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Infection des cellules du système immunitaire par le virus ZikaProvost, Joël 27 September 2018 (has links)
Le virus Zika est un pathogène qui a récemment retenu l’attention de la communauté scientifique suite à une importante éclosion en Amérique du Sud. Ce virus, peu étudié auparavant, peut causer des pathologies parfois graves chez les personnes infectées. Nous avons démontré que le virus Zika peut infecter les macrophages dérivés de monocytes. Plusieurs souches virales peuvent infecter les macrophages, mais certaines différences existent entre ces souches quant au taux d’infection et la cinétique de réplication. La réplication virale serait localisée autour du noyau de la cellule, comme ce qui est connu des autres membres de la famille des Flaviviridae. Les macrophages sont résistants aux effets cytopathiques du virus et peuvent donc jouer un rôle de réservoir viral à long terme. L’autophagie est un mécanisme nécessaire et important à la complétion du cycle viral du virus Zika dans les macrophages. Lors d’une co-infection entre le virus Zika et le VIH-1 dans les macrophages, il n’y a pas d’effet observé sur le taux d’infection et la réplication virale du VIH-1. Cependant, il y a une diminution de la réplication virale du virus Zika lors de ces co-infections. L’ajout de B18R, un inhibiteur de la réponse interféron de type I vient contrecarrer cette modulation, démontrant le mécanisme d’action de cette modulation. L’ajout d’un inhibiteur de la signalisation de la voie de l’interféron permet d’augmenter le taux d’infection des macrophages par le virus Zika. En résumé, le virus Zika peut infecter les macrophages et ces cellules pourraient être un réservoir viral à long terme, le virus a besoin de l’autophagie pour se répliquer et la production d’interféron de type I par les cellules qui sont infectées par un autre virus a un effet important sur la diminution de la réplication du virus Zika. / Zika virus is a pathogenic agent who recently gathered attention from the scientific community following a major outbreak in South America. This virus, who received little attention prior to this outbreak, can induce major pathologies in infected individuals. Our results indicate that Zika virus can infect monocyte-derived macrophages. Many viral strains can infect macrophages, but some differences were put in evidence, particularly regarding the infection rate and replication kinetic of the different strains. Viral replication occurs around the nucleus, which is expected and known from other viruses of the Flaviviridae family. Macrophages are resistant to the cytopathic effect of the virus, and can produce virus for many days. Autophagy is a necessary, and important cellular mechanism in completion of the virus life cycle. In the context of confections with Zika virus and HIV1, there is no effect observed in the infection rate and replication level of HIV-1. However, there is a decrease observed in the overall replication of Zika virus. The presence of B18R, a type I interferon inhibitor, restores a normal viral replication, demonstrating the mechanism behind this modulation. Addition of an inhibitor targeting the interferonmediated signalling pathway increases the infection rate of macrophages by Zika virus. In summary, Zika virus can infect macrophages, requires the autophagy signalling pathway to successfully replicate in macrophages, and is negatively impacted by interferon produced by its host cells infected by another virus.
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Estudo da infecção de vírus ZIKA em modelo de explantes de placenta humana /Ribeiro, Milene Rocha. January 2018 (has links)
Orientador: Paula Rahal / Coorientador: / Banca: / Resumo: O ZIKV é um vírus de RNA, não segmentado, de fita simples e sentido positivo membro da família Flaviviridae. O genoma viral possui uma arquitetura típica de flavivírus, com cerca de 11kb de comprimento, que codifica três proteínas estruturais (Capsídeo, precursor-Membrana, Envelope) e sete proteínas não-estruturais (NS1, NS2A, NS2B, NS3, NS4A, NS4B, NS5). Nas Américas, emergiu rapidamente após surto na ilha da Páscoa, Chile. No Brasil, o surto iniciou em 2015, aumentando consideravelmente casos de microcefalia em recém-nascidos. Aliada a esses casos, também foi observada a ocorrência de síndrome neurológica de Guillain-Barré. Essas associações transformaram o impacto da transmissão e infecções por ZIKV em uma preocupação de saúde pública global. O vírus é transmitido principalmente pelos mosquitos do gênero Aedes, que possuem ampla distribuição e apresentam grandes adaptações a ambientes urbanos. Além de transmissão vetorial, pode ser transmitido via sexual e materno-fetal. O objetivo deste trabalho foi comparar as infecções por uma cepa contemporânea de ZIKV com DENV2 em modelo de explantes de placenta humana a termo, bem como quantificar expressão de citocinas, interferons do tipo I, II e III e marcadores de apoptose induzida via infecção viral. Os resultados demonstram que os explantes da placenta a termo são permissivos e apoiam a infecção por ZIKV. A quantificação da carga viral entre infecções ZIKV e DENV2 foram similares. No entanto, DENV2 apresentou decréscimo na... / Abstract: ZIKV is a non-segmented, single-stranded, positive-sense RNA virus and a member of the Flaviviridae family. Its genome has a typical 11 kB-long flavivirus architecture that encodes three structural proteins (Capsid, PrecursorMembrane, Envelop) and seven non-structural proteins (NS1, NS2A, NS2B, NS3, NS4A, NS4B and NS5). In the Americas, the viruses emerged rapidly after outbreak on Pascoa Island, Chile. The outbreak reached Brazil in 2015, substantially increasing cases of microcephaly in newborns. In addition to microcephaly, cases associated with neurological diseases such as GuillainBarré syndrome have made ZIKV a global public health concern. The virus is mainly transmitted by mosquitoes of the genus Aedes, which are widely distributed and which have adapted well great to urban environments. In addition to vector transmission, ZIKV can be transmitted via sexual and maternal-fetal routes, the virus has been isolated is from sperm, amniotic fluid and central nervous systems of stillborn fetuses. The goal of this report was compare ZIKV-infected to DENV2 in full-term human placenta explant model. Quantify expression of cytokines, type I, II and III interferons and markers of induced-apoptosis by viral infection. The results demonstrated that full-term placenta explants are permissive and support ZIKV infection. Viral loads in ZIKV and DENV2 infections were similar. However, DENV2 presented a decrease in viral load release at 24 hours post infection (h.p.i). The kinetics of viral replication coincided with the expression of proinflammatory cytokines and the increase of apoptosis in the infected tissue. Apoptosis was partially dependent on TNF-α. Anti-TNF-α treatment significantly decreased the activated-caspase 3 mediated viral infection. Cumulatively, this model demonstrates that human placental tissues are targets of ZIKV-infection and that the infection is pathogenic to ... / Doutor
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Étude du rôle de la microglie dans l'infection du système nerveux central par le virus Zika dans un modèle murinEnlow, William 02 February 2024 (has links)
Depuis sa réémergence durant l'épidémie de 2013-2017 dans les régions du Pacifique et des Amériques, le virus Zika a été associé à plusieurs complications neurologiques chez l'adulte. L'immunité innée représente une composante importante de la réponse immunitaire au sein du système nerveux central (SNC). Nous avons donc postulé que les microglies, macrophages résidents du SNC, jouent un rôle actif dans le développement de la réponse initiale à l'infection du cerveau mature par le virus Zika. Nous avons utilisé un modèle murin non létal, déficient pour des composantes de l'immunité innée, pour étudier le rôle des microglies dans la pathogénèse et la réponse immunitaire lors de l'infection du SNC. Les souris infectées présentaient une virémie et une charge virale cérébrale élevées sans manifestations cliniques de l'infection. Une analyse immunohistochimique a montré que le virus Zika était distribué dans plusieurs régions du cerveau, particulièrement dans l'hippocampe dorsal. Dans cette région, le nombre de microglies est demeuré stable après l'infection, mais elles montraient des caractéristiques morphologiques compatibles avec un état de réactivité. Une analyse ultrastructurelle en microscopie électronique a révélé que les microglies présentaient une activité phagocytaire et une digestion extracellulaire accrues durant l'infection. La déplétion pharmacologique des microglies a provoqué une augmentation de la réplication virale et les astrocytes présentaient une activité phagocytaire compensatoire. Dans l'ensemble, ces résultats montrent que les microglies sont impliquées dans le contrôle de la réplication du virus Zika et dans son élimination phagocytaire au sein du SNC de souris jeunes adultes immunodéficientes. / Since its re-emergence during the 2013-2017 epidemic across the Pacific and the Americas, Zika virus has been associated with several neurological complications in adults. Because innate immunity is an important component of the immune response within the central nervous system (CNS), we postulated that microglia, the resident macrophages of the CNS, play an active role in the development of the initial response to infection of the mature brain with Zika virus. We used a non-lethal mouse model deficient in components of innate immunity to study the role of microglia in the pathogenesis and immune response of Zika virus infection of the CNS. Infected mice developed elevated viremia and brain viral load without showing clinical signs of infection. Immunohistochemical analysis showed that Zika virus was distributed in several regions of the brain, predominantly in the dorsal hippocampus. In this region, the number of microglia remained steady after infection with Zika virus, but microglia adopted morphological characteristics consistent with a state of reactivity. Ultrastructural analysis by electron microscopy revealed that microglia exhibited increased phagocytic activity and extracellular digestion during infection. Pharmacological depletion of microglia caused an increase in viral replication and astrocytes exhibited compensatory phagocytic activity. Taken together, these results show that microglia are involved in the control of Zika virus replication and its phagocytic elimination within the brain of immunodeficient young adult mice.
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Rol de la enfermera en la prevención y control de dengue, chikungunya y zika en red de servicios de salud de Chiclayo - Perú 2017Garay Laynes, Katherine Del Rocio, Mendoza Vásquez de Villalobos, Anita Michelle January 2018 (has links)
Las enfermedades metaxénicas en el Perú constituyen uno de los principales problemas de salud, teniendo gran impacto sobre la salud pública nacional; debido a esta problemática se planteó la pregunta de investigación ¿cuál es el rol de la enfermera en la prevención y control del dengue, chikungunya y zika en red de servicios de salud de Chiclayo, Perú 2017?, tuvo como objetivos describir y analizar el rol de la enfermera (o) en la prevención y control en la red de servicios de salud Chiclayo. Teniendo como bases teórico conceptuales al autor Ayuso D. en su libro enfermería familiar y comunitaria, y la norma técnica peruana de prevención y control de enfermedades metaxénicas. Esta Investigación fue de tipo cualitativa con abordaje metodológico estudio de caso. Los sujetos de estudio fueron 10 enfermeras de los centros de salud de la red de servicios de salud Chiclayo escenario II y III según riesgo entomológico. El tamaño de la muestra se determinó con técnica de saturación y redundancia, se utilizó la entrevista semiestructurada para la recolección de datos, siendo analizadas en tres fases: pre análisis, codificación, categorización. Así mismo se tuvo como base los principios éticos y los criterios de rigor científico. Del análisis realizado se obtuvo como resultado cuatro categorías: Educación para la prevención y control de enfermedades como dengue, chikungunya y zika, cuidado de enfermería en la vigilancia epidemiologia y entomológica, limitantes para la prevención y control de enfermedades antes mencionadas y concertación multisectorial en enfermería en enfermedades de vigilancia epidemiológica. / Tesis
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Biologie du virus zika dans les cellules cutanées et les astrocytes / Biology of zika virus in human skin cells and astrocytesHamel, Rodolphe 10 February 2017 (has links)
Le virus Zika (ZIKV), virus découvert pour la première fois à la fin des années quarante, est un arbovirus émergent récemment arrivé sous le feu des projecteurs à l’occasion d’une pandémie rapide à l’échelle mondiale. Appartenant à la famille des Flaviviridae, ce flavivirus est transmis par les moustiques du genre Aedes. Alors qu’on le croyait relativement peu pathogène, ce virus se révèle être la cause probable d’une vague de complications neurologiques, incluant l’apparition de microcéphalies et de syndromes de Guillain-Barré. De plus, il n’existe à l’heure actuelle ni vaccins ni traitements spécifiques, la lutte contre le virus se résumant largement à la mise en place de mesures de prévention contre la piqûre de moustiques et la lutte anti-vectorielle.Une meilleure connaissance de l’ensemble de la biologie du virus, depuis les modalités d’entrée dans l’organisme, en particulier au niveau cutanée, jusqu’aux mécanismes moléculaires intimes de la réplication du virus s’avère nécessaire. Par des approches moléculaires et cellulaires, nous avons mis en évidence le tropisme du virus, identifié ses récepteurs et déterminé les réponses cellulaires induites par ce dernier. Nos travaux ont également identifié un potentiel mécanisme d’évasion mise en place par le ZIKV. Nous avons également entrepris un travail original sur un mécanisme moléculaire favorisant la pathogénicité des flavivirus. Une meilleure connaissance de ce mécanisme pourrait déboucher sur l’identification de potentiels cibles thérapeutiques. Enfin, le tropisme neuronal avéré du ZIKV nous a amené à travailler sur la réponse immune des astrocytes humain. En effet, les astrocytes forment une population cellulaire très importante dans le système nerveux central qui est fortement impliquée dans les mécanismes de neurogénèse dans le cerveau des fœtus. / The Zika virus (ZIKV) was first isolated from non-human primates the late 1940s. This emerging arbovirus has recently been under the spotlight due to a rapid world pandemic. Belonging to the Flaviviridae family, this flavivirus is transmitted by Aedes’ genus mosquitoes. Historically low pathogenic, a new major concern is the possible association of ZIKV with diverse of neurological complications, including the development of microcephaly and Guillain-Barré syndrome, particularly in newborns of infected mothers. In addition, there is currently no vaccine or specific treatment to cure the disease, so the main preventive measures to fight the spreading of the virus are to prevent mosquitoes’ bites and to plan an effective vector control. A better understanding of the biology of the virus, from the entry in the body, especially at the skin level, to the molecular mechanisms of viral replication, is therefore necessary.Using different molecular and cellular strategies, we investigated the tropism of the virus, identified cell surface receptors and determined the cell’s responses to the infection. Our work also permitted to identify a potential mechanism by which ZIKV evades the host immune system to facilitated his own replication. We also have undertaken original work on a molecular mechanism increasing the pathogenicity of flavivirus. A better knowledge of this mechanism may lead to the identification of potential therapeutic targets. Finally, considering the neuronal tropism of the ZIKV, we studied the immune response of human astrocytes, a very important cell population in the central nervous system, playing a major role in the mechanisms of neurogenesis during the fetus’ brain development.
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Detección del virus del Dengue, Chikungunya y Zika en pacientes con síndrome febril en el departamento de Piura, PerúTantalean Yépez, Jorge Derek, Sánchez Carbonel, José Fernando 22 January 2018 (has links)
Background: Arboviral diseases has reemerged in the last years affecting primarily the coast of Peru. Piura is an endemic region of Dengue, where the recent appearance of Chikungunya (CHIKV) and Zika (ZIKV) has been renewed. Aim: To assess the presence of DENV, CHIKV, and ZIKV in serum samples of patients with acute febrile illness in a locality of Piura, Peru and describe associated clinical features. Methodology: Descriptive cross-sectional study, sampling was done for convenience where it was obtained a total of 496 serum samples from patients with acute febrile illness were collected from 18 primary care centers. All samples were analyzed via real-time RT-PCR to detect DENV, CHIKV, and ZIKV. In addition, positive samples for DENV were also processed for serotypes 1 to 4 classification via RT-PCR. Results: DENV was the most common arbovirus detected in 170/496 (34.3%), followed by ZIKV in 39/496 (7.9%) and CHIKV in 23/496 (4.6%). Among the 170 samples positive for DENV, serotype 2 was the most predominant type present in 97/170 (57.1%) of samples, followed by the serotype 3 in 9/170 (5.3%). Headaches, muscle pain, and joint pain were the most common symptoms associated with fever in patients with DENV and ZIKV. No symptoms predominance was observed in patients with CHIKV. Conclusions: DENV is considered the most frequent arbovirus in Peru and the number of cases has increased dramatically in the last 5 years. However, it is not the only arbovirus that circulates along the northern coast of Peru. It has also been determined the presence of ZIKV and CHIKV in our population, which may suggest the circulation of other arboviruses that have not been detected. / Tesis
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Étude fonctionnelle des intéractions génétiques du virus Zika avec les réponses antivirales de l'hôte / Study of the genetic interactions between Zika virus and the host antiviral responsesGrass, Vincent 22 May 2018 (has links)
Au cours des récentes épidémies, l’infection par le virus Zika (ZIKV) est à l’origine de microcéphalies chez le fœtus, d’avortements spontanés et du syndrome de Guillain–Barré chez l’adulte. L’infection par ZIKV représente donc un problème de santé publique. Il est nécessaire de comprendre la biologie de ce virus et quelles sont les réponses cellulaires impliquées. Dans les cellules infectées, les virus sont détectés par des récepteurs de la réponse immunitaire innée, tels que les Toll-like receptors (TLR). Cette reconnaissance conduit à la production de molécules antivirales, tel que l’interféron (IFN) de type I et III. De récents travaux montrent que l’activation de la voie TLR3 contribuerait au contrôle de la propagation de ZIKV et sa pathogénèse. Nous avons mis en place une approche pour cartographier les interactions génétiques entre le génome viral et différents régulateurs et effecteurs de cette réponse antivirale, incluant les étapes de reconnaissance du virus par TLR3. Cette approche est basée sur une combinaison de biologie moléculaire et d’évolution expérimentale qui repose sur le taux élevé de mutation de ZIKV et sa rapide faculté d’adaptation. J’ai pu mettre en avant l’apparition d’un phénotype de ZIKV face aux défenses antivirales de lignées cellulaires humaines qui se caractérise par une résistance à l’activation de la voie TLR3 et une meilleure propagation du virus après 5 passages. J’ai été capable d’observer que la population virale adaptée présente une perte d’activation des réponses antivirales (i.e. ISG15, MxA) 3h post-infection. La mise au point et la validation de l’approche CirSeq permet une analyse de précision des données de séquençage haut-débit, et permettra ainsi de prédire l’évolution de mécanismes d’échappement viral. / Zika virus (ZIKV) infection causes neurological diseases and birth defects representing an important threat for human health. Recent studies demonstrated that interferon (IFN) response is pivotal for the control of ZIKV spread, its in utero transmission and protects against ZIKV-induced neurological diseases. It is necessary to understand the biology of this virus and what are the cellular responses involved. In infected cells, viruses are detected by receptors of the innate immune response, such as Toll-like receptors (TLRs). This recognition leads to the production of antiviral molecules, such as type I and III interferon (IFN). Recent work shows that activation of the TLR3 pathway contributes to controlling the spread of ZIKV and its pathogenesis. We have implemented an approach to map the interactions between the viral genome and different regulators and effectors of this antiviral response, including the TLR3 virus recognition steps. This approach is based on a combination of molecular biology and experimental evolution based on the high mutation rate of ZIKV and its rapid adaptation. I was able to highlight the appearance of a phenotype of ZIKV against the antiviral defenses of human cell lines that triggered resistance to activation of the TLR3 pathway and a better spread of the virus after 5 iterative passages. I was able to observe that the adapted viral population exhibited a loss of activation of antiviral responses (i.e. ISG15, MxA) 3h after infection. The implementation and validation of the CirSeq approach allows an analysis of the accuracy of high throughput sequencing data, as well as predicting the evolution of viral escape mechanisms.
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Réponse cellulaire à l'infection par les arbovirus Sindbis et Zika. Effets d'un facteur environnemental : le cadmium / Cellular response to Sindbis and Zika arbovirus infection Effects of an environmental factor : the cadmiumFrumence, Étienne 08 July 2016 (has links)
Les arbovirus sont un groupe de virus transmis par des vecteurs arthropodes contaminant chaque année plusieurs centaines de millions de personnes à travers le monde. De nombreux facteurs environnementaux, comme les xénobiotiques peuvent influencer la propagation des infections virales, la susceptibilité de l'hôte et la sévérité de l'infection. Parmi eux, le cadmium, métal toxique est connu pour moduler la résistance de l'hôte lors des infections par les arbovirus. Ces travaux de thèse se sont portés sur l'étude de l'alphavirus Sindbis et du flavivirus Zika infectant des cellules épithéliales humaines. Les résultats de cette thèse ont permis de démontrer que les cellules A549 étaient permissives à la souche épidémique de 2013 du virus Zika. Le virus se réplique efficacement et induit une apoptose de type mitochondriale dans les cellules A549. La réponse immunitaire innée des cellules a été caractérisée et le rôle des interférons de type I a été mis en avant. Ces résultats peuvent contribuer à une meilleure compréhension des mécanismes de pathogénicité de ce virus chez l'homme. Par la suite, les effets d'une exposition au cadmium lors des infections par les virus Sindbis et Zika ont été évalués. L'infection par le virus Zika n'a pas été modulée par l'exposition au cadmium in vitro. Mais de façon surprenante dans le cas de l'infection des cellules HEK 293, le cadmium a protégé les cellules des effets cytopathiques induits par le virus Sindbis. En présence de cadmium, l'apoptose induite par le virus a été inhibée et la réplication du virus Sindbis a été réduite. / Arboviruses are a group of viruses transmitted by arthropod vectors infecting hundreds of millions of people each year worldwide. Many environmental factors including xenobiotics can influence the spread, the susceptibility and the outcome of viral infections. Among them, cadmium, a toxic metal is known to affect the host resistance against arboviral infection. In this thesis, our work has been focused on studying the infection capability of the Sindbis alphavirus and the Zika flavivirus in human epithelial cells. The results demonstrated that A549 cells was permissive to the 2013 epidemic strain of Zika virus. The virus replicates efficiently leading to mitochondrial apoptosis. The innate immune response was characterized and the crucial role of type I interferon was highlighted. These results may contribute to a better understanding of Zika virus pathogenesis in humans. Thereafter, the effects of cadmium exposure on Sindbis virus and Zika virus infection was evaluated. Zika virus infection was not modulated by cadmium in vitro. Interestingly, cadmium protected the HEK 293 cells from the cytopathic effect induced by Sindbis virus. Cadmium exposure inhibited the apoptosis and reduced the viral replication.
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Rol de la enfermera en la prevención y control de dengue, chikungunya y zika en red de servicios de salud de Chiclayo - Perú 2017Garay Laynes, Katherine Del Rocio, Mendoza Vásquez de Villalobos, Anita Michelle January 2018 (has links)
Las enfermedades metaxénicas en el Perú constituyen uno de los principales problemas de salud, teniendo gran impacto sobre la salud pública nacional; debido a esta problemática se planteó la pregunta de investigación ¿cuál es el rol de la enfermera en la prevención y control del dengue, chikungunya y zika en red de servicios de salud de Chiclayo, Perú 2017?, tuvo como objetivos describir y analizar el rol de la enfermera (o) en la prevención y control en la red de servicios de salud Chiclayo. Teniendo como bases teórico conceptuales al autor Ayuso D. en su libro enfermería familiar y comunitaria, y la norma técnica peruana de prevención y control de enfermedades metaxénicas. Esta Investigación fue de tipo cualitativa con abordaje metodológico estudio de caso. Los sujetos de estudio fueron 10 enfermeras de los centros de salud de la red de servicios de salud Chiclayo escenario II y III según riesgo entomológico. El tamaño de la muestra se determinó con técnica de saturación y redundancia, se utilizó la entrevista semiestructurada para la recolección de datos, siendo analizadas en tres fases: pre análisis, codificación, categorización. Así mismo se tuvo como base los principios éticos y los criterios de rigor científico. Del análisis realizado se obtuvo como resultado cuatro categorías: Educación para la prevención y control de enfermedades como dengue, chikungunya y zika, cuidado de enfermería en la vigilancia epidemiologia y entomológica, limitantes para la prevención y control de enfermedades antes mencionadas y concertación multisectorial en enfermería en enfermedades de vigilancia epidemiológica.
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Mathematical modeling and statistical inference to better understand arbovirus dynamics / Modélisation mathématique et inférence statistique pour une meilleure compréhension des dynamiques des arbovirosesChampagne, Clara 11 December 2018 (has links)
L’importance et l’expansion des arboviroses comme la dengue ou le virus Zika nécessite des modèles pour mieux comprendre et prédire leurs dynamiques. La propagation vectorielle de ces maladies est influencée par de multiples facteurs humains et environnementaux qui rendent complexe la construction de modèles épidémiologiques parcimonieux. Parallèlement, de nombreux outils théoriques et computationnels existent désormais pour confronter ces modèles aux données observées. L’objectif de ce travail de thèse est donc d’apporter l’éclairage des données sur les modèles de propagation des arboviroses. Dans un premier temps, il s’agit d’identifier les éléments les plus importants à incorporer pour modéliser les dynamiques de la dengue en milieu rural, dans la région de Kampong Cham (Cambodge). Différents modèles sont comparés, complexifiant à la fois le détail de l’histoire de la maladie et la prise en compte des formes de stochasticité. Dans le cadre déterministe, on a pu souligner l’importance des interactions entre sérotypes, et le faible intérêt pour la représentation explicite des moustiques vecteurs et des individus asymptomatiques. Par ailleurs, la prise en compte des incertitudes indique qu’une large part de la dynamique est capturée seulement par la stochasticité et non par les éléments du squelette déterministe du modèle. Aussi étudie-t-on dans un second temps d’autres aspects de la transmission de la dengue, comme la saisonnalité et la structure spatiale, grâce à des données d’épidémies à Rio de Janeiro (Brésil). Dans un dernier temps, ces méthodes et modèles sont appliqués à l’étude d’un arbovirus émergent, le virus Zika. A partir de données d’épidémies survenues dans le Pacifique, les paramètres-clé de la propagation du virus sont estimés dans le cadre stochastique, et leur variabilité est envisagée à la fois en termes de contexte géographique et de modèle épidémiologique, par la comparaison de quatre îles et de deux modèles à transmission vectorielle. Par ailleurs, la question des interactions potentielles du virus Zika avec celui de la dengue est explorée. / Arboviruses such as the dengue and Zika viruses are expanding worldwide and mo- deling their dynamics can help to better understand and predict their propagation, as well as experiment control scenarios. These mosquito-borne diseases are influenced by a multiplicity of human and environmental factors that are complex to include in parsimonious epidemiological models. In parallel, statistical and computational tools are nowadays available to confront theore- tical models to the observed data. The objective of this PhD work is therefore to study arbovirus propagation models in the light of data. Firstly, in order to identify the most important elements to incorporate in models for dengue dynamics in a rural setting, several dengue models are com- pared using data from the Kampong Cham region in Cambodia. Models incorporate increasing complexity both in the details of disease life history and in the account for several forms of sto- chasticity. In the deterministic framework, including serotype interactions proved decisive, whereas explicit modeling of mosquito vectors and asymptomatic infections had limited added value, when seasonality and underreporting are already accounted for. Moreover, including several forms of un- certainties highlighted that a large part of the disease dynamics is only captured by stochasticity and not by the elements of the deterministic skeleton. Therefore, secondly, we explore other aspects of transmission, such as seasonality and spatial structure, in the case of dengue epidemics in Rio de Janeiro (Brazil). Finally, the models and estimation methods are applied to study an emerging arbovirus, the Zika virus. Using data from epidemics in the Pacific, we estimate the key parameters of disease propagation in the stochastic framework and explore their variability in terms of geogra- phic setting and model formulation by comparing four islands and two models with vector-borne transmission. In addition, potential interactions with the dengue virus are explored.
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