Submitted by Anaclaudia Mattos Villalba (anaclaudiamattosvillalba@gmail.com) on 2016-04-06T20:20:17Z No. of bitstreams: 1 Dissertacao-final-08-01-15-Cintia-Ramm.pdf: 712039 bytes, checksum: 71ed21f23bcc12921d754ed1b5004e9f (MD5) / Approved for entry into archive by cleuza maria medina dos santos (cleuzamai@yahoo.com.br) on 2016-04-18T20:06:20Z (GMT) No. of bitstreams: 1 Dissertacao-final-08-01-15-Cintia-Ramm.pdf: 712039 bytes, checksum: 71ed21f23bcc12921d754ed1b5004e9f (MD5) / Made available in DSpace on 2016-04-18T20:06:21Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Dissertacao-final-08-01-15-Cintia-Ramm.pdf: 712039 bytes, checksum: 71ed21f23bcc12921d754ed1b5004e9f (MD5) Previous issue date: 2015 / A capivara Hydrochaeris hydrochaeris é um roedor de grande porte e semiaquático. A espécie ocorre em vários ambientes, podendo ocorrer em regiões com alto grau de influencia antrópica. A BR-471 que corta longitudinalmente a ESEC Taim, causa impacto localmente na região, por estar ocasionando prejuízos à fauna e a flora, em função dos atropelamentos de capivaras ao longo da reserva. Nesta região também vem sendo utilizados pesticidas e herbicidas, que podem estar contribuindo com a presença de metais. Estes metais podem se depositar no sedimento e na coluna d’água afetando direta ou indiretamente os organismos. No entanto as capivaras estão sujeitas aos efeitos da bioacumulação destes possíveis contaminantes, adquiridos através da ingestão de plantas contaminadas por metais. Com isso, o objetivo desse trabalho é avaliar os níveis de contaminação por metais pesados em tecidos de capivaras (Hydrochaeris hydrochaeris) mortas por atropelamentos na Br-471 Sul do Rio Grande do Sul. Para determinar as concentrações de metais (Ag, Cd, Cu, Pb, e Zn) em diferentes tecidos (fígado, rim, gordura, músculo) pelo e conteúdo estomacal de capivara, foram realizadas coletas mensais ao longo de um ano. As amostragens dos animais mortos serão feitas através de necropsia, as amostras e serão acondicionadas em tubos de plástico e posteriormente congeladas. Após, essas amostras serão pesadas, secas e digeridas em ácido nítrico e diluídas em água MilliQ. As concentrações de Ag, Cd, Cu, Pb, e Zn serão determinados por espectrofotometria de absorção atômica. Os dados serão expressos como média ± erro padrão. As médias dos metais dos tecidos de machos e fêmeas serão comparadas através de Analise de Variância de duas vias (ANOVA), seguida de teste a posterior de Tukey, com significância de 5%. Os resultados, demonstraram que a concentração de prata foi menor na primavera em relação às outras estações do ano nas amostras (P<0,05), não houve variação significativa (P< 0,05) na concentração de cádmio nas amostras, a concentração de chumbo na primavera foi maior em todas as amostras (P< 0,05), a concentração de cobre no inverno e no outono foi significativamente menor que o verão e a primavera (p< 0,05), a concentração de zinco não teve variação ao longo do ano (P< 0,05). O Cd, Ag e o Pb não tiveram variação significativa ao longo do ano no sedimento (P<0,05), já o Cu foi presente no sedimento na primavera, e o Zn foi maior no outono e inverno. (P<0,05). Os resultados deste trabalho demonstraram que as capivaras estão contaminadas por metais não essenciais na Estação Ecológica do Taim. Além disso, podemos sugerir a utilização de pelo para o monitoramento de contaminação da capivara por metais. / The capybara Hydrochaeris Hydrochaeris is a rodent large and semiaquático. The species occurs in various environments and can occur in regions with high anthropogenic influences. The BR- 471 that cuts along the ESEC Taim, impacts locally in the region, to be causing damage to fauna and flora, according to the roadkill capybaras along the reservation. This region has also been used herbicides and pesticides that may be contributing to the presence of metals. These metals can be deposited in the sediment and the water column affecting directly or indirectly the bodies. However capybaras are subject to the effects of bioaccumulation of these possible contaminants, acquired through eating plants contaminated by metals. Thus, the aim of this study is to assess the levels of heavy metal contamination in tissue capybaras (Hydrochoerus hydrochaeris) killed by being run over in the BR-471 South Rio Grande do Sul. To determine the concentrations of metals (Ag, Cd, Cu , Pb, and Zn) in different tissues (liver, kidney, fat, muscle) and the stomach contents of capybara, monthly samples were taken over a year. Samples of the dead animals will be made through autopsy, samples and will be placed in plastic tubes and subsequently frozen. After these samples are weighed, dried and digested in nitric acid and diluted in MilliQ water. The Ag concentrations of Cd, Cu, Pb, and Zn are determined by atomic absorption spectrophotometry. The data are expressed as mean ± standard error. The means of the metals of male and female tissues will be compared by analysis of two-way variance (ANOVA) followed by Tukey test later, with 5% significance. The results showed that the silver concentration was lower in the spring relative to the other seasons in samples (P <0.05), there was no significant difference (P <0.05) in cadmium concentration in the samples, the concentration lead spring was higher in all samples (P <0.05), the concentration of copper in the winter and autumn was significantly lower than the spring and summer (p <0.05), the concentration of zinc was not variation throughout the year (P <0.05). Cd, Ag and Pb have not changed throughout the year in the sediment (P <0.05), whereas the Cu was present in the sediment in the spring, and Zn was higher in autumn and winter. (P <0.05). These results demonstrated that capybaras are contaminated by non-essential metals in the Taim Ecological Station. In addition, we suggest the use of at for contamination monitoring of the capybara for metals.

Nome completo da orientadora: Alcina Magnólia da Silva Franca / Submitted by Pedro Barros (pedro.silvabarros@ufpe.br) on 2018-08-29T19:50:17Z No. of bitstreams: 2 license_rdf: 811 bytes, checksum: e39d27027a6cc9cb039ad269a5db8e34 (MD5) DISSERTAÇÃO Rudah Ruano Cavalcanti Duque.pdf: 4454329 bytes, checksum: c5708467ca6c17d249a4a9a65904702a (MD5) / Approved for entry into archive by Alice Araujo (alice.caraujo@ufpe.br) on 2018-09-11T17:20:15Z (GMT) No. of bitstreams: 2 license_rdf: 811 bytes, checksum: e39d27027a6cc9cb039ad269a5db8e34 (MD5) DISSERTAÇÃO Rudah Ruano Cavalcanti Duque.pdf: 4454329 bytes, checksum: c5708467ca6c17d249a4a9a65904702a (MD5) / Made available in DSpace on 2018-09-11T17:20:15Z (GMT). No. of bitstreams: 2 license_rdf: 811 bytes, checksum: e39d27027a6cc9cb039ad269a5db8e34 (MD5) DISSERTAÇÃO Rudah Ruano Cavalcanti Duque.pdf: 4454329 bytes, checksum: c5708467ca6c17d249a4a9a65904702a (MD5) Previous issue date: 2017-05-31 / CNPq / A Formação Romualdo (Ceará, Pernambuco e Piauí) é um dos principais depósitos fossilíferos cretácicos do mundo, principalmente por sua importante fauna de vertebrados do Albiano. Os seus fósseis vem sendo estudados desde o século 19. A região pernambucana da bacia é menos pesquisada em relação à porção cearense, daí surgiu o objetivo do presente trabalho, que se dedica ao estudo da diversidade fossilífera da Formação Romualdo em um município pernambucano, com ênfase em paleovertebrados. Foram estudados oito sítios fossilíferos na porção sudoeste da Bacia do Araripe. Os resultados são apresentados na forma de duas publicações. A primeira com o inventário de sítios novos e antigos, apresentando dados qualitativos e quantitativos, com o levantamento de 16 táxons, incluindo 11 espécies de peixes, a saber: Vinctifer comptoni, Rhacolepis buccalis, Calamopleurus cylindricus, Cladocyclus gardneri, Neoproscinetes penalvai, Paraelops cearenses, Tharrhias araripis, Notelops brama, Araripelepdotes temnurus, Brannerion latum e Beurlenichthys ouricuriensis. Pterossauros Anhangueridae e quelônios (Araripemys barretoi) também estão presentes. A segunda publicação descreve morfologicamente elementos ósseos de dois pterossauros, DGEO-CTG-UFPE 7571, que inclui carpos, fragmentos de rádio, ulna e metacarpos, todos articulados. Esse espécime era um Anhangueridae que possuía envergadura alar entre 5,5 e 5,8 metros e, através do estudo histológico, conclui-se que era indivíduo jovem e, sendo esse, o primeiro registro de pterossauro para o município de Araripina. O outro espécime, DGEO-CTG-UFPE 7781 é identificado como Pterodactyloidea e consiste em fragmentos proximais dos três primeiros dígitos da mão e seus respectivos ungueais e fragmentos do quarto dígito. Este trabalho contribui para um melhor entendimento da paleodiversidade de vertebrados na porção sudoeste da Bacia do Araripe e amplia o acervo paleontológico do estado de Pernambuco. / The Romualdo Formation (Ceara, Pernambuco and Piaui) is one of the main Cretaceous fossiliferous deposits in the world, mainly for its important fauna of vertebrates in the Albian. Its fossils have been studied since the 19th century. The Pernambuco portion of the basin is less researched in relation to the Ceara portion, thence the objective of the present work, which is dedicated to the study of the fossiliferous diversity of the Romualdo Formation in a municipality of Pernambuco, with emphasis on paleovertebrates. Nine fossiliferous sites were studied in the southwest portion of the Araripe Basin. The results are presented in the form of two publications. The first one is the inventory of new and old sites, presenting qualitative and quantitative data, with the survey of 16 taxa, including 11 species of fish, namely: Vinctifer comptoni, Rhacolepis buccalis, Calamopleurus cylindricus, Cladocyclus gardneri, Neoproscinetes penalvai, Paraelops cearenses, Tharrhias araripis, Notelops brama, Araripelepdotes temnurus, Brannerion latum and Beurlenichthys ouricuriensis. Pterosaurs Anhangueridae and chelonians (Araripemys barretoi) are also present. The second publication describes morphologically the bone elements of two pterosaurs, DGEO-CTG-UFPE 7571, which includes carpi, radio fragments, ulna and metacarpals, all articulated. This specimen was an Anhangueridae which had a wing span between 5.5 and 5.8 meters and, through the histological study, it was concluded that it was a young individual and this way, being the first pterosaur record int the municipality of Araripina. The other specimen, DGEO-CTG-UFPE 7781 is identified as Pterodactyloidea and consists of proximal fragments of the first three digits of the hand with their respective nails and fragments of the fourth digit. This work contributes to a better understanding of the vertebrates paleodiversity in the southwest portion of the Araripe Basin, expanding the paleontological collection of the Pernambuco state.

Se determina la prevalencia de Giardia spp. en ratas urbanas “Rattus rattus” y “Rattus norvegicus” capturadas en un zoológico de Lima Metropolitana, además , se evaluó la asociación del parasito con las variables especie, sexo y edad de estos roedores. Se atraparon 127 roedores (Rattus spp.), usando trampas especiales (tipo“Tomahawk”). Se siguió un estricto control de bioseguridad para la manipulación y recolección de muestras de estos animales, sirviendo de referencia los protocolos proporcionados por el “Centro de Enfermedades Infecciosas y Prevención de Atlanta (CDC)”. Los datos que se tomaron en cuenta para este estudio fueron especie, sexo y edad de los roedores, y las muestras recolectadas provinieron del recto. La conservación se hizo utilizando formol al 10% y posteriormente fueron procesadas en el Laboratorio de Parasitología de la FMV-UNMSM. La técnica empleada para determinar la presencia de Giardia spp. fue la de Ritchie modificado, siendo muestra positiva aquella en que se hallara la presencia de quiste o trofozoito de Giardia spp. Como resultado se halló una prevalencia de Giardia spp. de 5.5 ± 0.04% (7/127); y se hayo una prevalencia del 2.1% del genero Rattus rattus (1/48) y 7.6% en Rattus norvergicus (6/79). Mediante la prueba de Chi cuadrado se encontró que No existe asociación con una significancia de “(p > 0,05)” entre la presencia de Giardia spp. y las variables especie, sexo y edad, por lo que la prevalencia de Giardia spp. en ratas urbanas en el presente estudio, es baja. Sin embargo, es de consideración tomar en cuenta la posibilidad de transmisión de enfermedades parasitarias de este animal a una población vulnerable como son niños y ancianos, trabajadores y animales del zoológico. / Tesis

El presente trabajo incluye una evaluación detallada de las características tafonómicas y bioestratigráficas de los ver-tebrados fósiles procedentes de la Formación Monte Hermoso, en su localidad tipo de Farola Monte Hermoso (provincia de Buenos Aires). Dicho análisis se llevó a cabo a partir de mate-riales recolectados en el campo con un exhaustivo control, a nivel de facies, de su procedencia estratigráfica y también de la observación de ejemplares depositados en colecciones de diversas instituciones. La Formación Monte Hermoso está constituida por depósitos sedimentarios acumulados mediante una dinámica fluvial de ríos meandriformes con alta sinuosidad y elevada carga en suspensión. A su vez, en esta unidad se reconocen distintas facies que representan subambientes de llanura de inundación (facies Fl), desbordamiento mantiforme (facies Fm) y point bar (facies St, Sr, Fsc y Fcf). La asocia-ción faunística recuperada está constituida principalmente por ejemplares correspondientes a Mammalia, los cuales compren-dieron las familias Argyrolagidae (Polydolopimorphia); Didel-phidae (Didelphimorphia); Octodontidae, Chinchillidae, Ca-viidae, Hydrochoeridae, Cricetidae y Echimyidae (Rodentia); Hegetotheriidae, Mesotheriidae y Toxodontidae (Notoungula-ta), Proterotheriidae y Macraucheniidae (Litopterna); Mylodon-tidae, Pampatheriidae, Glyptodontidae y Dasypodidae (Xenar-thra). También se recuperaron especímenes de Osteichthyes (Siluriformes, Trichomycteridae, Percichthydae y Characidae), Amphibia (Bufonidae y Ceratophryidae), Reptilia (Teiidae, Testudinidae y Colubridae) y Aves (Cariamidae y Anatidae). Las diferencias registradas en los atributos tafonómicos (e.g. representación taxonómica y anatómica, dimensiones, formas, meteorización, abrasión, rotura, impregnación, bioerosión, orientación, buzamiento, empaquetamiento, desarticulación) indican que los restos de cada una de las facies fueron afec-tados por diversos procesos bioestratinómicos y fosildiagené-ticos, vinculados con los niveles de procedencia y, por lo tanto, representan distintas historias tafonómicas.Los estu-dios de difractometría de rayos X y composición química ele-mental (EDX) evidenciaron que todos los restos sufrieron cambios químicos y mineralógicos, incluyendo el enriquecimien-to con nuevos elementos químicos y reemplazos isomórficos en la estructura interna cristalina, que determinaron la sustitu-ción del hidroxiapatito original de los huesos por francolita. Por otra parte, las secciones delgadas revelaron un grado de pre-servación muy bueno de la microestructura ósea, afectada sólo por microfisuras y permineralización. En todas las facies consideradas se reconoció el desarrollo de asociaciones mez-cladas y condensadas (con un bajo grado de time-averaging), constituidas por elementos correspondientes a entidades bioló-gicas de distintos ambientes y temporalmente sucesivas, los cuales se fueron incorporando al sustrato en forma gradual a través del tiempo. Las diferencias identificadas entre los dife-rentes niveles fosilíferos permitieron definir dos modos tafonó-micos muy distintos entre sí. Por un lado, el modo tafonómico de llanura de inundación, representado por la facies Fl y, por otro, el modo tafonómico de fondo de canal o lag-channel, representado por la facies St. Los datos taxonómicos no reve-laron variaciones faunísticas importantes entre los niveles de la Formación Monte Hermoso, que representen diferencias temporales significativas y que justifiquen la existencia de dos unidades bioestratigráficas. Por otra parte, el análisis de los taxa exclusivos y los nuevos hallazgos no sustentan la validez de la Biozona de Trigodon gaudryi ni la de Neocavia depressi-dens y su asignación al Piso/Edad Montehermosense y al Piso/Edad Chapadmalalense inferior respectivamente. En base a ello, se propone un nuevo esquema en el que la Formación Monte Hermoso, en su localidad tipo de Farola Monte Hermo-so, está representada por una única unidad bioestratigráfica. Esta unidad corresponde a la Biozona de Asociación de Eumy-sops laeviplicatus y representa la base bioestratigráfica del Piso/Edad Montehermosense, incluido en el Plioceno temprano. Además de E. laeviplicatus, los taxa exclusivos de esta biozo-na son Hyperdidelphys inexpectata, Sparassocynus bahiai y probablemente también Argyrolagus palmeri. / The present study includes a detailed assessment of taphono-mic and biostratigraphic characteristics of fossil vertebrates from Monte Hermoso Formation, at its type locality of Farola Monte Hermoso (Buenos Aires Province). The said analysis was carried out on materials collected in the field with an exhaustive control, at the level of facies, of their stratigra-phic source and also observing specimens that are housed in collections at different institutions. Monte Hermoso Formation is constituted by sedimentary deposits accumulated by fluvial dynamics of meandering rivers with high sinuosity and a high suspended load. Also, different facies representing subenviron-ments of floodplain (facies Fl), sheet-flood (facies Fm) and point bar (facies St, Sr, Fsc and Fcf) are recognized in this unit. The recovered associated fauna is made up mainly of Mammalia specimens, including the following families: Argyrola-gidae (Polydolopimorphia); Didelphidae (Didelphimorphia); Octo-dontidae, Chinchillidae, Caviidae, Hydrochoeridae, Cricetidae and Echimyidae (Rodentia); Hegetotheriidae, Mesotheriidae and Toxodontidae (Notoungulata); Proterotheriidae and Macraucheniidae (Litopterna); Mylodontidae, Pampatheriidae, Glyptodontidae and Dasypodidae (Xenarthra). Specimens of Osteichthyes (Siluriformes, Trichomycteridae, Percichthydae and Characidae), Amphibia (Bufonidae and Ceratophryidae), Reptilia (Teiidae, Testudinidae and Colubridae) and Aves (Cariamidae and Anatidae) were also found. Recorded differences in taphonomic attributes (e.g. taxonomic and anatomical representation, sizes, shapes, weathering, abrasion, breakage, impregnation, bioerosion, orientation, dip, packing, disarticulation) indicate that remains of each facies were affected by different biostratinomic and fossildiagenetic processes, related to source levels, and, therefore, they represent different taphonomic histories. X-ray diffractometry and elemental chemical composition (EDX) studies showed that all the remains underwent chemical and mineralogical changes, including enrichment with new chemical elements and isomorphous replacements in the crystalline internal structure, which determined the substitution of the original hydroxyapatite for francolite. Thin sections revealed a very high degree of preservation of bone microstructure, only affected by microfissures and permineralization. In all the considered facies, the development of mixed and condensed associations (with a low degree of time-averaging) was recognized. These associations are constituted by elements corresponding to temporally-successive biological entities from different environments, which gradually incorporated into the sustrate over time. Identified differences between the different fossiliferous levels enabled to define two taphonomic modes that are very different from each other. On the one hand, the flood plain taphonomic mode, represented by facies Fl, and, on the other hand, the channel-lag taphonomic mode, represented by facies St. Taxonomic data did not reveal considerable fauna variations, among the levels of Monte Hermoso Formation, representing significant temporal differences and justifying the existence of two biostratigraphic units. Also, vertebrates from upper depo-sits of this formation (facies St, Sr, Fsc and Fcf) do not show a great similarity to those from Chapadmalal Formation (upper Chapadmalalan Stage/Age). In the other hand, the study of exclusive taxa and the new discoveries dont support the validity of the Trigodon gaudryi and the Neocavia depressi-dens Biozones, and its assignment to the Montehermosan Stage/Age and the lower Chapadmalalan Stage/Age respec-tively. Based on this, a new scheme is proposed, in which Monte Hermoso Formation, at its type locality of Farola Monte Hermoso, is represented by a single biostratigraphic unit. This unit corresponds to the Eumysops laeviplicatus Association Biozone and represents the biostratigraphic base of the Mon-tehermosan Stage/Age, included in the early Pliocene. In addition to E. laeviplicatus, taxa exclusive to this biozone are Hyperdidelphys inexpectata, Sparassocynus bahiai and proba-bly Argyrolagus palmeri.

A área de ocorrência das formações Tatuí e Irati, na região centro-leste do Estado de São Paulo, entre as cidades de Leme e Rio das Pedras é objeto desta pesquisa. São detalhadas as ocorrências destas duas formações, através de seções estratigráficas, caracterizando e analisando as sucessões de litotipos, conteúdo fossilífero, tafonomia dos fósseis, além de enfocar hipóteses paleoecológicas e paleoambientais. Na FormaçãoTatuí foram identificadas quatro fácies, a inferior de arenitos finos e paleoambiente incerto, duas refletindo contexto não marinho e a de topo com influência marinha. As duas fácies do contexto predominantemente não marinho são respectivamente siltitos arenosos com fósseis de água doce e arenitos grossos ou conglomeráticos, fácies Ibicatu, localmente com lenhos. A fácies de topo é caracterizada por depósitos de arenitos finos, ocasionalmente com grandes estratificações cruzadas, estratificações \"hummockies\", apropriado para um grande corpo d\'água salino. O conteúdo fóssil da Formação Tatuí inclui três tipos de icnofósseis em três fácies diferentes (fácies basal do estudo, Ibicatu, e no topo), grandes caules vegetais (pteridófitas e espermatófitas) na fácies Ibicatu, crustáceos (conchostráceos e fragmentos indeterminados) ocorrem na fácies síltica, escamas, dentes e partes ósseas de peixes ósseos na fácies siltica e topo da Formação Tatuí. O Membro Taquaral é reconhecido por duas fácies e dois paleoambientes de salinidade variável. A fácies basal, composta de arenitos finos a conglomeráticos, granulometria irregular horizontal e verticalmente e com ictiofósseis, é interpretada como depositada em ambiente raso dominado por ondas. A segunda fácies, folhelhos sílticos, é típica de paleoambientes mais calmos, provavelmente com menor salinidade. Os fósseis da base arenosa do Membro Taquaral são peixes, representados por Chondrichthyes sob a forma de dentes cladodontes, espinhos de Euselachii (Amelacanthuse Iratiacanthus), espinhos Ctenacanthiformes (Sphenacanthus sanpauloensis eS. sp.), dentes de Xenacanthiformes, Diplodoselachidae (Taquaralodus albuquerquei) e Xenacanthidae, dentes de Orodontiformes, (Orodus ipeunaensis), Petalodontiformes (Itapyrodus punctatus eI. sp.) e Holocephali indeterminados. A fauna de Osteichthyes é a mais abundante em número de espécimes, sendo composta, predominatemente, de dentes e escamas paleoniscóides, raras escamas de Coelacanthimorpha, partes ósseas e dentes labirintodontes, estes atribuídos a Osteolepiformes e a tetrápodes Temnospondyli. Os fósseis estão normalmente dispersos e desarticulados e os elementos ósseos fragmentados e desgastados. O conteúdo fóssil da fácies folhelho síltico do Membro Taquaral é raro, os mais comuns são crustáceos, principalmente do gênero Clarkecaris, e restos muito fragmentados de Coelacanthimorpha e Palaeonisciformes. / The following Paraná Basin, Late Paleozoic lithoestratigraphic units, the upper part of the Tatuí Formation, located under the lower partof the Irati Formation, Taquaral Member are cropping out at center-eastern State of São Paulo, Brazil, between Rio das Pedras and Leme. The lithologies, fossil contents and taphonomy ofthese units are studied through stratigraphic sections, allowing the formulations of paleoecological and paleoenvironmental hypothesis. Four facies were recognized at the top of the Tatuí Formation stratigraphic sections which were interpreted as following; the basal an uncertain paleoenvironment of deposition, two paleoenvironmental contexts; mostly continental and one under deposits marine influence. The two facies interpreted as mostly continental are respectively, sandy-siltstones facies with freshwater fossils and coarse to conglomeratic sandstone, Ibicatu facies, locally with log plants. The top facies, interpreted as under a marine influence, is characterized by deposits of fine sandstones, occasionally with large cross beds, hummockies, and, locally, tidal deposits, suited for a large body, of saline water. The fossil content of Tatui Formation include three kinds of trace fossils in three different facies (basal, Ibicatu and top respectively), large stem plants (Pterydophyta and Spermatophyta) in the Ibicatu deposit, with indeterminated fragments of crustaceans and conchostraceans, found out in the siltstone facies and scales, teeth and bone pieces, found out in siltstone and of the top facies. Two facies were recognized at the Taquaral Member. The basal are fine to conglomeratic sandstone with irregularly grain size both horizontal and vertically, with ichthyofossils. Itis interpreted as laid down in a salty shallow water dominated by waves. The second are silty shale laid down in low saline water. The fossils of the sandy facies are Chondrichthyes: cladodontes teeth, Euselachii finspines (Amelacanthus and Iratiacanthus santamariaensis), Ctenacanthiformes finspines (Sphenacanthus sanpauloensisand S.sp.), Xenacanthiformes teeth, Diplodoselachidae (Taquarodus albuquerquei) and Xenacanthidae, Orodontiformes: Orodus ipeunaensis, Petalodontiformes (Itapyrodus punctatus andI. sp.) and undetermined Holocephali. The fauna of Osteichthyes, the most abundant in number of specimens are predominantly paleoniscoid teeth and scales, rare Coelacanthimorpha scales, labyrinthodonts bones and teeth, assigned to Osteolepiformes and tetrapods Temnospondyli. The fossils are usually scattered, disorganized, fragmented and worn. The fossil content of the Taquaral silty-shale facies is meager, the most common are crustaceans, mainly of the genus Clarkecaris, and very fragmented remains of Coelacanthimorpha and Palaeonisciformes.

O clado de Passeriformes denominado, atualmente, Furnariida é endêmico da região Neotropical e muito diversificado; ele é representado por cerca de 623 espécies alocadas em 134 gêneros, distribuídas nas seguintes famílias: Furnariidae, Dendrocolaptidae, Thamnophilidae, Formicariidae, Conopophagidae e Rhinocryptidae. As aves deste grupo são, em geral, encontradas em bandos mistos de espécies e/ou podem seguir formigas de correição, fenômenos que são conspícuos entre aves de florestas tropicais. Os representantes de Furnariida são considerados insetívoros, embora possam consumir, ocasionalmente, pequena quantidade de frutos ou sementes e pequenos vertebrados. Este trabalho teve como objetivo descrever a dieta de espécies representantes dos Furnariida que ocorrem em diferentes regiões da Amazônia, além de estimar o número de presas e de biomassa bruta consumida. Para tal, foi analisado o conteúdo estomacal de 476 espécimes de aves Furnariida, dos quais 51 pertencem à família Furnariidae, 139 à Dendrocolaptidae, 280 à Thamnophilidae, 3 à Formicariidae e 3 à Conopophagidae. Foram utilizados dois métodos diferentes para avaliar a contribuição da biomassa de presas consumidas pelos Dendrocolaptidae. O método da biomassa parcial apresentou-se muito incerto e, neste estudo, considerou-se a biomassa estimada como o método mais confiável para comparar o número total de itens e sua biomassa correspondente. As principais presas consumidas por estes pássaros foram Coleoptera, Orthoptera e Araneae. No entanto, Orthoptera foi o item que contribuiu com a maior biomassa ingerida, seguido de Coleoptera e Vertebrata. A alta biomassa de Orthoptera no ambiente poderia explicar o maior consumo, ou preferência desses insetívoros por tal item. Os vertebrados foram consumidos por alguns espécimes de Dendrocolaptidae e de Thamnophilidae e a maior parte do material ingerido pelos dendrocolaptídeos corresponde a Gonatodes humeralis, um pequeno lagarto escansorial; já os vertebrados consumidos pelos tamnofilídeos não foram identificados. A predação de vertebrados pode ser ocasional e, em geral, é considerada oportunística. Nas famílias de Furnariida, com número representativo de espécimes, Orthoptera e Araneae tiveram maior frequência de ocorrência em Furnariidae, enquanto Coleoptera e Orthoptera em Thamnophilidae e Coleoptera em Dendrocolaptidae, o que pode estar relacionado aos hábitos de forrageamento das espécies nelas incluídas / The clade Furnariida of the Passeriformes is endemic to the Neotropical region, and is very diverse: it is represented by around 623 species in some 134 genera distributed in the following families: Furnariidae, Dendrocolaptidae, Thamnophilidae, Formicariidae, Conopophagidae e Rhinocryptidae. Commonly the birds of this group are found in mixed-species flocks and/or as army-ant-followers, features that are common amongst birds of the tropical forests. Members of the Funariida are considered to be insectivores although they may occasionally eat small quantities of fruit or seeds, or small vertebrates. The objective of this study was to describe the diet of representative species of the Funariida that occur in different Amazonian regions, and also estimate the numbers of prey and total biomass consumed. To do this the stomach contents of 476 specimens of the Furnariida were analyzed, of which, 51 belonged to the family Funariidae, 139 to the Dendrocolaptidae, 280 to the Thamnophilidae, and 3 each to the Formaricariidae and Conopophagidae. Two methods were used to evaluate the contribution of the biomass of the preys consumed by the Dendrocolaptidae. The partial biomass method was found to be very unreliable and so, in this study, the estimated biomass method was found to be the most appropriate to compare the total number of items in the corresponding biomass. The main types of prey eaten by these birds were Coleoptera, Orthoptera and Araneae. Nevertheless, Orthoptera were the group that made the biggest contribution to the ingested biomass, followed by Coleoptera and Vertebrata. The high biomass of Orthoptera in the environment would explain the high consumption and preference for these insects as prey. The vertebrates were consumed by some specimens of Dendrocolaptidae and Thamnophilidae, and in the case of the dendrocolaptids these were all the small scansorial lizard Gonatodes humeralis; those consumed by the thamnophilids were not identified. Predation on vertebrates seems to be occasional and is probably opportunistic. In the families of the Furnariida, represented by numbers of specimens, Orthoptera and Aranae had the highest frequency of occurrence in the Funariidae, with Coleoptera and Orthoptera in the Thamnophilidae, and Coleoptera in the Dendrocolaptidae, which can be related to the foraging habits of the species in these families

Mourasuchus (Alligatoroidea, Caimaninae) é um táxon extinto de crocodilianos restrito ao Cenozoico da América do Sul. Representa um dos grupos de crocodilianos mais peculiares de todos os tempos, devido ao formato longo, largo e achatado de seu rostro (lembrando o bico de um pato) entre outras características. Apesar dessas peculiaridades, relativamente poucos trabalhos foram feitos sobre esse grupo. A maioria das descrições morfológicas dos fósseis do gênero são sucintas e breves, incluindo as dos holótipos de duas das quatro espécies a ele assinaladas: M. amazonensis e M. arendsi. Do mesmo modo, as diagnoses das quatro espécies também se mostram sucintas. Poucas também são as análises filogenéticas realizadas com Mourasuchus a maioria das quais, porém, recupera Orthogenysuchus olseni, do Eoceno dos Estados Unidos, como táxon-irmão de Mourasuchus, gerando um impasse biogeográfico. Além disso, a maneira exata pela qual Mourasuchus se alimentava, fazendo uso de seu peculiar rostro bico de pato, bem como seus itens alimentares, ainda não foram plenamente esclarecidos, ainda que algumas teorias tenham sido propostas na literatura. Assim, este trabalho se propôs a: oferecer uma re-descrição dos holótipos de M. amazonensis e M. arendsi; revisar as diagnoses das espécies e do próprio gênero; realizar uma análise filogenética investigando as relações das espécies entre si e do gênero, como um todo, em Caimaninae; investigar a relação de Orthogenysuchus olseni como táxon-irmão de Mourasuchus; elucidar o modo de forrageio e os itens alimentares consumidos pelo grupo. As re-análises das diagnoses das espécies revelaram que duas delas constituem, na verdade, espécies não-válidas, enquanto a análise de um novo material craniano descrito neste trabalho (MCNC-PAL-110-72V) revelou a existência de uma nova espécie de Mourasuchus, fazendo com que este trabalho reconheça três espécies válidas para o gênero. A análise filogenética revelou M. atopus como o táxon mais basal, enquanto M. amazonensis e a nova espécie proposta formam um clado mais derivado. Orthogenysuchus olseni não foi recuperado como táxon-irmão de Mourasuchus em nenhuma das análises, mas seu posicionamento ainda dentro de Caimaninae faz com que impasses biogeográficos permaneçam. Este trabalho defende que Mourasuchus coletava presas em grande quantidade usando a musculatura da parte de baixo de seu rostro uma alimentação coletora enquanto ainda não há evidências de que esses animais fariam uma filtração da massa alimentar coletada. É possível, também, que tal hábito tenha evoluído a partir do hábito alimentar durófago exibido por Caimaninae basais, especialmente o gênero Gnatosuchus. / Mourasuchus (Alligatoroidea, Caimaninae) is an extinct crocodilian taxon restricted to the Cenozoic of South America. It represents one of the most peculiar crocodilian groups of all time, due to the long, wide, flattened shape of its rostrum (resembling the beak of a duck), among other features. Regardless these peculiarities, relatively few works have been done about this group. Most of morphological descriptions of the fossils belonging to this genus are shot and brief, including those of two from the four species assigned to it: M. amazonensis and M. arendsi. Similarly, the diagnoses of all the four species are also very brief. The phylogenetic analyses involving Mourasuchus are also very few most of them, however, recover Orthogenysuchus olseni, from the Eocene of the United States, as Mourasuchus sister-taxon, creating a biogeographically problematic scenario. Furthermore, the exact way by which Mourasuchus feed itself, using its peculiar beak of duck rostrum, as well as its prey items, are yet to be determined, even though some proposals have already been made in the literature. As such, this work had the following objectives: offer a redescription of the holotypes of M. amazonensis and M. arendsi; re-evaluate the diagnoses of Mourasuchus species and the genus itself; perform a phylogenetic analysis to evaluate the relationships between Mourasuchus species and of this group, as a whole, within Caimaninae; evaluate the position of Orthogenysuchus olseni as a sister-taxon of Mourasuchus; elucidate the foraging tactics and the prey items consumed by this group. The re-evaluation of the diagnoses of the species revealed that two are in reality non-valid species, while the analysis of a new cranial material described in this work (MCNC-PAL-110-72V) revealed the existence of a new species of Mourasuchus, taking this work to recognize the existence of three valid species for the genus. The phylogenetic analysis recovered M. atopus as the basalmost taxon, while M. amazonensis and the new species proposed in this work form a more derived clade. Orthogenysuchus olseni was not recovered as a Mourasuchus sister-taxon in any of the analyses made, but its position still within Caimaninae maintains biogeographically problematic scenarios in this clade. This work defends that Mourasuchus collected a high number of prey items using the musculature between the lower jaws a collecting foraging tactic while there is still no evidence that these animals could perform a straining of the entire concentration of food it collected. It is possible, as well, that such habit may have evolved from the durophagous feeding habit of some basal Caimaninae, especially Gnatosuchus.

O presente projeto representa uma extensão dos paradigmas que criamos com estudos de simulação molecular para compreender as frequentes mudanças de estrutura e função das Aldeído Desidrogenases (ALDHs) durante a evolução. As ALDHs formam uma superfamília de proteínas que catalisam a oxidação de vários aldeídos, mas as origens evolutivas das preferências pelos seus substratos são pouco conhecidas. Apesar de possuírem uma elevada identidade sequencial, duas destas ALDHs, a ALDH1 e a ALDH2, exibem distintos papéis funcionais de sinalização celular e detoxicação, respectivamente. Através de prévia análise computacional e logenética, identicamos que, curiosamente, as ALDH1s de organismos invertebrados, Branchiostoma oridae e Ciona intestinalis apresentam características estruturais mais semelhantes às de suas ALDH2s do que das ALDH1 típicas. Isto sugere que essas ALDH1s divergentes podem ter evoluído na direção da atividade de degradação de aldeídos pequenos e tóxicos, que parecem representar a função ancestral das ALDH2s eucarióticas. Nossa análise identicou três assinaturas de aminoácidos localizadas na área interna do canal de entrada do substrato (CES) que distinguem as ALDH1 das ALDH2. Desta forma, constatamos que as ALDH1s possuem um CES amplo e desobstruído, consistente com o fato destas enzimas catalisarem aldeídos de cadeia longa como o retinaldeído, que é um precursor de vias de sinalização por retinóides. Em contraste, as ALDH2s possuem o CES pouco volumoso e constrito, consistente com sua função na degradação de pequenos aldeídos tóxicos e reativos, como o acetaldeído. Neste projeto o nosso objetivo é analisar a correlação funcional e estrutural entre as ALDH1 e ALDH2 presentes em B. oridae e C. intestinalis para desvendar e compreender seus papéis funcionais e evolutivos em cordados. Especicamente, testaremos a hipótese de que as três assinaturas descritas constituem o núcleo fundamental da preferência por substratos, e que sua inversão por mutações sitio-dirigidas entre ALDH1 e ALDH2 modicará a preferência de substrato de acordo com a origem da assinatura. Se conrmado experimentalmente, este será um exemplo pioneiro de reversão evolutiva molecular, que terá impacto direto sobre as interpretações atuais sobre controversa lei de Dollo da irreversibilidade evolutiva. / This project represents an extension of the paradigms that we created from our molecular simulation studies to understand the frequent structure and function changes of aldehyde dehydrogenases (ALDH) during evolution. The ALDHs form a superfamily of proteins that catalyze the oxidation of several aldehydes, but the evolutionary origins of their substrate preference are unknown. Despite having a high sequence identity, two of these ALDHs, the ADLH1, and ALDH2, exhibit distinct functional roles of cellular signaling and detoxication, respectively. Through previous computational and phylogenetic analysis, we found that, interestingly, the ALDH1s of invertebrate organisms (Branchiostoma oridaeand Ciona intestinalis) show structural features more similar to their ALDH2s than the typical ALDH1. It suggests that these divergent ALDH1sevolved to provide small aldehydes detoxication pattern, what seems to represent the ancestral eukaryotic ALDH2s function. Our analysis also identied three aminoacidsignatures, located internally in the substrate entry channel (SEC), that distinguishes the ALDH1 from ALDH2. Thus, we nd that ALDH1s have a wide, open and unobstructed SEC, consistent with the fact that these enzymes catalyze bulky long-chainaldehydes, like retinaldehyde, a precursor of important signaling pathways. In contrast, the ALDH2s have a small and constricted SEC, consistent with the degradation function of small aldehydes, like the toxic metabolite acetaldehyde. In this project, our objective is to understand the functional and structural correlation between ALDH1 and ALDH2 found in B. oridaeand C. intestinalisto discover and comprehend their functional and evolutionary roles in chordates. Specically, we will test the hypothesis that the three signatures described above are the fundamental core of the substrate preference, based on the signature origin. If conrmed experimentally, this will be a pioneeringexample of evolutionary molecular reversion, impacting directly on the current interpretations of the controversial Dollos Law of Irreversibility.

Made available in DSpace on 2015-04-14T14:51:01Z (GMT). No. of bitstreams: 1 423837.pdf: 3323767 bytes, checksum: 8540f43fe0c310d46371629da67c4e9a (MD5) Previous issue date: 2010-03-03 / Originalmente conceituava-se a mielina como uma inova??o evolutiva exclusiva dos vertebrados com mand?bulas, capaz de permitir o aumento na velocidade de transmiss?o de impulsos nervosos gra?as ? transmiss?o saltat?ria. Este conceito tem sido desafiado pela identifica??o de estruturas morfologicamente equivalentes ? mielina em grupos independentes de invertebrados, incluindo anel?deos e crust?ceos capazes de garantir propaga??o de impulsos nervosos em velocidades superiores ? de vertebrados. At? o presente momento, a maioria das descri??es da mielina dos invertebrados ? baseada em dados morfol?gicos e mostram lamelas com variados graus de compacta??o e origem celular, envolvendo espiralmente ou concentricamente ax?nios de diversos calibres nos ap?ndices corporais ou cord?es nervosos destes animais. Para estabelecer as origens evolutivas da mielina e a rela??o intergrupo, elementos important?ssimos, como a descri??o das prote?nas componentes, est?o faltando. Este trabalho teve como objetivo realizar uma an?lise do conte?do prot?ico da mielina do camar?o Litopenaeus vannamei. Para identificar as prote?nas componentes das lamelas da mielina uma sub-fra??o enriquecida em mielina preparada a partir do cord?o nervoso ventral de animais adultos foi submetida ? an?lise prote?mica pela t?cnica de identifica??o multidimensional de prote?nas (MudPit). MudPit foi escolhido para otimizar a chance de detec??o de prote?nas carregadas ou transmebranas, que n?o s?o detectadas por 2D-PAGE. Dos 23668 pept?deos detectados, 311 prote?nas foram identificadas atrav?s do emprego dos algoritmos Mascot e Blast, entre as quais prote?nas constituintes do sistema nervoso previamente reportadas nas fra??es de mielina de vertebrados. Quando prote?nas t?picas da mielina de vertebrados foram procuradas, apenas pept?deos relacionados ? prote?na proteolip?dica (PLP) foram identificados. Uma busca complementar por seq??ncias de PLP no banco de dados de ESTs de L. vannamei resultou na identifica??o de seq??ncias adicionais. Estes achados demonstram que as prote?nas presentes na mielina do L. vannamei refletem um perfil semelhante a fra??es de mielina de vertebrados, e tamb?m a identifica??o de seq??ncias relacionadas a PLP, uma das prote?nas mais abundantes na mielina dos tetr?podes, pela primeira vez. Com base na identifica??o de m?ltiplos pept?deos correspondendo a dom?nios imunoglobulina t?picos de prote?nas de ades?o na fra??o de mielina do camar?o, utilizamos um anticorpo capaz de reconhecer as duas isoformas da glicoprote?na associada ? mielina (MAG) de mam?feros em cortes de cord?o nervoso de L. vannamei. Os resultados demonstraram uma liga??o espec?fica que dever?o ser explorados com estrat?gias complementares a fim de se confirmar a identidade do ant?geno presente na mielina do camar?o. Estes resultados sugerem a presen?a de prote?nas com caracter?sticas pr?ximas ?s j? descritas na mielina dos vertebrados na mielina de L. vannamei. Estes achados, somados a estrat?gias complementares, podem contribuir para o melhor entendimento do surgimento da mielina ao longo da evolu??o e da rela??o entre os grupos de animais que apresentam mielina.

Localidades contendo tetrápodes fósseis do Permiano são conhecidas para a Formação Rio do Rasto (FRR) no sul do Brasil desde a década de 1970. Posteriormente, elas foram agrupadas em três “faunas locais”, correlacionáveis com as ocorrências de tetrápodes do Guadalupiano e do Lopingiano da África do Sul e da Rússia. Contudo, os fósseis de tetrápodes no Brasil ocorrem em afloramentos dispersos, isolados e discontínuos, de maneira que a maioria deles não possui dados precisos referentes ao seu posicionamento estratigráfico no sítio de coleta. Sugere-se que seja suspenso o uso do termo “fauna local” para as localidades contendo tetrápodes da FRR, pois elas provavelmente agrupam táxons que não são contemporâneos. A presente tese reconheceu dez localidades contendo tetrápodes nesta formação, mas apenas em quatro delas há o registro de terápsidos (Serra do Cadeado-EFCP, Fazenda Fagundes, Fazenda Boqueirão e Tiarajú-Barro Alto). Até o momento, terápsidos permianos são reportados na América do Sul apenas na FRR e compreendem anomodontes e dinocefálios. Aqui são relatadas duas novas ocorrências de terápsidos para esta unidade. O espécime UFRGS-PV-0487P foi identificado como um Tapinocephalidade indeterminado (Dinocephalia) e provém da localidade Serra do Cadeado-EFCP. Comparação com outros Tapinocephalidae indicam que UFRGS-PV-0487P é um espécime juvenil ou sub-adulto, semelhante a Moschops e Moschognathus da Zona de Assembleia (ZA) de Tapinocephalus da África do Sul. A segunda ocorrência de terápsido reportada aqui é baseada no espécime UNIPAMPA-PV-317P, reconhecido como um novo gênero e espécie de anomodonte (especificamente um dicinodonte). Características diagnósticas do novo táxon incluem cristas bem desenvolvidas (em norma ventral) a partir da placa mediana do pterigoide e ao longo dos ramos anteriores do pterigoide, ângulo marcado da porção posterior dos ramos do pterigoide, presença de pequenas presas caniniformes a partir de uma pequena incisura levemente posterior a cada processo caniniforme e presença de um processo retro-articular bem desenvolvido e em forma de bulbo na mandíbula. Não está claro ainda se o tamanho reduzido das presas caniniformes é devido à ontogenia, patologia ou a dimorfismo sexual. A análise filogenética indicou que UNIPAMPA-PV-317P é o membro mais basal de Bidentalia, um clado cosmopolita que inclui a maioria dos dicinodontes permianos e triássicos. Em relação às correlações bioestratigráficas possíveis para as localidades contendo tetrápodes na FRR, não é possível correlacionar estas localidades com apenas uma das ZAs da África do Sul ou mesmo da Plataforma Russa no momento, por que a FRR parece abrigar múltiplas assembleias de tetrápodes, das quais um retrato muito tendenciado é conhecido. Apenas a localidade de Aceguá Sítio 1 indica um pequeno refinamento, visto que os níveis abaixo da ocorrência de Provelosaurus americanus (um pareiassaurídeo) foram datados com métodos radiométricos e indicaram ser mais recentes do que 265 Ma, demonstrando que este sítio é correlacionável a partir da ZA de Tapinocephalus. / Permian tetrapod-bearing localities have been recovered from the Rio do Rasto Formation (RRF) in southern Brazil since the 1970s. Posteriorly, they have been grouped into three ‘local faunas’, correlated with the Guadalupian and Lopingian tetrapods of South Africa and Russia. However, tetrapod findings in the Brazilian deposit occur in disperse, isolated and discontinuous outcrops and most specimens lack precise data regarding their stratigraphic provenance. We suggest that the term ‘local fauna’ be discontinued for the tetrapod-bearing localities of the RRF, since they may be grouping non-contemporaneous taxa. The present study recognized ten tetrapod-bearing localities in this formation, but only four of them bear therapsid remains (Serra do Cadeado-EFCP, Fagundes Farm, Boqueirão Farm and Tiarajú-Barro Alto). Until date, Permian therapsids in South America are only known from the RRF and comprise anomodonts and dinocephalians. Here we report two new therapsid occurrences for this unit. The specimen UFRGS-PV-0487P was identified as a Tapinocephalidae indet. (Dinocephalia), from the Serra do Cadeado-EFCP locality. Comparison with other tapinocephalids indicates that UFRGS-PV-0487P is a juvenile or sub-adult specimen, which most closely resembles the ‘moschopines’ Moschops and Moschognathus from the Tapinocephalus Assemblage Zone (AZ) of South Africa. The second occurrence is based on the specimen UNIPAMPA-PV-317P, recognized as a new genus and species of anomodont (namely a dicynodont). Diagnostic features of the new taxon include well-developed ridges extending from the crista oesophagea anteriorly along the pterygoid rami, strong posterior angulation of the posterior pterygoid rami, small tusks erupting from a short incisure slightly posterior to each caniniform process and well-developed bulbous retroarticular process of the articular. It is not clear whether the reduced size of the tusks represents pathology, an ontogenetic feature or sexual dimorphism. Phylogenetic analysis indicates that UNIPAMPA-PV-317P is the most basal member of Bidentalia, a cosmopolitan clade that includes most of the Permian and Triassic dicynodonts. It is not possible at the moment to constrain the time interval of the tetrapod-bearing localities of the RRF to only one biozone of South Africa or Russia because the RRF seems to bear incomplete but multiple faunal assemblages. Aceguá Site 1 age is better constrained due to radiometric dating, but it only indicates that the levels bearing the pareiasaurid Provelosaurus americanus are younger than 265 My and can be correlated with the Tapinocephalus AZ.