L'estimation de paramètres génétiques est un problème important dans le domaine de la génétique mathématique et statistique. Il existe plusieurs méthodes s'attaquant à ce problème. Certaines d'entre elles utilisent la méthode du maximum de vraisemblance. Celle-ci peut être calculée à l'aide des équations exactes de Griffiths-Tavaré, équations de récurrence provenant du processus de coalescence. Il s'agit alors de considérer plusieurs histoires possibles qui relient les données de l'échantillon initial de séquences d'ADN à un ancêtre commun. Habituellement, certaines des histoires possibles sont simulées, en conjonction avec l'application des méthodes Monte-Carlo. Larribe et al. (2002) utilisent cette méthode (voir chapitre IV). Nous explorons une nouvelle approche permettant d'utiliser les équations de Griffiths-Tavaré de façon différente pour obtenir une estimation quasi exacte de la vraisemblance sans avoir recours aux simulations. Pour que le temps de calcul nécessaire à l'application de la méthode demeure raisonnable, nous devons faire deux compromis majeurs. La première concession consiste à limiter le nombre de recombinaisons permises dans les histoires. La seconde concession consiste à séparer les données en plusieurs parties appelées fenêtres. Nous obtenons ainsi plusieurs vraisemblances marginales que nous mettons ensuite en commun en appliquant le principe de vraisemblance composite. À l'aide d'un programme écrit en C++, nous appliquons notre méthode dans le cadre d'un problème de cartographie génétique fine où nous voulons estimer la position d'une mutation causant une maladie génétique simple. Notre méthode donne des résultats intéressants. Pour de très petits ensembles de données, nous montrons qu'il est possible de permettre un assez grand nombre de recombinaisons pour qu'il y ait convergence dans la courbe de vraisemblance obtenue. Aussi, il est également possible d'obtenir des courbes dont la forme et l'estimation du maximum de vraisemblance sont similaires à celles obtenues avec la méthode de Larribe et al. Cependant, notre méthode n'est pas encore applicable dans son état actuel parce qu'elle est encore trop exigeante en termes de temps de calcul. ______________________________________________________________________________ MOTS-CLÉS DE L’AUTEUR : Équations exactes de Griffiths-Tavaré, Paramètres génétiques, Processus de coalescence, Vraisemblance composite.

L'attention de l'auteur se porte sur la nécessité d'interroger, en tant qu'être pensant qui pense dans l'existence, le concept de concept. Qu'est-ce qu'un concept? Toute intelligibilité du concept réclame un savoir qui dépasse sa définition comme « objet fixé », c'est-à-dire qu'elle implique de s'attarder à « ce qu'il est », en deçà et par-delà l'évènementiel. L'auteur présume que les diverses formes du concept ne sont pas une « pluralité de définitions » à partir de laquelle il conviendrait d'isoler la « vraie », mais indique bien davantage les divers moments, les diverses articulations ou les multiples dimensions à travers lesquels il se forme et se « trans-forme » jusqu'à se signifier, dans un temps déterminé, de telle ou telle façon. Le concept se donne au présent. Toute conceptualisation qui prétendrait lui donner un contenu unitaire, a-temporel ou intemporel ne pourrait que le ramener aux phénomènes ou apparitions qu'il nomme. L'auteur propose ici une réflexion, en devenir, sur le concept « derrière » le concept: le concept de concept. À travers la voix de l'exception, exemple paradigmatique de la réduction du concept à l'évènementiel qu'il nomme, l'auteur cherche à dégager le rituel de la fondation et de la refondation du concept afin d'ouvrir les possibilités permettant de le penser en tant qu'unité ouverte, invention toujours inachevée et création évanescente où le sens se cristallise jusqu'à devenir l'assise d'une nouvelle création de sens. Au-delà d'une articulation du concept de concept, cette thèse de maîtrise n'est pas tant reliée à un « objet de recherche » qu'elle est une modalité pour trouver le « commun » : dépasser tous les éléments réfléchis en son parcours pour dégager une intelligibilité transcendante qui relierait toutes les voies ouvertes dans l'écriture. L'écriture et la parole s'expriment ici aux « risques et périls » de l'auteur. Leur domaine n'est pas donné d'avance, il est sans destination. C'est une écriture signante qui, en écrivant, renvoie à d'autres, mais est forcée prend sur soi le propos; malgré et envers tout l'héritage qu'elle transporte. C'est l'expérience d'une traversée questionnante. ______________________________________________________________________________ MOTS-CLÉS DE L’AUTEUR : Pensée (penseur subjectif existant), Concept, Concept de concept, Oubli, Création, Exception, Deleuze (1925-1995).

Les diverses théories des appraisals (évaluations) des émotions s'entendent généralement pour affirmer que les processus cognitifs amenant la différenciation de diverses émotions se font par une série d'évaluations cognitives. L'objectif de ce mémoire consiste à déterminer si une des évaluations nommée l'évaluation de la plaisance intrinsèque s'effectue réellement avant une seconde évaluation qui porte le nom de l'évaluation de la conductance au but. Ainsi, les études ont pour but de faire ressortir l'ordre séquentiel de ces différentes évaluations cognitives. À cette fin, des images à valence intrinsèquement positive et négative ont été utilisées pour vérifier l'évaluation de la plaisance intrinsèque, et des conséquences négatives et positives dans un jeu vidéo de type Pacman ont été utilisées pour vérifier l'évaluation de la conductance au but. Grâce à des mesures d'électromyographie faciale, il a ainsi été possible de déterminer les réactions faciales des individus pour chacune des évaluations. Ainsi, les résultats soutiennent l'hypothèse prédisant que l'évaluation de la plaisance intrinsèque s'effectue avant l'évaluation de la conductance au but. Donc, ce mémoire a permis de démontrer empiriquement que la séquence temporelle de diverses évaluations cognitives, tel que prédite dans la théorie, est bel et bien effectuée tel que décrit.

Dans ce mémoire, nous présentons une nouvelle méthode de cartographie génétique fine ayant comme particularité de pouvoir être utilisée dans le cadre de modèles génétiques complexes. Nous présentons tout d'abord quelques concepts de génétique et de statistique génétique, avec une emphase particulière sur le processus de coalescence qui est à la base de notre travail. Par la suite, trois méthodes de cartographie génétique déjà existantes sont présentées ; notre nouvelle méthode contient des éléments de chacune d'entre elles. Nous décrivons ensuite la nouvelle méthode proposée dans ce mémoire. Finalement, nous testons notre nouvelle approche à l'aide de simulations; nous comparons par la suite les résultats obtenus avec notre méthode à ceux obtenus par des tests d'association classiques, et par deux des trois méthodes présentées au début du mémoire. Les résultats nous laissent croire que notre méthode est performante autant dans des cas de modèles génétiques simples que complexes, contrairement à la plupart des méthodes existantes. ______________________________________________________________________________ MOTS-CLÉS DE L’AUTEUR : cartographie génétique, processus de coalescence, arbre de recombinaison ancestral, arbre partiel, distribution proposée, fonction de pénétrance.

Nous décrivons le niveau de dégradation caractéristique d'une structure à l'aide d'un processus stochastique appelé processus de dégradation. La dynamique de ce processus est modélisée par un système différentiel à environnement markovien.<br /><br />Nous étudions la fiabilité du système en considérant la défaillance de la structure lorsque le processus de dégradation dépasse un seuil fixe. Nous obtenons la fiabilité théorique à l'aide de la théorie du renouvellement markovien.<br /><br />Puis, nous proposons une procédure d'estimation des paramètres des processus aléatoires du système différentiel. Les méthodes d'estimation et les résultats théoriques de la fiabilité, ainsi que les algorithmes de calcul associés, sont validés sur des données simulés.<br /><br />Notre méthode est appliquée à la modélisation d'un mécanisme réel de dégradation, la propagation des fissures, pour lequel nous disposons d'un jeu de données expérimental.

Texte remanié de: Thèse Master of science--Agronomie--Montpellier--CIHEAM, 2006. / Bibliogr. p. 70-79. Résumé en français et en anglais. CIHEAM = Centre international des hautes études agronomiques méditerranéennes. IAMM = Institut agronomique méditerranéen de Montpellier.

Thèse de doctorat : Physique : Lyon, École normale supérieure (sciences) : 2005. / Bibliogr. p. 201-214.

Reproduction de : Thèse de doctorat : Sciences de la Terre et de l'Environnement, Mécanique des Fluides : Toulouse, INPT : 2004. Reproduction de : Thèse de doctorat : Sciences de la Terre et de l'Environnement, Mécanique des Fluides : Institut für Wasserbau und Wasserwirtschaft der RWTH, Aachen : 2004. / Thèse soutenue en co-tutelle. Titre provenant de l'écran-titre. Bibliogr. 16 p.

Thèse doctorat : Images et Systèmes : Villeurbanne, INSA : 2006. / Titre provenant de l'écran-titre. Bibliogr. p. 187-195.

Reproduction de : Thèse de 3e cycle : mathématiques appliquées : Grenoble 1 : 1987. / Titre provenant de l'écran-titre. Bibliogr. p.[167]-[170].