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Do Porto dos Casais a Porto Alegre : a trajetória demográfica e evolutiva de uma cidade revelada através de marcadores genéticos uniparentais

Guerreiro-Junior, Vanderlei Farias January 2007 (has links)
As populações da América pós-colombiana, em especial as populações brasileiras, foram estabelecidas principalmente através de cruzamentos envolvendo colonizadores europeus e mulheres ameríndias ou africanas. No entanto, têm sido descritas particularidades regionais e locais. Desta forma, este trabalho objetivou esclarecer os detalhes da formação da população de Porto Alegre através de dados genéticos. Para isto uma amostra de 290 indivíduos fenotipicamente identificados como brancos foi investigada com relação a marcadores de linhagens uniparentais maternos e paternos. Duzentos e três homens foram genotipados para doze marcadores bialélicos (single nucleotide polymorphisms - SNPs ) presentes na região não recombinante do cromossomo Y, sendo também seqüenciada a primeira região hipervariável (HVS-I) do DNA mitocondrial (mtDNA) de cento e setenta e dois indivíduos. Com relação aos marcadores do cromossomo Y a freqüência dos SNPs mostrou um cenário predominante de cromossomos europeus (~93%), sendo o restante de cromossomos possivelmente de origem africana. Além disso, mais de 51% dos cromossomos genotipados pertencem ao haplogrupo R1b3*, amplamente distribuído em populações ibéricas. Em consonância com este achado as análises dos dados apontaram para uma herança predominante dos colonizadores açorianos e portugueses, confirmando que o legado genético masculino da população de Porto Alegre tem origem em seus colonizadores históricos. Um cenário diferente foi encontrado para o mtDNA, pois além da presença européia (69%), também foram detectadas linhagens ameríndia (21%) e africana (10%). A avaliação das seqüências ameríndias mostrou a presença Guarani e também pela primeira vez, considerando-se uma amostra gaúcha, a herança Kaingang. Finalmente, os dados comparativos com uma amostra de negros revelaram a possibilidade de que distintas dinâmicas de mestiçagem ocorreram na formação da população porto-alegrense. / The post-Columbian American populations, especially Brazilians, are mainly the result of intercrossings between European males and Amerindian or African females. However, regional and local particularities have been described. The main objective of this investigation was to reveal details about the formation of the Porto Alegre population using genetic markers. A sample of 290 persons phenotypically classified as white was investigated in relation to several uniparental genetic systems. Two-hundred and three men were genotyped considering twelve biallelic loci (single nucleotide polymorphisms - SNPs) located in the non-recombinant region of the Y-chromosome, while the first hipervariable region (HVS-I) of the mitocondrial DNA (mtDNA) was sequenced in 172 individuals. The main origin of Y-chromosomes is European (~93%), the complementary fraction having a probable African origin. The Y-SNP haplogroup R1b3*, the most frequent in Iberian populations, is present in Porto Alegre with a frequency of 51%. These and other results show that the male contribution to this population is predominantly Azorean and Portuguese, confirming historical sources. A different scenario was oberved considering the mtDNA, because European (69%), Amerindian (21%) and African (10%) mtDNA sequences were identified. Restricting our attention to the sequences of Amerindian origin, it was Introdução possible to detect Guarani and for the first time considering a gaúcho sample, Kaingang heritages. The comparative analysis with a black sample revealed that distinct admixture dynamics have occurred in the formation of the Porto Alegre population.
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Sincronização em um modelo metapopulacional com a migração dependendo do tempo

Stroschein, Sandra Denise January 2009 (has links)
Como os assuntos relacionados à extinção de espécies e conservação da biodiversidade são de grande importância, devemos concentrar-nos em ações que visem a sua manutenção e perpetuação. Para isso, o trabalho propõe-se a estudar quais são as condições para que ocorra o fenômeno da sincronização causado pela migração, já que o risco de extinção de uma espécie pode aumentar quando temos sincronização no sistema. Neste sentido, obteremos um critério para a estabilidade do estado sincronizado sob determinadas condições. Como podemos modelar a migração dependente ou independente da densidade, primeiramente faremos um breve estudo sobre a migração dependente da densidade e veremos resultados recentes sobre a dinâmica de metapopulações. Em uma segunda etapa, iremos focar a migração independente da densidade. Para tal, supomos o processo migratório obedecendo à dinâmica sazonal. Admitimos inicialmente a partida de indivíduos através da fração migratória com dependência temporal e, após, consideramos uma fração constante, migrando conforme a distribuição dependente do tempo, representando a chegada. Para o desenvolvimento deste estudo, iremos modelar um sistema de n sítios discretos no tempo e no espaço, considerando a con guração da rede na forma unidimensional (anéis cíclicos) e a matriz de interação simétrica. / As the issues related to the species extinction and biodiversity are very important, we have to concentrate on actions that lead to their maintenance and perpetuation. My aim is to study the conditions which create the synchronization phenomenon caused by migration, having in mind that a species extinction risk may increase if there is synchronization in the system. In this sense, we are going to establish a criterion for the synchronized state's stability grounded on determined conditions. As we can pattern migration dependent or not on density, rst, we will brie y study the migration that depends on density. Then recent results about met populations dynamic will be obtained. On a second moment, the focus will be on migration independent on density. With this purpose, we suppose that the migration process is lead by a seasonal dynamic. At rst, we report us to the individuals departure throughout the migration fraction with temporal dependence. After, a constant fraction will be considered, migrating according to the distribution depended on time. It represents the arrival. In the development of this study, a system of n patches which are time and space bounded will be patterned. Thus, the net con guration on a one-dimensional shape (cyclical rings) and the symmetric interaction matrix will be considered.
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Grau de ativação e frequência das sub-populações de monócitos entre os pacientes com a forma multibacilar e paucibacilar da hanseníase

Franciscon, Giovana Bergheme 18 September 2013 (has links)
Submitted by Hiolanda Rêgo (hiolandar@gmail.com) on 2013-09-17T19:43:52Z No. of bitstreams: 1 Dissertação_ICS_ Giovana Bergheme Franciscon.pdf: 3239549 bytes, checksum: d4cc72276fd2113b602703dc9ee6e1a0 (MD5) / Approved for entry into archive by Patricia Barroso(pbarroso@ufba.br) on 2013-09-18T17:43:36Z (GMT) No. of bitstreams: 1 Dissertação_ICS_ Giovana Bergheme Franciscon.pdf: 3239549 bytes, checksum: d4cc72276fd2113b602703dc9ee6e1a0 (MD5) / Made available in DSpace on 2013-09-18T17:43:36Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Dissertação_ICS_ Giovana Bergheme Franciscon.pdf: 3239549 bytes, checksum: d4cc72276fd2113b602703dc9ee6e1a0 (MD5) / INCT – DT (Instituto Nacional de Ciência e Tecnologia – Doença Tropical) Processo Nº 573839/2008-5; CAPES. / INTRODUÇÃO: A hanseníase é uma doença de caráter granulomatoso e crônico causada pelo Mycobacterium leprae, o qual tem tropismo por nervos periféricos e pele. Apresenta-se de forma espectral e polarizada. Enquanto pacientes com a forma multibacilar (MB) da doença não montam uma resposta Th1 facilitando assim a multiplicação do Mycobacterium, indivíduos com a forma paucibacilar (PB) produzem IFN-gama em resposta a antígenos de M. leprae. Os monócitos são tipos celulares circulantes derivados da medula óssea que se diferenciam em macrófagos e células dendríticas no tecido. Recentemente, os monócitos circulantes foram classificados em clássicos (CD14++CD16-), intermediários (CD14++CD16+) e nãoclássicos (CD14+CD16++). O grau de ativação dessas células está associado à intensidade da resposta de linfócitos T. Objetivo: Determinar o grau de ativação das sub-populações de monócitos em pacientes com hanseníase antes e durante o tratamento e identificar o perfil do grau de incapacidade funcional apresentado pelos pacientes incluídos no estudo. Metodologia: Foram coletados 20 ml de sangue heparinizado de pacientes PB (n=22) e MB (n=12) e realizada a separação de células mononucleares e a caracterização e o grau de ativação dos monócitos foi determinado por citometria de fluxo através da marcação de CD14, CD16, MHC II, CD80, CD86 e CD40. Resultados: Os pacientes com a forma multibacilar apresentaram a frequência de monócitos não-clássicos aumentada. Não houve diferença na expressão de CD80 e MHC II entre monócitos de pacientes com a forma paucibacilar e multibacilar da hanseníase. No entanto, monócitos de pacientes com a forma paucibacilar apresentaram uma baixa expressão de CD86 antes de iniciar o tratamento, a qual foi restaurada durante o tratamento. A maioria dos pacientes apresentaram grau zero de incapacidade funcional. Conclusão: Pacientes com a forma paucibacilar da hanseníase apresentam uma diminuição do grau de expressão da molécula co-estimulatória CD86 a qual é restaurada durante o tratamento com a PQT. Todos os pacientes não apresentaram alteração no grau de incapacidade funcional devido à hanseníase. / Salvador
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Estrutura e dinâmica de populações de espécies arbóreas de uma floresta Estacional Semidecidual Aluvial em Viçosa – MG / Structure and dynamics of arboreal species populations of an Alluvial Semideciduous Seasonal forest in Viçosa, MG

Silva, Sheila Souza da 27 February 2003 (has links)
Submitted by Marco Antônio de Ramos Chagas (mchagas@ufv.br) on 2016-10-13T12:53:52Z No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 367979 bytes, checksum: 60a8e16cc544d3eb5293da494ac845ba (MD5) / Made available in DSpace on 2016-10-13T12:53:52Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 367979 bytes, checksum: 60a8e16cc544d3eb5293da494ac845ba (MD5) Previous issue date: 2003-02-27 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / Muito pouco é conhecido sobre a sucessão em Florestas Estacionais Semideciduais Aluviais e sobre as taxas de natalidade, mortalidade e crescimento de populações de espécies arbóreas. Portanto, o objetivo desse trabalho foi analisar a composição florística e estrutural através de um censo e determinar as alterações ocorridas num intervalo de quatro anos entre os anos de 1998 e 2002 em uma Floresta Estacional Semidecidual Aluvial, que está em processo de sucessão secundária, verificando-se a posição sucessional e as taxas de natalidade, mortalidade e crescimento das populações de espécies arbóreas nessa floresta. Foi realizado um censo dos indivíduos com, no mínimo, 10cm de CAP em uma área de 0,175ha. Utilizou-se a análise da distribuição diamétrica para verificar as alterações ocorridas entre os dois levantamentos e a classificação sucessional das espécies foi feita a partir da taxa de crescimento das populações. Foram encontradas 52 espécies distribuídas em 26 famílias botânicas, que corresponde ao acréscimo de 2 espécies e 1 família ao levantamento de 1998. Foram levantados 391 indivíduos, 13 a mais que em 1998, resultando em uma densidade total estimada em 2.234 indivíduos por hectare. O índice de diversidade de Shannon variou de 2,99 para 3,06 em 2002 e a equabilidade manteve-se estável. Os indivíduos mortos corresponderam a 8,44% do total, sendo esse percentual considerado alto em relação a 1998 (3,17%) demonstrando dinâmica acentuada no processo sucessional do fragmento estudado, o que também foi verificado com os dados da distribuição de freqüências em classes de diâmetro e o aumento da biomassa, de 198,25m 3 /0,175ha em 1998 para 208,11m 3 /ha em 2002, e da área basal por hectare, de 80,38m 2 para 82,88m 2 . As espécies cujas populações apresentaram taxa de crescimento maior que 10% foram classificadas como secundárias tardias, as que apresentaram taxa de crescimento entre –10% e 10% foram as secundárias iniciais e as que apresentaram taxa de crescimento menor que –10% foram classificadas como pioneiras. As espécies classificadas com secundárias tardias foram: Abutilon sellovianum, Allophylus edulis, Annona cacans, Coffea arabica, Endlicheria paniculata, Guarea kunthiana, Ficus guaranitica, Inga laurina, Machaerium nyctitans, Peschieria laeta, Piper arboreum, Piper caldense, Piper gaudichaudianum, Piper lhotzkyanum, Sapium bigladulosum, Rollinia sericea, Siparuna reginae, Sorocea bonplandii e Trichilia pallida. Dentre as secundárias iniciais encontram-se: Alchornea iricurana, Alsophila sternbergii, Cabralea canjerana, Casearia sylvestris, Cecropia glaziovi, Cestrum coriaceum, Euterpe edulis, Ficus citrifolia, Ficus luschnathiana, Hyeronima alchorneoides, Luehea grandiflora, Machaerium floridum, Myrcia eriopus, Nectandra rigida, Piper aduncum, Randia armata, Solanum cernuum, Swartzia myrtifolia e Talauma sellowiana. As espécies classificadas como pioneiras foram: Allophylus petiolatus, Andira fraxinifolia, Copaifera langsdorffii, Cyathea delgadii, Erythrina falcata, Ficus trigona, Maclura tinctoria, Matayba elaeagnoides, Mollinedia floribunda, Myrcia fallax, Piper sp, Plathymenia foliolosa, Protium warmingiana, Rollinia laurifolia, Schinus terebinthifolius, Syagrus romanzoffiana, Tibouchina granulosa, Trichilia emarginata, Trichilia lepidota, Vernonia rubriramea e Xylopia sericea. Os dados obtidos demonstram que houve evolução do processo sucessional nesta Floresta Estacional Semidecidual Aluvial entre 1998 e 2002 e que a comunidade deverá passar por um intenso processo de substituição entre as populações mais densas, pois as populações com crescimento positivo e que apresentaram os maiores valores de densidade em 1998 devem assumir as posições estruturais de maior importância com o avanço desse processo sucessional. / Little is know about the succession in Alluvial Semideciduous Seasonal Forests and about the natality, mortality and growth rates of arboreal species populations. Therefore, the objective of this work was to analyse the floristic and structural composition using a survey and to determine the changes which ocurred during a period of four years, between 1998 and 2002, in an alluvial Semideciduous Seasonal Forest which is in a secondary successional process, to verify the successional position and the natality, mortality and growth rates of the arboreal species populations in this forest. A survey of the individuals with a minimum of 10 cm at DBH in an area of 0,175 ha was carried out. The diametric distribuition analysis was used to check the changes which ocurred between the two survey. The successional classification of the species was made based on the growth rate of the populations. A total of 52 species among 26 botanic families were found in 2002. That corresponds to an addition of two species and on family to the 1998 survey. A total of 391 individuals were surveyed, 13 more than in 1998, which resulted in an estimated total density of 2,234 individuals per hectare. The Shannon diversity index varied from 2.99 to 3.06 in 2002 and the equability remained stable. The dead individuals corresponded to 8.44% of the total and this percentage is considered as high in relation to 1998 (3.17%) showing outstanding dynamics in the successional process of the studied fragment. This was also verified with the frequency distribuition data in diameter classes and with the biomass increase, from 198.25m 3 /0.175 ha in 1998 to 208.11m 3 /0.175 ha in 2002, and of the based area per hectare, from 80.38m 2 to 82.88m 2 . the species which showed a growth rate greater than 10% were classified as late secondaries. Those that showed a growth rate between –10 and 10% were classified as initial secondaries, and those that showed a growth rate smaller than –10% were classified as pioneers were: Abutilon sellovianum, Allophylus edulis, Annona cacans, Coffea arabica, Endlicheria paniculata, Guarea kunthiana, Ficus guaranitica, Inga laurina, Machaerium nyctitans, Peschiera laeta, Piper arboreum, Piper caldense, Piper gaudichaudianum, Piper lhotzkyanum, Sapium bigladulosum, Rollinia sericea, Siparuna reginae, Sorocea bonplandii and Trichilia pallida. Among the initial secondary individuals there were: Alchornea iricurana, Alsophila sternbergii, Cabralea canjerana, Casearia sylvestris, Cecropia glaziovi, Cestrum coriaceum, Euterpe edulis, Ficus citrifolia, Ficus luschnathiana, Hyeronima alchorneoides, Luehea grandiflora, Machaerium floridum, Myrcia eriopus, Nectandra rigida, Piper aduncum, Randia armata, Solanum cernuum, Swartzia myrtifolia and Talauma sellowiana. The species classified as pioneers were: Allophylus petiolatus, Andira fraxinifolia, Copaifera langsdorffii, Cyathea delgadii, Erythrina falcata, Ficus trigona, Maclura tinctoria, Matayba elaeagnoides, Mollinedia floribunda, Myrcia fallax, Piper sp, Plathymenia foliolosa, Protium warmingiana, Rollinia laurifolia, Schinus terebinthifolius, Syagrus romanzoffiana, Tibouchina granulosa, Trichilia emarginata, Trichilia lepidota, Vernonia rubriramea e Xylopia sericea. Data obtained showed that there was an evolution of the successional process in this Alluvial Semideciduous Seasonal Forest between 1998 and 2002 and that the community will go through an intensive process of substitution within the thickest populations, because the populations with a positive growth and which showed the greatest density values in 1998 probably will occupy the structural positions of greater importance with the progress of this successional process. / Dissertação importada do Alexandria
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Respondent driven sampling (RDS) aplicado à população de homens que fazem sexo com homens no Brasil / Respondent driven sampling (RDS) applied to the population of men who have sex with men in Brazil

Mota, Rosa Maria Salani January 2012 (has links)
MOTA, Rosa Maria Salani. Respondent Driven Sampling (RDS) aplicado à população de homens que fazem sexo com homens no Brasil. 2012. 189 f. Tese (Doutorado em Saúde Pública) - Universidade Federal do Ceará. Faculdade de Medicina, Fortaleza, 2012. / Submitted by denise santos (denise.santos@ufc.br) on 2014-01-13T11:52:45Z No. of bitstreams: 1 2012_tese_rmsmota.pdf: 6131750 bytes, checksum: cb9fb63c55db61f8c6b8276aaa755008 (MD5) / Approved for entry into archive by denise santos(denise.santos@ufc.br) on 2014-01-13T11:53:07Z (GMT) No. of bitstreams: 1 2012_tese_rmsmota.pdf: 6131750 bytes, checksum: cb9fb63c55db61f8c6b8276aaa755008 (MD5) / Made available in DSpace on 2014-01-13T11:53:07Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2012_tese_rmsmota.pdf: 6131750 bytes, checksum: cb9fb63c55db61f8c6b8276aaa755008 (MD5) Previous issue date: 2012 / The estimators for population parameters in samples collected by sampling Respondent Driven Sampling (RDS) are sensitive to the presence of observations ignored and tends to underestimate the population parameters. The absence of a clearly defined sampling frame for the collection of samples from populations considered hidden and/or difficult access made the RDS became an important tool for biological and behavioral surveillance in these populations at higher risk for HIV, especially Brazil. Considered a method of sampling in the reference chain, RDS uses information about the connections of social networks for specific asymptotically unbiased estimators of population characteristics and accuracy of these estimators. Multicenter cross-sectional epidemiological and behavioral surveillance for MSM populations in 18 years or more was conducted in 10 cities (Manaus, Recife, Salvador, Campo Grande, Brasilia, Curitiba, Itajaí, Santos, Belo Horizonte and Rio de Janeiro) in 2009 and collected in each municipality, a sample through RDS. This study offered the rapid test for diagnosis of HIV infection to those who agreed to participate in a pre-counseling. All participants were asked about testing for HIV prior to the research and about which the diagnosis obtained. By simulating a dichotomous variable (eg, HIV serology positive or negative) without comment ignored in recruiting network in Rio de Janeiro and later recruited 18 deletions, that is, the unknown sample is evaluated from a number of observations significantly smaller than the original sample and the parameter in question (HIV prevalence) is underestimated. Still, with the allocation of single serology ignored in the descriptive context, it is observed in samples with attribution, biological markers indicating that more accurate values. Multicentre study for the group of participants who self-reported positive or negative serology for HIV rapid test and performed the research notes to self-reports, high correlation (0.88) and 100% sensitivity with gold standard rapid test for HIV diagnosis. Finally, estimating the prevalence of HIV in the samples observed by county and general, and the proposed allocation of the self-reported HIV positive and HIV serology subsequent assignment of + / - through three proposed charges: are all negative, proximity of the participants in the network recruitment and by logistic regression. It is found in samples collected from the estimated overall HIV prevalence was equal to 11.1%, by municipality, the lower prevalence in Santos (2.6%) and highest in Rio de Janeiro (17.6%).With the charges tend to increase the prevalence and the highest estimates are found with the imputation logistic regression in 7 of 9 municipalities assessed by this methodology. The estimated overall HIV logistic regression is 14.2% and, by municipality, the lower prevalence in Recife (5.2%) and highest in Brasilia (23.7%). The allocation of serology for HIV by the Logistic Regression occurs by municipality and by a model with a minimum accuracy of 70%. / Os estimadores para parâmetros populacionais em amostras coletadas pelo método de amostragem Respondent Driven Sampling (RDS) são sensíveis à presença de observações ignoradas e tendem a subestimar os parâmetros populacionais. A ausência de um quadro de amostragem bem definido para a coleta de amostras em populações consideradas escondidas e/ou de acesso difícil fez com que o RDS se tornasse uma importante ferramenta de vigilância comportamental e biológica nessas populações com maior risco para o HIV, em especial no Brasil. Considerado um método de amostragem em cadeia de referência, o RDS utiliza informações sobre as conexões das redes sociais para obter estimadores contingentes assintoticamente imparciais das características populacionais e a precisão desses estimadores. Estudo multicêntrico de corte transversal para vigilância epidemiológica e comportamental em populações de HSH com 18 anos ou mais foi realizado em dez cidades brasileiras (Manaus, Recife, Salvador, Campo Grande, Brasília, Curitiba, Itajaí, Santos, Belo Horizonte e Rio de Janeiro) no ano de 2009 e, coleta, em cada município, uma amostra pelo RDS. Neste estudo, foi oferecido o teste rápido para diagnóstico da infecção por HIV àqueles que aceitam participar de um pré-aconselhamento. Todos os participantes foram inquiridos sobre a realização de testes anti-HIV anteriores ao da pesquisa e sobre qual o diagnóstico obtido. Com a simulação de uma variável dicotômica (exemplo: sorologia para HIV positiva ou negativa) sem observações ignoradas na rede de recrutamento do Rio de Janeiro e posteriores exclusões de 18 recrutados, encontra-se que, a amostra com ignorados é avaliada com base em um número de observações significativamente menor que o da amostra original e o parâmetro em questão (prevalência do HIV) é subestimado. Ainda, com a imputação única das sorologias ignoradas, no contexto descritivo, observam-se, nas amostras com imputação, marcadores biológicos que indicam valores mais acurados. No estudo multicêntrico, para o grupo de participantes que autorrelatou sorologia positiva ou negativa para o HIV e realizou teste rápido na pesquisa, observa-se para os autorrelatos elevada concordância (0,88) e sensibilidade de 100% com o padrão-ouro teste rápido para diagnóstico do HIV. Finalmente, estimando a prevalência para o HIV nas amostras observadas por município e geral, e, com a proposta da imputação pelo autorrelato do HIV positivo e posterior atribuição de sorologia HIV +/- mediante três propostas de imputações: todos são negativos, proximidade dos participantes na rede de recrutamento e pela regressão logística. Encontra-se nas amostras coletadas a estimativa geral da prevalência do HIV igual a 11,1% sendo, por município, a menor prevalência em Santos (2,6%) e a maior no Rio de Janeiro (17,6%). Com as imputações as prevalências tendem a aumentar e as maiores estimativas são encontradas com a imputação por meio da regressão logística em sete de nove municípios avaliados por essa metodologia. A estimativa geral do HIV pela regressão logística é 14,2% sendo, por município, a menor prevalência no Recife (5,2%) e a maior em Brasília (23,7%). A imputação da sorologia de infecção por HIV pela regressão logística ocorre por município e por intermédio de um modelo com acurácia mínima igual a 70%.
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Conforto térmico de frangos de corte em galpões com sistema de nebulização / Thermal comfort of broiler chickens in sheds with misting system

Queiroz, Marília Lessa de Vasconcelos January 2014 (has links)
QUEIROZ, M. L. V. Conforto térmico de frangos de corte em galpões com sistema de nebulização. 2014. 177 f. Dissertação (Mestrado em Engenharia Agrícola) - Centro de Ciências Agrárias, Universidade Federal do Ceará, Fortaleza, 2014. / Submitted by Daniel Eduardo Alencar da Silva (dealencar.silva@gmail.com) on 2015-01-30T21:06:18Z No. of bitstreams: 1 2014_dis_mlvqueiroz.pdf: 6311774 bytes, checksum: ec2398c810bed9ca353aeaab4b4b3b10 (MD5) / Approved for entry into archive by Margareth Mesquita(margaret@ufc.br) on 2015-02-09T14:09:35Z (GMT) No. of bitstreams: 1 2014_dis_mlvqueiroz.pdf: 6311774 bytes, checksum: ec2398c810bed9ca353aeaab4b4b3b10 (MD5) / Made available in DSpace on 2015-02-09T14:09:35Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2014_dis_mlvqueiroz.pdf: 6311774 bytes, checksum: ec2398c810bed9ca353aeaab4b4b3b10 (MD5) Previous issue date: 2014 / Para os animais expressarem melhor suas características genéticas é necessário que estejam em um ambiente favorável para isso. Apesar de no Estado do Ceará haver condições ambientais favoráveis à produção de frangos de corte, as temperaturas elevadas predominam durante todo o ano. O mecanismo de controle da temperatura corporal das aves só é eficiente quando a temperatura do ambiente se encontra dentro de certos limites. A combinação de elevadas temperaturas e elevada umidade relativa do ar pode afetar o bem-estar das aves e se tornar um fator limitante para a produção. Sendo assim, o objetivo deste trabalho foi avaliar o ambiente de galpões avícolas, medindo temperatura e umidade relativa do ar para o cálculo do Índice Entalpia de Conforto, assim também como a medição da temperatura da cama das aves, luminosidade e velocidade do vento para elaboração de mapas de krigagem, assim também como monitorar variáveis fisiológicas (temperatura retal e frequência respiratória), o comportamento das aves e o ganho de peso. As avaliações foram feitas durante a época seca, no período da manhã e da tarde, em dois galpões idênticos, através de ferramentas da zootecnia de precisão. Os dados de temperatura da cama, luminosidade e velocidade do vento foram analisados através da geoestatística e, posteriormente, foram elaborados mapas com os perfis da distribuição espacial destas variáveis ao longo dos galpões. Com os mapas foi possível observar que em alguns locais a temperatura da cama das aves apresentou valores muito elevados, chegando a 33,8 oC aos 42 dias de uso do galpão, temperatura considerada elevada e que pode gerar desconforto térmico às aves e prejudicar as trocas térmicas por condução. Os mapas de krigagem também mostraram que o sistema de ventilação não distribuiu a ventilação de forma homogênea. A maior média da velocidade do vento foi 2,6 m.s-1. As medidas da temperatura retal e da frequência respiratória das aves na 5ª e 6ª semana foram consideradas elevadas e indicaram uma condição de estresse térmico. A avaliação do etograma demonstrou que as aves diminuíram o tempo gasto na alimentação e aumentaram o tempo de ócio, da 5ª para a 6ª semana. Esta queda no consumo provavelmente aconteceu devido à condição de estresse térmico a que as aves estavam submetidas. Todos esses fatores avaliados refletiram negativamente no ganho de peso dos animais, que tiveram o peso abaixo do esperado para a linhagem estudada.
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Como os cágados sobrevivem e se reproduzem na caatinga? Aspectos da história de vida de Phrynops tuberosus (Testudines: Chelidae) / How the freshwater turtles survive and reproduce in caatinga? - Life history traits of Phrynops tuberosus (Testudines: Chelidae)

Rodrigues, João Fabrício Mota January 2013 (has links)
RODRIGUES, João Fabrício Mota. Como os cágados sobrevivem e se reproduzem na caatinga? Aspectos da história de vida de Phrynops tuberosus (Testudines: Chelidae). 2013. 54 f. Dissertação (Mestrado em ecologia e recursos naturais)- Universidade Federal do Ceará, Fortaleza-CE, 2013. / Submitted by Elineudson Ribeiro (elineudsonr@gmail.com) on 2016-05-20T18:29:46Z No. of bitstreams: 1 2013_dis_jfmrodrigues.pdf: 1163460 bytes, checksum: 761d0697c32e92f333485e0489d72fe9 (MD5) / Approved for entry into archive by José Jairo Viana de Sousa (jairo@ufc.br) on 2016-05-27T20:34:43Z (GMT) No. of bitstreams: 1 2013_dis_jfmrodrigues.pdf: 1163460 bytes, checksum: 761d0697c32e92f333485e0489d72fe9 (MD5) / Made available in DSpace on 2016-05-27T20:34:43Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2013_dis_jfmrodrigues.pdf: 1163460 bytes, checksum: 761d0697c32e92f333485e0489d72fe9 (MD5) Previous issue date: 2013 / The life history theory studies the characteristics combinations that maximize the organisms reproduction and survival in the environment where they live. The species use the habitat in a diverse way and this use depends on the environmental conditions in the available habitats. Phrynops tuberosus, a freshwater turtle found in the north-northeastern regions of Brazil, is the animal-model chosen for the life history traits and habitat use studies. This work aims understand how this species reproduce, maintain and use the habitat in Caatinga. The study generated biological and ecological knowledge of the species and allowed the testing of hypotheses and predictions of life history traits, sexual dimorphism and habitat use. Selection of clutching sites, males smaller than females and preference of larger animals for environments most exposed were found in the populations studied. The results facilitate understanding of reproduction and survival of turtles in a semiarid environment. / A teoria de história de vida estuda as combinações de características que maximizam a reprodução e a sobrevivência dos organismos no ambiente onde vivem. As espécies utilizam o ambiente de modo diverso, e esse uso depende das condições existentes nos hábitats disponíveis. Phrynops tuberosus, cágado encontrado nas regiões norte-nordeste do Brasil, é o animal-modelo escolhido para o estudo dos traços de história de vida e de uso de hábitat. Esse trabalho objetiva entender como a espécie se reproduz, organiza-se e utiliza o hábitat na caatinga. O estudo gerou conhecimentos biológicos e ecológicos da espécie e permitiu o teste de hipóteses e previsões sobre traços de história de vida, dimorfismo sexual e uso de hábitat. Seleção de locais de desova, machos menores que fêmeas e preferência de animais maiores por ambientes mais expostos foram encontradas nas populações estudadas. Os resultados encontrados facilitam a compreensão da reprodução e da sobrevivência dos quelônios em um ambiente do semiárido.
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Análise da sincronização de uma metapopulação com acoplamento por combinação convexa.

Arsego, Sabrina January 2010 (has links)
Este trabalho versara sobre dinâmicas populacionais. Nesse contexto, a população é dita metapopulação. Essa e descrita como um conjunto discreto de fragmentos de habitats, denominados sítios, os quais, supostamente, apresentam condições ideais para reprodução e sobrevivência dos indivíduos. Considere-se inicialmente uma Única espécie, distribuída em n sítios, formando uma metapopulação. A cada geração, os indivíduos passam por dois processos distintos: a dinâmica local, composta pelos processos de reprodução e sobrevivência, e a migração. Tendo ocorrido a dinâmica local, dá-se inicio ao processo migratório. Desta forma, os indivíduos de um dado sitio j podem deslocar-se para outro sitio i, de acordo com a topologia da rede. Neste trabalho, optou-se por utilizar uma topologia obtida através de uma combinação convexa de dois anéis cíclicos, um de conexão global e outro de conexão local. Com esse aumento na conectividade entre os sítios, surge o que, biologicamente, e chamado de corredor. Os corredores são faixas de terra que facilitam a movimentação das espécies entre áreas fragmentadas, porem o seu use e sua eficácia geram ainda muitas divergências entre os - pesquisadores, pois não existem estudos totalmente conclusivos sobre seus resultados. Facilitando a viabilidade dos indivíduos entre os sítios, e possível aumentar a migração e com isso dar inicio ao processo de sincronização. A certificação desse fenômeno em uma metapopulação feita através do calculo do Número de Lyapunov Transversal, que esta relacionado com movimentação das espécies entre os sítios. Neste trabalho, procurou-se analisar a influencia da migração, sendo ela independente ou dependente da densidade populacional juntamente com a topologia da rede escolhida, na obtenção ou não da sincronização. / This work deals with dynamics of populations. In this context the population is named metapopulation. Metapopulation is a discrete set of habitat fragments, which we call patches, and we assume they present ideal conditions for the individuals to breed and survive. We will consider initially a unique species, distributed in n patches, which constitutes a metapopulation. In each generation the individuals pass through two different processes: one is the local dynamics, composed by the reproduction and the survival, and the other, migration process. When the local dynamics occurred, the migratory process begins, so that the individuals of a given patch can move to another patch, following the net topology. In this work we decided to use a topology obtained by a convex combination of two cyclic rings, one of them with global connection and the other with local one. Through this enlargement of connectivity between the patches, it appears what, biologically is named corridor. The corridors are land strips that facilitate species movimentation between fragmentated areas, but the researchers do not totally agree about corridors, since the studies of their availabity are not conclusive. If we ease the passage of the individuals between the patches, it is possible to improve the migration, and then to start a synchronization process. The certification of that phenomenon in a metapopulation is performed by the computation of Transversal Liapunov Number, which is related to the movement of the species between the patches. In this work we also aim to analyze how the migration influences the synchronization when it is either density-dependent or density-independent of the population, taken into account the chosen net topology.
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História genética dos gaúchos : dinâmica populacional do sul do Brasil

Marrero, Andrea Rita January 2006 (has links)
Visando avaliar a extensão da diversidade genética do povo gaúcho, e com isso resgatar parte de sua história, foi realizado um estudo envolvendo 547 indivíduos, sendo 278 Nativos Americanos (Guarani e Kaingang) e 269 provenientes de populações miscigenadas do Rio Grande do Sul (RS). Foram estudados marcadores uniparentais de herança materna e paterna utilizando os seguintes sistemas: a) seqüenciamento da região hipervariável I (HVS I) do DNA mitocondrial (mtDNA), determinação de RFLPs (Restriction Fragment Length Polymorphisms) e mini-seqüenciamento da porção codificadora, envolvendo os quatro principais haplogrupos mitocondriais ameríndios (A, B, C e D); b) sete polimorfismos de base única (SNPs) (DYS199, M242, M9, 92R7, sY81, M19 e RPS4Y711), uma inserção Alu (YAP) e onze microssatélites (DYS19, DYS389 I, DYS389 II, DYS390, DYS391, DYS392, DYS393, DYS437, DYS438, DYS439 e DYS385a/b), todos localizados na região não recombinante do cromossomo Y. Além desses marcadores uniparentais, foram obtidos dados para 16 microssatélites do cromossomo X (DXS1001, DXS1047, DXS1060, DXS1068, DXS1073, DXS1106, DXS1214, DXS1226, DXS1227, DXS8051, DXS8055, DXS986, DXS987, DXS990, DXS991 e DXS993).Analisaram-se 200 Guarani de três parcialidades (Ñandeva, Kaiowá e M’Byá) e 78 Kaingang do Paraná e Rio Grande do Sul, visando identificar diferenças entre as duas tribos, que possam ter ocorrido ao longo do processo histórico. Dezenove linhagens mitocondriais foram detectadas e estas mostraram distribuição diferenciada. A dinâmica de mestiçagem que ocorreu com os Guarani e Kaingang ao longo do tempo foi diversa. O ingresso de genes não-nativos entre as comunidades Guarani foi marcadamente restrito a homens não-ameríndios, enquanto entre os Kaingang há evidências diretas de introdução através do lado materno. Este estudo permitiu desvendar detalhes até então não conhecidos sobre estas duas populações nativas do Rio Grande do Sul, para a história do Estado e para a formação das populações gaúchas atuais. Já os estudos de populações não-indígenas (N=225) revelaram 94% dos cromossomos no RS como tendo origem européia, 4% ameríndia e 2% africana. Ao levar em consideração as distintas populações aqui investigadas, as quais diferem significativamente em histórias demográficas e de mistura, constatou-se que na Serra 100% das patrilinhagens são de origem européia, enquanto no Pampa há uma parcela decontribuição ameríndia (8%) e africana (4%), embora a maior parte seja de cromossomos Y europeus. Os microssatélites (STR) dos cromossomos X e Y foram tipados apenas para a amostra do Pampa: para os Y-STRs (N=89), 81 haplótipos foram identificados, dos quais 74 deles (91%) são únicos. Comparando-se estes dados com outros previamente publicados para portugueses, espanhóis, italianos, alemães, africanos e outras populações brasileiras, observou-se a importante contribuição de ibéricos, particularmente de espanhóis, na atual formação masculina do Pampa. Para os X-STRs (N=70) o número de alelos variou de 1 a 14 e os níveis de heterozigosidade entre 0.5565 e 0.8817. Nenhum haplótipo foi encontrado mais de uma vez, indicando que existe uma grande diversidade no Pampa gaúcho. Com relação aos resultados obtidos para o mtDNA, no RS como um todo (N=225) foram identificadas matrilinhagens européias (63%), ameríndias (30%) e africanas (7%). Porém, da mesma forma que para as patrilinhagens, a distribuição destas variou de acordo com a região estudada. Na Serra 97% dos haplogrupos mitocondriais são característicos de populações européias e apenas 3% têm origem ameríndia. Já no Pampa 51%, 38% e 11% das linhagens mitocondriais têm, respectivamente, origem ameríndia, européia e africana. Considerando-se apenas as linhagens de origem ameríndia, verificou-se que estão assim distribuídas: A – 30%, B – 31%, C – 31% e D – 8%. A marcante diferença nas distribuições destes haplogrupos, quando comparadas com os Guarani bem como com outros resultados, apontaram para a idéia de que outros grupos nativos (principalmente os Charrua), através de suas mulheres, teriam contribuído de maneira marcante para a formação das populações gaúchas contemporâneas. Foi possível verificar ainda que o legado ameríndio (Charrua e Guarani), tão marcadamente presente na cultura gaúcha tradicional, também pode ser visto em nível genômico, num exemplo extraordinário de continuidade genética e cultural entre populações nativas e miscigenadas. / To evaluate the extension of Gaucho genetic diversity of the Gauchos, and retrieve part of their history, a study with 547 individuals, of which 278 were Native Americans (Guarani and Kaingang) and 269 admixed from the state of Rio Grande do Sul, was carried out. Uniparental markers, of maternal and paternal inheritance, were studied by using the following systems: a) Mitochondrial DNA (mtDNA) Hypervariable Sequence I sequencing (HVS I), RFLP (Restriction Fragment Length Polymorphisms) determinatins and minisequencing of the coding region, involving the four major mitochondrial Amerindian haplogroups (A, B, C and D); b) seven Single Nucleotide Polymorphisms (SNPs) (DYS199, M242, M9, 92R7, sY81, M19 and RPS4Y711), one Alu insertion (YAP) and eleven microsatellites (DYS19, DYS389 I, DYS389 II, DYS390, DYS391, DYS392, DYS393, DYS437, DYS438, DYS439 and DYS385a/b), all of them located in the nonrecombining region of the Y chromosome (NRY). In addition to these uniparental markers, data for 16 microsatellites of the X chromosome were obtained ((DXS1001, DXS1047, DXS1060, DXS1068, DXS1073, DXS1106, DXS1214, DXS1226, DXS1227, DXS8051, DXS8055, DXS986, DXS987, DXS990, DXS991 and DXS993). Two hundred Guarani of three partialities (Ñandeva, Kaiowá e M’Byá) and 78 Kaingang from Paraná and Rio Grande do Sul were analyzed, aiming to identify differences between the two tribes, that might have occurred during their long historical process. Nineteen mitochondrial lineages were detected and these showed a distinct distribution. The admixture dynamics that occurred along the time with the Guarani and Kaingang was diverse. The introduction of non-native genes in Guarani communities was markedly restricted to non-Amerindian males, while among the Kaingang there are direct evidences of introduction by the maternal side. This study allowed to reveal details that, until now ,were not known about these two Rio Grande do Sul native populations, which had contributed to the state’s history and the formation of the contemporary Gaucho population. The studies with non-native populations (N=225) revealed that 94% of the Y chromosomes have European, 4% Amerindian and 2% African origins. When considering the distinct populations here investigated, which significantly differ in their demographic and admixture histories, it was detected that in the Serra 100% of the patrilineages haveEuropean origin, while in the Pampa there is a fraction of Amerindian (8%) and African (4%) contributions, although the majority is of European origin. The microsatellites (STRs) X and Y were typed only in the Pampa sample: 81 haplotypes were identified for the Y-STRs (N=89), of which 74 (91%) are unique. Comparing these data with previously published results from Portuguese, Spanish, Italian, German, African and other Brazilian populations, it is noteworthy the major contribution of Iberian, particularly the Spaniards, in the present male fraction of the Pampa. For the X-STRs (N=70) the number of alleles varied from 1 to 14 and the levels of heterozygosity varied between 0.5565 and 0.8817. No haplotype was found more than once, indicating that there is a great diversity in the Gaucho. When considering the mtDNA data, in the RS as a whole (N=225) European (63%), Amerindian (30%) and African (7%) matrilineages were identified. But in the same way as in the patrilineages, their distribution has much variation according to the studied region. In the Serra 97% of the mitochondrial haplogroups are typical of European populations and only 3% have Amerindian origin. On the other hand, in the Pampa 51%, 38% and 11% of the mitochondrial lineages have Amerindian, European and African origins, respectively. When only Amerindian origin lineages were considered, it was verified that they are distributed as follows: A – 30%, B – 31%, C – 31% and D – 8%. The marked difference in these haplogroups’ distributions, when compared to Guarani and other results, pointed to the idea that other native groups (particularly the Charrua), should have contributed, through their women, to the formation of the contemporary Gaucho populations. It was also possible to verify that the Amerindian legacy (Guarani and Charrua), so markedly present in the traditional Gaucho culture, can also be seen at the genomic level, in an extraordinary example of genetic and cultural continuity between native and admixed populations
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Instabilidade de Turing e sincronismo em redes de populações acopladas

Rempel, Ana Luisa January 2007 (has links)
Neste trabalho analisamos os efeitos causados pela migração dependente da densidade em metapopulações, modelada como um sistema de n sítios discretos no tempo e no espaço. A análise é feita em diferentes funções que descrevem a dinâmica local do sistema e, para configuração da rede, trabalhamos com anéis cíclicos. Este trabalho trata de dois estudos: a instabilidade de Turing e a sincronização entre os sítios. A análise da instabilidade de Turing é feita comparando o comportamento do modelo local com o modelo acoplado, numa rede cuja matriz de interação é simétrica. Neste estudo foi considerado que o modelo de um único sítio (desaco- plado) é estável, portanto toda instabilidade é decorrente da migração. Além disso, comparamos a região de estabilidade do modelo localmente conectado, com a região de estabilidade do modelo globalmente conectado, concluindo que quando a conexão é maior, o sistema tem uma região maior de estabilidade.A ¯m de determinar para quais par^ametros a migração além de tornar o sistema instável, gera oscilações caóticas, calculamos numericamente os expoentes de Lyapunov. Este cálculo foi feito para vários números de sítios, comparando: o modelo globalmente conectado com o modelo localmente conectado; modelos com diferentes taxas de migração máxima; o modelo onde a migração ocorre por escassez de parceiros (dispersão dependente da densidade negativa) com o modelo onde a migração ocorre por excesso de indivíduos no sítio (dispersão dependente da densidade positiva); e o modelo onde a taxa de reprodução do modelo desacoplado é maior que 1 com o modelo onde a taxa de reprodução do modelo desacoplado é menor que 1. Na segunda parte estudamos a estabilidade do estado síncrono, que está fortemente correlacionada com a extinção. Pensando em estudar os fatores que levam a população µa extinção, obtemos um critério de estabilidade do estado síncrono. Este critério é baseado no cálculo do número de Lyapunov Transversal dos atratores no subespaço invariante de sincronia. Fizemos algumas simulações numéricas, assim como feito para a instabilidade de Turing comparando: o modelo globalmente conectado com o modelo localmente conectado; o modelo onde a migração ocorre por escassez de parceiros com o modelo onde a migração ocorre por excesso de indivíduos no sítio e para diferentes valores na taxa de reprodução do modelo de um único sítio (desacoplado). / In this study we analyse the e®ects caused by density-dependent disper- sal on metapopulations which are modelled as a discrete dynamical system in time and space. The analysis is done using di®erent functional formulations describing the local dynamics while the network con¯guration used is of a circular type. Two di®erent problems are studied: the Turing instability and the stability of synchroni- zed trajectories. The Turing instability analysis is done comparing the local model behavior with the coupled map lattice with symmetric interactions.We assume the single patch model to be stable, thus any observed instability is caused by the dis- persal between patches. Moreover we compare the stability region of a network where the connections are only between the two nearest neighbors sites with glo- bally connected ensembles, and we conclude that the stability region increases when there are more connections between patches. We also computed the Lyapunov ex- ponents of the metapopulation system in order to detect the presence of chaotic dynamics caused by the densitydependent migration. This numerical calculations were performed for various values of n (number of sites), comparing the two nea- rest neighbors topology with the globally connected interaction system, comparing the migration process that occurs because of lack sexual partners (negative density- dependent dispersal) with the dispersal caused by overpopulated patches (positive density-dependent dispersal), and also comparing metapopulations where the local model presents an intrinsic reproductive rate larger than one with systems where the local dynamics are driven by models with intrinsic reproductive rate less than one. In the second part we study the stability of synchronized attractors. This is important since synchronization is closely related to the possibility of the metapopulation extinction. We obtained a stability criterion for synchronized at- tractors. This criterion is based on the computation of the Transversal Lyapunovnumber of attractors within the synchronized invariant manifold. We performed nu- merical simulations as done for the Turing instability study, comparing models with di®erent connection schemes, positive and negative density-dependent dispersal and local models with di®erent behaviors with respect to the intrinsic reproductive rate.

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