Submitted by Socorro Pontes (socorrop@ufersa.edu.br) on 2017-11-27T13:36:02Z No. of bitstreams: 1 MariaVFGM_TESE.pdf: 2255574 bytes, checksum: d3cf0b423233b9046e82012595a64ce4 (MD5) / Approved for entry into archive by Vanessa Christiane (referencia@ufersa.edu.br) on 2018-02-20T14:29:14Z (GMT) No. of bitstreams: 1 MariaVFGM_TESE.pdf: 2255574 bytes, checksum: d3cf0b423233b9046e82012595a64ce4 (MD5) / Approved for entry into archive by Vanessa Christiane (referencia@ufersa.edu.br) on 2018-02-20T14:31:40Z (GMT) No. of bitstreams: 1 MariaVFGM_TESE.pdf: 2255574 bytes, checksum: d3cf0b423233b9046e82012595a64ce4 (MD5) / Made available in DSpace on 2018-02-20T14:31:47Z (GMT). No. of bitstreams: 1 MariaVFGM_TESE.pdf: 2255574 bytes, checksum: d3cf0b423233b9046e82012595a64ce4 (MD5) Previous issue date: 2017-08-21 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / The aim of this study was to evaluate the use of whey powder associated with powdered milk as a substitute for whole milk without breastfeeding until 60 days of age on the development of pre-stomachs, growth and proliferation rate Cellular of the ruminal papillae, as well as an influence of the diets on as chymosin and pepsinogen producing cells of the calf abomasum through the immunohistochemical technique. To that end, 24 crossbred calves with one week of life were distributed in a completely randomized design with four treatments and six replicates: LI: whole milk (Control); LP: milk powder; LPS1: 80% milk powder + 20% whey powder; LPS2: 60% milk powder + 40% whey powder cheese. For the methods of dry matter (DM) consumption, measurements of hay consumption and concentrate are made by the supply / surplus method. The animals were slaughtered at 60 days of age. The cavity organs were weighed with contents, and soon thereafter emptied and newer, registering, full and empty weights, respectively. The weight of the stomach and its compartments were determined with absolute values (kg) and relative (%) as a function of the empty body weight (%PCVZ) and as a function of the weight of the whole stomach (%PE). Fragments of approximately one square centimeter (1cm2) of tissues were collected from 4 regions of the world: rumen atrium, dorsal sac, caudate-dorsal blind sac and ventral sac from where they are measured as heights of ruminal papillae. Proliferative activity was evaluated in tissue samples collected by counting Argirophilic Nucléole Organisms (AgNOR). Tissue samples of 1 cm2 of the abomasum were collected for immunohistochemistry. There was no difference for dry matter intake (P> 0.05). As averages obtained for absolute and relative weights as a function of the empty body weight of the digital compartments did not present significant residues (P> 0.05) between the treatments. Regarding the development of non-rumen papillae There were significant (P <0.05) for a height variable in the ventral sac, where animals receiving whole milk had higher averages. There were no significant differences (P> 0.05) for the rate of cell proliferation in ruminal papillae. The percentage of acini with immunoreactive cells to the chymosin and pepsinogen antibodies presented a statistical difference (P <0.05), where the calves that received a 100% whole milk diet presented a mean percentage of marking for upper chymosin (95.11%), Animals that consumed 60% milk powder + 40% whey powder (89.59%) / Objetivou-se avaliar o desenvolvimento dos pré-estômagos, o crescimento e a taxa de proliferação celular das papilas ruminais, em bezerros aleitados com sucedâneos (leite em pó e soro de queijo em pó) durante os 60 primeiros dias de vida. Verificar se a dieta pode influenciar as células produtoras de quimosina e pepsinogênio. Para isso, 24 bezerros mestiços com uma semana de vida foram distribuídos em um delineamento inteiramente casualizado com 4 (quatro) tratamentos e 6 (seis) repetições: LI: leite integral (Controle); LP: leite em pó; LPS1: 80% leite em pó + 20% de soro de queijo em pó; LPS2: 60% leite em pó + 40% de soro de queijo em pó. Para os cálculos de consumo de matéria seca (MS) foram feitas medições diárias de consumo de feno e concentrado pelo método de oferta/sobra. Os animais foram abatidos aos 60 dias de vida. Os órgãos cavitários foram pesados com conteúdo, e logo em seguida, esvaziados e novamente pesados, registrando-se, os pesos cheios e vazios, respectivamente. Foi determinado o peso dos estômagos e de seus compartimentos com valores absolutos (kg) e relativos (%) em função do peso de corpo vazio (% PCVZ) e em função do peso do estômago completo (% PE). Foram retirados fragmentos de aproximadamente um centímetro quadrado (1cm2) de tecidos de 4 regiões do rúmen: átrio ruminal, saco dorsal, saco cego caudo-dorsal e saco ventral de onde foram medidas as alturas das papilas ruminais. A atividade proliferativa foi avaliada em amostras de tecidos retiradas do rúmen por meio da contagem de Regiões Organizadoras de Nucléolos Argirofílicos (AgNOR). Foram coletadas amostras teciduais de 1cm2 do abomaso para a realização da imunohistoquímica. Não houve diferença significativa para o consumo de matéria seca (P>0,05). As médias obtidas para pesos absolutos e relativos em função do peso do corpo vazio dos compartimentos gástricos não apresentaram diferenças significativas (P>0,05) entre os tratamentos. Quanto ao desenvolvimento de papilas no rúmen houve diferenças significativas (P<0,05) para a variável altura no saco ventral, onde os animais que receberam leite integral possuíram maiores médias. Não houve diferenças significativas (P>0,05) para a taxa de proliferação celular nas papilas ruminais. Os percentuais de ácinos contendo células imunorreativas aos anticorpos quimosina e pepsinogênio apresentaram diferença estatística (P<0,05), onde os bezerros que receberam a dieta 100% leite integral, apresentaram média percentual de marcação para quimosina superior (95,11%), aqueles animais que consumiram a dieta 60% leite em pó + 40% de soro de queijo em pó (89,59%) / 2017-11-27

Chez les ruminants, l’Acidose Ruminale SubAiguë (ARSA) est une maladie d’origine nutritionnelle qui fait suite à une perturbation des fermentations microbiennes et à une acidité anormale du compartiment ruminal. L’installation chronique de ce dysfonctionnement digestif peut avoir une incidence néfaste sur l’efficacité de production et la santé des animaux. À l’échelle de l’individu ou du troupeau, elle aura pour conséquences des retombées économiques négatives pour l’éleveur. Un des problèmes majeurs de cette maladie est qu’elle ne se manifeste pas par des signes cliniques spécifiques. A l’heure actuelle, seul le pH ruminal permet d’objectiver la maladie même si aucun indicateur de pH ne fait l’unanimité, notamment du fait des variabilités importantes liées à la technique de mesure du pH d’une part et à la susceptibilité des animaux d’autre part. Dans ce contexte, cette thèse a eu pour objectif d’améliorer le diagnostic individuel de l’ARSA chez la vache laitière en développant une approche multiparamétrique applicable sur le terrain. Nous proposons de nouveaux indicateurs issus de cinétiques de pH mesuré de façon non-invasive avec des bolus intra-ruminaux. Ces nouveaux indicateurs relatifs, calculés quotidiennement sur les cinétiques normalisées sur 0 (NpH), sont le temps passé sous NpH <-0,3, l’écart type et l’amplitude. Ils permettent de pallier les fortes sources de variabilité et présentent l’intérêt d’être transposables entre études et sont plus précis pour caractériser l’ARSA. Parallèlement, nous avons développé des modèles multiparamétriques composés de plusieurs paramètres mesurés simultanément dans différents compartiments biologiques (lait, fèces, salive, sang, urine) ou sur l’animal (comportement). Leur capacité de prédiction de l’ARSA a ensuite été évaluée en élevage. Certains modèles incluant des paramètres périphériques au rumen et simples à mesurer sur le terrain présentent une bonne sensibilité (concentration en urée dans le lait, en bicarbonate dans le sang, pH salivaire), et d’autres ont une bonne spécificité (nombre de buvées de l’animal, pH fécal, concentration en urée dans le lait). Néanmoins, aucun modèle ne renferme un couple sensibilité et spécificité satisfaisant. A l’issue de ce travail nous proposons une stratégie diagnostique fondée sur 4 étapes : 1) l’analyse du contexte de diagnostic de l’ARSA, 2) l’évaluation des facteurs de risques, 3) l’évaluation des modèles multiparamétriques et 4) le calcul d’indicateurs NpH ruminaux des individus à risque. / In ruminants, subacute ruminal acidosis (SARA) is a nutritional disease that induces an abnormal acidity of the rumen compartment as well as disturbance in microbial fermentation. When the disease becomes chronic, it can lead to negative effects on production efficiency and animal health at the individual or the herd scales, with negative economic consequences for the farmer. One of the major problems of SARA is that there are no obvious clinical signs. Presently, the only benchmark to define SARA is rumen pH. However, no pH indicator is unanimous due to the important variability related both to the measurement technique itself and to the animal susceptibility. In this context, this thesis aimed to improve the individual diagnosis of SARA in dairy cows by developing a multiparametric approach that could be used on field. We propose new indicators of pH kinetics measured noninvasively with intra-ruminal boluses. These new relative indicators, calculated daily (kinetic normalised on 0, NpH), consist of the time spent under NpH < - 0.3, the NpH standard deviation and the NpH range. These indicators make it possible to overcome the strong sources of variability and have the advantage of being transposable while being more accurate to characterize SARA. At the same time, we have developed multiparametric models including a number of parameters measured simultaneously in various biological compartments (milk, faeces, saliva, blood, urine) or on animal behaviour. The models ability to predict SARA has been evaluated on field. Some models including rumen peripheral parameters (concentration of urea in milk, of bicarbonate in blood, salivary pH) have a proficient sensitivity while others have a proficient specificity (number of drinking acts, faecal pH, and urea concentration in milk). However, no model developed is both sensitive and specific enough. The diagnostic strategy we propose is based on 4 steps: 1) analysis of the SARA diagnostic context, 2) assessment of risk factors, 3) evaluation of multiparametric models and (4) determination of ruminal NpH indicators for individuals presenting a high risk of SARA.

Submitted by DANIELA DUTRA ESTEVAM null (daniela_estevam@yahoo.com.br) on 2016-02-01T14:08:30Z No. of bitstreams: 1 DISSERTAÇÃO DANIELA.pdf: 1615348 bytes, checksum: 18226c859c846688ff9fa236460a54de (MD5) / Approved for entry into archive by Sandra Manzano de Almeida (smanzano@marilia.unesp.br) on 2016-02-01T18:01:26Z (GMT) No. of bitstreams: 1 estevam_dd_me_bot.pdf: 1615348 bytes, checksum: 18226c859c846688ff9fa236460a54de (MD5) / Made available in DSpace on 2016-02-01T18:01:26Z (GMT). No. of bitstreams: 1 estevam_dd_me_bot.pdf: 1615348 bytes, checksum: 18226c859c846688ff9fa236460a54de (MD5) Previous issue date: 2016-01-22 / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP) / O objetivo deste estudo foi avaliar os efeitos dos períodos de 6, 9, 14 e 21 dias de adaptação de bovinos da raça Nelore confinados a dietas de alto teor de concentrado em relação ao desempenho, variação na ingestão de massa seca, energia líquida, perfil metabólico sanguíneo, comportamento ingestivo, saúde ruminal e características de carcaça. Os animais foram alimentados durante 88 dias, independentemente do período de adaptação adotado e o delineamento utilizado foi em blocos casualizados, com seis repetições cada, em que 96 bovinos da raça Nelore não castrados (391,1 ± 30,9 kg) foram alimentados em 24 baias (4 animais/baia), de acordo com os diferentes períodos de adaptação adotados: 6, 9, 14 e 21 dias. O programa de adaptação utilizado foi em escadas, com três dietas ao longo de períodos de adaptação com seguintes níveis de concentrado: 70, 75, 80,5 e 86% da massa seca na dieta. Contrastes ortogonais foram utilizados para avaliar a relação linear, quadrática e cúbica entre os dias de adaptação e a variável dependente, além da interação de tratamento e fase (P≤0,10). Os animais adaptados por 14 dias apresentaram resultados superiores em relação ao ganho de peso diário, peso vivo final e eficiência alimentar, bem como peso de carcaça quente (P=0,04) e área de olho de lombo final (P=0,01). A adaptação por 14 dias também proporcionou aos animais melhor desenvolvimento do epitélio ruminal, pois apresentaram maior área de superfície absortiva (P=0,02) e largura de papilas (P=0,06). Além disso, esses animais demonstraram que estavam adequadamente adaptados, pois a renovação celular do epitélio ruminal demonstrou-se estabilizada no índice de proliferação celular (P=0,003) e nos núcleos em morte celular (P=0,0004). Com base nesses resultados, recomenda-se adaptar bovinos da raça Nelore a dietas de alto concentrado com o protocolo em escadas por 14 dias, pois este proporcionou maior desempenho produtivo e desenvolvimento do epitélio ruminal. / This study was designed to determine the effects of adaptation periods of 6, 9, 14 and 21 days on feedlot performance, dry matter intake fluctuations, energy gain, blood metabolic profile, feeding behavior, rumen health and carcass traits of Nellore cattle. Cattle were fed for 88-d regardless of adaptation period adopted and the experiment was designed as a completely randomized block, replicated 6 times, in which ninety-six 20-mo-old yearling Nellore bulls (391.1 ± 30.9 kg) were fed in 24 pens (4 animals/pen) according to the different adaptation periods adopted: 6, 9, 14, and 21 days. The adaptation program consisted of ad libitum feeding of 3 diets over adaptation periods with concentrate level increasing from 70, 75, 80.5 and 86% of diet dry matter. Orthogonal contrasts were used to evaluate linear, quadratic, and cubic relationship between adaptation periods and the dependent variable, moreover the interaction the treatment and phase (P≤0.10). Cattle adapted for 14 days had significantly greater for average daily gain, final body weight, G:F ratio, hot carcass weight (P=0,04) and rib-eye area (P=0,01). The adaptation for 14 days the animals also provided better development of the rumen epithelium for a greater absorptive surface area (P=0.02) and width papillae (P=0.06). Moreover, these cattle showed that were properly adapted because the cell epithelium renovation proved to be stable in cell proliferation index (P=0.003) and cell death (P=0.0004). Thus, based on the results of this study, yearling Nellore bulls should be adapted for the step protocol for 14 days, because these provided greater performance and development of the rumen epithelium. / FAPESP: 2013/25403-0

Submitted by ANDRÉ LUIZ NAGATANI RIGUEIRO null (andrenagatani@yahoo.com.br) on 2016-03-21T15:13:20Z No. of bitstreams: 1 Defesa-André04JAN2016_FINAL.pdf: 1050041 bytes, checksum: ad145a930ac44964a3ccf42de7b60ee7 (MD5) / Approved for entry into archive by Ana Paula Grisoto (grisotoana@reitoria.unesp.br) on 2016-03-23T12:00:02Z (GMT) No. of bitstreams: 1 rigueiro_aln_me_dra.pdf: 1050041 bytes, checksum: ad145a930ac44964a3ccf42de7b60ee7 (MD5) / Made available in DSpace on 2016-03-23T12:00:02Z (GMT). No. of bitstreams: 1 rigueiro_aln_me_dra.pdf: 1050041 bytes, checksum: ad145a930ac44964a3ccf42de7b60ee7 (MD5) Previous issue date: 2016-01-14 / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP) / O objetivo deste estudo foi avaliar o efeito do uso combinado de monensina sódica (MON) e virginiamicina (VM) sobre o desempenho produtivo, comportamento ingestivo, características de carcaça, e saúde ruminal de bovinos Nelore terminados em confinamento. Foram utilizados 72 animais machos inteiros da raça Nelore, com peso vivo médio inicial de 388±31,07 kg, provindos de sistema de recria em pasto. Os animais foram divididos em quatro tratamentos de acordo com associação ou não dos aditivos nas fases de adaptação e terminação: MON (30 mg/kg) na adaptação + terminação; MON (30 mg/kg) + VM (25 mg/kg) na adaptação e VM (25 mg/kg) na terminação; MON (30 mg/kg) + VM (25 mg/kg) na adaptação e VM (25 mg/kg) + MON (30 mg/kg) na terminação e VM (25 mg/kg) na adaptação e MON (30 mg/kg) + VM (25 mg/kg) na terminação, caracterizando assim delineamento em blocos casualizados, em que cada tratamento contou com 6 repetições (3 animais por baia, sendo as baias as unidades experimentais). A duração do experimento foi de 90 dias, sendo 19 dias de adaptação, divididos em três períodos (7, 5 e 7 dias) com dietas de 69%, 74% e 79% de ingredientes concentrados, respectivamente; e 71 dias de terminação, com dieta contendo 84% de concentrado. Durante a fase de adaptação, a suplementação somente com VM aumentou a ingestão de matéria seca em quilos (IMSKG), ingestão de matéria seca em % do peso vivo (IMSPV), diminuiu a flutuação da ingestão de matéria seca (IMS) em quilos e em porcentagem e diminui os dias para os animais atingirem 2% de IMSPV (P<0,05). No período total de confinamento, a suplementação com MON e VM na fase de adaptação e somente VM na terminação aumentou o PV final, IMSKG, IMSPV, GPD, peso de carcaça quente, área de olho de lombo (AOL) final e ganho de AOL por dia. Não houve diferenças significativas entre os tratamentos para os parâmetros relacionados a saúde ruminal e seletividade da ração (P>0,05). Desta forma, a suplementação com somente VM melhorou o desempenho dos animais na fase de adaptação, no entanto, a suplementação com MON e VM na fase de adaptação e somente VM na terminação melhorou o desempenho e características de carcaça dos animais sem diferenças nos parâmetros relacionados a saúde ruminal e seletividade da dieta. / The experiment was designed to evaluate the effect of combined use of monensin (MON) and virginiamycin (VM) in the adaptation period and finishing period on feedlot performance, feeding behavior, ruminal health and carcass characteristics of Nellore cattle. Seventy two 26-mo-old yearling Nellore bulls (388±31.07 kg), backgrounded on pasture were randomly allocated and kept in 24 pens (10 m² and e 1.67 m bunk space per animal) according to the treatments: MON (30 mg/kg) in the adaptation and finishing period, MON (30 mg/kg ) + VM (25 mg/kg) in adaptation and only VM (25 mg/kg) in finish, MON (30 mg/kg) + VM (25 mg / kg) in adaptation and VM (25 mg/kg) + MON (30 mg/kg) in finish and VM (25 mg/kg) in adaptation MON (30 mg/kg) + VM (25 mg/kg) in finish, thus characterizing a completely randomized block design. Each treatment was composed by 6 replications (pens) in this study. The adaptation program consisted of ad libitum feeding of three adaptation diets over period of 19 days with concentrate level increasing from 69% to 84% of diet dry matter. During the adaptation period, animals feed with only VM showed greater dry matter intake in kilos, dry matter intake expressed as % of body weight, reduced in dry matter intake variation in kilos and percentage, and the number of days to achieve 2% of DMI, expressed as % of body weight (P<0.05). Throughout the study, steers that were fed MON and VM during the adaptation period and only VM during the finishing period increase final BW, DMI in kilograms and as percentage of BW, average daily gain, hot carcass weight, ribeye area and daily gain of ribeye area when compared to animals receiving others combinations. There were no differences between the treatments for parameters related of rumen health and selective consumption of ration (P>0.05). Thus, supplementation with only VM in the adaptation period improved the feedlot performance of the animals during the adaptation period; however, the supplementation with MON e VM during the adaptation period and only VM in the finishing period improved animals performance and carcass traits of Nellore cattle. / FAPESP: 2013/21672-7

Made available in DSpace on 2014-06-11T19:33:33Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2009-08-24Bitstream added on 2014-06-13T20:45:16Z : No. of bitstreams: 1 messana_jd_dr_jabo.pdf: 516057 bytes, checksum: 5a76bbae8a2f8d295527d5f8dc5edcd0 (MD5) / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP) / A suplementação com teores crescentes de lipídeos na dieta de ruminantes é uma alternativa estudada para aumentar a densidade energética da dieta, e para manipular a fermentação ruminal através da alteração na digestão e absorção dos nutrientes. O fornecimento de lipídeos para ruminantes pode reduzir a produção de metano e conseqüentemente a perda de energia pelo animal, pois os lipídeos na forma de ácidos graxos insaturados sofrem biohidrogenação no rúmen, consumindo H+. A adição de lipídeos poliinsaturados na dieta permite ainda melhorar o desempenho animal e alterar a composição de ácidos graxos na carcaça de bovinos de corte. Desta forma, este trabalho avaliou o efeito de diferentes teores de lipídeos nos parâmetros de fermentação ruminal, desempenho, desenvolvimento e características quantitativas e qualitativas das carcaças de bovinos alimentados com três diferentes teores de lipídeos na dieta (2,4 e 6% na MS). Os consumos e digestibilidade totais de MS, MO, EB, FDN e FDA não foram influenciados (P> 0,05) pela utilização de diferentes teores de lipídeos. No entanto, o tratamento com maior teor de lipídeo (6%) na dieta proporcionou tendência de diminuição linear (P< 0,1) na digestibilidade total da PB e CHOT com médias de 67,14 e 72,76%, respectivamente, quando comparada ao tratamento com menor teor de lipídeo (2%), que apresentou, nas respectivas variáveis citadas, médias de 71,6 e 75,95%. O fornecimento da dieta com 2% de lipídeos resultou em menor concentração média de amônia (9,13 mg/dL) no rúmen quando comparado com 4 e 6% de lipídeos (13,04 e 12,66% respectivamente). Verificou-se menor valor médio de pH ruminal (6,39) nos animais que receberam maior teor de lipídeos na dieta (6%), quando comparado aos animais que receberam 2 e 4% de lipídeo que apresentaram pH de 6,58 e 6,54, respectivamente. As concentrações ruminais... / The supplementation with increasing levels of fat in the diet of ruminants is considered an alternative to increasing energy density of the diet, and to manipulate the rumen fermentation through the change in digestion and absorption of nutrients. The supply of fat for ruminants may reduce the production of methane and consequently the loss of energy by the animal, because the fat in the form of unsaturated fatty acids undergo biohydrogenation in the rumen, consuming H+. The addition of polyunsaturated fat in the diet also improved animal performance and change the composition of fatty acids in the carcasses of cattle. This study evaluated the effect of different levels of fat in the parameters of rumen fermentation, performance, development and quantitative and qualitative characteristics of cattle fed three different levels of fat in the diet (2.4 and 6% of DM). The intake and total digestibility of DM, OM, GE, NDF and ADF were not affected (P> 0.05) by using different levels of fat. However, the treatment with high fat content (6%) in the diet provided decreasing linear trend (P <0.1) in the total digestibility of CP and TC with averages of 67.14 and 72.76% respectively when compared to treatment with lower fat intake (2%), which presented the respective variables mentioned, averaging 71.6 and 75.95%. Food supply with 2% fat resulted in lower average concentration of ammonia (9.13 mg / dL) in the rumen compared with 4 and 6% fat (13.04 and 12.66% respectively). A lower average rumen pH (6.39) in animals that received higher levels of fat in the diet (6%) compared to animals that received 2 and 4% fat which showed pH of 6.58 and 6.54, respectively. The ruminal concentrations of fatty acids of short chain were not affected (P> 0.05) the levels of fat in the diet. The dry matter intake, feed conversion and feed efficiency were not affected (P> 0.05) between the different levels of fat... (Complete abstract click electronic access below)

Made available in DSpace on 2014-06-11T19:33:33Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2010-02-25Bitstream added on 2014-06-13T18:45:25Z : No. of bitstreams: 1 goncalves_js_dr_jabo.pdf: 576207 bytes, checksum: cfdaea1c27461a2cb51c7532f31b6d87 (MD5) / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP) / Os objetivos deste trabalho foram verificar os efeitos das relações amido:fibra solúvel em detergente neutro (FSDN) das dietas sobre os parâmetros ruminais, digestivos e de desempenho de ovinos Dorper x Santa Inês. As dietas foram caracterizadas pelas altas concentrações de amido (25%MS) ou de FSDN (25%MS) ou concentrações equivalentes destes nutrientes (18%amido+18%fibra solúvel na MS). No primeiro experimento foram utilizados seis borregos canulados ruminalmente, distribuídos em delineamento quadrado latino duplo (3 dietas x 3 períodos) para avaliação ruminal da concentração de amônia, pH e qualificação de massa microbiana. O segundo experimento avaliou o consumo, a digestibilidade total da matéria seca e dos nutrientes e os balanços de nitrogênio e energia das dietas experimentais, utilizando 15 borregos distribuídos em delineamento inteiramente casualizado. No terceiro experimento realizou-se um confinamento utilizando 24 borregos não castrados distribuídos em delineamento em blocos completos casualizados. Após 74 dias de confinamento os animais foram avaliados quanto ao ganho em peso, consumo, conversão e eficiência alimentar. Posteriormente foram abatidos e avaliados quanto ao peso de abate, características de carcaças e composição química do músculo Longissimus. Os valores de pH (6,29) não diferiam (P>0,05) entre as dietas enquanto que a maior concentração de amônia foi encontrada para a dieta com 25% de FSDN. Aproximadamente 60% dos microrganismos ruminais estavam associados a fase líquida, contudo as dietas não interferiram (P>0,05) na população microbiana ruminal. Elevados coeficientes de digestibilidade foram observados, independentementemente do tipo de carboidrato solúvel utilizado em maior proporção. O consumo de matéria seca foi menor para a dieta FSDN (1,075 kg) quanto comparado às demais dietas, afetando a maioria das variáveis... / The objective of this study was to evaluate the effects of dietary starch:neutral detergent soluble fiber (NDSF) relation on ruminal, digestibility and performance of Dorper x Santa Inês ram lambs. The diets were characterized by high concentrations of starch (25% DM) or NDSF (25% DM) or equivalent concentrations of these nutrients (18% starch +18% soluble fiber at MS). In the first experiment six lambs with ruminal cannula were used, distributed in Latin square design (3 diets x 3 periods) to assess ruminal ammonia concentration, pH and classification of microbes. The second experiment assessed intake, total digestibility of dry matter and nutrients and nitrogen balance and energy of diets, using 15 lambs distributed in a completely randomized design. In the third experiment ram lambs were distributed in a complete randomized block design. After 74 days of confinement all animals were evaluated weight gain, intake, feed conversion and efficience. Later were slaughter and evaluated by slaughter weight, carcass characteristics and Longissimus chemical composition. Average pH (6.29) did not differ (P>0.05) amoung diets while the highest concentration of ammonia was found for the diet with 25% of NDSF. Approximately 60% of ruminal microorganisms were associated with the liquid phase, however the diets did not affect (P>0.05) ruminal microbial populations. High digestibility coefficients were observed, regardless of the type of soluble carbohydrate used. Dry matter intake was lower (P<0.05) for NDSF (1.075 kg) compared to the other diets, affecting most of the performance variables. It is recommended the use of diets with 18% starch and 18% of fsdn to sheep fed high proportions of concentrate

Submitted by Simone Souza (simonecgsouza@hotmail.com) on 2017-08-22T15:36:14Z No. of bitstreams: 1 DISS_2014_Géssy Gabriella Gentile de Paula Caetano.pdf: 1022879 bytes, checksum: 9b17e43aea531d67800fc9446aa2e02f (MD5) / Approved for entry into archive by Jordan (jordanbiblio@gmail.com) on 2017-08-24T15:08:32Z (GMT) No. of bitstreams: 1 DISS_2014_Géssy Gabriella Gentile de Paula Caetano.pdf: 1022879 bytes, checksum: 9b17e43aea531d67800fc9446aa2e02f (MD5) / Made available in DSpace on 2017-08-24T15:08:32Z (GMT). No. of bitstreams: 1 DISS_2014_Géssy Gabriella Gentile de Paula Caetano.pdf: 1022879 bytes, checksum: 9b17e43aea531d67800fc9446aa2e02f (MD5) Previous issue date: 2014-02-21 / CAPES / Foram realizados dois experimentos no setor de Ovinocultura da Fazenda Experimental da Universidade Federal de Mato Grosso, com objetivo de avaliar o efeito da substituição parcial da silagem de milho por bagaço de cana de açúcar in natura (BCIN) sobre os consumos, digestibilidades aparente dos componentes nutritivos, parametros ruminais, síntese de nitrogênio microbiano, balanço de nitrogênio, desempenho e viabilidade econômica. As dietas foram compostas por 40% de volumoso e 60% de concentrado. A silagem de milho foi substituída por BCIN em 0; 17,5; 35,0; 52,5 e 70%, o que correspondeu a 0,7, 14, 21 e 28% de inclusão nas dietas. No primeiro experimento foram utilizados 40 cordeiros sem raça definida, machos não castrados, com idade aproximada 105 dias e peso médio inicial de 20,16±0,59 kg, distribuídos em 20 baias de 4,06 m² cada. O experimento foi conduzido em delineamento em blocos casualizados com cinco tratamentos e quatro repetições.O consumo de matéria seca (MS) não foi alterado nos tratamentos avaliacos, enquanto que os consumos de fibra em detergente neutro (FDN) e fibra em detergente neutro corrigido para cinzas e proteína (FDNcp) assim como as digestibilidades da MS, proteína bruta e FDN aumentaram linearmente (P<0,05) em consequência da maior participação do BCIN nas dietas. A inclusão crescente de BCIN reduziu o ganho médio diário, e o melhor custo benefício foi observado com a substituição do BCIN em 7%. No segundo experimento foram utilizados cinco ovinos machos castrados, adultos, canulados no rúmen com peso médio inicial de 65±2,07 kg, distribuídos em delineamento em quadrado latino 5 x 5. As inclusões de BCIN não influenciaram (P<0,05) digestibilidade da MS, mas as digestibilidades da FDN, FDNcp e carboidatos totais descresceram linearmente. O pH ruminal e NAR não foram influenciados (P<0,05) pela adição do BCIN, com médias de 6,16 e 8,03 mg/dL, respectivamente. As excreções de derivados de purinas não foram influenciadas, com excreção de purinas totais de 29,67 mmol/dia, resultando em 25,68 g/dia de N microbiano. O consumo e as perdas de nitrogênio variaram com quantidades acima de 14% de BCIN na dieta. Diante do desempenho nutricional e animal, a substituição da silagem de milho por BCIN em até 7% reduz os custos e melhora a margem bruta na terminação de cordeiros. / Two experiments were conducted in the Sheep section of the Experimental Farm of the Federal University of Mato Grosso, to evaluate the effect of partial replacement of corn silage by sugar cane bagasse in natura (BIN) on intake, apparent digestibility of components nutritious, ruminal parameters, synthesis of microbial nitrogen, nitrogen balance, performance and economic viability. The diets were composed of 40 % forage and 60 % concentrate. Corn silage was replaced by BCIN on 0; 17.5; 35.0; 52.5 and 70 %, corresponding to 0, 7, 14, 21 and 28% inclusion in the diet. In the first experiment 40 lambs mixed breed, neutered males, aged approximately 105 days and an average initial weight of 20.16 ± 0.59 kg were divided into 20 pens of 4.06 m² each were used. The experiment was conducted in a randomized block design with five treatments and four repetições.The intake of dry matter (DM) was not altered in treatments evaluated, whereas the intake of neutral detergent fiber (NDF) and neutral detergent fiber corrected for ash and protein (NDF) as well as the digestibility of DM, CP and NDF increased linearly (P < 0.05) as a result of increased participation in the BCIN diets. The increasing inclusion of BIN reduced average daily gain, and the best cost benefit was observed with the substitution of BIN 7%. In the second experiment, five male sheep, adults, cannulated in the rumen with an average initial weight of 65 ± 2.07 kg, allotted to a 5 x 5 Latin square were used. BIN The inclusions did not influence (P < 0.05) DM digestibility, but apparent digestibility of NDF, NDF and total carboidatos descresceram linearly. The NAR and ruminal pH were not affected (P < 0.05) by the addition of BIN, with averages of 6.16 and 8.03 mg/dL, respectively. Excretion of purine derivatives were not affected, with excretion of total purine 29.67 mmol/day, resulting in 25.68 g/day of microbial N. Consumption and nitrogen losses varied with quantities greater than 14% of the BIN diet. Given the nutritional and animal performance, the substitution of corn silage BIN by up to 7% reduces costs and improves gross margin in lamb finishing.

Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - CAPES / With the prospect of increased production, the lambs diet evaluation is so important in order to obtain optimal results of weight gain and quality. When we talk about productivity, we must take into consideration diet type offered to animals, thinking about the economic view and also the development of the animal's organism. Feeding causes morphophysiological changes in organs which are part of the nutrients absorption and will generate energy for growing and development. The two treatments used in the present work differ significantly for the volatile fatty acids (VFA) concentration resulting from food fermentation propitiating structural and absorption changes. The treatments used for the extensive system of grass - grazing and the concentrate in confinement. The aim of this paper is a morphometric evaluation of ruminal papillae from different diets, exclusively pasture and concentrate considering best collection site. Data analysis is going to te through rumen blades, with special staining for tissue differentiation and better analysis morphological on the cellular level. The obtained data is going to be analyzed comparing two diets and tissues with each other on the same diet, since there were two collection sites in rumen, dorsal sac and rumen of the meat. This will be done using randomized design and comparison between diets in the rumen tissues and factorial arrangement (2 x 2) for two samples taken from different rumen portions. Measurements will be obtained with the aid of microscope and image analysis of differences generated from the feeding. The histological evaluation sections showed significant differences comparing between treatments and collection site. Animals which concentrate presented more significant measures in relation to the animals which ate pasture propitiating structural changes at the cellular level. Therefore, feeding directly influences the animal growth. In general, it is important to establish specific collection sites to histological evaluations. / Com a perspectiva de aumento de produção, a avaliação da dieta de cordeiros é de grande importância para que se tenham ótimos resultados de ganho de peso e qualidade. Quando falamos em produtividade se deve levar em conta o tipo de dieta oferecida aos animais, pensando na parte econômica e também no desenvolvimento do organismo do animal. A alimentação causa mudanças morfofisiológicas nos órgãos que fazem parte da absorção dos nutrientes e vão gerar energia para o crescimento e desenvolvimento do animal. Os dois tratamentos utilizados neste trabalho diferem significativamente na concentração de ácidos graxos voláteis (AGV) resultantes da fermentação do alimento, propiciando as mudanças estruturais e de absorção. Os tratamentos utilizados neste trabalho foram o pasto no sistema extensivo - pastoreio e o concentrado em confinamento. O objetivo deste trabalho é a avaliação morfométrica do rúmen de dietas diferentes, exclusivamente a pasto e concentrado, levando em conta o melhor local de coleta para avaliação dos parâmetros gerados nos diferentes tipos de alimentação. A análise dos dados foi por meio de lâminas do rúmen, com coloração especial, Goldner e HE, para diferenciação dos tecidos e melhor análise dos aspectos morfológicos a nível celular. Os dados obtidos foram analisados comparando-se as duas dietas e comparando os tecidos entre si de mesma dieta, já que houveram dois locais de coleta no rúmen, saco dorsal e rúmen do cárdia. Para isso foi usando o delineamento inteiramente casualizado e comparação entre dietas nos tecidos do rúmen e arranjo fatorial (2 x 2) para as duas amostras retiradas de porções diferentes do rúmen. As medidas foram obtidas com auxilio de microscópio óptico e programa analisador de imagens que permitiu a mensuração dos tecidos e posterior análise das diferenças geradas a partir da alimentação. A avaliação dos cortes histológicos mostraram diferenças significativas na comparação entre os tratamentos e o local de coleta. Os animais que comeram concentrado apresentaram medidas mais significativas em relação aos animais que comeram pasto, propiciando mudanças nas estruturas a nível celular. Portanto, a alimentação influencia diretamente no crescimento do animal. De modo geral, é importante estabelecer locais de coleta específicos para as avaliações histológicas.

O presente trabalho teve como principal objetivo o estudo das diferenças entre os resultados obtidos com o uso do método dos mínimos quadrados ponderados e de mínimos quadrados ordinários, no ajuste do modelo de Orskov e McDonald (1979) aos dados de degradação da matéria seca (MS) e fibra em detergente ácido (FDA) em novilhos Nelore fistulados, utilizando a técnica in situ. Foram utilizados os dados de um experimento delineado em quadrado latino 4x4 (quatro animais e quatro períodos) cujos tratamentos foram: dieta com sal de cálcio de ácidos graxos e monensina (A); dieta com caroço de algodão e monensina (B); dieta controle com monensina (C) e dieta com caroço de algodão sem monensina (D). As medidas de degradabilidade foram coletadas em oito ocasiões (0, 3, 6, 12, 24, 48, 72 e 96 horas). Como essas medidas são obtidas repetidamente no mesmo animal, espera-se que as variâncias das respostas nas diversas ocasiões não sejam iguais. Nas análises propostas foram utilizados os dados originais (MS e FDA) e os dados corrigidos para os efeitos de animal e de período. De uma forma geral, observou-se que o uso do método dos mínimos quadrados ponderados alterou os resultados das análises, produzindo um aumento das estatísticas dos testes e uma alteração da significância dessas estatísticas, por conta da retirada do efeito de animal e período dos dados originais e ao uso do método de mínimos quadrados ponderados, com a ponderação feita pelo inverso da variância dos dados em cada ocasião. / The present work had as main objective the study of the differences between the results obtained using the method of the weighted least squares and ordinary least squares, in the fit of the model of Orskov and McDonald (1979) to the data of degradation of the dry matter (MS) and acid detergent fiber (ADF) in fistulated Nelore steers, using the technique in situ. The data of a delineated 4x4 Latin Square had been used (four animals and four periods) whose treatments had been: diet with calcium salt of fatty acid and monensin (A); diet with whole cottonseed and monensin (B); diet has control with monensin (C) and diet with whole cottonseed without monensin (D). The measures of degradability had been collected in eight occasions (0, 3, 6, 12, 24, 48, 72 and 96 hours). As these measures they are gotten repeatedly in the same animal, expects that the variances of the answers in the diverse occasions are not equal. In the analyses proposals the original data (MS and ADF) and the data corrected for the period and animal effect had been used. Of a general form, it was observed that the use of the method of the weighted least squares modified the results of the analyses, producing an increase of the statisticians of the tests and an alteration of the significance of these statisticians, for account of the withdrawal of the animal effect and period of the original data and to the use of the method of weighted least squares, with the weighted made for the inverse one of the variance of the given ones in each occasion.

Submitted by CLAUDIO DAMASCENO PAVANI null (claudio_dp913@hotmail.com) on 2017-07-10T13:24:55Z No. of bitstreams: 1 Tese Claudio_Damasceno _Pavani.docx: 10100219 bytes, checksum: b0579cc0881c7d4a4bd458b37a7be301 (MD5) / Rejected by Monique Sasaki (sayumi_sasaki@hotmail.com), reason: Solicitamos que realize uma nova submissão seguindo as orientações abaixo: A versão final da dissertação/tese deve ser submetida no formato PDF (Portable Document Format). O arquivo PDF não deve estar protegido e a dissertação/tese deve estar em um único arquivo, inclusive os apêndices e anexos, se houver. Por favor, corrija o formato do arquivo e realize uma nova submissão. Agradecemos a compreensão. on 2017-07-13T19:46:29Z (GMT) / Submitted by CLAUDIO DAMASCENO PAVANI null (claudio_dp913@hotmail.com) on 2017-07-17T13:16:54Z No. of bitstreams: 1 Tese Claudio_Damasceno _Pavani.pdf: 4981240 bytes, checksum: c45fa10351f84e64eb25cd201dcc69c9 (MD5) / Approved for entry into archive by LUIZA DE MENEZES ROMANETTO (luizamenezes@reitoria.unesp.br) on 2017-07-18T16:17:22Z (GMT) No. of bitstreams: 1 pavani_cd_dr_jabo.pdf: 4981240 bytes, checksum: c45fa10351f84e64eb25cd201dcc69c9 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-07-18T16:17:22Z (GMT). No. of bitstreams: 1 pavani_cd_dr_jabo.pdf: 4981240 bytes, checksum: c45fa10351f84e64eb25cd201dcc69c9 (MD5) Previous issue date: 2017-06-22 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) / A comunidade mundial busca pela obtenção de biocombustível celulósico, embora ainda seja um grande desafio a desconstrução do arranjo lignocelulósico para obtenção de açúcares livres de forma eficiente e economicamente viável. A fim de superar tais desafios, avanços conquistados pela metagenômica ressaltam sua aplicação como alternativa para compreender e desvendar o grande potencial metabólico presente nos ambientes, buscando encontrar em tais ambientes novas enzimas que atuem de forma eficiente na desconstrução do material lignocelulósico. Neste trabalho utilizou-se, a abordagem metagenômica para caracterização de genes com potencial para degradar biomassa vegetal e também para avaliação da diversidade taxonômica do ambiente ruminal bovino (Cow_1), bem como comparar os dados coletados com outros metagenomas disponíveis. Amostras de conteúdo ruminal de três bovinos machos da raça Nelore foram coletadas para a obtenção da amostra de DNA metagenômico, que posteriormente foi sequenciada pelo sequenciador HiScan SQ (Illumina). Foram obtidas aproximadamente 63 milhões de sequências (Cow _1), 2 x 100 pb. Dentre os 26 filos encontrados o filo Bacteroidetes foi o mais abundante, seguido de Firmicutes e Proteobacteria. Para a anotação gênica foi utilizado os bancos de dados Pfam, GO, KEGG e CAZy. Foram associadas ORFs relacionadas a 86 famílias de Glycoside Hydrolases (GHs), 52 famílias de Carbohydrate-Binding Modules (CBMs), 4 famílias de Auxiliary Activities (AAs), 16 famílias de Carbohydrate Esterases (CEs), 55 famílias de Glycosyl Transferases (GTs), 16 famílias de Polysaccharide Lyases (PLs), 1 família de S-layer homology (SLH) domain e 1 família de cohesina e dockerina, estes genes estão relacionados a formação do complexo enzimático para desconstrução da biomassa vegetal (celulossoma). O metagenoma da cow_1 analisado apresentou maior quantidade de genes relacionados à desconstrução da biomassa vegetal, quando comparados com outros 11 metagenomas. Além disso, os metagenomas dos ambientes lignocelulósicos apresentaram, principalmente, maior abundância de GH3, GH5, GH8, GH10 e GH11, genes que são importantes na degradação da lignocelulose quando comparados com o grupo de metagenomas não lignocelulósico. Os ambientes lignocelulósicos também revelaram maior abundância de sequências de domínios que se ligam na estrutura da celulose (CBM1, CBM10, CBM11, CBM16, CBM3, CBM63, CBM79 e CBM56), domínios que se ligam na estrutura da hemicelulose (CBM35, CBM61, CBM62 e CBM67) e domínios que atuam na estrutura da celulose e xilana (CBM37, CBM44 e CBM59). O metagenoma ruminal mostrou uma grande diversidade de enzimas responsáveis pela degradação da biomassa vegetal, demonstrando seu potencial como fonte de enzimas com potencial biotecnológico. Os metagenomas lignocelulósicos mostraram uma maior abundância de GH3, GH5, GH8, GH10 e GH11, genes que são importantes na degradação de celulose, celobiose, manana, xilana e xilo-oligossacarídeos quando comparados ao grupo não-lignocelulósico. / The world community search to obtain cellulosic biofuel; however the deconstruction of the lignocellulosic arrangement to obtain free sugars in an efficient and economically viable way is still a great challenge. Advances achieved through the metagenomic emphasize its application as an alternative to unfold the great metabolic potential present in the environments in order to overcome such challenges. Thus, a metagenomic approach was used to characterize genes with potential to degrade plant biomass and to evaluate the taxonomic diversity of the Nelore bovine ruminal environment. Samples were collected from three bovine males to obtain the DNA sample, which were sequentially sequenced by the HiScan SQ (Illumina) sequencer. About 63 million sequences, 2 x 100 bp, were obtained. Among the 26 phyla found, Bacteroidetes was the most abundant, followed by Firmicutes and Proteobacteria. For gene annotation was used the Pfam, GO, KEGG and CAZy databases. A total of 86 families of Glycoside Hydrolases (GHs), 52 families of Carbohydrate Binding Modules (CBMs), 4 families of Auxiliary Activities (AAs), 16 Esterase Carbohydrate (CEs), 55 GlycosylTransferases (GTs) Polysaccharide Lyases (PLs), 1 S-homology homology (SLH) domain and 1 family of cohesin and dockerine was associated. these genes are related to the formation of the enzymatic complex for deconstruction of plant biomass (cellulosome). The cow_1 metagenome presented a greater number of genes related to deconstruction of plant biomass when compared to other 11 metagenomes. In addition, the metagenomes of the lignocellulosic environments presented, mainly, greater abundance of GH3, GH5, GH8, GH10 and GH11, genes that are important in the degradation of lignocellulose when compared with the group of non-lignocellulosic metagenomes. Focusing on the CBMs, the metagenomes of the lignocellulosic group showed a greater abundance of CBM1, CBM10, CBM11, CBM16, CBM3, CBM63, CBM79 and CBM56 that bind in the cellulose structure; CBM35, CBM61, CBM62 and CBM67 which bind to the hemicellulose structure; CBM37, CBM44 and CBM59 that act on the structure of cellulose and xylan. The ruminal metagenome showed a great diversity of enzymes responsible for the degradation of the plant biomass, demonstrating its potential as a source of enzymes with biotechnological potential. Lignocellulosic metagenomes showed a greater abundance of GH3, GH5, GH8, GH10 and GH11, genes that are important in the degradation of cellulose, cellobiose, mannan, xylan and xylo-oligosaccharides when compared to the non-lignocellulosic group.