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Dinâmica do microbioma da rizosfera de mandacaru na Caatinga / Dynamics of mandacaru rhizosphere microbiome in the Caatinga

Clederson Ferreira 28 February 2014 (has links)
O atual cenário mundial das mudanças climáticas, somado ao aquecimento global e ao aumento das áreas em processo de desertificação tem impactado diretamente nos padrões de produção agrícola. A Caatinga é um bioma que só ocorre no Brasil e possui um clima semiárido, quente e de baixa pluviosidade, sendo que na estação seca a temperatura do solo pode chegar até 60ºC. A Caatinga apresenta uma grande riqueza de ambientes e espécies, e boa parte dessa diversidade não é encontrada em nenhum outro bioma. Uma característica muito peculiar da Caatinga é a existência de duas estações bem contrastantes durante o ano, o inverno caracterizado por ser a estação da chuva e o verão a época da seca. A vegetação é composta por Euforbiáceas, Bromeliáceas e Cactáceas, dentre as quais destacam-se o Cereus jamacaru (mandacaru), Pilosocereus gounellei (xique-xique) e Melocactus sp. (cabeça-de-frade). O mandacaru planta que sobrevive às altas temperaturas e baixa disponibilidade de água da Caatinga possui adaptações morfológicas estruturais que contribuem para a sobrevivência da mesma. Além dessas adaptações a comunidade microbiana da rizosfera foi estudada para descobrir quais micro-organismos presentes nesse ambiente auxiliam na manutenção do hospedeiro frente a essas condições adversas. Assim como, quais grupos e funções são mais abundantes nessas condições. Nesse estudo foi feito o sequenciamento parcial do gene 16S rRNA e do DNA total da rizosfera de mandacaru. A comunidade bacteriana foi bem representada pelos filos Actinobacteria, Proteobacteria e Acidobacteria, sendo que o filo Actinobacteria foi mais abundante na seca de acordo com o sequenciamento metagenômico e o filo Acidobacteria foi mais abundante no período de chuva. Em geral o sequenciamento do gene 16S rRNA, indicou que Actinobacteria e Proteobacteria são os filos mais abundantes e os genes relacionados às funções de resistência a doenças foram mais abundantes na estação seca, enquanto genes relacionados ao metabolismo do nitrogênio foram mais abundantes durante o período chuvoso, revelando assim, um pouco do potencial que o microbioma da rizosfera de mandacaru possui para auxiliar a planta hospedeira. / The present world scenario of climate change, global warming and the increase in areas undergoing desertification, have directly impacted on current patterns of agricultural crop production. The Caatinga is a specific Brazilian biome because of its semi-arid climate, hot and low rainfall, and the temperature that reaches the 60°C in the dry season. The Caatinga has a huge biodiversity and much of its diversity is not found in any other biome. A peculiar characteristic of the Caatinga biome is the occurrence of two very contrasting seasons during the year, the winter which is characterized by a rainy season and summer the dry season. The vegetation is composed by Euphorbiaceae , Bromeliaceae and Cactaceae, represented by Cereus jamacaru (Mandacaru) Pilosocereus gounellei (xique-xique) and Melocactus sp. (head-to-brother). Mandacaru is the plant that can survive through the specifics climate conditions of the Caatinga biome such as high temperatures and low water availability and this is probably due to some structural and morphological adaptations that contribute to its survival. Therefore, we assessed which microorganisms are associated with the plant rhizosphere, and which microbial groups contribute to the maintenance of the host throughout these adverse conditions. Also, we identified which are the most abundant microbial groups in these conditions and which microbial functions are more abundant in both evaluated seasons. Thus the present study assessed the mandacaru rhizosphere microbiome through a partial 16S rRNA gene sequencing and metagenomic sequencing. The bacterial community was well represented by the phyla Actinobacteria, Proteobacteria and Acidobacteria. The Actinobacteria was the most abundant microbial phyla in the dry season according to shotgun sequencing while the Acidobacteria was the most abundant microbial phyla in the rainy season. Overall, the 16S rRNA sequencing indicated that Actinobacteria and Proteobacteria were the most abundant groups and additionally, and genes related to disease resistance functions were more abundant in the dry season. Genes related to nitrogen metabolism were more abundant during the rainy season revealing some of the potential traits that the mandacaru can explore from its microbiome.
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Sulfato de cálcio, fosfogesso e carbonato de cálcio na melhoria do ambiente radicular de subsolos ácidos / not available

Maria da Conceição Santana Carvalho 20 December 1994 (has links)
Um experimento em casa de vegetação, foi conduzido objetivando comparar os efeitos da aplicação de sulfato de cálcio, fosfogesso, e carbonato de cálcio sobre a alteração das propriedades da fase sólida e liquida de amostras de subsolo de dois latossolos vermelho-amarelos álicos, dois latossolos roxos ácricos e um latossolo vermelho escuro álico do estado de São Paulo. Avaliaram-se os efeitos dessas alterações sobre o crescimento e a absorção de água e nutrientes pelo milho (Zea mays L.). Utilizou-se uma técnica de raiz bipartida vertical, em que quatro plantas de milho foram cultivadas inicialmente em um recipiente contendo 130 g de uma amostra de solo fértil. Quinze dias após a germinação, removeu-se o recipiente e o bloco de terra com as plantas foi introduzido em um vaso preenchido com 2 dm3 de amostra de subsolo, que recebeu um dos seguinte tratamentos: sem corretivo, sulfato de cálcio, fosfogesso e carbonato de cálcio, aplicados na dose de 10 mmo.dm- 3 de terra, além de 56 mg de N e 78 mg de K. Passados mais dezenove dias, as plantas foram colhidas e o subsolo contido nos vasos foi amostrado para determinações do teor de água e do comprimento radicular e para a realização de análise química. O sulfato de cálcio e o fosfogesso aumentaram o pH em cloreto de cálcio e o teor de Ca2+ trocável e reduziram o Al3+ trocável e o H+ + Al3+, mas em menor proporção que o carbonato de cálcio. Não houve diferença significativa entre o sulfato de cálcio e o fosfogesso quanto a esses efeitos. Os valores de pH em água diminuíram devido ao efeito do sal na medida do pH. As amostras de subsolo utilizadas apresentaram severas restrições ao desenvolvimento do sistema radicular do milho. Com a adição dos corretivos o comprimento de raízes aumentou em até 194 % devido à correção da deficiência de cálcio e/ou redução da toxicidade do alumínio. O carbonato de cálcio reduziu a atividade do Al3+ pelo aumento do pH. Nos latossolos ácricos e no latossolo vermelho escuro álico, o sulfato de cálcio e o fosfogesso também provocaram a redução da atividade de Al3+ como resultado do aumento da força iônica da solução e formação do par iônico AlS04 +. No caso do fosfogesso, a formação de complexos de Al com F (AlF2+ e AlF2 +) foi a principal causa da redução da atividade do Al3+. Já nos latossolos vermelho-amarelos álicos, o aumento do comprimento de raízes nos tratamentos com sulfato de cálcio e fosfogesso deveu-se, provavelmente, ao efeito do cálcio em reduzir a toxicidade do alumínio, uma vez que a atividade do Al3+ foi aumentada. A produção de matéria seca do milho aumentou com a aplicação dos corretivos em todos os solos. Nos latossolos ácricos e no latossolo vermelho escuro, o efeito do calcário foi inferior ao efeito do sulfato de cálcio e do fosfogesso devido à menor concentração de nutrientes na solução. Nos latossolos vermelho-amarelos álicos não houve diferença entre os corretivos. O sulfato de cálcio e o fosfogesso foram tão eficazes quanto o carbonato de cálcio em favorecer a absorção de nitrogênio e potássio do subsolo / not available
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Interação de plantas de trevo vermelho inoculadas com rizóbios com ácaros e colêmbolos edáficos / Interaction of red clover plants inoculated with rhizobia with edaphic mites and springtails

Bassani, Victor Lucas January 2015 (has links)
A mesofauna edáfica, compreendendo ácaros e colêmbolos, é sensível a alterações no solo, sendo considerada um indicador de qualidade, uma vez que realiza a fragmentação de matéria orgânica, controle populacional de determinados grupos da biota do solo e ingestão de microrganismos. A colonização de plantas por micro-organismos, como a de leguminosas por rizobios, pode levar a mudanças na rizosfera vegetal e influenciar a mesofauna. Este estudo teve por objetivo avaliar o efeito da inoculação de plantas de trevo vermelho com rizóbios sobre os ácaros e colêmbolos edáficos e avaliar se colêmbolos alimentados com rizóbios poderiam inocular plantas hospedeiras. Para isso, plantas de trevo vermelho, inoculadas com as estirpes SEMIA 2081, SEMIA 2082 e SEMIA 222, e plantas controle sem inoculação foram plantadas em tubos-armadilha e inseridas em campo. A seguir, a mesofauna atraída foi extraída e identificada. Outro experimento em laboratório utilizou plantas de trevo vermelho que foram colocadas em contato com colêmbolos da família Hypogastruridae e dos gêneros Proisotoma, Onychiurus e Orthonychiurus, os quais haviam sido alimentados com um substrato impregnado com o rizóbio da estirpe SEMIA 2081 As plantas inoculadas com as três estirpes de rizóbios atrairam ácaros edáficos mas não colêmbolos, quando comparadas com as plantas que não foram inoculadas nem receberam fonte de nitrogênio. Considerando os números totais de ácaros e colêmbolos, somente as plantas inoculadas com a estirpe SEMIA 222 apresentaram atratividade quando comparadas ao controle sem inoculação e sem fonte de nitrogênio. A atratividade de ácaros e colêmbolos observada no tratamento controle com nitrogênio foi similar aos tratamentos inoculados. No experimento de laboratório, os colêmbolos vivos e o macerado de colêmbolos da família Hypogastruridae, e gêneros Proisotoma e Orthonychiurus foram capazes de transferir os rizóbios que receberam pela alimentação às plantas, formando nódulos radiculares. As plantas que receberam o macerado de colêmbolos da família Hypogastruridae apresentaram maior número de nódulos comparadas às plantas que receberam os mesmos colêmbolos vivos. / The soil mesofauna comprising mites and springtails, is sensitive to changes in soil, and it is considered a quality indicator since it performs fragmentation of organic matter, population control of certain soil biota groups and ingestion of microorganisms. The plants colonized by microorganisms, such as legumes by rhizobia can lead to changes in plant rhizosphere and influence mesofauna. This study aimed to evaluate the effect of inoculation of red clover plants with rhizobia on edaphic mites and springtails and assess if springtails fed with rhizobia could inoculate host plants. For this, red clover plants inoculated with strains SEMIA 2081, SEMIA 2082 and SEMIA 222, and control plants without inoculation were planted in trap-tubes and inserted on field. Then, the attracted mesofauna was submitted to extraction and identification. Another laboratory experiment used red clover plants put in contact with springtails. These springtails of Hypogastruridae family and Proisotoma, Onychiurus and Orthonychiurus genera, had been fed with a substrate impregnated with rhizobia strain SEMIA 2081. Plants inoculated with three Rhizobia strains attracted edaphic mites, but not Collembola, when compared to uninoculated plants with no nitrogen source Considering the total numbers of mites and springtails, only plants inoculated with SEMIA 222 strain showed attractiveness when compared to the control without inoculation and no nitrogen source. The attractiveness of mites and springtails observed in the control treatment with nitrogen was similar to the inoculated treatments. In the laboratory experiment, the living springtails and the macerate of springtails of Hypogastruridae family, and Proisotoma and Orthonychiurus genera were able to transfer the rhizobia that they received by feeding to the plants, forming root nodules. The plants that received the macerate of springtails of the Hypogastruridae family had a higher number of nodules compared to the plants that received the same living springtails.
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Emissão de CO2 do solo e sua correlação com a rizosfera de diferentes paisagens de áreas mineradas do município de Santo Antônio de Pádua-RJ / Emission from soils and their correlation with the rhizosphere of different landscapes of mined areas in the municipality of Santo Antônio de Pádua-RJ

Cássia Barreto Brandão 12 February 2014 (has links)
Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / Objetivando avaliar o comportamento das emissões de CO2 do solo em áreas mineradas do município de Santo Antônio de Pádua-RJ e sua correlação com a rizosfera, este presente estudo utilizou uma câmara fechada com sensor de infravermelho em três diferentes paisagens, a saber: A-1 (área reflorestada há 10 anos), A-2 (área desmatada) e A-3 (área em processo de recuperação). Em cada área foi instalada três cilindros para efeitos de repetição. O monitoramento foi realizado durante os meses representativos de cada estação do ano de 2013, sendo a análise realizada durante dois dias consecutivos. Concomitantemente as coletas de CO2 foram realizadas coletas de dados de temperatura e umidade do solo, sendo também avaliadas informações pedológicas através das análises de granulometria, porosidade, pH, carbono orgânico e matéria orgânica. Informações meteorológicas e microclimatológicas também foram extraídas através de uma estação meteorológica automática e através de sensores portáteis. Os resultados permitem concluir que existe uma variação sazonal dos fluxos de CO2, havendo uma tendência de máximos de emissão durante o verão e de mínimas durante o inverno, sendo o outono e a primavera marcados por valores medianos. A correlação das áreas entre os dois dias monitoramento indicam que as emissões foram semelhantes ao da análise em dia anterior, apresentando uma correlação significativa a 5% para A-1 e A-2 e de 1% para A-3. A-1 e A-2 apresentaram emissões de CO2 mais homogêneas que A-3, havendo, entretanto, um maior fluxo de CO2 durante o verão para todas as áreas. Os dados de MOS, COS e pH demonstraram não haver uma correlação direta com as emissões de CO2. Os dados de porosidade e densidade, porém, apontam para uma possível correlação com as menores emissões de CO2 em A-3 devido a menor porosidade e maior densidade de seus solos. A temperatura do solo foi a variável que mais se correlacionou com as emissões de CO2, havendo um índice igual a r =0,68 para A-1 e de r =0,74 para A-2, sendo que em A-3 esta correlação não foi significativa. A temperatura do ar demonstrou uma correlação somente na área descampada de A-2. No que se refere à correlação da umidade do solo não houve correlações diretas significativas, sendo que somente houve uma correlação negativa (r=-0,50) significativa a 5% em A-3 com a umidade do ar. O diagnóstico ambiental das áreas de monitoramento revela que estas possuem baixos indicadores de qualidade, sendo afetados também pela escassez hídrica da região durante oito meses do ano. A-1 apresenta os melhores indicadores biológicos, químicos e microclimáticos, seguidos por A-2 e A-3 que apresentam diversas deficiências e problemas em termos de estrutura e atividade biológica dos solos. Neste estudo permite-se concluir que áreas próximas, porém com características distintas podem produzir diferentes padrões de emissão de CO2, dificultando, portanto, estimativas globais de emissão de CO2. Os elementos mais associados às emissões de CO2 parecem estar relacionados à temperatura do solo e do ar, umidade do ar e estrutura do solo, havendo, entretanto, outros fatores que podem estar indiretamente relacionados e que exercem diferentes influências de acordo com o ambiente analisado. / Seeking evaluate the performance of CO2 emissions from soil in mined areas in the municipality of Saint Anthony of Padua - RJ and its correlation with the rhizosphere , the present study used a closed chamber with infrared sensor in three different landscapes , namely: A- 1 ( reforested area 10 years ago ) , a- 2 ( pasture) and A- 3 (area under recovery ) . In each area was installed three cylinders for the purpose of repetition. Monitoring was conducted during the months representing each season of the year 2013, with an analysis performed for two consecutive days. Simultaneously the analyses of temperature and soil moisture were performed, and also evaluated soil information by analyzing particle size , porosity, pH , organic carbon and organic matter information microclimatológicas and of weather were also extracted through sensors automatic and portable.The results indicate that there is a seasonal variation in CO2 fluxes , there is a trend of maximum emission during summer and minimum during winter , with autumn and spring marked by median values . The correlation among the areas two days indicate that monitoring emissions analysis were similar to the previous days, presenting a significant correlation to 5 % for A -1 and A -2 and A- 1 to 3 %. A- 1 and A- 2 had CO2 emissions more homogeneous than A- 3, there are, however, a greater flow of CO2 during the summer for all areas. MOS data, COS and pH showed no direct correlation with CO2 emissions. The porosity and density data, however, point to a possible correlation with the lowest CO2 emissions in A- 3 due to lower porosity and higher density of your soil. Soil temperature was the variable that was most associated with CO2 emissions, with an equal index for air = 0.68 A- 1 and r = 0.74 for A- 2, and A- 3 in this correlation was not significant. The air temperature showed a correlation only in the open area A- 2. With regard to the correlation of soil moisture no significant direct correlations, and only there was a significant negative correlation (r = -0.50) to 5 % in A- 3 with the humidity. The environmental assessment of the areas of monitoring shows that these have low quality indicators is also affected by water shortages in the region for eight months of the year. A- 1 shows the best biological, chemical and microclimatic indicators, followed by A-2 and A- 3 which have several deficiencies and problems in terms of structure and biological activity of soil. In this study, we conclude that nearby areas , but with distinct characteristics can produce different patterns of CO2 emission , thus hindering global estimates of CO2 emissions . Most elements associated CO2 emissions appear to be related to soil temperature and air temperature , humidity and soil , however , other factors that may be indirectly related and exert different influences according to the analyzed environment .
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Estudos de fungos filamentosos isolados da rizosfera de Senna spectabilis: uma exploração racional da biodiversidade molecular com potencial citotóxico e anticolinesterásico / Study of filamentous fungi isolated from Senna spectabilis' rizosphere: a rational exploitation of molecular biodiversity with cytotoxic and anticholinesterase potential

Vieira, Natália Carolina [UNESP] 01 March 2016 (has links)
Submitted by NATÁLIA CAROLINA VIEIRA null (vieira_naty@hotmail.com) on 2016-03-21T18:33:32Z No. of bitstreams: 1 Dissertação de Mestrado - Natália Carolina Vieira.pdf: 4489683 bytes, checksum: bb278e0db97defa0e9b2982e4b2a0703 (MD5) / Approved for entry into archive by Ana Paula Grisoto (grisotoana@reitoria.unesp.br) on 2016-03-22T18:08:55Z (GMT) No. of bitstreams: 1 vieira_nc_me_araiq.pdf: 4489683 bytes, checksum: bb278e0db97defa0e9b2982e4b2a0703 (MD5) / Made available in DSpace on 2016-03-22T18:08:55Z (GMT). No. of bitstreams: 1 vieira_nc_me_araiq.pdf: 4489683 bytes, checksum: bb278e0db97defa0e9b2982e4b2a0703 (MD5) Previous issue date: 2016-03-01 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) / A cada ano vem crescendo a busca por novas fontes de produtos naturais, na qual os micro-organismos recebem uma grande atenção, sendo eles de extrema importância na descoberta de compostos bioativos e promissores a novos fármacos. Esse trabalho teve como foco o estudo de fungos filamentosos da rizosfera de Senna spectabilis. Foram testadas suas viabilidades e após esse processo, dez fungos foram escolhidos para esse trabalho e submetidos aos testes biológicos como citotóxico, anticolinesterásico e antifúngico e também foram obtidos seus perfis cromatográficos e químicos por CLAE-DAD e RMN, além da identificação filogenética. Após esses resultados iniciais, dois fungos foram escolhidos para desenvolver o método de desreplicação, sendo eles Fusarium solani e F. oxysporum. Esses fungos apresentaram atividade antifúngica contra C. cladosporioides e C. sphaerospermun e também apresentaram atividade anticolinesterásica, além disso, F. oxysporum apresentou também atividade antitumoral contra câncer do colorretal. Através das técnicas CG-EM, CLAE-EM, CLAE-EM/EM e RMN foram propostas estruturas moleculares interessantes para substâncias produzidas por esses micro-organismos, sendo que para o extrato de Fusarium solani foram identificados 12 metabólitos: ácido fumárico, ácido málico, tirosol, ácido p-hidroxibenzóico, ácido azelaico, ácido fusárico, (-)-ácido jasmônico/ácido (+)-7-iso-jasmônico, 10-hidroxicaptotecina, C-16-esfinganina, xestoaminol C, armilarina/armilaripina e beauvericina e para o extrato do fungo Fusarium oxysporum foram observados 14 metabólitos: ácido succínico, ácido phidroxibenzóico, ácido hexadecanóico, ácido octadecanóico, ácido fusárico e três de seus derivados, integracídeo C, fusagerina C/D, C-16-esfinganina, xextoaminol C, armilarina/armilaripina e beauvericina. Além desses compostos, outros 5 metabólitos comuns às espécies solani e oxysporum foram observados, mas não puderam ser estruturalmente caracterizados por CLAE-EM/EM, no entanto, suas massas moleculares já foram relatadas para espécies de Fusarium. / The search for new sources of natural products has been increasing to the rational exploration of microorganisms as great sources for the discovery of bioactives and promising compounds as well as new drugs. This work focused on the study of filamentous fungi, isolated from Senna spectabilis’s rhizosphere from which were tested its viabilities. Thereon, ten fungi were chosen for this work and were submitted to biological tests, such as cytotoxic, anticholinesterase and antifungal. In addition, their chemical profiles were obtained for HPLC and NMR, besides phylogenetic identification. Finally, two fungi were chosen to develop dereplication method, being them Fusarium solani and F. oxysporum.These fungi howed anticholinesterase activity and antifungal activity against C. cladosporioides and C. sphaerospermun. Additionally, F. oxysporum showed antitumor activity against colorectal cancer. Through the GC-MS, HPLC-MS, HPLC-MS/MS and NMR, we were able to obtained interesting molecular chemotypes for these microorganisms; for F. solani we identified 12 metabolites, fumaric acid, malic acid, tyrosol, p-hydroxybenzoic acid, azelaic acid, fusaric acid, (+)-7-iso-jasmonic acid/(-)-jasmonic acid, 10- hydroxycamptotecin, C16-sphinganine, xestoaminol C, armillarin/armillaripin and beauvericin and for F. oxysporum was observed 14 metabolites, succinic acid, phydroxybenzoic acid, hexadecanoic acid, octadecanoic acid, fusaric acid and its three derivatives, integracide C, fusagerin C/D, C-16-sphinganine, xestoaminol C, armillarin/armillaripin and beauvericin. Besides these compounds, others 5 metabolites common to both species (solani and oxysporum) couldn’t be structurally characterized thorough LC-MS/MS, but they were accounted in several Fusarium species.
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Estudos de fungos filamentosos isolados da rizosfera de Senna spectabilis: uma exploração racional da biodiversidade molecular com potencial citotóxico e anticolinesterásico /

Vieira, Natália Carolina. January 2016 (has links)
Orientador: Ian Castro-Gamboa / Banca: Isabele Rodrigues Nascimento / Banca: Flávia Talarico Saia / Resumo: A cada ano vem crescendo a busca por novas fontes de produtos naturais, na qual os micr o - organismos recebem uma grande atenção, sendo eles de extrema importância na descoberta de compostos bioativos e promissores a novos fármacos. Esse trabalho teve como foco o estudo de fungos filamentosos da rizo sfera de Senna spectabilis . F oram testadas suas viabilid ad es e a pós esse processo, dez fungos foram escolhidos para esse trabalho e submetidos a os testes biológicos como citotóxico, anti colinesterásico e antifúngico e t ambém foram obtidos seus perfis cromatográficos e químicos por CLAE - DAD e RMN, além da identificação filogenética. A pós esses resultados iniciais, dois fungos foram escolhidos para desenvolver o método de desreplicação, sendo eles Fusarium solani e F . oxysporum . Esses fungos apresentaram atividade antifúngica contra C. cladosporioides e C. sphaerospermun e também apresentaram atividade anticolinesterásica, além disso, F. oxysporum apresentou também atividade antitumoral contra câncer do colorretal. Através das téc n icas CG - EM, CLAE - EM, CLAE - EM/EM e RMN foram propostas estruturas moleculares interessantes para substâncias produzidas por e sses micro - organismos, sendo que para o extrato de Fusarium solani foram identificados 1 2 metabólitos: ácido fumárico, ácido málico, tirosol, ácido p - hidroxibenzóico, ácido azelaico, ácido fusárico, ( - ) - ácido jasmônico/ácido (+) - 7 - iso - jasmônico, 10 - hidroxicaptotecina, C - 16 - esfinganina, xestoaminol C, armilarina/armilaripina e beauvericina e para o extrato d o fungo Fusarium oxysporum foram observados 14 metabólitos: ácido succínico, ácido p - hidroxibenzóico, ácido hexadecanó i co, ácido octadecanóico, ácido fusárico e três de seus derivados, integracídeo C, fusagerina C/D, C - 16 - esfinganina, xextoaminol C, armila rina/armilaripina e beauver i cina . Além desses... / Abstract: T he search for new sources of natural products has been increasing to the rational exploration of microorganisms as great sources for the discovery of bioactives and promising compounds as well as new drugs. This work focused on the study of filamentous fungi, isolated from Senna spectabilis's rhizosphere from which were tested its viabilities. Thereon, ten fungi were chosen for this work and were s ubmitted to biological tests, such as cytotoxic, anticholinesterase and antifungal. In addition, their chemical profiles were obtained for HPLC and NMR, besides phylogenetic identification. Finally, tw o fungi were chosen to develop dereplication method, being them Fusarium solani and F . oxysporum. Th ese fungi howed anticholinesterase activity and antifungal activity aga in st C. cladosporioides and C. sphaerospermun . Additionally, F. oxysporum showed antitumor activity against colorectal cancer. Through the GC - MS, HPLC - MS, HPLC - MS/MS and NMR, we were able to obtained interesting molecular chem o types for these microorganisms; for F. solani we identified 12 metabolites, fumaric acid, malic acid, tyrosol, p - hydroxybenzoic acid, azelaic acid, fusaric acid, (+) - 7 - iso - jasmonic acid/( - ) - jasmonic acid, 10 - hydroxycamptotecin, C16 - sphinganine, xestoaminol C, armillarin/armillaripin and beauvericin and for F. oxysporum was observed 14 metabolites, succinic acid, p - hydroxybenzoic acid, hexadecanoic acid, octadecanoic acid, fusaric acid and its three derivatives, integracide C, fusagerin C/D, C - 16 - sphinganine, xestoaminol C, armillarin/armillaripin and beauvericin . Besides these compounds, others 5 metabolites common to both species ( solani and ox y sporum ) couldn't be structurally characterized thorough LC - MS/MS, but they were accounted in several Fusarium species. / Mestre
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Emissão de CO2 do solo e sua correlação com a rizosfera de diferentes paisagens de áreas mineradas do município de Santo Antônio de Pádua-RJ / Emission from soils and their correlation with the rhizosphere of different landscapes of mined areas in the municipality of Santo Antônio de Pádua-RJ

Cássia Barreto Brandão 12 February 2014 (has links)
Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / Objetivando avaliar o comportamento das emissões de CO2 do solo em áreas mineradas do município de Santo Antônio de Pádua-RJ e sua correlação com a rizosfera, este presente estudo utilizou uma câmara fechada com sensor de infravermelho em três diferentes paisagens, a saber: A-1 (área reflorestada há 10 anos), A-2 (área desmatada) e A-3 (área em processo de recuperação). Em cada área foi instalada três cilindros para efeitos de repetição. O monitoramento foi realizado durante os meses representativos de cada estação do ano de 2013, sendo a análise realizada durante dois dias consecutivos. Concomitantemente as coletas de CO2 foram realizadas coletas de dados de temperatura e umidade do solo, sendo também avaliadas informações pedológicas através das análises de granulometria, porosidade, pH, carbono orgânico e matéria orgânica. Informações meteorológicas e microclimatológicas também foram extraídas através de uma estação meteorológica automática e através de sensores portáteis. Os resultados permitem concluir que existe uma variação sazonal dos fluxos de CO2, havendo uma tendência de máximos de emissão durante o verão e de mínimas durante o inverno, sendo o outono e a primavera marcados por valores medianos. A correlação das áreas entre os dois dias monitoramento indicam que as emissões foram semelhantes ao da análise em dia anterior, apresentando uma correlação significativa a 5% para A-1 e A-2 e de 1% para A-3. A-1 e A-2 apresentaram emissões de CO2 mais homogêneas que A-3, havendo, entretanto, um maior fluxo de CO2 durante o verão para todas as áreas. Os dados de MOS, COS e pH demonstraram não haver uma correlação direta com as emissões de CO2. Os dados de porosidade e densidade, porém, apontam para uma possível correlação com as menores emissões de CO2 em A-3 devido a menor porosidade e maior densidade de seus solos. A temperatura do solo foi a variável que mais se correlacionou com as emissões de CO2, havendo um índice igual a r =0,68 para A-1 e de r =0,74 para A-2, sendo que em A-3 esta correlação não foi significativa. A temperatura do ar demonstrou uma correlação somente na área descampada de A-2. No que se refere à correlação da umidade do solo não houve correlações diretas significativas, sendo que somente houve uma correlação negativa (r=-0,50) significativa a 5% em A-3 com a umidade do ar. O diagnóstico ambiental das áreas de monitoramento revela que estas possuem baixos indicadores de qualidade, sendo afetados também pela escassez hídrica da região durante oito meses do ano. A-1 apresenta os melhores indicadores biológicos, químicos e microclimáticos, seguidos por A-2 e A-3 que apresentam diversas deficiências e problemas em termos de estrutura e atividade biológica dos solos. Neste estudo permite-se concluir que áreas próximas, porém com características distintas podem produzir diferentes padrões de emissão de CO2, dificultando, portanto, estimativas globais de emissão de CO2. Os elementos mais associados às emissões de CO2 parecem estar relacionados à temperatura do solo e do ar, umidade do ar e estrutura do solo, havendo, entretanto, outros fatores que podem estar indiretamente relacionados e que exercem diferentes influências de acordo com o ambiente analisado. / Seeking evaluate the performance of CO2 emissions from soil in mined areas in the municipality of Saint Anthony of Padua - RJ and its correlation with the rhizosphere , the present study used a closed chamber with infrared sensor in three different landscapes , namely: A- 1 ( reforested area 10 years ago ) , a- 2 ( pasture) and A- 3 (area under recovery ) . In each area was installed three cylinders for the purpose of repetition. Monitoring was conducted during the months representing each season of the year 2013, with an analysis performed for two consecutive days. Simultaneously the analyses of temperature and soil moisture were performed, and also evaluated soil information by analyzing particle size , porosity, pH , organic carbon and organic matter information microclimatológicas and of weather were also extracted through sensors automatic and portable.The results indicate that there is a seasonal variation in CO2 fluxes , there is a trend of maximum emission during summer and minimum during winter , with autumn and spring marked by median values . The correlation among the areas two days indicate that monitoring emissions analysis were similar to the previous days, presenting a significant correlation to 5 % for A -1 and A -2 and A- 1 to 3 %. A- 1 and A- 2 had CO2 emissions more homogeneous than A- 3, there are, however, a greater flow of CO2 during the summer for all areas. MOS data, COS and pH showed no direct correlation with CO2 emissions. The porosity and density data, however, point to a possible correlation with the lowest CO2 emissions in A- 3 due to lower porosity and higher density of your soil. Soil temperature was the variable that was most associated with CO2 emissions, with an equal index for air = 0.68 A- 1 and r = 0.74 for A- 2, and A- 3 in this correlation was not significant. The air temperature showed a correlation only in the open area A- 2. With regard to the correlation of soil moisture no significant direct correlations, and only there was a significant negative correlation (r = -0.50) to 5 % in A- 3 with the humidity. The environmental assessment of the areas of monitoring shows that these have low quality indicators is also affected by water shortages in the region for eight months of the year. A- 1 shows the best biological, chemical and microclimatic indicators, followed by A-2 and A- 3 which have several deficiencies and problems in terms of structure and biological activity of soil. In this study, we conclude that nearby areas , but with distinct characteristics can produce different patterns of CO2 emission , thus hindering global estimates of CO2 emissions . Most elements associated CO2 emissions appear to be related to soil temperature and air temperature , humidity and soil , however , other factors that may be indirectly related and exert different influences according to the analyzed environment .
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Interação de plantas de trevo vermelho inoculadas com rizóbios com ácaros e colêmbolos edáficos / Interaction of red clover plants inoculated with rhizobia with edaphic mites and springtails

Bassani, Victor Lucas January 2015 (has links)
A mesofauna edáfica, compreendendo ácaros e colêmbolos, é sensível a alterações no solo, sendo considerada um indicador de qualidade, uma vez que realiza a fragmentação de matéria orgânica, controle populacional de determinados grupos da biota do solo e ingestão de microrganismos. A colonização de plantas por micro-organismos, como a de leguminosas por rizobios, pode levar a mudanças na rizosfera vegetal e influenciar a mesofauna. Este estudo teve por objetivo avaliar o efeito da inoculação de plantas de trevo vermelho com rizóbios sobre os ácaros e colêmbolos edáficos e avaliar se colêmbolos alimentados com rizóbios poderiam inocular plantas hospedeiras. Para isso, plantas de trevo vermelho, inoculadas com as estirpes SEMIA 2081, SEMIA 2082 e SEMIA 222, e plantas controle sem inoculação foram plantadas em tubos-armadilha e inseridas em campo. A seguir, a mesofauna atraída foi extraída e identificada. Outro experimento em laboratório utilizou plantas de trevo vermelho que foram colocadas em contato com colêmbolos da família Hypogastruridae e dos gêneros Proisotoma, Onychiurus e Orthonychiurus, os quais haviam sido alimentados com um substrato impregnado com o rizóbio da estirpe SEMIA 2081 As plantas inoculadas com as três estirpes de rizóbios atrairam ácaros edáficos mas não colêmbolos, quando comparadas com as plantas que não foram inoculadas nem receberam fonte de nitrogênio. Considerando os números totais de ácaros e colêmbolos, somente as plantas inoculadas com a estirpe SEMIA 222 apresentaram atratividade quando comparadas ao controle sem inoculação e sem fonte de nitrogênio. A atratividade de ácaros e colêmbolos observada no tratamento controle com nitrogênio foi similar aos tratamentos inoculados. No experimento de laboratório, os colêmbolos vivos e o macerado de colêmbolos da família Hypogastruridae, e gêneros Proisotoma e Orthonychiurus foram capazes de transferir os rizóbios que receberam pela alimentação às plantas, formando nódulos radiculares. As plantas que receberam o macerado de colêmbolos da família Hypogastruridae apresentaram maior número de nódulos comparadas às plantas que receberam os mesmos colêmbolos vivos. / The soil mesofauna comprising mites and springtails, is sensitive to changes in soil, and it is considered a quality indicator since it performs fragmentation of organic matter, population control of certain soil biota groups and ingestion of microorganisms. The plants colonized by microorganisms, such as legumes by rhizobia can lead to changes in plant rhizosphere and influence mesofauna. This study aimed to evaluate the effect of inoculation of red clover plants with rhizobia on edaphic mites and springtails and assess if springtails fed with rhizobia could inoculate host plants. For this, red clover plants inoculated with strains SEMIA 2081, SEMIA 2082 and SEMIA 222, and control plants without inoculation were planted in trap-tubes and inserted on field. Then, the attracted mesofauna was submitted to extraction and identification. Another laboratory experiment used red clover plants put in contact with springtails. These springtails of Hypogastruridae family and Proisotoma, Onychiurus and Orthonychiurus genera, had been fed with a substrate impregnated with rhizobia strain SEMIA 2081. Plants inoculated with three Rhizobia strains attracted edaphic mites, but not Collembola, when compared to uninoculated plants with no nitrogen source Considering the total numbers of mites and springtails, only plants inoculated with SEMIA 222 strain showed attractiveness when compared to the control without inoculation and no nitrogen source. The attractiveness of mites and springtails observed in the control treatment with nitrogen was similar to the inoculated treatments. In the laboratory experiment, the living springtails and the macerate of springtails of Hypogastruridae family, and Proisotoma and Orthonychiurus genera were able to transfer the rhizobia that they received by feeding to the plants, forming root nodules. The plants that received the macerate of springtails of the Hypogastruridae family had a higher number of nodules compared to the plants that received the same living springtails.
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A planta e a forma de nitrogênio na solubilização de fosfato natural / The plant and nitrogen form in the solubilization of rock phosphate

Silva, Lucas de Ávila 17 February 2014 (has links)
Submitted by Reginaldo Soares de Freitas (reginaldo.freitas@ufv.br) on 2015-11-30T09:10:00Z No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 545088 bytes, checksum: 797bd363c30cfa29a89410cfa9849974 (MD5) / Made available in DSpace on 2015-11-30T09:10:00Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 545088 bytes, checksum: 797bd363c30cfa29a89410cfa9849974 (MD5) Previous issue date: 2014-02-17 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / Na maioria dos solos brasileiros, a adsorção específica de P em óxidos e a precipitação como diferentes formas de fosfatos de Fe e Al dificultam a absorção e utilização de fosfato pelas plantas. Nessas condições, a utilização de espécies vegetais com sistema radicular desenvolvido e a combinação de fertilizantes podem favorecer a recuperação do P adicionado. Para avaliar a influência da planta e a combinação de fertilizantes na solubilização de fosfatos naturais e disponibilidade de P, plantas pré-germinadas de milheto (Pennisetum glaucum (L.) Leeke) foram cultivadas em câmara com luz e temperatura controlada. As plantas cresceram em rizotubos, estrutura cilíndrica oca que favorece uma maior densidade de raiz. Foram aplicadas fontes de P combinadas com fontes de N em amostras de um Latossolo Vermelho-Amarelo com baixa (Pbaixo) e média (Pmédio) disponibilidade inicial de P. As fontes de P utilizadas foram os fosfatos naturais (FNs) de Bayóvar e de Araxá e o superfosfato triplo (ST), e as de N, (NH4)2SO4 e Mg(NO3)2.6H2O. Rizotubos sem a planta foram mantidos como controle. Após 46 d de cultivo, as plantas foram coletadas e separadas em parte aérea e raiz, para determinação da massa de matéria seca e do conteúdo de P, Ca, Mg e N. O solo foi seco e peneirado para a análise de P- resina, Ca2+, Mg2+, NO3-, NH4+ e pH. Os resultados indicaram maior nitrificação em Pmédio (na ausência de planta). A presença da planta favoreceu a solubilização dos FNs. Observou-se que a resposta à adubação fosfatada combinada com N depende dos teores iniciais de P no solo. De maneira geral, o fornecimento de N-NH4+ proporcionou maior produção de matéria seca em Pbaixo, maior conteúdo de P e aumento da recuperação pela planta do FN Araxá em Pbaixo e do FN Bayóvar em Pmédio. Na presença de planta, houve aumento da eficiência agronômica dos FNs em relação ao ST quando o solo apresentava média disponibilidade de P. / In most Brazilian soils, the specific adsorption of P to oxides and precipitation in different Fe and Al phosphate forms hamper the phosphate uptake and use by plants. Under these conditions, using plant species with a well-developed root system and fertilizer combinations can promote the recovery of P applications. To assess the influence of a plant species and fertilizer combinations on the solubilization of phosphate rocks (PR) and P availability, pre-germinated plants of pearl millet (Pennisetum glaucum (L.) Leeke) were grown under controlled light and temperature conditions. To favor a higher root density, the plants were grown in hollow cylindrical rooting tubes. Combined P and N sources were applied to samples of a Latossolo Vermelho Amarelo (Oxisol) with low (Plow) and medium (Pmed) initial P availability. The P sources consisted of Bayóvar and Araxá PRs and triple superphosphate (TS), and of N, (NH4)2SO4 and Mg(NO3)2.6H2O. Rooting tubes without plants were maintained as controls. After 46 d of cultivation, the plants were cut and separated into aerial and root parts to determine dry matter and P, Ca, Mg, and N concentrations. The soil was dried and sieved to analyze P-resin, Ca2+, Mg2+, NO3-, NH4+ and pH. The results indicated higher nitrification in Pmed (without plant). The presence of plants favored the solubilization of PR. It was observed that the response to P + N fertilization was related to the initial soil P content. In general, the supply of N-NH4+ induced a higher dry matter production in Plow, and increased the P concentration and plant P recovery from Araxá PR in Plow and from Bayóvar PR in Pmed. The presence of plants increased the agricultural efficiency of PR over TS in soil with medium P availability.
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Interação de plantas de trevo vermelho inoculadas com rizóbios com ácaros e colêmbolos edáficos / Interaction of red clover plants inoculated with rhizobia with edaphic mites and springtails

Bassani, Victor Lucas January 2015 (has links)
A mesofauna edáfica, compreendendo ácaros e colêmbolos, é sensível a alterações no solo, sendo considerada um indicador de qualidade, uma vez que realiza a fragmentação de matéria orgânica, controle populacional de determinados grupos da biota do solo e ingestão de microrganismos. A colonização de plantas por micro-organismos, como a de leguminosas por rizobios, pode levar a mudanças na rizosfera vegetal e influenciar a mesofauna. Este estudo teve por objetivo avaliar o efeito da inoculação de plantas de trevo vermelho com rizóbios sobre os ácaros e colêmbolos edáficos e avaliar se colêmbolos alimentados com rizóbios poderiam inocular plantas hospedeiras. Para isso, plantas de trevo vermelho, inoculadas com as estirpes SEMIA 2081, SEMIA 2082 e SEMIA 222, e plantas controle sem inoculação foram plantadas em tubos-armadilha e inseridas em campo. A seguir, a mesofauna atraída foi extraída e identificada. Outro experimento em laboratório utilizou plantas de trevo vermelho que foram colocadas em contato com colêmbolos da família Hypogastruridae e dos gêneros Proisotoma, Onychiurus e Orthonychiurus, os quais haviam sido alimentados com um substrato impregnado com o rizóbio da estirpe SEMIA 2081 As plantas inoculadas com as três estirpes de rizóbios atrairam ácaros edáficos mas não colêmbolos, quando comparadas com as plantas que não foram inoculadas nem receberam fonte de nitrogênio. Considerando os números totais de ácaros e colêmbolos, somente as plantas inoculadas com a estirpe SEMIA 222 apresentaram atratividade quando comparadas ao controle sem inoculação e sem fonte de nitrogênio. A atratividade de ácaros e colêmbolos observada no tratamento controle com nitrogênio foi similar aos tratamentos inoculados. No experimento de laboratório, os colêmbolos vivos e o macerado de colêmbolos da família Hypogastruridae, e gêneros Proisotoma e Orthonychiurus foram capazes de transferir os rizóbios que receberam pela alimentação às plantas, formando nódulos radiculares. As plantas que receberam o macerado de colêmbolos da família Hypogastruridae apresentaram maior número de nódulos comparadas às plantas que receberam os mesmos colêmbolos vivos. / The soil mesofauna comprising mites and springtails, is sensitive to changes in soil, and it is considered a quality indicator since it performs fragmentation of organic matter, population control of certain soil biota groups and ingestion of microorganisms. The plants colonized by microorganisms, such as legumes by rhizobia can lead to changes in plant rhizosphere and influence mesofauna. This study aimed to evaluate the effect of inoculation of red clover plants with rhizobia on edaphic mites and springtails and assess if springtails fed with rhizobia could inoculate host plants. For this, red clover plants inoculated with strains SEMIA 2081, SEMIA 2082 and SEMIA 222, and control plants without inoculation were planted in trap-tubes and inserted on field. Then, the attracted mesofauna was submitted to extraction and identification. Another laboratory experiment used red clover plants put in contact with springtails. These springtails of Hypogastruridae family and Proisotoma, Onychiurus and Orthonychiurus genera, had been fed with a substrate impregnated with rhizobia strain SEMIA 2081. Plants inoculated with three Rhizobia strains attracted edaphic mites, but not Collembola, when compared to uninoculated plants with no nitrogen source Considering the total numbers of mites and springtails, only plants inoculated with SEMIA 222 strain showed attractiveness when compared to the control without inoculation and no nitrogen source. The attractiveness of mites and springtails observed in the control treatment with nitrogen was similar to the inoculated treatments. In the laboratory experiment, the living springtails and the macerate of springtails of Hypogastruridae family, and Proisotoma and Orthonychiurus genera were able to transfer the rhizobia that they received by feeding to the plants, forming root nodules. The plants that received the macerate of springtails of the Hypogastruridae family had a higher number of nodules compared to the plants that received the same living springtails.

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