Thesis (Ph. D.)--University of Wisconsin--Madison, 1966. / Typescript. Vita. Includes bibliographical references.

Made available in DSpace on 2016-08-29T15:38:12Z (GMT). No. of bitstreams: 1 tese_7215_31 - Francisco de Castro Rocha Neto- dissertação20150904-103939.pdf: 1515880 bytes, checksum: 492b726ff20f4173c65523fb754e2f2b (MD5) Previous issue date: 2013-11-27 / A pimenta-do-reino é o terceiro item na pauta das exportações agrícolas do Estado do Espírito Santo. A fusariose é uma das principais doenças da cultura por causar a morte da planta e inviabilizar a produção econômica. O estudo do comportamento espaço-temporal é uma importante ferramenta no diagnóstico e na orientação do manejo de doenças de plantas. Objetivou-se, com este trabalho, conhecer o comportamento espaço-temporal da fusariose em plantios de pimenta do-reino. O experimento foi conduzido em condições de campo, na região Norte do Estado do Espírito Santo, no período de julho de 2010 a janeiro de 2012. Foram selecionados quatro talhões de cada idade, 1, 2, 3, 4 e 5 anos, em diferentes lavouras de pimentado-reino, com 500 plantas cada. A incidência da fusariose foi avaliada bimensalmente. No estudo temporal, realizado por meio da curva de progresso da doença, o modelo monomolecular foi o que melhor se ajustou aos dados obtidos. O comportamento espacial mostrou uma distribuição inicial da doença de forma casualizada, seguindo a mudança do modelo para agregado, indicando o lento processo de disseminação da doença planta-a-planta, característico de patógenos habitantes do solo.

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Submitted in partial fulfillment for the Degree of Master of Technology: Biological Sciences at M.L. Technikon, 2001. / Mycotic keratitis has been found to account for 6% to 50% of all cases of ulcerated keratitis. Fusarium species, and in particular Fusarium so/ani, is the most frequent cause of mycotic infections of the cornea. These infections lead to a marked loss of vision and eventually a complete perforation of the cornea if not correctly diagnosed and treated. Fusarium species produce toxic mycotoxins that are known to exert adverse health effects in humans and animals. However, very few attempts have been made to establish the mycotoxin-producing capabilities of clinical isolates of Fusarium species from keratitis infections or any other human infections for that matter. / M

Made available in DSpace on 2015-07-22T20:50:08Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2009-02-27 / Em vista do crescimento de infecções fúngicas oportunisticas causadas por Fusarium spp. e da resistência do fungo aos antifúngicos frequentemente utilizados, o estudo visa avaliar o perfil de sensibilidade das associações entre terbinafina, itraconazol, cetoconazol e anfotericina B frente a 20 isolados clínicos e ambientais de Fusarium solani, e verificar fatores associados a virulência como pesquisa de melanina na parede celular e a produção das enzimas extracelulares proteinase, fosfolipase, lipase e DNAse. Anfotericina B associada à itraconazol demonstrou efeito sinérgico em 15% dos isolados, sendo 33% de origem ambiental e 65% de origem clínica. Efeitos sinérgicos foram obtidos contra 10% dos isolados na associação entre anfotericina B e cetoconazol e contra 5% na associação entre anfotericina B e terbinafina. Nossos resultados revelaram efeitos aditivos e indiferentes contra as cepas testadas nas associações entre terbinafina e derivados azólicos. Não foi detectada presença de melanina na parede de F. solani. As culturas de F. solani clínicas e ambientais apresentaram atividade enzimática de proteinase positiva após coloração com ácido acético e negro de amido, com formação de halos ao redor da colônia na proporção de 30% e 45% respectivamente. Atividades enzimáticas de lipase, fosfolipase e DNAse não foram detectadas, contudo, não é possível afirmar que F. solani não produza essas enzimas, considerando que as mesmas podem ser mantidas intracelularmente e não liberadas para o meio. / Despite of the increase of opportunistic fungal infections caused by Fusarium spp. and their resistance to antifungal drugs, the aims of this study were to evaluate susceptibility profiles of 20 clinical and environmental isolates of Fusarium solani against the associations among terbinafine, itraconazole, ketoconazole and amphotericin B, and to verify the presence of associated virulence factors as melanin and extracellular enzymes (proteinase, phospholipase, lipase and DNAse). Amphotericin B combined with itraconazole showed synergism against 15% of the isolates, 33% of these was from the environment and 65% from clinical cases. Synergistic effect was observed against 10% of strains tested by association between amphotericin B and ketoconazole and against 5% in association between anphotericin B and terbinafine. The associations between terbinafine and azole derivatives showed additive effect and no difference against the samples. Presence of melanin in the F. solani cell wall was not observed. Both, clinical and environmental isolates expressed enzymatic activity of proteinase in 30% and 45% of cases. Enzymatic activity of lipase, phospholipase and DNAse were not detected; however, it was not possible to state that F. solani do not produce these enzymes, as they could manteined intracellularly and would not released to the environment. / TEDE / BV UNIFESP: Teses e dissertações

Made available in DSpace on 2014-07-29T15:16:27Z (GMT). No. of bitstreams: 1 dissertacao andrei.pdf: 2548450 bytes, checksum: dedf19335cba3686a528075fb5da8300 (MD5) Previous issue date: 2010-02-26 / Species of Trichoderma are commercially applied as biological control agents against plant fungal pathogens. Their action is based on a set of events, such as the production of antifungal metabolites, competition for space and nutrients and mycoparasitism. However the biocontrol mechanism of the interaction between Trichoderma harzianum and Fusarium solani is not yet understanded at the transcriptome level. This study aimed to initiate the preliminary development of an expressed sequence tag (EST) database for Trichoderma harzianum and thereby gain potentially useful information on Trichoderma gene sequences in order to elucidate the integrated biocontrol mechanism. Partial sequencing of anonymous cDNA clones is a widely used technique for gene identification. A directional cDNA library has been constructed from mycelium of Trichoderma harzianum grown on cell wall isolated from Fusarium solani. 3984 clones have been randomly selected, subjected to single-pass sequencing from the 5 end of the vector, and identified by sequence similarity searches against gene sequences in GenBank fungal database. Of the 3984 mycelium clones, 40.8% exhibit similarity to known genes. Analysis of the identified clones indicated sequence similarity to a broad diversity of genes encoding proteins such as enzymes, structural proteins, and regulatory factors. A significant proportion of genes identified were involved in processes related to mycoparasitism (3,81%), as would be expected in biocontrol fungus. These results present the successful application of EST analysis in the interaction of Trichoderma harzianum and Fusarium solani to provide a preliminary indication of gene expression. / Espécies do gênero Trichoderma são comercialmente aplicadas como agentes de controle biológico contra fungos patógenos de plantas. Sua ação é baseada em diferentes mecanismos como a produção de antibióticos voláteis e não-voláteis, competição por espaço e nutrientes e micoparasitismo. O mecanismo de biocontrole da interação entre Trichoderma harzianum e Fusarium solani ainda não foi explorado ao nível de transcriptoma. Este estudo buscou iniciar o desenvolvimento de uma base de dados de EST (Expressed Sequence Tags) para assim obter informações úteis nas sequências de Trichoderma harzianum e entender melhor as vias integradas do mecanismo de biocontrole. Uma biblioteca direcional de cDNA foi construída a partir do micélio de Trichoderma harzianum crescido em parede celular isolada de Fusarium solani. 3984 clones foram selecionados aleatoriamente, submetidos ao seqüenciamento da região 5 do vetor e identificados por similaridade contra a base de dados de seqüências de fungos GenBank. Dentre os 3984 clones, 40,8% mostraram similaridade com genes conhecidos e descritos na literatura. Análises dos genes identificados indicam similaridade com uma grande diversidade de genes que codificam para enzimas, proteínas estruturais e fatores de regulação. Uma proporção significante dos genes identificados está envolvida com processos relacionados ao icoparasitismo (3,81%), como esperado para um fungo envolvido no controle biológico. Estes resultados mostram uma aplicação bem sucedida da análise de ESTs na interação entre Trichoderma harzianum e Fusarium solani e dar uma sugetão da expressão gênica.

Made available in DSpace on 2014-07-29T15:16:28Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Marcelo Ramada -.pdf: 3086154 bytes, checksum: d8d600492d75495c63dd916423b6e86b (MD5) Previous issue date: 2010-03-31 / Trichoderma harzianum is a saprophytic fungus, known for its potential as a biological control agent of different phytopathogens that causes losses in crops. Its action is based on different mechanisms like volatile and non-volatile antibiotics production, competition for nutrient and space, production of hydrolytic enzymes and mycoparasitism. Fusarium solani is the agent of bean dry root rot, and is responsible for significant losses. This work sought to analyze and identify secreted proteins from T. harzianum grown in the presence of F. solani cell wall, in an attempt to obtain new insights on biocontrol.In the dual culture test, T. harzianum proved to be a potent antagonist of F. solani. Some differences in the secreted proteins profile and final medium pH were observed when T. harzianum was grown in TLE medium containing glucose and in TLE and Minimum medium containing the cell wall of the phytopathogen. 33 proteins from 18 different genes were identified. The protein Sm1 was identified and secreted in all growth conditions. Many hydrolytic enzymes related to mycoparasitism, like endochitinases, β-1,3, β-1,6-glucanases, proteases and α-1,3-glicanases, were identified and among the proteases, a hypothetical metalocarboxipeptidase and a serine subtilisin-like never described for T. harzianum. Some enzymes with unkown roles in the mycoparasitism, such as β-1,3-glucanosyltransferase, secreted only in MM growth medium supernatant, were also identified. / Trichoderma harzianum é um fungo saprofítico, conhecido devido ao seu grande potencial como agente de controle biológico de diferentes fitopatógenos. Sua ação é baseada em diferentes mecanismos como a produção de antibióticos voláteis e não-voláteis, competição por espaço e nutrientes, produção de enzimas hidrolíticas e o micoparasitismo. Fusarium solani causa a podridão radicular seca no feijoeiro, resultando em perdas significativas. Este trabalho buscou analisar e identificar as proteínas secretadas por T. harzianum quando crescido na presença de parede celular de F. solani, em uma tentativa de obter novas informações sobre o biocontrole. Nos testes de pareamento, T. harzianum provou ser um potente antagonista de F. solani. Foi observada uma variação tanto no perfil de proteínas secretadas quanto no pH final, quando T. harzianum foi crescido em meio TLE contendo glicose e em meio TLE e Mínimo (M.M.) contendo parede celular do fitopatógeno. No total, 33 proteínas de 18 genes diferentes foram identificadas neste trabalho. A proteína Sm1 foi identificada e secretada em todas as condições de crescimento. Várias enzimas hidrolíticas relacionadas ao micoparasitismo, como endoquitinases, β-1,3, β-1,6-glicanases, proteases e α- 1,3-glicanases, foram identificadas e dentre as proteases, uma hipotética metalocarboxipeptidase e uma serina subtilisin-like nunca descritas em T. harzianum. Foram identificadas, também, enzimas que não possuem função conhecida no micoparasitismo, como a β-1,3-glicanosiltransferase, presente somente no sobrenadante do crescimento realizado em MM.

Submitted by Mario BC (mario@bc.ufrpe.br) on 2017-03-14T13:04:27Z No. of bitstreams: 1 Jose Aldo Teixeira da Silva.pdf: 972040 bytes, checksum: d6bba973ec0295e20860c1178753f8e3 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-03-14T13:04:27Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Jose Aldo Teixeira da Silva.pdf: 972040 bytes, checksum: d6bba973ec0295e20860c1178753f8e3 (MD5) Previous issue date: 2015-10-26 / Cassava has economic importance in Brazil and abroad, for their food importance. The Northeast is the region that most increased this crop in Brazil, but farmers use few technologies, resulting in diseases and decline in production. The crop is attacked for numerous pathogens as Fusarium solani and Scytalidium lignicola, that causes diseases such as cassava root rot and cassava black root, affecting the commercial part of plant, the tubera. Several research, support the use of practices that enable the production and support the environment, so the use of biocontrol has been used, particularly with the use of Trichoderma spp. However, little research reporting the physiological mechanisms that are activated by plants when exposed to this interaction, pathogen-plant-antagonist such as plant response to infection diseases. Thus, the objective this work was to verify the potential antagonism of Trichoderma spp. against F. solani and S. lignicola, and evaluating the physiological response of plants exposed to the pathosystem. We analyzed in vitro inhibition of mycelial growth of F. solani and S. lignicola to select the best Trichoderma antagonist with potential direct these pathogens. By the method of use of basal medium with colloidal chitin as the only carbon source, it was used to evaluate the best Trichoderma production of chitinase. In greenhouse, the selected Trichoderma was compared against the use of plant resistance inducer in vivo inhibition assessing the severity of disease infested plants after 92 days of growth. Then we evaluated the enzyme of antioxidative complex (peroxidase ascorbate, catalase, peroxidase and polyphenyl oxidase). All strains were inhibited the growth of pathogens. However, the best strain against F. solani was T. hamatum (6656), and has been for S. lignicola was T. harzianum (3086), with values of 88.91 and 80.78% growth mycelial respectively, being designated as the best candidates for treatments in the greenhouse. For chitinase production evaluation, all Trichoderma tested were positive, highlighting the T. aureoviride (5158) to produce 6.70 U mL-1, being selected candidate for inhibiting the severity of pathogens in greenhouse. All Trichoderma selected for in vivo testing against the severities of diseases, presented efficiency compared to the control with the presence of the pathogen. However, the T. aureoviride (5158), showed the blunt values for both pathogens. The results of the enzymes of the plants, treatments that stopped inoculation of Trichoderma showed satisfactory results, collaborating with the answer in a greenhouse, however, again treating with the strain (5158), showed the best values, especially the production of the enzymes peroxidase and ascorbate peroxidase. Therefore, concludes the efficiency of Trichoderma aureoviride (5158), for use as biocontrol of root rot and black rot of cassava as induced resistance to plant pathogens, contributing to the production of enzymes antioxidatives. / A mandioca tem grande expressão econômica no Brasil e no mundo, pela sua importância alimentar. O Nordeste é a região que mais aumentou a produção dessa cultura no Brasil, porém, os produtores usam poucas tecnologias, acarretando em possíveis desenvolvimentos de doenças e queda na produção. A cultura sofre muitas perdas na produção pela ação de inúmeros fitopatógenos, sendo os do solo os mais severos, o Fusarium solani e Scytalidium lignicola, ganham ênfase por causarem doenças como a podridão radicular e negra da mandioca, respectivamente, afetando diretamente a parte comercial da planta, a tubera. Muitas pesquisas, apoiam o uso de práticas que viabilizem a produção e favoreçam o ambiente, assim, a utilização de biocontroladores vem ganhando destaque, principalmente fungos do gênero Trichoderma spp., por suas características como antagonistas de uma gama de fitopatógenos. Todavia, há poucas pesquisas que relatam os mecanismos fisiológicos que são ativados pelas plantas, quando expostos a essa interação, patógeno-planta-antagonista, como resposta vegetal a infecção de doenças. Desse modo, objetivou-se verificar o potencial antagônico de dez Trichoderma spp. aos patógenos F. solani e S. lignicola, e avaliar a resposta fisiológica das plantas exposta a esse patossistema. Foi analisado, in vitro, a inibição do crescimento micelial do F. solani e S. lignicola em meio batata-dextrose-ágar, para selecionar o melhor Trichoderma com potencial antagonista direto a esses patógenos. Através do método da utilização de meio basal com quitina coloidal, sendo a única fonte de carbono, foi utilizada para avaliar o melhor Trichoderma para produção de quitinase. Em casa de vegetação, foi comparado os Trichoderma selecionados, contra o indutor de resistência, in vivo, avaliando a inibição das doenças infestadas nas plantas, após 92 dias de crescimento. Em seguida, avaliou-se a produção de enzimas das plantas dos tratamentos in vivo, do complexo oxidativo (ascorbato peroxidase, catalase, peroxidase e polifeniloxidase). Todas as estirpes apresentaram inibição do crescimento dos fitopatógenos. Porém, a melhor estirpe contra o F. solani foi o T. hamatum (6656), e para o S. lignicola foi o T. harzianum (3086), com valores de 88,91 e 80,78% de inbiçao de crescimento micelial, respectivamente, sendo designados como os melhores candidatos para tratamentos em casa de vegetação. Para a avaliação de produção de quitinase, todos os Trichoderma testados foram positivos, destaque dado ao T. aureoviride (5158) por produzir 6,70 U mL-1, sendo selecionado para candidato da inibição da severidade dos patógenos em casa de vegetação. Todas os Trichoderma selecionados para teste in vivo contra as severidades das doenças, apresentaram eficiência em comparação ao controle com a presença do patógeno. No entanto, o T. aureoviride (5158), foi a que apresentou valores contundentes para os dois patógenos. Dos resultados das enzimas das plantas, os tratamentos que detiveram a inoculação dos Trichoderma apresentaram resultados satisfatórios, colaborando com a resposta em casa de vegetação, contudo, novamente o tratamento com a estirpe (5158), foi a que apresentou melhores valores, com destaque a produção das enzimas ascorbato peroxidase e peroxidase. Portanto, conclui-se a efiência do Trichoderma aureoviride (5158), para uso como biocontrolador da podridão radicular e da podridão negra da mandioca, pois induziu resistência a planta aos fitopatógenos, colaborando com a produção das enzimas antioxidativas.

Made available in DSpace on 2018-08-01T23:26:43Z (GMT). No. of bitstreams: 1 tese_11880_87 - Ana Carolina Lyra Brumat.pdf: 1982746 bytes, checksum: d2338d3f287ef07c150e9304247877f7 (MD5) Previous issue date: 2018-02-16 / O estudo espaço-temporal de doença de plantas analisa a interação entre o patógeno, ambiente e o hospedeiro, no qual existem diversas metodologias que podem ser utilizadas para esse fim. A fusariose é considerada a principal doença fúngica na cultura da pimenta-do-reino, no entanto ainda são poucos os estudos epidemiológicos da doença. Visto isso, objetivou-se com o trabalho estudar a distribuição espacial da fusariose em pimenta-do-reino utilizando diferentes metodologias de estudo. Foram monitoradas quatro áreas homogêneas de pimenta-do-reino, no município de São Mateus-ES, no período de dez/2015 a dez/2016. A presença ou ausência de sintomas, bem como a posição de cada planta, foram anotadas em planilhas obtendo-se o mapeamento da evolução da doença dentro das áreas. Para o estudo espacial analisou-se os dados por diferentes metodologias: Índice de Dispersão (ID), Lei de Taylor modificada, análise de dinâmica e estrutura de focos (ADEF), e a krigagem. A análise dos dados por meio Lei de Taylor modificada indicou distribuição agregada somente para a área quatro. A ADEF mostrou que, com a evolução da doença no campo, os focos se tornavam maiores e em menor número. Com a utilização de geoestatística foi possível observar que a fusariose é disseminada a curta distância, e que os focos obedecem a um padrão de alongamento. Comparando os resultados obtidos pelos diferentes métodos observa-se que a geoestatística corroborou com os resultados apresentados pelas metodologias convencionais (Lei de Taylor modificada e a ADEF), e que a mesma tem potencial para ser utilizada no estudo espacial de doença de plantas.

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