A time course study was conducted to monitor disease development and expression of the defense-related genes phenylalanine ammonia-lyase (PAL), chalcone synthase (CHS), chalcone isomerase (CHI), and hydroxyproline-rich glycoprotein (HRGP) in bean (Phaseolus vulgaris L.) plants colonized by the arbuscular mycorrhizal (AM) fungus Glomus intraradices , and post-infected with the soil-borne pathogen Rhizoctonia solani. Pre-colonization of bean plants by the AM fungus did not significantly reduce the severity of rot symptoms. RNA blot analysis revealed a systemic increase in transcript levels of the four defense-related genes in response to R. solani infection. On the other hand, pre-colonization of bean plants with G. intraradices elicited no change in PAL, CHS and CHI transcripts, but an increase of HRGP transcripts in leaves was detected. A differential and systemic alteration in the expression of all four defense genes was observed in AM beans post-infected with R. solani. Depending on the time after infection with R. solani and the tissue examined, varying responses from stimulation, suppression, to no change in transcript levels were detected.

Thesis (Ph.D.)--University of Adelaide, Dept. of Soil and Water, 2002? / Bibliography: leaves 172-197.

Resumo: O objetivo da pesquisa foi determinar a influência de fatores abióticos e bióticos sobre a ocorrência de "damping-off" de pré e de pós - emergência, além de outros danos nas sementes e plântulas, quando da semeadura de milho e feijão. Foram escolhidos dois lotes de milho e feijão, safra 2007/2008, provenientes das cultivares D 766 e Carioca, respectivamente, de acordo com sua distinção em alto e baixo vigor, com baixa incidência fúngica e ausência de Rhizoctonia solani. Sementes desinfestadas foram infectadas com o fungo em meio de cultura BDA com restrição hídrica (acrescido de manitol a -1,0 MPa). Nos tratamentos testemunha foi utilizado o mesmo meio de cultura, porém, sem a presença do fungo. Para cada tratamento as sementes foram sobrepostas nos meios de cultura por 36 horas para o milho e por 20 horas para o feijão. Para a infestação direta do fungo em solo, foram utilizadas sementes de sorgo esterilizadas. O experimento foi conduzido em duas épocas distintas (caracterizadas como fria e quente). Para as duas épocas, as parcelas experimentais foram constituídas de vasos plásticos (capacidade de 4,5 L) contendo terra esterilizada dispostos segundo a casualização dos tratamentos em casa de vegetação. Os tratamentos foram constituídos a partir de três disponibilidades hídricas no solo contido em vaso (30 %, 50 % e 70 % de retenção de água), dois níveis de vigor da semente (alto e baixo vigor) com e sem a inoculação de Rhizoctonia solani, através de inoculação na própria semente do hospedeiro e da infestação no solo através de sementes de sorgo esterilizadas. Foram feitas quatro repetições, cada uma contendo dois vasos, totalizando oito vasos para cada tratamento. / Abstract: The objective of the research was to determine the influence of biotic and abiotic factors on the occurrence of "damping-off" of pre and post - emergence, and others problems to the seeds and seedlings, when the sowing of corn and bean. They chose two plots of corn and bean, growing season 2007/2008, from the cultivars Carioca and D 766 respectively, according to his distinction in high and low vigour, low fungi incidence and absence of Rhizoctonia solani. Disinfested seeds were infected with the fungus in culture medium without BDA and water restriction (mannitol, -1.0 MPa). In control treatments was the same growing medium, but without the presence of the fungus. For each treatment the seeds were superimposed in culture media for 36 hours for the corn and bean for 20 hours. For the direct addition of the fungus in soil, we used the technique of sterile sorghum seeds. The experiment was conducted in two different seasons (hot and cold). For two growing seasons the plots were established in plastic pots (capacity 4.5 L) containing sterilized soil prepared according to the randomization of treatments in a greenhouse. The treatments were made from three water availability in the soil contained in vase (30 %, 50 % and 70 % retention of water), two levels of vigour of the seed (high and low vigour) with and without inoculation of Rhizoctonia solani by of inoculation in the seed of the host and soil addition with sterile sorghum seeds. Were four replicates, each containing two vessels, totaling eight pots for each treatment. Twenty days after inoculation, for the cold season, and fifteen days for the hot season was to assess the severity, "damping-off" of pre and post-emergence, seedling length, dry matter weight and percentage of seedlings healthy. / Orientadora: Rita de Cássia Panizzi / Coorientador: Nelson Moreira de Carvalho / Banca: Margarete Camargo / Banca: Adriana Zanin Kronka / Mestre

Made available in DSpace on 2014-06-11T19:32:16Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2012-01-31Bitstream added on 2014-06-13T20:23:19Z : No. of bitstreams: 1 molina_lmr_dr_jabo.pdf: 480341 bytes, checksum: b838d0062518eb208c7e881bd5eb7588 (MD5) / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq) / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) / No início dos anos 90, o fungo Rhizoctonia solani emergiu como um patógeno importante associado à morte de pastagens do gênero braquiária na Colômbia. Inicialmente, esse estudo indicou que R. solani AG-1 IA predomina como patógeno associado à queima da folha da braquiária nos Llanos Colombianos. Para o estudo da estrutura genético-populacional do patógeno, um total de 198 isolados de R. solani AG-1 IA foram coletados de campos de B. brizantha cv. Toledo, de Brachiaria híbrido Mulato e do arroz. Os isolados foram genotipados usando dez loci microssatélites. Um sistema reprodutivo misto (reprodução sexuada e clones adaptados) caracterizou as populações de R. solani AG-1 IA que infectam a braquiária. A alta fração clonal e os desvios do equilíbrio de Hardy-Weinberg encontrados foram consistentes com o efeito Wahlund associado à mistura de populações. Padrões históricos de migração entre populações hospedeiro-distintas indicaram a origem provável das populações que infectam braquiária a partir de populações que infectavam arroz. Para determinar o efeito do estresse térmico na evolutibilidade para crescimento micelial, populações de R. solani AG-1 IA infectando braquiária ou arroz e R. oryzae-sativae do arroz, foram submetidas à temperatura ótima e de estresse (25 e 35°C). A herdabilidade para crescimento micelial sob condições de estresse foi considerada alta na população de R. oryzae-sativae do arroz, indicando que os patógenos têm potencial de adaptação à temperatura de 35°C / In the early '90s, the fungus Rhizoctonia solani has emerged as an important pathogen associated with the death of Brachiaria pastures in the Colombian Llanos. Initially, this study indicated that R. solani AG-1 IA was the predominant pathogen associated with the leaf blight in the Colombian Llanos. To study the population genetic structure of the pathogen, a total of 198 isolates of R. solani AG-1 IA were collected from fields of B. brizantha cv. Toledo, Brachiaria Mulato hybrid and from rice. These isolates were genotyped using ten microsatellite loci. A mixed mating system (sexual reproduction and dispersal of adapted clones) characterized the populations of R. solani AG-1 IA infecting Brachiaria. The high clonal fraction and deviations from Hardy-Weinberg equilibrium found in three out of four populations were consistent with Wahlund effect associated with the mixing of populations. Historical patterns of migration between different host-populations indicated that the likely source of the current populations infecting Brachiaria in the Colombian Llanos was from populations that originally infected rice. To determine the effect of heat stress on the evolvability for mycelial growth, two host distinct populations of Rhizoctonia solani AG-1 IA infecting either brachiaria or rice and a rice-infecting population of R. oryzae-sativae, were submitted to optimal and stress temperatures (25°C and 35°C). The heritability values for mycelial growth under heat stress was considered high for rice-infecting population of R. oryzae-sativae, indicating that these pathogen’s population have a high potential to adapt to 35°C temperature

Made available in DSpace on 2014-06-11T19:29:44Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2006-06-13Bitstream added on 2014-06-13T19:18:06Z : No. of bitstreams: 1 basseto_ma_me_ilha.pdf: 949120 bytes, checksum: dd3f3b104d600fa3d0cc25023fb35d18 (MD5) / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) / A mancha areolada causada por Thanatephorus cucumeris, é uma das doenças mais importantes da seringueira (Hevea brasiliensis) na região Amazônica. Apesar disso, há pouca informação disponível sobre a diversidade biológica, patogênica e genética do patógeno. Uma questão importante sobre o real posicionamento filogenético deste patógeno ainda não foi respondida. Neste estudo, foram analisadas seqüências da região ITS-5.8S do rDNA de uma população de T. cucumeris (fase anamórfica = Rhizoctonia solani AG 2-2) associado à mancha areolada da seringueira, obtida em Belém (PA), Manaus (AM) e Xapuri/Rio Branco (AC). Esta população foi também comparada filogeneticamente com membros do AG 2 descritos mundialmente. Este estudo representa um passo importante para revelar a origem, os padrões de movimento e amplificação de genótipos epidemiologicamente importantes de T. cucumeris da seringueira. Filogenéticamente, através de análise Bayesiana e de máxima parcimônia, encontramos suporte para nomear um novo grupo de anastomose associado à mancha areolada da seringueira: o AG 2-2 Hb. Este grupo constitui-se numa unidade evolucionária independente em relação aos subgrupos mundiais do AG 2-2 analisados. Na genealogia construída por análise coalescente, observou-se que a população de R. solani AG 2-2 Hb, de Belém, é relativamente mais velha que as demais populações analisadas. O ancestral comum de todas as três populações analisadas está associado com a mancha foliar do maracujazeiro (Passiflora edulis), em Belém, e tem cerca de 0,8 unidades evolucionárias coalescentes de idade. Nenhum haplótipo da região ITS-5.8S do AG 2-2 Hb, de Belém, foi observado em outras regiões. Entretanto, a população de Manaus compartilhou dois, de seus quatro haplótipos, com aqueles observados em Xapuri / Rio Branco, no Acre, indicando fluxo gênico e deriva genética. / Thanatephorus leaf spot is one of the most important diseases of rubber tree (Hevea brasiliensis) in the Amazon region, Brazil. However, there is fill information available about the biological, pathogenic and genetic diversity of the pathogen. An important question about the actual phylogenetic placement of this pathogen is not answered yet. In this study, we analyzed sequences of the ITS-5.8S rDNA region from a population of T. cucumeris (anamorphase = Rhizoctonia solani AG 2-2) associated to the rubber tree leaf spot obtained in Belém (PA), Manaus (AM) and Xapuri/Rio Branco (AC). This population was also phylogenetically compared with members of AG 2 world-widely described. This study represents an important step to reveal the origin, the patterns of movement and amplification of epidemiologically important genotypes of rubber tree-infecting T. cucumeris. Phylogenetically, through both Bayesiana and maximum parsimony analyses, we found support to nominate a new group of anastomosis associated with the rubber tree foliar spot: the AG 2-2 Hb. This group consisted of a independent evolutionary unit in relation to the world-wide sub-groups of AG 2-2 analyzed. In the gene genealogy built by coalescent analysis, was observed that the population of R. solani AG 2-2 Hb of Belém is relatively older than the other populations analyzed. The oldest most recent common ancestor of all the three populations analyzed was associated with a sample obtained from passion-fruit (Passiflora edulis) leaf blight in Belém and has about 0.8 coalescent evolutionary units of age. No AG 2- 2 Hb ITS-5.8S rDNA haplotype from Belém was observed in any other regions. However, the population from Manaus shared two, of its four haplotypes, with those observed in Xapuri/Rio Branco (Acre), indicating both gene flow and genetic drift.

Submitted by Mario BC (mario@bc.ufrpe.br) on 2016-11-28T12:59:54Z No. of bitstreams: 1 Dyana de Albuquerque Tenorio.pdf: 1359840 bytes, checksum: 2d9414b172e6c51ef868267286f6ef2b (MD5) / Made available in DSpace on 2016-11-28T12:59:54Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Dyana de Albuquerque Tenorio.pdf: 1359840 bytes, checksum: 2d9414b172e6c51ef868267286f6ef2b (MD5) Previous issue date: 2015-02-25 / The damping-off and stem rot caused by the soil pathogen Rhizoctonia solani, is considered one of the most important diseases of common bean (Phaseolus vulgaris) and cowpea (Vigna unguiculata), being one of the factors that contribute to the low productivity of these crops. This study aimed to characterize isolates of the causal agent of damping-off and stem rotof beans in the rural area of Pernambuco State, using microsatellite markers and phylogenetic analysis; and evaluate the use of yeasts in the control of the causal agent of damping-off and stem rot of beans. In bean growing areas of the southern region of Pernambuco, there were collections of plants with symptoms of damping-off and stem rot. Thirty-four fungal isolates were identified as Rhizoctonia. In the phylogenetic analysis, the sequences of ITS rDNA region of isolates were similar to at least three anastomosis groups (AG4 HG-I, AG3-PT and AG4 HG-III). In microsatellite analysis, five sets of primers (TC_AG3_1, TC01, TC06, TC11 and TC_AG3_09) amplified a total of 13 bands, showing genetic variation. Seventy R. solani were evaluated for aggressiveness, being the isolate CMM-3643 selected to the biological control trials. Seventy yeast isolates were obtained from apparently asymptomatic bean plants. From these, were chosen only isolates where the disease severity index was ≤ 25%. Experimental tests showed that the three yeast isolates (C6A, FVF10 (R1), FVC10) were selected as promising biocontrol agents of damping-off and stem rot of cowpea (cv. IPA-207), being efficient in controlling the disease caused by isolated CMM -3643. Increases in the levels of POX and CAT enzymes by treating the seeds with FVF10 yeast (R1), as well as, the absence of antibiosis mechanisms suggests that the biocontrol mechanism in question is the induction of disease resistance. In view of the results it is concluded that the AG4 HG-I is the primary anastomosis group causing damping-off and stem rot of beans in the São João municipality, Pernambuco State. In addition, this is the first report of damping-off and stem rot symptoms reduction in cowpea seedlings due to the antagonistic action of yeasts against R. solani. / A rizoctoniose, causada pelo fungo de solo Rhizoctonia solani, é considerada uma das doenças mais importantes do feijoeiro-comum (Phaseolus vulgaris) e do feijoeiro-caupi (Vigna unguiculata), sendo um dos fatores responsáveis pela baixa produtividade da cultura. O presente trabalho teve como objetivos: caracterizar isolados do agente causal da rizoctoniose do feijoeiro na região do agreste de Pernambuco, utilizando marcadores microssatélites e análise filogenética; e avaliar o uso de leveduras no controle do agente causal da rizoctoniose do feijoeiro. Em áreas de cultivo do feijoeiro da região do agreste meridional de Pernambuco, realizaram-se coletas de plantas com sintomas da rizoctoniose. Sendo obtidos 34 isolados fúngicos identificados como Rhizoctonia. Na análise filogenética, as sequências gênicas da região ITS do rDNA destes isolados foram similares a pelo menos três grupos de anastomose (AG4 HG-I, AG3-PT e AG4 HG-III). Na análise de microssatélites, cinco conjuntos de iniciadores (TC_AG3_1, TC01, TC06, TC_AG3_09 e TC11) amplificaram um total de 13 bandas, observando-se variação genética. Setenta isolados de R. solani foram avaliados quanto a agressividade, sendo selecionado o isolado CMM-3643 para o ensaio de controle biológico. Foram obtidos 70 isolados de leveduras de plantas de feijoeiro aparentemente assintomáticas, destes foram escolhidos os que proporcionaram índice de severidade da doença ≤ 25%. Ensaios experimentais demonstraram que os três isolados de leveduras (C6A, FVF10 (R1), FVC10) selecionados foram promissores como agentes de biocontrole da rizoctoniose do feijoeiro-caupi (cv. IPA-207), apresentando eficiência no controle da doença causada pelo isolado CMM-3643. Aumentos nos níveis das enzimas POX e CAT pelo tratamento das sementes com a levedura FVF10 (R1), assim como a ausência de mecanismos de antibiose, sugere que o mecanismo de biocontrole em questão é a indução de resistência da planta. Com base nas avaliações realizadas concluiu-se que o AG4 HG-I é o principal grupo de anastomose da rizoctoniose do feijoeiro no município de São João. Além disso, este é o primeiro relato da redução dos sintomas da rizoctoniose em plântulas de feijoeiro-caupi pela ação antagônica de leveduras sobre R. solani.

Memoria para optar al título profesional de: Ingeniero Agrónomo Mención: Sanidad Vegetal

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