Au cours des dernières années, un développement continu a été observé dans les domaines des systèmes électroniques et des ordinateurs. Une série de mécanismes menaçant la fiabilité ont émergé. Par exemple, des défauts physiques provenant de fils mal lithographié, vias et d'autres dispositifs de bas niveau sont fréquemment observées dans les circuits nanométriques. D'autre part, les circuits sont également devenus plus sensibles aux grèves de particules excitées. Ces deux mécanismes, bien que essentiellement différente, peuvent causer de multiples fautes qui contribuent pour fiabilités plus faibles dans les circuits intégrés. Fautes multiples sont plus inquiétant que de simples car elles sont plus graves et aussi parce qu'ils peuvent surmonter les techniques de tolérance aux fautes. Les circuits numériques sont utilisés dans la plupart des systèmes électroniques aujourd'hui, mais il y a un contexte spécifique dans lequel ils doivent être fiable. Tel contexte comprend des applications de haute dépendabilité. Et cela est le scénario dans lequel cette thèse est conçu. Il a un double objectif: (a) de proposer des méthodes pour évaluer la fiabilité des circuits numériques, et (b) de proposer des techniques d'amélioration de la fiabilité. En ce qui concerne le premier objectif, plusieurs méthodes ont été proposées dans la littérature et le texte montre comment ces méthodes présentent des limitations en ce qui concerne la taille de circuit (nombre de portes), le type de circuit (séquentielle ou combinatoire) et le profil de faute (unique ou fautes multiples). Cette thèse propose deux méthodes pour l'évaluation de la fiabilité. La première méthode est appelée SPR+ et elle vise l'analyse de la logique combinatoire seulement. SPR+ améliore la précision de l'analyse, en tenant compte de l'effet de chaque nœud de fanout par rapport à la fiabilité de l'ensemble du circuit. Une autre méthode, appelée SNaP, est également proposé dans cette thèse. Il s'agit d'une approche hybride, car il est partiellement basée sur la simulation. SNaP peut être utilisé pour la logique combinatoire et séquentielle, et peut également être émulé dans un dispositif FPGA pour une analyse plus rapide. Les deux méthodes, SPR+ et SNAP, peuvent traiter de fautes multiples. / With the current advances achieved in the manufacturing process of integrated circuits, a series of reliability-threatening mechanisms have emerged or have become more prominent. For instance, physical defects originating from poorly lithographed wires, vias and other low-level devices are commonly seen in nanometric circuits. On the other hand, circuits have also become more sensitive to the strikes of highly energized particles. Both mechanisms, although essentially different, can cause multiple faults that contribute for lower reliabilities in integrated circuits. Multiple faults are more troubling than single faults since these are more severe and also because they can overcome fault tolerance techniques. Digital circuits are used in most electronic systems nowadays, but there is a specific context in which they are required to be reliable. Such context comprises high-dependability applications. This is the scenario in which this thesis is conceived. It’s goals are twofold : (a) to pro pose methods to assess the reliability of digital circuits, and (b) to propose techniques for reliability improvement. Concerning the first goal, several methods have been proposed in the literature and the text shows how these methods present limitations with respect to circuit size (number of gates), circuit type (sequential or combinational) and fault profile (single versus multiple faults). This thesis proposes two methods for reliability assessment. The first method is termed SPR+ and its targeted at the analysis of combinational logic only. SPR+ improves the average analysis accuracy by taking into account the effect of each fanout reconvergent node to the overall circuit reliability. Another method, termed SNaP, is also proposed in this thesis. It is a hybrid approach since it is partially based on simulation. SNaP can be used for combinational and sequential logic and can also be emulated in an FPGA device for faster analysis. Both SPR+ and SNaP can cope with multiple faults.

Les bactéries symbiotiques facultatives, transmises verticalement de mère à descendants, sont connues pour avoir des effets importants sur la reproduction de leurs hôtes (incompatibilité cytoplasmique et biais de sex-ratio), sur l’adaptation à des situations de stress (spécialisation, résistance aux pathogènes et aux fortes températures) ainsi que sur l’évolution de l’ADN mitochondrial par l’induction de balayages sélectifs. Bemisia tabaci est un complexe d’espèces divisé en nombreux biotypes, principalement différenciés sur la base de marqueurs moléculaires (essentiellement mitochondrial). Cet insecte héberge 7 symbiotes, 1 symbiote nutritionnel obligatoire et 6 symbiotes facultatifs. Nos résultats ont montré une extrême diversité ainsi qu’une prévalence exceptionnelle des bactéries symbiotiques chez B. tabaci. Leur dynamique rapide a entraîné de nombreux balayages sélectifs sur l’ADN mitochondrial influençant nettement son évolution. La très forte fréquence des infections multiples chez cet insecte peut certainement être expliquée par la co-localisation de l’ensemble des bactéries au sein des mêmes cellules, avec le symbiote nutritionnelle. Enfin, la coexistence de différents cytotypes en sympatrie offre l’opportunité d’étudier les interactions qui se mettent en place entre différentes communautés symbiotiques et comment ces systèmes vont évoluer / Facultative endosymbiotic bacteria that are vertically transmitted from mother to offsprings, have important effects on their host reproduction (cytoplasmic incompatibilities and sex-ratio biais), on host adaptation to situation of stress (specialization, resistance against pathogens or high temperature) and also on the evolution of mtDNA, by inducing selective sweeps. Bemisia tabaci is a species complex divided into numerous, mainly differentiated based on molecular markers (essentially mtDNA markers). This insect is infected by 7 bacterial symbionts, one nutritionnal symbiont that is obligatory and 6 facultative symbionts. Our results show an extreme diversity of symbionts in this insect and a very high prevalence in B. tabaci populations. Moreover their rapid dynamic has strongly influenced mtDNA evolution by inducing recurrent selective sweeps. The colocalization of the whole symbiotic community in the same cells, with the nutritional symbiont, might certainly explain the very high frequency of multiple infections in B. tabaci. Finally, coexistence of very different cytotypes in sympatry allows to study the interactions that take place between different symbiotic communities and how these systems will evolve

Si les drones militaires connaissent un développement important depuis une quinzaine d’année, suivi depuis quelques années par les drones civiles dont les usages ne font que se multiplier, en réalité les drones ont un siècle avec le premier vol d’un avion équipé d’un système de pilotage automatique sur une centaine de kilomètre en 1918. La question des règles d’usage des drones civiles sont en cours de développement malgré leur multiplication pour des usages allant de l’agriculture, à l’observation en passant par la livraison de colis. Ainsi, leur intégration dans l’espace aérien reste un enjeu important, ainsi que les standards de communication avec ces drones dans laquelle s’inscrit cette thèse. Cette thèse vise en effet à étudier et proposer des solutions pour les liens de communications des drones par satellite.L’intégration de ce lien de communication permet d’assurer la fiabilité des communications et particulièrement du lien de Commande et Contrôle partout dans le monde, en s’affranchissant des contraintes d’un réseau terrestre (comme les zones blanches). En raison de la rareté des ressources fréquentielles déjà allouées pour les futurs systèmes intégrant des drones, l’efficacité spectrale devient un paramètre important pour leur déploiement à grande échelle et le contexte spatiale demande l’utilisation d’un système de communication robuste aux non-linéarités. Les Modulations à Phase Continue permettent de répondre à ces problématiques. Cependant, ces dernières sont des modulations non-linéaire à mémoire entraînant une augmentation de la complexité des récepteurs. Du fait de la présence d’un canal multi-trajet (canal aéronautique par satellite), le principal objectif de cette thèse est de proposer des algorithmes d’égalisation (dans le domaine fréquentiel pour réduire leur complexité) et de synchronisation pour CPM adaptés à ce concept tout en essayant de proposer une complexité calculatoire raisonnable. Dans un premier temps, nous avons considéré uniquement des canaux sélectifs en fréquence et avons étudier les différents égaliseurs de la littérature. En étudiant leur similitudes et différences, nous avons pu développer un égaliseur dans le domaine fréquentiel qui proposant les mêmes performances a une complexité moindre. Nous proposons également des méthodes d’estimation canal et une méthode d’estimation conjointe du canal et de la fréquence porteuse. Dans un second temps nous avons montré comment étendre ces méthodes à des canaux sélectifs en temps et fréquence permettant ainsi de conserver une complexité calculatoire raisonnable.

Ce travail de recherche doctorale s’intéresse spécifiquement aux déchets granulaires minéraux issus de mâchefers d’incinération de déchets non dangereux (MIDND). Il vise à l’élaboration de sables de mâchefers mieux épurés que les MIDND classiquement produits en sortie d’usine ou d’installation dans une finalité de valorisation à plus forte valeur ajoutée dans une matrice cimentaire. Dans une première partie, une méthodologie de traitement pour l’élaboration de sables de mâchefers mieux épurés que ceux standards au sens enlèvement des métaux ferreux et non-ferreux est proposée. Cette méthodologie repose sur un broyage de la fraction 0-20 mm des MIDND par le procédé BHS. La fraction 0-4 mm majoritaire obtenue est traitée par des tambours magnétiques à pôles axiaux et par de séparateur à courants de Foucault NES4T de STEINERT. Dans une seconde partie, une caractérisation physique, chimique, minéralogique et environnementale des sables de mâchefers non traités et améliorés est effectuée. Dans une finalité de valorisation en matrice cimentaire, la troisième partie de la thèse s’est focalisée sur la fraction la plus problématique des MIDND, à savoir la fraction 0-2 mm. Les fractions granulaires 0-2 mm élaborées sont utilisées en substitution volumique partielle (50% et 75%) et totale (100%) d’un sable de référence normalisé dans la formulation de mortiers cimentaires. Une caractérisation physique, mécanique et environnementale des mortiers confectionnés est réalisée à différentes échéances de cure humide, jusqu’à 180 jours. Les résistances mécaniques des mortiers à base de mâchefers sont encourageantes et prometteuses. Enfin, une caractérisation des pâtes de ciment incorporant des sables de mâchefers est effectuée par la technique d’indentation instrumentée à travers la détermination du module élastique et la dureté. / This doctoral study focuses on granular mineral wastes from municipal solid waste incineration (MSWI) bottom ash. This research is aiming to elaborate upgraded mineral sands fractions in comparison to standard MSWI bottom ash thanks to its beneficial use in cementitious materials. In the first step, a new methodology is proposed for dry separation of MSWI bottom ash in order to better recover ferrous and non-ferrous metals from the sands fractions and obtain an improved mineral sand fraction at the same time. This proposed methodology is composed of grinding of 0-20 mm input bottom ash fraction through BHS crushers. Subsequently, the main sand fraction (0-4 mm) is processed through magnetic drums and the innovative non-ferrous metal separator NES 4T of STEINERT process. In the second step, physical, chemical, mineralogical and environmental characterizations have been performed on untreated and treated sands fractions. The third step of this research focuses on beneficial use of the 0-2 mm granular fraction in cementitious materials, that is considered most problematic of MSWI bottom ash fractions. The standardized reference sand is replaced in volume for the partial substitution (50% and 75%) and total substitution (100%) by 0-2 mm upgraded mineral fractions in the mortar preparation. Physical, mechanical and environmental characterization have been performed on cement mortar up to 180 days of moist curing. Compressive strengths of mortar containing upgraded bottom ash are promising. Finally, a mechanical characterization on hardened cement paste has been performed as well on mortar containing upgraded bottom ash fractions through indentation technique in order to determine the modulus of elasticity and hardness.

Dans ces travaux de thèse, nous avons étudié les propriétés dynamiques et spectrales d’une diode laser puissante à 980 nm qui est soumise à un retour optique provenant d’un réseau de Bragg fibré (FBG). Dans cette configuration, le FBG est un élément clé de la thèse d’une part il permet de former une cavité externe par réflexion comme un miroir et d’autre part il est un filtre qui fournit un retour optique sélectif en fréquence (FOF : Filtered Optical Feedback) aux alentours de 980 nm. Nous nous sommes intéressé à étudier cette configuration FOF dans le cadre d’un projet de collaboration entre la société 3S Photonics Group et le Laboratoire de Physique des Lasers. Il s’agit plus particulièrement d’étudier expérimentalement les séries temporelles par un oscilloscope, les spectres RF par un analyseur de spectre RF et les spectres optiques par un analyseur de spectre optique et par un interféromètre Fabry-Perot, afin d’observer, identifier et comprendre ses comportements dynamiques, notamment fluctuations basses fréquences (LFF). Ce système laser FOF est très peu étudié et ces travaux de thèse permettront de nouvelles connaissances techniques ou scientifiques dans un domaine d’application relativement récent, notamment pour l’application dans les systèmes EDFA (Erbium Doped Fiber Amplifier). / In this thesis, we have studied spectrums and the dynamics properties of a high-powerlaser diode emitting at 980 subject to optical feedback via a fibre Bragg grating (FBG). In such a configuration, FBG is a key element of this work because it establishes an ex-ternal cavity with a reflection like a mirror on one hand and it is a filter which provides frequency selective optical feedback (FOF : Filtered Optical Feedback) at around 980 nm on the other hand. We are interested in investigating this FOF configuration for a project in a collaboration between 3S Photonics Group and the Laboratoire de Physique des Lasers.In order to observe, identify and understand its dynamical behaviours, especially low frequency fluctuations (LFF), the experimental studies have been undertaken particularly with time series from an oscilloscope, RF spectra from an RF spectrum analyser and optical spectra from an optical spectrum analyser and Fabry-Perot interferometer. Onlyfew studies have been done with this FOF laser system and our thesis work may allow new technical and scientific understanding for recent application, particularly application to Erbium-doped fibre amplifier.

Des copolymères à blocs de type ABA à gradient de composition, s'auto-assemblent en micelles sphériques, dans un solvant apolaire sélectif pour les blocs latéraux. Ces solutions micellaires constituent un très bon exemple de la formation de phases vitreuses dans les suspensions colloïdales, en présence d'interactions attractives. Les structures et les dynamiques à l'équilibre et sous cisaillement sont étudiées par diffusion des rayons X, rhéologie et diffusion de la lumière. A faible concentration, les solutions se comportent comme des suspensions de sphères dures et les variations de la viscosité newtonienne, en fonction de la température et de la concentration, peuvent être décrites par une courbe universelle. A des concentrations plus élevées, des forces attractives à courte portée apparaissent qui affectent la formation du verre et sont responsables de l'existence d'un régime viscoélastique. Cette phase a de nombreux points communs avec un gel faible mais peut solidifier lorsqu'un cisaillement supérieur à une valeur critique est appliqué. Cette gélification sous cisaillement de solutions micellaires attractives est différente du rhéo-épaississement qui se produit dans les suspensions colloïdales conventionnelles et dans les « shake-gels ». Les verres qui se forment aux concentrations plus élevées peuvent être de nature attractive ou répulsive en fonction de la force des interactions attractives à courte portée, qui peut être modifiée en variant la température. Les verres répulsifs présentent les dynamiques lentes et les phénomènes de vieillissement qui sont associés aux dynamiques vitreuses classiques.

Si les pouvoirs publics ont en charge la gestion des déchets ménagers, la réussite de la politique de revalorisation repose sur l'adoption par chacun des pratiques domestiques adaptées. L'enjeu pour les institutions concernées est alors que le plus grand nombre participe au dispositif de tri mis en place. Pour ce, les collectivités territoriales multiplient les communications à destination de leurs administrés. Ces opérations d'information et de sensibilisation revêtent le plus souvent la forme d'une éducation au geste juste, ne favorisant pas la responsabilisation du citoyen. Par ailleurs, elles sont de forme persuasive et reposent sur l'hypothèse d'un homme rationnel qui agirait en fonction de ses idées, savoirs et croyances. Les liens entre attitudes et comportements sont aussi complexes que discutés ; de nombreuses études et arguments plaident en faveur d'un homme rationalisant. La psychologie de l'engagement s'inscrit dans ce paradigme et préconise la réalisation « libre » d'un comportement comme le meilleur prédicteur des comportements et attitudes futurs. Autrement dit, elle préconise l'obtention d'un acte préparatoire dans l'objectif d'obtenir de l'individu qu'il réalise à la suite le comportement attendu. Nous expérimenterons ici différentes techniques d'influence issues de ce paradigme. Des observations réalisées en marge de ces expériences nous conduiront à reconsidérer le modèle d'une influence unilatérale proposé par cette théorie. Aussi, en appréhendant les phénomènes d'influence dans leur complexité, nous développerons des modalités de communication participative au sein desquelles le sujet sera appelé à devenir acteur et l'administré à devenir citoyen

Les phénotypes complexes observés dans les populations humaines contemporaines sont déterminés par la génétique, ainsi que par des facteurs environnementaux. Par exemple, la nutrition et les modes de vie jouent un rôle important dans le développement de maladies multifactorielles, comme l'obésité ou le diabète. L'adaptation sur de tels traits phénotypiques complexes survient généralement sous la forme de modification des fréquences alléliques à de multiple locus, un phénomène nommé sélection polygénique. Les avancées récentes des méthodes statistiques, ainsi que l'émergence des données issues du séquençage haut-débit permettent dorénavant la détection de ces signaux. Ici, nous visons à comprendre à quel point des changements environnementaux peuvent entraîner des modifications dans les pressions sélectives, ainsi que leurs impacts sur la sensibilité aux maladies. Dans ce but, nous proposons une analyse d'enrichissement en groupes de gènes (GSEA, Gene Set Enrichment Analysis) en utilisant des données de scores de sélection sur du polymorphisme nucléotidique (SNP, Single Nucleotide Polymorphism), pour quantifier la pression de sélection sur ces SNP (qui pourrait issus par exemple de méthodes de scan génomique). D'abord, nous effectuons une analyse de sensibilité des méthodes de scan génomique pour examiner leur exactitude. Nous utilisons une analyse par simulation pour étudier leurs performances sous un large éventail de scénarios démographiques complexes et des hypothèses de balayage sélectif fort (hard sweep) ou faible (soft sweep). Ensuite, nous développons SEL-GSEA, un outil utilisant des données de SNP pour identifier des voies biochimiques enrichies en pressions sélectives. Enfin, dans l'optique d'examiner les effets de potentiels changements environnementaux qui pourraient représenter des changements dans les pressions sélectives, nous utilisons SEL-GSEA et Gowinda (un outil disponible en ligne) lors d'une étude population-centrée. Nous analysons trois différentes populations (africains, européens et asiatiques) de la base de données HapMap. Pour obtenir les scores de sélection des SNP qui servent de base à SEL-GSEA, nous utilisons une combinaison de deux méthodes (iHS et XP-CLR) qui sont les plus performantes dans notre analyse de sensibilité. Les résultats de notre analyse montrent une forte pression de sélection sur les voies biochimiques liées à l'immunité, principalement en Afrique, ainsi que sur la glycolyse et la néoglucogenèse en Europe, qui sont des voies liées au métabolisme et au diabète. / The complex phenotypes observed nowadays in human populations are determined by genetic as well as environmental factors. For example, nutrition and lifestyle play important roles in the development of multifactorial diseases such as obesity and diabetes. Adaptation on such complex phenotypic traits may occur via allele frequency shifts at multiple loci, a phenomenon known as polygenic selection. Recent advances in statistical approaches and the emergence of high throughput Next Generation Sequencing data has enabled the detection of such signals. Here we aim to understand the extent to which environmental changes lead to shifts in selective pressures as well as the impact of those on disease susceptibility. To achieve that, we propose a gene set enrichment analysis using SNP selection scores that are simply scores that quantify the selection pressure on SNPs and they could be derived from genome-scan methods. Initially we carry out a sensitivity analysis to investigate which of the recent genome-scan methods identify accurately the selected region. A simulation approach was used to assess their performance under a wide range of complex demographic structures under both hard and soft selective sweeps. Then, we develop SEL-GSEA, a tool to identify pathways enriched for evolutionary pressures, which is based on SNP data. Finally, to examine the effect of potential environmental changes that could represent changes in selection pressures, we apply SEL-GSEA as well as Gowinda, an available online tool, on a population-based study. We analyzed three populations (Africans, Europeans and Asians) from the HapMap database. To acquire the SNP selection scores that are the basis for SEL-GSEA, we used a combination of two genome scan methods (iHS and XPCLR) that performed the best in our sensitivity analysis. The results of our analysis show extensive selection pressures on immune related pathways mainly in Africa population as well as on the glycolysis and gluconeogenesis pathway in Europeans, which is related to metabolism and diabetes.

La conception et le développement de biocapteurs pour la détection directe de biomarqueurs dans un échantillon de fluide biologique constituent un véritable défi dans la recherche pour leur application dans le système de point de soins en diagnostic. Mon projet est axé sur l'élaboration d'une nouvelle plateforme de décomposition biologique composée de graphène qui présente une surface électroactive et spécifique élevée permettant de greffer de nombreux biomolécules avec des métalloporphyrines en tant que nouveau marqueur redox pour suivre le processus de reconnaissance biologique obtenu dans le cas d'un capteur d'ADN. Le concept sera de démontrer que les métalloporphyrines où le potentiel d'oxydo-réduction pourrait être contrôlé par la nature des ions métalliques pourraient être appliquées dans une plate-forme de biocapteurs électrochimique multidétection. L'association de la métalloporphyrine avec le graphène offrira de nombreux avantages, comme la promotion de la réaction de transfert d'électrons et ayant une grande surface pour l'immobilisation des protéines. La détection de la cible présente sera réalisée suite à l'activité redox des métalloporphyrines greffées à la surface. Nous avons déjà synthétisé différentes métalloporphyrines modifiées et caractérisées par des techniques habituelles de spectrométrie telles que la RMN, les UV et la MS. Le biocapteur d'ADN a été construit par le composite de graphène et métalloporphyrine et sonde d'ADN comme biorécepteur suivant l'approche d'attachement covalent et l'optimisation de la construction de biocapteur pour améliorer la stabilité et la reproductibilité. Et nous avons déjà fait une détection de l'ADN cible par diverses méthodes électrochimiques, y compris la voltamétrie cyclique, la voltampérométrie à onde carrée et la spectroscopie d'impédance. Cette stratégie a été réalisée d'abord avec la porphyrine Mn insérée puis généralisée à divers complexes métalliques pour une approche multidétection. Parallèlement, les nanomatériaux hybrides combinant les caractéristiques du graphène (haute conductivité et grande surface spécifique) et des porphyrines (propriétés physiques et chimiques et capacité de transfert d'électrons), tels que la tétraphénylporphyrine portant un et quatre groupes carboxyliques nommés H₂TPP-nCP (n = 1, 4) et la tétraphénylporphyrine incorporant du manganèse (III) (MnTPP-1CP) ont été synthétisés avec succès. L'interaction entre H₂TPP-nCP (n = 1, 4) et l'oxyde de graphène chimiquement réduit (CRGO) a été étudiée dans mon travail de thèse. Pour étudier les propriétés caractéristiques des nanomatériaux préparés, la microscopie électronique à balayage (MEB), la microscopie à force atomique (AFM), les spectres UV-visible, les spectres infrarouges à transformée de Fourier (FT-IR) et les spectres de photoélectrons X. Afin d'éliminer l'absorption non spécifique, la modification de l'électrode par le PEA a également été appliquée et obtenir une excellente application pour la détection de la cible d'ADN. / The design and development of biosensors for direct detection of biomarkers in biological fluid sample is real challenge in research for their application in point of care system in diagnostic. My project is focus on the elaboration of a new platform for biological detaction composed of graphene which exhibits a high electroactive and specific surface suitable for grafting numerous biomoleculer with metalloporphyrins as a novel redox marker for following biological recognition process obtained in the case of DNA sensor. The concept will be to demonstrate that the metaloporphyrines where there redox potential could be controlled by the nature of metal ions could be applied in multidetection electrochemical biosensor platform. The association of metalloporphyrin with graphene will offer numerous advantages, as promoting electron transfer reaction and having a large surface for protein immobilization. The detection of target present will be performed following redox activity of the metalloporphyrins grafted on the surface. We have already synthesized various modified metalloporphyrins and characterizatized by usual spectrometry techniques such as NMR, UV and MS. The DNA biosensor has been constructed by the composite of graphene and metalloporphyrin and DNA probe as bioreceptor following covalent attachment approach and optimization of the biosensor construction for improving stability and reproducibility. And we have already done some detection of DNA Target by various electrochemical methods including cyclic voltammetry, square wave voltammetry and impedance spectroscopy. This strategy was performed firstly with on Mn inserted porphyrin and then generalized to various metal complex for multidetection approach. Meanwhile, the hybrid nanomaterials which combined the features of both graphene (high conductivity and large specific surface area) and porphyrins (physical and chemical properties and electron transfer ability), such as tetraphenylporphyrin bearing one and four carboxylic group named H₂TPP-nCP(n=1, 4) and tetraphenylporphyrin incorporating manganese (III) (MnTPP-1CP) were successfully synthesized. The interaction modes between H₂TPP-nCP(n=1, 4) and chemically reduced graphene oxide (CRGO) was studied in my thesis work. To investigate the characteristic properties of as-prepared nanomaterials, scanning electron microscopy (SEM), atomic force microscopy (AFM), UV-visible spectra, Fourier Transform infrared spectra (FT-IR), X-ray photoelectron spectra (XPS). In order to eliminate the non-specific absorption, the modification of the electrode by monolayer PEA was also applied and obtain excellent application for the detection of DNA target.

Brettanomyces bruxellensis est un microorganisme qui est considéré comme la cause majeure des défauts microbiologiques du vin. L’importance de cette levure à l’échelle industrielle est liée au fait qu’elle est isolée à partir de substrats différents tels que la bière, le kombucha, les molasses utilisées pour la production de bioéthanol et autres. Ce projet a pour objectif d’étudier la diversité génétique de l’espèce en se basant sur une large population d’isolats provenant de niches écologiques et géographiques variées. Pour ce faire, une méthode de génotypage robuste (analyse microsatellite) a été optimisée et appliquée sur la population, mettant en évidence la coexistence de populations diploïdes et triploïdes à l’échelle globale. Puis, la relation entre regroupement génétique et traits physiologiques a été explorée. Notamment, l'étude de la tolérance aux sulfites a été effectuée sur un sous-ensemble de souches représentatif de la population. Les résultats obtenus mettent en évidence un lien entre groupes génétiques et comportement vis-à-vis des sulfites. Des expériences de compétition en présence de dioxyde de soufre montrent un avantage sélectif des souches tolérantes aux sulfites par rapport aux souches sensibles, suggérant ainsi une adaptation spécifique au principal antiseptique utilisé en œnologie. Ce travail contribue à une meilleure connaissance de cette levure d’altération du vin en termes de diversité génétique et phénotypique et permet d’émettre des hypothèses sur les stratégies évolutives d'adaptation au milieu anthropique de cette espèce modèle non conventionnelle. / Brettanomyces bruxellensis is a microorganism described as the first cause of microbial spoilage of wine. Its industrial relevance is highlighted by the fact that this yeast is isolated from different substrates such as beer, kombucha, bioethanol fermentation molasses and others. This project aims to explore the genetic diversity of the species by studying a large population of isolates from various geographical and ecological niches. For this purpose, a robust genotyping method (microsatellite analysis) was optimized and applied on the population, thus highlighting the coexistence of diploid and triploid populations worldwide. Further, the relation between genotypic clustering and physiological traits was studied. Namely, sulphite tolerance assay was performed on a subset of strains representative of the total population. The results reveal a link between genetic group and growth profile in the presence of sulphur dioxide. Competition experiments in presence of sulphites highlight a selective advantage of sulphite tolerant strains compared to sulphite sensitive ones, thus suggesting a specific adaptation to the main antimicrobial used in winemaking. This work contributes to a deeper understanding of this wine spoilage microorganism in means of genetic and phenotypic diversity and sheds light on putative evolutionary strategies for adaptation to human related environment of this non-conventional model yeast species.