Le trypanosome est le parasite responsable de la maladie du sommeil chez l’homme et de la Nagana chez le bétail. Afin d’échapper au système immunitaire de son hôte mammifère, il remplace périodiquement la protéine VSG (Variant Surface Glycoprotein) présente en 10 millions d’exemplaires à sa surface. Ce mécanisme a pour nom la variation antigénique. Pour être exprimé, le gène de VSG (VSG) doit se trouver en fin d’un site d’expression (ES) particulier. Cet ES est polycistronique, télomérique et transcrit par une ARN polymérase de type ribosomique (Pol I). 20 à 40 ESs similaires et un millier de VSGs sont recensés dans le génome du trypanosome. Cependant, un seul ES est totalement transcrit (actif) et un seul VSG est exprimé. La variation antigénique est donc possible par deux mécanismes: soit l’activation d’un autre ES, soit le remplacement du VSG dans l’ES actif. La base de ce système est l’activation d’un seul ES à la fois (contrôle monoallélique). Au laboratoire, un modèle a été proposé où la transcription s’initie au niveau de tous les ESs mais n’aboutit au VSG que dans le cas de l’ES actif (Vanhamme et al., 2000). Dans ce cas uniquement, le transcrit primaire subit une maturation correcte (épissage et polyadénylation) et est exporté dans le cytoplasme. Etant donné que des transcrits Pol I subissent une maturation identique à des transcrits Pol II, la régulation s’effectuerait par recrutement d’une machinerie d’élongation/maturation de l’ARN de type Pol II (Pol II « RNA factory »). Cette dernière serait uniquement localisée au niveau de l’ES actif dans le compartiment nucléaire appelé ES body (Navarro and Gull, 2001). Durant cette thèse, diverses stratégies ont été élaborées pour tester la validité du modèle. La première visait à comparer l’état de maturation d’un ES en fonction de son activité. Nos résultats ont appuyé l’idée que les transcrits d’ESs ayant subi une maturation correcte provenaient préférentiellement de l’ES actif mais le(s) facteur(s) en quantité limitante ne permettant cette maturation qu’au niveau de l’ES actif doivent encore être identifiés. Le seconde stratégie analysait l’acétylation des histones ainsi qu’un éventuel attachement différentiel à la matrice nucléaire de l’ES suivant son activité. Le niveau d’acétylation d’un ES lorsqu’il est actif n’a pu être étudié. Des résultats préliminaires en faveur d’une association préférentielle de l’ES à la matrice nucléaire lorsqu’il est actif ont été obtenus. Enfin, nous avons cloné deux homologues d’un facteur général de la transcription appelé TFIIS. Ce dernier permet à la Pol de redémarrer lorsqu’elle est bloquée par un site de pause. Individuellement chacun de ces facteurs ne semble pas être essentiel au trypanosome. Cependant, un retard de croissance a été observé lorsque les deux facteurs sont invalidés dans la même lignée cellulaire. Ce phénotype particulier doit être caractérisé. En parallèle, nous avons envisagé de caractériser le complexe de la Pol I du trypanosome. Cette stratégie constituait la manière la plus simple de mettre en évidence un éventuel contact physique et/ou fonctionnel entre la Pol I transcrivant l’ES et la machinerie d’élongation/maturation de l’ARN de type Pol II « RNA factory ». 5 sous-unités du complexe ont été identifiées, associées à une protéine de fonction inconnue ainsi qu’à des histones. L’identification d’autres protéines associées au complexe constitue notre perspective principale. La phosphorylation de la plus grande sous-unité du complexe a été démontrée mais son rôle doit encore être élucidé.

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El objetivo de este trabajo es determinar si el cociente PCR/albúmina es suficientemente especifico en la detección aguda de la infección en enfermos operados de artroplastias aplicadas a extremidades inferiores. Todo ello frente la importancia que tiene un problema tan grave como es la infección en cirugía ortopédica electiva. Se establecieron unos objetivos, uno principal y otros de secundarios, entre los que destacan el estudio de la sensibilidad, especificidad, valor predictivo positivo, negativo y eficiencia de los diferentes test.Sobre una muestra de cien individuos se hizo un estudio observacional, prospectivo y longitudinal en un periodo comprendido entre el año dos mil hasta el dos mil dos. Todos ellos intervenidos de prótesis total de cadera o de rodilla. En los criterios de exclusión se incluyeron todos aquellos que podían influir en el resultado de los parámetros analíticos estudiados. Se realizaron tres extracciones sanguíneas en un periodo comprendido de diez días, uno al día siguiente de la intervención, otro al cuarto día y la ultima en el décimo día. Se midieron : proteína © reactiva,(PCR), velocidad de sedimentación globular (VSG), albúmina,PCR/VSG, PCR/ albúmina, niveles de proteínas preoperatorias y leucocitos. Se tomó nota de las características clínicas de la herida quirúrgica , del curso clínico, la temperatura , las radiografías realizadas, sondaje vesical, resultados analíticos, cultivos microbiológicos y necesidad de transfusión. Delante de los resultados se llego a la conclusión de que no se podía obtener un cociente suficientemente especifico en la detección de la infección aguda, con unas sensibilidades entre el 66 - 84 % y unas especificidades entre el 20 - 61 %.En definitiva, se recomienda la exploración clínica del enfermo, el estudio de su historia clínica, un estudio analítico que incluiría:- PCR- Albúmina, - Cultivo microbiológicoY la gammagrafía ósea (leucocitos marcados, tecnecio 99 / sulfuro coloidal más indio 111)

ISWI is a member of a versatile family of ATP-dependent chromatin remodelling complexes involved not only in transcription regulation (initiation, elongation and termination), but also in other cellular functions like maintenance of higher order chromatin structure and DNA replication. TbISWI, a novel ATPase of the ISWI family in Trypanosoma brucei, is involved in the transcriptional repression of silent VSG expression sites (ESs) in both bloodstream form (BF) and procyclic form (PF) life cycle stages of the parasite. Using in silico analysis, I have found that TbISWI is well conserved across the eukaryotic lineage, including those members of the order Kinetoplastida that do not exhibit antigenic variation. Compared to the ISWIs of higher eukaryotes, TbISWI has greater representation of random coils within its structure, an indicator of more structural fluidity and flexibility of interaction with multiple protein partners. Using an eGFP reporter based assay, I have studied the role of TbISWI in transcriptional repression of silent areas of the T. brucei genome. TbISWI was found to be involved in preventing inappropriate transcription of the silent VSG repertoires. TbISWI was also found to downregulate transcription in RNA pol I, but not pol II, transcription units. These results argue for the presence of at least two functionally distinct TbISWI complexes in T. brucei. Using DNA staining and fluorescence in situ hybridisation (FISH), I have investigated the potential effect of TbISWI depletion on cell cycle progression and minichromosome segregation. I did not find any evidence for the role of TbISWI in the maintenance of centromeric heterochromatin in T. brucei.

Ma thèse est dédiée aux propriétés et à l'évolution des poussières dans le milieu interstellaire (MIS) Galactique et en particulier aux plus petites tailles de la distribution des grains. Tout au long de ces trois années, de nouvelles observations infrarouges (IR) du télescope spatial Spitzer m'ont permis d'apporter ma propre contribution à la connaissance du cycle de vie des poussières. Afin d'en acquérir une vision la plus globale possible, j'ai étudié trois types d'environnements interstellaires différents : le milieu diffus Galactique, un nuage moléculaire et une région de formation d'étoiles.<br />J'ai analysé une ligne de visée qui pointe en direction du MIS diffus Galactique, en évitant les régions brillantes de formation d'étoiles. En combinant des données spectroscopiques et photométriques, j'ai construit un spectre Galactique moyen de l'émission de la poussière dans le proche et moyen IR, qui m'a ensuite servi de référence. Les bandes des hydrocarbures aromatiques polycycliques (HAPs) sont visibles ainsi qu'un continuum. Afin d'interpréter les rapports<br />d'intensité des bandes en termes de taille et d'état d'ionisation des HAPs, j'ai mis à jour notre modèle de poussières, de telle sorte qu'il tienne compte de la dépendance de l'état d'ionisation des HAPs en fonction de leur taille. Le spectre du MIS diffus est ajusté pour une taille moyenne des HAPs de 60 atomes de carbone et pour une fraction de cation de 40%. Des HAPs de taille moléculaire et chargés sont donc présents dans le milieu diffus. Un continuum vers 3-5 μm, originellement détecté dans des nébuleuses par réflexion, est également présent dans l'émission du MIS diffus. Ce continuum explique 70% de l'émission dans le filtre Spitzer/IRAC à 3.6 μm. Son origine demeure inconnue. Je montre qu'il ne s'agit ni de lumière diffusée ni de fluorescence des HAPs puisque ce processus requiert une efficacité de conversion des photons supérieure à 100%.<br />J'ai utilisé les observations Spitzer pour quantifier les variations spatiales des propriétés des HAPs à travers la Galaxie et sur de petites échelles dans le nuage moléculaire du Taureau. L'analyse d'un échantillon de lignes de visée du MIS diffus Galactique montre que la taille moyenne des HAPs varie de manière signiffcative, de 40 à 80 atomes de carbone, tandis que leur fraction d'ionisation demeure constante dans les barres d'erreur. J'ai également analysé les images Spitzer du nuage moléculaire du Taureau dans l'IR moyen et lointain. Chaque composante de poussières (HAPs, TPGs pour Très Petits Grains et GGs pour Gros Grains) peut être associée à un canal Spitzer (IRAC 8, MIPS 24 et MIPS 160 μm). Une première difficulté était d'obtenir les images de l'émission diffuse de faible brillance pour le nuage complet. J'ai travaillé avec les spécialistes du Centre Spatial Spitzer (CSS) afin de produire les images IRAC 8 μm et MIPS 24 μm. Pour MIPS 160 μm, j'ai utilisé un algorithme d'inversion développé pour supprimer certains effets instrumentaux des données. J'ai validé la photométrie de ces images. Les observations montrent que les HAPs sont seulement présents au sein d'une couche en surface plus fine que celle pénétrée par les photons ultraviolets et que celle où émettent les TPGs. Ces variations ne peuvent être expliquées par un simple effet d'extinction et révèlent une réelle disparition des HAPs dans le gaz dense où les plus petites particules pourraient se coller sur les plus gros grains et/ou coaguler.<br />Pendant ma thèse, j'ai postulé à une bourse du CSS dans le but d'étudier la Nébuleuse de l'Aigle (M16), l'objet céleste qui m'a décidé à faire de l'astrophysique, il y a plus de dix ans, lorsque le télescope spatial Hubble a photographié les fameux Piliers de la Création. Ma candidature a été acceptée et j'ai passé six mois au sein de l'équipe scientifique MIPSGAL. Mon objectif était de combiner les données IRAC et MIPS de M16 afin d'analyser les propriétés des grains dans les structures de gaz et de poussières, tout en m'impliquant dans le traitement des données. L'image MIPS à 24 μm révèle une structure en forme de coquille à l'intérieur de la nébuleuse tandis que les piliers sont visibles aux autres longueurs d'onde. M16 est une région de formation d'étoiles massives où l'émission de la poussière est censée être alimentée par le rayonnement des étoiles massives. Cependant, nous montrons que le champ de rayonnement ultraviolet est un ordre de grandeur plus faible que celui requis pour expliquer la température de la poussière dans la coquille. À des fins comparatives, nous avons également analysé plusieurs autres coquilles Galactiques. La Nébuleuse de l'Aigle est particulière dans le sens où elle possède une température de couleur IR lointain inhabituellement élevée. Nous avons envisagé une interprétation selon laquelle la poussière est chauffée par les collisions avec le gaz. Cette interprétation implique que la coquille est un reste de supernova (RSN) d'environ 3000 ans. Si cela était confirmé, le RSN de l'Aigle serait le premier détecté grâce à l'émission de la poussière et au sein d'une pouponnière stellaire. De plus, cela illustrerait l'importance de l'émission infrarouge de la poussière dans l'étude énergétique des RSNs. Dernier point, et non des moindres, la question de la formation et/ou destruction des fameux Piliers de la Creation serait (ré)ouverte.

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L’objectif de cette thèse est de dimensionner et régler un système hybride de production d’énergie pour un site isolé de type insulaire, basé sur des énergies renouvelables marines. De manière préliminaire divers systèmes de production d’énergie renouvelable marine ont d’abord été étudiés et comparés de manière qualitative à des systèmes de production d’énergie classiques. Plusieurs types de système de stockage d’énergie ont également été étudiés, comparés et évalués dans le cas du site considéré. Cette analyse préliminaire a été étendue aux différents types de transmissions d’énergie offshore et de méthodes de réglage des convertisseurs associés aux sources renouvelables. A partir de l’étude des caractéristiques du site et de l’analyse statistique des ressources renouvelables (vents, courants marins) une méthode de dimensionnement des éléments du système de production est présentée, dans l’objectif de minimiser les émissions de CO2 et le coût du système sur son cycle de vie. Pour cela, une solution de gestion de la puissance basée sur la logique floue est proposée pour le type de site considéré et comparée à une solution plus classique basée sur des règles logiques. Pour finir, une étude détaillée des différentes méthodes de réglage du système hybride côté réseau est présentée. Trois niveaux de réglage sont considérés : réglage d’une source unique, réglage d’une ferme de plusieurs sources et réglage global du système hybride. Plusieurs modes de réglage sont considérés pour chaque niveau. / This PhD thesis models a renewable-based hybrid power supply system applied in an islanded context and investigates sizing and regulation strategies of such a hybrid system. First, various marine energy production technologies were reviewed and compared to common renewable resources. As well, various energy storage technologies were reviewed, compared, and evaluated to fit the chosen site characteristics. A brief investigation on offshore energy transmission and inverter regulations methods is presented. Then, a study of the site characteristics, and the availability of the different renewable energy resources in the area are presented. This energy study constitutes the basis of the proposed system sizing method, where minimizing the cost and the CO2 emissions are considered as the main objectives. Furthermore, a fuzzy logic power management approach is proposed for the islanded microgrid. Finally, a detailed study of the system components grid-side inverter regulation is presented. Three regulation levels were investigated: the single inverter, the renewable farm, and the hybrid system. In this context, different regulation strategies are considered at each level.

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African trypanosomes are a major plague in sub-Saharan Africa. They cause sleeping sickness in humans and nagana in cattle. These parasites are transmitted between their mammalian hosts by tsetse flies. They are adapting to their different environments through differentiation processes. These processes involve, amongst other things, the expression of different surface coats. These coats are made of procyclin protein at the insect midgut procyclic stage and of variant surface glycoprotein (VSG) at the mammalian bloodstream stage. At a given time, one VSG is expressed from a single VSG gene out of a repertoire of more than 1500 VSG genes present in the trypanosomes genome. The expressed VSG gene is always located at one of fifteen telomeric polycistronic transcription units called expression sites (ES). The VSG coat is changed regularly in a process called antigenic variation allowing trypanosomes to escape the immune response. The exact mechanism controlling the selection of the active ES is not yet known and controversies have been raised concerning the ES transcription control. Although several molecular factors involved in the ES monoallelic-expression have been identified, none of them seems to be a critical regulator.<p><p>Thus during my thesis we decided to explore two aspects of ES expression: (A) deciphering the level at which this expression is controlled and (B) fishing for new protein factors controlling this expression.<p>A) It is not even clear at which level the ES transcription control takes place. In particular, there has been debate on whether it is taking place at the transcription initiation or elongation level. Previous experiments generated contradictory conclusions and gave rise to two different models. The first model suggested that transcription initiation takes place in all ESs simultaneously. The second model suggested that transcription is initiated in only two ESs, one being fully active and a second being pre-active. These two models were equally able to account for the finding of transcripts from different ES within a trypanosome population provided the pre-active ES differs between individual cells. In order to decide if a single or multiple ES promoters can initiate transcription in a given cell, single cell RT-PCR targeting the beginning of the ES was required. Thus single cell RT-PCR was performed and an analysis of the obtained transcripts showed that transcription initiation is taking place on many ES while only one VSG is transcribed. This permitted the unambiguous conclusion that the monoallelic expression of VSG is exerted by controls operating downstream from transcription initiation, suggesting transcription elongation or RNA processing as critical control steps. <p>B) We have characterized a new nuclear protein, Tb alba3, involved in the repression of silent VSGs. Its invalidation lead to chromatin opening in the silent expression sites and to a raise in their expression. As this protein is cytoplasmic and binding procyclin mRNAs at the procyclic stage, it could be a new versatile factor, shuttling between the cytoplasm and the nucleus and involved both in the inverse regulation of major surface antigens at different differentiation stages and the control of antigenic variation.<p><p>These results enhance our understanding of ES transcription control and of ES monoallelic expression. / Doctorat en Sciences / info:eu-repo/semantics/nonPublished