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Estudos estruturais e filogenéticos com fosfolipases e serino proteases de venenos de serpentes botrópicas nativas e quimicamente modificadas

Fernandes, Carlos Alexandre Henrique [UNESP] 16 September 2009 (has links) (PDF)
Made available in DSpace on 2014-06-11T19:26:03Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2009-09-16Bitstream added on 2014-06-13T20:33:38Z : No. of bitstreams: 1 fernandes_cah_me_botib.pdf: 1288061 bytes, checksum: 481773a993e5e2c2a2095ba6bcf346cc (MD5) / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP) / As serpentes do gênero Bothrops são de grande interesse científico, médico e social para o Brasil, visto que este gênero é responsável por cerca de 90% dos acidentes ofídicos que ocorrem em nosso país. Dois dos principais componentes do veneno desses animais são as fosfolipases A2 e as serino proteases. As fosfolipases A2 são enzimas responsáveis pela destruição da membrana celular através da hidrólise de fosfolipídios Ca2+ dependente. Uma classe destas fosfolipases, as fosfolipases homólogas (Lys49-PLA2s), que se caracteriza pela uma substituição natural na posição 49 de um resíduo de Asp para um resíduo de Lys, não apresenta atividade catalítica, mas é capaz de induzir mionecrose por um mecanismo Ca2+ independente devido, provavelmente, à resíduos da região C-terminal. Neste trabalho, através de estudos por cristalografia de raios-X de Lys49-PLA2s botrópicas nativas e quimicamente modificadas pelo brometo de p-bromofenacila (BPB), revisamos a posição da Lys122 – anteriormente apontado como um dos responsáveis ela ausência da atividade catalítica das Lys49-PLA2s por conta da hiperpolarização que causaria na ligação peptídica Cys29/Gly30 – e concluímos que, por conta de esta hiperpolarização ocorrer apenas em alguns monômeros de Lys49-PLA2s complexadas, a Lys122 não deve estar envolvida no “bloqueio” da atividade catalítica. Além disso, a comparação estrutural do loop de ligação de Ca2+ entre as Lys49 e Asp49-PLA2s nos mostra a importância da conservação da Tyr28 dentre as Asp49-PLA2s para a integridade do loop de ligação do Ca2+. Este resíduo estabiliza essa região através de uma ponte de hidrogênio com a Gly35. Nas Lys49-PLA2s, que possuem um resíduo de Asn na posição 28, não ocorre a formação dessa ponte, o que contribuiria para a desestabilização dessa região nessas proteínas... / The snakes from Botrops genus are objects with great scientific, medical and social interesting since that these snakes are responsible of 90% of snakebites in our country. Two of the main components of the venom from these animals are the phospholipases A2 and the serine proteases. The phospholipases A2 are enzymes responsible of cellular membrane disruption through phospholipids hydrolysis Ca2+-dependent. A class of these phospholipases, the homolog phospholipases (Lys49-PLA2s) that underwent a natural substitution Lys to Asp substitution in 49 position, does not show catalytic activity. However, these proteins can perform myonecrosis by a Ca2+-independent mechanism probably, due to action of C-termini region residues. In this work, by x-ray crystallography studies with bothropic Lys49-PLA2s in native and chemically modified by p-bromophenacyl bromide (BPB) forms, we revised the position of Lys122, previously pointed as one of the responsibles of Lys49-PLA2s due to hiperpolarization of its side chain on Cys29/Cys30 peptide bond. Here, we conclude that this hiperpolarization are present only in a few monomers and thus, Lys122 may not be involved in the “blocking” of catalytic activity. Furthermore, structural comparisons of Ca2+ binding loop between Lys49 and Asp49-PLA2s revels the importance of the Tyr28 residue conservation to the integrity of this region. This residue stabilizes the Ca2+ binding loop by a hydrogen bond to Gly35. In Lys49-PLA2s that have an Asn residue in 28 position, does not occur the formation of this bond, contributing to unstabilization of this region and difficulting the binding of Ca2+ cofactor. Phylogenetic studies showed that Asp49- PLA2s with reduced catalytic inactivity and capable to induce myonecrosis are phylogenetic more related to Lys49-PLA2s than to others Asp49-PLA2s, forming a ...(Complete abstract click electronic access below)
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Biogeografia histórica e conservação das serpentes da floresta pluvial atlântica costeira do Brasil

Barbo, Fausto Erritto [UNESP] 16 February 2012 (has links) (PDF)
Made available in DSpace on 2014-12-02T11:16:48Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2012-02-16Bitstream added on 2014-12-02T11:21:33Z : No. of bitstreams: 1 000796546_20143112.pdf: 151390 bytes, checksum: 2cdd9ceb849d403547bf35b62b3da23c (MD5) Bitstreams deleted on 2015-01-05T11:00:53Z: 000796546_20143112.pdf,Bitstream added on 2015-01-05T11:01:49Z : No. of bitstreams: 1 000796546.pdf: 3078084 bytes, checksum: b325495a392fcd35616c530d3155be45 (MD5) / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP) / A biogeografia tem como objetivo principal identificar os padrões de distribuição das espécies e propor hipóteses sobre os processos que resultaram nesses padrões. Os padrões de distribuição de espécies não são aleatórios e resultam de eventos históricos. A congruência entre esses padrões de distribuição, ou seja, a sobreposição de distribuição entre dois ou mais táxons, delimitam uma área de endemismo, que é fundamental para a formulação de hipóteses de biogeografia histórica. Áreas de endemismo na Mata Atlântica já foram delimitadas em estudos anteriores, porém nenhum estudo foi desenvolvido com serpentes para essa finalidade. Nesse estudo, foram identificadas 83 espécies endêmicas de serpentes para a Mata Atlântica, e a partir da análise de parcimônia de Endemicidade (PAE) e de endemismo (NDM/VNDM), quatro áreas de endemismo foram propostas: Alagoas, Sul da Bahia, Serra do Mar e Araucária. A partir da sobreposição de distribuição de serpentes e outros táxons endêmicos, foram definidas outras quatro áreas de endemismo: Ilha dos Alcatrazes, Ilha da Queimada Grande, Ilha de São Sebastião e Brejos de Altitude do nordeste. Essas oito áreas de endemismo foram analisadas em relação aos remanescentes de vegetação e área protegida por unidades de conservação. As espécies que delimitam as áreas de endemismo foram avaliadas em relação a ameaças de extinção de acordo com critérios propostos pela IUCN. Quatro espécies foram consideradas como “Criticamente Ameaçadas”, cinco “Em Perigo”, nove “Vulneráveis”, e sete “quase ameaçadas” de extinção. Essas áreas de endemismo devem ser consideradas como prioritárias para conservação pois representam unidades evolutivas únicas e abrigam serpentes endêmicas e ameaçados de extinção / Biogeography aims mainly to identify patterns of species distribution and to propose hypothesis about the process that have shaped those patterns. The distribution patterns are not random and are a result of historical events. The congruence among those distribution patterns, ie the distribution overlap of two or more endemic taxa, delimits an area of endemism, fundamental for formulation of hypothesis in historical biogeography. Areas of endemism in the Atlantic Forest have already been delimited in previous studies. However, there are no studies on snakes for this purpose. In the present study, 83 endemic snake species were identified in the Atlantic Forest. From Parsimony Analysis of Endemicity (PAE) and Endemism analysis (NDM/VNDM), four areas of endemism were proposed: Alagoas, Sul da Bahia, Serra do Mar, and Araucária. From the distribution overlap of snakes and other endemic taxa, additional four areas of endemism were defined: Ilha dos Alcatrazes, Ilha da Queimada Grande, Ilha de São Sebastião, and Northestern Brejos de Altitude. These eight areas of endemism were analyzed in order to quantify the vegetation remnants and protected areas in conservation units. The species delimiting areas of endemism were evaluated in the threat of extinction, according to the IUCN criteria. Four species were considered as “Critically Endangered”, five were “Endangered”, nine “Vulnerable”, and seven as “Near Threatened”. Those areas of endemism must be considered as priorities for conservation as they correspond to unique evolutionary unities and harbor endemic and threatened taxa / FAPESP: 08/50068-2
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Hematopoese em serpentes Oxyrhopus guibei (Hoge & Romano, 1978) (Ophidia: Dipsadidae): caracterização morfológica, citoquímica e ultraestrutural / Hematopoiesis in Oxyrhopus guibei (Hoge & Romano, 1978) (Ophidia: Dipsadidae) snakes: morphological, cytochemical and ultrastructural characterization

Priscila Aparecida Ozzetti 28 May 2013 (has links)
A hematopoese nas serpentes inicia-se durante a embriogênese e através dos processos de alterações da vida fetal. A primeira atividade eritropoética é extraembrionária, a partir de células mesodérmicas do saco vitelínico e durante o desenvolvimento embrionário torna-se intraembrionário. Em serpentes recém-nascidas e adultas, o principal foco hematopoético ocorre na medula óssea. O objetivo deste estudo foi caracterizar os diferentes estágios de maturação das células sanguíneas da serpente O. guibei, com base em estudos de microscopia, reações citoquímicas e aspectos ultraestruturais. Fragmentos de vértebras de serpentes recém-nascidas e adultas (n=11) foram coletados para obtenção da medula óssea que foi fixada em formol cálcio ou Bouin e processadas para histologia de rotina. Cortes histológicos, imprint de medula óssea e esfregaços sanguíneos foram corados com Rosenfeld, hematoxilina e eosina ou azul de metileno. As reações citoquímicas realizadas foram ácido periódico de Schiff (PAS), azul de toluidina (AT), Sudan Black B (SBB), benzidina peroxidase (PA) e fosfatase ácida (FA). Para a microscopia electrónica de transmissão (TEM), a medula óssea foi fixada em paraformaldeído a 4% + glutaraldeído 2%, em tampão Tyrode, pós fixados em tetróxido de ósmio a 1% e embebidos em resina Epon 812. A maior parte das células progenitoras de células sanguíneas foram identificadas em focos hematopoiéticos ativos na medula óssea de vértebras e costelas. As linhagens azurofílicas e linfoides foram morfologicamente similares aos de outros répteis. A linhagem granulocítica foi classificada como mieloblasto, promielócito, mielócito e granulócito maduro. Mielócitos podem ser diferenciados em basófilos com grânulos grandes, redondos e eletrondensidade homogênia ou heterófilos, com grânulos de tamanhos e formas variadas na análise MET. TB e PAS foram positivos nos grânulos imaturos e maduros basófilos. Por outro lado, heterófilos e azurófilos mostraram reação fortemente positiva para lípidos de SBB e BP. FA foi encontrado nos azurófilos em várias fases de maturação. As diferentes fases de eritrócitos foram classificadas como: proeritroblasto, eritroblasto basófilo, eritroblasto policromático, proeritrócitos e eritrócitos maduros. Os trombócitos apresentaram positivadade para PAS. As características dos trombócitos maduros e imaturos foram definidas através da TEM apresentando corpos densos, grânulos alfa, microtúbulos e sistema canalicular aberto. Concluindo, a medula óssea das costelas e vértebras é um importante foco hematopoético nas serpentes O. guibei recém-nascidas e adultas. Os aspectos morfológicos, citoquímicos e ultraestruturais são úteis para identificar e caracterizar os diferentes estágios de maturação das células sanguíneas / Hematopoiesis in snakes begins during embryogenesis and the process changes through fetal life. The first erytropoietic activity is extraembryonic from mesoderm cells of the yolk sac and during the embryonic development it becomes intraembryonic. In newborn and adult snakes, the main site of hematopoiesis occurs in the bone marrow. The aim of this study was to characterize different stages of blood cells maturation of O. guibei snakes, based on microscopic studies including cytochemical stains and ultrastructural features. Fragments of vertebrae of newborn and adult snakes (n= 11) were collected to obtain bone marrow that was fixed in Bouin or formol calcium and processed routinely for histology. Tissue sections, imprint of bone marrow and blood smears were stained with Rosenfeld, hematoxylin and eosin or methylene blue. The cytochemical reactions performed were periodic acid-Schiff (PAS), toluidine blue (AT), sudan black B (SBB), benzidine peroxidase (BP) and acid phosphatase (FA). For transmission electron microscopy (MET), bone marrow was fixed in paraformaldehyde 4% + glutaraldehyde 2% in Tyrode buffer, postfixed in 1% osmium tetroxide and embedded in Epon 812 resin. Most of progenitors of blood cells were identified in the active hematopoietic focus in bone marrow of vertebrae and ribs. The azurophilic and lymphocytic series were morphologically similar to those of other reptiles. Granulocytic lineage was classified as myeloblast, promyelocyte, myelocyte and mature granulocytes. Myelocyte can be differentiated into basophils, with large, round and electrondensity homogeneous granules or heterophils, with varied size and shapes granules in the TEM analysis. AT and PAS were positive in the immature and mature basophils granules. On the other hand, heterophils and azurophils showed strong positive reaction for lipids staining of SBB and BP. FA was found on azurophils in various stages of maturation. The different stages of erythrocytes were classified as: proerythroblast, basophilic erythroblast, polychromatic erythroblast, proerythrocyte and mature erythrocytes. Thrombocytics cells showed PAS positive. The characteristics of mature and immature thrombocytes were defined using TEM identifying the dense bodies, alpha granules, microtubules and open canalicular system. Concluding, the rib or vertebral bone marrow is an important hematopoietic site in the newborn and adult O. guibei snakes. The morphologic, cytochemical and ultrastructural characteristics are useful to identify and characterize different stages of maturation of blood cells
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Avaliação da resposta humoral e da capacidade de neutralização do soro de camundongos Swiss inoculados com venenos nativo e irradiado com cobalto-60 de serpentes Crotalus durissus terrificus, Bothrops jararaca, Bothrops jararacussu e Bothrops moojeni

Ferreira Júnior, Rui Seabra [UNESP] January 2003 (has links) (PDF)
Made available in DSpace on 2014-06-11T19:23:01Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2003Bitstream added on 2014-06-13T18:09:09Z : No. of bitstreams: 1 ferreirajunior_rs_me_botfm.pdf: 1446696 bytes, checksum: dbfee5e5aa68ebc4a664a665cf902076 (MD5) / O ensaio imunoenzimático de ELISA foi utilizado para avaliar, acompanhar e comparar a resposta imune humoral de camundongos SWISS durante o processo de hiperimunização com veneno nativo e irradiado com Cobalto-60 (60Co) obtido das serpentes Crotalus durissus terrificus, Bothrops jararaca, Bothrops jararacussu e Bothrops moojeni. A potência e a capacidade de neutralização foram avaliadas por meio de desafios “in vitro”. A imunidade obtida ao final do processo de hiperimunização foi verificada mediante desafio “in vivo” e os efeitos colaterais foram avaliados. A imunização dos animais, com uma DL50 de cada veneno, ocorreu nos dias um, 15, 21, 30 e 45, quando foram colhidas amostras de sangue. No 60º dia ocorreram os desafios. Os resultados demonstraram que o teste de ELISA mostrou-se eficiente na avaliação, acompanhamento e comparação da resposta imune dos camundongos durante o processo de hiperimunização. Os títulos do soro produzido com veneno nativo foram semelhantes aos títulos do soro obtido com veneno irradiado. A capacidade imunogênica foi mantida após a irradiação com 60Co. O soro produzido a partir do veneno irradiado de Crotalus durissus terrificus apresentou potência e capacidade de neutralização maiores, quando comparado ao soro obtido a partir do veneno nativo.Os anticorpos antiveneno nativo e irradiado, mediante os desafios “in vitro”, mostraram-se igualmente eficazes na neutralização dos venenos de Bothrops jararaca, Bothrops jararacussu e Bothrops. Todos anticorpos foram capazes de neutralizar cinco DL50 dos respectivos venenos. As alterações clínicas foram mínimas durante o processo de hiperimunização com veneno irradiado e evidentes com veneno bruto. / ELISA was used to evaluate, follow, and compare the humoral immune response of Swiss mice during hyperimmunization with natural and Cobalt-60- irradiated (60Co) Crotalus durissus terrificus, Bothrops jararaca, Bothrops jararacussu, and Bothrops moojeni venoms. Potency and neutralization were evaluated by in vitro challenges. After hyperimmunization, immunity was observed by in vivo challenge and the side effects were assessed. The animals’ immunization with one LD50 of each venom was on days one, 15, 21, 30, and 45, when blood samples were collected; the challenges occurred on the 60th day. Results showed that ELISA was efficient in evaluating, following, and comparing mouse immune response during hyperimmunization. Serum titers produced with natural venom were similar to those with irradiated venom. Immunogenic capacity was maintained after 60Co irradiation. Serum produced from Crotalus durissus terrificus irradiated venom showed higher potency and neutralization capacity than that from natural venom. Antibodies from natural and irradiated venom by in vitro challenges were also efficient in neutralizing Bothrops jararaca, Bothrops jararacussu, and Bothrops moojeni venoms. All antibodies were capable of neutralizing five LD50 from these venoms. Clinical alterations were minimum during hyperimmunization with irradiated venom and evident with natural venom.
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Avaliacao do mecanismo de captacao e endocitose de crotoxina submetida a acao da radiacao gama, por macrofagos peritoneais de comundongos

CARDI, BRUNO A. 09 October 2014 (has links)
Made available in DSpace on 2014-10-09T12:43:37Z (GMT). No. of bitstreams: 0 / Made available in DSpace on 2014-10-09T13:58:25Z (GMT). No. of bitstreams: 1 06500.pdf: 5041467 bytes, checksum: 85575a2b20c2e1b56487851767fef65f (MD5) / Tese (Doutoramento) / IPEN/T / Instituto de Pesquisas Energeticas e Nucleares - IPEN/CNEN-SP
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Alteracoes bioquimicas e imunologicas do veneno de Bothrops jararacussu irradiado com 60supCo

SPENCER, PATRICK J. 09 October 2014 (has links)
Made available in DSpace on 2014-10-09T12:38:55Z (GMT). No. of bitstreams: 0 / Made available in DSpace on 2014-10-09T13:59:52Z (GMT). No. of bitstreams: 1 02760.pdf: 2199881 bytes, checksum: 667afa150258a68d2030168187d89158 (MD5) / Dissertacao (Mestrado) / IPEN/D / Instituto de Pesquisas Energeticas e Nucleares - IPEN/CNEN-SP
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Resposta imune frente a bothropstoxina-1 irradiada com sup(60)Co: edentificacao das principais citocinas envolvidas e a participacao de substancias scavengers / Immune response against the irradiated Bothropstoxin-1: Identification of main cytokines involved and the participation of scavengers substances

ALVES, JANAINA B. 09 October 2014 (has links)
Made available in DSpace on 2014-10-09T12:52:51Z (GMT). No. of bitstreams: 0 / Made available in DSpace on 2014-10-09T14:01:52Z (GMT). No. of bitstreams: 0 / Tese (Doutoramento) / IPEN/T / Instituto de Pesquisas Energeticas e Nucleares - IPEN-CNEN/SP
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Acao da Bothrospstoxina-1 do veneno total de Bothrops jararacussu irradiados sobre o sistema imune / Effects of irradiated Bothropstoxin-1 and Bothrops jararacussu crude venom on the immune system

CAPRONI, PRISCILA 09 October 2014 (has links)
Made available in DSpace on 2014-10-09T12:52:47Z (GMT). No. of bitstreams: 0 / Made available in DSpace on 2014-10-09T14:03:50Z (GMT). No. of bitstreams: 0 / Dissertacao (Mestrado) / IPEN/D / Instituto de Pesquisas Energeticas e Nucleares - IPEN-CNEN/SP
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Contribuicao ao estudo das giroxinas (enzimas semelhantes a trombina) dos venenos das serpentes brasileiras Lachesis muta muta e crotalus durissus terrificus

CAMILLO, MARIA A.P. 09 October 2014 (has links)
Made available in DSpace on 2014-10-09T12:43:02Z (GMT). No. of bitstreams: 0 / Made available in DSpace on 2014-10-09T14:05:39Z (GMT). No. of bitstreams: 1 06211.pdf: 4280505 bytes, checksum: f590901934d469233907b4a44c9ef5ee (MD5) / Tese (Doutoramento) / IPEN/T / Instituto de Pesquisas Energeticas e Nucleares - IPEN/CNEN-SP
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Aspectos estruturais de proteinas do veneno crotalico modificado por radiacao ionizante / Structural aspects of crotalic venom proteins modified by ionizing radiation

OLIVEIRA, KARINA C. de 09 October 2014 (has links)
Made available in DSpace on 2014-10-09T12:27:22Z (GMT). No. of bitstreams: 0 / Made available in DSpace on 2014-10-09T14:06:36Z (GMT). No. of bitstreams: 0 / Dissertacao (Mestrado) / IPEN/D / Instituto de Pesquisas Energeticas e Nucleares - IPEN-CNEN/SP

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