Seasonality influences life history through its effect on the availability of essential resources, with birds timing breeding to occur during peak food availability. Due to density-dependence, investment in breeding is determined largely by the seasonality of food availability, with an increased investment being traded-off against adult survival. A bird's mass acts as an index of a species' foraging environment, because a bird bases its foraging decisions on a trade-off between the risk of predation and the risk of starvation. Under constant predation risk a bird increases its mass as insurance against increased foraging unpredictability. In tropical savannahs day length and temperature remains relatively constant, and there is not a season of increased density-dependent mortality which acts across all species. Thus species have evolved a broad range of life history traits under the same environmental conditions, although how a species experiences seasonality depends largely on its foraging niche. This thesis shows that most savannah species varied their mass across the year, having a reduced mass in the non-breeding season which suggests that foraging remained predictable. Independent of gonad or egg growth they then increased their mass as they started to breed, with the timing of breeding coinciding with peak food availability. Across species in the same foraging niche mass acts as an index of breeding investment, with females increasing their mass more than males. While across species in different foraging niches an increased mass response was associated with higher adult survival, probably because breeding strategy and subsequently adult survival are governed by food limitation. This thesis shows that birds adaptively manage their mass during breeding and that mass is not a result of energetic stress, thus under constant predation risk a bird's mass is a result of foraging predictability as a function of competition for available food and investment in breeding.

O nordeste paulista é composto por um mosaico de ambientes fortemente antropizado, com predominância de plantios de cana-de-açúcar, além de florestas plantadas de eucalipto e fragmentos de Cerrado. Embora o veado-catingueiro (Mazama gouazoubira) seja uma espécie amplamente distribuída em diferentes biomas do Brasil, pouco é conhecido sobre a sua capacidade de adaptação em paisagens alteradas. Neste contexto, modelos de ocupação da paisagem e dados de armadilhas fotográficas foram utilizados para verificar quais fatores ambientais são importantes na escolha do uso e seleção de hábitat pelo veado-catingueiro. Foram amostradas quatro áreas em três cenas de paisagens, entre os meses de Abril e Setembro de 2013 e 2014, totalizando um esforço amostral de 6240 armadilhas/dia. Os resultados apontam que o veado-catingueiro está amplamente distribuído nos remanescentes de Cerrado do nordeste do estado de São Paulo, além de ocupar com a mesma intensidade tanto o interior como o entorno de unidades de conservação. Foi observado um efeito positivo dos plantios de silvicultura na ocupação da paisagem pela espécie. A distribuição temporal dos registros ao longo do ciclo de 24 horas também foi semelhante dentro e fora de unidades de conservação. Estes resultados sugerem que o veado-catingueiro é uma espécie ecologicamente plástica e que está se beneficiando da heterogeneidade ambiental presente no nordeste paulista. Estes hábitos generalistas lhe atribuem vantagens em comparação a outras espécies mais especialistas nesse cenário. / The northeast of São Paulo state is a region where Cerrado remants are immersed in a landscape with high human influence mediated by vast sugarcane and Eucalyptus plantations. Mammals survival in this landscape has been little explored. Brown brocket deer (Mazama gouazoubira, Fischer 1814) is a species with widespread distribution in different biomes of Brazil, however little is known about its capacity of adaptation in landscapes with intensive agriculture. We conducted a study based on occupancy modelling from camera trapping data in order to evaluate which environmental factors are important to habitat selection by brown brocket deer. The study was carried out in three agricultural landscapes at four study areas between April and September (2013 and 2014) with a total effort of 6240 traps-day. Our results show that brown brocket deer are well adapted to Cerrado/agricultural matrix in the state of Sao Paulo, showing high ecological flexibility. This deer used non-protected areas as much as protected areas. Silviculture represented the only landscape covariate with high relative importance for brown brocket deer. Also, brown brocket deer shows rhythm of activity similar in and out protected areas. Our results suggest that brown brocket deer is extremely plastic species that is benefiting from environmental heterogeneity present in São Paulo\'s northeast. The generalist habit of this deer gives it advantage when compared to other more specialist species in this scenario.

Made available in DSpace on 2016-08-10T10:44:27Z (GMT). No. of bitstreams: 1 RUY CHAVES BOZZA JUNIOR.pdf: 2029295 bytes, checksum: 0404373bf719fe40153a9c9cbea62744 (MD5) Previous issue date: 2010-01-30 / This study was accomplished in six urban parks (Flamboyant, Areião, Bosque dos Buritis, Mutirama, Botafogo and Vaca Brava) of Goiânia city, Goiás State. Two questions intend to be answered: i) are the Meliponini community similar in the parks urban sampled? ii) which among the considered environmental variables (two physiochemical: air temperature, air relative humidity of the air; two related to the beehives: type of used substrate and location in the arboreal stratum) influence the Meliponini assemblages? Two samplings were accomplished in each park being one in the low waters period (August 2008) and other in the high waters (November 2008). In each park, they were delimited ten transects of 100x20m, where the visual location of beehives was accomplished, collected the biological material and measured the environmental variables. It was collected 11 species of Meliponini. The most abundant species were Nannotrigona testaceicornis (24% of total abundance), Tetragonisca angustula (21%) and Scaptotrigona postica (19%). The Bosque dos Buritis Park displayed elevated richness values (9) and specific number of species (NEE = 2.4), whereas the Areião and Vaca Brava parks presented the lowest richness and NEE values (1.9 and 1.6, respectively). The analysis of Morisita-Horn indicates that the Meliponini community of the Areião Park are similar to these of the other parks sampled, except Mutirama Park. The result of the co-inertia analysis performed considering the Meliponini community and the substrate was significant (p = 0.007; 99.04% of the total inertia explained). The substrate preferred by Meliponini for the construction of beehives is trees of the Leguminosae and Apocynaceae family. Preference is observed by hollow spaces of trees, as well as for heights < 5 m for internal beehives and between 15 to 20 m for external ones. The natural conditions allied to anthropogenic activities seem to influence the composition and structure of Meliponini community. / Este estudo foi realizado em seis parques urbanos (Flamboyant, Areião, Bosque dos Buritis, Mutirama, Botafogo e Vaca Brava) da cidade de Goiânia, Estado de Goiás. Duas perguntas pretendem ser respondidas: i) as comunidades de Meliponini são semelhantes nos parques urbanos amostrados? ii) quais entre as variáveis ambientais consideradas (duas físico-químicas: temperatura do ar, umidade relativa do ar; duas relacionadas às colméias: tipo de substrato usado e localização no estrato arbóreo) influenciam as comunidades de Meliponini? Duas amostragens foram realizadas em cada parque sendo uma no período da seca (agosto 2008) e outra na chuva (novembro 2008). Em cada parque foram delimitados dez transectos de 100x20m, onde foi realizada a localização visual de colméias, coletado o material biológico e medida as variáveis ambientais. Foram coletadas 11 espécies de Meliponini. As espécies mais abundantes foram Nannotrigona testaceicornis (24% de abundância total), Tetragonisca angustula (21%) e Scaptotrigona postica (19%). O Parque Bosque dos Buritis exibiu valores elevados de riqueza (9) e número efetivo de espécies (NEE = 2,4), enquanto que os parques Areião e Vaca Brava apresentaram os mais baixos valores de riqueza e NEE (1,9 e 1,6, respectivamente). A análise de Morisita-Horn indica que as comunidades de Meliponini do parque Areião são semelhantes aos outros parques amostrados, exceto o parque Mutirama. O resultado da análise de co-inercia executado, considerando a comunidade de Meliponini e o substrato, foi significativo (p = 0.007, explicaram 99,04% da inércia total). O substrato preferido por Meliponini para a construção de colméias são árvores da família Leguminosae e Apocynaceae. Preferência é observada por ocos em árvores, como também para alturas entre 0 a 5 m para colméias internas e 15 a 20 m para externas. As condições naturais aliadas a atividades antrópicas parecem influenciar a composição e estrutura das comunidades de Meliponini.

Made available in DSpace on 2016-08-10T10:49:47Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Jesse Goncalves Cutrim.pdf: 2774161 bytes, checksum: c360b9a9826d2517b584fa34250e4579 (MD5) Previous issue date: 2011-03-18 / This study examines in a broader perspective, the territorial changes produced in the Amazonico Maranhense Savannah . These are strongly related to the expansion fronts and development of the agricultural frontier in evidence. From the years 1980 accelerate the process of implementation of large agricultural projects and development in the region, which is part of the legal Amazon, in an area geographically related to the savannah, the area of the plateau and the forest. Hence the name "Amazonico Maranhense Savannah." The way some of these appropriations of Maranhense Savannah in the legal Amazon territory in large scale involves conflicts and contradictions within the sustainable territorial development. In the last three decades came to this region large agribusiness conglomerates of South-Central. It changed its territory, causing in the passage of a rural complex for agro-industrial complex. The region of "Amazonico Maranhense Savannah" established itself as agriculture frontier area and territorial development in the light of implementation of public policies and institutional logistical contributions. As well, favorable natural conditions, fertile land and abundant water, for example. Large projects and agribusiness contributed to highlight the effects of development about society and nature, contributing to increasing population densities and the region's economic dynamism. Therefore, this study examines more strictly the socioeconomic and environmental relationship of sugarcane industry in the city of Campestre of Maranhão. / O presente estudo analisa numa perspectiva mais ampla, as transformações territoriais produzidas no cerrado amazônico maranhense . Estas estão intensamente relacionadas às frentes de expansão e a concepção de fronteira agrícola em evidência. A partir dos anos 1980 se acelera o processo de implantação dos grandes projetos agropecuários e de desenvolvimento na região, que é parte integrante da Amazônia Legal, numa área geograficamente relacionada com o cerrado, a zona da chapada e a floresta. Daí a denominação cerrado amazônico maranhense . O modo como algumas dessas apropriações do cerrado maranhense em território da Amazônia Legal em larga escala implica em conflitos e contradições no âmbito do desenvolvimento territorial sustentável. Nas últimas três décadas vieram para essa região grandes conglomerados agroindustriais do Centro-Sul. Isso modificou o seu território, saindo da condição de complexo rural para um complexo agroindustrial. A região do cerrado amazônico maranhense consolidou-se como área de fronteira agrícola e de desenvolvimento territorial em função da implantação de políticas públicas e de aportes logísticos institucionais. Bem como, condições naturais favoráveis, terras férteis e água em abundância, por exemplo. Os grandes projetos e as agroindústrias contribuíram para dar visibilidade aos efeitos do desenvolvimento sobre a sociedade e a natureza, concorrendo para o aumento da densidade demográfica e para o dinamismo econômico da região. Portanto, esta pesquisa analisa de maneira mais estrita a relação socioeconômica e ambiental da agroindústria canavieira no município de Campestre-MA.

Os índices de seleção são combinações lineares de valores fenotípicos, resultando numa medida que concentra em único valor, os atributos positivos e negativos de cada genótipo para vários caracteres. Por necessitarem das estimativas das variâncias e covariâncias genotípicas e fenotípicas dos caracteres, esses índices são mais indicados para programas de seleção recorrente. Contudo, existem também outros tipos de índices não lineares, conhecidos como não paramétricos que, por não precisarem das estimativas dos parâmetros genéticos, podem ser utilizados na seleção de cultivares em fase final dos programas de melhoramento. Para essa situação, uma alternativa bastante promissora é o emprego do índice de seleção de cultivares proposto por Garcia (1998) que é uma medida de distância genética entre cada genótipo a um ideótipo. Esta técnica permite a aplicação de teste de comparação de médias e a identificação de genótipos com desempenhos abaixo dos critérios mínimos definidos pelo melhorista. Este trabalho teve como objetivos avaliar a viabilidade do índice proposto por Garcia (1998) na identificação de genótipos superiores de algodão, estimar os parâmetros de estabilidade do índice e verificar quanto da variação fenotípica do índice é de natureza genotípica. Foram utilizados quinze genótipos de algodoeiro do Ensaio Estadual de Algodoeiro Herbáceo (2000/01) avaliados em 27 locais sob o delineamento de blocos ao caso com quatro repetições. Os caracteres avaliados foram produtividade de algodão em caroço (kg/ha), altura de planta (cm), peso de um capulho (g), porcentagem de fibra (%), resistência da fibra (gf/tex), comprimento da fibra (mm), finura da fibra (IM), ramulose (notas) e bacteriose (notas) Os resultados obtidos evidenciaram que o índice proposto por Garcia (1998) identificou com eficiência as cultivares superiores com destaque para BRS AROEIRA, CNPA 97- 4565 e DELTA OPAL. As cultivares mais estáveis foram: CNPA CO 99-01, BRS IPÊ e BRS JATOBÁ, para o índice de seleção e BRS AROEIRA, BRS IPÊ e CNPA 99-01, para a produtividade. Os índices de seleção apresentaram médio e alto coeficiente de determinação genotípica, indicando que é possível antever o sucesso com a seleção utilizando as estimativas do índice proposto por Garcia (1998). Neste aspecto, recomenda-se complementar o emprego do índice de seleção com informações sobre a estabilidade e adaptabilidade das cultivares selecionadas sob condições favoráveis e desfavoráveis. / Selection indices are linear combinations of phenotypic values, which combine in one unique value the positive and negative attributes of each genotype for the characters evaluated. Because these indices need estimates of genetic and phenotypic variances and covariances, their use is best suited in recurrent selection programs. However, other types of non-linear indices also exist, and are known as non-parametric indices; these can be used in selection of cultivars at the final stage of breeding programs, since genetic parameter estimates are not a requirement. In this situation, the selection index developed by Garcia (1998) is a promising alternative. This index is an estimate of the genetic distance from each genotype to an "ideotype". This technique allows the comparison of means and the identification of genotypes with performances that meet the minimum requirements chosen by the breeder. The present work had the following objectives: to evaluate the viability of the Garcia index for the identification of superior genotypes, to estimate the stability parameters of the index and verify how much of the phenotypic variation is genotypic. Fifteen genotypes of the Upland cotton Variety Trials (Ensaio Estadual de Algodoeiro Herbáceo) - 2000/01 were evaluated in 27 locations in randomized complete block design with four replications. Characters assessed were: seed cotton yield (kg/ha), plant height (cm), boll mass (g), lint percentage (%), fiber strength (gf/tex), fiber length (mm), lint micronaire (IM), ramulosis (scores) and bacterial blight (scores). The data showed that the Garcia index identified superior cultivars successfully, as BRS AROEIRA, CNPA 97-4565 and DELTA OPAL. The most stable cultivars were: CNPA CO 99-01, BRS IPÊ and BRS JATOBÁ for selection index and BRS AROEIRA, BRS IPÊ e CNPA 99-01 for yield. The selection indices showed medium and high coefficient of genotypic determination indicating that is possible to expect selection success when the Garcia index is used. We suggest to complementing the use of the selection index with informations about stability and adaptability of the selected cultivars at favorable and unfavorable environments.

O interesse em valorizar os serviços ecossistêmicos fornecidos pela vegetação natural aumentou em um esforço para mitigar os efeitos da mudança do uso da terra. Nesta linha de pensamento, desenvolvemos um índice para valorar as comunidades de árvores - do ponto de vista antropocêntrico - da savana brasileira (Cerrado). O índice e a cartografia produzida servirão como ferramenta para a priorização da conservação, bem como para revelar como a colonização e a expansão da agricultura tem ocorrido. Para desenvolver o índice, foram produzidas novas camadas ambientais com resolução de 90m; A distribuição das 93 espécies mais comuns foi modelada; e a cartografia da distribuição de cada uso humano das árvores (alimentos, aromáticos, fibras, cosméticos, cortiça, etc., totalizando 20 usos) e um índice de valor total fo desenvolvido. O novo índice de valor, nomenado a Soma de Usos (SoU, Sum of Uses), representa o número esperado de usos para a montagem de espécies potenciais que poderia estar ocorrendo no lugar em condições ideais. O impacto da agricultura foi avaliado pela contabilização da área que foi convertida em lavouras. Nossos resultados indicam fortemente que a colonização humana e a expansão de terras cultivadas eliminaram as árvores de áreas que antes eram melhores prestadores de serviços ambientais. Por outro lado, observamos também que as áreas protegidas no Cerrado estão localizadas onde esperamos encontrar valor marginal para as espécies ótimas. Esses resultados nos levam a pensar que a estratégia de conservação pode estar longe de ser ideal para o maior remanescente arável do mundo. / The interest in valuing the ecosystem services provided by the natural vegetation has increased in an effort to mitigate the effects of land use change. In this line of thinking, we developed an index to value the tree communities -from an anthropocentric point of view- of the Brazilian savannah (Cerrado). The index and the cartography produced will serve as a tool for prioritization of conservation, has well as to unveil how colonization and agriculture expansion has taken place. In order to develop the index: new environmental layers at 90m resolution were produced; the most common 93 species’ distribution was modelled; and cartography for each use humans derive from the trees (food, aromatic, fiber, cosmetic, cork, etc., totaling 20 uses) and a total value index were developed. The new index of value, namely the Sum of Uses (SoU), represent the expected number of uses for the potential species assemblage that could be taking place under optimal conditions. The impact of agriculture was assessed by accounting for the area that has been converted to croplands. Our results strongly indicate that human settlement and cropland expansion have cleared the trees of areas that once were better than average ecosystem service providers. On the other hand, we also observe that protected areas in the Cerrado are located where we expect to find marginal value for the optimal communities. These results lead us to think that the conservation strategy might be far from optimal for the largest remaining arable patch in the world.

Existem vários métodos empregados em estudos fitossociológicos e muitos trabalhos já se propuseram a avaliar o desempenho desses métodos. O primeiro e mais utilizado é o método de parcelas, que sempre é referido nos trabalhos como o melhor e por isso definido como base para comparação com os demais. Por esse motivo, nunca foi avaliado isoladamente. Com o presente trabalho tem-se a oportunidade de avaliar o próprio método de parcelas, comparando seus resultados com os valores paramétricos, uma vez que foi feito um censo da área amostrada e a população estatística é conhecida sem erro amostral. Os dados são de uma parcela permanente instalada em uma área de cerradão (Estação Ecológica de Assis, SP). A parcela possui 10,24 ha e todos seus indivíduos com CAP &#8805; 15 cm foram marcados, georreferenciados, medidos e identificados. Foi feita uma tabela de fitossociologia para a parcela que, por se tratar de um censo, representa os valores paramétricos. Foram geradas simulações de levantamentos fitossociológicos por amostragens sistemáticas para quatro tamanhos de parcela quadrada, sendo 10 x 10 m, 20 x 20 m, 50 x 50 m e 100 x 100 m, todas com área total amostrada de 1 ha. Para a parcela de 10 x 10 m foram simuladas mais três intensidades amostrais: 75, 50 e 25 parcelas. Para cada situação de amostragem foram simuladas 1.000 amostras e para cada uma dessas amostras foi elaborada uma tabela de fitossociologia. Foi avaliado o viés das etimativas de densidade e dominância, e a alteração da posição das espécies na tabela de fitossociologia. Foi avaliada também a influência da distribuição espacial das espécies nas etimativas. Por fim, foram feitas algumas análises de atributos de comunidade que são viáveis à partir de levantamentos fitossociológicos, como densidade, área basal, curva de acumulação de espécies, número de espécies amostradas e proporção de espécies e indivíduos por classe de densidade. O método de parcelas de 10 x 10 m foi o que apresentou menor viés para as estimativas, e também menor variação na posição das espécies na tabela de fitossociologia, mas mesmo assim há um alto viés para espécies de baixa densidade e uma grande alteração na posição das espécies na tabela de fitossociologia. Com relação à distribuição espacial, espécies com densidades intermediárias têm suas estimativas mais influenciadas pela distribuição espacial do que aquelas com baixa densidade - que sempre apresentarão viés - e aquelas com alta densidade - que não apresentam viés devido ao alto número de invivíduos na amostra. As análises de tributos de comunidade mostraram que esses atributos podem ser bem estimados, levando-se em consideração apenas detalhes usuais da escolha de método para qualquer amostragem, como o número de unidades amostrais, seu tamanho e sua distribuição pela área de estudo. / Many methodologies are available for phytosociological studies, and many attempts have been made to evaluate them. The most commonly used method employs sample plots. This technique is always referred to in the literature as the basic approach and, as such, is usually defined as the benchmark to which the other methods are compared. For this reason, it has never been evaluated on its own. This work presents the opportunity to evaluate the plot method itself and compare its results with the parametric values available from a full census of a sampling area in which the complete population data is known and contains no sampling error. Data was taken from a permanent plot located in an area of forested savannah (Assis Ecological Station, SP, Brazil), that comprises an area of 10.24 ha, and all trees over 15 cm girth at breat hight were marked, georeferenced, measured and identified. Phytosociological measures were computed with the values of density and basal area for each species in the census and represent the parametric values. Simulations were made of phytosociological surveys by sistematic sampling with four square plot sizes (10 x 10 m, 20 x 20 m, 50 x 50 m, and 100 x 100 m). Additionally, three sampling intensities were simulated for the 10x10m plots (75, 50, and 25 plots). One thousand simulated surveys were performed for each sampling situation, and for each of these surveys phytosociological measures were computed. The bias in the estimates of both density and dominance was evaluated, as well as change in species importance. The influence of spatial pattern on the estimation of phytosociological measures was also evaluated. At last, some analysis of community attributes, that are feasible with phytosociological measures were made, such as density, basal area, species acummulation curves, number of species sampled and propotion of species and individuals per density group. The 10 x 10 m sample plots showed the lowest overall bias and the lowest variation in species importance, but even in this method were observed high bias and high variation. About the spatial distribution, species with very low density showed very large bias, indenpendently of spatial pattern. Spatial pattern had a clear influence on the estimates of intermediate density species, where species with more clustered pattern showed more skewed distribution. And for the species with high density, spatial pattern does not seem to play an importante role. The community attributes analysed can be well estimated with phytosociolocical measures, just taking into consideration some usual methodological details, such as sampling size and plot distributions within the study area.

Submitted by Cláudia Bueno (claudiamoura18@gmail.com) on 2016-03-10T20:32:55Z No. of bitstreams: 2 Dissertação - Anna Paula Santos Almeida Rotta - 2015.pdf: 1241010 bytes, checksum: 9da763a436471dd9f131621df58acc8c (MD5) license_rdf: 23148 bytes, checksum: 9da0b6dfac957114c6a7714714b86306 (MD5) / Approved for entry into archive by Luciana Ferreira (lucgeral@gmail.com) on 2016-03-14T15:27:32Z (GMT) No. of bitstreams: 2 Dissertação - Anna Paula Santos Almeida Rotta - 2015.pdf: 1241010 bytes, checksum: 9da763a436471dd9f131621df58acc8c (MD5) license_rdf: 23148 bytes, checksum: 9da0b6dfac957114c6a7714714b86306 (MD5) / Made available in DSpace on 2016-03-14T15:27:32Z (GMT). No. of bitstreams: 2 Dissertação - Anna Paula Santos Almeida Rotta - 2015.pdf: 1241010 bytes, checksum: 9da763a436471dd9f131621df58acc8c (MD5) license_rdf: 23148 bytes, checksum: 9da0b6dfac957114c6a7714714b86306 (MD5) Previous issue date: 2015-10-14 / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de Goiás - FAPEG / In recent decades, the growth of industrial activity and agriculture has been responsible for environmental contamination due to the presence of organic and inorganic substances. Phenol and its derivatives are an important class of environmental contaminants by their presence in many industrial effluents. The seeking of biological alternatives to mitigate the environmental pollution has motivated researches to find microorganisms that combine the capacity to degrade phenol with a sustainable focus. Therefore, bacteras capable of degrading xenobiotics are been used in soil, sediment and water treatment. This study has aimed to evaluate the biodegradation of phenol by bacterial isolates isolated from two Brazilian biomes (Cerrado Goiano and Mangrove of Guarapary, ES), whereupon the influence of pre-adaptation of the bacteria was checked, as well as the effects of growth parameters in different concentrations and the tolerance to this chemical compound. One isolated from Cerrado was identified as Staphylococcus aureus (BF 2.5), and the other one as a gram-positive rod (\BF 2.3.2), and the mangrove bacteria were identified as Bacillus circulans (MF-2) and Bacillus sp. (MF-1). All of the isolates consumed phenol in the approximated of 500mg.L-1 when cultivated in liquid Busnell-Hass (BH) medium and 1.500mg.L-1 in Nutrient Agar medium (NA). The consumption of phenol as carbon source by BF-2.5 isolated was 2,78; 4;79 and 0,35% for concentrations of 100, 200 and 300 mg.L-1 of phenol, respectively. The isolated BF-2.3.2 results were 11, 04; 19,13 and 16,02%, respectively. For the mangrove isolated the results were 22,43; 11,52 and 3.33% to 21,54; 20;54 and 28.85% for the MF-1 and MF-2 isolates, respectively in the same phenol concentrations tested. These results suggest a higher phenol consumption capacity of MF-2 isolated from mangrove. / Nas últimas décadas, a crescente atividade industrial e a agropecuária têm sido as responsáveis pela contaminação do meio ambiente devido à presença de substâncias orgânicas e inorgânicas. O fenol e seus derivados constituem uma importante classe de contaminantes ambientais pela sua presença em muitos efluentes industriais. A busca por alternativas biológicas para combater a poluição ambiental tem motivado pesquisas por micro-organismos que aliem a capacidade de degradar o fenol com enfoque sustentável. Nesta vertente, bactérias degradadoras de xenobióticos, estão sendo utilizadas como inóculo nos diversos tipos de tratamento biológico para a minimização de contaminação de águas, solos e sedimentos. Este trabalho teve como objetivo avaliar a biodegradação do fenol por isolados bacterianos de dois biomas brasileiros (Cerrado Goiano e Manguezal de Guaraparí, ES), no qual, verificou-se a influência da adaptação bacteriana perante as diferentes concentrações de fenol e a tolerância a esse composto químico. Das bactérias de Cerrado uma foi identificada como Staphylococcus aureus (BF 2.5) e a outra somente como bastonete gram-positivo (BF 2.3.2) e entre as bactérias de manguezal uma foi identificada como Bacillus circulans (MF-2) e a outra Bacillus sp. (MF-1) Todos os isolados consumiram fenol na concentração aproximada de 500mg.L-1 quando crescidos em meio de Bushnell-Haas (BH) líquido e em 1.500mg.L-1 quando em meio Ágar Nutriente (AN). Quanto à utilização do fenol como fonte única de carbono observamos que o consumo de fenol pelo isolado BF-2.5 foi de 2,78; 4,79 e 0,35% para as concentrações de 100, 200 e 300mg.L-1 de fenol, respectivamente. Já para o isolado BF-2.3.2 os resultados foram de 11,04; 19,13 e 16,02%, respectivamente. Para os isolados de manguezal os resultados foram 22,43; 11,52 e 3,33% e 21,54; 20,54 e 28,85% para os isolados MF-1 e MF-2, respectivamente nas mesmas concentrações de fenol testadas. Estes isolados sugerem uma maior capacidade de utilização pelo isolados MF-2 de manguezal.

Submitted by Erika Demachki (erikademachki@gmail.com) on 2017-01-06T18:59:59Z No. of bitstreams: 2 Tese - Fernanda Gomes Ferreira - 2016.pdf: 3057846 bytes, checksum: 5cdd832b55313b3b126d066db50d3548 (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) / Approved for entry into archive by Luciana Ferreira (lucgeral@gmail.com) on 2017-01-09T09:48:21Z (GMT) No. of bitstreams: 2 Tese - Fernanda Gomes Ferreira - 2016.pdf: 3057846 bytes, checksum: 5cdd832b55313b3b126d066db50d3548 (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) / Made available in DSpace on 2017-01-09T09:48:21Z (GMT). No. of bitstreams: 2 Tese - Fernanda Gomes Ferreira - 2016.pdf: 3057846 bytes, checksum: 5cdd832b55313b3b126d066db50d3548 (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Previous issue date: 2016-10-14 / This study had as objective to evaluate diametric growth aspects and the dynamics in a Semideciduous seasonal forest, twelve years after the conduction of a silvicultural management. The main objects were: to analyze the arboureous community density during the period that ranges from 2003 to 2015, after silvicultural interventions (Chapter 1); to develop Markov models and test its predictive capacity for different silvicultural managements (Chapter 2). The experiment was carried out in 2003, in Fazenda Vagafogo, Pirenópolis, Goiás. Experimental area was divided in four blocks, and, inside each one, three plots were allocated (25 30 m – 750 m 2), with the following treatments: Treatment 1 – control (T1), without interventions; Treatment 2 – all woody species were removed at a distance of one meter, considering the wanted trees (T2); Treatment 3 – T2 was repeated, joining to large lianas removal all over the plot (T3). Inside the plots, in 2003, 2007 and 2015, all the individuals (DBH > 3 cm) were measured. The community dynamics, considering the period ranging from 2003 to 2015, was described according to mortality taxes, recruitment, basal area gain and loss, net change rate to the number of individuals and basal area. Collected data were also used to develop Markov models that describe the seasonal forest dynamics of the diameter distribution after silvicultural treatments application (GT1, GT2, and GT3). Treatments did not negatively affect long term the community dynamics, because, in all treatments, recruitment was higher than mortality. Growth taxes and annual periodic increment (API) between 2003- 2007 and 2007-2015 analysis allow us to conclude that silvicultural treatments lost its effect, because taxes drop considerably in the second period compared to the first one. Models GT1, GT2 and GT3 were tested for an 8 year period (two consecutive projections), and all of them were able to efficiently simulate the diametric structure. This way, Markov chain is an efficient tool to project seasonal deciduous forests dynamics upon silvicultural interventions, which strengths its importance as a tool for forest management. / O presente estudo teve como objetivo geral avaliar aspectos da dinâmica e do crescimento em diâmetro de uma floresta estacional semidecidual, doze anos após a aplicação de tratamentos silviculturais. Os objetivos específicos foram: analisar a dinâmica da comunidade arbórea durante o período de 2003 a 2015, após intervenções silviculturais; desenvolver modelos markovianos e testar sua capacidade preditiva para diferentes tratamentos silviculturais. O experimento foi implantado em 2003, na Fazenda Vagafogo, em Pirenópolis, Goiás. A área experimental foi dividida em quatro blocos, e, dentro de cada bloco foram alocadas três parcelas de 25 30 m (750 m 2) com os seguintes tratamentos: Tratamento 1 – testemunha (T1), sem intervenções; Tratamento 2 – retirada de todas as espécies lenhosas em um raio de um metro em relação às árvores desejáveis (T2); Tratamento 3 – repetiu-se o T2, incorporando a retirada de cipós de grande porte em toda a parcela (T3). Dentro das parcelas, nos anos de 2003, 2007 e 2015, foram tomadas medidas de todos os indivíduos com DAP > 3 cm. A dinâmica da comunidade, considerando o período de 2003 a 2015, foi descrita por meio das taxas de mortalidade, recrutamento, ganho e perda em área basal, taxa de mudança liquida para número de indivíduos e área basal. Os dados coletados também foram utilizados para o desenvolvimento de modelos markovianos que descrevem a dinâmica da distribuição diamétrica da floresta estacional após a aplicação dos tratamentos silviculturais (GT1, GT2 e GT3). Os tratamentos aplicados não afetaram negativamente a dinâmica da comunidade no longo prazo, pois, em todos os tratamentos, o recrutamento foi maior do que a mortalidade. A análise das taxas de crescimento e incremento periódico anual (IPA) entre os períodos 2003-2007 e 2007-2015, nos permite concluir que os tratamentos silviculturais perderam o efeito, pois as taxas caíram consideravelmente no segundo período com relação ao primeiro. Os modelos GT1; GT2 e GT3 foram testados para um período de oito anos (duas projeções consecutivas), e todos eles foram capazes de simular a estrutura diamétrica de forma satisfatória. Assim, a cadeia de Markov é uma ferramenta eficiente para projetar a dinâmica de florestas estacionais semideciduais sob intervenções silviculturais, o que reforça sua importância como ferramenta para o manejo florestal.

Macroinvertébrés benthiques et hyphomycètes aquatiques représentent une part importante de la biocénose des cours d'eau de tête de bassin. D'un point de vue écologique, ils participent au recyclage du carbone organique à travers leur implication dans certaines fonctions écosystémiques telles que la décomposition de la litière. Ce processus est vital pour les cours d'eau forestiers ou bordés de ripisylve. Si celui-ci est aujourd'hui bien étudié en milieu tempéré, la contribution des deux types de décomposeurs (champignons et invertébrés) reste mal comprise en milieu tropical du fait de la variabilité éco-géographique prononcée de ce biome. Cette thèse qui concernait deux régions de Guinée jusque-là inexplorées, la Guinée Forestière et la Haute-Guinée, avait un double objectif. D'une part, il s'agissait de documenter la diversité taxonomique et trophique des communautés de macroinvertébrés benthiques et la composition des assemblages d'hyphomycètes aquatiques. D'autre part, la thèse visait à caractériser le processus de décomposition de la litière et les communautés de décomposeurs associés, notamment dans une perspective de quantification de la contribution de chacun des deux groupes. Cette dernière étude répondait ainsi à l'hypothèse d'une plus grande importance des décomposeurs fongiques aux faibles latitudes en comparaison des latitudes élevées où l'activité des décomposeurs invertébrés est prépondérante. Une étude exploratoire menée sur 12 rivières a révélé une diversité de 45 taxons correspondant à la faune macrobenthique de l'Afrique de l'Ouest, et incluant un nouveau taxon de crustacé pour la Guinée. Les deux régions d'étude se différenciaient dans la composition des groupes trophiques : les déchiqueteurs, essentiellement représentés par les crevettes, étaient dominants dans les cours d'eau de Guinée Forestière, et les racleurs abondaient dans ceux de savane en Haute-Guinée, caractérisés par une faible densité de la végétation riveraine. Par ailleurs, les prélèvements d'eau et d'écume ont décelé la présence de 29 espèces d'hyphomycètes aquatiques. A ces espèces viennent s'ajouter 9 autres identifiées sur les litières lors des expériences de décomposition portant ainsi à 38 le nombre d'espèces identifiées pour la Guinée au cours de cette thèse, dont 12 sont nouvelles pour le continent africain. Les expériences menées dans les deux régions montrent une décomposition rapide, probablement en partie liée à la forte teneur en nutriments des litières, et une faible diversité des décomposeurs associés. Dans les deux cours d'eau temporaires de savane étudiés, les invertébrés associés aux litières étaient absents. Comme une compensation, l'activité des champignons était accrue, lesquels accumulaient une biomasse mycélienne très élevée. La présence de déchiqueteurs potentiels a été notée dans les deux cours d'eau étudiés de Guinée Forestière mais leurs densités étaient faibles. Dans les deux régions, la différence entre les taux de décomposition totale et microbienne était faible, soulignant une importance minime des invertébrés et un rôle majeur des champignons et confirmant notre hypothèse. Il a également été montré au cours de cette thèse que les asséchements des cours d'eau avaient peu d'influence sur le taux de décomposition de la litière. Par ailleurs, une faible diversité des organismes décomposeurs, invertébrés et hyphomycètes aquatiques, ne semble pas altérer le processus de décomposition. Ainsi les lois générales basées sur les facteurs déterminants de la décomposition des litières tels que la qualité du matériel végétal ou un rôle équilibré entre les deux types de décomposeur, ne sont pas nécessairement transposables aux milieux tropicaux. Enfin, les résultats de cette thèse suggèrent que les conséquences du changement climatique sur le recyclage du carbone organique dans les eaux d'Afrique de l'Ouest, région prédite comme très affectée, pourraient être tempérées par la prédominance d'organismes peu vulnérables. / Benthic macroinvertebrates and aquatic hyphomycetes are major components of the biocenosis of headwater ecosystems. Both of them contribute to essential ecosystem functions like leaf litter decomposition as part of the organic carbon cycling. Such a process is vital for woodland streams or riparian tree-lined rivers. While this process is very well documented for temperate regions, the contribution of both types of decomposers, i.e. fungi and invertebrates, remains poorly understood in the tropics partly due to the large ecogeographic variability prevailing in this biome. The present thesis dealt with two unexplored regions of Guinea (Forested Guinea and Upper Guinea) and was motivated by a double objective. First, it aimed at documenting the taxonomic and trophic diversity of benthic macroinvertebrate communities together with the composition of aquatic hyphomycete assemblages. The second objective was to characterize leaf litter decomposition and leaf-associated decomposers, particularly in the perspective of quantifying the relative contribution of both decomposer types. The latter study specifically addressed the hypothesis of a greater importance of fungal decomposers at low latitudes compared to higher latitudes where the activity of invertebrate decomposers prevails. An exploratory survey conducted in 12 streams revealed the occurrence of 45 taxa belonging to the macrobenthic fauna of West Africa and including a new genus, Asellus, which completes the list of known crustacean taxa of Guinea. Both regions differed in the importance of the Functional Feeding Groups: shredders, mainly consisting in shrimps, dominated in Forested Guinea whereas scrapers were abundant in the savannah streams of Upper Guinea, which were characterized by scarce riparian vegetation. In stream water and foam, a total of 29 species of aquatic hyphomycetes were identified. Moreover, 9 additional species were found as sporulating on leaves in litter decomposition experiments, which led to a total of 38 species for Guinea with 12 being new for Africa. This thesis thus substantially expanded the list of known species for Africa. The experiments carried out in both regions showed a fast leaf litter decomposition, likely partly due to the high nutrient contents in litter, and a low diversity of leaf-associated decomposers. In the two studied temporary savannah streams, no leaf-associated invertebrates occurred. The latter was apparently compensated by a strong fungal activity as illustrated by very high mycelial biomass accrual. In the two studied streams of Forested Guinea, the occurrence of Caridina africana (Atyidae crustacean) as potential shredder could explain the leaf mass loss due to invertebrates, even though their density remained low. In both regions, the discrepancies between total and microbial decomposition rates were weak, highlighting a minute contribution of invertebrates and a major role of fungi thus supporting our hypothesis. The present results suggest that droughts resulted in low effects on the rate of leaf decomposition. Furthermore, leaf decomposition did not seem to be affected by the poor diversity of decomposers, i.e. invertebrates and aquatic hyphomycetes. Overall, the principles of leaf decomposition control by factors like the quality of leaf litter and the balanced involvement of both decomposer types do not appear to be fully applicable to tropical environments. Finally, the findings of this thesis suggest that the consequences of climatic change on the cycling of organic carbon in the aquatic ecosystems of West Africa, i.e. a region predicted to be particularly affected, could be mitigated by the dominance of organisms exhibiting a low vulnerability.