema de martingala bem posto para um operador linear construído de forma a modelar diversas características importantes no estudo da genética populacional, como mutação, seleção, deriva genética, entre outras, o processo de Fleming-Viot permite, por meio de uma abordagem matemática unificadora, tratar problemas de complexidade variada. No presente trabalho, estudamos s processs de Fleming-Viot com saltos, introduzidos por Hiraba. Interpretamos biologicamente esse saltos como mudanças abruptas que podem ocorrer, num curto espaço de tempo, durante a evolução de uma população de indivíduos, causadas por epidemias, desastres naturais ou outras catástrofes, e que levam a descontinuidades nas frequências dos tipos gênicos. Apresentamos uma forma de incluir um fator de seleção no processo com saltos, através da aplicação de uma transformação de medida do tipo Girsanov. Em seguida, fazemos uma análise do comportamento assintótico do processo utilizando técnicas de dualidade e acoplamento.
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Modelos para a dinâmica de vegetação em áreas alagáveis amazônicas / Models for vegetation dynamic in floodplain amazonian areas

Jaqueline Maria da silva 16 December 2011 (has links)
Muitos dos processos que afetam a distribuição, estrutura e dinâmica de uma população arbórea vegetal podem ocorrer muito cedo na vida de uma planta. Desta forma, o estudo dos processos de germinação e estabelecimento das plantas e fundamental para entender o crescimento populacional e a dispersão de suas sementes. Neste trabalho, apresentamos modelos de vegetação que usam autômatos celulares para representar o crescimento de espécies arbóreas nas áreas alagáveis da floresta amazônica considerando a dispersão de suas sementes, o recrutamento dos indivíduos e a influência da inundação. O primeiro dos modelos representa a dinâmica de vegetaão sem considerar diretamente a influência do pulso de inundação. O segundo modelo representa a influência da inundação via a mortalidade dos indivíduos da população. O terceiro modelo acrescenta a variação no tempo da altura da inundação,adicionando informações sobre o relevo da regi ão. É feita uma análise da influência de cada parâmetro principal na dinâmica da vegetação. Além disso apresentamos uma análise dos resultados que avaliam o comportamento do modelo, bem como a consistência e a estabilidade dos resultados obtidos pelos modelos computacionais. / Most processes that aect the distribution, structure and dynamics of tree populations occur early in the plant life cycle. Hence, it is very important to study seed germination and seedling establishment processes to understand the growth and the dispersion of plant populations. In this work, we present three vegetation models to represent the tree growth process in flooded areas of the Amazon Forest that use cellular automata. We consider seed dispersion, seedling establishment, in uence of light, recruitment of individuals, as well as the ood gradient in the models.The rst model represents the influence of flooding in the vegetation dynamic only through data and adequate hypotheses about the ooded regions. The second model represents the influence of ooding in the vegetation dynamic taking into account its in uence on mortalities. The third model represents the ood varying along time and includes topographic information.We analyze the in uence of each parameter on the vegetation dynamic. Furthermore, we present a statistical analysis of the results, evaluating the model behavior and the consistency and stability of the results obtained by the computational models.
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Desenvolvimento e identificação de mirossatélites para pirarara - Phractocephalus hemioliopterus (Siluriformes, Pimelodidae): para análise de variabilidade genética

Souza, Caroline Araújo de [UNESP] 01 March 2012 (has links) (PDF)
Made available in DSpace on 2014-06-11T19:27:25Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2012-03-01Bitstream added on 2014-06-13T19:14:55Z : No. of bitstreams: 1 souza_ca_me_botib.pdf: 341694 bytes, checksum: 40dc6e4e81c8e29fb6bfbe2be1a26c7e (MD5) / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq) / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) / A pirarara (Phractocephalus hemioliopterus) é um bagre nativo das bacias do rio Amazonas e Tocantins-Araguaia que pode atingir na sua fase adulta cerca de 60 kg. A pirarara é comercializada como peixe ornamental e é um peixe atrativo para a pesca esportiva. A espécie pertence à família Pimelodidae e tem sido ameaçada em seu habitat devido à crescente interferência antrópica nas últimas décadas. O acesso aos dados sobre a situação destas populações constitui um importante meio para o delineamento de projetos de manejo, a fim de conservar a espécie e manter os estoques de reprodutores para piscicultura. Para este fim, os marcadores microssatélites são interessantes para estudos genéticos devido a sua natureza codominante e multialélica, características ideais para serem utilizados em estudos de mapeamento genético, identificação e elucidação de questões sobre a genética de populações de diferentes organismos. Neste contexto, o presente projeto teve por objetivo a identificação e seleção de marcadores moleculares tipo microssatélites para indivíduos da espécie Phractocephalus hemioliopterus, coletados nos Rios Araguaia e Rio das Mortes,e avaliar a estrutura e os níveis de diversidade genética nessas duas localidades. Inicialmente, foram seqüenciadas 67 colônias recombinantes, dos quais apenas 32 continham sequências repetitivas do tipo microssatélite. Destas, 62,5% eram repetições dinucleotídicas e o restante composto por trinucleotídeos e tetranucelotídeos repetidos de forma imperfeita. Deste total, foi possível desenhar primers para 26 loci. Após a amplificação por PCR, 9 loci se mostraram polimórficos e informativos, e foram testados em seis espécies próximas, para a investigação de regiões no DNA altamente conservadas, com sucesso de amplificação de 81,4%. A heterozigosidade observada... / The catfish pirarara (Phractocephalus hemioliopterus) is a native Amazonas and Tocantins-Araguaia basin fish, which can weigh up to about 60 kg in its adult form. The pirarara is marketed as an ornamental fish and it is an attraction for sport fishing. The species belongs to the family Pimelodidae and it has been threatened in its habitat due to increasing human interference in recent decades. Access to data on the situation of these populations is an important means for the design of management projects in order to conserve the species and maintaining the stocks of fish breeding. The microsatellite markers for genetic studies are interesting because of their codominant and multiallelic nature, ideal characteristics for use in studies of gene mapping, identification and elucidation of questions about population’s genetics of different organisms. In this context, this project aimed to identify and select microsatellite markers on Phractocephalus hemioliopterus individuals, collected in the Araguaia and das Mortes Rivers, and to evaluate the structure and levels of genetic diversity. Initially, 67 recombinat colonies were sequenced, of which only 32 contained repetitive sequences of the microsatellite type. Of these, 62.5% were dinucleotide repeats, and the remainder consisted of trinucelotide and tetranucleotide imperfect repeats. Of this total, it was possible to design primers for 26 loci. After PCR amplification, nine loci showed to be polymorphic and informative, and were tested on six related species for the investigation of highly conserved DNA regions, with a successful amplification of 81.4%. The observed heterozygosity ranged from 0.421 to 0.947. The two sites showed significant deviations from Hardy-Weinberg equilibrium (HWE) (p<0.01) for some loci, which may be due to the presence of null alleles or even problems... (Complete abstract click electronic access below)
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Composição da avifauna em uma parcela de vegetação perturbada na Baixada, em Majé, Estado do Rio de Janeiro, Brasil

Gonzaga, Luiz Antonio Pedreira January 1986 (has links)
Submitted by Alberto Vieira (martins_vieira@ibest.com.br) on 2017-10-18T20:40:28Z No. of bitstreams: 1 200782.pdf: 15713628 bytes, checksum: 9a421d95d0bc3c6423146a523d98bb47 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-10-18T20:40:28Z (GMT). No. of bitstreams: 1 200782.pdf: 15713628 bytes, checksum: 9a421d95d0bc3c6423146a523d98bb47 (MD5) Previous issue date: 1986 / Numa faixa de mata parcialmente isolada e muito perturbada por atividades humanas no sopé da serra dos órgãos, com uma área de 36 hectares, foram encontradas 126 espécies de aves entre 1975 e 1984. Cerca de 40% delas provavelmente não se reproduzem regularmente na área, que visitam ocasional ou periodicamente. Há uma grande proporção de espécies e de indivíduos que se alimentam de frutos e vivem nas bordas da mata, pertencentes à subordem Oscines e à superfamília Tyranoidea, representantes mais típicas da avifauna de regiões temperadas. Entre as aves que vivem no interior da mata acha-se uma proporção maior de espécies que só existem no leste brasileiro. Há proporcionalmente mais dessas espécies endêmicas entre as aves que se alimentam de néctar do que entre as que se alimentam de frutos ou de outros animais. Das 99 espécies registradas na área de estudo em 1982, 62 foram capturadas em redes esticadas dentro da mata, perto do solo. A composição dessa amostra não corresponde à da avifauna da área, havendo uma tendência para a captura de maior proporção de espécies e de indivíduos que frequentam o interior da mata e cujos tamanho e comportamento não dificultam a captura. Mais de 40% dos indivíduos capturados pertencem a uma espécie, Manacus manacus, também a Única capturada em todas as redes e em todos os dias de amostragem. Reafirma-se a necessidade do uso de uma combinação de métodos para a obtenção de resultados mais confiáveis em estudos sobre comunidades de aves florestais. No final apresentam-se notas sobre distribuição e abundância de espécies selecionadas. / In a partially isolated, 36 ha woodlot located in the foothills of Serra dos Órgãos, and which has suffered greatly from human influence,126 species of birds were found from 1975 to 1984. About 40 percent of these most likely do not nest regularly in the area. Some are occasional visitors; others are seasonal, coming down from the nearby mountain slopes mainly in winter, from May to August. There is a large proportion of fruit-eating, forest edge species and individuals, belonging to the suborder Oscines and to the superfamily Tyrannoidea. These groups more typically represent the avifauna of temperate zones. There is a greater proportion of species endemic to eastern Brazíl among the forest interior birds than among the edge inhabitants. There are relatively more endemic species among nectarivores than among either frugivores or insectivores. Sixty-two of the 99 species recorded in the study area in 1982 were mist-netted in the forest undergrowth. The guild signature of this sample did not match that of the entire avifauna. There was a bias towards capturing more forest interior dwellers of proper size and behavior. The White-bearded Manakin (Manacus, manacus) alone contributed to over 40 percent of all the birds ringed. This species was also the only one caught in every net and on every day of sampling. One must recognize the importance of the use of combined methods in order to achieve better results in studies of forest bird communities. Notes on distribution and abundance of selected species are presented at the final chapter.

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