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Nesta dissertação buscamos abordar dois aspectos pouco usuais, a análise de diatomáceas com plastídeos e sua aplicação no estudo da comunidade no plâncton de sistemas lóticos. Os rios Gravataí, Sinos, Caí e Jacuí têm importância ambiental e social, uma vez que, junto com seus afluentes, drenam grande parte da rede hidrográfica do Estado. Enquanto sustentam a população com o abastecimento de água, suportam seus rejeitos, o que faz deles grandes “guerreiros” - fortes e vulneráveis em uma sociedade de desenvolvimento ainda pouco sustentável. As diatomáceas são peças chaves no diagnóstico e monitoramento ambiental em diversos países. Suas sensibilidades as tornam raras, mas suas tolerâncias as tornam porta vozes do impacto ambiental da nossa civilização. Podem permanecer no ambiente como resquício de condições passadas e podem ser determinantes das condições atuais. Para esta última interpretação, procuramos algo que pudesse garantir seu potencial bioindicador: os plastídeos. Normalmente negligenciados, completamente excluídos pelas técnicas de oxidação, neste trabalho passaram a ser protagonistas. Acreditamos que eles possam nos mostrar o que as valvas vazias de diatomáceas já tentavam nos dizer A partir do estudo da composição taxonômica da comunidade de diatomáceas com plastídeos íntegros, partimos para a análise ecológica dos dados, buscando inferir padrões da composição relativos às particularidades ambientais de cada rio. Apresentamos aqui as respostas dessa comunidade às variáveis ambientais impostas pela geografia, pelo clima e por nós. O estudo das diatomáceas na foz dos rios formadores do Delta do Jacuí só foi possível devido ao apoio do Departamento Municipal de Águas e Esgotos de Porto Alegre (DMAE), que realizou as coletas e forneceu os dados físicos e químicos necessários para este estudo.

As células compartimentadas do gênero Araucaria Juss. foram primeiramente descritas como células incomuns, caracterizadas pela ocorrência de partições pécticas no lume celular, formando um sistema de compartimentos. Entretanto, várias questões sobre essas células ainda não haviam sido esclarecidas, por isso, o presente trabalho envolveu a observação e descrição dos estádios de desenvolvimento das células compartimentadas nas plantas jovens e adultas da espécie Araucaria angustifolia, sob microscopia óptica e eletrônica, além de elucidar as funções e a dinâmica celular desempenhada pelas mesmas. A diferenciação das células compartimentadas ocorria ainda no ápice caulinar, iniciando quando a célula aumentava de volume (estádio 1). A mucilagem era continuamente secretada, através do Golgi e retículo endoplasmático rugoso, preenchendo o citoplasma e reduzindo o vacúolo (estádio 2). A quantidade citoplasmática se reduzia, praticamente, em torno do núcleo (estádio 3). Finalmente, a célula era totalmente preenchida de mucilagem, constituída por uma rede lamelar, perdendo sua forma poligonal (estádio 4). Núcleo e citoplasma degeneravam. Com base nesses resultados, constatou-se que as células compartimentadas de Araucaria angustifolia eram semelhantes às células de mucilagem de algumas famílias de dicotiledôneas. A função de controle hídrico foi comprovada, baseado, principalmente, nos resultados obtidos pelo traçador apoplástico HPTS (hidroxi-ácido pirenetrissulfônico), que demonstrou a rota de translocação e regulação hídrica na folha. A morte celular programada também mostrou-se evidente com a degeneração do vacúolo, condensação e descromatização do núcleo e degeneração geral do sistema de membranas A utilização de anticorpos monoclonais para determinados epitopos pécticos, são importantes ferramentas nos estudos da dinâmica da parede celular. Ao longo do desenvolvimento das células compartimentadas (células mucilaginosas), havia um gradiente de distribuição com relação a rápida de-esterificação, ao aumento da concentração de galactanos e ligações de cálcio e diminuição nas concentrações de arabinanos e de proteínas arabinogalactanos (AGPs). Alguns resultados mostraram-se diferentes nas células parenquimáticas, justificando as diferenças na elasticidade da parede celular nas células mucilaginosas de Araucaria angustifolia. Observou-se que proteínas arabinogalactanos e pectinas com alto grau de metil-esterificação estavam presentes na mucilagem. A degeneração das AGPs na maturidade das células mucilaginosas, tanto na parede celular, como na mucilagem, poderia estar envolvida no processo de morte celular programada.

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Dentre as plantas vasculares sem sementes, o gênero Elaphoglossum Schott ex J. Sm. de acordo com estudos morfológicos e moleculares, pertence à família Dryopteridaceae. Seus representantes são caracterizados por apresentarem rizoma com um meristema ventral transversalmente alongado, curto a longo rastejante; frondes simples (na maioria das espécies); nervuras livres (com exceção de algumas espécies); dimorfismo entre as frondes férteis e estéreis e soros exindusiados e acrosticóides (cobrindo inteiramente a face abaxial da lâmina). É um gênero predominantemente epifítico (80%), mas também há representantes rupícolas e terrícolas. O gênero apresenta distribuição pantropical, com aproximadamente 600 espécies, onde a maioria ocorre na região Neotropical. No Brasil, o centro de diversidade das espécies está no Bioma Floresta Atlântica, que faz parte de um dos três centros de especiação e endemismo de plantas vasculares sem sementes para a América Tropical. Na região Sul do Brasil, o Estado do Paraná apresenta o maior número de espécies (29), seguido pelo Estado de Santa Catarina (23) e Rio Grande do Sul (18). Portanto, para a região Sul são reconhecidas 33 espécies: E. actinotricum (Mart.) T. Moore, E. alpestre (Gardner) T. Moore, E. beurepairei (Fée) Brade, E. brachyneuron (Fée) J. Sm., E. burchellii (Baker) C. Chr., E. didymoglossoides C.Chr., E. dutrae Brade, E. edwallii Rosenst., E. flaccidum (Fée) T. Moore, E. gardnerianum (Kunze ex Fée) T. Moore, E. gayanum (Fée) T. Moore, E. gertii Sehnem, E. glabellum J. Sm., E. glaziovii (Fée) Brade, E. horridulum (Kaulf.) J. Sm., E. iguapense Brade, E. itatiayense Rosenst., E. lagesianum Rosenst., E. langsdorffiii (Hook. & Grev.) T. Moore, E. lingua Brack., E. luridum (Fée) Christ, E. macahense (Fée) Rosenst., E. macrophyllum (Mett. ex Kuhn) Christ, E. montanum Kieling-Rubio & P. G. Windisch, E. nigrescens (Hook.) T. Moore ex Diels, E. pachydermum (Fée) T. Moore, E. paulistanum Rosenst., E. scolopendrifolium (Raddi) J. Sm., E. sellowianum (Klotzsch ex Kuhn) T. Moore, E. squamipes (Hook.) T. Moore, E. strictum (Raddi) T. Moore, E. ulei Christ e E. vagans (Mett.) Hieron. Chaves de identificação, lectotipificações, descrições do esporófito, comentários sobre a biologia e ecologia, imagens dos esporos, ilustração dos caracteres diagnósticos e mapas da distribuição geográfica são apresentados.

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Made available in DSpace on 2016-03-07T19:20:37Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2015-07-13. Added 1 bitstream(s) on 2016-03-07T19:24:14Z : No. of bitstreams: 1 000854521_20160812.pdf: 82338 bytes, checksum: e4da31f0cbbba0357b1f03a80a768a0e (MD5) Bitstreams deleted on 2016-08-12T12:00:48Z: 000854521_20160812.pdf,. Added 1 bitstream(s) on 2016-08-12T12:01:21Z : No. of bitstreams: 1 000854521.pdf: 1322164 bytes, checksum: 7b22d155b69c968406f0adc4a9c9c1de (MD5) / O Brasil possui uma grande diversidade botânica, graças a seus diversos biomas, sendo a documentação das espécies existentes muito importante para o conhecimento da biodiversidade mundial. O gênero Senna possui 80 espécies enquanto o gênero Casearia apresenta 37 espécies no Brasil. O gênero Lantana possui cerca de 150 espécies. Alguns princípios ativos dessas espécies foram testados previamente no laboratório da Orientadora, apresentando atividade tripanocida promissora; entretanto existem dificuldades na classificação de alguns espécimes desses gêneros. Novas técnicas de identificação surgem para auxiliar na taxonomia. DNA Barcoding é uma técnica muito útil, pois é rápida, precisa, e com alta relação custo-benefício, utilizando uma pequena sequência de DNA para identificação. Suas aplicações vão desde identificar espécies crípticas até na luta contra o comércio ilegal de espécies ameaçadas de extinção e madeira extraída ilegalmente, dentre outras. Para realização desta técnica em plantas, utilizam-se genes localizados no cloroplasto - matK (codifica a proteína maturase K), rbcL (codifica a proteína ribulose 1,5-bifosfato ou Rubisco) e/ou regiões de espaçador intergênicos presente no cloroplasto (trbH-psbA). Neste trabalho em parceria com o NuBBE - Núcleo de Bioensaios, Biossíntese e Ecofisiologia de Produtos Naturais, visamos identificar as espécies pela técnica de DNA Barcoding, utilizando as regiões rbcL, trbH-psbA e ITS2, para para verificar a acurácia de banco de dados e melhorar a classificação taxonômica. Os resultados mostraram que a região rbcL é uma boa região para amplificação e sequenciamento, com boa taxa de discriminação de espécie. A região psbA-trnH é menos efetiva na discriminação de espécie comparada à região rbcL. A região ITS2 apresentou identidade com sequência de fungos, mostrando dificuldade na... / Brazil has a great botanical diversity, thanks to its various biomes, and the documentation of existing species is very important for understanding the world's biodiversity. Senna genus has 80 species while Casearia genus has 37 species in Brazil. The Lantana genus has about 150 species. Some active compounds of these species were tested in the laboratory presenting promising trypanocidal activity; however there are difficulties in classification of some specimens of these genres. New identification techniques emerge to assist in taxonomy. DNA barcoding is a very useful technique because it is fast, accurate, and highly cost-effective, using a small DNA sequence for identification. Its applications range from identifying cryptic species to the fight against illegal trade in endangered species and illegally harvested timber, among others. To perform this technique, in plants, use genes located in the chloroplast - matK (encoding the protein maturase K) rbcL (encoding ribulose 1,5-bisphosphate or protein Rubisco) and/or intergenic spacer regions in the chloroplast (trbH-psbA). In this work in partnership with NuBBE - Center for Bioassays, Biosynthesis and Ecophysiology of Natural Products, we aimed to identify the species by DNA barcoding technique, using the regions rbcL, trbH-psbA and ITS2, to check the database accuracy and improve the taxonomic classification. The results showed that the rbcL region is a good region for amplification and sequencing, with good species discrimination rate. The psbA-trnH region is less effective in discrimination compared to the rbcL region. The ITS2 region showed identity with fungal sequence, showing difficulty in using this region.

Made available in DSpace on 2014-06-11T19:33:40Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2006-11-06Bitstream added on 2014-06-13T19:23:57Z : No. of bitstreams: 1 gonzaga_v_dr_jabo.pdf: 2262058 bytes, checksum: 9f1c54256f73cca2fe58faf334cc3382 (MD5) / Empresa Brasileira de Pesquisa Agropecuária (EMBRAPA) / Os nematóides das lesões radiculares (Pratylenchus spp.) são considerados o segundo grupo de fitonematóides de maior importância econômica em todo o mundo. A morfologia e a morfometria das seis espécies mais comuns desses nematóides, no Brasil, a saber: Pratylenchus brachyurus, P. coffeae, P. jaehni, P. penetrans, P. vulnus e P. zeae, foram estudas aos microscópios óptico composto e eletrônico de varredura. Os dados foram analisados, também, por análise discriminante e análise canônica, tendo sido determinada uma equação da função de classificação para cada uma das espécies. Conquanto cada uma das espécies possa ser identificada por qualquer das ferramentas utilizadas, a análise morfológica, a análise morfométrica, assim como as análises discriminante e canônica devem ser consideradas ferramentas complementares no processo de identificação das espécies, aumentando a confiabilidade da identificação. Uma grade politômica ilustrada para identificação rápida dessas espécies foi elaborada. A técnica de multiplicação in vitro dessas espécies em cilindro de cenoura mostrou-se adequada para produção massiva desses nematóides, sendo que P. penetrans e P. jaehni foram as espécies que produziram, respectivamente, o maior e o menor número de indivíduos e ovos por cilindro de cenoura, aos 120 dias após a inoculação. / The lesion nematodes (Pratylenchus spp.) are considered the second largest group of plant parasitic nematodes of economic importance in the world. The morphology and morphometry of the six more common species of these nematodes in Brazil, namely: Pratylenchus brachyurus, P. coffeae, P. jaehni, P. penetrans, P. vulnus and P. zeae, were studied at the light and scanning electron microscopes. The data were also submitted to discriminant and canonical analyses and an equation of the classification function for each one of the species was determinated. Althought each one of the species can be identified by any of the tools used, the morphologic and morphometric analyses, as well as the discriminant and canonical analyses, must be considered complementary tools in the process of species identification, thus increasing the reliability of the identification. An illustrated polytomous key for a fast identification of these species was elaborated. The in vitro multiplication technique of these species in carrot cylinder was suitable for massive production of these nematodes. Pratylenchus penetrans and P. jaehni were the species that produced, respectively, the greatest and the smallest number of individuals and eggs for carrot cylinder, 120 days after the inoculation.

Made available in DSpace on 2015-09-17T15:24:53Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2015. Added 1 bitstream(s) on 2015-09-17T15:47:03Z : No. of bitstreams: 1 000844425.pdf: 1354415 bytes, checksum: 63decd4896f01dc6e3a5c1e0bea3b0d9 (MD5) / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP) / As algas verdes representam um grupo bastante diversificado e seus representantes podem ser encontrados em muitos tipos de habitats. Nos solos, as algas verdes, em associação com outros organismos, podem originar as crostas biológicas, uma comunidade considerada relevante nos ecossistemas (especialmente nos áridos e semiáridos). São colonizadores, auxiliando na redução da erosão, estabilizando e melhorando as propriedades físicas e químicas dos solos e também influenciando a germinação de diferentes plantas. O estudo proposto visa o levantamento taxonômico das assembleias de algas verdes encontradas em áreas de cerrado nos estados de São Paulo e Minas Gerais (Parque Estadual Furnas do Bom Jesus e Parque Nacional Serra da Canastra, respectivamente). Também pretende-se realizar a comparação da biota encontrada nos ambientes estudados e a caracterização molecular das espécies mais frequentes. O material coletado foi submetido a exame direto sob microscópio de luz e também a cultivo em meio artificial. Os resultados obtidos baseiam-se nas análises de 40 amostras coletadas em abril de 2013. O levantamento taxonômico resultou em 17 morfotipos, incluídos nas classes Trebouxiophyceae, Chlorophyceae, Ulvophyceae, Klebsormidiophyceae e Conjugatophyceae. Duas identificações foram possíveis apenas até o nível genérico (Chlorococcum sp. e Klebsormidium sp.) devido à ausência dos estágios reprodutivos e uma população não foi identificada devido à inconsistência no conjunto das características observadas. Quatro ocorrências são novos registros para o país. As duas áreas de estudo apresentaram composição florística distinta, havendo apenas seis ocorrências comuns aos dois parques. A maior riqueza específica foi registrada no Parque Nacional da Serra da Canastra, com 14 morfotipos, enquanto no Parque Estadual das Furnas do Bom Jesus foram registradas apenas sete... / Green algae are a higly diversified group and their representatives can be found in many types of habitats. On soils, green algae, in association with other organisms, may form biological crusts, a community considered relevant in some ecosystems (especially in arid and semi-arid environments). They are pioneer in soil systems, helping to reduce erosion by stabilizing and improving the physical and chemical properties of soils and influencing the germination of different plants. This study aims to the taxonomic survey of green algae assemblages found in savannah areas in the states of São Paulo and Minas Gerais. In addition, the comparison of taxonomic compositions of the assemblages from different localities and the molecular characterization of the most frequent species are complementary objetives. The sampled material was directly examined under light microscope and also cultivated on artificial growth media. The results obtained are based on the analyzes of 40 samples collected in April 2013. The taxonomic survey resulted in the finding of 17 morphotypes pertaining to Trebouxiophyceae, Chlorophyceae, Ulvophyceae, Klebsormidiophyceae and Conjugatophyceae. Two out 17 identifications were possible only to the generic level (Chlorococcum sp. and Klebsormidium sp.) due to the absence of reproductive stages. One population was not identified due to the inconsistence of the observed characteristics to identify. Four occurrences are new records for the country. The two study areas showed distinct floristic composition, with only six occurrences common to both parks. The highest species richness was recorded in the Serra da Canastra National Park, with 14 morphotypes, while in the State Park Furnas do Bom Jesus were recorded only seven. Soil nutrients, moisture, temperature and pH have shown that the occurrence of a species cannot be addressed to a single environmental variable, but possibly two or more...

Made available in DSpace on 2014-08-13T14:50:53Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2014-03-21Bitstream added on 2014-08-13T18:01:25Z : No. of bitstreams: 1 000765738.pdf: 3031114 bytes, checksum: 720660e6f0f69a9227777b3b2f49ef19 (MD5) / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP) / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) / As três seções do gênero Batrachospermum - Acarposporophytum (com uma única espécie, B. brasiliense Necchi), Aristata (B. beraense Kumano, B. cayennense Montagne, B. longiarticulatum Necchi e B. turgidum Kumano) e Macrospora (B. equisetifolium Montagne, B. hypogynum Kumano & Ratnasabapathy e B. macrosporum Montagne) têm sido demonstradas como monofiléticas em estudos filogenéticos envolvendo pelo menos um representante de cada seção. As seguintes hipóteses foram testadas: 1) as seções Acarposporophytum, Aristata e Macrospora constituem grupos monofiléticos dentro do gênero Batrachospermum; as seções têm sido demonstradas como monofiléticas em estudos filogenéticos e com a adição de maior número de espécies e populações essa tendência deverá ser confirmada; 2) A maioria das espécies atualmente reconhecidas em cada seção com base em caracteres morfológicos será corroborada pelos dados moleculares. A presente revisão das três seções teve como objetivos: 1) inferir as relações filogenéticas, bem como os limites de variação intraespecíficas, das espécies dentro e entre as seções, bem como com outras seções do gênero, foram utilizados os caracteres morfológicos diagnósticos atualmente aceitos e três marcadores moleculares - rbcL, gene plastidial que codifica a subunidade grande da RUBISCO; região de “barcode” do gene mitocondrial cox1, que codifica a subunidade 1 da enzima citocromo c oxidase; e UPA - gene plastidial “universal plastid amplicon”; 2) elaborar estudo de revisão para as três seções por meio da realização dos caracteres taxonômicos diagnósticos para espécies desses grupos, à luz dos novos dados moleculares. Foram analisadas 19 amostras provenientes das regiões sudeste, centro-oeste, norte e nordeste do Brasil, além dos espécimes-tipo de cada seção e sequências disponíveis no “GenBank” para cada um dos marcadores utilizados. Os caracteres diagnósticos para o... / he three sections of the genus Batrachospermum - Acarposporophytum (with the single species B. brasiliense Necchi), Aristata (B. beraense Kumano, B. cayennense Montagne, B. longiarticulatum Necchi and B. turgidum Kumano) and Macrospora (B. equisetifolium Montagne, B. hypogynum Kumano & Ratnasabapathy and B. macrosporum Montagne) – have been shown to be monophyletic in phylogenetic studies involving at least one member of each section. The following hypotheses were tested: 1) the sections Acarposporophytum, Aristata and Macrospora represent monophyletic groups within the genus Batrachospermum; the sections have been shown to be monophyletic and closely related in previous studies and with the addition of more species and populations this trend will be confirmed; 2) most species currently recognized in each section on the basis of morphological characters will be corroborated by molecular data. This revision of the three sections has the following aims: 1) to infere phylogenetic relationships and the intra-specific limits of variation of the species within and between sections, as well as with the other sections of the genus; the investigation used the morphological diagnostic characters currently applied and three molecular markers - rbcL, the plastidial gene encoding the large sub-unit of RUBISCO; the barcode region of the mithocondrial gene cox1, encoding sub-unit 1 of cythochorme c oxidase; and UPA, plastidial universal plastid amplicon; 2) to carry out a revisional study of the three sections by means of the reevaluation of taxonomic diagnostic characters for species within these groups, in the light of new molecular data. Nineteen new samples were analysed from the southeast, mid-west, north and northeast regions of Brazil, as well as the type specimens of each species and the sequences available in GenBank for each molecular marker. The diagnostic characters for section circumscription and species identification within the sections... / FAPESP: 12/06848-9 / FAPESP: 12/12016-6