Medidas restritivas de controle de antimicrobianos têm sido propostas para controlar surtos epidêmicos de infecção por germes multirresistentes em hospitais, mas são escassas as publicações a respeito de sua eficácia. Em um estudo quaseexperimental com controles históricos, avaliou-se a efetividade de uma intervenção restritiva ao uso de antimicrobianos para controlar a emergência de germes multirresistentes em uma unidade de cuidados intensivos (UTI) de um hospital geral. Os Serviços de Controle de Infecção e Comissão de Medicamentos restringiu o uso de drogas antimicrobianas em pacientes hospitalizados na UTI a não mais que dois agentes simultaneamente, exceto em casos autorizados por aqueles serviços. A incidência de eventos clínicos e bacteriológicos foi comparada entre o ano que precedeu a intervenção e o ano que a seguiu. No total, 225 pacientes com idade igual ou maior de 15 anos , com infecção, internados na UTI por pelo menos 48 horas, foram estudados no ano precedente a intervenção e 263 no ano seguinte a ela. No ano seguinte à intervenção, um percentual menor de pacientes foi tratado simultaneamente com mais de dois antimicrobianos, mas não houve modificação no número total de antimicrobianos prescritos, na duração e no custo do tratamento. Mortalidade e tempo de internação foram similares nos dois períodos de observação. O número de culturas positivas aumentou depois da intervenção, tanto para germes Gram positivos, quanto para germes Gram negativos, principalmente devido ao aumento do número de isolados do trato respiratório. A maioria dos isolados foi Staphylococcus aureus dentre os Gram positivos e Acinetobacter sp dentre os germes Gram negativos. No ano seguinte à intervenção, a sensibilidade dos microorganismos Gram negativos para carbenicilina, ceftazidima e ceftriaxona aumentou, e para o imipenem diminuiu. A ausência de resposta dessa intervenção sobre desfechos clínicos pode ser em conseqüência da insuficiente aderência ou a sua relativa ineficácia. A melhora da sensibilidade microbiana de alguns germes, semaumento de custos ou a incidência de efeitos adversos, encoraja o uso de protocolos similares de restrição de drogas antimicrobianas para reduzir a taxa de resistência bacteriana na UTI. / Restrictive policies of the use of antimicrobial drugs have been proposed to prevent the occurrence of outbreaks of infection by multiresistant germs in hospitals, but assessments of their effectiveness have been scarcely reported. In a quasiexperimental study with historical controls, we evaluate the effectiveness of a policy of restriction in the use of antimicrobial drugs to control the emergence of multiresistant strains in an Intensive Care Unit of a general hospital. The Services of Infection Control and Intensive Care and of the Committee of Pharmacy restricted the use of antimicrobial drugs in patients hospitalized in the ICU a no more than two agents simultaneously, excepted in cases authorized by those Services. Clinical and bacteriological outcomes were compared in the year preceding the intervention with the year following the restriction. In the total, 225 patients with 15 years of age or more, with infection, hospitalized in the Intensive Care Unit for at least 48 hours, were studied in the year preceding the intervention and 263 in the year following it. In the year following the intervention fewer patients were treated simultaneously with more than two antimicrobial drugs, but the total number of drugs used, the duration of use and expenses with antimicrobial drugs did not change. Mortality rates and length of hospitalization in the Intensive Care Unit and in the Hospital were also similar in both periods of observation. The number of positive cultures increased after the intervention, both for Gram positive and Gram negative germs, mainly due to the increase of isolates from the respiratory tract. Most isolates were Staphylococcus aureus among Gram positive germs and Acinetobacter sp among Gram negative germs. In the year following the intervention the sensibility of Gram negative microorganisms to carbenecillin, ceftazidime and ceftriaxone increased and to imipenem decreased. The absence of efficacy of this intervention on clinical outcomes may be due to the insufficient adherence by the clinical staff it or to its inefficacy. The improvement in the antimicrobial sensitivity of some germs, without increasing in costs and in the incidence of adverse events, encourages the use of this or similar rules of restriction of antimicrobial drugs to reduce the resistance rates of bacterial strains in intensive care units.

Submitted by Heitor Rapela Medeiros (heitor.rapela@ufpe.br) on 2015-03-06T14:31:08Z No. of bitstreams: 2 Dissertação Mestrado Marcal final - Versao digital 2014.pdf: 1600288 bytes, checksum: 4447766afbde81290b801aeb44281f3c (MD5) license_rdf: 1232 bytes, checksum: 66e71c371cc565284e70f40736c94386 (MD5) / Made available in DSpace on 2015-03-06T14:31:08Z (GMT). No. of bitstreams: 2 Dissertação Mestrado Marcal final - Versao digital 2014.pdf: 1600288 bytes, checksum: 4447766afbde81290b801aeb44281f3c (MD5) license_rdf: 1232 bytes, checksum: 66e71c371cc565284e70f40736c94386 (MD5) Previous issue date: 2012-08-28 / A emergência de bactérias Gram-negativas com resistência antimicrobiana é uma preocupação de ordem mundial. Diversos estudos vêm mostrando o crescimento desse problema no ambiente hospitalar, especialmente em Unidades de Terapia Intensiva (UTI). OBJETIVOS: Analisar o tempo até o surgimento de bactérias Gram-negativas multidroga resistentes (BGN-MDR) e os fatores de risco para aquisição de infecção/colonização por esses patógenos nos pacientes de duas UTI (uma pública e uma privada) em Recife. A influência desses fatores no tempo até o surgimento da resistência também foi avaliada. METODOLOGIA: Estudo de coorte prospectivo, com análise estatística de sobrevida. Todos os pacientes admitidos no segundo semestre de 2011 nessas duas UTI, que permaneceram internados por mais de 48 horas e cuja família autorizou a participação na pesquisa foram seguidos enquanto estiveram internados na UTI, por um período máximo de tempo de 28 dias, ou até a positivação de cultura/swab para BGN-MDR. Foi coletado swab na admissão e semanalmente, além das culturas solicitadas pela equipe médica assistente, de acordo com suspeita clínica de infecção. Os pacientes foram acompanhados diariamente pelo pesquisador. RESULTADOS: Dos 177 pacientes incluídos no estudo, 56 tiveram cultura ou swab positivos para BGN-MDR, uma taxa de incidência de 3,6 casos/100 pacientes-dia. O tempo mediano de sobrevida até atingir o desfecho foi 14 dias. Entre os fatores de risco, internamento hospitalar prévio, uso de antibióticos nos 30 dias anteriores à admissão na UTI e uso de ventilação mecânica aumentaram o risco de aquisição de BGN-MDR, com significância estatística. CONCLUSÃO: Procedimentos invasivos, como ventilação mecância, uso prévio de antibiótico e internamento hospitalar anterior foram associados a maior risco de surgimento de BGN-MDR, com risco diário aumentado, nos pacientes críticos estudados.

Orientadores: Maria Luiza Moretti, Raquel Silveira Bello Stucchi / Tese (doutorado) - Universidade Estadual de Campinas, Faculdade de Ciencias Medicas / Made available in DSpace on 2018-08-13T06:04:56Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Vigani_AlineGonzalez_D.pdf: 3903866 bytes, checksum: ff088b307f62ac2226ce3f88499695cf (MD5) Previous issue date: 2008 / Resumo: O enterococo é o terceiro agente mais freqüente em infecção de corrente sangüínea (ICS) hospitalar, responsável por 10% dessas infecções e está associado com alta letalidade. Durante as duas últimas décadas, o surgimento de alto nível de resistência à gentamicina (HLGR) e resistência à vancomicina adicionaram desafios ao tratamento das infecções por Enterococcus faecalis. Avaliamos as ICSs por E. faecalis no Hospital de Clínicas (HC) da Universidade Estadual de Campinas (Unicamp) identificadas de janeiro de 1999 a dezembro de 2003. Nosso objetivo foi determinar as características clínicas, microbiológicas e moleculares das ICSs por E. faecalis com HLGR e sem HLGR em pacientes internados no HC-Unicamp. ICS foi definida como pelo menos uma cultura de sangue positiva para E. faecalis com ou sem sinais e sintomas associados. Em casos de múltiplos episódios de ICS em um mesmo paciente, somente o primeiro episódio foi considerado. Coletamos informações de prontuários médicos utilizando formulários estruturados. A tipagem molecular de isolados de E. faecalis estocados foi realizada através da técnica de eletroforese em gel com campo pulsátil (PFGE). Identificamos 164 pacientes com ICS por E. faecalis, dos quais 145 (88,4%) foram incluídos neste estudo. Nossos achados demonstraram que pacientes com ICS por E. faecalis são graves. Dentre os 145 pacientes, 128 (88,3%) apresentavam pelo menos uma co-morbidade. Além disso, a realização de procedimento invasivo ou presença de dispositivos invasivos foram freqüentes (75,2%), assim como o uso prévio de antimicrobianos (61,4%). Das 145 ICSs, 66 (45,5%) foram por E. faecalis com HLGR e 79 (54,5%) sem HLGR. Na análise univariada, idade avançada, malignidade hematológica, cateterização urinária e uso prévio de cefalosporinas, quinolonas e carbapenêmicos foram mais freqüentes em pacientes com infecção por HLGR quando comparados com pacientes sem HLGR (p <0,05). A análise multivariada mostrou idade avançada, presença de malignidade hematológica e uso prévio de vancomicina como variáveis independentes associadas com infecção por HLGR (p <0,05). A taxa de letalidade foi de 46,2% e não apresentou diferença estatística significativa entre pacientes com infecção por HLGR (50,0%) e sem HLGR (43,0%) (p= 0,40). Ventilação mecânica e gravidade das co-morbidades foram associadas com óbito (p <0,05). Durante o período de estudo, a taxa de resistência à ampicilina foi de 2,0%; ciprofloxacina, 51,7%; penicilina, 35,1%; e estreptomicina, 27,6%. Nenhum isolado resistente à vancomicina foi identificado. A genotipagem dos 44 isolados disponíveis (32 de pacientes incluídos no estudo e 12 controles) revelou 29 isolados distribuídos em 11 perfis genotípicos e 15 isolados apresentaram perfis genotípicos únicos e distintos. Alguns isolados geneticamente relacionados eram suscetíveis à gentamicina e outros possuíam HLGR, o que pode ser resultado da transferência de gene plasmidial de resistência HLGR entre isolados. Nossos resultados permitem concluir que ICSs por E. faecalis estão associadas com alta taxa de letalidade e são freqüentemente causadas por HLGR. Medidas de controle de infecção, incluindo vigilância ativa, respeito às normas de precauções de contato e uso criterioso de antimicrobianos devem ser consideradas para reduzir o risco de transmissão de E. faecalis resistentes em ambiente hospitalar. / Abstract: Enterococus is the third most frequent agent in nosocomial blood stream infection (BSI), accounting for 10% of nosocomial BSI, and is associated with high mortality. During the last two decades, the emergence of high-level gentamicin resistance (HLGR) and vancomycin resistance added additional challenges in the treatment of Enterococcus faecalis infections. We evaluated E. faecalis BSI at the Hospital de Clínicas (HC) of the Universidade Estadual de Campinas (Unicamp) in Brazil between January 1999 and December 2003. We sought to determine the clinical, microbiological, and molecular characteristics of BSI caused by HLGR and non-HLGR strains. E. faecalis BSI was defined as at least one positive blood culture for E. faecalis during the study period with or without associated symptoms. In patients with multiple BSI episodes, only the first episode was considered. We collected information from medical charts using standard forms. Banked E. faecalis isolates were typed using pulsed field gel electrophoresis (PFGE). We identified 164 patients with E. faecalis BSI, 145 (88.3%) patients were included in this study. Our data showed that patients with E. faecalis BSI are severely ill. One hundred twenty-eight (88.3%) patients had some underlying chronic disease. Invasive procedure or invasive device (75.2%) and previous use of antimicrobial (61.4%) were also frequent. Of the 145 BSIs, 66 (45.5%) were due to HLGR isolates and 79 (54.5%) were non-HLGR. In the univariate analysis, patients with HLGR infection were older, had hematological malignancy, had higher rates of bladder catheterization, and more often had treatment with cephalosporin, quinolone, and carbapenem when compared with non-HLGR infection patients (p <0.05). Multivariate analysis indicated that older age, hematological malignancy, and previous use of vancomycin were independent risk factors associated with HLGR (p <0.05). Mortality rate was 46.2% and was not statistically significantly different among patients with HLGR (50.0%) and non-HLGR (43.0%) infections (p= 0.40). Multivariate analysis indicated that mechanical ventilation and severity of underlying chronic diseases were associated with death (p <0.05). During the study period, the prevalence of resistance to ampicilin was 2.0%; to ciprofloxacin, 51.7%; to penicillin, 35.1%; and to streptomycin, 27.6%. We did not detect any isolate resistant to vancomycin. We genotyped 44 available isolates, 32 from study patients and 12 controls. Twenty-nine isolates were distributed in 11 PFGE patterns, the remaining 15 isolates had distinct and unique PFGE patterns. Some isolates with related PFGE pattern were HLGR and others non-HLGR, this may have result from transference of HLGR resistance plasmidial between isolates. Our results suggest that E. faecalis BSI are associated with high mortality and are frequently caused by HLGR. Hospital infection control measures, including active surveillance and judicious use of antibiotics, should be considered to reduce the spread of resistant E. faecalis infections in healthcare settings. / Doutorado / Clinica Medica / Doutor em Clínica Médica

INTRODUÇÃO: Cepas de Pseudomonas aeruginosa (PA) produtoras de Metalo-b- lactamase (MBL) tem sido reportadas como sendo uma importante causa de infecções nosocomiais assim como um grande problema terapêutico mundial. No complexo HC-FMUSP, o maior hospital universitário do Brasil, a prevalência de PA resistente aos carbapenêmicos também se apresenta de forma crítica. No entanto, a prevalência de MBL em nossa instituição e a padronização para detecção fenotípica deste mecanismo de resistência ainda não foram estabelecidos. OBJETIVOS: Determinar a prevalência de MBL em cepas de PA resistentes ao imipenem; comparar métodos fenotípicos e moleculares na detecção de MBL; avaliar a clonalidade dos isolados produtores de MBL e determinar o perfil de suscetibilidade de todos os isolados incluídos no estudo. MÉTODOS: Foi realizado um estudo retrospectivo com 69 cepas de PA resistentes ao imipenem isoladas de hemoculturas de pacientes do HC-FMUSP no ano de 2005. Os isolados foram submetidos ao teste de suscetibilidade pelo método de microdiluição e Etest® para colistina. Estes foram testados para a produção de MBL pelos métodos fenotípicos de Disco Aproximação (DA), Etest® MBL e Teste de Hodge Modificado (THM). A Reação em Cadeia da Polimerase (PCR) foi realizada para detecção dos seguintes genes: (blaSPM-1, blaIMP-1, blaIMP-2, blaVIM-1 e blaVIM-2). A clonalidade dos isolados produtores de MBL foi avaliada por Eletroforese em Campo Pulsado (PFGE). RESULTADOS: Cinqüenta e três cepas (76.8%) foram positivas pelos métodos de DA e Etest® MBL, e 19 cepas (27.5%) foram positivas pelo THM. Vinte e um isolados (30.4%) demonstraram o gene blaMBL por PCR, sendo que 17 (81%) foram positivos para o gene blaSPM-1 e 4 (19%) para o gene blaVIM-2. Os genes blaIMP-1, blaIMP-2 e blaVIM-1 não foram detectados. O inibidor ácido 2-mercaptoacético (MAA) e o THM mostram a melhor concordância com a PCR, com índices de kappa variando de 0.81 a 0.86 e 0.79, respectivamente O ácido etilenodiaminotetracético (EDTA), demonstrou alta sensibilidade (100%), baixa especificidade (33.3%), e pobre concordância com a PCR. Entre os isolados positivos para o gene blaSPM-1, 5 foram indistinguíveis, 11 foram estreitamente relacionados e 1 possivelmente relacionado. Entre os isolados positivos para o gene blaVIM-2, 2 foram indistinguíveis, 1 foi estreitamente relacionado e 1 diferente. Entre os isolados produtores de MBL, a colistina e o aztreonam foram as drogas mais ativas com 90.5% e 85.7% de sensibilidade, respectivamente. CONCLUSÃO: Este é o primeiro relato de PA produtora de MBL no HC-FMUSP, reforçando a epidemiologia brasileira onde a enzima SPM-1 é a mais prevalente entre isolados de PA. Os métodos de DA com o inibidor MAA e o THM mostraram-se boas opções para detecção fenotípica de MBL em laboratórios de microbiologia. Os produtores de MBL demonstraram fenótipo multiresistente com um padrão clonal, enfatizando a necessidade de práticas de controle de infecções em nossa instituição / INTRODUCTION: Pseudomonas aeruginosa (PA) strains Metallo-b-lactamase (MBL) producing have been reported as an important cause of nosocomial infection, also becoming a critical therapeutic problem worldwide. At HC-FMUSP complex, the largest teaching hospital in Brazil, the prevalence of PA resistant to carbapenems is also presented as a critical problem. However, MBL prevalence and the standardization for phenotypical detection of this resistance mechanism still had not been established. PURPOSE: To determine MBL prevalence in PA resistant to imipenem; to compare phenotypic and molecular methods to detect MBL; to evaluate the clonality of the MBL producers strains and to determine the susceptibility profile of all isolates included in this study. METHODS: A retrospective study was carried analyzing 69 PA strains resistant to imipenem isolated from blood cultures of patients at HC-FMUSP during 2005. They were submitted to the susceptibility profile test by microdilution method and Etest® to colistin. The isolates were also tested for MBL production by phenotypic methods like Double Disk Synergy (DDS), Etest® MBL, Modified Hodge Test (MHT). The Polimerase Chain Reaction (PCR) was used to detect the following genes: (blaSPM-1, blaIMP-1, blaIMP-2, blaVIM-1 and blaVIM-2). The clonality of the MBL producers was evaluated by Pulsed Field Gel Electrophoresis (PFGE). RESULTS: Fifty-three isolates (76.8%) had positive results with DDS and Etest® MBL, and 19 isolates (27.5%) were positive by MHT. Twenty-one isolates (30.4%) had a blaMBL gene by PCR, being 17 (81%) positive for blaSPM-1 and 4 (19%) for blaVIM-2. The blaIMP-1, blaIMP-2 and blaVIM-1 genes had not been detected. Mercaptoacetic acid (MAA) inhibitor and MHT showed the best agreement with PCR, with kappa value ranging from 0.81 to 0.86 and 0.79, respectively. Etilenodiaminotetracetic acid (EDTA) inhibitor showed high sensibility (100%), low specificity (33.3%), and poor agreement with PCR. Among isolates producing blaSPM-1 gene, 5 were indistinguishable, 11 were closely related and 1 was possibly related. Among isolates producing blaVIM-2 gene, 2 were indistinguishable, 1 closely related and 1 was different. Among MBL-producing strains, colistin and aztreonam were the most active drugs with 90.5% and 85.7% of sensitivity, respectively. CONCLUSION: This is the first report of PA MBL producers at HCFMUSP, reinforcing the Brazilian epidemiology where SPM-1 enzyme is the most prevalent among PA isolates. The DDS method with MAA inhibitor and MHT had the best agreement with PCR, showing themselves as good options for MBL phenotypical detection in microbiology laboratories. The MBL producers had shown multiresistant phenotype with a clonal standard, reinforcing the necessity of infection control practices in our institution

Orientador: Marcelo de Carvalho Ramos / Tese (doutorado) - Universidade Estadual de Campinas, Faculdade de Ciencias Medicas / Made available in DSpace on 2018-08-04T11:07:18Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Hofling_ChristianCruz_D.pdf: 21680576 bytes, checksum: d24a23695ef6089d59f1055b941a14a2 (MD5) Previous issue date: 2005 / Resumo: Isoniazida, rifampicina e pirazinamida têm sido usadas como a base do tratamento da tuberculose no Brasil e na maioria dos países do mundo. O fenômeno da resistência bacteriana aos agentes quimioterápicos tem sido descrito desde que seu uso foi instituído. No caso da tuberculose, houve aumento expressivo do número de cepas resistentes, principalmente na década de 1990, devido à desestruturação dos serviços de vigilância e controle da doença e, também, à pandemia da AIDS. A resistência a antimicrobianos em cepas de Mycobacterium tuberculosis resulta em aumento da morbi-mortalidade e maiores custos para o serviço de saúde. A mutação no códon 315 do gene katG, responsável pela codificação da enzima catalase-peroxidase em M. tuberculosis, é um dos mecanismos de resistência desta bactéria à isoniazida. Para caracterizar as bases genéticas da resistência a drogas em cepas de M. tuberculosis no estado de São Paulo, foram selecionadas para estudo 91 amostras resistentes e 4 sensíveis à isoniazida. Essas cepas foram obtidas de culturas enviadas ao Instituto Adolfo Lutz central, em São Paulo, para identificação e realização de teste de sensibilidade a drogas. Um total de 467 cepas foram recebidas no período de agosto de 1999 a setembro de 2000. A genotipagem, utilizando a técnica de RFLP, foi realizada para o estabelecimento de parentesco entre as cepas. Estudos com as técnicas de SSCP e seqüenciamento de fragmento contendo o códon 315, amplificado do gene katG, foram realizados para triagem e confirmação de mutações associadas à resistência à isoniazida. A associação de resistência à isoniazida e rifampicina foi encontrada em 74.8% das cepas testadas. Resistência à isoniazidalpirazinamida e isoniazidaletambutol foi encontrada em 33 e 9,9%, respectivamente. Resistência concomitante a todas as drogas consideradas de primeira linha para o tratamento da tuberculose (isoniazida, rifampicina e pirazinamida) foi encontrada em 13,1 % das cepas. A genotipagem mostrou padrão heterogêneo de bandas, com formação de oito agrupamentos com apenas dua~ amostras cada. A substituição AGC~ACC (Serina~Tirosina) foi a mutação mais encontrada (48%). Não foram encontradas mutações em 39,5% das cepas resistentes estudadas e nos restantes 12,5% foram detectadas outras mutações. Conclui-se que no estado de São Paulo a resistência à rifampicina é freqüente entre as cepas resistentes à isoniazida. A resistência às três principais drogas para o tratamento da tuberculose também ocorreu em alta freqüência. A substituição AGC-.ACC foi a mutação mais encontrada, porém uma grande parte das cepas resistentes não apresentavam tais mutações. Pelos dados levantados, podemos também inferir que o fenômeno da resistência do M. tuberculosis a drogas não é, em São Paulo, uma conseqüência de disseminação clonal das cepas, mas casos isolados, provavelmente secundários a irregularidades no tratamento. Este trabalho, quando do seu início, foi um dos primeiros a endereçar a questão das bases genéticas para resistência a drogas em M. tuberculosis no Brasil, e estudos mais sistemáticos e abrangentes são necessários para melhor compreensão desta dinâmica em nosso meio / Abstract: Isoniazid, rifampin and pirazinamide have been used as the Standard treatment for tuberculosis in Brazil and most countries around the world. Antimicrobial resistance has been described since its use was instituted. As for tuberculosis, there has been an expressive rise in multidrug resistant strains in the decade of 1990, due mainly to the dismantling of tuberculosis vigilance programs and the AIDS pandemics. Antimicrobial resistance among Mycobacterium tuberculosis strains result in increase in morbidity and mortality and cost for health care. Mutations in codon 315 of the katG gene, responsible for coding catalaseperoxidase in M tuberculosis. has been associated as one of the key mechanisms of resistance of this bacteria to isoniazid. In Brazil, studies towards the molecular mechanisms involved in this process are still on its beginning. To characterize the genetic basis of M tuberculosis drug resistance in the state of São Paulo, 91 isoniazid resistant and 4 isoniazid sensitive strains were selected for study. These strains were drawn from samples (462 strains) sent to the Instituto Adolfo Lutz central laboratory in São Paulo for identification and drug susceptibility tests. The study period was from august 1999 through september 2000. Genotyping of mycobacterium was performed using RFLP technique. SSCP study and sequencing of the amplified fragment of katG gene that contained codon 315 were performed to screen and check for mutations conferring resistance to isoniazid. Concomitant resistance to isoniazid and rifampin was foud in 74,8% of strains tested. Resistance to both isoniazid/rifampin and isoniazid/ethambutol was found in 33 and 9,9%, respectively. Concomitant resistance to all drugs considered as first line treatment of tuberculosis (isoniazid, rifampin and pirazinamid) was found in 23,1% of strains. Genotypic studies revealed a heterogeneous band pattern, with formation of 8 clusters with only two specimens each. The most prevalent substitution was AGC-+ACC (Ser-+Thr), found in 48% of strains. No mutation was noted in 39,5% of resistant strains studied, and the remaining 12,5% habored other I .5S frequent mutations. In conclusion, resistance to rifampin is a frequent event among isoniazid resistant strains collected in Sao Paulo, Brazil. Resistance to the three front drugs used for the treatment of tuberculosis also occurred in high frequency. The AGC-+ACC substitution was the most frequent mutation found, a1thougha high percentage of strains did not carry any mutation / Doutorado / Clinica Medica / Doutor em Clínica Médica

Orientador: Marcelo Lancellotti / Dissertação (mestrado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Biologia / Made available in DSpace on 2018-08-22T07:21:21Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Varela_JuliaNogueira_M.pdf: 1464845 bytes, checksum: 930cccae996588333b99f1aaa50988c0 (MD5) Previous issue date: 2013 / Resumo: Haemophilus influenzae é uma bactéria causadora de doenças tipicamente associadas ao trato respiratório superior e inferior. Tal bactéria é classificada em linhagens capsuladas e não capsuladas - as não tipadas. As grandes responsáveis por patogenias mais severas são as capsuladas, especialmente as do sorotipo b, a existência de uma vacina para somente esse sorotipo, faz com que ocorra uma emergência de casos com H. influenzae não tipado - NTHi. A crescente resistência a antibióticos dessa bactéria está associada à plasmídios de resistência, bem como sua competência natural. A presença desses patógeno é maior em países nos quais não existe acesso a vacina, devido ao alto custo da mesma, que acabam utilizando antibióticos mais acessíveis como o cloranfenicol no tratamento. Esse trabalho estudou a transferência horizontal do gene ompP2 em diversas cepas de H. influenzae com a ajuda de nanopartículas de óxido de grafeno. Essas nanopartículas mimetizam uma atmosfera rica em partículas suspensas como as grandes cidades e zonas de agricultura precoce, já que, nesses locais ocorrem com maior frequência mutações e adaptações desse patógeno. Quando as nanopartículas encontravam-se no meio de cultura, verificou-se um aumento da taxa de transformação dessas bactérias. Assim como uma modificação no padrão de adesão celular das bactérias mutadas quando comparadas com as selvagens em linhagens celulares distintas e expostas ao antibiótico de resistência, levando a um aumento da taxa de adesão das cepas mutadas com relação às cepas selvagens. Como esse gene é e de possível aquisição entre cepas de H. influenzae em seu ambiente natural seria possível utilizá-lo para obtenção de uma proteína recombinante, com possível antigenicidade. Uma vez que a taxa de adesão aumenta com a presença do mesmo, levando a uma possível nova vacina que também protegeria contra cepas não tipadas e não somente capsuladas / Abstract: Haemophilus influenzae is a bacteria that causes diseases typically associated with the upper and lower respiratory tract. Their strains are divided in capsulated and non-capsulated - the non typable. The major responsible for more severe cases are the capsulated types, specially the b type. The existence of a vaccine for the serotype b, allows the emergence of cases of non typable H. influenzae - NTHi. The growing resistance is associated with resistance plasmids, and with its natural competence, that enables the bacteria to acquire DNA fragments between it's' species. Since this pathogen is common in countries that there is no access to this vaccine, therefore the use of accessible and cheaper antibiotics, such as chloramphenicol for treatment is. This work studied the horizontal transference of the ompP2 gene from multiresistant strains of H. influenzae, with the aid of grafen oxide nanoparticles, that mimesis an atmosphere rich in suspended particles, such as great urban areas and ancient agricultural zones. In these environments a great frequency in mutation and adaptations of these bacteria is verified. When we look at the adhesion patterns of these bacteria we can see that it is modified when they are mutated and exposed to the resistance antibiotic. Leading to an augmentation of the adhesion patterns when we compare to the wild strains. Since this gene was present in all strains and it was of easy acquisition between strains, it would be possible to use it to obtain a recombinant protein with likely antigen properties. Because the adhesion tax enhances with the presence of this gene. Leading to a possible new vaccine target, for NTHi and capsulated strains also / Mestrado / Fármacos, Medicamentos e Insumos para Saúde / Mestra em Biociências e Tecnologia de Produtos Bioativos

Introdução: o aumento gradativo da resistência dos microrganismos aos antimicrobianos usados na prática clínica tem contribuído efetivamente para que as infecções hospitalares sejam consideradas um problema de saúde pública. Assim, diminuir a disseminação destes microrganismos no ambiente hospitalar tem se tornado um desafio aos profissionais que atuam nos serviços de controle de infecção hospitalar. Objetivo: identificar a sensibilidade e especificidade dos critérios para isolamento de pacientes admitidos num hospital especializado em oncologia. Material e Método: trata-se de um estudo de corte transversal de caráter prospectivo, aprovado pelo Comitê de Ética em Pesquisa de um hospital especializado em oncologia. A população do estudo foi composta por 61 pacientes admitidos no hospital, no período de 01 março a 31 de agosto de 2009, segundo o protocolo para isolamento de pacientes procedentes de outros hospitais. Os dados foram obtidos por meio de entrevista individual e consulta aos resultados de cultura provenientes de swab nasal e anal, coletados pela equipe de enfermagem no momento da admissão no hospital e disponibilizados no laboratório de microbiologia. Resultado: dos 61 pacientes admitidos no hospital, 56 preencheram os critérios para que as precauções de contato fossem instituídas. Destaca-se que 30(49,2%) pacientes tiveram culturas positivas para microrganismos multirresistentes, sendo o Staphylococcus aureus resistente à oxacilina o microrganismo mais freqüentemente isolado no swab nasal e anal. A sensibilidade dos critérios para isolamento de pacientes admitidos no referido hospital e procedentes de outros hospitais foi de 90%. Conclusão: foram altamente sensíveis os critérios utilizados para o isolamento de pacientes provenientes de outros hospitais, portanto a maioria dos pacientes colonizados por microrganismos multirresistentes foi isolada no momento da admissão. / Introduction: the gradual increase of microorganisms\' resistance to antimicrobials used in clinical practice has effectively contributed to hospital-acquired infections be considered a public health problem. Hence, reducing the dissemination of these microorganisms in the hospital setting has become a challenge for professionals working in hospital-acquired infection control services. Objective: to identify the sensitivity and specificity of criteria for isolation of patients admitted to a cancer specialized hospital. Material and method: this prospective cross-sectional study was approved by the Research Ethics Committee of a cancer specialized hospital. The study\'s population was composed of 61 patients, who were admitted to the hospital between March 1 and August 31 2009 according to the protocol for isolation of patients from other hospitals. Data were collected through individual interview and consultation of the results from nasal and anal swabs culture collected by the nursing team at the moment patients were admitted to the hospital and available in the microbiology laboratory. Results: 56 out of the 61 patients met the criteria establishing contact precautions. It is worthy noting that 30(49,2%) patients presented positive cultures for multi-resistant microorganisms, while the Staphylococcus aureus resistant to oxacillin was the microorganism most frequently isolated in nasal and anal swabs. The sensitivity of the criteria for isolation of patients from other hospitals admitted in the studied hospital was of 90%. Conclusions: criteria used for isolation of patients from other hospitals were highly sensitive, thereby the majority of patients colonized by multi-resistant microorganisms were isolated at the moment of admission.

Orientador: Margarida Maria Barros / Coorientador: Filipe Giardini Pereira Bonfim / Resumo: Os Peixes foram alimentados com dietas contendo níveis de pó de gengibre (GgP) para verificar seus efeitos sobre o desempenho produtivo e resistência à infecção bacteriana. Um grupo de 540 tilápias-do-Nilo (8,2 g ± 0,34) foi distribuído aleatoriamente em 36 aquários de 250 L (15 peixes / tanque) e alimentadas com seis dietas práticas, uma sem a adição de gengibre (0 GgP, dieta basal, controle positivo) e níveis crescentes de suplementação de 0,25% (0,25 GgP), 0,5% (0,5 GgP), 0,75% (0,75 GgP), 1% (1 GgP) e 1,5% da dieta GgP (1,5 GgP). Estas dietas foram formuladas para conter 29% de proteína digestível e 18 MJ de energia digestível kg-1. Após 30 dias de alimentação, determinou-se o desempenho produtivo, os parâmetros hematológico e imunológico e a atividade das enzimas do sistema antioxidantes. Em seguida, os peixes foram submetidos a desafio com Aeromonas hydrophila e a mortalidade foi registrada por 15 dias. Os mesmos parâmetros e atividade de enzimas do sistema antioxidantes foram determinados após esse tempo. Peixes alimentados com dietas contendo níveis acima de 0,5 GgP apresentaram maior peso final e taxa de crescimento específica. Maior ingestão de ração foi determinada nos peixes alimentados com dietas contendo 1GgP e 1,5 GgP (P <0,05). Quanto aos parâmetros hematológicos e imunológicos, antes ou após o desafio bacteriano, peixes alimentados com 0 GgP e 1,5 GgP apresentaram os piores resultados para todos os parâmetros. Os peixes alimentados com 1 GgP mostraram a maior... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: Not available / Mestre

Submitted by Priscila Nascimento (pnascimento@icict.fiocruz.br) on 2013-04-10T13:59:40Z No. of bitstreams: 2 Patricia_M_Lima_Dois.doc: 131072 bytes, checksum: 98e1ab34d602b80d18a06d92c6bc168a (MD5) Patricia_M_Lima_um.pdf: 1534203 bytes, checksum: e84c34b0ca61e948c1a489cec5fb02f9 (MD5) / Approved for entry into archive by Priscila Nascimento(pnascimento@icict.fiocruz.br) on 2013-04-10T14:30:12Z (GMT) No. of bitstreams: 2 Patricia_M_Lima_Dois.doc: 131072 bytes, checksum: 98e1ab34d602b80d18a06d92c6bc168a (MD5) Patricia_M_Lima_um.pdf: 1534203 bytes, checksum: e84c34b0ca61e948c1a489cec5fb02f9 (MD5) / Made available in DSpace on 2013-04-10T14:30:13Z (GMT). No. of bitstreams: 2 Patricia_M_Lima_Dois.doc: 131072 bytes, checksum: 98e1ab34d602b80d18a06d92c6bc168a (MD5) Patricia_M_Lima_um.pdf: 1534203 bytes, checksum: e84c34b0ca61e948c1a489cec5fb02f9 (MD5) Previous issue date: 2011 / Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Rio de Janeiro, RJ, Brasil. / Klebsiella sp. é uma bactéria ubíqua, responsável por infecções nosocomiais oportunistas. Linhagens multirresistentes a antibióticos têm se tornado um problema cada vez mais freqüente no mundo todo. Estudos objetivando a determinação do potencial patogênico dos isolados ambientais são escassos. K. pneumoniae de origem ambiental poderia estar atuando como reservatório de genes de resistência que eventualmente poderiam ser transferidos e levar ao aparecimento linhagens multirresistentes. Nosso objetivo é determinar o perfil de resistência aos antimicrobianos de isolados clínicos e ambientais de K. pneumoniae, determinar os genótipos circulantes e sua clonalidade e caracterizar a genética da resistência observada. A susceptibilidade a 9 classes de antibióticos foi determinada para os 76 isolados clínicos e ambientais. De modo geral, os isolados clínicos mostraram-se resistentes a maioria das classes de antibióticos testadas, enquanto os isolados ambientais mostraram-se suscetíveis às diferentes classes. A pesquisa por elementos genéticos associados a resistência a antibióticos mostrou a presença de integron de classe 1 entre os isolados clínicos e integron de classe 2 em isolados ambientais. Os principais cassetes identificados no integron de classe 1 foram acetilt- e adenil-transferases ou dihidrofolatoredutase, os cassetes mais frequentemente encontrados nessa classe. No integron de classe 2, foi caracterizado o arranjo sat-aadA. Essa é a primeira identificação de integron de classe 2 em isolado ambiental de K. pneumoniae. A caracterização da relação genética entre os isolados, utilizando MLST, mostrou a existência de 45 sequencias-tipo(STs), das quais 24 novas. A análise por MLST mostrou que existe uma linhagem principal, distribuída pelo Brasil. Identificamos STs pandêmicos: ST11, ST23, ST37, ST423 e ST437 e sua distribuição mostra a existência de complexos clonais distribuídos em diferentes regiões geográficas do Brasil. / Klebsiella sp. Are ubiquitous bacteria associated with opportunistic nosocomial infections. Multiresistant strains to antibiotics have become an increasingly common problem worldwide. Studies focused on determining the pathogenic potential of environmental isolates are scarce. K. pneumoniae environmental strains could be acting as reservoirs of resistance genes that could be transferred and eventually lead to the emergence of multiply antibiotic-resistant strains. Our aim is to determine the antimicrobial resistance profiles of clinical and environmental K. pneumoniae strains, characterize the circulating genotypes and their clonality, and investigate the presence of genetic elements associated with the resistance observed, in Brazil. The susceptibility to nine classes of antibiotics was determined for 76 clinical and environmental isolates. There is a prevalence of the multidrug resistant phenotype (MDR) within the clinical isolates, whilst the environmental isolates are susceptible to different classes of antibiotics. The search for genetic elements associated with antibiotic resistance revealed the presence of class 1 and class 2 integrons among clinical and environmental isolates, respectively. The main gene cassettes present in class 1 integrons were aac and aad (acetylt- and adenyl-transferases) or dfr (dihydrofolateredutase), the most commonly found in class 1 integrons. The class 2 integron harbored the sat-aadA arrangement. This is the first observation of class 2 integrons in environmental K. pneumoniae isolates. Using the MLST approach, the genetic relationship among the strains showed 45 sequence-types (STs), of which 24 have not been described yet. The MLST analysis revealed a major K. pneumoniae lineage distributed throughout Brazil. Pandemic STs were identified among the clinical strains: ST11, ST23, ST37, ST423 and ST437. Their distribution shows the existence of clonal complexes throughout geographic regions of Brazil.

Submitted by Fabiana Gonçalves Pinto (benf@ndc.uff.br) on 2016-10-14T16:58:18Z No. of bitstreams: 1 Bruna Maiara Ferreira Barreto.pdf: 2112648 bytes, checksum: 4c761e7719f7c47c46f78b5978ed12be (MD5) / Made available in DSpace on 2016-10-14T16:58:18Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Bruna Maiara Ferreira Barreto.pdf: 2112648 bytes, checksum: 4c761e7719f7c47c46f78b5978ed12be (MD5) Previous issue date: 2015 / Mestrado Acadêmico em Ciências do Cuidado em Saúde / Este estudo teve como objetivo analisar a presença de cepas de Staphylococcus aureus nas lesões cutâneas crônicas tratadas com hidrogel a 2% e placa de poliuretano. Para tal, foi realizada pesquisa descritiva, com abordagem quantitativa, tendo como campo de pesquisa o Ambulatório de Reparo de Feridas do Hospital Universitário Antônio Pedro (HUAP/UFF) e a Policlínica Comunitária da Engenhoca (PCE), ambos localizados na cidade de Niterói, RJ. A análise microbiológica foi realizada no Laboratório de Controle Microbiológico da Faculdade de Farmácia da Universidade Federal Fluminense (UFF) e no Instituto de Microbiologia Paulo de Góes da Universidade Federal do Rio de Janeiro (UFRJ). A coleta de dados foi realizada em duas etapas, a primeira relacionada ao exame clínico com a identificação do paciente e descrição clínica das lesões e a segunda relacionada à coleta do espécime clínico utilizando-se como instrumento de coleta o swab. Todas as cepas de S. aureus analisadas foram identificadas por MALDI-TOF e a suscetibilidade a antimicrobianos foi determinada pelo teste de disco-difusão em meio sólido, seguindo as normas recomendadas do CLSI (Clinical and Laboratory Standards Institute). A reação em cadeia da polimerase (PCR) foi empregada na detecção do gene mecA e genes lukF-PV e lukS-PV. A diversidade clonal foi verificada pelo PFGE (pulsed-field gel electrophoresis). O S. aureus foi detectado em 82,9% (29/35) dos pacientes em uso de hidrogel e em 100% (8/8) dos pacientes em uso de placa de poliuretano. Os pacientes em uso de placa de poliuretano com prata apresentaram mais sinais clínicos de infecção quando comparados aos pacientes em uso de hidrogel a 2%, principalmente pela presença do exsudato purulento. A razão de prevalência demonstrou que os pacientes que usaram a placa de poliuretano com prata tiveram pelo menos 3,6 vezes maior chance de apresentarem infecção nas feridas quando comparados com os pacientes em uso de hidrogel. A maioria dos S. aureus identificados, em ambos os campos de pesquisa, apresentou resistência à penicilina, meticilina, eritromicina e clindamicina. Em cinco pacientes (10 cepas- 20%) foi observada amplificação para o gene mecA, demonstrando a colonização por MRSA. Não foi observada amplificação para os genes lukF-PV e lukS-PV. Embora tenha sido detectada grande diversidade genética entre as cepas analisadas, o mesmo padrão se repetiu entre os S. aureus coletados em dois momentos diferentes nos mesmos pacientes. No entanto, as amostras 1 e 32/32* apresentaram o mesmo padrão de fragmentação de DNA pelo PFGE. Através da razão de prevalência, determinou-se que os pacientes com MSSA têm 16 vezes mais chance de ter infecção em feridas quando comparados aos pacientes com MRSA. Assim, o tratamento com hidrogel a 2% ou placa de poliuretano não interferiu na colonização por S. aureus. Além disso, verificamos que o uso de placa de poliuretano com prata não é indicado para feridas infectadas quando o paciente possuir como comorbidades hipertensão arterial e insuficiência venosa crônica. / This study aimed to analyze the presence of Staphylococcus aureus in chronic wounds treated with hydrogel 2% and polyurethane plate. To do this, was done a descriptive study with a quantitative approach. The field research was the Wound Repair Clinic at the University Hospital Antônio Pedro (HUAP / UFF) and the Community Polyclinic of the Engenhoca, both located in the city of Niterói, RJ. The microbiological analysis was conducted at the Laboratory of Microbiological Control of the Faculty of Pharmacy of the University Federal Fluminense (UFF) and the Institute of Microbiology Paulo de Góes of the University Federal of the Rio de Janeiro (UFRJ). Data collection was carried out in stages, the first related to the clinical examination with the patient identification and clinical description of the wounds and the other step related to the collection of the clinical specimen using the swab. All strains of S. aureus analyzed were identified by MALDI-TOF and susceptibility to antibiotics was determined by disk diffusion test on solid medium following the standards recommended by CLSI (Clinical and Laboratory Standards Institute). The polymerase chain reaction (PCR) was used in the detection of the mecA gene and lukF-PV and luks-PV genes. The clonal diversity was verified by PFGE (pulsed-field gel electrophoresis). The S. aureus was detected in 82.9% (29/35) of patients using hydrogel and in 100% (8/8) the patients using polyurethane plate. Patients using polyurethane plate with silver presented more clinical signs of infection when compared to patients using hydrogel 2%, mainly by the presence of purulent exudate. The prevalence ratio showed that patients who used polyurethane plate with silver had at least 3.6 times more chance to have infection in the wound when compared to patients using hydrogel. Most S. aureus identified in both research fields presented resistance to penicillin, methicillin, erythromycin and clindamycin. Five patients (10 strains - 20%) were observed amplification for the gen mecA demonstranting colonization by MRSA. There was no amplification for lukF-PV and lukS-PV genes. Although was detected a big genetic diversity among the strains analyzed, the same pattern repeated among the S. aureus collected at two different times from the same patients. However, samples 1 and 32/32* showed the same fragmentation pattern by PFGE. Through the prevalence ratio identified that patients with MSSA had 16 times more likely to have infection in wounds when compared to patients with MRSA. Thus, the treatment with hydrogel 2% or polyurethane board did not interfered in the colonization by S. aureus. In addition, we perceived that the use of polyurethane plate with silver is not indicated for infected wounds when patients had comorbidities such as hypertension and chronic venous insufficiency.