O câncer de mama apresenta alta incidência na população feminina, sendo considerado uma das principais causas de morte por câncer entre mulheres em diversos países; devido a isso, tornam-se essenciais estudos de sobrevivência na área oncológica, para avaliar resultados, fatores relacionados e delinear o comportamento da doença. Este estudo teve como objetivo avaliar a taxa de sobrevida em mulheres com câncer de mama atendidas em um serviço de reabilitação de mulheres mastectomizadas, tratadas em hospital universitário de nível terciário, localizado no interior da região Sudeste do país. A coorte foi identificada a partir de busca de atendimentos realizados no núcleo de reabilitação de 1989 a 2014. A coleta foi realizada em dados secundários, complementado por busca no banco do Sistema de Informação sobre Mortalidade (SIM), contato telefônico e distribuição de cartas. As principais variáveis analisadas foram as sociodemográficas: idade ao diagnóstico, cor da pele, estado civil e procedência; as clínicas e de tratamento: tamanho do tumor, estadiamento, marcadores tumorais, hormonioterapia, cirurgia e radioterapia, entre outras. Os dados foram apresentados de maneira descritiva por meio de números absolutos, medidas de tendência central e de variabilidade. As funções de sobrevida foram calculadas por meio do método de Kaplan- Meier, e para comparação entre as curvas foi utilizado o teste Log Rank. O nível de significância considerado para o estudo foi de 0,05. Não foi realizado neste estudo o modelo de riscos proporcionais de Cox. Os resultados deste estudo indicam que a sobrevida global em 60 meses desta população foi de 78,5%. E a sobrevida livre de doença (SLD) foi 75,8% em 60 meses. Apresentaram diferenças significativas em relação à ocorrência ao desfecho analisado, que foi o óbito, das características sociodemográficas, apenas as variáveis estado civil (p < 0,007) e escolaridade (p < 0,000). Na análise das curvas de sobrevivência, identificamos uma sobrevivência menor para aquelas mulheres que tiveram até 4 anos de estudo. Referente às características clínicas, o tipo histológico mais frequente foi o CDI com (82,2%); 49,9% apresentavam tumor entre 2 e 5 cm e o estádio clínico predominante no diagnóstico foi o IIA (25,7%), o estadiamento e presença de receptor de hormônio estrógeno e progesterona positivos, apresentaram uma relação estatisticamente significativa com a ocorrência do óbito (p < 0,000) e diferenças significativas nas curvas de sobrevivência. Aquelas que não desenvolveram metástase à distância apresentaram sobrevida de 96,9% em cinco anos, comparado com aquelas que tiveram metástase em 5 anos (50%). Houve significância pelo teste de Log-rank (p<0,000) nessa variável. Os resultados deste estudo fortalecem a importância do diagnóstico precoce através do rastreamento por meio do exame clínico das mamas e de mamografia, aliado ao tratamento eficaz. A análise da sobrevivência dessas mulheres possibilitou conhecer o perfil de mulheres atendidas em um serviço público de saúde, de nível terciário/quaternário, de alta complexidade e de referência. Estas informações são extremamente úteis para os gestores de saúde adotarem medidas voltadas para a prevenção e controle da doença, assim como para avaliações da qualidade do cuidado prestado e acessibilidade ao sistema de saúde / Breast cancer has a high incidence in the female population and is considered a major cause of cancer death among women in many countries, there fore it is essential more survival studies in oncology to evaluate results, related factors and outline the behavior disease. This study aimed to evaluate the survival rate of women treated in a rehabilitation service of mastectomies at the university hospital of tertiary level, located in the Southeast region of the country. The cohort was identified from search services performed in the rehabilitation center from 1989 to 2014. The data were collected on secondary data, complemented by search the database of the Mortality Information System (MIS), telephone call and distribution of cards. The main demographic variables were: age at diagnosis, skin color, marital status and origin, clinical and treatment: tumor size, stage, tumor markers, hormone therapy, surgery and radiation, among others. The data were presented descriptively by absolute numbers, measures of central tendency and variability. Survival functions were calculated using the Kaplan-Meier method and to compare the curves we used the log rank test. The level of significance for the study was 0.05. It was not done in this study the model of Cox proportional hazards. The results indicated that overall survival at 60 months of this population was 78.5%, and the specific-survival was 75.8% in 60 months. Only the variables marital status (p <0.007) and education (p <0.000), the sociodemographic characteristics, showed significant differences in the occurrence analyzed the outcome, which was death. In the analysis of the survival curves we identified a lower survival for those women who had up to 4 years of study. Regarding the clinical features, the most common histological type was with CDI (82.2%); 49.9% had tumors between 2 and 5 cm and the predominant clinical stage at diagnosis was the IIA (25.7%), the staging and the presence of the hormone estrogen and progesterone receptor positive showed a statistically significant related to the occurrence of death (p <0.000) and significant differences in survival curves. Those who did not develop distant metastases had a survival rate of 96.9% in five years compared with those who had metastasis in 5 years (50%). There were significant by log-rank test (p <0.000) in this variable. The results of this study reinforce the importance of early diagnosis through screening by clinical breast examination and mammography combined with effective treatment. The analysis of the survival of these women showed the profile of women in reference a public health service, tertiary / quaternary level, high complexity. These informations are extremely useful for health managers to adopt measures aimed at preventing and controlling the disease, as well as the quality of service and accessibility to health care system assessments

O câncer é responsável por aproximadamente 13% de todas as mortes no mundo, sendo que elas ocorrem principalmente em pessoas que são diagnosticadas tardiamente e em estágios avançados. Devido às suas características devastadoras e à prevalência cada vez maior da doença, é inquestionável a necessidade de investigações e pesquisas constantes na área, no sentido de aprimorar a detecção precoce e auxiliar em sua prevenção e tratamento. Dentre as diversas abordagens existentes, uma alternativa é a criação de técnicas para estimar o período de crescimento \"silencioso\" do câncer, que significa conhecer o momento do início do processo cancerígeno, também chamado de período de latência. A partir da revisão da literatura realizada, foi verificada uma escassez de modelos que estimam a latência do câncer, indicando a necessidade de estudo sobre o tema. Nesse contexto, métodos de análise de sobrevivência surgem como uma ferramenta útil para a construção desses modelos. No presente trabalho, é apresentada uma revisão de um modelo já existente, bem como sua formulação e métodos de estimação. Além disso, apresenta-se uma aplicação em um conjunto de dados reais e uma discussão dos resultados obtidos.Foi identificada a necessidade da formulação de um novo modelo, visto que o método estudado apresenta algumas limitações. Com isso são apresentadas 3 alternativas de modelos que solucionam os pontos apresentados na discussão, com respectivas aplicações. / Cancer is responsible for about 13% of all deaths in the world occuring mainly in people who are late diagnosed and in advanced stages. Due to its devastating characteristics and the growing prevalence of the disease, it is unquestionable the need of constant investigation and research in this area, in order to improve the early detection and to help in its prevention and treatment. Among the existing approaches, one alternative is the creation of techniques to estimate the \"silent\" growth period of cancer, which means to know the beginning moment of the carcinogen period, also known as latency period. In a literature review, it was found an shortage of models that estimate the latency of cancer, indicating the need of study about this theme. In this context, survival analysis methods appear as an useful tool to build these models. In this study, a review of an existing model is presented, as well as its formulation and estimation methods. Furthermore, an application on real data and a discussion of the obtained results are made. As a result, it was identified the need to formulate a new model, because of the limitations of the studied one. We present 3 alternative models that solve the points presented in the discussion, with applications.

Analyzing life-time data with long-term survivors is an important topic in medical application. Cure models are usually used to analyze survival data with the proportion of cure subjects or long-term survivors. In order to include the propor- tion of cure subjects, mixture and non-mixture cure models are considered. In this dissertation, we utilize both maximum likelihood and Bayesian methods to estimate model parameters. Simulation studies are carried out to verify the nite sample per- formance of the estimation methods. Real data analyses are reported to illustrate the goodness-of- t via Fr echet, Weibull and Exponentiated Exponential susceptible distributions. Among the three parametric susceptible distributions, Fr echet is the most promising. Next, we extend the non-mixture cure model to include a change point in a covariate for right censored data. The smoothed likelihood approach is used to address the problem of a log-likelihood function which is not di erentiable with respect to the change point. The simulation study is based on the non-mixture change point cure model with an exponential distribution for the susceptible subjects. The simulation results revealed a convincing performance of the proposed method of estimation. / Includes bibliography. / Dissertation (Ph.D.)--Florida Atlantic University, 2018. / FAU Electronic Theses and Dissertations Collection

A reposição de dentes perdidos por meio de próteses implanto-suportadas tornou-se uma opção de tratamento previsível e aceitável tanto para pacientes parcialmente como totalmente desdentados. Após sua instalação, os implantes de titânio interagem com fluidos biológicos e tecidos, sendo que a direta aposição óssea sobre a superfície do titânio é fundamental para o carregamento desses implantes. As características superficiais dos implantes podem influenciar na interação implanteosso, na taxa e qualidade da osseointegração. O objetivo desse estudo clínico retrospectivo foi avaliar a taxa de sobrevivência de implantes osseointegrados com superfície Acqua e verificar se existe interferência de determinadas variáveis na perda de implantes: região de instalação, tipo de reabilitação protética, tipo de carregamento, tempo de carregamento, experiência do cirurgião, enxertos ósseos, tipo de sítio para instalação, uso de tabaco e diabetes. Foram avaliados 131 pacientes, totalizando 331 implantes instalados com conexão interna tipo cone Morse e superfície Acqua. Os dados foram coletados de prontuários clínicos e tabulados e nenhum paciente foi excluído devido a qualquer doença sistêmica, gênero, raça, hábitos parafuncionais e tabagismo. A análise estatística incluiu estatísticas descritivas para todos os parâmetros clínicos avaliados e foi aplicado o método exato de Fisher. Foram avaliados implantes instalados anteriormente a março de 2014 e o tempo de acompanhamento do carregamento dos implantes foi de 0 a 55 meses. Entre as variáveis avaliadas apenas o tipo de reabilitação protética influenciou de forma significativa na falha de implantes. Sete implantes (2,11%) foram considerados perdidos, totalizando uma taxa de sobrevivência de 97,89%. Os implantes com superfície Acqua apresentaram alto índice de sobrevivência nas mais diversas situações e com a associação de diversos fatores de risco, provando ser uma superfície confiável e apropriada para a aplicação na prática clínica diária. / The replacement of lost teeth by dental implant has become a predictable and acceptable treatment option for patients either partially or fully edentulous. After place, titanium implants surface interact with biological fluids and tissues, and direct bone apposition on the titanium surface is critical for loading these implants. The surface characteristics of implants can influence the implant-bone interaction in the rate and quality of osseointegration. The aim of this retrospective clinical study was to evaluate the dental implants survival rate with Acqua surface and check for interference of certain variables in the loss of implants: placed region, type of prosthetic rehabilitation, loading type, load time, surgeon experience, bone grafts, installation site, tobacco use and diabetes. One hundred thirty one patients, totaling 331 implants inserted with internal Morse taper connection and Acqua surface. Data were collected from medical records and tabulated and no patient was excluded due to any systemic disease, gender, race, parafunctional habits and smoking. Statistical analysis included descriptive statistics for all clinical parameters evaluated and was applied Fishers exact test. Were evaluated implants placed prior to March 2014 and the follow-up time of loading of the implants was 0-55 months. Among the variables evaluated only the type of prosthetic rehabilitation influenced significantly in implant failure. Seven implants (2.11%) were considered lost, amounting to a survival rate of 97.89%. Implants with Acqua surface showed high survival rate in different situations and with the association of various risk factors, proving to be a reliable and suitable surface for application in clinical practice.

Personalised medicine is replacing the one-drug-fits-all approach with many prognostic models incorporating biomarkers available for risk stratifying patients. Evidence has been emerging that the effects of biomarkers change over time and therefore violate the assumption of proportional hazards when performing Cox regression. Analysis using the Cox model when the assumptions are invalid can result in misleading conclusions. This thesis reviews existing approaches for the analysis of non-proportional effects with respect to survival data. A number of well-developed approaches were identified but to date their uptake in practice has been limited. There is a need for more widespread use of flexible modelling to move away from standard analysis using a Cox model when the assumption of proportional hazards is violated. Two novel approaches were applied to investigate the impact of follow-up duration on two residual risk models, IHC4 and Mammostrat, for predicting risk in early breast cancers using two studies with different lengths of follow up; the Edinburgh Breast Conservation Series (BCS) and the Tamoxifen versus Exemestane Adjuvant Multinational (TEAM) trial. Similar results were observed between the two approaches that were considered, the multivariable fractional polynomial time (MFPT) approach and Royston-Parmer flexible parametric models, with their respective advantages and disadvantages being discussed. The analyses identified a strong time-varying effect of IHC4 score with the prognostic effect of IHC4 score on time-to distant recurrence decreasing with increasing follow-up time. Mammostrat score identified a group of patients with an increased risk of distant recurrence over full follow-up in the TEAM and Edinburgh BCS cohorts. The results suggest a combined IHC4 and Mammostrat risk score could provide information on the risk of recurrence and warrants further study.

Com a evolução do Biomateriais houve melhorias nas opções de tratamentos e atualmente são utilizados em substituição de partes do corpo que foram perdidas e promovem a recuperação de funções biológicas. Dentre eles existem as chamadas Biocerâmicas, que incluem alumina, zircônia e derivadas de fosfato de cálcio. A hidroxiapatita possui composição e estrutura minerais semelhantes à fase mineral óssea e apresenta como propriedades a biocompatibilidade, osteocondutividade e bioatividade. O trabalho avaliou a viabilidade celular em cerâmica de hidroxiapatita experimental de origem bovina em comparação com dois tipos de zircônia comerciais e liga de titânio comercialmente puro, para que futuramente possa ser utilizada como material base para implantes dentários. A avaliação in vitro foi realizada por meio de testes nos quais células pré-osteoblásticas cultivadas de linhagem murina MC3T3-E1 foram colocadas em contato indireto e direto com estes materiais. Para viabilidade celular (n=8) foram feitos testes de ensaio MTT e Cristal Violeta em duplicata e após 24, 48 e 72 horas os níveis de absorbâncias foram analisados por meio de espectrofotometria no leitor de Elisa. Para as analises por microscopia eletrônica de varredura (n=6) as células foram plaqueadas diretamente sobre as superfícies dos discos, fixadas em vapor de tetróxido de ósmio 2% após 24 e 48 horas, seguido da metalização após 48 horas da fixação das células para análise em Microscópio Eletrônico de Varredura. Os resultados para viabilidade indireta foram submetidos ao teste paramétrico ANOVA, seguido de teste de Tukey (p<0,05). Tanto no teste de MTT quanto no Cristal Violeta, de acordo com o grupo controle positivo, todos os grupos apresentaram resultados satisfatórios. A cerâmica de hidroxiapatita não apresentou diferença estatística significante, demonstrando não ser um material citotóxico. Pelas imagens geradas no MEV do teste de viabilidade direta, verificou-se que houve adesão e proliferação das células nos dois períodos sobre as superfícies dos materiais. Portanto, pode-se afirmar que a cerâmica de hidroxiapatita apresentou-se como um material biocompatível. / With the evolution biomaterials there were improvements in treatment options, and are currently used in replacement body parts that were lost and promote the recovery of biological functions. Among them are the bioceramic which include alumina, zirconia and calcium phosphate derivative. Hydroxyapatite has mineral composition and structure similar to bone mineral phase and can be used as a biomaterial having biocompatibility, osteoconductivity and bioactivity. The study evaluated the cell viability in experimental hydroxyapatite ceramic bovine compared the two types of commercial zirconia and titanium alloy commercially pure, so that in future it can be used as base material for dental implants. In vitro evaluation was carried by means of tests in which the pre-osteoblastic cells MC3T3-E1 murine lineage cultured were placed in indirect and direct contact with these materials. For cell viability (n=8) were carried MTT assay and Crystal Violet tests in duplicate and after 24, 48 and 72 hours the absorbance levels were analyzed by spectrophotometry Elisa reader. For analysis by Scanning Electron Microscope variable pressure (n = 6) cells were plated directly on the discs surfaces, fixed in osmium tetroxide steam 2% after 24 and 48 hours, followed by metallization after 48 of cells fixation. The results for the cell viability were submitted to parametric test ANOVA, followed by Tukey test (p<0.05). Both in the MTT assay as Crystal Violet all groups exhibited satisfactory results absent cytotoxicity. By means of the SEM images produced, it was found that there was adhesion and proliferation of cells on the materials surfaces in the two periods. Therefore, it can be stated that the hydroxyapatite ceramic was presented as a biocompatible material.

Usualmente a análise de sobrevivência considera a modelagem da função da taxa de falha ou função de risco. Uma alternativa a essa visão é estudar a vida residual, que em alguns casos é mais intuitiva do que a função de risco. A vida residual é o tempo de sobrevida adicional de um indivíduo que sobreviveu até um dado instante t0. Este trabalho descreve técnicas semiparamétricas e não paramétricas para estimar a média e a mediana de vida residual em uma população, testes para igualdade dessas medidas em duas populações e também modelos de regressão. Tais técnicas já foram testadas anteriormente em dados com baixa presença de censura; aqui elas são aplicadas a um conjunto de dados de pacientes com insuficiência cardíaca que possui uma alta quantidade de observações censuradas. / Usually, survival analysis is based on the modeling of the hazard function. One alternative approach is to consider the residual life, which would be more intuitive than the hazard function. Residual lifetime is the remaining survival time of a person given he or she survived a given time point t0. We describe semiparametric and non-parametric techniques for mean and median residual life estimation in a one-sample population, as well as tests for two-sample cases and regression models. Such techniques were previously tested for moderate censored data; here we apply them to heart-failure patients data with a high rate of censoring.

Introdução: As bronquiectasias não-fibrocísticas são uma doença supurativa crônica caracterizada pela dilatação anormal e irreversível de um ou mais brônquios e são a via final de uma grande variedade de doenças, embora possam não ter uma causa identificável. Elas levam ao comprometimento da função pulmonar, colonização bacteriana crônica das vias aéreas, infecções respiratórias de repetição, redução da tolerância ao exercício e piora na qualidade de vida, entre outras coisas. Existem poucos estudos na literatura que abordam os fatores relacionados ao prognóstico desses pacientes. Objetivos: O objetivo deste estudo é avaliar a taxa de mortalidade e os fatores relacionados à morbidade e à mortalidade de uma coorte de pacientes com bronquiectasias não-fibrocísticas durante um seguimento de 6 a 8 anos e testar a habilidade dos escores Bronchiectasis Severity Index (BSI) e FACED de predizer a mortalidade dos pacientes na nossa coorte. Materiais e métodos: Trata-se de um estudo prospectivo de uma coorte de 70 pacientes com bronquiectasias não-fibrocísticas que foram originalmente recrutados de Maio de 2008 a Agosto de 2010. O estudo original forneceu os dados necessários para a classificação de gravidade da doença segundo os escores BSI e FACED e todos os dados usados para esse propósito foram coletados na avaliação inicial. Após o cálculo dos escores, os pacientes foram separados em diferentes grupos de acordo com a gravidade da doença. Nós também avaliamos os prontuários de todos os pacientes para determinar o número de hospitalizações por exacerbações após a avaliação inicial, o desfecho a longo prazo para cada paciente e a causa do desfecho quando apropriado. Os desfechos foram definidos como favoráveis e desfavoráveis (sobreviventes submetidos a transplante pulmonar e óbito por todas as causas) e foram determinados até 1° de março de 2016. Resultados: Dos 70 pacientes, 27 (38,57%) haviam morrido e 1 (1,43%) sido submetido ao transplante pulmonar. Análise de sobrevivência demonstrou que o tempo médio para a ocorrência dos desfechos desfavoráveis foi de 74,67 ± 4,00 meses (IC 66,82 – 82,52). A principal causa de óbito foi a exacerbação infecciosa aguda das bronquiectasias (60,7% dos óbitos). Na nossa coorte, o modelo de risco proporcional de Cox identificou a idade (p=0,035; HR 1,04; IC 1,01 – 1,08), o VEF1 % do previsto (p=0,045; HR 0,97; IC 0,93 – 0,99) e a Pemax (p=0,016; HR 0,97; IC 0,94 – 0,99) como preditores independentes de desfechos desfavoráveis. A maior parte dos pacientes (44,3%) foi classificada como tendo doença grave pelo escore BSI e 97,2% como tendo doença leve ou moderada (48,6% cada) pelo escore FACED. De maneira geral, o escore FACED foi um melhor preditor de desfechos desfavoráveis na nossa população de pacientes (log-rank test, FACED p = 0,001 e BSI p = 0,286). A análise da curva ROC demonstrou que ambos os escores foram similares na predição de desfechos desfavoráveis (área sob a curva BSI 0,65; FACED 0,66), mas nenhum deles foi um bom preditor para essa população específica de pacientes. Conclusão: Os pacientes da nossa coorte apresentaram maior comprometimento da função pulmonar e uma taxa de mortalidade mais alta do que o previamente reportado na literatura. A principal causa de óbito foi a exacerbação infecciosa aguda da doença. A idade mais avançada, o VEF1 % do previsto e uma Pemax mais baixa foram os fatores independentemente associados aos desfechos desfavoráveis. Os escores FACED e BSI não foram bons preditores de mortalidade para este grupo de pacientes, contrastando com os dados disponíveis na literatura até o momento, portanto outros estudos incluindo um maior número de pacientes são necessários para validar o uso deles na nossa população. / Background: Non-cystic fibrosis bronchiectasis is a chronic suppurative disease characterized by an abnormal and irreversible dilation of one or more bronchi. It is the final pathway of a large number of diseases, although it can be present without an identifiable cause. It leads to impaired lung function, chronic bacterial colonization, recurrent respiratory tract infections, reduced exercise tolerance and poor quality of life, among other things. There are few studies about prognostic factors in these patients. Objectives: The goal of this study is to assess the mortality rates and the factors related to the morbidity and mortality on a cohort of patients with non cystic fibrosis bronchiectasis during a 6 to 8-year follow-up and to test the ability of the Bronchiectasis Severity Index (BSI) and FACED scores in predicting mortality in our cohort. Materials and methods: This was a prospective cohort analysis of 70 patients with non-cystic fibrosis bronchiectasis who were originally recruited from May 2008 to August 2010. The original study records provided the necessary data for the determination of the disease severity scores (BSI and FACED) and all the data used for that purpose were collected at baseline. After the calculation of the scores, patients were separated into different groups according to disease severity. We also reviewed the records of all patients to determine the number of hospitalizations for exacerbations after baseline, the long-term outcome for each patient and the cause of the outcome when appropriate. Outcomes were defined as favorable and unfavorable (survivors who underwent lung transplantation and death from all causes) and were determined as of March 1st, 2016. Results: Out of 70 patients, 27 (38.57%) had died and 1 (1.43%) had undergone lung transplantation by the end of the study. Survival analysis demonstrated that the mean time for the occurrence of an unfavorable outcome was 74.67 ± 4.00 months (CI 66.82 – 82.52). The main cause of death among non-survivors was an acute infectious exacerbation of bronchiectasis (60.7% of the deceased). In our cohort, the multivariate Cox proportional hazard model analysis identified age (p=0.035; HR 1.04; CI 1.01 – 1.08), FEV1 % of predicted (p=0.045; HR 0.97; CI 0.93 – 0.99) and MEP (p=0.016; HR 0.97; CI 0.94 – 0.99) as independent predictors of unfavorable outcomes. Most patients (44.3%) were classified as having severe disease when BSI was used and 97.2% as having a mild or moderate disease (48.6% each) when FACED was used. Overall the FACED score was better at predicting unfavorable outcomes in our population of patients (log-rank test, FACED p = 0.001 and BSI p = 0.286). AUC from the ROC analysis shows us that both scores are similar in predicting poor outcomes in our cohort (BSI 0.65; FACED 0.66), but they weren't good predictors for this specific population. Conclusion: Patients in our cohort had worst lung function and a higher mortality rate than previously reported and the main cause of death among them was an acute infectious exacerbation of bronchiectasis. Older age, lower FEV1 % of predicted and lower MEP were independently linked to the occurrence of poor outcomes. FACED and BSI scores were not accurate in predicting mortality in our cohort, contradicting the available data at the moment, so other studies including a greater number of subjects are needed to validate their use in our population.

Procedimentos endodônticos regenerativos proporcionaram mudanças no tratamento de pacientes com dentes imaturos e periodontite apical possibilitando desenvolvimento radicular completo e menor incidência de fratura dental. Medicações intracanal são utilizadas para a realização da desinfecção; entretanto, o efeito delas sobre às células da papila apical é pouco elucidado. Adicionalmente, pouco se conhece a respeito do efeito destas substâncias sobre células previamente submetidas à condição pró- inflamatória. O objetivo deste estudo foi avaliar a citotoxicidade de medicações intracanal empregadas em procedimentos regenerativos em Endodontia sobre células de papila humana em cultura em condição fisiológica e ativada. Cultura de células foi estabelecida a partir da papila apical removida de um terceiro molar imaturo extraído. As substâncias estudadas foram a pasta tripla antibiótica modificada: ciprofloxacina, metronidazol e cefalosporina (1:1:1); CFC: ciprofloxacina, metronidazol e hidróxido de cálcio (1:1:2) e CFC modificado: ciprofloxacina, metronidazol e hidróxido de cálcio (2:2:1). Parte das células foram estimuladas previamente por ácido lipoteicóico (LTA) de Enterococcus faecalis por 7 dias. Após plaqueamento, células foram expostas a concentrações crescentes das medicações por 1, 3, 5 e 7 dias. Foram avaliados viabilidade celular por meio de brometo de 3-(4,5-dimetiliazol-2-il)-2,5-difeniltetrazólio (MTT) e liberação de óxido nítrico (NO) pelo método de Griess. A análise estatística foi realizada por meio de análise de variância a 1 critério (ANOVA) seguida de pós teste de Tukey, com nível de significância de 5%. O CFC modificado foi a medicação que demonstrou menor efeito citotóxico sobre a viabilidade celular nos tempos experimentais estudados, o CFC promoveu queda da viabilidade celular especialmente após 7 dias de contato. A pasta tripla antibiótica modificada resultou em comprometimento importante da viabilidade podendo ser considerada a mais citotóxica. A ativação celular por LTA resultou em níveis aumentados de atividade mitocondrial para todas as medicações sendo mais evidente nos períodos experimentais mais longos. A ativação celular também contribuiu para níveis maiores de óxido nítrico. Conclui-se que o efeito citotóxico das medicações testadas é dependente de sua concentração, tempo de contato e condição celular, sendo a pasta tripla antibiótica modificada a mais citotóxica em concentrações elevadas podendo implicar clinicamente na diminuição da viabilidade das células da papila apical podendo diminuir o sucesso dos procedimentos regenerativos. / Regenerative Endodontic procedures have provided changes in treatment of patients with immature teeth and apical periodontitis enabling full root development and lower incidence of dental fracture. Intracanal dressings are used for disinfection; however, their effect on apical papilla cells is poorly elucidated. Additionally, the effect of these substances on cells previously subjected to proinflammatory condition is still unknown. The aim of this study was to evaluate the cytotoxicity of intracanal dressings used in Endodontics regenerative procedures on cultured human apical papilla cells at physiologic and activated condition. Cell culture was established from the apical papilla removed from an extracted immature third molar. The substances studied were triple antibiotic modified paste: ciprofloxacin, metronidazole and cephalosporin (1:1:1); CFC: ciprofloxacin, metronidazole and calcium hydroxide (1:1:2) and modified CFC: ciprofloxacin , metronidazole and calcium hydroxide (2:2:1). Part of the cells was stimulated previously with lipotheichoic acid (LTA) of Enterococcus faecalis por 7 days. Once plated, cells were exposed to increasing concentration of the medications for 1, 3, 5 and 7 days. Cell viability was evaluated by means of 3-bromide (4.5-dimetiliazol-2-yl) -2.5-difeniltetraze (MTT) and Nitric Oxide (NO) release was assessed by the Griess method. The statistical analysis was done through analysis of variance with 1 criteria (ANOVA) followed by Tukey test with 5% of significance level. Modified CFC was the medication that demonstrated the less cytotoxic effect on cell viabilityat the experimental periods studied while CFC promoted significant decrease on cell viability specially after 7 days of contact. The modified triple antibiotic paste resulted in important alteration of cell viability being considered the most citotoxic. Cellular activation by LTA resulted in increased levels of mitochondrial activity for all medications being more evident at the longer experimental periods. Cellular activation also contributed to higher levels of nitric oxide release. In conclusion, the cytotoxic effect of the tested medications is dependent on concentration, time of contact and cellular condition, being the triple antibiotic modified paste the most cytotoxic in high concentrations leading clinically in the decreased of the cells viability of the apical papilla, decreasing the success of regenerative procedures.

Porcine Reproductive and Respiratory Syndrome (PRRS) is, globally, one of the costliest of diseases to the pig industry. Despite enormous efforts, methods such as vaccination strategies and herd management have failed to fully control the disease. Exploiting the genetic variation in host response could be included as part of a multifaceted approach to mitigate the devastating impact of this disease. Establishing the presence of genetic variation and its underlying genetic architecture are key to implementing genomic selection, which is considered a viable and safe long-term disease control strategy. This thesis explores the effect of natural PRRSV outbreaks on the reproductive performance of sows, and the underlying genetic influences on it. Litter records were available from two farms, where Porcine Reproductive and Respiratory Syndrome Virus (PRRSV) outbreaks had been confirmed using ELISA. One farm had full pedigree information, but for both farms 60K SNP genotypes were available. In both farms, performance records could be partitioned into an epidemic and non-epidemic phase using a previously established threshold method. The partitioning also identified a period of high reproductive failure not coinciding with a diagnosed PRRSV outbreak on one farm. This period was isolated and analysed separately. Linear mixed models were used to explore both genetic and non-genetic factors contributing to differences in reproductive performance associated with the two phases. This analysis identified five disease indicator traits identified showing significant differences (>95% CI) in least squares means between the epidemic and non-epidemic phase. These were the number of mummified, stillborn, dead and alive piglets per litter and the fraction of the total born dead. Alternative statistical models that accounted for differences in the severity of the individual PRRSV outbreaks were also considered throughout. Despite differences in the estimates associated with different models and farms, in general very low heritability estimates were obtained for these disease indicator traits during the non-epidemic phase, whereas the traits were found moderately heritable during the epidemic phase. Two genome wide association analyses methods were used to explore the distribution of the genetic effects throughout the genome: Family-based Score Test for Association (FASTA) and Genome-wide Rapid Analysis using Mixed Model and Regression (GRAMMAR). In addition, regional associations were studied using Regional Heritability Mapping (RHM). Associations were then further characterised using Measured Genotype (MG) analyses. Genome-wide significant associations were identified for five SNPs and one region. The regional association spans the region previously identified in an experimental challenge experiment of growing pigs, in association with viral load and weight gain. Different patterns of linkage disequilibrium (LD) are observed which may explain why this study and others failed to find single SNP effects at this location. One genome wide significant SNP on SSC15 was found between two previously identified SNPs associated with PRRSV mortality. Five further putative SNP associations are indicated by RHM and subsequent measured genotype analysis, two of which flank previously reported associations and indicate an epistatic effect, observed in several traits. In summary, this study showed that reproductive performance of sow is considerably reduced during PRRSV outbreaks and the genetics of the sow significantly affects variance in survival and mortality. Several novel genomic regions associated with the reproductive performance of sows in the absence and during PRRSV outbreaks have been identified in this study. In addition to these, the results suggest the region on SSC4 previously associated with PRRSV viral load and weight gain may also affect foetal mortality. These results demonstrate the potential for genomic selection to be used to mitigate PRRSV related reproductive losses, the greatest financial exposure faced by the pig industry. In addition, RHM is directly shown to capture genetic variance, where single SNP methods fail to identify an effect, highlighting the usefulness of this tool as a method to identify genomic regions with significant effect on production traits.