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Do Porto dos Casais a Porto Alegre : a trajetória demográfica e evolutiva de uma cidade revelada através de marcadores genéticos uniparentais

Guerreiro-Junior, Vanderlei Farias January 2007 (has links)
As populações da América pós-colombiana, em especial as populações brasileiras, foram estabelecidas principalmente através de cruzamentos envolvendo colonizadores europeus e mulheres ameríndias ou africanas. No entanto, têm sido descritas particularidades regionais e locais. Desta forma, este trabalho objetivou esclarecer os detalhes da formação da população de Porto Alegre através de dados genéticos. Para isto uma amostra de 290 indivíduos fenotipicamente identificados como brancos foi investigada com relação a marcadores de linhagens uniparentais maternos e paternos. Duzentos e três homens foram genotipados para doze marcadores bialélicos (single nucleotide polymorphisms - SNPs ) presentes na região não recombinante do cromossomo Y, sendo também seqüenciada a primeira região hipervariável (HVS-I) do DNA mitocondrial (mtDNA) de cento e setenta e dois indivíduos. Com relação aos marcadores do cromossomo Y a freqüência dos SNPs mostrou um cenário predominante de cromossomos europeus (~93%), sendo o restante de cromossomos possivelmente de origem africana. Além disso, mais de 51% dos cromossomos genotipados pertencem ao haplogrupo R1b3*, amplamente distribuído em populações ibéricas. Em consonância com este achado as análises dos dados apontaram para uma herança predominante dos colonizadores açorianos e portugueses, confirmando que o legado genético masculino da população de Porto Alegre tem origem em seus colonizadores históricos. Um cenário diferente foi encontrado para o mtDNA, pois além da presença européia (69%), também foram detectadas linhagens ameríndia (21%) e africana (10%). A avaliação das seqüências ameríndias mostrou a presença Guarani e também pela primeira vez, considerando-se uma amostra gaúcha, a herança Kaingang. Finalmente, os dados comparativos com uma amostra de negros revelaram a possibilidade de que distintas dinâmicas de mestiçagem ocorreram na formação da população porto-alegrense. / The post-Columbian American populations, especially Brazilians, are mainly the result of intercrossings between European males and Amerindian or African females. However, regional and local particularities have been described. The main objective of this investigation was to reveal details about the formation of the Porto Alegre population using genetic markers. A sample of 290 persons phenotypically classified as white was investigated in relation to several uniparental genetic systems. Two-hundred and three men were genotyped considering twelve biallelic loci (single nucleotide polymorphisms - SNPs) located in the non-recombinant region of the Y-chromosome, while the first hipervariable region (HVS-I) of the mitocondrial DNA (mtDNA) was sequenced in 172 individuals. The main origin of Y-chromosomes is European (~93%), the complementary fraction having a probable African origin. The Y-SNP haplogroup R1b3*, the most frequent in Iberian populations, is present in Porto Alegre with a frequency of 51%. These and other results show that the male contribution to this population is predominantly Azorean and Portuguese, confirming historical sources. A different scenario was oberved considering the mtDNA, because European (69%), Amerindian (21%) and African (10%) mtDNA sequences were identified. Restricting our attention to the sequences of Amerindian origin, it was Introdução possible to detect Guarani and for the first time considering a gaúcho sample, Kaingang heritages. The comparative analysis with a black sample revealed that distinct admixture dynamics have occurred in the formation of the Porto Alegre population.
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Sincronização em um modelo metapopulacional com a migração dependendo do tempo

Stroschein, Sandra Denise January 2009 (has links)
Como os assuntos relacionados à extinção de espécies e conservação da biodiversidade são de grande importância, devemos concentrar-nos em ações que visem a sua manutenção e perpetuação. Para isso, o trabalho propõe-se a estudar quais são as condições para que ocorra o fenômeno da sincronização causado pela migração, já que o risco de extinção de uma espécie pode aumentar quando temos sincronização no sistema. Neste sentido, obteremos um critério para a estabilidade do estado sincronizado sob determinadas condições. Como podemos modelar a migração dependente ou independente da densidade, primeiramente faremos um breve estudo sobre a migração dependente da densidade e veremos resultados recentes sobre a dinâmica de metapopulações. Em uma segunda etapa, iremos focar a migração independente da densidade. Para tal, supomos o processo migratório obedecendo à dinâmica sazonal. Admitimos inicialmente a partida de indivíduos através da fração migratória com dependência temporal e, após, consideramos uma fração constante, migrando conforme a distribuição dependente do tempo, representando a chegada. Para o desenvolvimento deste estudo, iremos modelar um sistema de n sítios discretos no tempo e no espaço, considerando a con guração da rede na forma unidimensional (anéis cíclicos) e a matriz de interação simétrica. / As the issues related to the species extinction and biodiversity are very important, we have to concentrate on actions that lead to their maintenance and perpetuation. My aim is to study the conditions which create the synchronization phenomenon caused by migration, having in mind that a species extinction risk may increase if there is synchronization in the system. In this sense, we are going to establish a criterion for the synchronized state's stability grounded on determined conditions. As we can pattern migration dependent or not on density, rst, we will brie y study the migration that depends on density. Then recent results about met populations dynamic will be obtained. On a second moment, the focus will be on migration independent on density. With this purpose, we suppose that the migration process is lead by a seasonal dynamic. At rst, we report us to the individuals departure throughout the migration fraction with temporal dependence. After, a constant fraction will be considered, migrating according to the distribution depended on time. It represents the arrival. In the development of this study, a system of n patches which are time and space bounded will be patterned. Thus, the net con guration on a one-dimensional shape (cyclical rings) and the symmetric interaction matrix will be considered.
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Análise da sincronização de uma metapopulação com acoplamento por combinação convexa.

Arsego, Sabrina January 2010 (has links)
Este trabalho versara sobre dinâmicas populacionais. Nesse contexto, a população é dita metapopulação. Essa e descrita como um conjunto discreto de fragmentos de habitats, denominados sítios, os quais, supostamente, apresentam condições ideais para reprodução e sobrevivência dos indivíduos. Considere-se inicialmente uma Única espécie, distribuída em n sítios, formando uma metapopulação. A cada geração, os indivíduos passam por dois processos distintos: a dinâmica local, composta pelos processos de reprodução e sobrevivência, e a migração. Tendo ocorrido a dinâmica local, dá-se inicio ao processo migratório. Desta forma, os indivíduos de um dado sitio j podem deslocar-se para outro sitio i, de acordo com a topologia da rede. Neste trabalho, optou-se por utilizar uma topologia obtida através de uma combinação convexa de dois anéis cíclicos, um de conexão global e outro de conexão local. Com esse aumento na conectividade entre os sítios, surge o que, biologicamente, e chamado de corredor. Os corredores são faixas de terra que facilitam a movimentação das espécies entre áreas fragmentadas, porem o seu use e sua eficácia geram ainda muitas divergências entre os - pesquisadores, pois não existem estudos totalmente conclusivos sobre seus resultados. Facilitando a viabilidade dos indivíduos entre os sítios, e possível aumentar a migração e com isso dar inicio ao processo de sincronização. A certificação desse fenômeno em uma metapopulação feita através do calculo do Número de Lyapunov Transversal, que esta relacionado com movimentação das espécies entre os sítios. Neste trabalho, procurou-se analisar a influencia da migração, sendo ela independente ou dependente da densidade populacional juntamente com a topologia da rede escolhida, na obtenção ou não da sincronização. / This work deals with dynamics of populations. In this context the population is named metapopulation. Metapopulation is a discrete set of habitat fragments, which we call patches, and we assume they present ideal conditions for the individuals to breed and survive. We will consider initially a unique species, distributed in n patches, which constitutes a metapopulation. In each generation the individuals pass through two different processes: one is the local dynamics, composed by the reproduction and the survival, and the other, migration process. When the local dynamics occurred, the migratory process begins, so that the individuals of a given patch can move to another patch, following the net topology. In this work we decided to use a topology obtained by a convex combination of two cyclic rings, one of them with global connection and the other with local one. Through this enlargement of connectivity between the patches, it appears what, biologically is named corridor. The corridors are land strips that facilitate species movimentation between fragmentated areas, but the researchers do not totally agree about corridors, since the studies of their availabity are not conclusive. If we ease the passage of the individuals between the patches, it is possible to improve the migration, and then to start a synchronization process. The certification of that phenomenon in a metapopulation is performed by the computation of Transversal Liapunov Number, which is related to the movement of the species between the patches. In this work we also aim to analyze how the migration influences the synchronization when it is either density-dependent or density-independent of the population, taken into account the chosen net topology.
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Marcadores isotópicos da origem da pesca do pirarucu na bacia Amazônica, Brasil

Pereira, Luciana Alves 15 August 2016 (has links)
Dissertação (mestrado)—Universidade de Brasília, Instituto de Ciências Biológicas, Programa de Pós-Graduação em Ecologia, 2016. / Submitted by Camila Duarte (camiladias@bce.unb.br) on 2016-09-20T15:58:52Z No. of bitstreams: 1 2016_LucianaAlvesPereira.pdf: 4357025 bytes, checksum: 32348bc07ee8be67758bdde45c9c206f (MD5) / Approved for entry into archive by Raquel Viana(raquelviana@bce.unb.br) on 2016-12-02T14:54:05Z (GMT) No. of bitstreams: 1 2016_LucianaAlvesPereira.pdf: 4357025 bytes, checksum: 32348bc07ee8be67758bdde45c9c206f (MD5) / Made available in DSpace on 2016-12-02T14:54:05Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2016_LucianaAlvesPereira.pdf: 4357025 bytes, checksum: 32348bc07ee8be67758bdde45c9c206f (MD5) / O desenvolvimento de ferramentas analíticas para determinar a origem de peixes é útil para o entendimento de padrões de uso do habitat e podem auxiliar no monitoramento, manejo e no controle de recursos naturais, bem como na certificação da origem de alimentos. A aplicação da metodologia de análise isotópica em estruturas calcificadas fornece informações integradas sobre a origem geográfica dos peixes provenientes de diferentes ambientes. O objetivo deste trabalho foi desenvolver marcadores isotópicos de estrôncio (Sr), carbono (C) e oxigênio (O) para traçar a origem geográfica do pirarucu (Arapaima sp.) comercializado na bacia Amazônica, por meio da análise cronológica de Sr nos otólitos em alta resolução com LAMC- ICPMS, visando distinguir indivíduos criados em cativeiro e capturados em ambiente natural. Foram coletados espécimes de diferentes ambientes, bem como a água e as rações utilizadas na alimentação do pirarucu em cativeiro. Os principais resultados encontrados foram: a discriminação total da pesca do pirarucu quanto a origem geográfica e ao método de produção com 70,5% e 94,16% de classificação correta, respectivamente; a integração cronológica entre as variações das razões 87Sr/86Sr dos peixes em relação as sub-bacias amazônicas, bem como a confirmação do padrão de sedentarismo e migração lateral do pirarucu. A ferramenta isotópica desenvolvida apresenta diversas aplicações no rastreamento da pesca do pirarucu na bacia Amazônia, sendo assim importante para o desenvolvimento tecnológico e ecológico desta espécie no ecossistema Amazônico. _________________________________________________________________________________________________ ABSTRACT / The development of an analytical tool to determine the origin of fish is useful for the understanding of habitat use patterns and can assist in monitoring, management and control of natural resources, as well as the certification of food origin. The application of isotopic analyses methodology in calcificated structures provides integrate information about a fish´s geographic origin from different environments. The objective of this study was to develop a method using Sr, C and O isotopic markers to trace the geographical origin of pirarucu (Arapaima sp) sold in Amazonian basin, through the chronological otolith analyses in high resolution with LA-MCICPMS, in order to distinguish captive fishes from those caught in their natural environment. Individuals were collected from different environments, as well as water and food used for feeding pirarucu in captivity. The main findings were total discrimination of Arapaima fishing for the geographic origin and production method with 70,5% e 94,16% of correct classification, respectively; chronological integration between the variation of fish 87Sr/86Sr ratio in relation to the Amazon sub basins, as well as confirmation of pirarucu sedentary pattern and lateral migration. The isotopic tool developed has several applications in tracking the Arapaima sp. fishing in Amazon basin, therefore important for technological and ecological development about these species in Amazon ecosystem.
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Heterogeneidade genética de Anopheles darlingi e suas implicações para epidemiologia da malária / Genetic heterogeneity of Anopheles darlingi and its implications for malaria epidemiology

Lima, Melina Aulino Campos [UNESP] 13 May 2016 (has links)
Submitted by MELINA AULINO CAMPOS DE LIMA null (mel_linaa@hotmail.com) on 2016-06-14T11:27:04Z No. of bitstreams: 1 Campos, versão final.pdf: 6619779 bytes, checksum: 1ced7c5593e51838fa6cdc10742bb1f2 (MD5) / Rejected by Ana Paula Grisoto (grisotoana@reitoria.unesp.br), reason: Solicitamos que realize uma nova submissão seguindo a orientação abaixo: O arquivo submetido está sem a ficha catalográfica. A versão submetida por você é considerada a versão final da dissertação/tese, portanto não poderá ocorrer qualquer alteração em seu conteúdo após a aprovação. Corrija esta informação e realize uma nova submissão contendo o arquivo correto. Agradecemos a compreensão. on 2016-06-15T19:04:14Z (GMT) / Submitted by MELINA AULINO CAMPOS DE LIMA null (mel_linaa@hotmail.com) on 2016-07-28T09:31:04Z No. of bitstreams: 1 Campos, versão final.pdf: 6669108 bytes, checksum: bf58ca3048946ca88e3c4dd8fb99500a (MD5) / Approved for entry into archive by Felipe Augusto Arakaki (arakaki@reitoria.unesp.br) on 2016-07-28T14:10:56Z (GMT) No. of bitstreams: 1 lima_mac_dr_bot.pdf: 6669108 bytes, checksum: bf58ca3048946ca88e3c4dd8fb99500a (MD5) / Made available in DSpace on 2016-07-28T14:10:56Z (GMT). No. of bitstreams: 1 lima_mac_dr_bot.pdf: 6669108 bytes, checksum: bf58ca3048946ca88e3c4dd8fb99500a (MD5) Previous issue date: 2016-05-13 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP) / Degradação florestal, alterações ambientais antropogênicas e mudanças climáticas são fatores que podem modificar a dinâmica populacional de anofelinos. Anopheles (Nyssorhynchus) dar- lingi é o principal vetor de malária no Brasil e em outros países na América do Sul. Estudos observaram o aumento da abundância do vetor An. darlingi e número de casos de malária após desflorestação e demais modificações ambientais antropogênicas. Além de ter ampla distribuição geográfica, essa espécie possui plasticidade comportamental e diversidade morfo- lógica, biológica e genética. Tendo em vista essa heterogeneidade, o presente estudo avaliou a diversidade genética populacional em An. darlingi ligada a distribuição geográfica, dinâmica sazonal e comportamento hematofágico, através de marcadores microssatélites e SNPs. Espé- cimes de An. darlingi foram coletados em dois assentamentos rurais próximos e, em uma área urbana à aproximadamente 600 km de distância. Além disso, as coletas foram realizadas no primeiro e segundo semestre e, dentro e fora das casas, durante o período de atividade hema- tofágica do vetor, ou seja, das 18-6 horas. Os resultados apresentaram subpopulações de An. darlingi em aspecto geográfico, em escalas macro e microgeográficas, acessadas com mais pro- fundidade com os dados dos SNPs. Além disso, o estudo corroborou o prévio achado de duas subpopulações de An. darlingi relacionadas ao regime de chuvas. Por fim, pela primeira vez, a heterogeneidade genética em populações simpátricas desse vetor foi encontrada e relacionada com o fenótipo de comportamento hematofágico, endo e exofagia. Esses achados demonstram a importância do entendimento e vigilância entomológica, pois possuem potencial impacto na transmissão de malária. Dado que cada localidade possui características ambientais peculia- res e portanto, diferentes composições populacionais dos vetores, intervenções específicas em menor escala passam a ser abordagens interessantes no controle da malária. / Forest degradation, human environmental alteration and climate changes are all influence anopheline populations. Anopheles darlingi is the main vector of malaria parasite in Brazil and other countries of South America. Deforestation and others anthropogenic activities have been accompanied by sharp increases in both abundance of the primary malaria vector Anopheles darlingi and numbers of malaria cases. Besides it is widely distributed, this species display great behavioral plasticity and morphological, biological and genetic diversity. The aim of this study was to analyze population genetic diversity of An. darlingi related to geographical distribution, seasonal dynamics and hematophagic behavior, using microsatellites and SNPs markers. An. darlingi specimens were collected in two close rural settlements and in an urban area about 600 km away. In addition, collections were performed in both semesters of the year and, indoor and outdoor during the biting activity period of the vector, i.e., 6pm-6am. The results showed subpopulations of An. darlingi related to geographical aspect, in a macro and micro geographic scales, better accessed with SNPs dataset. Moreover, this study corroborated with a previous finding showing two subpopulations of An. darlingi related to rainfall. Finally, for the first time, genetic heterogeneity was found in sympatric populations of this vector, and it was associated with a phenotype of hematophagic behavior, endo and exophagy. These outcomes demonstrate that genetic heterogeneity may represent an important vector phenotypic variation with potentially highly significant consequences for malaria transmission. Since each site has unique environmental characteristics and therefore, different population compositions of vectors, specific interventions on a smaller scale become interesting approaches for optimal targeted malaria transmission interventions. / CAPES: BEX 9230/12-2 / FAPESP: 2014/09461-3 / FAPESP: 2012/04881-9
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Estudo populacional de Anopheles darlingi utilizando análise de RAPD e seqüenciamento de genes mitocondriais /

Angêlla, Aline Fernandes. January 2006 (has links)
Orientador: Paulo Eduardo Martins Ribolla / Banca: Alexandre Afrânio Peixoto / Banca: Newton Goulart Madeira / Resumo: O fungo termo dimórfico, Paracoccidioides brasiliensis é o agente etiológico da Paracoccidioidomicose (PCM), a micose sistêmica mais prevalente da América Latina. Este fungo vem sendo frequentemente isolado de amostras clínicas, tecidos de tatu (Dasypus novemcinctus) e recentemente foi também isolado de cão. Este trabalho avaliou a transição de micélio para levedura (M-L), a termo tolerância e o perfil de virulência em nove isolados de P. brasiliensis (quatro de pacientes humanos, quatro de tatus e um de cão), bem como a sua relação com a seqüência parcial e expressão do gene hsp70 (Heat Shock Protein 70) através de Real Time RT-PCR. Tanto os dados morfológicos como moleculares se mostraram variáveis dentre os diferentes isolados. Alguns destes dados, como sequenciamento e morfologia leveduriforme corroboram com a divisão de nossos isolados nas duas espécies crípticas simpátricas previamente propostas por Matute et al (2006). Nossos resultados confirmam que a HSP70 pode ser um importante fator de virulência por estar associado à termo tolerância, mas sua expressão parece não ser diretamente associada a altos padrões de virulência. / Abstract: The thermo dimorphic fungus Paracoccidioides brasiliensis is the etiological agent of Paracoccidioidomycosis (PCM), the most prevalent systemic mycosis in Latin America. The previous phylogenetic species recognition proved the existence of, at least, three cryptic species in this pathogen. In this work we evaluated the mycelia to yeast (M-Y) transition, thermo tolerance and virulence profiles of nine isolates of P. brasiliensis, (including members of two of the three species) as well as its relation to the partial sequence and expression of hsp70 gene. It was observed a large phenotypic variability concerning the M-Y transition. The isolates Bt84 and T10 took more time to convert to the yeast form. These same isolates presented stretched yeast cells at 36°C, instead of the typical round cells. It was also observed arthroconidia production during the M-Y transition for some of the nine isolates studied. The hsp70 expression showed to be variable among our isolates. The partial sequencing of hsp70 gene resulted in a Neighbour Joining tree that divided our isolates in two main groups. Conclusions: Our data confirm that hsp70 gene might be an important virulence factor, associated with the thermo tolerance, but its expression does not seem to be directly related to high virulence profiles. We also presented some preliminary results about mycological characters that could be important candidates for morphologic markers for species recognition, as well as the partial sequencing of one member of the hsp70 gene family that allowed the separation of our isolates in two clusters, that correspond to the two sympatric cryptic species that occur in our PCM hyper endemic area (Botucatu, SP, Brazil). / Mestre
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Artemisia annua L.: produção de biomassa, artemisinina, rendimento e composição de óleo essencial em função de diferentes variedades e densidades de plantio

Capelin, Diogo 28 February 2012 (has links)
CNPq / Artemisia annua L. é uma planta herbácea nativa da Ásia, muito utilizada como fonte de óleo essencial e artemisinina, uma lactona sesquiterpenica utilizada como princípio ativo antimalárico. Devido à grande demanda por esta molécula a busca pela melhoria da produção de A. annua é intensa. O objetivo deste estudo foi identificar a densidade de cultivo adequada para o maior rendimento de biomassa, artemisinina e óleo essencial, e a composição deste, além de comparar o desempenho produtivo de três variedades de A. annua para o cultivo na região Sudoeste do Paraná. Para isso, um experimento foi conduzido em delineamento de blocos ao acaso, com quatro repetições. Foram utilizadas três diferentes variedades de A. annua: Artemis F2, Artemis F1 e (2/39 x 5)x3M. Um segundo experimento foi conduzido com a variedade Artemis F2 em delineamento de blocos ao acaso, com três repetições. Os tratamentos utilizados foram: T1: 16.666 plantas ha-1, T2: 55.555 plantas ha-1, T3: 94.444 plantas ha-1 e T4: 133.333 plantas ha-1. Em pleno florescimento, o material vegetal dos dois experimentos foi colhido (aproximadamente 159 dias após o transplante) e seco até peso constante em estufa com circulação de ar a 35 ºC. A quantificação de artemisinina foi realizada por cromatografia em camada delgada com detecção por densitometria. A separação e quantificação das substâncias presentes no óleo essencial foram realizadas em cromatógrafo gasoso com detector de ionização de chama e, a identificação das mesmas foi feita em cromatógrafo a gás acoplado a espectrômetro de massas. Os resultados foram submetidos à análise da variância e ao teste de Tukey a 5% de probabilidade do erro para as variáveis qualitativas e a regressão do quadro da análise da variância para os tratamentos quantitativos. Todas as variedades testadas apresentaram elevada produção de massa seca de parte aérea, massa seca de folhas, produção de artemisinina e óleo essencial por área não diferindo estatisticamente ente si. As variedades Artemis F2 e Artemis F1 apresentaram maior relação folha/caule entre as variedades testadas. As variedades Artemis F1 e (2/39 x 5)x3M apresentaram maior teor de óleo essencial na matéria seca de folhas sendo mais recomendadas para o cultivo na região Sudoeste do Paraná, para fins de produção de óleo essencial. Os principais constituintes encontrados no óleo essencial das três cultivares foram a cânfora (39,69%), 1,8 cineol (12,66%), mirceno (9,29%), γ-muuroleno (4,95%), trans-b-farneseno (4,02%), que juntos somam em média 70,61% do óleo essencial das variedades testadas. Alterações na densidade de plantio não tiveram influência significativa sobre os constituintes majoritários do óleo essencial de A. annua variedade Artemis F2. Para as diferentes densidades as maiores produções de biomassa de folhas, artemisinina, teor de artemisinina na massa seca de folhas e óleo essencial foram obtidas nas densidades de 93.966 plantas ha-1, 80.0,71 plantas ha-1, 81.969 plantas ha-1 e 91.272 plantas ha-1 respectivamente. O teor de óleo essencial na massa seca de folhas não foi alterado pela densidade de plantio. A alteração na densidade de plantio influenciou na produção de canfeno, α-copaeno, acetato de mirtenila, γ- terpineno. Em todas as densidades de plantio a cânfora foi o constituinte majoritário com níveis superiores a 39% indicando que A. annua é uma fonte alternativa para a produção desta substância. Os monoterpenos foram a classe de compostos mais abundantes no óleo essencial de A. annua com 59,03% da constituição química e 33,91% pertence à classe dos sesquiterpenos. / Artemisia annua L. is a herbaceous plant native from Asia which is much used as a source of essential oil and artemisinin, a sesquiterpene lactone used as antimalarial active principle. The search in the improvement regarding the production of A. annua is intense due to the high demand for this molecule. The aim of this study was to identify the suitable planting density for a higher yield of biomass, artemisinin and essential oil, and the composition of this, and also compare the performance of three varieties of A. annua for cultivation in the Southwest region of Paraná. In order to this, an experiment was conducted in a randomized block design with four replications. Three different varieties of A. annua were used: Artemis F2, and Artemis F1 (2/39 x 5)x3M. A second experiment was conducted with Artemis F2 variety in a randomized block design with three replications. The treatments were: T1: 16.666 plants ha-1, T2: 55.555 plants ha-1, T3: 94.444 plants ha-1 and T4: 133.333 plants ha-1. The plant material of both experiments was harvested at flowering (approximately 159 days after transplantation) and dried until a constant weight in an oven with air circulation at 35 ° C. The quantification of artemisinin was performed by thin-layer chromatography and detected by densitometry. The separation and quantification of substances present in the essential oil were performed by gas chromatography with a flame ionization detector and the identification of them was performed by gas chromatography coupled to a mass spectrometer. The results were submitted to analysis of variance and Tukey's test at 5% of failure probability for qualitative variables and the regression of the analysis of variance for quantitative treatments. All the tested varieties showed an increasing production in relation to the dry mass of the aerial part, dry mass of leaves, artemisinin and essential oil production per area and they did not differ statistically between themselves. The varieties of Artemis F1 and Artemis F2 had a higher leaf/stem ratio among the varieties tested. The varieties of Artemis F1 and (2/39 x 5)x3M showed a higher content of essential oil in the dry mass of leaves, and due to this they are recommended for cultivation in the Southwest region of Paraná, for the essential oil production. The main compounds found in essential oils from the three cultivars were camphor (39.69%), 1.8 cineole (12.66%), myrcene (9.29%), γ-muuroleno (4.95%), trans - β-farnesene (4.02%), which together totalize an average 70.61% of the essential oil of the varieties tested. Changes in the planting density had no significant influence on the major constituents regarding the essential oil of A. annua variety of Artemis F2. Concerning the different densities, the highest production of leaf biomass, artemisinin, artemisinin content in the dry mass of leaves and essential oil were obtained at densities of 93,966 plants ha-1, 80.0,71 plants ha-1, 81 969 plants ha-1 and 91,272 plants ha-1 respectively. The essential oil content in dry mass of leaves was not affected by the planting density. The alteration in planting density influenced the production of camphene, α-copaene, mirtenila acetate, γ-terpinene. Regarding all the planting densities, camphor was the major constituent with levels above 39% indicating that A. annua is an alternative source for the production of this substance. Monoterpenes were the most abundant class of compounds in essential oil of A. annua with 59.03% of the chemical constitution and 33.91% belong to the class of sesquiterpenes.
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Heterogeneidade genética de Anopheles darlingi e suas implicações para epidemiologia da malária

Lima, Melina Aulino Campos January 2016 (has links)
Orientador: Paulo Eduardo Martins Ribolla / Resumo: Degradação florestal, alterações ambientais antropogênicas e mudanças climáticas são fatores que podem modificar a dinâmica populacional de anofelinos. Anopheles (Nyssorhynchus) dar- lingi é o principal vetor de malária no Brasil e em outros países na América do Sul. Estudos observaram o aumento da abundância do vetor An. darlingi e número de casos de malária após desflorestação e demais modificações ambientais antropogênicas. Além de ter ampla distribuição geográfica, essa espécie possui plasticidade comportamental e diversidade morfo- lógica, biológica e genética. Tendo em vista essa heterogeneidade, o presente estudo avaliou a diversidade genética populacional em An. darlingi ligada a distribuição geográfica, dinâmica sazonal e comportamento hematofágico, através de marcadores microssatélites e SNPs. Espé- cimes de An. darlingi foram coletados em dois assentamentos rurais próximos e, em uma área urbana à aproximadamente 600 km de distância. Além disso, as coletas foram realizadas no primeiro e segundo semestre e, dentro e fora das casas, durante o período de atividade hema- tofágica do vetor, ou seja, das 18-6 horas. Os resultados apresentaram subpopulações de An. darlingi em aspecto geográfico, em escalas macro e microgeográficas, acessadas com mais pro- fundidade com os dados dos SNPs. Além disso, o estudo corroborou o prévio achado de duas subpopulações de An. darlingi relacionadas ao regime de chuvas. Por fim, pela primeira vez, a heterogeneidade genética em populações... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: Forest degradation, human environmental alteration and climate changes are all influence anopheline populations. Anopheles darlingi is the main vector of malaria parasite in Brazil and other countries of South America. Deforestation and others anthropogenic activities have been accompanied by sharp increases in both abundance of the primary malaria vector Anopheles darlingi and numbers of malaria cases. Besides it is widely distributed, this species display great behavioral plasticity and morphological, biological and genetic diversity. The aim of this study was to analyze population genetic diversity of An. darlingi related to geographical distribution, seasonal dynamics and hematophagic behavior, using microsatellites and SNPs markers. An. darlingi specimens were collected in two close rural settlements and in an urban area about 600 km away. In addition, collections were performed in both semesters of the year and, indoor and outdoor during the biting activity period of the vector, i.e., 6pm-6am. The results showed subpopulations of An. darlingi related to geographical aspect, in a macro and micro geographic scales, better accessed with SNPs dataset. Moreover, this study corroborated with a previous finding showing two subpopulations of An. darlingi related to rainfall. Finally, for the first time, genetic heterogeneity was found in sympatric populations of this vector, and it was associated with a phenotype of hematophagic behavior, endo and exophagy. These outcomes demon... (Complete abstract click electronic access below) / Doutor
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Artemisia annua L.: produção de biomassa, artemisinina, rendimento e composição de óleo essencial em função de diferentes variedades e densidades de plantio

Capelin, Diogo 28 February 2012 (has links)
CNPq / Artemisia annua L. é uma planta herbácea nativa da Ásia, muito utilizada como fonte de óleo essencial e artemisinina, uma lactona sesquiterpenica utilizada como princípio ativo antimalárico. Devido à grande demanda por esta molécula a busca pela melhoria da produção de A. annua é intensa. O objetivo deste estudo foi identificar a densidade de cultivo adequada para o maior rendimento de biomassa, artemisinina e óleo essencial, e a composição deste, além de comparar o desempenho produtivo de três variedades de A. annua para o cultivo na região Sudoeste do Paraná. Para isso, um experimento foi conduzido em delineamento de blocos ao acaso, com quatro repetições. Foram utilizadas três diferentes variedades de A. annua: Artemis F2, Artemis F1 e (2/39 x 5)x3M. Um segundo experimento foi conduzido com a variedade Artemis F2 em delineamento de blocos ao acaso, com três repetições. Os tratamentos utilizados foram: T1: 16.666 plantas ha-1, T2: 55.555 plantas ha-1, T3: 94.444 plantas ha-1 e T4: 133.333 plantas ha-1. Em pleno florescimento, o material vegetal dos dois experimentos foi colhido (aproximadamente 159 dias após o transplante) e seco até peso constante em estufa com circulação de ar a 35 ºC. A quantificação de artemisinina foi realizada por cromatografia em camada delgada com detecção por densitometria. A separação e quantificação das substâncias presentes no óleo essencial foram realizadas em cromatógrafo gasoso com detector de ionização de chama e, a identificação das mesmas foi feita em cromatógrafo a gás acoplado a espectrômetro de massas. Os resultados foram submetidos à análise da variância e ao teste de Tukey a 5% de probabilidade do erro para as variáveis qualitativas e a regressão do quadro da análise da variância para os tratamentos quantitativos. Todas as variedades testadas apresentaram elevada produção de massa seca de parte aérea, massa seca de folhas, produção de artemisinina e óleo essencial por área não diferindo estatisticamente ente si. As variedades Artemis F2 e Artemis F1 apresentaram maior relação folha/caule entre as variedades testadas. As variedades Artemis F1 e (2/39 x 5)x3M apresentaram maior teor de óleo essencial na matéria seca de folhas sendo mais recomendadas para o cultivo na região Sudoeste do Paraná, para fins de produção de óleo essencial. Os principais constituintes encontrados no óleo essencial das três cultivares foram a cânfora (39,69%), 1,8 cineol (12,66%), mirceno (9,29%), γ-muuroleno (4,95%), trans-b-farneseno (4,02%), que juntos somam em média 70,61% do óleo essencial das variedades testadas. Alterações na densidade de plantio não tiveram influência significativa sobre os constituintes majoritários do óleo essencial de A. annua variedade Artemis F2. Para as diferentes densidades as maiores produções de biomassa de folhas, artemisinina, teor de artemisinina na massa seca de folhas e óleo essencial foram obtidas nas densidades de 93.966 plantas ha-1, 80.0,71 plantas ha-1, 81.969 plantas ha-1 e 91.272 plantas ha-1 respectivamente. O teor de óleo essencial na massa seca de folhas não foi alterado pela densidade de plantio. A alteração na densidade de plantio influenciou na produção de canfeno, α-copaeno, acetato de mirtenila, γ- terpineno. Em todas as densidades de plantio a cânfora foi o constituinte majoritário com níveis superiores a 39% indicando que A. annua é uma fonte alternativa para a produção desta substância. Os monoterpenos foram a classe de compostos mais abundantes no óleo essencial de A. annua com 59,03% da constituição química e 33,91% pertence à classe dos sesquiterpenos. / Artemisia annua L. is a herbaceous plant native from Asia which is much used as a source of essential oil and artemisinin, a sesquiterpene lactone used as antimalarial active principle. The search in the improvement regarding the production of A. annua is intense due to the high demand for this molecule. The aim of this study was to identify the suitable planting density for a higher yield of biomass, artemisinin and essential oil, and the composition of this, and also compare the performance of three varieties of A. annua for cultivation in the Southwest region of Paraná. In order to this, an experiment was conducted in a randomized block design with four replications. Three different varieties of A. annua were used: Artemis F2, and Artemis F1 (2/39 x 5)x3M. A second experiment was conducted with Artemis F2 variety in a randomized block design with three replications. The treatments were: T1: 16.666 plants ha-1, T2: 55.555 plants ha-1, T3: 94.444 plants ha-1 and T4: 133.333 plants ha-1. The plant material of both experiments was harvested at flowering (approximately 159 days after transplantation) and dried until a constant weight in an oven with air circulation at 35 ° C. The quantification of artemisinin was performed by thin-layer chromatography and detected by densitometry. The separation and quantification of substances present in the essential oil were performed by gas chromatography with a flame ionization detector and the identification of them was performed by gas chromatography coupled to a mass spectrometer. The results were submitted to analysis of variance and Tukey's test at 5% of failure probability for qualitative variables and the regression of the analysis of variance for quantitative treatments. All the tested varieties showed an increasing production in relation to the dry mass of the aerial part, dry mass of leaves, artemisinin and essential oil production per area and they did not differ statistically between themselves. The varieties of Artemis F1 and Artemis F2 had a higher leaf/stem ratio among the varieties tested. The varieties of Artemis F1 and (2/39 x 5)x3M showed a higher content of essential oil in the dry mass of leaves, and due to this they are recommended for cultivation in the Southwest region of Paraná, for the essential oil production. The main compounds found in essential oils from the three cultivars were camphor (39.69%), 1.8 cineole (12.66%), myrcene (9.29%), γ-muuroleno (4.95%), trans - β-farnesene (4.02%), which together totalize an average 70.61% of the essential oil of the varieties tested. Changes in the planting density had no significant influence on the major constituents regarding the essential oil of A. annua variety of Artemis F2. Concerning the different densities, the highest production of leaf biomass, artemisinin, artemisinin content in the dry mass of leaves and essential oil were obtained at densities of 93,966 plants ha-1, 80.0,71 plants ha-1, 81 969 plants ha-1 and 91,272 plants ha-1 respectively. The essential oil content in dry mass of leaves was not affected by the planting density. The alteration in planting density influenced the production of camphene, α-copaene, mirtenila acetate, γ-terpinene. Regarding all the planting densities, camphor was the major constituent with levels above 39% indicating that A. annua is an alternative source for the production of this substance. Monoterpenes were the most abundant class of compounds in essential oil of A. annua with 59.03% of the chemical constitution and 33.91% belong to the class of sesquiterpenes.
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Estrutura e dinâmica genética das populações de Echinococcus vogeli e Echinococcus oligarthrus (Cestoda: Taeniidae)

Santos, Guilherme Brzoskowski dos January 2012 (has links)
A taxonomia dos cestóides do gênero Echinococcus está submetida a constante revisão. Dez espécies são atualmente aceitas para Echinococcus, duas delas são o Echinococcus oligarthrus, agente causador da equinococose unicística, e o Echinococcus vogeli, agente causador da equinococose policística e que parece ser a espécie mais patogênica do gênero. Existem haplótipos que ainda não foram determinados como espécies e permanecem dentro da categoria de variantes genéticas. Atualmente, os estudos genéticos em Echinococcus concentram-se na análise do DNA mitocondrial, um genoma que não recombina, de rápida evolução, e de herança materna na maioria dos animais. Além disso, esses estudos têm se concentrado em E. granulosus e E. multilocularis, usando uma ou poucas amostras de Echinococcus neotropical. Este estudo teve como objetivo analisar, utilizando sequências nucleares, a composição genética das duas espécies neotropicais, visando colaborar para a compreensão dos processos evolutivos do gênero Echinococcus e, consequentemente, contribuir para o correto manuseio do parasito nas regiões afetadas. No total, foram utilizados 45 isolados para extração de DNA e subsequentes análises, 38 E. vogeli, 4 E. oligarthrus, 1 E. granulosus, 1 E. ortleppi e 1 E. multilocularis. As espécies foram determinadas a partir da amplificação e análise da sequência parcial (366 pb) do gene mitocondrial da citocromo-oxidase (cox1). Para os 45 isolados, 6 diferentes alvos nucleares (P-29, EG10, AG4, Ir, Er e TGF) foram amplificados por PCR e os diferentes genótipos foram selecionados através da técnica de SSCP. Os loci mais polimórficos encontrados em E. vogeli foram Ag4 e E10, ambos com 2 alelos, e nos loci Ir, Er, P-29 e Tgf, com um alelo. E. oligarthrus tem alelos exclusivos para cinco dos seis loci nucleares analisados; contudo, o alelo T2, do locus Tgf, também está presente em seis isolados de E. vogeli. O fluxo gênico entre as metapopulações de E. vogeli das duas áreas geográficas parece ser restrito. Além disso, o fluxo gênico entre a população de E. oligarthrus e as demais populações é restrito. A AMOVA revelou que o nível mais significante de variabilidade genética ocorre dentro das metapopulações, o segundo nível mais significativo foi encontrado entre as metapopulações dentro das suprapopulações do Acre e Pará. Os isolados amostrados no estado do Acre parecem formar um “cluster” distinto. Além disso, foi possível verificar que os isolados de E. vogeli amostrados no estado do Pará também tendem a constituir um “cluster” único, mas de forma menos uniforme. Os 11 haplótipos mitocondriais de E. vogeli constituem um grupo monofilético e distinto de E. oligarthrus e das demais espécies do gênero. / Cestodes of the genus Echinococcus are subjected to a constant taxonomic revision. Ten species are currently accepted for the genus Echinococcus, two of them are Echinococcus oligarthrus, the agent of unicystic echinococcosis and Echinococcus vogeli, the agent of polycystic echinococcosis, which seems to be one of the most pathogenic species of Echinococcus. There are haplotypes that have not been determined as species and remain within the genetic variants category. Currently, the genetic studies on Echinococcus have focused on the analysis of mitochondrial DNA, a non-recombining, fast evolving and maternally inherited genome in most animals. Besides, these studies have been concentrated in the E. granulosus and E. multilocularis, using one or few samples from neotropical Echinococcus. This study aimed to analyze, using nuclear sequences, the genetic composition of the two neotropical species, which may support the understanding of evolutionary processes on the genus Echinococcus and, consequently, will contribute to the correct handling of the parasite in the affected regions. A total of 45 isolates were used for DNA extraction and further analyses, 38 E. vogeli, 4 E. oligarthrus, 1 E. granulosus, 1 E. ortleppi and 1 E. multilocularis. The species were determined by amplification and sequence analysis of a partial sequence (366 bp) of the mitochondrial cytochrome oxydase 1 gene (cox1). For the 45 isolates, 6 different nuclear targets (P-29, Eg10, Ag4, Ir, Er and Tgf) were amplified by PCR and the genotypes were screened by SSCP technique. In E. vogeli, the most polymorphic loci found were Ag4 and E10, both with 2 alleles, and the Ir, Er, P-29 and Tgf loci with 1 allele. E. oligarthrus has exclusive alleles for five of the six analyzed nuclear loci. However, the allele T2, from Tgf locus, is also present in six E. vogeli isolates. The gene flow between the metapopulations of E. vogeli seems to be restricted. In addition, the gene flow between the E. oligarthrus population and the other populations of E. vogeli is restricted. The AMOVA revealed that the most significant level of genetic variability occurs within metapopulations, and the second most significant level of variability was found among metapopulations within suprapopulations of Acre and Pará. Isolates sampled in Acre seems to form a distinct cluster. Furthermore, it was possible to verify that the E. vogeli isolates sampled in Pará also are likely to form a single "cluster", but less uniform. The 11 mitochondrial haplotypes of E. vogeli constitute a monophyletic group and distinct from E. oligarthrus and other Echinococcus species.

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