Plant MAP3Ks have expanded significantly compared to their metazoan counterparts. A new, sequential workflow combining multispecies ortholog clustering and newly built, family-specific HMMs is used to identify the MAP3K gene family within seven plant species, allowing for a refinement of previously proposed gene family cladding and the novel identification of the MAP3K gene families in the allotetraploid cotton Gossypium hirsutum and newly sequenced monocot seagrass Zostera marina. The MAP3K gene family architecture is further refined and validated using bioinformatics analyses before the recently characterized Arabidopsis Raf-like MAP3K ILK1 is identified and characterized in upland cotton. Transient gene silencing reveals an increase in RKN susceptibility following GhILK1.1 silencing in the susceptible TM1 cultivar. No changes in susceptibility were seen in the resistant M240 cultivar or against reniform nematodes. GhILK1.1 is only the second cotton gene characterized to have a direct role in mediating RKN resistance.

No description available.

Upland cotton (Gossypium hirsutum ) is an important fiber crop grown throughout the southern United States. Plant-pathogenic nematodes are worm-like animals that feed on the roots of most agronomic crops, including cotton. The southern root-knot nematode (Meloidogyne incognita, RKN) and the reniform nematode (Rotylenchulus reniformis, RN) cause significant yield losses in cotton every year. Current sources of resistance are effective but limited, therefore historical screenings of cotton accessions were revisited in search for novel resistance sources. None were identified but many of the screened accessions possessed markers of known root-knot nematode and reniform nematode resistance. The emerging guava root-knot nematode (Meloidogyne enterolobii, GRKN) is a risk for upland cotton production, and identifying host plant resistance would greatly reduce the yield losses for growers. Assays were conducted on the currently available RN and RKN resistance sources inoculated with GRKN. No known nematode resistance gene suppressed GRKN infection, indicating that work must be done to protect crops from the eventual discovery of GRKN in Mississippi fields. Using the same resistance sources, tests were conducted to determine if the currently available resistances to RKN and RN offer any suppression of secondary infection of non-target nematode species for resistance. This is referred to as systemic acquired resistance, which is the induction of non-specific plant defense. Assays found that early inoculation with the nematode targeted by resistance did not effect infection by a secondary nematode species.

Field studies were conducted over two growing seasons to evaluate the effect of different levels of third instar European corn borer, Ostrinia nubilalis Hübner (Lepidoptera: Crambidae), on whole-plant dry matter in corn grown for silage. Mean (± SEM) whole-plant dry matter was significantly greater by 18.8% in uninfested control plants than in plants with an infestation level of 6 larvae/plant in 2004. Whole-plant dry matter in 2005 was significantly greater by 10.5% in control plants than in plants with an infestation level of 5 larvae/plant. Economic injury levels were calculated for each year using regression equations between whole-plant dry matter and European corn borer infestation level. Plant growth stage and infestation level had no effect on percent acid detergent fiber, neutral detergent fiber, and crude protein values for either year. Greenhouse studies were conducted to examine the relationship between aboveground herbivory by European corn borer and belowground herbivory by root knot nematode, Meloidogyne incognita Chitwood (Tylenchida: Heteroderidae), in corn. Two experiments were conducted to measure belowground herbivory by M. incognita in juvenile penetrations and eggs/root system. In the first experiment, the main effects interaction was not significant for either M. incognita juvenile penetrations or eggs/root system. Overall mean juvenile penetrations/root system across all three growth stages, at infestation levels of 1 and 3 larvae/plant were significantly less than in the non-infested control. In addition, overall mean eggs/root system at an infestation level of 3 larvae/plant were significantly less than in the control. In the second experiment, the main effects interaction was significant for both juvenile penetrations and eggs/root system. At the 8 and 10 leaf growth stages, juvenile penetrations/root system at infestation levels of 1 and 3 larvae/plant were significantly less than in the control. In addition, eggs/root system at an infestation level of 3 larvae/plant were significantly less than in the control, at all growth stages. In the reciprocal study, which examined the effect of different M. incognita inoculation levels on European corn borer stalk tunneling, no significant effect of inoculation level on European corn borer stalk tunneling was found. / Ph. D.

Este projeto objetivou desenvolver um marcador molecular ligado ao gene de resistência a Tobacco mosaic virus (TMV), em vista da necessidade de aprimorar os métodos de melhoramento de plantas para atender crescentes demandas de produtividade. O outro objetivo deste trabalho foi a avaliação de uma população segregante F2 e de retrocruzamento (RC1F1) a Meloidogyne incognita raça 3, oriunda do cruzamento das cultivares comerciais Coker 176 (C176) e Coker 371 Gold (C371G). Para o desenvolvimento do marcador ligado ao gene de resistência a TMV, o gene N, foram desenvolvidos iniciadores específicos para regiões conservadas (TIR, NBS e LRR) deste gene com base em sua seqüência. Estes iniciadores foram utilizados para amplificar um marcador cuja ligação ao referido gene foi confirmada em 200 indivíduos de população segregante F2 oriunda do cruzamento entre uma linhagem resistente (Coker176) e outra suscetível ao vírus (Kentucky326). A proporção entre o número de plantas resistentes e suscetíveis (154:46) não diferiu estatisticamente daquela esperada no caso de segregação de um gene dominante de resistência, que seria de 3:1. Os resultados indicaram que o marcador e o gene estão proximamente ligados segundo taxa de recombinação, que foi de 1%. Na avaliação da hereditariedade a M.incognita utilizou-se 141 indivíduos da população segregante F2 oriunda do cruzamento entre uma linhagem resistente (Coker176) e suscetível (Coker 371G) e 138 indivíduos de RC1F1 ([C176 X C371G] X C371G). Os resultados obtidos entre a proporção entre o número de plantas resistentes e suscetíveis da população F2 (102:39) e da RC1F1 (67:71) não diferiu estatisticamente daquela esperada no caso de segregação de um gene dominante de resistência. / The aim of this study is to develop a molecular marker linked to the resistant gene to Tobacco mosaic virus (TMV) considering the necessity to improve plant breeding to meet growing demands of productivity. The other goal of this study is to evaluate the mode of inheritance of an F2 segregating population and backcross (BCF1) population of Meloidogyne incognita race 3 originated from cross breeding between commercial cultivars Coker 176 and Coker 371 Gold. For the development of the marker linked to the TMV resistant gene, the N gene, specific primers of this gene were developed for conserved regions (TIR, NBS and LRR) based on their sequence. These primers were used to amplify a marker whose connection with the aforementioned gene was confirmed in 200 individuals in a segregating F2 population originated from the cross breeding between a resistant cultivar (Coker176) and another cultivar which is susceptible to the virus (Kentucky326). The proportion between the number of resistant and susceptible plants (154:46) did not statistically differ from the one expected in the segregation of one dominant resistance, which would be a 3:1 segregation ratio. The results indicated that the marker and the gene are narrowly linked according to recombination ratio 1%. In the heredity evaluation of resistance to M.incognita 141 plants of the segregating F2 population originated from the cross breeding of a resistant (Coker176) and susceptible cultivar (Coker 371G) and 138 plants of backcross BC1F1 ([C176 X C371G) X C3371G) were used. The outcome of the proportion between the number of resistant and susceptible plants of segregating F2 (102:39) and BC1F1 population (67:71) were not statistically different from the ones expected for a monogenic dominant resistance.

Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / The soybean crop is among the crops that are most affected by the presence of nematodes, it is observed large losses in productivity each year. In view of this problem, this study aimed characterize and identify populations of nematodes present in soybean crops in the North, Northwest and South of the Rio Grande do Sul, with greater emphasis on Meloidogyne and Helicotylenchus genres, and evaluate the reaction of soybean cultivars to M. javanica, M. arenaria and M. morocciensis. The populations of Meloidogyne spp. obtained were characterized chemically by esterase (Est), and populations Helicotylenchus spp. were identified by morphometry. Subsequently, evaluated in a greenhouse the reaction of six soybean cultivars to three populations of M. javanica, M. arenaria and M. morocciensis. They identified six nematode genera associated with culture, Meloidogyne, Helicotylenchus, Tylenchus, Aphelenchus, Paratylenchus and Pratylenchus, it is identified 19 populations of Meloidogyne, comprising three species, M. javanica Est J3 (59%), M. arenaria Est A2 (12,5%) and M. morocciensis Est A3 (6,2%), and nineteen populations Helicotylenchus, comprising species H. dihystera (78%), H. multicinctus (11%) and H. pseudorobustus (11%). In assessing the reaction of soybean cultivars, BMX Ponta, BMX Potência RR, FPS Urano RR, BMX Turbo RR, TEC 6029 IPRO and Fundacep 58 RR, the populations of Meloidogyne it was found that the vegetative parameters plant height, number of branches, number of vegetables, chlorophyll content and fresh weight and shoot dry were not affected by the nematode presence. Among the cultivars tested most it was susceptible to nematode galls, regardless of the population of origin, as presented reproduction factor greater than 1 and galls index greater than 2. The cultivars BMX Ponta, BMX Potência RR, FPS Urano RR, TEC 6029 IPRO and Fundacep 58 RR were susceptible to all populations tested. The cultivar BMX Turbo RR showed resistance reaction ace populations of M. arenaria and M. morocciensis being, but susceptible populations of M. javanica. / A cultura da soja está entre as culturas que mais são afetadas pela presença de fitonematoides, sendo observadas grandes perdas em produtividade a cada ano. Tendo em vista este problema, o presente trabalho teve por objetivo caracterizar e identificar as populações de nematoides presentes nas lavouras de soja das regiões Norte, Noroeste e Sul do Rio Grande do Sul, com maior ênfase nos gêneros Meloidogyne e Helicotylenchus, e, avaliar a reação de cultivares de soja a M. javanica, M. arenaria e M. morocciensis. As populações de Meloidogyne spp. obtidas foram caracterizadas bioquimicamente através da isoenzima esterase (Est), e, as populações de Helicotylenchus spp. foram identificadas através de morfometria. Posteriormente, avaliou-se em casa de vegetação a reação de seis cultivares de soja a três populações de M. javanica, uma de M. arenaria e uma de M. morocciensis. Foram identificados seis gêneros de fitonematoides associados à cultura, Meloidogyne, Helicotylenchus, Tylenchus, Aphelenchus, Paratylenchus e Pratylenchus, sendo identificadas 19 populações de Meloidogyne, compreendendo três espécies, M. javanica Est J3 (59%), M. arenaria Est A2 (12,5%) e M. morocciensis Est A3 (6,2%), e dezenove populações de Helicotylenchus, compreendendo as espécies H. dihystera (78%), H. multicinctus (11%) e H. pseudorobustus (11%). Na avaliação da reação das cultivares de soja, BMX Ponta, BMX Potência RR, FPS Urano RR, BMX Turbo RR, TEC 6029 IPRO e Fundacep 58 RR, às populações de Meloidogyne, verificou-se que os parâmetros vegetativos altura de planta, numero de ramificações, numero de legumes, teor de clorofila e massa fresca e seca da parte aérea não foram alterados pela presença do nematoide. Dentre os cultivares testados a maioria foi suscetível ao nematoide de galhas, independente da origem da população, pois apresentaram fator de reprodução maior que 1 e índice de galhas maior que 2. As cultivares BMX Ponta, BMX Potência RR, FPS Urano RR, TEC 6029 IPRO e Fundacep 58 RR foram suscetíveis a todas as populações testadas. A cultivar BMX Turbo RR demonstrou reação de resistência ás populações de M. arenaria e M. morocciensis, sendo, porém suscetível ás populações de M. javanica.

CoordenaÃÃo de AperfeiÃoamento de Pessoal de NÃvel Superior / Estudos com fungos micorrÃzicos arbusculares tentam elucidar a contribuiÃÃo desses microrganismos no transporte de compostos sinalizadores entre plantas, uma vez que, eles formam uma rede micelial subterrÃnea que conecta as plantas e sÃo capazes de translocar substÃncias entre plantas vizinhas. O objetivo deste estudo foi avaliar a contribuiÃÃo dos fungos micorrÃzicos arbusculares na induÃÃo à resistÃncia do tomateiro a Meloidogyne incognita raÃa 2. O experimento foi realizado em casa de vegetaÃÃo e o delineamento experimental adotado foi o inteiramente casualizado (DIC), composto por 4 tratamentos e 5 repetiÃÃes, totalizando 20 parcelas. Cada parcela constituiu-se por um sistema inicial de vaso duplo conectado (VDC), contendo uma planta em cada lado do vaso, onde uma das plantas foi denominada de emissora (E) e a outra de receptora (R). Os tratamentos foram oriundos da combinaÃÃo entre os vasos com plantas emissoras com e sem micorriza, respectivamente (EM+ e EM-), conectados a vasos com plantas receptoras com e sem micorriza (RM+ e RM-). O experimento foi realizado em duas etapas, fase I e fase II. Iniciou-se a fase I com a introduÃÃo do inÃculo de nematÃide (4000 ovos e J2 M. incognita raÃa 2) apenas nos lados dos vasos contendo as plantas emissoras, com e sem micorrÃza (EM+ e EM-), tendo estas permanecido em contato com os nematÃides durante 45 dias. ApÃs esse perÃodo, procedeu-se a separaÃÃo dos vasos duplos conectados. A fase II teve inÃcio apÃs a separaÃÃo dos vasos e adiÃÃo do inÃculo do nematÃide nas plantas receptoras, permanecendo 45 dias em contado com os nematÃides em casa de vegetaÃÃo. Os resultados mostraram que as plantas emissoras inoculadas com micorrizas foram mais susceptÃveis ao parasitismo por M. incognita raÃa 2, apresentando menor desenvolvimento da planta e maior susceptibilidade ao nematoide. As plantas receptoras que estiveram em contato com as plantas emissoras com micorriza (EM+) no perÃodo de prÃ-condicionamento apresentaram melhor crescimento e menor susceptibilidade ao M. incognita revelando, dessa forma, que foram estimuladas durante a fase I, a acionar seu mecanismo de defesa contra o patÃgeno. / Studies mycorrhizal fungi try to elucidate the contribution of microorganisms in the transport of signaling between plants compounds, since they form a network that connects the underground mycelial and plant substances are able to translocate between neighboring plants. The aim of this study was to evaluate the contribution of mycorrhizal fungi in inducing resistance of tomato to Meloidogyne incognita race 2. The experiment was conducted in a greenhouse and the experimental design was a completely randomized design, consisting of 4 treatments and 5 replicates, totaling 20 plots. Each plot was constituted by a dual system connected initial vessel containing a plant on each side of the vessel, where a plant has been called issuing (I) and one receiver (R).The treatments were derived from the combination of the potted issuing plants with and without mycorrhiza, respectively (IM + and IM-) connected the potted receiver plant with and without mycorrhiza (RM + and RM-). The experiment was conducted in two phases, phase I and phase II. It started with phase I the introduction of nematode inoculum (4000 eggs and J2 Meloidogyne incognita race 2) only at the sides of the pots containing the issuing plants with and without mycorrhiza (IM + and IM-), and those remained in contact with nematodes for 45 days. After this period, we proceeded to double the separation vessel connected. Phase II began after the separation vessel and addition of the nematode inoculum in receiver plants 45 days remaining in contact with the nematodes in the greenhouse. The results showed that issuing plants inoculated with mycorrhizal were more likely to parasitism by M. incognita race 2, with lower plant development and increased susceptibility to nematodes. The receiver plants that were in contact with the issuing plants with mycorrhiza (IM+) during the preconditioning showed better growth and lower susceptibility to M. incognita revealing thereby that were stimulated during Phase I, the activate mechanism of defense against the pathogen.

Submitted by Mario BC (mario@bc.ufrpe.br) on 2016-09-19T12:32:08Z No. of bitstreams: 1 Fabian Santana Silva.pdf: 2324497 bytes, checksum: 5c4e600acdaff03ee633bf78d5a2a9d2 (MD5) / Made available in DSpace on 2016-09-19T12:32:08Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Fabian Santana Silva.pdf: 2324497 bytes, checksum: 5c4e600acdaff03ee633bf78d5a2a9d2 (MD5) Previous issue date: 2016-02-19 / In Brazil, the snapmelons of momordica botanical group are known in different regions of the country such as melon caxi, meloite, melon papoco and snow melon. There are few reports in the literature with snapmelons, requiring studies aimed at understanding the genetic variability. This study aimed to evaluate the melon caxi access reactions the Meloidogyne enterolobii and M. javanica, and then select the promising genotypes for the crop breeding program for resistance to root knot nematode UFRPE. The isolated M. enterolobii e M. javania they was kept in pure wing vegetation and multiplied in susceptible tomato plants. The extraction of the eggs was performed according to the technique proposed by Hussey &Barker (1973) and modified by Bonetti & Ferraz (1981). The experiments carried out in a randomized block design were conducted in the period February to April 2015, and from October to December of the same year. These experiments were conducted in a protected environment with the sowing of accesses made in PVC tubes containing commercial substrate Basaplant®. Infestation was performed of each species separately in egg suspension ratio of 3000 eggs.tubete-1. 45 days after the infestation of the seedlings, we proceeded to the evaluation of the hits, where the roots were washed for counting the number of galls per root system. After counting galls, the eggs were extracted from the roots of melon plants by technical Hussey and Barker (1973), modified by Boneti and Ferraz (1981). The thus obtained eggs were counted using a stereomicroscope, obtaining the number of eggs per root system. The reproduction factor: FR ≥ 1 indicate good host, FR <1.0 poor host and FR = 0 host not based on the classification proposed by Oostenbrink (1966). All tested accessions showed FR> 1 proved to be good hosts for M. enterolobii and M. javania. / No Brasil, os snapmelons do grupo botânico momordica são conhecidos em diferentes regiões do país como melão caxi, meloite, melão papoco e melão de neve. Existem poucos relatos na literatura com os snapmelons, necessitando de estudos que visem o conhecimento da variabilidade genética. O presente trabalho teve como objetivo avaliar as reações de acessos de melão caxi à Meloidogyne enterolobii e M. javania e, posteriormente, selecionar os genótipos promissores com resistência aos nematoides das galhas para o programa de melhoramento da cultura para da UFRPE. Os isolados de M. enterolobii e M. javania foram mantidos puros em casa de vegetação e multiplicados separadamente em plantas de tomate suscetíveis. A extração dos ovos foi realizada conforme técnica proposta por Hussey e Barker (1973) e modificada por Bonetti e Ferraz (1981). Os experimentos foram em blocos casualizados, sendo conduzidos no período de fevereiro a abril de 2015, e de outubro a dezembro do mesmo ano. Esses experimentos foram realizados em ambiente protegido com a semeadura dos acessos realizada em tubetes de PVC contendo substrato comercial Basaplant®. Foi realizada a infestação do substrato com uma suspensão de ovos de cada espécie separadamente na proporção de 3000 ovos.tubete-1. Aos 45 dias após a infestação das plântulas, procedeu-se a avaliação dos acessos, onde as raízes foram lavadas para a contagem do número de galhas por sistema radicular. Após a contagem das galhas, os ovos foram extraídos das raízes das plantas de melão pela técnica de Hussey & Barker (1973), modificada por Boneti & Ferraz (1981). Os ovos assim obtidos foram contados com auxílio de estereomicroscópio, obtendo-se o número de ovos por sistema radicular. O fator de reprodução: FR ≥ 1 indicará boa hospedeira, FR < 1,0 má hospedeira e FR = 0 não hospedeira com base na classificação proposta por Oostenbrink (1966). Todos os acessos testados apresentaram FR >1 mostraram-se bons hospedeiros para o M. enterolobii e M. javania.

Submitted by Cássia Santos (cassia.bcufg@gmail.com) on 2015-10-28T14:32:01Z No. of bitstreams: 2 Dissertação - Juliana de Oliveira Silva - 2015.pdf: 2010407 bytes, checksum: a40c60aa62966947c2de8f29f43f3a75 (MD5) license_rdf: 23148 bytes, checksum: 9da0b6dfac957114c6a7714714b86306 (MD5) / Approved for entry into archive by Luciana Ferreira (lucgeral@gmail.com) on 2015-10-28T14:50:14Z (GMT) No. of bitstreams: 2 Dissertação - Juliana de Oliveira Silva - 2015.pdf: 2010407 bytes, checksum: a40c60aa62966947c2de8f29f43f3a75 (MD5) license_rdf: 23148 bytes, checksum: 9da0b6dfac957114c6a7714714b86306 (MD5) / Made available in DSpace on 2015-10-28T14:50:14Z (GMT). No. of bitstreams: 2 Dissertação - Juliana de Oliveira Silva - 2015.pdf: 2010407 bytes, checksum: a40c60aa62966947c2de8f29f43f3a75 (MD5) license_rdf: 23148 bytes, checksum: 9da0b6dfac957114c6a7714714b86306 (MD5) Previous issue date: 2015-02-24 / Conselho Nacional de Pesquisa e Desenvolvimento Científico e Tecnológico - CNPq / The tomato crop is attacked by a high range of pathogens, and among them are the nematodes of genera Meloidogyne. Among the various methods of controlling these pathogens, biological control has stood out on the world stage. The nematode survey is a necessary measure to plan and achieve the appropriate management. This study aimed to make a nematode survey in different producing areas of tomatoes in the vicinity of Goiânia-GO, evaluate the efficiency of different biological products in reducing Meloidogyne incognita population in the tomato crop, and to evaluate the most effective dose of a product based on Bacillus and Trichoderma. In this study nematode survey was performed in the tomato-producing areas of the surroundings of Goiânia-GO for a better understanding of the genera occurring in this crop. Also, four experiments were conducted: two to evaluate different doses of the biological product NemOutTM (Bacillus spp. and Trichoderma longibrachiatum) and two to evaluate different commercial biological products in reducing Meloidogyne incognita population and promoting tomato growth. The survey was conducted on ten tomato areas, in two consecutive years. Soil and root samples were collected and performed the extraction of nematodes and the identification of genera. The experiments were conducted in a greenhouse at the Universidade Federal de Goiás, in polyethylene pots (5L) containing sterilized substrate 1: 1 (soil + sand) in two periods, from March to May and October to December of 2014. Inoculation was made with 2,000 eggs and J2 of M. incognita. At 45 and 65 days after inoculation (DAI) the variables plant height, fresh weight shoots, fresh weight of root, galls index and egg mass index, nematode density and reproduction factor (RF), were evaluated. Producing tomato areas around Goiania-GO showed presence of genres Meloidogyne sp., Pratylenchus sp., Helicotylenchus sp., Criconemella sp. and Tylenchus sp. There was a greater abundance and dominance of Helicotylenchus sp. and Meloidogyne sp. on tomato areas studied. The use of crop rotation and fallow were effective in reducing the population of the genera found in the study area. Saturations of higher bases were positively correlated with the population density of Helicotylenchus sp., Pratylenchus sp. and Criconemella spp. and negative with the population density of Meloidogyne sp. At 45 DAI, in the first experiment, increasing doses of NemOutTM reduced the nematode population density and de reproduction factor (RF) linearly. In tested conditions the biological products NemOutTM, Nemat®, Paecilomyces JCO®, Serenade® and isolated P. chlamydosporia Pc-10 did not affect the development of tomato plants. The Serenade® product reduced index of galls and egg mass equaling the chemical in some cases. / A cultura do tomate é atacada por uma elevada gama de patógenos, e entre eles estão os nematoides do gênero Meloidogyne. Entre os vários métodos de controle desses patógenos, o controle biológico vem se destacando no cenário mundial. Fazer um levantamento dos nematoides presentes na área de produção é uma medida necessária para se planejar e realizar o manejo adequado. Este trabalho teve como objetivo fazer um levantamento de nematoides em diferentes áreas produtoras de tomate no entorno de Goiânia-GO, avaliar a eficiência de diferentes produtos biológicos na redução da população de Meloidogyne incognita na cultura do tomate, além de avaliar a dose mais eficaz de um produto a base de Bacillus e Trichoderma. Neste trabalho foi realizado um levantamento em áreas produtoras de tomate da região do entorno de Goiânia-GO, para um melhor conhecimento dos gêneros de nematoides presentes nessa cultura. Foram realizados também quatro experimentos, dois para avaliar diferentes dosagens do produto biológico NemOutTM (Bacillus spp. e Trichoderma longibrachiatum) e dois para avaliar diferentes produtos biológicos comerciais na redução da população de Meloidogyne incognita e na promoção do crescimento do tomateiro. O levantamento foi realizado em dez áreas produtoras de tomate, em dois anos consecutivos. Foram coletadas amostras de solo e raiz. Foram realizadas as extrações dos nematoides e a identificação dos gêneros. Os experimentos foram conduzidos em casa de vegetação na Universidade Federal de Goiás, em vasos de polietileno (5L), contendo substrato esterilizado na proporção de 1:1 (solo + areia), em dois períodos, de Março a Maio e de Outubro a Dezembro de 2014. Foram inoculados 2000 ovos e J2 de M. incognita. As avaliações foram realizadas aos 45 e 65 dias após a inoculação (DAI). Foram avaliadas as variáveis altura da planta, massa fresca da parte aérea, massa fresca da raiz, índice de galhas e massas de ovos, densidade populacional do nematoide e fator de reprodução (FR). Áreas produtoras de tomate no entorno de Goiânia-GO apresentaram presença dos gêneros Meloidogyne sp., Pratylenchus sp., Helicotylenchus sp., Criconemella sp. e Tylenchus sp. Houve maior abundância e dominância de Helicotylenchus sp. e Meloidogyne sp. nas áreas de tomate estudadas. A utilização de rotação de culturas e do pousio se mostraram eficientes na redução da população dos gêneros encontrados nas áreas estudadas. Saturações de bases mais altas apresentaram correlação positiva com a densidade populacional de Helicotylenchus sp., Pratylenchus sp. e Criconemella sp. e negativa com a densidade populacional de Meloidogyne sp. Na avaliação aos 45 DAI, do primeiro experimento, doses crescentes do produto NemOutTM reduziram a densidade populacional e o fator de reprodução de M. incognita linearmente. Nas condições testadas os produtos biológicos NemOutTM, Nemat®, Paecilomyces JCO®, Serenade® e o isolado P. chlamydosporia Pc-10 não afetaram o desenvolvimento das plantas de tomate. O produto Serenade® reduziu o índice de galhas e o índice de massas de ovos se igualando ao produto químico em alguns casos.

Submitted by Marlene Santos (marlene.bc.ufg@gmail.com) on 2016-08-17T20:40:40Z No. of bitstreams: 2 Dissertação - Camilla Martins de Oliveira - 2015.pdf: 2722272 bytes, checksum: c1b127a024727131109290202bf7f846 (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) / Approved for entry into archive by Luciana Ferreira (lucgeral@gmail.com) on 2016-08-18T12:47:02Z (GMT) No. of bitstreams: 2 Dissertação - Camilla Martins de Oliveira - 2015.pdf: 2722272 bytes, checksum: c1b127a024727131109290202bf7f846 (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) / Made available in DSpace on 2016-08-18T12:47:02Z (GMT). No. of bitstreams: 2 Dissertação - Camilla Martins de Oliveira - 2015.pdf: 2722272 bytes, checksum: c1b127a024727131109290202bf7f846 (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Previous issue date: 2015-02-23 / Conselho Nacional de Pesquisa e Desenvolvimento Científico e Tecnológico - CNPq / Nematodes cause losses in plants throughout the world that can be translated into many economic losses. The root-knot nematodes (Meloidogyne sp.) are the most common and destructive pathogens within this group. In order to get an efficient method of nematode management, it is need to identify species and quantify accurately and reliably. The aim of this research was to optimize an assay based on real-time PCR to detect and quantify M. incognita. For this purpose the effectiveness of different DNA methods of extraction were compared through the values of Ct intervals. The DNA extraction was made from 100 individual nematodes by the methods: CTAB, Phenol: Chloroform and commercial kit (PureLink® Genomic ADN Kit, Invitrogen). In the comparative analysis using the three methods the CTAB method and commercial kit obtained similar Ct values. The CTAB was the best method of extraction with less variation among the replications and showed higher linearity of the standard curve in comparison with the other methods tested. It was possible to quantify nematodes in the samples based on the intervals of the Ct values established from different numbers of nematodes (1, 10, 25, 100, 250, 500 and 750). This study demonstrated that qPCR technique is a sensitive and reliable alternative for the quantification of M. incognita that may help laboratories of diagnose and field survey. Twenty-six populations of the root-knot nematode (Meloidogyne spp.) from five locations of the state of Bahia, five from the state of Mato Grosso, four from the state of Goiás and one from the state of Minas Gerais, were characterized based on morphology of perineal cut, biochemical analysis through esterase profile and molecular analysis with specific primers. Identification of nematodes in the samples using the analysis of perineal cut, esterase profile and molecular analysis was possible, but with some variations in the perineal patterns and some atypical profiles of esterase. In the analyses of esterase profiles were found 69.23% of M. javanica with esterase profiles J3 and J2, and 30.77% of M. incognita with esterase profile I1. There was a higher occurrence of M. javanica in the areas cultivated with soybeans. Molecular analysis showed to be practical and accurate. / Nematoides causam perdas em plantas em todo o mundo, as quais podem ser traduzidas em muitos prejuízos econômicos. Os nematoides das galhas (Meloidogyne spp.) são os mais comuns e destrutivos dentro deste grupo de patógenos. Para conseguir implantar um método eficiente de manejo de fitonematoides há uma necessidade de identificação das espécies e quantificação precisa e confiável. O objetivo deste trabalho foi a otimização de um ensaio baseado em PCR em tempo real para detectar e quantificar M. incognita. Para isto diferentes métodos de extração de DNA e sua eficiência foram comparados. A extração de DNA foi feita a partir de 100 nematoides pelos métodos do CTAB, Fenol: Clorofórmio e KIT comercial (PureLink® Genomic DNA Kits, Invitrogen). Na análise comparativa destes três métodos de extração de DNA observou-se que o método CTAB e o utilizando o Kit comercial obtiveram igual eficiência, dados pelos valores próximos Ct (cycle threshold). O melhor método de extração foi considerado o CTAB, apresentando menor variação entre as diferentes amostras biológicas utilizadas como repetições e demonstrando maior linearidade na curva-padrão em comparação com os demais métodos testados. Foi possível estabelecer um parâmetro para a quantificação de nematoides nas amostras baseado em faixas de valores de Ct, estabelecidas a partir de diferentes números de indivíduos (1, 10, 25, 100, 250, 500 e 750). Este estudo demonstrou que a técnica de qPCR é uma alternativa sensível e confiável para a quantificação de M. incognita, para auxiliar laboratórios de diagnóstico e o monitoramento no campo desses nematoides. Vinte e seis populações do nematoide das galhas (Meloidogyne spp.), provenientes de cinco municípios do Estado da Bahia, cinco municípios do Estado do Mato Grosso, quatro municípios do Estado de Goiás e um município do Estado de Minas Gerais, foram caracterizados com base em: morfologia do corte perineal, análise bioquímica por meio de perfil de esterase e análise molecular com iniciadores específicos. Baseado nestes parâmetros foi possível a identificação das amostras, porém foram encontradas algumas variações nos padrões perineais e perfis atípicos nos perfis de esterase. Nas análises dos perfis de esterase foram encontradas 69,23% de M. javanica com perfis de esterase J3 e J2, e 30,77% de M. incognita com perfil de esterase I1. Verificou-se a maior ocorrência de M. javanica, nas áreas coletadas cultivadas com soja. A análise molecular se mostrou prática e precisa.