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Perfil eletroforético das proteínas do leite e estabilidade no teste do álcool. / Electrophoretic profile of milk proteins and stability in alcohol testBarbosa, Rosângela Silveira 30 June 2011 (has links)
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Previous issue date: 2011-06-30 / Unstable non acid milk (LINA) characterizes for lack of stability of caseins, resulting in coagulation in the alcohol test, without high acidity, above 18°D and with changes in the milk s physic and chemical properties. Among chemical attributes, differences of total crude protein and protein fractions percentages are noticeable between stable and unstable milk. This study aimed to evaluate the relation between milk s electrophoretic profile and stability in the alcohol test with cows being fed with different diets. The trials were conducted at the dairy region of Pelotas, at the south of Rio Grande do sul State, Brazil.The first trial was held at the Embrapa Clima Temperado, from April to August, with two diets: control and feeding restriction, 100 and 60% of previous feeding amounts, with six Jersey cows, at the beginning of their lactation. The second trial was held at the Embrapa Clima Temperado, from May to June, with three diets: control (no additive inclusion), addition of sodium bicarbonate and addition of sodium citrate, with 17 Jersey cows at all lactation stages (76 to 293 days in milking). The third trial was held at the Colégio Agrícola Visconde da Graça UFPEL, from march to April, with three diets: control (deficient), 100% of energy nutritional requirements and 100% of protein-energy nutritional requirements, using 12 Holstein and Jersey cows, at the beginning and mid lactation. In all evaluations the following analyses were performed: alcohol test (with ethanol concentration from 68 to 80°GL v/v), titrable acidity, pH, boiling test, chemical composition, Somatic Cells Count (SCC). Besides, milk production, body weight, body condition score were
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also evaluated. Milk s protein fractions were evaluate with electrophoreses in 12% poliacrilamide gel. In the first trial, diets did not change protein fraction of the milk not its composition and stability, just milk production. However, stable milk and unstable milk presented differences for κ-CN percentages. In the second, the addition of sodium bicarbonate and addition of sodium citrate, influenced protein fraction β e κ-CN. The unstable milk presented higher amounts of αs-CN. In the third, the adjusted diets could alter milk production, protein, total solids and levels of calcium in milk and blood. / O Leite Instável Não Ácido (LINA) caracteriza-se pela perda da estabilidade das caseínas, resultando em precipitação positiva ao teste do álcool, sem apresentar acidez elevada acima de 18ºD e com alterações nas suas propriedades físico-químicas. Dentre as propriedades químicas destaca-se a diferença na porcentagem de proteína total e das frações protéicas entre leite estável e aquele instável no teste do álcool. O objetivo foi avaliar a relação entre o perfil eletroforético das frações protéicas do leite e sua estabilidade no teste do álcool com vacas recebendo diferentes dietas. Os experimentos foram conduzidos na bacia leiteira de Pelotas, zona sul do Rio Grande do Sul Brasil. O primeiro foi realizado na Embrapa Clima Temperado, nas estações de outono e inverno (de abril a agosto), com dois tratamentos: controle (dieta equilibrada) e restrição alimentar (60% de fornecimento de alimento), em seis vacas em lactação da raça Jersey, no estágio inicial de lactação. O segundo experimento foi realizado na Embrapa Clima Temperado, na estação do outono (maio a junho), com três tratamentos: controle (atendendo 100% das exigências nutricionais), adição de bicarbonato de sódio e adição de citrato de sódio, usando 17 vacas da raça Jersey, com média de 30 semanas de lactação). O terceiro experimento foi realizado no Colégio Agrícola Visconde da Graça UFPel,
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nas estações: final de verão e início do outono (março a abril), com 3 tratamentos: controle (sem atender as necessidades nutricionais dos animais), 100% de atendimento das exigências energéticas e 100% de atendimento das exigências energético-protéicas, usando 12 vacas da raças Jersey e Holandês, no primeiro e segundo estádio de lactação. Em todas as etapas foram realizadas as análises: teste do álcool (68 a 80ºGL v/v, acidez titulável, pH, fervura, composição química (gordura, proteína, lactose, sólidos totais), contagem de células somáticas. Foram avaliados os parâmetros de produção de leite, peso corporal, escore da condição corporal. Além dessas, foi realizado eletroforese em gel de poliacrilamida 15% para determinação das frações protéicas do leite. No primeiro experimento, conclui-se que as dietas não alteraram as frações protéicas, composição e estabilidade do leite e parâmetros produtivos das vacas em estudo, com exceção da produção de leite. Já com relação a comparação de leite estável e leite instável no teste do álcool houve diferenças na fração protéica β-caseína. O grupo de vacas com menor estabilidade do leite apresentou menor proporção de β, mas maior de k-CN, caseína total e proporção de caseína. No segundo experimento, os aditivos bicarbonato de sódio e citrato de sódio influenciaram apenas as frações protéicas β e κ-caseína. O leite instável apresentou maiores quantidades de αs-caseína. No terceiro experimento, as dietas ajustadas foram suficientes para reverter o quadro de LINA, causar influência na produção do leite, proteína, sólidos totais e teor de cálcio no leite e sangue.
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"Análise bayesiana da probabilidade de permanência no rebanho como característica de seleção para a raça Nelore" / Bayesian inference for stayability as selection criteria in Nelore beef cattleMarcondes, Cintia Righetti 12 September 2003 (has links)
As novas biotecnologias em reprodução, como a transferência de embriões e a fecundação in vitro, de certo modo, despertaram nos produtores e pesquisadores da área de melhoramento animal o interesse na seleção de fêmeas, antes pouco explorada dada a grande ênfase empregada na seleção e avaliação de reprodutores machos. A cada ano é percebido que a pecuária de corte funciona como uma empresa e, como tal, deve-se preocupar com todos os detalhes e não enfocando apenas um, como o mais importante, e é com isso que o Programa de Melhoramento Genético da Raça Nelore (PMGRN-USP) estuda cada vez mais um número maior de características como, stayability e suas possíveis aplicações à seleção das vacas Nelore, pois tem grande importância econômica. Com o objetivo de analisar a característica stayability sob enfoque Bayesiano, em registros de produção de vacas da raça Nelore, inicialmente foram implementados dois tamanhos de cadeia de Gibbs (225 ou 550 mil), dois períodos de descarte amostral (25 ou 50 mil) e duas formas de tomadas de amostra (a cada 1000 ou 250 rodadas). Os registros foram codificados como 0 (fracasso, ou menos de três partos até os 6 anos de idade) ou 1 (sucesso, ou pelo menos três partos até os 6 anos de idade) e os arquivos sofreram restrição ou não para NEP (Número Efetivo de Progênie), para número de touros dentro do grupo de contemporâneos (GC) e exclusão de grupos inteiros com média para a característica igual a 0 ou 1 (ou seja, sem variabilidade dentro do GC). Testaram-se três definições para GC. Utilizou-se o software MTGSAM for threshold (Multiple-Trait Gibbs Sampler for Animal Models), sob modelo unicaráter de touro-avô materno, para obtenção de componentes de (co)variância, estimativas de herdabilidade e soluções para cada touro (que originam as Diferenças Esperadas na Progênie - DEPs). As análises resultaram em amostras com baixa correlação serial, mostraram pequenas diferenças entre as estimativas pontuais de herdabilidade e alta correlação de rank para as DEPs dos 4180 touros avaliados. Adotou-se a implementação tamanho da cadeia/descarte amostral/amostragem como 225mil/25mil/1000 para as análises subseqüentes. A comparação entre estimativas de herdabilidade obtidas sob modelo de limiar e sob modelo linear não mostrou vantagens do primeiro, sendo que análises sob modelo linear, que têm reduzido tempo de processamento, poderiam ser preferidas quando houver muitos registros de produção, bastando transformar as estimativas de herdabilidade para escala subjacente. As comparações, sob modelo linear ajustadas para escala subjacente, entre a stayability padrão (0 ou 1) e a alternativa (considerando o número de partos até os seis anos de idade para aquelas vacas antes codificadas com valor 1), mostraram que podem ocorrer alterações na classificação de um número significativo de touros avaliados, mesmo sendo nas posições intermediárias do rank, talvez pela ligeira capacidade da característica alternativa em detectar variabilidade entre touros. Classificaram-se os 4180 touros em ordem decrescente e foram estudadas as genealogias dos 42 melhores (também chamados de TOP 1% ou aqueles que apresentam DEP para stayability superior a 57,6%) para identificar famílias importantes e avaliar a variabilidade genética da stayability. Além do touro Karvadi Imp. (essencialmente presente como avô, bisavô ou tataravô das mães dos touros TOP1%), outros genearcas com grande representatividade entre os TOP1% foram os touros Godhavari Imp. (via Kurupathy e Neofito), Rolex (via Cardeal), Rastã e Falo da BV (estes últimos pela via materna). / The new reproduction technologies like embryo transfer and in vitro fertilization brought to animal breeding researchers, and producers, a growing interest in the selection of females, which was a subject not well explored before, when the focus used to be only on evaluation and selection of males. The beef cattle industry is becoming more competitive each year, and the producers must think about all the aspects and details that can affect the production process. The PMGRN-USP (Nelore Breeding Program of the São Paulo University) studies a large number of traits to be used as selection criteria. Among these traits, there is stayability, which has a great economic importance. The aim of this project was to analyze the trait stayability, with a Bayesian approach, in a Nelore cattle population. Firstly, the implementation used two lengths of Gibbs chain (225 or 550 thousand), two periods of burn-in (25 or 50 thousand) and two thinning intervals (at each 1000 or 250 rounds). The cows were classified as 0 (failure, or less than three calves until six years of age), or 1 (success, or at least 3 calves until six years of age). The data were, or were not, restricted for NEP (Effective Number of Progeny), for number of sires in the contemporary group (GC), and for lack of variability in the contemporary group. Three different definitions of GC were tested. The software MTGSAM for threshold (Multiple-Trait Gibbs Sampler for Animal Models) was used, under an univariate sire-maternal grandsire model to get the (co)variance components, the heritability estimate and the solutions to each sire (that are used to get the Expected Progeny Differences - EPD). The results showed a low serial correlation in the samples, small differences among heritability estimates and a high rank correlation among the EPD estimates of the 4180 sires evaluated. The implementation 225000/25000/1000 was adopted to the subsequent analysis. The comparison between the heritability estimates obtained under the threshold model and the linear model didnt show any advantage to the first. The analysis under linear models could be preferred because of its reduced processing time in large data sets, needing only a transformation of the heritability estimates to the underlying scale. The comparisons, under linear model adjusted to the underlying scale, between the standard stayalility (0 or 1) and the alternative (obtained from the perception of the fertility differences among the cows classified as 1) showed a variation in the position of a considerable number of sires in the rank, maybe because the alternative trait gets some additional variation among sires. 4180 sires were classified in a rank and the genealogies of the 42 best sires (or TOP 1%, or the ones with stayability EPD greater than 57,6%) were studied to identify major families and evaluate the genetic variation of stayability. Besides of Karvardi Imp (a bull very present as an ascendant (2, 3 or 4 generations) of the dams of the TOP1% sires), another founder sires with influence among the TOP1% were Godhavari Imp (via Kurupathy and Neofito), Rolex (via Cardeal), Rastã, and Falo da BV (the last two via maternal).
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"Análise bayesiana da probabilidade de permanência no rebanho como característica de seleção para a raça Nelore" / Bayesian inference for stayability as selection criteria in Nelore beef cattleCintia Righetti Marcondes 12 September 2003 (has links)
As novas biotecnologias em reprodução, como a transferência de embriões e a fecundação in vitro, de certo modo, despertaram nos produtores e pesquisadores da área de melhoramento animal o interesse na seleção de fêmeas, antes pouco explorada dada a grande ênfase empregada na seleção e avaliação de reprodutores machos. A cada ano é percebido que a pecuária de corte funciona como uma empresa e, como tal, deve-se preocupar com todos os detalhes e não enfocando apenas um, como o mais importante, e é com isso que o Programa de Melhoramento Genético da Raça Nelore (PMGRN-USP) estuda cada vez mais um número maior de características como, stayability e suas possíveis aplicações à seleção das vacas Nelore, pois tem grande importância econômica. Com o objetivo de analisar a característica stayability sob enfoque Bayesiano, em registros de produção de vacas da raça Nelore, inicialmente foram implementados dois tamanhos de cadeia de Gibbs (225 ou 550 mil), dois períodos de descarte amostral (25 ou 50 mil) e duas formas de tomadas de amostra (a cada 1000 ou 250 rodadas). Os registros foram codificados como 0 (fracasso, ou menos de três partos até os 6 anos de idade) ou 1 (sucesso, ou pelo menos três partos até os 6 anos de idade) e os arquivos sofreram restrição ou não para NEP (Número Efetivo de Progênie), para número de touros dentro do grupo de contemporâneos (GC) e exclusão de grupos inteiros com média para a característica igual a 0 ou 1 (ou seja, sem variabilidade dentro do GC). Testaram-se três definições para GC. Utilizou-se o software MTGSAM for threshold (Multiple-Trait Gibbs Sampler for Animal Models), sob modelo unicaráter de touro-avô materno, para obtenção de componentes de (co)variância, estimativas de herdabilidade e soluções para cada touro (que originam as Diferenças Esperadas na Progênie - DEPs). As análises resultaram em amostras com baixa correlação serial, mostraram pequenas diferenças entre as estimativas pontuais de herdabilidade e alta correlação de rank para as DEPs dos 4180 touros avaliados. Adotou-se a implementação tamanho da cadeia/descarte amostral/amostragem como 225mil/25mil/1000 para as análises subseqüentes. A comparação entre estimativas de herdabilidade obtidas sob modelo de limiar e sob modelo linear não mostrou vantagens do primeiro, sendo que análises sob modelo linear, que têm reduzido tempo de processamento, poderiam ser preferidas quando houver muitos registros de produção, bastando transformar as estimativas de herdabilidade para escala subjacente. As comparações, sob modelo linear ajustadas para escala subjacente, entre a stayability padrão (0 ou 1) e a alternativa (considerando o número de partos até os seis anos de idade para aquelas vacas antes codificadas com valor 1), mostraram que podem ocorrer alterações na classificação de um número significativo de touros avaliados, mesmo sendo nas posições intermediárias do rank, talvez pela ligeira capacidade da característica alternativa em detectar variabilidade entre touros. Classificaram-se os 4180 touros em ordem decrescente e foram estudadas as genealogias dos 42 melhores (também chamados de TOP 1% ou aqueles que apresentam DEP para stayability superior a 57,6%) para identificar famílias importantes e avaliar a variabilidade genética da stayability. Além do touro Karvadi Imp. (essencialmente presente como avô, bisavô ou tataravô das mães dos touros TOP1%), outros genearcas com grande representatividade entre os TOP1% foram os touros Godhavari Imp. (via Kurupathy e Neofito), Rolex (via Cardeal), Rastã e Falo da BV (estes últimos pela via materna). / The new reproduction technologies like embryo transfer and in vitro fertilization brought to animal breeding researchers, and producers, a growing interest in the selection of females, which was a subject not well explored before, when the focus used to be only on evaluation and selection of males. The beef cattle industry is becoming more competitive each year, and the producers must think about all the aspects and details that can affect the production process. The PMGRN-USP (Nelore Breeding Program of the São Paulo University) studies a large number of traits to be used as selection criteria. Among these traits, there is stayability, which has a great economic importance. The aim of this project was to analyze the trait stayability, with a Bayesian approach, in a Nelore cattle population. Firstly, the implementation used two lengths of Gibbs chain (225 or 550 thousand), two periods of burn-in (25 or 50 thousand) and two thinning intervals (at each 1000 or 250 rounds). The cows were classified as 0 (failure, or less than three calves until six years of age), or 1 (success, or at least 3 calves until six years of age). The data were, or were not, restricted for NEP (Effective Number of Progeny), for number of sires in the contemporary group (GC), and for lack of variability in the contemporary group. Three different definitions of GC were tested. The software MTGSAM for threshold (Multiple-Trait Gibbs Sampler for Animal Models) was used, under an univariate sire-maternal grandsire model to get the (co)variance components, the heritability estimate and the solutions to each sire (that are used to get the Expected Progeny Differences - EPD). The results showed a low serial correlation in the samples, small differences among heritability estimates and a high rank correlation among the EPD estimates of the 4180 sires evaluated. The implementation 225000/25000/1000 was adopted to the subsequent analysis. The comparison between the heritability estimates obtained under the threshold model and the linear model didnt show any advantage to the first. The analysis under linear models could be preferred because of its reduced processing time in large data sets, needing only a transformation of the heritability estimates to the underlying scale. The comparisons, under linear model adjusted to the underlying scale, between the standard stayalility (0 or 1) and the alternative (obtained from the perception of the fertility differences among the cows classified as 1) showed a variation in the position of a considerable number of sires in the rank, maybe because the alternative trait gets some additional variation among sires. 4180 sires were classified in a rank and the genealogies of the 42 best sires (or TOP 1%, or the ones with stayability EPD greater than 57,6%) were studied to identify major families and evaluate the genetic variation of stayability. Besides of Karvardi Imp (a bull very present as an ascendant (2, 3 or 4 generations) of the dams of the TOP1% sires), another founder sires with influence among the TOP1% were Godhavari Imp (via Kurupathy and Neofito), Rolex (via Cardeal), Rastã, and Falo da BV (the last two via maternal).
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Impacto da vacinação contra o meningococo C na morbidade da doença meningocócica / Impact of meningococcal C vaccination on invasive meningococcal disease in BrazilTomich , Lísia Gomes Martins de Moura 15 August 2016 (has links)
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Previous issue date: 2016-08-15 / Conselho Nacional de Pesquisa e Desenvolvimento Científico e Tecnológico - CNPq / INTRODUCTION: Routine infant immunization with meningococcal C conjugate vaccine (MenC-V) started in Brazil in November 2010, administered at three, five and 12 months of age with no catch-up for older age-groups. However, by March 2010, a vaccination campaign with MenC-V was performed in Salvador in individuals under five years-old, and from 10 to 24 yearsold. In São Paulo state, the outbreaks occurred in teenagers and young adults prompting one-time vaccination campaign from 2010 to 2014 targeting these age-groups. OBJECTIVE: To assess the direct and indirect impact (herd effect) of vaccination on invasive meningococcal disease (MD) for capsular group C (MenC) four years after the introduction of MenC-V in three scenarios: i) Brazil as a whole (routine vaccination in childhood only); ii) Brazil except for Salvador (vaccination campaign with teenagers during the year of MenC-V introduction); and iii) São Paulo state (vaccination campaign for adolescents and young adults during 2010-2014 to control outbreaks). METHODS: We performed an ecological quasi-experimental design from 2008 to 2014 using data from the National Reference Laboratory for Meningitis, and data from the National Information System for Notifiable Diseases. A deterministic linkage was performed between the two databases to improve the accuracy of the detection of MD, especially in capsular groups. An interrupted time-series analysis was conducted using the Holt-Winters technique to
control for pre-existing trends and seasonal variations. The MenC vaccination impact was evaluated as the percentage of reduction in the incidence rates of MenC in the post-vaccination period (2012 to 2014), using the pre-vaccination period (2008 to 2010) to estimate what would be expected on the post-vaccination period, whether the vaccination had not been introduced. For Salvador, we analyzed the effect of the vaccination on the number of MenC cases. RESULTS: A total of 18,136 invasive MD cases were analyzed. For Brazil as a whole, the vaccination reduced 67.4% (lower 95%CI 42.5%) the rates for MenC for infants under 12 months, 92.3% (lower 95%CI 77.7%) for the age-group 12-23 months, and 65.7% (lower 95%CI 28%) for children aged 2-4 years. Indirect impact (20-24.7%) was observed in the age-group 5-19 years. When excluding Salvador from the analysis of Brazil, the indirect impact was observed only for children in the age-group 5-9 years. In the scenario of São Paulo state, similarly to Brazil, significant impact was observed in the target age-groups, in addition to indirect impact in the age group 5-9 years. In Salvador, in addition to the effect on the vaccinated population a sharp and sustainable decline of MenC cases was observed in all age-groups not target for vaccination. Overall, 1,170 cases of MenC were averted in Brazil after the introduced of Men-C vaccination. CONCLUSION: The strategy of catch-up for adolescents and young adults, especially during the year of MenC-V introduction may lead to rapid and sustainable herd effect. / A vacina meningocócica conjugada contra o grupo capsular C (MenC-V) foi introduzida no calendário de imunização infantil brasileiro em novembro de 2010, sendo administrada aos três, cinco e 12 meses de idade sem catch-up para os demais grupos etários. Entretanto, em março de 2010, uma campanha de vacinação com MenC-V foi realizada em Salvador para indivíduos menores de cinco anos de idade e de 10 a 24 anos. No estado de São Paulo os surtos ocorreram em adolescentes e adultos jovens, determinando campanhas de vacinações de bloqueio nessa faixa etária nos anos de 2010 a 2014. OBJETIVO: Avaliar o impacto direto e indireto (rebanho) da vacinação nas taxas de incidência de doença meningocócica (DM) invasiva pelo grupo capsular C (MenC) após quatro anos da introdução da MenC-V em três cenários: i) Brasil como um todo (imunização de rotina somente de crianças); ii) Brasil exceto Salvador (campanha de vacinação em adolescentes no ano de introdução da MenCV); e iii) estado de São Paulo (vacina de rotina na infância e vacinações de bloqueio em adolescentes e adultos jovens para controlar surtos). MÉTODOS: Foi realizado um estudo ecológico quasi-experimental para avaliar o impacto da vacinação em série histórica de 2008 a 2014 usando os bancos de dados do Laboratório Nacional de Referência para Meningites Bacterianas, Instituto Adolfo Lutz (IAL) e o Sistema de Informação de Agravos de Notificação (Sinan). Um processo de vinculação (linkage) determinístico entre as duas bases foi realizado para melhorar a acurácia da detecção de casos de DM, especialmente de grupo capsulares. Uma análise de série temporal interrompida foi conduzida utilizando a técnica de Holt-Winters para controlar por tendência pré-existente e variações sazonais. O desfecho foi taxa de MenC. O impacto da vacinação foi avaliado pelo percentual de redução da incidência de MenC no período pós-vacinal (2012 a 2014), utilizando o período pré-vacinal (2008 a 2010) para estimar o que seria esperado no período pós-vacinal, caso a vacinação não tivesse sido introduzida. Para Salvador foi analisado o efeito da MenC-V no número de casos de MenC. RESULTADOS: Um total de 18.136 casos de DM invasiva foram analisados. Para o Brasil como um todo, a vacinação reduziu significativamente a DM por MenC na faixa etária alvo, com redução de 67,4% (limite inferior do IC95% 42,5%) em menores de 12 meses, 92,3% (limite inferior do IC95% 77,7%) para faixa etária de 12-23 meses e 65,7% (limite inferior do IC95% 28%) em crianças de 2-4 anos, e efeito rebanho foi observado na faixa etária de 5 a 19 anos com 20-24,7%. Quando se exclui Salvador na análise do Brasil, impacto indireto significativo foi observado somente em crianças de 5-9 anos. No cenário São Paulo, semelhante ao Brasil, observou-se impacto estatisticamente significante nas faixas etárias alvo do PNI, além do efeito rebanho na faixa etária de 5-9 anos de idade. Para Salvador, o impacto da vacinação apresentou um declínio acentuado e sustentável em todas as faixas etárias fora do alvo da vacinação. Ao todo, 1.170 casos de MenC foram evitados no período estudado. CONCLUSÃO: A estratégia de vacinação de catch-up em adolescentes e adultos jovens, especialmente no ano de introdução da MenC-V, promoveu um rápido e sustentável rebanho.
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