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1	Improvement of direct electron transfer-type bioelectrocatalytic property of D-fructose dehydrogenase by protein engineering approach / フルクトース脱水素酵素による直接電子移動型バイオエレクトロカタリシスのタンパク質工学的手法による特性改良 Hibino, Yuya 25 March 2019 (has links) 京都大学 / 0048 / 新制・課程博士 / 博士(農学) / 甲第21836号 / 農博第2349号 / 新制\|\|農\|\|1068(附属図書館) / 学位論文\|\|H31\|\|N5208(農学部図書室) / 京都大学大学院農学研究科応用生命科学専攻 / (主査)教授加納健司, 教授三芳秀人, 教授三上文三 / 学位規則第4条第1項該当 / Doctor of Agricultural Science / Kyoto University / DFAM directo electron trasfer fructose dehydrogenase electron transfer pathway protein engineering bioelectrocatalysis 610
2	Studies on Electron Transfer Pathway and Characterization of Direct Electron Transfer-Type Bioelectrocatalysis of Fructose Dehydrogenase / フルクトース脱水素酵素による直接電子移動型酵素電極反応の電子移動経路とその特性評価 Kawai, Shota 23 March 2015 (has links) 京都大学 / 0048 / 新制・課程博士 / 博士(農学) / 甲第19022号 / 農博第2100号 / 新制\|\|農\|\|1030(附属図書館) / 学位論文\|\|H27\|\|N4904(農学部図書室) / 31973 / 京都大学大学院農学研究科応用生命科学専攻 / (主査)教授加納健司, 教授阪井康能, 教授小川順 / 学位規則第4条第1項該当 / Doctor of Agricultural Science / Kyoto University / DFAM Direct electron transfer Fructose dehydrogenase Electron transfer pathway Bioelectrocatalysis Surfactant layer 610
3	Biochemical and electrochemical studies of metalloproteins involved in oxygen reduction pathway in Acidithiobacillus ferrooxidans / Etude biochimique et électrochimique des métalloprotéines impliquées dans la voie de la réduction de l'oxygène chez Acidithiobacillus ferrooxidans Wang, Xie 07 December 2018 (has links) Acidithiobacillus ferrooxidans (A. f.) est un modèle bactérien parfaitement adapté à l’étude de la survie en milieu acide. Si plusieurs métalloprotéines ont été identifiées et caractérisées d’un point de vue biochimique, le fonctionnement de la chaîne respiratoire couplant l’oxydation du Fe(II) à la réduction de l’oxygène dans cet organisme n’est pas élucidée. Au cours de ce travail de thèse, après avoir optimisé les conditions de croissance de la bactérie et de production des protéines redox impliquées, nous avons reconstitué sur interface électrochimique une partie de la chaîne respiratoire d’A. f. dans le but de déterminer étape par étape le chemin de transfert d’électrons (TE). Notre attention s’est portée sur trois protéines qui interagissent dans la chaîne respiratoire: la cytochrome c oxidase (CcO), la cuprédoxine AcoP, qui copurifie avec la CcO mais de fonction inconnue, et un cytochrome dihémique (Cyt c4) proposé comme interagissant avec la CcO. La mise en évidence, puis la quantification d’un TE intermoléculaire entre le Cyt c4 et AcoP, puis entre le Cyt c4 et la CcO nous a permis de proposer un rôle pour AcoP et un nouveau chemin de TE vers la CcO. Nous avons ensuite étudié les propriétés électrochimiques de la CcO vis à vis de la réduction catalytique de l’O2, en particulier avec une forte affinité. Nous avons ainsi pu montrer que la CcO de A. f. réduisait l’O2 à des potentiels 500 mV plus anodiques que les CcO neutrophiles par une connexion directe de l’enzyme sur nanomatériaux carbonés. Affinité pour O2 et haut potentiel redox font de cette CcO une enzyme de choix pour développer une nouvelle génération de piles à combustible enzymatique. / Acidithiobacillus ferrooxidans is one of the most studied bacterial models to understand how to survive in an acid environment. Although several metalloproteins have been identified and characterized from a biochemical point of view, the electron transfer pathway (ET) of the respiratory chain coupling the oxidation of ferrous iron with the reduction of oxygen in this organism has not been elucidated.During this thesis work, after having optimized the growth conditions of the bacterium and the production of the redox proteins involved, we reconstituted on the electrochemical interface part of the respiratory chain of A. ferrooxidans for the purpose of determining step by step the ET. Our attention focused on three proteins that interact in the respiratory chain: cytochrome c oxidase (CcO), the cupredoxin AcoP, which co-purifies with CcO but of unknown function, and a cytochrome dihemic (Cyt c4) proposed as interacting with the CcO. The demonstration, then the quantification of an intermolecular ET between the Cyt c4 and AcoP, then between the Cyt c4 and the CcO allowed us to propose a role for AcoP and a new pathway for the ET to the CcO. We then studied the electrochemical properties of CcO with respect to the catalytic reduction of O2. We have demonstrated the strong affinity of this oxidase for O2. We have established the chemical functions required to obtain a direct wiring of the enzyme on carbon nanomaterials. This showed that A. ferrooxidans CcO reduced O2 at potentials 500 mV more anodic than neutrophilic CcOs. Affinity for O2 and high redox potential make this CcO an enzyme of choice to develop a new generation of enzymatic fuel cells. Acidithiobacillus ferrooxidans Cytochrome c oxidase Transfert d’électrons Piles à combustible enzymatique Acidithiobacillus ferrooxidans Cytochrome c oxidase The Fe(II) respiratory chain The electron transfer pathway Enzymatic fuel cells 540
4	Identifikation von Genen und Mikroorganismen, die an der dissimilatorischen Fe(III)-Reduktion beteiligt sind / Isolation of Genes and Microorganisms Involved in Dissimilatory Fe(III)-Reduction Özyurt, Baris 21 January 2009 (has links) No description available. 500 Naturwissenschaften allgemein Mathematics and Computer Science Metagenomik dissimilatorische Fe(III)-Reduktion Dissimilatory iron reduction DIR dissimilatory oxido-reduction of iron dissimilatory iron(III) reduction metal reduction ferricironreduction microbial iron respiration bacterial respiration microorganisms for energy production dissimilatory iron reducing bacteria dissimilatory metal reducing bacteria DMRB energy production electricity energy transduction microbial electricity electron donor electron acceptor electron transfer carbon source carbohydrate mannit mannitol biofilm mineral mineral formation microbial degradation ribosomal proteins cytochromes hypothetical proteins enzymes oxidation reduction ferric iron iron oxide Fe(II) Fe(III) soluble iron insoluble iron ferric reductase activity iron mineral formation mineralisation <i>E. coli</i> Escherichia coli environmental microorganisms life in extreme environments uncultivable bacteria soil microbial ecology anaerobic growth anaerobic incubation environmental sequences environmental DNA DNA extraction functional screening metagenomic metagenome meta-genome microbial ecology environmental genomics soil metagenome BACs sequencing bioinformatics microbial communities 16S rRNA phylogenetics 30 42.30 42.30 58.30 42.49 58.30 42.13 RA W

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