TCTP est une petite protéine globulaire (20~kDa) qui interagit avec de nombreux partenaires et qui est impliquée dans diverses fonctions cellulaires et physiologiques, avec un rôle bien documenté dans la réversion tumorale qui est un phénomène rare et spontané où une cellule cancereuse perd tout ou partie de son phénotype malin et retrouve des caractéristiques associées aux cellules bénignes telles que la sensibilité à l'apoptose. Dans les cellules cancéreuses, TCTP inhibe la dégradation de MDM2, diminuant ainsi les niveaux de p53 et favorisant le maintien et la progression du cancer. TCTP contient également un motif BH3-like connu pour réguler les membres de la famille Bcl-2 et elle interagit directement avec Bcl-xL et Mcl-1 pour renforcer leurs propriétés anti-apoptotiques. Dans la structure TCTP, le motif BH3-like n'est pas facilement accessible pour une interaction avec un partenaire. Conformément à son importance dans le maintien de la tumeur, TCTP est une cible pharmacologique validée dans le traitement du cancer et fait l’objet d’essais cliniques en cours avec une molécule d'abord connue comme anti-depresseur, la sertraline. Cependant, on en sait peu sur la structure de TCTP en complexe avec ses partenaires, ce qui entrave le développement de médicaments et ne permet pas de comprendre comment TCTP peut s'adapter à une telle variété de partenaires. Ainsi, nous avons étudié le mécanisme moléculaire par lequel TCTP s'associe à des protéines et à des ligands en utilisant diverses méthodes biophysiques (RMN, SAXS, CD, SEC, DSF...). Nous avons démontré que la protéine TCTP se lie à Bcl-xL et à Mcl-1 dans le sillon de liaison des motifs BH3. Dans les complexes, la région BH3-like est engagée dans l'interface intermoléculaire et la structure centrale de TCTP est déstabilisée dans un état de globule fondu (molten-globule). Nous avons en outre montré que seule une forme mineure pré-existante de TCTP, à savoir TCTP*, est compétente pour les interactions avec les partenaires Bcl-xL et Mcl-1. Dans TCTP*, la région BH3-like est détachée du domaine structuré et elle est accessible aux protéines Bcl-xL/Mcl-1 tandis qu'on retrouve un état globule fondu dans la partie globulaire de TCTP*. Nous avons également collecté des données d'interaction préliminaires entre TCTP et la sertraline, des ARN, la protéine YB-1 se liant à l'ARN et le domaine N-terminal de MDM2. Enfin, nous avons caractérisé TCTP phosphorylé (pTCTP) au résidu S46 en utilisant la Plk-1 car cette modification a un impact sur les interactions et est un marqueur de l'aggressivité tumorale. En résumé, ces travaux ont établi la versatilité de TCTP en terme de structure et ont montré que cette versatilité est indispensable pour exercer ses fonctions cellulaires. En conséquence, ceci devrait être pris en compte dans les stratégies de développement de nouvelles molécules thérapeutiques ciblant TCTP. / TCTP is a small (20~kDa) globular protein that interacts with many partners with consequences in various cellular and physiological functions, with well-documented roles in tumoral reversion program. Cells that undergo such program spontaneously loose their malignant phenotype and recover characteristics associated with benign cells, such as apoptosis. In cancer cells, TCTP inhibits MDM2 degradation, thus decreasing p53 levels and favoring tumor maintenance and progression. TCTP also contains a BH3-like motif known to regulate Bcl-2 family members and TCTP directly interacts with Bcl-xL and Mcl-1 to reinforce their pro-survival properties. In TCTP structure, the BH3-like motif is not readily accessible for interaction. Consistently with its importance in tumor maintenance, TCTP is a validated pharmacological target in cancer treatment with ongoing clinical trials using the TCTP-targeting antidepressant drug sertraline. However, little is known about TCTP structure in complex with partners, thus impeding the development of drugs and the understanding of how TCTP could adapt to its myriad of partners. Thus, we investigated the molecular mechanism by which TCTP associates with proteins and ligands using various biophysical methods (NMR, SAXS, CD, SEC, DSF...). We have demonstrated that full length TCTP binds to Bcl-xL and Mcl-1 in their BH3-binding groove. In the complexes, the TCTP BH3-like region is engaged in the intermolecular interface and the core TCTP structure is destabilized into a molten-globule (MG) state. We further showed that only a minor pre-existing form of TCTP, namely TCTP*, is competent for interactions with the Bcl-2 protein partners. In TCTP*, the BH3-like region is unpinned and accessible to Bcl-xL/Mcl-1 proteins and the core structure is also in MG state. We also collected preliminary interaction data between TCTP and sertraline, RNA, the RNA binding YB-1 protein and the MDM2 N-terminal domain. Finally, we characterized the Plk-1-mediated S46 phosphorylated TCTP (pTCTP), a marker of tumor aggressivity and its interaction properties. Overall, this work established the structural versatility of TCTP that is mandatory to exert its cellular functions and this versatility should be taken into account in drug-design strategies targeting TCTP.

L'amylose est un homopolymère quasi-linéaire d'unités glucosyles liées en α(1,4) qui, extrait de l'amidon natif, possède la propriété remarquable de former des complexes cristallins avec une grande variété de petites molécules organiques. Ces complexes sont regroupés sous le terme générique d'amylose V. Nous avons testé la capacité de 120 composés à induire la cristallisation de l'amylose à partir de solutions aqueuses diluées. La morphologie et la structure des cristaux lamellaires formés ont été caractérisés par microscopie électronique en transmission ainsi que par diffraction des électrons et des rayons X. Les données révèlent que les structures de ces complexes peuvent être classées en 10 familles dont 5 sont décrites pour la première fois. Des spectres de résonnance magnétique nucléaire du solide du 13C montrent clairement que l'hélicité de l'amylose V est corrélée à la résonnance du carbone C1 qui se déplace vers les champs faibles lorsque le nombre d'unités glucosyles par tour augmente. Des modèles géométriques préliminaires ont été proposés pour tous les allomorphes, la structure de cristaux de V1-butanol ayant été analysée en détail en combinant des calculs de conformation et d'énergie d'empilement avec un affinement de structure de polymère cristallin classique. Tous les allomorphes contiennent des simples hélices d'amylose d'ordre 6, 7 ou 8 et les molécules invitées peuvent être localisées dans ces hélices, entre elles ou les deux. Chaque type d'allomorphe peut être obtenu avec différents complexants et la conformation de l'hélice d'amylose dépend de la taille du complexant. De plus, un ligand donné est susceptible d'induire la formation de plusieurs allomorphes. Le polymorphisme cristallin de l'amylose serait donc une caractéristique plus générale que ce qui avait été rapporté auparavant. La propension au polymorphisme dépend non seulement de la nature du complexant mais aussi des conditions de cristallisation. Le degré de polymérisation de l'amylose, sa concentration et celle du complexant, la température de mélange ou de cristallisation et la composition du solvant ont un impact significatif sur la formation de cristaux et la structure de l'amylose V. Par ailleurs, nous avons utilisé des complexes avec l'ibuprofène comme modèle afin d'évaluer le potentiel de l'amylose V comme système de délivrance de principes actifs. Différentes fractions d'ibuprofène, probablement corrélées aux positions possibles de la molécule dans le cristal, sont sélectivement relarguées en variant le pH du milieu de dissolution. Puisque le relargage intervient principalement à pH élevé, ces complexes d'inclusion sont donc potentiellement intéressants pour cibler une libération intestinale et pourraient donc améliorer l'effet thérapeutiques de l'ibuprofène. / Amylose, a mostly linear homopolymer of α(1,4)-linked glucosyl units extracted from native starch, has the remarkable property to form "V-amylose" crystalline complexes with a variety of small organic molecules. We have tested the ability of 120 compounds to induce the crystallization of amylose from dilute aqueous solutions. The morphology and structure of the resulting lamellar crystals were characterized by transmission electron microscopy as well as electron and X ray diffraction. The data revealed that the structures of the complexes could be classified into 10 families, 5 of which were described for the first time. In addition, 13C solid-state nuclear magnetic resonance spectra clearly showed that the helicity of V-amylose was correlated with the resonance of carbon C1 that was shifted downfield with increasing number of glucosyl units per turn. Tentative geometrical models were proposed for all allomorphs and the structure of V1-butanol was analyzed in more details by combining conformational and packing energy calculations with classical crystalline polymer structure refinement. All allomorphs contained 6-, 7- or 8-fold amylose single helices and the guest molecules could be located inside these helices, in-between, or both. Each allomorph could be obtained with different complexing agents and the helical conformation was found to depend on the size of the complexing agent. In addition, a given ligand could induce the formation of several allomorphs, suggesting that the polymorphism of V-amylose crystals is a more general characteristic than what was previously reported. The propensity for polymorphism is not only related to the nature of the complexing agent but also to the crystallization conditions. The degree of polymerization of amylose, its concentration and that of the complexing agent, the temperature of mixing and crystallization, and the solvent composition have a significant impact on the formation and crystal structure of V-amylose. In addition, crystalline complexes prepared with ibuprofen were used as a model to evaluate the potential of V-amylose as a delivery system of bioactive molecules. Different fractions of ibuprofen, likely correlated with the different locations of the guest in the crystal, were selectively released by varying the pH of the dissolution medium. Since the release mainly occurred at high pH, these inclusion complexes appear to be potentially interesting for intestinal targeting and would thus improve the therapeutic effect of ibuprofen.

Selon la tradition, Samuel de Champlain aurait retenu le site de Québec pour ses qualités défensives. Mais se pourrait-il qu'à défaut de comprendre Champlain, la tradition ait préféré questionner la nature au lieu de questionner le fondateur? Cette question constitue notre point de départ. Notre projet consiste à comprendre Québec à l'aune d'une morphogenèse traduisant une mobilisation des acteurs par les formes sensibles des paysages, préalablement investies de valeurs. La fondation de Québec aurait été le fait d'un investissement de représentations symboliques auxquelles le promontoire aurait fait écho. C'est que depuis la Renaissance, la localisation de certains acteurs serait influencée par une coïncidence entre des formes symboliques (idéaux, modèles...) et les images mentales que peuvent suggérer les formes des paysages. Dans ce processus, les artistes auraient la capacité de nous révéler ces coïncidences. Dans cette optique, quatre acteurs auraient lourdement infléchie la morphogenèse de Québec. Champlain, malgré ses prétentions, aurait finalement été contraint d'occuper une position attribuée, son «choix» pour Québec relevant notamment d'une coïncidence entre l'intuition qu'il pouvait avoir de la géopolitique amérindienne et des formes paysagères pouvant suggérer les discontinuités découlant de cette géopolitique. Dans le regard de Montmagny, le promontoire de Québec aurait fait écho à la posture que s'attribuait alors le sujet baroque. Le sujet aurait cherché à exprimer son unicité en s'associant avec les saillances du paysage. Mais au même moment, d'autres acteurs baroques — les communautés religieuses — auraient elles aussi été mobilisées par le promontoire de Québec. Une mimesis d'appropriation aurait été amplifiée par un paysage pouvant suggérer le rang social de ces acteurs. De cette rivalité devait émerger l'organisation axiale de Québec. Cette axialité a eu et a encore, une forte incidence sur le devenir de Québec. L'organisation du domaine bâti de Québec — des faubourgs enserrant un centre — aurait évoqué l'individualisme romantique, incitant les bourgeoisies à vouloir occuper le bourg fortifié. Modernes, elles voulaient détruire les murs de Québec. Or, Lord Dufferin les forçait à conserver ces derniers. La morphogenèse de Québec prenait une nouvelle tangente sous l'influence d'une confusion entre un idéal individualiste, l'organisation du paysage de Québec et une position centrale qui changeait de valeur. Les bourgeoisies se aisaient prendre dans un «piège paysager». Depuis lors, la morphogenèse de Québec ne ferait que s'inscrire à l'intérieur du lourd héritage de la «vieille capitale», au détriment de quartiers entiers. Aujourd'hui, nous pouvons constater que certains espaces, sous l'influence d'idéaux spécifiques, sont l'objets d'investissements de valeurs. Le bourg fortifié, dans la foulée de son classement, est l'objet d'une valorisation par des acteurs inscrits dans des trajectoires longues. Il est de ce fait de plus en plus un espace vide. Aussi, sous l'influence des discours environnementaux, le bassin de Québec serait en train d'émerger comme espace attractif, et ce, en concurrence avec les investissements récents dans le nouveau centre-ville. / According to tradition, the site for the construction of Québec was chosen by Samuel de Champlain for its defensive properties. Yet, while having no insight of the founder’s intentions, could it be that the above tradition preferred to investigate nature instead of investigating Champlain’s motives? This question constitutes the starting point of this research endeavor. It aims at understanding Québec from the very start of its morphogenesis resulting from a succession of actors influenced by the perceived landscape forms pre-invested with human values. Hence, the founding of Québec would have been the result of representation inputs of a symbolic nature to which echoed its promontary, considering that since Renaissance the location of certain actors could have been determined through the coincidence between symbolic forms ( ideals, models...) and the mental images as generated by the forms of the landscape. In this process, artists tend to unveil these coincidences. In that perspective, four actors have strongly inflected the morphogenesis of Québec. Champlain, notwithstanding his claims, would have been constrained to occupy a designated position, his «choice» for Québec resulting from a coincidence between his possible intuition of the ameridian geopolitics and the landscape forms suggesting the potential discontinuities created by this geopolitics. As seen by Montmagny, the Québec promontory evoqued the posture to which the Baroque individual pretended: his tendency to express his wholesomeness by his association with the stricking features of the landscape. But at the same time, other Baroque actors — the religious communities — invested the Québec promontory: an appropriative mimesis would have been amplified by a landscape able to suggest the social position of these actors. From this rivalry resulted the axial organisation of Québec which had and still has a strong incidence upon the spatial evolution of the agglomeration. The organization of the built form of Québec — faubourgs enclosing a centre — would have evoqued the romantic individualism, encouraging the (modern) bourgeoisies to occupy the fortified bourg; they wanted to destroy its walls, while Lord Dufferin insisted in conserving them. From then on, the morphogenesis of Québec took a new direction under the influence of a confusion between the individualistic ideal, the structured landscape of Québec and a central position undergoing a value change. Hence, the bourgeoisies were caught into a «landscape trap». Since then, the morphogenesis of Québec is still submitted to the constraining legacy of the «old Québec», creating prejudice to surrounding neighbourhoods. As a result, one can ascertain that today some portions of the agglomeration, under the influence of specific ideals, are subjected to new value investments. The fortified bourg, following its designation as a Heritage precinct (UNESCO), is subjected to a valorization process by actors set in long term trajectories; hence, it more and more becomes an “empty place”. Moreover, influenced by the environmental discourse, the walled City and its harbour seem to emerge as a space of attraction, this being in competition with the recent investments in the new CBD.

Mémoire numérisé par la Division de la gestion de documents et des archives de l'Université de Montréal. / Le développement de l’identité régionale dans la région de la capitale nationale fut l’objet de problématiques diverses. Ce développement identitaire eut même des répercussions au niveau de l’aménagement de son territoire. Depuis plus d’un siècle, plusieurs événements survenus sur la scène politique, économique, sociale et culturelle ont eu un impact sur l’aménagement de la région. En 1946, le gouvernement canadien fit appel à Jacques Gréber, un architecte aménagiste d’origine française, afin de réaliser un plan d’aménagement pour le territoire de la capitale nationale. Ses propositions d’aménagement suggéraient une relocalisation des équipements industriels et ferroviaires en périphérie du centre-ville ainsi qu’un reverdissement et une mise en valeur des berges et cours d’eau de la région. De plus, ces recommandations visaient parallèlement à développer une capitale où l’aménagement reflèterait une identité pancanadienne. Le projet de Gréber ne fut cependant pas réalisé intégralement. Afin de comprendre le développement de la région, nous ferrons appel à certains éléments de la géographie structurale. Cette approche théorique permettra de révéler la présence d’une structure sous-jacente au territoire, ayant influencé le développement urbain. La configuration de cette structure fut, elle aussi, influencée par les changements sociaux survenus au sein de la population. Ces derniers eurent un impact sur la perception qu’avait la population sur son environnement et par conséquent sur la réalisation d’aménagements sur le territoire. Finalement, une comparaison entre les volontés d’aménagements de Gréber et la structure sous-jacente permettra d’expliquer les résultats de la réalisation du Plan Gréber et d’autres projets plus récents. / The development of regional identity in the National Capital Region has been at the centre of a variety of issues, it even had repercussions on regional urban planning. Since the late 19th century, many events that occurred in the political, economic, social and cultural spheres have had major impacts on the urban development of the region. In the middle of the 20th century, the Canadian government asked Jacques Gréber, a French planner and architect, to propose a plan for the National Capital Region. The plan suggested that all industrial and railroad equipment should be relocated outside the downtown area and that the esthetical aspect of the shores and the rivers be improved. Furthermore, these recommendations had a parallel objective of promoting a Canadian identity through the urban planning. The current layout of the region reveals that Greber’s plan was not fully implemented. To understand the development of the region, we will refer to certain elements of the structural geography theory. This theoretical approach will reveal a subjacent structure that influenced the urban development. The configuration of this structure was also influenced by social change occurring in the population. These changes had an impact on the population’s perception of its environment and consequently on planning and implementation. Finally, a comparison of Gréber’s development plans and the subjacent structure revealed by the morphogenetic path of urban development, provided by the structural geography theory, will allow for the explanation of the results of the implementation of Greber’s plan and other more recent planning projects.

Titre de l'écran-titre (visionné le 9 janvier 2024) / Au Québec, pour nombre de personnes, l'évidence topographique qu'est le Saint-Laurent à la surenchère de superlatifs est dotée d'un puissant genius loci en apparence bien ancré dans l'espace et le temps. Une certaine superficie de ses rives humanisées, portion de Laurentie, est également baignée d'une atmosphère variablement maritime, héritée ou construite, mais difficilement qualifiable et moins encore quantifiable. Délicate à circonscrire, mais assurément de culture maritime, la Laurentie est à la fois lieu -- la rive, vue de la terre -- et concept -- la combinaison du Saint-Laurent et de ses côtes, vues de la mer. Néanmoins, individuellement et collectivement, et à l'inverse de leur prise de la terre, de la forêt, d'autres ressources et récemment du Nord, les gens du Québec semblent ne s'y adjoindre et se la représenter que timidement et sans consensus. Manifestement, dans une apparente ignorance généralisée des qualités laurentines essentielles, ceux-là sont contraints d'un accès physique improbable dans un contexte de propriété incertaine et de règlementation à l'extrême, politique, économique, technique et culturelle. Des concepts géographiques sont à introduire et à mettre en œuvre afin d'étudier scientifiquement cette relation au Saint-Laurent, les manières contemporaines qu'ont ces acteurs terrins de généralement ne pas revendiquer leur mer pourtant si prégnante, et même de lui tourner le dos. La maritorialité est un domaine d'étude nouveau et inexploré en géographie humaine. En contexte spécifique de « territorialité maritime », elle construit et interroge les modalités des relations d'homme-à-la-mer, de liens humains individuels et collectifs avec un espace érémal inhabitable et inhabité, bien qu'humanisé et faiblement anthropisé. La Laurentie prend alors des dimensions conceptuelles au delà de son simple locus maritorial déjà évoqué, en matière de perceptions, de représentations, de conceptions et d'affections, depuis sa pure esthétique jusqu'au contrôle de ses mobilités à diverses échelles micro, méso et macro. Remarquons que l'objet d'étude est bien la maritorialité et non la maritimité, qui désigne plutôt un résultat de maritimisation des politiques, économie, usages et pratiques de la mer par l'État et l'industrie. Les théories du cadre géographique structuraliste -- dont la spatialisation des phénomènes à l'objet et celles de l'interdit initial de propriété et de la forme urbaine -- serviront à modeler un nécessaire domaine d'océanologie humaine, afin d'exposer le processus de la génération de l'espace océanologique humanisé du Saint-Laurent et de la Laurentie. Dans cette génération s'assemblent en séquence des savoirs et les valeurs axiologiques, déclencheurs de désirs et fondements de normativités, puis la catégorisation de l'espace en domaines et les discontinuités qui les joignent, et jusqu'aux contrôles des mobilités et des positions de ses utilisateurs. Les gens du Québec tournent-ils vraiment le dos à la Laurentie? Comment et pourquoi cela se pourrait-il? Quelque détour de leur géographie et de leur histoire les en aurait-il déviés? Le Saint-Laurent fait-il partie du territoire du Québec? La recherche raisonnera de façon inédite les causes et les effets d'une exclusion ou d'une privation de ce maritoire laurentin, pourtant réputé patrimonial et fondateur d'identité, et tentera de trouver réponse à la question à qui appartient le Saint-Laurent? / In Quebec, for many people, the topographical certainty of the St. Lawrence, with its one-upmanship of superlatives, is endowed with a powerful genius loci seemingly well anchored in space and time. Some area of its humanized shores, considered as part of Laurentia, is also bathed in a variably maritime atmosphere, inherited or constructed, but difficult to qualify and still less quantifiable. Delicate to circumscribe, but certainly of maritime culture, Laurentia is both place -- the shore, seen from land -- and concept -- the combination of the St. Lawrence and its coasts, seen from the sea. Nevertheless, individually and collectively, and in contrast to their taking of the land, the forest, other resources and recently the North, the people of Quebec seem to be only timidly joining in and representing Laurentia, and without consensus. Obviously, in an apparent general ignorance of the essential Laurentine qualities, these are constrained from an improbable physical access, in a context of uncertain property and extreme political, economic, technical and cultural regulations. Geographical concepts must be introduced and implemented to scientifically study this relationship to the St. Lawrence, the contemporary ways in which these terrine actors generally do not claim their sea, yet so significant and even turn their backs on it. Maritoriality is a new and unexplored field of study in human geography. In specific context of “maritime territoriality”, it constructs and questions the modalities of human-to-the-sea relations, of individual and collective human ties with an uninhabitable and uninhabited space, albeit humanized and weakly anthropized. Laurentia then takes conceptual dimensions beyond its simple maritorial locus already mentioned, in terms of perceptions, representations, conceptions and affections, from its pure aesthetics to the control of its mobility, at various micro, meso and macro scales. Do consider that the object of study is indeed maritoriality and not maritimity, which refers rather to a result of the maritimization of the policies, economy, uses and practises of the sea by the State and the industry. The theories of the structural geography framework -- including the spatialization of phenomena to object and those of the initial prohibition of property and the urban form -- will be used to model a necessary field of human oceanology, conducive to exposing the process of the generation of humanized oceanological space of the St. Lawrence and Laurentia. Assembled in sequence in this generation are knowledge and axiological values, triggering desires and founding normativities, then categorization of space into domains and the discontinuities that join them, and up to the controls of the mobility and positions of its users. Are the people of Quebec really turning their backs on Laurentia? How and why could this happen? Has some detour in their geography and history led them astray? Is the St. Lawrence part of Quebec's territory? This unprecedented research will examine the causes and effects of an exclusion or deprivation of this Laurentine maritory, yet reputed patrimonial and identity builder, and will attempt to find answers to the question: to whom does the St. Lawrence belong?

One of the greatest challenges in nonlinear optics microscopy is the search for new contrast mechanisms. This is one of the reasons of the increasing interest in polarimetric nonlinear optics in the last couple of decades. In this work we have explored the potential of four-wave mixing in probing vibrational and structural symmetries in molecular media. In particular, we have been concerned with coherent Raman scattering (CRS), either at resonance or not. We have developed a theoretical model allowing to determine the structures of the susceptibility tensors from symmetry considerations, involving both the spatial structure of the medium and the vibration of specific molecular modes. Experimental results on isotropic sample, crystals and biomolecular assemblies were successfully achieved. Polarimetric measurements at resonance provide information on the symmetry of the addressed vibrational modes and on departure from Kleinman symmetry conditions. Nonresonant polarimetric measurements are able to reveal departure from isotropy in cubic crystals and the symmetry order and orientation of molecular distribution in biomolecular assemblies, such as collagen fibers. In particular, we have shown that higher-order molecular symmetries can only be probed by high-order nonlinear optical processes. Finally, this work has demonstrated the great potential of polarimetric four-wave mixing as a powerful contrast mechanism, providing structural selectivity in microscopy imaging. When it is further associated with a resonant process (such as CRS), it provides also chemical selectivity, allowing a complete description of the sample, involving both structural and vibrational symmetries.

Les matériaux des zones de sutures et des nappes ophiolitiques représentent les témoins essentiels des différents stades d'évolution des anciennes aires océaniques et de leurs marges. Cette étude présente l'analyse lithostratigraphique et structurale des divers constituants de la suture téthysienne d'une partie des Alpes franco-italiennes nord-occidentales. Il s'agit plus précisément de l'étude du complexe des Schistes lustrés le long de la chaîne frontière franco-italienne dans la région du Mont Cenis (régions de Suse, Italie et de Lanslebourg, France). Une partie du massif péridotitique de Lanzo (Nord de Turin), dans ses limites avec le massif de Sesia notamment, la klippe des Schistes lustrés du Mont Jovet (région de Moûtiers, France) ainsi que la zone valaisanne à la latitude de Bourg Saint Maurice ont aussi été analysées. Ce travail, essentiellement qualitatif, tient compte des données pétrologiques, métamorphiques et radiochronologiques connues. Les Schistes lustrés appartiennent à trois ensembles distincts d'unités lithostructurales. Les deux ensembles inférieurs, issus de la paléomarge européenne pour le plus bas et du paléodomaine océanique pour l'autre, comportent des calcschistes et des marbres caractérisés par un détritisme syn-orogénique d'origine mixte, océanique et continentale. L'importance de ce détritisme, en volume et en taille des éléments remaniés, ophiolitique ou non, décroît notamment des unités océaniques les plus basses vers les unités hautes. Bien qu'encore sujettes à discussion, les datations des vestiges fossiles ainsi que les intervalles radio chronologiques des métamorphismes convergent tous vers une seule conclusion: ces schistes lustrés appartiennent au Crétacé supérieur. Nous avons donc affaire à des flyschs néocrétacés. L'unité la mieux connue de l'ensemble supérieur, non reconnue sur notre secteur d'étude, est constituée exclusivement de métasédiments terrigènes dépourvus de clastes ophiolitiques, datés du Crétacé terminal [Deville, 1986]. Ces dépôts du Crétacé supérieur sont interprétés comme les conséquences sédimentaires de deux épisodes essentiels de la fermeture de l'océan téthysien, à partir du Crétacé moyen et durant le Crétacé supérieur. Les Schistes lustrés de la région de Lanzo et le massif péridotitique de Lanzo d'une part, les Schistes lustrés de la Klippe du Jovet d'autre part, s'intègrent sans difficulté dans le schéma précédent. Les premiers s'apparentent à ceux des unités océaniques les plus basses structuralement, les seconds à ceux des unités océaniques les plus hautes. Un modèle lithosphérique du massif de Lanzo est par ailleurs proposé, dans lequel ce massif n'est plus en relation avec le manteau apulien, comme cela était présenté jusqu'à maintenant. La zone valaisanne en France, dans la région de Bourg-Saint-Maurice est en dernier lieu réexaminée. Le Flysch valaisan repose stratigraphiquement sur les Roches vertes du Versoyen. Les microfaunes découvertes, qui complètent celles connues, imposent d'attribuer à ce Flysch un âge post-barrêmo-aptien. En outre, les Roches vertes sont considérées comme issues d'un domaine cratonique aminci et partiellement océanisé, localisé sur la bordure occidentale du domaine briançonnais. Si ce complexe essentiellement volcanogènique se met en place pendant le Crétacé, si l'âge du métamorphisme qui l'affecte, calé vers 60-70 Ma, est confirmé et si le Flysch a connu au même moment ces mêmes conditions métamorphiques, alors ce dernier est post BarrêmoAptien et aussi anté-Tertiaire, c'est-à-dire en définitive Crétacé supérieur. En conclusion, un modèle d'évolution de la suture téthysienne est proposé, tenant compte des données de la transversale étudiée.

Les phénomènes qui régissent l'évolution d'un bassin sédimentaire et modifient sa géométrie laissent une empreinte dans l'organisation des dépôts. Aux phénomènes qui accroissent à long terme le volume du bassin (étirement initial, rééquilibrage thermique de la lithosphère, compensation isostasique du poids des sédiments qui se déposent) se superposent des fluctuations plus rapides de l'espace disponible. L'évolution d'un bassin peut donc être décryptée en étudiant les corps sédimentaires, et plus particulièrement: 1) la géométrie des discontinuités qui les limitent (failles et discordances), 2) les faciès qui les constituent, 3) leur âge, 4) les variations de leurs propriétés physiques (radioactivité, porosité ... ). L'utilisation des méthodes de décompaction, des diagrammes de mouvements différentiels, de substitution des structures plissées/faillées (coupes équilibrées) permet de quantifier les mouvements qui affectent le substratum du bassin. L'application de ces méthodes au Broad Fourteens Basin (Sud de la Mer du Nord), à partir d'une base de données constituée par 3000 km de sismique réflexion et une cinquantaine de puits (consultée grâce à Elf-Petroland) a mis en évidence une histoire polyphasée complexe, affectant une couverture décollée de son socle. Cette histoire est composée principalement : 1) d'une extension jurassique, puis 2) d'une extension crétacé inférieur avec une subsidence dans le bassin d'environ 1000 m et une importante surrection initiale des marges, 3) d'une compression avec une composante décrochante sénestre au Crétacé supérieur le long des failles de bordure orientées N160° ; elle a induit une érosion du centre du bassin de plus de 3000 m, et un raccourcissement horizontai de l'ordre de 10 %, 4) d'une extension néogène plus limitée. Une analyse détaillée a permis de mettre en évidence seize unités sédimentaires retraçant les mouvements tectoniques et les fluctuations relatives du niveau de la mer au Crétacé dans le bassin. Des corrélations temporelles entre le Broad Fourteens Basin, d'autres bassins intraplaques et la cinématique des plaques aux pourtours de l'Europe de l'Ouest semblent envisageables. La réorganisation des plaques mondiales paraît être à l'origine de variations horizontales des contraintes intraplaques, qui induisent à la fois des réactivations d'accidents préexistants de la croûte fragile et des mouvements verticaux (flambage) de la lithosphère.

Ce travail concerne l'étude hydrogéologique de quatre sources situées dans les chaînons béarnais (Pyrénées-Atlantiques). Afin d'améliorer la connaissance de la géométrie et du fonctionnement de ces aquifères, une approche pluridisciplinaire a été choisie. Des expérimentations géophysiques et un suivi hydrogéochimique, couplés à des campagnes de terrain, ont ainsi été mises en œuvre. Dans un premier temps, une étude statistique des paramètres climatiques de la région a montré une hausse significative de la température depuis cinquante ans, qui s'accentue depuis les années 70. A partir des images de résistivité électrique et des mesures de la fracturation des massifs carbonatés, la géométrie des contacts géologiques et la structure des aquifères ont pu être définies. De plus, il a été possible d'identifier la présence systématique d'un niveau argileux continu le long de la limite sud des aquifères locaux. Les bassins d'alimentation de la plupart des sources des chaînons béarnais sont ainsi limités par cet écran imperméable au sud et par les marnes de l'Albien au nord. L'analyse de l'évolution des paramètres physico-chimiques mesurés au cours de deux cycles hydrologiques, a permis de mettre en évidence deux fonctionnements distincts. Deux sources émergent d'un aquifère karstique tandis que les deux autres sont issues d'un aquifère de type fissuré. Les différences de variation des ions majeurs et des isotopes stables (13C) illustrent de courts temps de résidence au sein des systèmes karstiques et le caractère inertiel des aquifères carbonatés fissurés. De plus, l'analyse des relations conductivité/turbidité a fourni des informations sur le degré de karstification des deux systèmes karstiques et sur leur fonctionnement hydrodynamique. En conclusion, ce travail apporte un point de vue nouveau sur la gestion de l'eau dans ce secteur et a permis de proposer un modèle d'étude qui aide à la caractérisation des ressources en eau souterraine de la région.

Un des principaux défis du domaine de la biologie structurale est l'obtention d'informations à haute résolution sur les grandes macromolécules biologiques. En raison de leurs tailles et de leurs flexibilités, les techniques traditionnelles de biologie structurales sont souvent impuissantes. Une des techniques prometteuses est la microscopie à force atomique (AFM). Contrairement à la microscopie optique, l'AFM utilise une sonde mécanique de très faible taille (<10 nm) pour obtenir des informations topographiques sur du matériel biologique isolé et déposé sur des surfaces ultras plates. L'objectif du travail de thèse est de développer les outils informatiques pour permettre la modélisation de grandes macromolécules au niveau atomique tout en intégrant des contraintes topologiques obtenues par l'imagerie AFM. À partir d'images AFM de hauteur, à haute résolution, un protocole d'assemblage de domaines protéiques a été mis au point. Il utilise une recherche exhaustive dans l'espace tridimensionnel réel de toutes les orientations possibles des domaines de la macromolécule à modéliser qui respectent les contours imposés par l'image AFM. Un jeu de contraintes de distance entre chacun des domaines permet un premier tri des modèles candidats. Un classement final est attribué à chaque modèle selon un score appelé EFactor, estimateur de la ressemblance entre la surface topographique expérimentale et celle du modèle. Le protocole a été validé sur le système modèle que sont les anticorps. Il a été également utilisé pour reconstruire une particule virale (virus de la mosaïque du tabac) et assembler la structure tétramérique de la protéine membranaire l'aquaporine Z. / A major challenge in the field of structural biology is to obtain high-resolution information on the major biological macromolecules. Because of their size and their flexibility, the traditional techniques of structural biology are often powerless. One of the promising techniques is atomic force microscopy (AFM). Unlike optical microscopy, AFM uses a mechanical probe of very small size (<10 nm) to obtain topographical information on isolated biological material deposited on ultra flat surfaces. The aim of the thesis was to develop tools to enable the modeling of large macromolecules at the atomic level while incorporating topological constraints obtained by AFM imaging. Using high resolution AFM height images, a protocol for assembling protein domains has been developed. It uses an exhaustive search in real three-dimensional space of all possible orientations of the macromolecule's domains respecting the boundaries imposed by the AFM topographical image. A set of distance constraints between each of the domains allows an initial screening of candidate models. A final ranking is assigned to each model according to a score called EFactor, estimator of the similarity between the experimental topography and the model. The protocol was validated on model systems that are antibodies. It was also used to reconstruct a virus particle (tobacco mosaic virus) and assemble the tetrameric structure of the membrane protein aquaporin Z.