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Nutritional modeling of bacterial infections physiology and metabolism of Pseudomonas aeruginosa during growth in cystic fibrosis sputum /

Palmer, Kelli Lea, January 1900 (has links)
Thesis (Ph. D.)--University of Texas at Austin, 2008. / Vita. Includes bibliographical references.
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Análise fenotípica e genética de fatores virulência de isolados clínicos de Pseudomonas aeruginosa multidroga-sensível e multidroga-resistente de Recife - PE

SILVA, Stephanie Targino 29 February 2016 (has links)
Submitted by Fabio Sobreira Campos da Costa (fabio.sobreira@ufpe.br) on 2016-10-20T12:53:52Z No. of bitstreams: 2 license_rdf: 1232 bytes, checksum: 66e71c371cc565284e70f40736c94386 (MD5) ANÁLISE FENOTÍPICA E GENÉTICA DE FATORES VIRULÊNCIA DE ISOLADOS CLÍNICOS DE Pseudomonas aeruginosa MULTIDROGA-SENSÍVEL E MULTIDROGA-RESISTENTE.pdf: 1188065 bytes, checksum: 3d201d9ccfc4ba0e5a0ef45cce7f7056 (MD5) / Made available in DSpace on 2016-10-20T12:53:52Z (GMT). No. of bitstreams: 2 license_rdf: 1232 bytes, checksum: 66e71c371cc565284e70f40736c94386 (MD5) ANÁLISE FENOTÍPICA E GENÉTICA DE FATORES VIRULÊNCIA DE ISOLADOS CLÍNICOS DE Pseudomonas aeruginosa MULTIDROGA-SENSÍVEL E MULTIDROGA-RESISTENTE.pdf: 1188065 bytes, checksum: 3d201d9ccfc4ba0e5a0ef45cce7f7056 (MD5) Previous issue date: 2016-02-29 / CNPq / Pseudomonas aeruginosa é um patógeno humano oportunista responsável por causar uma enorme variedade de infecções agudas e crônicas com níveis significativos de morbidade e mortalidade. A sua plasticidade genética e metabólica possibilitou o desenvolvimento de isolados multidroga-resistentes (MDR) e a capacidade de expressar de inúmeros fatores de virulência. Este trabalho teve como objetivo correlacionar o padrão de susceptibilidade antimicrobiana, a produção de fatores de virulência através de técnicas fenotípicas (protease alcalina, hemolisina, fosfolipase C, lipase e pigmentos) e genéticas (genes aprA, lasA, lasB, plcH e toxA) e a variabilidade genética de 30 isolados clínicos de P. aeruginosa isoladas de diferentes sítios de infecção, sendo 15 isolados multidroga-sensível (MDS) e 15 MDR. Nossos resultados revelaram que 50% dos isolados foram resistentes a ceftazidima, sendo as cefalosporinas a classe antimicrobiana com mais isolados resistentes, principalmente entre isolados MDR onde todos foram resistentes. Entre os isolados MDS, todos foram sensíveis a carbapenêmicos e quinolonas. A grande diversidade apresentada no perfil de susceptibilidade às classes de antimicrobianos sugere a existência de associação de diversos mecanismos de resistência. Entre os isolados 53% foram amostras de secreção traqueal, entre estes todos os isolados sensíveis a todos os antimicrobianos testados. Em relação aos fatores de virulência os isolados MDR apresentaram menor produção de piocianina e lipase, e menor detecção dos genes toxA e lasA, enquanto os MDS, apresentaram menor produção de hemolisina e fosfolipase C. Não houve diferença entre os grupos para produção de protease alcalina e o gene aprA. Todos isolados apresentaram produção de piocianina e os genes lasB e plcH. Em relação ao perfil genético, foi encontrada uma grande diversidade, em um total de 30 isolados foi possível observar 28 perfis genéticos. A presença dos clones ocorreu entre os isolados MDR. Embora alguns estudos relatem que o acréscimo de mecanismos de resistência leva a diminuição dos fatores de virulência, sugerindo assim que, as cepas de P. aeruginosa MDR têm a virulência diminuída quando comparada com cepas MDS, neste trabalho dos resultados obtidos não constatamos esta tendência para produção de protease alcalina, hemolisina, fosfolipase C e para a detecção do gene aprA, sugerindo que esta correlação seja multifatorial. Contudo, a ocorrência destes fatores de virulência em quase todos os isolados estudados sugere um elevado nível de patogenicidade dos mesmos. Concluímos portanto, que P. aeruginosa é um patógeno capaz de acumular inúmeros fatores de virulência e frequentemente associado à multirresistência, o que dificulta o tratamento de infecções causadas por esta bactéria. / Pseudomonas aeruginosa is an opportunistic human pathogen responsible for causing a wide variety of acute and chronic infections with significant levels of morbidity and mortality. Its genetic and metabolic plasticity enabled the development of multidrug-resistant (MDR) strains and the ability to express countless virulence factors. This paper aimed to correlate the pattern of antimicrobial susceptibility, the production of virulence factors through phenotyping techniques (alkaline protease, hemolysin, phospholipase C, lipase and pigments) and genetic (gene aprA, lasB, lasB, plcH e toxA) and the genetic variability of 30 clinical isolates of P. aeruginosa isolated from different sites of infection, 15 isolates multidrug-sensitive (MDS) and 15 MDR. Our results showed reveal that 50% of the isolates were resistant to ceftazidime, cephalosporin was the antimicrobial class with more resistant isolates, especially isolates MDR that were totally resistant to them. Among the isolated MDS, all were sensitive to carbapenems and quinolones. The large diversity presented in the susceptibility profile to antimicrobial classes suggests the existence of an association of several resistance mechanisms. Among the isolated 53% came from tracheal secretions, among them all isolates susceptible to all antimicrobials tested. Regarding virulence factors MDR isolates presented lower production pyocyanin and lipase, and lower detection toxA e lasA genes, since the MDS, showed lower production of hemolysin and phospholipase C. There was no difference between groups for the production of alkaline protease and aprA gene. All isolates presented pyocyanin production and lasB and plcH genes. In relation to genetic profile, it was verified a large diversity, in a totality of 30 isolates was observed 28 genetic profiles. The presence of clones occurred among the MDR isolates. Even though some studies to report that the increase of resistance mechanisms leads to the reduction of virulence factors, suggesting that the strains of P. aeruginosa MDR have decreased virulence strains compared with MDS, this work the results obtained we have not found this tendency to alkaline protease production, hemolysin, phospholipase C and for detecting aprA gene, suggesting that this correlation is multifactorial. However, the occurrence of these virulence factor in almost all isolates studied suggests a high level of pathogenicity the same. Therefore, it can be concluded that, P. aeruginosa is a pathogen with ability to accumulate several virulence factors and often associated to multiresistant complicating the treatment of infections caused by this bacterium.
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Atividade biolÃgica das lectinas de sementes de erythrina fusca e velutina, de algas marinhas hypnea musciformes, bryothamnion seaforthii e triquetrum e do produto natural diterpeno casbano, em culturas de pseudomonas aeruginosa / Biological activity of lectins from Erythrina velutina and fusca, seaweed Hypnea musciformes, bryothamnion seaforthii and triquetrum and casbano diterpene natural product, in cultures of Pseudomonas aeruginosa

Ricardo Hideo Togashi 24 February 2010 (has links)
FundaÃÃo de Amparo à Pesquisa do Estado do Cearà / Neste trabalho avaliamos a atividade biolÃgica de lectinas de sementes de Erythrina fusca e velutina, de algas marinhas Hypnea musciformes, Bryothamnion seaforthii e triquetrum e do diterpeno casbano, um produto natural isolado de Croton nepetaefolius, sobre Pseudomonas aeruginosa ATCC 10145. Foi comparada a aÃÃo in vitro das 5 lectinas e do diterpeno casbano, sobre colÃnias de P. aeruginosa, em placas de poliestireno. Investigada a aÃÃo das lectinas de alga marinha H.musciforme, de sementes de Erythrina velutina, e do diterpeno casbano, no processo de formaÃÃo do biofilme bacteriano de P.aeruginosa, em placas de poliestireno; e identificado entre as lectinas de E.velutina, H.musciforme e diterpeno casbano, aquele com maior potencial de aplicaÃÃo no controle do crescimento de colÃnias de P. aeruginosa. As lectinas testadas nÃo foram capazes de inibir o crescimento e a formaÃÃo de biofilme de Pseudomonas aeruginosa nas condiÃÃes experimentadas. Por outro lado, diterpeno casbano, na concentraÃÃo de 500 μg/mL em 18 horas, foi capaz de inibir o crescimento de P. aeruginosa em 40%, comparado ao controle positivo. Esta inibiÃÃo foi observada atà uma concentraÃÃo de 125 μg/mL. Entretanto, nÃo foi observada inibiÃÃo da formaÃÃo do biofilme da P. aeruginosa nas concentraÃÃes utilizadas neste estudo. / In this study the biological activity of seeds lectins from Erythrina velutina and fusca, marine algae Hypnea musciformis, Bryothamnion seaforthii and triquetrum and the diterpene casbane, a natural product isolated from Croton nepetaefolius was evaluated upon Pseudomonas aeruginosa ATCC 10145. We compared the in vitro effect of lectins and diterpene casbane on colonies of P. aeruginosa in microtiter plates. Investigated the action of lectins from marine algae H. musciforme of seeds of Erythrina velutina, and diterpeno casbano in the process of formation of P. aeruginosa biofilm on polystyrene plates, and identified among lectins: E. velutina, H. musciforme and diterpene casbane, the one with greater potential for application in controlling the growth of colonies of P. aeruginosa. The lectins tested were able to inhibit growth and biofilm formation of P. aeruginosa in the studied conditions. Moreover, diterpene casbane at a concentration of 500 mg/mL in 18 hours, was able to inhibit the growth of P. aeruginosa in 40%, compared to positive control. This inhibition was observed until a concentration of 125 mg/mL. However, the inhibition of biofilm formation of P. aeruginosa there was no observed at the concentrations used in this study.
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AvaliaÃÃo in vitro da interferÃncia de lectinas vegetais e do diterpeno casbano isolado de Croton nepataefolius sobre o crescimento de formas planctÃnicas e biofilmes de Pseudomonas aeruginosa / In vitro evaluation of the interference of plant lectins and the diterpene isolated from Croton casbano nepataefolius on the growth of planktonic forms and biofilms of Pseudomonas aeruginosa

Fabiano Fazanaro 26 February 2010 (has links)
FundaÃÃo de Amparo à Pesquisa do Estado do Cearà / Este trabalho mostra as atividades biolÃgicas de lectinas isoladas de sementes de Vatairea macrocarpa e de Vatairea guianensis e do composto vegetal diterpeno casbano, isolado do Croton nepetaefolius, sobre o crescimento de Pseudomonas aeruginosa (ATCC 9027), causadora de otite externa. Comparou-se a aÃÃo in vitro das duas lectinas e do composto vegetal diterpeno casbano sobre culturas de P. aeruginosa em placas de poliestireno. As cÃlulas bacterianas foram testadas tanto em sua forma planctÃnica como na de biofilme. As lectinas testadas nÃo foram capazes de inibir o crescimento da forma planctÃnica e a formaÃÃo de biofilme da P. aeruginosa nas condiÃÃes experimentais. Por outro lado, o diterpeno casbano foi capaz de inibir o crescimento de P. aeruginosa na forma planctÃnica, nas concentraÃÃes de 500, 250 e 125 Âg/mL. Entretanto, nÃo foi observada inibiÃÃo da formaÃÃo do biofilme da P. aeruginosa nas concentraÃÃes utilizadas neste estudo. O diterpeno casbano isolado de Croton nepetaefolius poderà ser utilizado, apÃs a realizaÃÃo de outros estudos, como ferramenta biotecnolÃgica antimicrobiana sobre as formas planctÃnicas de P. aeruginosa / This work shows the biological activities of lectins isolated from Vatairea macrocarpa and Vatairea guianensis seeds and the vegetable compound diterpen casban, isolated from Croton nepetaefolius on the growth of Pseudomonas aeruginosa (ATCC 9027) that causes otites externa. The in vitro activity of the two lectins and vegetable compound casbane diterpene were compared on cultures of P. aeruginosa in polystyrene microplates. The bacterial cells were tested such in planktonic as in biofilm forms. The lectins tested were not capable to inhibit the growth and biofilm production of P. aeruginosa in the experimental conditions. On the other hand, the casbane diterpene was capable to inhibit the growth of planctonic forms of P. aeruginosa at the concentrations of 500, 250 and 125 Âg/mL. However, the inhibition of biofilm production was not observed at the same concentrations. The casbane diterpene isolated from Croton nepetaefolius can be used, after the realization of other studies, as an antibiotic biotechnological tool on planktonic forms of P. aeruginosa
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Estudo genético e molecular da disseminação da resistência aos beta-lactâmicos em Pseudomonas aeruginosa / Genetic and molecular study of beta-lactams resistance dissemination in Pseudomonas aeruginosa

Renata Galetti 06 November 2014 (has links)
A presença de plasmídeos conjugativos como IncP, IncU e IncFII carreando genes de resistência em Pseudomonas aeruginosa é de grande importância, pois podem ser trocados entre diferentes bactérias gram-negativas, disseminando a resistência aos antibióticos. Conhecer estes genes de resistência bem como os elementos genéticos que os carreiam é importante para entender os fatores que contribuem para a disseminação da resistência, auxiliando no controle da disseminação da resistência aos antibióticos. Ainda hoje não existe esquema para a tipagem de plasmídeos de P. aeruginosa, e são encontrados poucos trabalhos sobre estes plasmídeos. O objetivo deste estudo foi identificar os genes de resistência a antibióticos, o ambiente genético em que estes genes estão inseridos e a clonalidade dos isolados produtores de genes bla. No período do estudo, foram estudados 293 isolados de P. aeruginosa resistentes às cefalosporinas de 3ª e/ou 4ª gerações e/ou aos carbapenêmicos isoladas de pacientes de hospitais de Ribeirão Preto-SP, Belo Horizonte-MG, Franca-SP, Cuiabá-MT, de Barretos-SP e de Rio Branco-AC. Genes de resistência foram pesquisados por PCR. O perfil clonal dos isolados produtores de genes bla foi determinado por PFGE e MLST. A tipagem de plasmídeos foi feita por PFGE-S1 nuclease, hibridações com sondas específicas e tipagem de replicons (PBRT). Foram identificados 12 isolados carreando o gene blaSPM-1, 16 isolados carreando o gene blaCTX-M-2 e 3 isolados carreando o gene blaKPC-2. Em todos os 12 isolados produtores de SPM-1 foram identificadas duas cópias do elemento de inserção ISCR4, sendo uma cópia upstream e uma cópia downstream ao gene blaSPM-1 inseridos no cromossomo bacteriano. Em 13 dos 16 isolados produtores de CTX-M-2 o gene blaCTX-M-2 foi encontrado associado ao elemento de inserção ISCR1 e em 3 ao elemento de inserção ISEcp1 também inseridos no cromossomo bacteriano. Em 2 isolados o gene blaKPC-2 é carreado por um plasmídeo de ~3kb não tipável por PBRT e um em está inserido no cromossomo bacteriano. O ambiente genético do gene blaKPC-2 nos isolados estudados é diferente daqueles encontrados na literatura. Os isolados produtores de genes bla citados apresentaram diversidade clonal, tanto por PFGE quanto MLST demonstrando que vários clones estão envolvidos na disseminação desses genes. Este trabalho identificou e caracterizou 31 isolados produtores de ?-lactamases, o ambiente genético destes genes e a clonalidade de isolados de várias cidades do Brasil e em períodos diferenciados, demonstrando a disseminação desses genes em diferentes hospitais brasileiros. Esses dados auxiliam no conhecimento dos fatores que estão envolvidos na disseminação da resistência aos antibióticos e podem auxiliar as CCIHs dos hospitais a definirem estratégias para controlar a disseminação desses microrganismos prevenindo surtos de bactérias multirresistentes. / The presence of conjugative plasmids as IncP, IncU and Inc FII carrying resistance genes in Pseudomonas aeruginosa is very important because t these plasmids can be shared among different bacteria, spreading antibiotic resistance. Knowledge of these genes as well as genetic elements carrying these genes it is important to understend the factors that contribute to the spread of resistance, helping to control the spread of antibiotic resistance. Today there is no plasmid typing scheme to P. aeruginosa and few papers are found about this subject. The purpose of this study was to investigate resistance genes, genetic environment of these genes and clonal relationship of the isolates carrying these resistance genes. In the period of this study was studied 293 P. aeruginosa resistant to third and fourth generations of cephalosporins and/or carbapenens isolated of patients from hosptital from Ribeirão Preto, Belo Horizonte-MG, Franca-SP, Cuiabá-MT, Barretos-SP and Rio Branco-AC. Resistance genes were investigated by PCR. Twelve isolates were identified carrying blaSPM-1 gene, 16 isolates carrying blaCTX-M-2 gene and 3 isolates carrying blaKPC-2 gene. Clonal profiles of isolates producing resistance genes were investigated by PFGE and MLST. Plasmid typing was performed by PFGE-S1 nuclease, specific hybridizations and PCR replicon typing (PBRT). Two isolates presented a 3kb plasmid non-typeable by PBRT carrying blaKPC-2 gene. In all isolates SPM-1-producers were identified two copies of insertion sequence ISCR4, a copy upstream and a copy downstream to blaSPM-1 gene inserted in chromosomal DNA. In 13 of 16 isolates CTX-M-2-producers the blaCTX-M-2 gene was found associated to insertion sequence ISCR1 and in 3 isolates was associated to insertion sequence ISEcp1 also inserted in chromosomal DNA. Genetic environment of blaKPC-2 gene in the isolates studied it is different from those found in the literature. Isolates producing bla genes are clonally diversified using both PFGE and MLST showing that various clones are responsible to spread these resistance genes. This work identified and characterized 31 P. aeruginosa-?-lactamase-producing, the genetic environment of these genes and the clonal relationship of isolates collected from different periods from different cities of Brazil. These data can help us to understand the factors that are involved in the spread of antibiotics resistance and to help the Hospital Infection Control Committee to define strategies to control the spread of these microorganisms preventing outbreaks of resistant.
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Seleção de bactérias para biodegradação dos pesticidas organoclorados DDD, PCP e dieldrin / Selection of bacteria for biodegradation of organochlorine pesticides DDD, PCP and dieldrin

Mariana Consiglio Kasemodel 11 October 2012 (has links)
O objetivo deste trabalho foi a seleção de bactérias capazes de biodegradar os pesticidas organoclorados dieldrin, DDD e PCP. Inicialmente, foram realizados os ensaios de tolerância visando à seleção das bactérias degradadoras; posteriormente foram realizados os ensaios de biodegradação em meio liquido utilizando a bactéria selecionada. Dentre as 14 linhagens bacterianas isoladas testadas, selecionou-se a linhagem Pseudomonas aeruginosa L2-1 por apresentar maior tolerância a todos os pesticidas. Os ensaios de biodegradação foram realizados em diferentes meios de cultura, variando-se a concentração de glicose, a fonte de nitrogênio e a presença de ramnolipídeo. Os ensaios de biodegradação foram realizados determinando-se a concentração de pesticida, a concentração de glicose, o número de células viáveis, e o pH. O meio de cultura que mais favoreceu a biodegradação dos três pesticidas foi o meio com nitrato de sódio e 0,5% de glicose, obtendo-se biodegradação de aproximadamente 50% para cada pesticida após três dias de incubação. Na ausência de glicose, o meio com nitrato de amônio e 0,1% de ramnolipídeo, favoreceu a biodegradação, obtendo-se após 14 dias de incubação 36,8% de biodegradação de dieldrin; 33,7% de DDD e 42,8% de PCP. De uma forma geral, as taxas de biodegradação pela P. aeruginosa L2-1 foram maiores em menores concentrações de glicose e na presença de ramnolipídeo. Ao alterar a fonte de nitrogênio foram observados resultados diversos sobre a taxa de biodegradação: na ausência de glicose, o nitrato de sódio favoreceu a biodegradação de PCP, enquanto o nitrato de amônio favoreceu a biodegradação de dieldrin, na presença de glicose observou-se o inverso. A taxa de biodegradação do DDD não foi significativamente alterada ao variar a fonte de nitrogênio. A bactéria selecionada P. aeruginosa L2-1 apresentou potencial para biodegradação de pesticidas organoclorados, sendo que as condições nutricionais do meio influenciaram diretamente a biodegradação. / The objective of this work was the selection of bacteria capable of biodegrading the organochloride pesticides dieldrin, DDD and PCP. Initially tolerance tests were conducted in order to select degrading bacteria subsequently, biodegradation tests were carried out in liquid medium using the selected bacteria. Among the 14 bacterial isolated strains, Pseudomonas aeruginosa L2-1 was selected due to its greater tolerance to all pesticides. The biodegradation tests were conducted on different culture media, varying the concentrations of glucose, nitrogen source and presence of rhamnolipid. Biodegradation studies were performed by measuring the concentration of pesticide, the concentration of glucose, the number of viable cell and pH during time. The best medium for the biodegradation of all three pesticides was composed of sodium nitrate and 0.5% glucose, giving approximately 50% yield after three days of incubation. In the absence of glucose, the medium containing ammonium nitrate and 0.1% rhamnolipid improved biodegradation yielding, after 14 days of incubation, 36.8% biodegradation of dieldrin; 33.7% DDD and 42.8% of PCP. In general, the biodegradation rates of pesticides by P. aeruginosa L2-1 were greater at lower concentrations of glucose and in the presence of rhamnolipid. Nitrogen source had different effects on the rate of biodegradation: in the absence of glucose, sodium nitrate favored the biodegradation of PCP, whereas ammonium nitrate favored the biodegradation of dieldrin; and in the presence of glucose, it was observed the opposite. The biodegradation rate of the DDD was not significantly altered by the nitrogen source tested. The selected bacteria, P. aeruginosa L2-1, showed potential for the biodegradation of organochloride pesticides demonstrating that nutritional conditions has a direct effect on degradation yields.
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Sorologia anti-IgG para detecção da infecção pulmonar por Pseudomonas aeruginosa em pacientes com fibrose cística atendidos no Hospital de Clínicas da Universidade Estadual de Campinas / Anti-IgG serology for detection of Pseudomonas aeruginosa pulmonary infection in cystic fibrosis patients attended at the Campinas State University Hospital

Mauch, Renan Marrichi, 1988- 08 June 2014 (has links)
Orientador: Carlos Emilio Levy / Dissertação (mestrado) - Universidade Estadual de Campinas, Faculdade de Ciências Médicas / Made available in DSpace on 2018-08-25T23:09:16Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Mauch_RenanMarrichi_M.pdf: 2012702 bytes, checksum: 947bbc196f2331b0a48b9596a06effdc (MD5) Previous issue date: 2014 / Resumo: A Fibrose Cística (FC) é uma doença genética decorrente da disfunção da proteína reguladora da condutância transmembrana (CFTR), essencial para o transporte de íons e água pela membrana celular, sendo a doença pulmonar a mais preponderante das manifestações, havendo colonização bacteriana seguida de infecções, principalmente por Pseudomonas aeruginosa, bactéria de maior relevância para pacientes com FC. Neste estudo, buscamos padronizar e avaliar o valor diagnóstico e prognóstico de um teste de ELISA (Enzyme-linked immunosorbent assay) para pesquisa de anticorpos séricos IgG anti-P. aeruginosa, comparando os resultados com a cultura microbiológica de material respiratório (padrão-ouro atual). Os níveis de anticorpos foram avaliados primeiramente em um estudo transversal, com 117 pacientes com FC atentidos no HC-Unicamp, buscando determinar a acurácia do teste, e paralelamente em um estudo longitudinal, com 78 pacientes inicialmente sem infecção crônica por P. aeruginosa, buscando monitorar a variação dos níveis de anticorpos em diferentes períodos de coleta de amostras. Observamos que a taxa de soropositividade e a mediana dos níveis de IgG anti-Pseudomonas foram significativamente maiores em pacientes cronicamente infectados pela bactéria, tendo o teste sensibilidade de 96,8%, especificidade de 98,1%, valor preditivo positivo de 96,8% e valor preditivo negativo de 98,1% para a detecção da infecção crônica. Houve aumento progressivo dos níveis de anticorpos dos pacientes ao longo do tempo, com maior significância em dois períodos de coleta, entre pacientes que apresentaram evolução no perfil de colonização/infecção por P. aeruginosa. Foi possível, pela pesquisa de anticorpos, a detecção da bactéria até 15 meses antes do primeiro isolamento positivo em cultura e pacientes com níveis de anticorpos elevados no início do estudo apresentaram maior risco de posterior evolução no perfil de colonização/infecção por P. aeruginosa. Concluímos que a sorologia pode ser um recurso diagnóstico de grande utilidade para a detecção precoce da infecção pulmonar P. aeruginosa em pacientes com FC, complementando resultados da cultura microbiológica. Introduzindo-a na rotina de acompanhamento dos pacientes, será possível a terapia antimicrobiana precoce, o que poderá ajudar a melhorar a função pulmonar dos pacientes e sua qualidade de vida / Abstract: Cystic Fibrosis (CF) is a genetic disease, resulting from disfunction of the CFTR protein, which is essential for the transportation of ions and water across the cell membrane, being the pulmonary disease the most prominent manifestation, where there is bacterial colonization followed by infections, mainly caused by Pseudomonas aeruginosa, the most relevant bacterium for CF patients. The aim of this study was to standardize and to evaluate the diagnostic and prognostic values of an ELISA (Enzyme-linked immunosorbent assay) test for detection of serum anti-P. aeruginosa IgG antibodies, comparing the results with the microbiological respiratory culture (current gold standard). The antibody levels were first evaluated in a cross sectional study, with 117 CF patients attended at the HC-Unicamp, seeking to evaluate the accuracy of the test, and in a parallel longitudinal study, with 78 patients initially without P. aeruginosa chronic infection, seeking to monitor the variation in the antibody levels in different periods of sample collection. We observed that the seropositivity rate and the median of the anti-Pseudomonas IgG antibody levels were significantly higher in chronically infected patients, with the serological test presenting a sensitivity of 96.8%, specificity of 98.1%, positive predictive value of 96.8% and negative predictive value of 98.1% for detection of chronic infection. There was a progressive increase of the antibody levels in the patients over time, with greater significance, in two collection periods, among patients who presented evolution in the P. aeruginosa colonization/infection status. Through antibody measurement, we could detect the bacterium until 15 months before the first positive isolation in microbiological culture and the patients with elevated antibody levels in the baseline showed higher risk for later evolution in the P. aeruginosa colonization/infection status. We conclude that serology can be a very useful diagnostic resource for early detection of P. aeruginosa pulmonary infection, complementing microbiological results. By introducing it on the follow-up routine, the early antimicrobial therapy will be possible, which will help to improve the patients¿ lung function and quality of life / Mestrado / Saude da Criança e do Adolescente / Mestre em Ciências
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Estudo da ação da oxigenação hiperbárica em Pseudomonas aeruginosa. / Study of action of hyperbaric oxygenation in Pseudomonas aeruginosa.

Lima, Flávia Luna 18 August 2018 (has links)
Orientador: Selma Giorgio, Luciana Maria de Hollanda / Dissertação (mestrado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Biologia. / Made available in DSpace on 2018-08-18T19:40:07Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Lima_FlaviaLuna_M.pdf: 5109370 bytes, checksum: b5d1a1158570ae39829ed8ec9ff682e5 (MD5) Previous issue date: 2011 / Resumo: Pseudomonas aeruginosa é um dos principais patógenos oportunistas responsáveis pelas infecções nosocomiais. Essas infecções representam um grave problema de saúde para pessoas com feridas graves e queimaduras, sendo responsável por altas taxas de mortalidade nos pacientes. Os tecidos cronicamente lesados apresentam microáreas de hipóxia, pouco vascularizadas, que são extremamente difíceis de serem tratadas, diminuem e alteram os efeitos dos medicamentos propiciando que linhagens multiresistentes desse patógeno infectem e sobrevivam. Assim, torna-se imprescindível o desenvolvimento de tratamentos que sejam eficazes tanto no combate do patógeno, como na regeneração do tecido destruído. A terapia com oxigenação hiperbárica (HBO) promove a regeneração tecidual pela formação de novos vasos, apresenta propriedades bacteriostáticas e bactericidas e pode atuar de forma sinérgica com antibióticos. O objetivo geral deste trabalho foi avaliar o papel da HBO no crescimento de P. aeruginosa, na ação de imipenem e em macrófagos e peles artificiais infectadas com esse patógeno. Nossos resultados mostraram que a exposição de seis cepas de P. aeruginosa a HBO (100% de O2 a 3 ATA pressão) diminui o crescimento bacteriano, além de potencializar o efeito de imipenem/cilastatina no combate a esta bactéria. A exposição a HBO durante 90 minutos protegeu macrófagos peritoneais da lise causada pela infecção bacteriana. Quando peles artificiais infectadas com P. aeruginosa foram expostas a HBO a carga bacteriana destes tecidos diminuiu. Os nossos resultados evidenciam a importância do tratamento hiperbárico no controle de infecções causadas por este patógeno / Abstract: Pseudomonas aeruginosa is a major opportunistic pathogens responsible for nosocomial infections. These infections represent a serious health problem for people with severe wounds and burns and are responsible for high mortality rates in these patients. The chronically injured tissues have small areas of hypoxia, these areas, low vascularization, are extremely difficult to treat, reduce and alter the effects of medicines providing that multiresistant strains of this pathogen to infect and survive in these places. Thus, it is essential to develop a treatment that is effective both in combating the pathogen, as in the regeneration of damaged tissue. Therapy with hyperbaric oxygen (HBO) promotes tissue regeneration by new vessel formation, has bacteriostatic and bactericidal properties and can act synergistically with antibiotics. The aim of this study was to evaluate the role of HBO on the growth of P. aeruginosa, in the imipenem action and infected macrophages and artificial skin infected with this pathogen. Our results show that exposure of six strains of P. aeruginosa to hyperbaric conditions (100% O2 at 3 ATA pressure) reduces bacterial growth, and maximize the effect of imipenem/ cilastatina against this bacterium. Exposure to HBO for 90 minutes protected macrophages from lysis caused by bacterial infection. Artificial skins infected with P. aeruginosa and exposed to HBO showed a decrease in bacterial load. These results support the importance of hyperbaric oxygen therapy in control infections caused by this pathogen / Mestrado / Imunologia / Mestre em Genética e Biologia Molecular
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Formation of biofilm in Pseudomonas aeruginosa : molecular characterisation of the macromolecular complex Pel / Formation de biofilms chez Pseudomonas aeruginosa : caractérisation moléculaire du complexe macromoléculaire Pel

Kowalska, Karolina 12 January 2011 (has links)
Pseudomonas aeruginosa est une bactérie pathogène opportuniste qui peut développer deux modes d’infection. Les infections aigües sont associées à la production et à la sécrétion de toxines qui peuvent avoir un effet cytotoxique, alors que dans le contexte d’une infection chronique la bactérie a tendance à s’établir sous la forme d’un biofilm. Un biofilm est une population de microorganismes organisée en une communauté et attachée sur une surface. Cette surface peut être biotique ou abiotique. Les biofilms bactériens ont des caractéristiques intrinsèques qui les rendent plus résistants à des conditions environnementales difficiles (pH, oxygène, UV, flux, etc…). Dans le cadre d’une infection l’établissement du biofilm résulte aussi en une population bactérienne difficile à éliminer par le système immunitaire mais également résistante aux antibiotiques. Des déterminants moléculaires majeurs qui interviennent dans la formation du biofilm sont le flagelle, les pili de type IV et les fimbriae Cup pour l’attachement, ou bien encore les exopolysaccharides qui sont avec l’ADN des composants essentiels de la matrice extracellulaire du biofilm qui englobe la population bactérienne. Chez P. aeuginosa, si l’alginate est le polysaccharide majeur, il a été montré que des souches non-mucoides forment également des biofilms et que dans ce contexte la synthèse et la sécrétion du polysaccharide majeur de la matrice sont dépendantes des gènes pel. Mon travail a consisté dans l’étude de l’organisation structurale du système Pel et le contrôle de son activité. / Pseudomonas aeruginosa is a human opportunistic pathogen, and in the course of an infection can develop two lifestyles. One of them is involved in secretion of toxins and results in acute infection, and the other one causes chronic infections and is characterized by formation of a biofilm. A biofilm is a highly organized bacterial population, organized as a complex community that is attached to a surface. Bacterial biofilm shows higher resistance to different enviromental factors including physical factors, antimicrobials or host immune response. Major components taking part in biofilm formation are flagella, type IV pili, cup fimbriae as well as exopolysaccharides. The latter provides a protective matrix for the biofilm, together with proteins and DNA. In non-mucoid strains the major exopolysaccharide of biofilm matrix is synthetised and secreted by pel gene cluster. My work concentrates on the structural organisation of Pel polysaccharide secretion machinery, regulation of its activity as well as detailed characterisation of the Pel polysaccharide itself.
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Role of the outer membrane of Pseudomonas aeruginosa in antibiotic resistance

Nicas, Thalia Ioanna January 1982 (has links)
It was demonstrated that induction of a major outer protein, HI, was associated with increased resistance to chelators of divalent cations such as EDTA and to the cationic antibiotics polymyxins and aminoglycosides. Outer membrane protein HI was the major cellular protein in cells grown in Mg²⁺-deficient medium (0.02 mM Mg²⁺) and in mutants selected for resistance to polymyxin. Increase in protein HI was associated with decrease in cell envelope Mg²⁺. Induction of protein HI was prevented by supplementation of Mg²⁺-deficient medium with 0.5 mM Mg²⁺, Ca²⁺, Mn²⁺ or Sr²⁺, but not by Zn²⁺, Ba²⁺, or Sn²⁺. Cells grown in Ca²⁺, Mn²⁺ or Zn²⁺ showed enhanced levels of these cations as main major cell envelope associated cation. Only cells grown in the presence of those cations which failed to prevent HI induction were resistant to chelators, polymyxin B and gentamicin. Protein HI overproducing cells also demonstrated altered streptomycin uptake. It was further demonstrated that aminoglycosides could interact with the outer membrane so as to make it more permeable to other substances. Mg²⁺ inhibited aminoglycoside-mediated permeabilization. Both aminoglycosides and polymyxin B could be shown to displace a small amount of Mg²⁺ from the cell envelope. / Science, Faculty of / Microbiology and Immunology, Department of / Graduate

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