Introdução: A Organização Mundial da Saúde sugere que as recomendações alimentares para populações devem basear-se em alimentos ao invés de nutrientes. No entanto, devem levar em consideração, que os indivíduos não consomem nutrientes ou alimentos isoladamente e sim refeições compostas por uma variedade de alimentos. Objetivo: Identificar os padrões alimentares do café da manhã, almoço e jantar da população adulta e idosa do município de São Paulo e caracterizá-los de acordo com variáveis socioeconômicas, demográficas e antropométricas. Métodos: Foram utilizados dados secundários do estudo transversal de base populacional ISA-Capital 2008 de adultos e idosos (n=1102). O consumo alimentar foi estimado pelo Multiple Source Method considerando dois recordatórios de 24 horas. A partir dos grupos de alimentos de cada refeição aplicou-se análise fatorial por componentes principais (rotação varimax) para derivar os padrões alimentares. Calcularam-se os escores fatoriais, que foram então utilizados para agrupar os indivíduos através da análise de agrupamento. Adicionou-se um grupo com os indivíduos que não realizaram a refeição para cada uma das análises. Os grupos foram caracterizados segundo sexo, faixa etária, renda familiar per capita e estado nutricional. Admitiu-se nível de significância de 0,05 e para caracterização dos grupos considerou-se uma diferença de escore padronizado em pelo menos |0,5| com relação à amostra geral. Resultados: Identificou-se prevalência de 5,6 por cento de omissão do café da manhã, 3,6 por cento do almoço e 12,8 por cento do jantar. Quanto aos que realizaram as refeições, identificaram-se três padrões do Café da Manhã: Saudável, Tradicional e Lanche; quatro padrões do Almoço: Tradicional, Salada, Suco Adoçado e Ocidental; e quatro padrões do Jantar: Café com Leite e Pão, Transição, Tradicional e Sopa e Frutas. Os grupos de indivíduos associados a idosos apresentaram aderência ao café da manhã Saudável, almoço Salada e jantar Sopas e Frutas. Aqueles associados a homens e adultos em geral omitiram o café da manhã e aderiram ao almoço Ocidental e jantar Transição. Os grupos associados a apenas homens aderiram a café da manhã e almoço Tradicional. Aqueles associados a somente adultos apresentaram aderência ao almoço Suco Adoçado. E associados a mulheres aderiram a um jantar Café com Leite e Pão. Grupos associados à baixa escolaridade aderiram a um jantar Sopa e Frutas, e os de escolaridade elevada aderiram a café da manhã Lanche e Omissão do mesmo; e padrão de almoço ocidental. Grupos associados com indivíduos de baixa renda aderiram ao almoço tradicional. Conclusão: Os resultados encontrados no presente estudo indicam que padrões alimentares identificados de acordo com a refeição discriminam bem o consumo alimentar, salientando peculiaridades que não são encontradas em análises globais. E a associação entre a aderência a esses padrões e fatores demográficos e socioeconômicos sugere a existência de públicos-alvo para o planejamento e execução de políticas públicas em alimentação e nutrição. / Introduction: The World Health Organization suggests that dietary recommendations for populations should be based on foods rather than nutrients. However, individuals do not consume foods or nutrients in isolation but meals with variety of foods. Objective: To identify dietary patterns from breakfast, lunch and dinner of the adult and elderly population in São Paulo and characterize them according to socioeconomic, demographic and anthropometric variables. Methods: Data from cross-sectional population-based ISA Capital 2008 of adults and elderly (n = 1102) was used. Dietary intake was estimated by Multiple Source Method considering two 24-hour recalls. Principal component factor analysis (varimax rotation) was used to derive dietary patterns for each meal. Factor scores were calculated and then used in the cluster analysis. Individuals that skipped the meal were added as an extra cluster. The groups were characterized by gender, age, family income and nutritional status. Significance level of 0.05 was assumed for the groups characterization it was considered a difference of standardized score of at least | 0.5 | with respect to the overall sample. Results: We found omission prevalence of 5.6 per cent for breakfast, 3.6 per cent for lunch and 12.8 per cent for dinner. Three patterns of breakfast were identified: Healthy, Traditional and Snack; four patterns to lunch: Traditional, Salad, Sweetened Juice and Western; and four patterns to dinner: Coffee with Milk and Bread, Transitional, Traditional and Soup and Fruits. The groups of individuals associated with the elderly showed adherence to Healthy breakfast, Salad lunch and Soups and Fruit dinner. The groups that were associated with adult and men skipped breakfast and adhered to the Western lunch and Transition dinner. The groups associated with only men showed adherence to Traditional breakfast and lunch. The groups associated with only adults showed adherence to Sweetened Juice lunch. The groups associated with women showed adherence with Coffee with Milk and Bread dinner. The groups associated with low education adhered to Soup and Fruits dinner, and the groups associated with high school skipped breakfast and they adhered to Snack breakfast and Western breakfast. Groups associated with low-income individuals adhered to Traditional lunch. Conclusion: The results of this study indicate that dietary patterns identified by meal discriminated food consumption very well, highlighting peculiarities that a global analysis cannot show. And the adherence to meal patterns associated with socioeconomic and demographic factors suggest there is evidence of risk groups and possible public policies related to health diet.

Submitted by Renata Lopes (renatasil82@gmail.com) on 2017-06-06T12:39:52Z No. of bitstreams: 1 viniciuscampistabrum.pdf: 846002 bytes, checksum: 5ac93812c3739c70741f6052b77b22c8 (MD5) / Approved for entry into archive by Adriana Oliveira (adriana.oliveira@ufjf.edu.br) on 2017-06-06T14:06:19Z (GMT) No. of bitstreams: 1 viniciuscampistabrum.pdf: 846002 bytes, checksum: 5ac93812c3739c70741f6052b77b22c8 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-06-06T14:06:19Z (GMT). No. of bitstreams: 1 viniciuscampistabrum.pdf: 846002 bytes, checksum: 5ac93812c3739c70741f6052b77b22c8 (MD5) Previous issue date: 2015-08-28 / CAPES - Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / Análise de agrupamento é uma tarefa descritiva e não-supervisionada de mineração de dados que utiliza amostras não-rotuladas com o objetivo de encontrar grupos naturais, isto é, grupos de amostras fortemente relacionadas de forma que as amostras que per-tençam a um mesmo grupo sejam mais similares entre si do que amostras em qualquer outro grupo. Avaliação ou validação é considerada uma tarefa essencial dentro da análise de agrupamento. Essa tarefa apresenta técnicas que podem ser divididas em dois tipos: técnicas não-supervisionadas ou de validação interna e técnicas supervisionadas ou de va-lidação externa. Trabalhos recentes introduziram uma abordagem de validação interna que busca avaliar e melhorar a estabilidade do algoritmo de agrupamento por meio de identificação e remoção de amostras que são consideradas prejudiciais e, portanto, de-veriam ser estudadas isoladamente. Por meio de experimentos foi identificado que essa abordagem apresenta características indesejáveis que podem resultar em remoção de todo um grupo e ainda não garante melhoria de estabilidade. Considerando essas questões, neste trabalho foi desenvolvida uma abordagem mais ampla utilizando algoritmo genético para análise de agrupamento e estabilidade de dados. Essa abordagem busca garantir melhoria de estabilidade, reduzir o número de amostras para remoção e permitir que o usuário controle o processo de análise de estabilidade, o que resulta em maior aplicabi-lidade e confiabilidade para tal processo. A abordagem proposta foi avaliada utilizando diferentes algoritmos de agrupamento e diferentes bases de dados, sendo que uma base de dados genotípicos também foi utilizada com o intuito de aquisição e validação de conhe-cimento. Os resultados mostram que a abordagem proposta é capaz de garantir melhoria de estabilidade e também é capaz de reduzir o número de amostras para remoção. Os resultados também sugerem a utilização da abordagem como uma ferramenta promissora para aquisição e validação de conhecimento em estudos de associação ampla do genoma (GWAS). Este trabalho apresenta uma abordagem que contribui para aquisição e valida-ção de conhecimento por meio de análise de agrupamento e estabilidade de dados. / Clustering analysis is a descriptive and unsupervised data mining task, which uses non-labeled samples in order to find natural groups, i.e. groups of closely related samples such that samples within the same cluster are more similar than samples within the other clusters. Evaluation and validation are considered essential tasks within the clustering analysis. These tasks present techniques that can be divided into two kinds: unsuper-vised or internal validation techniques and supervised or external validation techniques. Recent works introduced an internal clustering validation approach to evaluate and im-prove the clustering algorithm stability through identifying and removing samples that are considered harmful and therefore they should be studied separately. Through experi-mentation, it was identified that this approach has two undesirable characteristics, it can remove an entire cluster from dataset and still decrease clustering stability. Taking into account these issues, in this work a broader approach was developed using genetic algo-rithm for clustering and data stability analysis. This approach aims to increase stability, to reduce the number of samples for removal and to allow the user control the stability analysis process, which gives greater applicability and reliability for such process. This approach was evaluated using different kinds of clustering algorithm and datasets. A genotype dataset was also used in order to knowledge acquisition and validation. The results show the approach proposed in this work is able to increase stability, and it is also able to reduce the number of samples for removal. The results also suggest the use of this approach as a promising tool for knowledge acquisition and validation on genome-wide association studies (GWAS). This work presents an approach that contributes for knowledge acquisition and validation through clustering and data stability analysis.

Orientadores: Arnaldo Cesar da Silva Walter, Michelle Cristina Araújo Picoli / Dissertação (mestrado) - Universidade Estadual de Campinas, Faculdade de Engenharia Mecânica / Made available in DSpace on 2018-08-24T01:53:10Z (GMT). No. of bitstreams: 1 CelisTorres_LauraJimenadelPilar_M.pdf: 2012741 bytes, checksum: 2390e3157804be716a5d5a38316ada71 (MD5) Previous issue date: 2013 / Resumo: O presente trabalho tem como objetivo principal aprimorar os procedimentos metodológicos anteriormente propostos e que permitem a análise da qualidade de vida em municípios nos quais a atividade canavieira é relevante. O procedimento é baseado em indicadores socioeconômicos censitários e foi aplicado para quatro dos principais estados produtores de cana-de-açúcar do Brasil: Alagoas, Goiás, Paraná e São Paulo, no período de 1970 a 2000. Para isso, primeiramente foram coletados dados dos indicadores socioeconômicos e da localização de usinas e destilarias sucroalcooleiras instaladas nos estados, para os anos estudados. Em seguida, os municípios de cada estado foram classificados em dois grupos: com e sem significativa produção de cana-de-açúcar, assim como os municípios com significativa produção de cana foram sub-classificados em municípios com e sem presença de usinas sucroalcooleiras. Foi então realizada uma comparação dos indicadores socioeconômicos entre esses grupos e foi observado que o grupo de municípios canavieiros apresenta, em média, melhores indicadores socioeconômicos do que o grupo de municípios não canavieiros para os quatro estados. Da comparação do grupo de municípios com e sem usinas, observou-se que, em geral, não há diferenças significativas dos indicadores socioeconômicos, ao nível de 5% de significância. Foi também analisada a evolução do conjunto de indicadores, durante os anos estudados, comparando-se os coeficientes angulares das retas de regressão ajustadas para cada grupo (municípios canavieiros e não canavieiros) e testando-se a existência de diferenças significativas na forma como evoluíram os indicadores. O resultado indica que a vantagem dos municípios canavieiros sobre os não canavieiros tende a diminuir com o passar do tempo. Com o objetivo de se conhecer as razões de existência de municípios canavieiros com melhores e piores indicadores socioeconômicos, foi utilizada a Análise de Cluster para separar de forma não tendenciosa os municípios em grupos de melhores e piores indicadores. Em seguida, for empregada a metodologia de Análise Discriminante. Ao contrário do esperado, os resultados indicam que a diversificação da atividade econômica não explica a existência de municípios com melhores indicadores socioeconômicos / Abstract: This work has as main objective to improve the methodological procedures previously proposed which allow the analysis of quality of life in municipalities where the sugarcane activity is relevant. This procedure is based on socioeconomic indicators and it was applied to four of the through census socioeconomic indicators for four major producing states of sugarcane in Brazil: Alagoas, Goiás, Paraná and São Paulo, from 1970 until 2000. To accomplish this, it was first collected data of the socioeconomic indicators and location of sugarcane mills and distilleries installed in states and in for the years studied. Then, the counties of each state were classified into two groups: with and without significant production of sugarcane. Likewise, municipalities with significant sugarcane production were sub-classified into: municipalities with and without the presence of sugarcane mills Therefore, it was carried out a comparison of the socioeconomic indicators amongst these those groups and it was observed that the sugarcane producing municipalities showed, on average, better higher socioeconomic indicators than the group of non-producing municipalities for the four states. Comparing the group of municipalities with and without distilleries, it was observed that, in general, there are no significant differences in the socioeconomic indicators, at the 5% level of significance. It was also analyzed the evolution of the set of indicators over the years studied, comparing the slopes of regression lines fitted for each group (sugarcane producing and non-producing municipalities) and testing for the existence of significant differences in how the indicators have evolved. The result indicated indicates that the advantage of the sugarcane producing municipalities over non-producing tends to decrease over time. The result indicates that the advantage of the sugarcane producing municipalities over non-producing tends to decrease over time. In order to know the reasons for the existence of sugar cane municipalities with the highest and lowest socioeconomic indicators, it was used Cluster Analysis to separate in a non-biased way municipalities in groups of highest and lowest indicators. Then, the methodology is employed Discriminant Analysis. Contrary to expectations, the results indicate that the diversification of economic activity does not explain the existence of cities with higher socioeconomic indicators / Mestrado / Planejamento de Sistemas Energeticos / Mestra em Planejamento de Sistemas Energéticos

Made available in DSpace on 2014-08-20T14:06:15Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Tese_ Clause_Fatima_ Piana.pdf: 1906168 bytes, checksum: 6bfd8bec615dee869166bbd0c0269e0d (MD5) Previous issue date: 2009-03-13 / In Brazil, common bean (Phaseolus vulgaris L.) is cultivated in a range of ecologically differentiated environments. For being a culture highly influenced by the environment variation, its average productivity in the Country is unstable and low. An origin of this variation of productivity is the genotype x environment interaction, which has been one of the largest impediments for obtaining genotypes that maintain consistently high yield in the growing environments. The methods proposed for the exploration of the genotype x environment interaction are directed to the stability of the yield of the genotypes or to the regionalization of the growing locations. Most of the common bean genotypes registered for cultivation in Rio Grande do Sul evidences yield instability. The present research explored data from Rio Grande do Sul Common Bean State Trial ("Ensaio Estadual de Feijão" - EEF), executed at 24 locations in the period from 1987/88 to 1994/95, with considerable variation of genotypes and locations among those years. This research had two main objectives: (1) to evaluate the magnitude and the nature of the genotype x environment interaction and (2) to identify possible stratification of the growing region of common bean in the State in sub-regions inside of which the genotypes have stable relative performance. The inferences about the components of the interaction genotype x environment were proceeded by the joint analysis of each one of the eight years and the analyses of two subsets of four years and of the set of eight years. Because of the intent of obtaining a long time regionalization, general for the growing location of the Rio Grande do Sul and for any collection of beans genotypes, the factors year, location and genotype were considered random. The maximum likelihood and the generalized minimum squares methods were used. This approach allowed taking into account the incomplete and unbalanced structure of the data and the heterogeneity of variance of the experimental error. The results of the annual analyses revealed high significance of the component of the interaction genotype x location in all of the years, indicating that the relative performance of the genotypes varies among locations. This interaction was also revealed significant in the analysis of the eight years, but was not significant in the analyses of the two subsets four years. In these three joint analyses of years the triple interaction genotype x location x year was highly significant. The indication of heterogeneous performance of the genotypes among the locations and the possibility that the pattern of performance have some consistence along the years justified the attempt to the grouping of the locations. Cluster analyses were performed for each one of the eight years and for the set of eight years by the method of Sokal and Michener, that uses the Euclidean distance as similarity measure. The cluster analysis of the set of eight years constituted subregions that are generally incoherent with the sub-regions formed by the annual analyses that, by they turn, were inconsistent amongst themselves. This incoherence and inconsistency of groupings disabled the characterization of a division of the State for the regionalization of the indication of cultivars. It should be observed, however, that these evidences might have been influenced by the considerable alterations of the genotypes and of the locations of execution of the EEF among the years of the period from 1987/88 to 1994/95 in whose data they are based. They can also have resulted, partly, of flaws of the experimental techniques adopted in that period of execution of EEF, particularly of the accentuated variations of the sowing date and of the stand by plot. / No Brasil, o feijão (Phaseolus vulgaris L.) é cultivado em uma gama de ambientes ecologicamente diferenciados. Por ser uma cultura altamente influenciada pela variação de ambiente, sua produtividade média no país é instável e baixa. Uma origem da oscilação da produtividade é a interação genótipo x ambiente, a qual tem sido um dos maiores entraves para a obtenção de genótipos que mantenham rendimentos consistentemente elevados nos diversos ambientes de cultivo. Os métodos propostos para a exploração da interação genótipo x ambiente são direcionados para a estabilidade do rendimento dos genótipos ou para a regionalização dos locais de cultivo. A maioria dos genótipos de feijão registrados para cultivo no Rio Grande do Sul evidencia instabilidade de rendimento. A presente pesquisa explorou dados do Ensaio Estadual de Feijão (EEF) do Rio Grande do Sul, conduzido em 24 locais no período de 1987/88 a 1994/95, com variação considerável de genótipos e de locais entre esses anos. Essa pesquisa teve dois objetivos principais: (1) avaliar a magnitude e a natureza da interação genótipo x ambiente e (2) identificar possível estratificação da região de cultivo do feijão no Estado em sub-regiões dentro das quais os genótipos tenham desempenho relativo estável. As inferências sobre os componentes da interação genótipo x ambiente foram procedidas pela análise conjunta de cada um dos oito anos e as análises de dois subconjuntos de quatro anos e do conjunto dos oito anos. Em razão de se pretender lograr uma regionalização de longo prazo, geral para os locais de cultivo do Rio Grande do Sul e para qualquer coleção de genótipos de feijão, os fatores ano, local e genótipo foram considerados aleatórios. Foram utilizadas as metodologias de máxima verossimilhança e quadrados mínimos generalizados. Essa abordagem permitiu levar em conta a estrutura incompleta e não balanceada dos dados e a heterogeneidade da variância do erro experimental. Os resultados das análises anuais revelaram alta significância do componente da interação genótipo x local em todos os anos, indicando que o desempenho relativo dos genótipos se altera entre os locais. Essa interação também se revelou significativa na análise dos oito anos, mas não significativa nas análises dos dois subconjuntos de quatro anos. Nessas três análises conjuntas de anos a interação tripla genótipo x local x ano foi altamente significativa. A indicação de desempenho heterogêneo dos genótipos entre os locais e a possibilidade do padrão desse desempenho ter alguma consistência ao longo dos anos justificou a tentativa de agrupamento desses locais. Foram efetuadas análises de agrupamento para cada um dos oito anos e para o conjunto dos oito anos, pelo método de Sokal e Michener, que utiliza a distância euclidiana como medida de similaridade. A análise de agrupamento do conjunto dos oito anos constituiu sub-regiões incoerentes com as sub-regiões formadas pelas análises anuais que, por sua vez, foram inconsistentes entre si. Essa incoerência e inconsistência de agrupamentos impossibilitaram a caracterização de uma divisão do Estado para a regionalização da indicação de cultivares. Observe-se, entretanto, que essas evidências podem ter sido influenciadas pelas consideráveis alterações dos genótipos e dos locais de condução do EEF no período de 1987/88 a 1994/95 em cujos dados elas se baseiam. Também podem ter decorrido, em parte, de falhas das técnicas experimentais adotadas nesse período de execução do EEF, particularmente das acentuadas variações da data de semeadura e do estande por parcela.

Este estudo foi desenvolvido a partir de informações das avaliações genéticas de touros pertencentes a rebanhos participantes do Programa de Melhoramento Genético da Raça Nelore (PMGRN-Nelore Brasil), que desenvolve, desde 1995, um teste de progênie denominado Reprodução Programada (RP), o qual tem como finalidade principal de disponibilizar animais com valores genéticos mais confiáveis no mercado de reprodutores. Assim, as Diferenças Esperadas nas Progênies (DEPs) de 234 touros participantes da RP no período de 1996 a 2003 foram analisadas com os seguintes objetivos: 1- Avaliar o mérito genético dos touros ao longo dos anos, utilizando regressão linear entre a DEP e ano de participação do touro na RP para as características, peso aos 120 e 210 dias, efeitos direto e materno (DDPP120, DDPP210, DMPP120 e DMPP210); peso e perímetro escrotal aos 365 e 450 dias, efeito direto (DDP365, DDP450, DDPE365 e DDPE450) e idade ao primeiro parto (DDIPP); 2- Identificar, por meio de abordagens multivariadas, grupos de animais cujas DEPs apresentem padrões de semelhança, assim como discriminar as variáveis que mais influenciam na divisão dos grupos, numa tentativa de auxiliar a tomada de decisão nos sistemas de produção de bovinos de corte, com vistas a maximizar a produtividade. Os procedimentos multivariados de análises de agrupamento e componentes principais foram aplicados às DEPs de sete características (DMPP120, DMPP210, DDPP365, DDPP450, DDPE365, DDPE450 e DDIPP). As análises foram processadas com o auxílio do software Statistica (STATSOFT, 2004). As tendências genéticas das DEPs relacionadas com as características de fertilidade, DDPE365, DDPE450 e DDIPP, mostraram progressos genéticos de 0,051 e 0,061 cm e -0,026 mês por ano respectivamente, enquanto que DDPP450 foi à característica que obteve maior ganho genético dentre as DEPs de crescimento, 1,467 kg/ano. Com referência às abordagens multivariadas, a análise de agrupamento k-médias foi aplicada e o resultado envolvendo três grupos foi o melhor obtido, dos quais dois se destacaram quanto aos valores médios das DEPs. A importância desses dois grupos de touros foi confirmada pela análise de componentes principais que associou a eles valores superiores de DEPs diretas de peso e perímetro escrotal. A quantidade de variabilidade original retida pelos dois primeiros componentes principais foi de 70,22%. Foram observados progressos genéticos nos touros da Reprodução Programada para todas as características durante o período estudado, indicando que a estratégia de seleção praticada vem sendo efetiva e evidenciando a importância da contribuição dos touros da RP para o melhoramento das características reprodutivas e de crescimento da raça Nelore. Neste estudo pode-se verificar o poder classificatório e discriminatório das análises de agrupamentos e componentes principais, o que muito pode contribuir na classificação de touros, facilitando a seleção de animais em Programas de Melhoramento Genético. / This research was developed with genetic information of sires that belong to herds of the ?Programa de Melhoramento Genético da Raça Nelore? (PMGRN-Nelore Brasil), witch has been carried on, since 1995, a progeny test denominated ?Reprodução Programada? (RP), whose the main aim is to obtain reliable genetic values for sires market. Therefore, the Expected Progeny Difference (EPD) of 243 sires taking part of the RP from 1996 to 2003 were used with the following objectives of: 1- Evaluating the genetic merit over the years applying linear regression between the EPD and the year of the sires RP participation, for the following traits: weight at 120 and 210 days of age, direct and maternal effects (DDPP120, DDPP210, DMPP120 and DMPP210) weight and scrotal circumference at 365 and 450 days of age, direct effect (DDPP365, DDPP450, DDPE365 and DDPE450) and age at first calving (DDIPP); 2- Identifying groups of animals, whose, EPDs show similarity patterns, as well as, verifying which were the variable that showed greater power in discriminating group formations, trying to help the decisions making support in the beef cattle production system by multivariate approaches, in order to maximizing the productivity. The multivariate procedures of clusters analysis and principal components were applied in the EPDs from seven traits (DMPP120, DMPP210, DDPP365, DDPP450, DDPE365, DDPE450 and DDIPP). The analyses were performed by software Statistica (STATSOFT, 2004). The genetic trends of the EPD related to the fertility traits, DDDPE365, DDPE450 e DDIPP, showed some genetic progress of 0.051 and 0.061 cm and ? 0.026 month per year respectively, while, the DDPP450 was the trait that obtained the highest genetic gain in the growth EPDs, 1.467 kg/year. About the multivariate approaches, the k-means clustering analysis was applied and the results of three groups formation were the best option, two of them stood out in relation to values of the EPDs means. The importance of these two groups was confirmed by the analyses of principal components that associate the direct EPDs of weight and scrotal circumference values to them. The quantity of original variability kept in the first main components was 70.22%. It was observed genetic progress in the RP sires for every trait during the studied period, indicating that the selection has been effective and evidencing how important the contribution of the RP sires for the reproductive and growth traits for the Nelore breed improvement is. In this research, the classificatory and discriminatory power of cluster analyses and principal components could be verify, and certainly could contribute in the sire classification, helping the selection in the Animal Breeding Program.

Objetivou-se com o presente estudo foram caracterizar e definir ambientes homogêneos de produção de bovinos de corte compostos no Brasil com relação às variáveis climáticas e geográficas, utilizando técnicas exploratórias multivariadas. Verificar a presença de interação genótipo-ambiente (GxE) nas características peso ao nascimento (PN), peso a desmama (PD), ganho de peso da desmama ao sobreano (GP), perímetro escrotal (PE) e musculosidade (MUS). Pela análise de agrupamento não-hierárquico foram agrupadas as regiões similares com relação às variáveis ambientais. Foram formados seis grupos de fazendas. A inclusão do efeito de interação touro-grupo foi avaliada em análises uni-característica. Comparou-se um modelo com o efeito de interação touro-grupo com outro sem esse efeito. Incluir o efeito de interação touro-GEO no modelo de avaliação genética do PN, PD e PE não resultou melhor ajuste aos dados, no entanto não deve ser descartada a hipótese de se considerar outros tipos de efeitos de GxE. Foram estimados parâmetros genéticos por meio de análises multi-característica, considerando-se a mesma característica como diferente em cada grupo de fazendas. Foi verificada heterogeneidade de variância para todas as características. Os coeficientes de herdabilidade nos grupos de fazendas para PN, PD, GP, PE e MUS variaram de 0,15 a 0,25; 0,16 a 0,25; 0,10 a 0,20; 0,17 a 0,31 e 0,17 a 0,24, respectivamente. As correlações genéticas variaram de 0,19 a 0,90 para PN, -0,02 a 0,92 para PD, 0,31 a 0,93 para GP, 0,64 a 0,89 para PE e de 0,18 a 0,80 para MUS nos grupos fazendas. As diferentes estimativas de herdabilidade obtidas entre grupos de fazendas implicam resposta à seleção diferenciada conforme o ambiente em que os animais são criados e selecionados. Pelas correlações genéticas entre as características nas diversas regiões, constatou-se GxE, indicando que os melhores reprodutores para uma determinada região não são sempre os mesmos para as demais. Um modelo hierárquico de norma de reação sob abordagem Bayesiana também foi utilizado para estimação dos componentes de variância, parâmetros genéticos e verificação da existência de GxE. Os gradientes ambientais baseados nas soluções para o efeito de grupo de contemporâneos para PN, PD, GP e PE foram -6,45 a +4,75 kg, -65 a +65 kg, -72 a +112 kg e -6.5 a +5.5 cm, respectivamente. As estimativas de herdabilidade foram crescentes no gradiente ambiental, PN (0,04 a 0,55), PD (0,39 a 0,47), GP (0,01 a 0,43) e PE (0,21 a 0,23). A correlação entre o nível e a inclinação da norma de reação para PN e GP foi de alta magnitude, indicando que os animais de maior valor genético médio foram os que apresentaram maior resposta à melhoria das condições ambientais, caracterizando o efeito de escala da GxE. Para PD e PE, a correlação entre intercepto e inclinação foi baixa implicando reclassificação dos animais em ambientes diferentes. O modelo hierárquico de normas de reação foi útil para descrever alterações nos componentes de variância decorrentes do ambiente e para descrever a presença de GxE nas características estudadas de bovinos compostos. Existe variação genética com respeito à sensibilidade dos animais, o que possibilita a seleção de genótipos mais plásticos ou mais robustos. / The objectives of this study were to characterize and define homogenous production environments of composite beef cattle in Brazil in terms of climatic and geographic variables using multivariate exploratory techniques; to evaluate the presence of genotype by environment interaction (GxE) for birth weight (BW), weaning weight (WW), postweaning gain (PWG), scrotal circumference (SC) and muscling. Nonhierarchical cluster analysis was used to group farms located in regions with similar environmental variables into clusters. Six clusters of farms were formed. The effect of sire-cluster interaction was tested by single-trait analysis. The inclusion of sire-cluster interaction in the genetic evaluation model may not result in better fit to the data for BW, WW and SC. Genetic parameters were estimated by multiple-trait analysis considering the same trait to be different in each cluster. The heritability coefficient in the clusters for BW, WW, PWG, SC and muscling ranged from 0.15 to 0.25; 0.16 to 0.25; 0.10 to 0.20; 0.17 to 0.31 and 0.17 to 0.24, respectively. The genetic correlations ranged from 0.19 to 0.90 for BW, -0.02 to 0.92 for WW, 0.31 to 0.93 for PWG, 0.64 a 0.89 for SC and 0.18 to 0.80 for muscling in the clusters of farms. The different heritability estimates between groups of farms indicates that the response to selection varies with the environment in which animals are selected. The low genetic correlations between traits in the different regions demonstrated the presence of GxE, indicating that the best sires in a certain region are not the same for the other regions. A reaction norm hierarchical model using Bayesian approach was also used for estimation of variance components, genetic parameters and to verify the existence of GxE. Environmental gradients based in solutions for the effect of contemporary groups for BW, WW, PWG and SC were -6.45 to +4.75 kg, -65 kg to +65, -72 to +112 kg and -6.5 to +5.5 cm, respectively. Heritability estimates were increasing in the environmental gradient, BW (0.04 to 0.55), WW (0.39 to 0.47), PWG (0.01 to 0.43) and SC (0.21 to 0.23). The correlation between the level and slope of reaction norm for BW and PWG was of high magnitude, indicating that animals of higher average breeding value were the ones which presented a best response to environmental improvement, characterizing a scale effect on GxE. For WW and SC, the correlation between intercept and slope was low implying reranking of animals in different environments. The reaction norm hierarchical model has been useful to describe changes in the variance components due to the environment and to describe the presence of GxE traits in composite beef cattle. There is genetic variation with respect to the sensitivity of the animals, which enables the selection of genotypes most plastics or more robust.

Made available in DSpace on 2015-03-04T18:50:55Z (GMT). No. of bitstreams: 1 DissertacaoLuizGonzaga.pdf: 3514446 bytes, checksum: 517d9c7b241b2bd9c799c807d6eac037 (MD5) Previous issue date: 2008-08-31 / The increasing amount of digitally stored texts makes necessary the development of computational tools to allow the access of information and knowledge in an efficient and efficacious manner. This problem is extremely relevant in biomedicine research, since most of the generated knowledge is translated into scientific articles and it is necessary to have the most easy and fast access. The research field known as Text Mining deals with the problem of identifying new information and knowledge in text databases. One of its tasks is to find in databases groups of texts that are correlated, an issue known as text clustering. To allow clustering, text databases must be transformed into the commonly used Vector Space Model, in which texts are represented by vectors composed by the frequency of occurrence of words and terms present in the databases. The set of vectors composing a matrix named document-term is usually sparse with high dimension. Normally, to attenuate the problems caused by these features, a subset of terms is selected, thus giving rise a new document-term matrix with reduced dimensions, which is then used by clustering algorithms. This work presents two algorithms for terms selection and the evaluation of clustering algorithms: k-means, spectral and graph portioning, in five pre-classified databases. The databases were pre-processed by previously described methods. The results indicate that the term selection algorithms implemented increased the performance of the clustering algorithms used and that the k-means and spectral algorithms outperformed the graph portioning. / O volume crescente de textos digitalmente armazenados torna necessária a construção de ferramentas computacionais que permitam a organização e o acesso eficaz e eficiente à informação e ao conhecimento nele contidos. No campo do conhecimento da biomedicina este problema se torna extremamente relevante, pois a maior parte do conhecimento gerado é formalizada através de artigos científicos e é necessário que o acesso a estes seja o mais fácil e rápido possível. A área de pesquisa conhecida como Mineração de Textos (do inglês Text Mining), se propõe a enfrentar este problema ao procurar identificar novas informações e conhecimentos até então desconhecidos, em bases de dados textuais. Uma de suas tarefas é a descoberta de grupos de textos correlatos em base de dados textuais e esse problema é conhecido como agrupamento de textos (do inglês Text Clustering). Para este fim, a representação das bases de dados textuais comumente utilizada no agrupamento de textos é o Modelo Espaço-vetorial, no qual cada texto é representado por um vetor de características, que são as freqüências das palavras ou termos que nele ocorrem. O conjunto de vetores forma uma matriz denominada de documento-termo, que é esparsa e de alta dimensionalidade. Para atenuar os problemas decorrentes dessas características, normalmente é selecionado um subconjunto de termos, construindo-se assim uma nova matriz documento-termo com um número reduzido de dimensões que é então utilizada nos algoritmos de agrupamento. Este trabalho se desdobra em: i) introdução e implementação de dois algoritmos para seleção de termos e ii) avaliação dos algoritmos k-means, espectral e de particionamento de grafos, em cinco base de dados de textos previamente classificadas. As bases de dados são pré-processadas através de métodos descritos na literatura, produzindo-se as matrizes documento-termo. Os resultados indicam que os algoritmos de seleção propostos, para a redução das matrizes documento-termo, melhoram o desempenho dos algoritmos de agrupamento avaliados. Os algoritmos k-means e espectral têm um desempenho superior ao algoritmos de particionamento de grafos no agrupamento de bases de dados textuais, com ou sem a seleção de características.

Os objetivos deste trabalho foram estimar as associações genéticas entre características de crescimento e produção de leite, utilizando análises bicaracterísticas, e entre características de crescimento, perímetro escrotal e idade ao primeiro parto utilizando modelos de regressão aleatória, de animais da raça Guzerá. Para as análises bicaracterísticas foram utilizadas 252.257 informações de pesos de machos e fêmeas aos 120 dias (P120), ao desmame (PD), ao ano (P365), ao sobreano (PSOBRE) aos 24 meses de idade (P24) e 6.493 lactações encerradas (P305), pertencentes a 4.723 vacas, e os modelos incluíram como os efeitos aleatórios o genético aditivo direto, de ambiente permanente materno e residual, e como efeitos fixos os grupos de contemporâneos e a idade da vaca ao parto (efeito linear e quadrático). Para as análises com os modelos de regressão aleatória foram utilizadas 159.366 observações de pesos e 23.780 de perímetro escrotal, realizadas entre 335 e 724 dias de idade dos animais e agrupadas em classes com intervalo de 10 dias, e 63.596 observações de idade ao primeiro parto. Os efeitos aleatórios considerados foram o genético aditivo direto, de ambiente permanente e residual e como efeitos fixos os grupos de contemporâneos, a idade da vaca ao parto (efeito linear e quadrático) e a curva fixa para modelar a tendência média da população (quadrática) sobre as classes de idade. Foram testados quatro possíveis graus de polinômios de Legendre (zero, linear, quadrático e cúbico), sendo o quadrático mais adequado para descrever as variâncias das características analisadas. Para verificar a existência de diferentes padrões de crescimento e agrupar os touros com base nos seus valores genéticos para produção de carne, leite e duplo propósito, foram realizadas análises de componentes principais e de agrupamento. As herdabilidades estimadas foram 0,23; 0,14; 0,16; 0,17; 021 e 0,22 para P305, P120, PD, P365, PSOBRE e P24, respectivamente, sugerindo que para as características de pesos, as herdabilidades aumentam com o aumento da idade dos animais. Mesma tendência foi observada pelas análises de regressão aleatória, cujas herdabilidades variaram de 0,17 a 0,31. As correlações genéticas entre os pesos em diferentes idades e a produção de leite foram positivas e de magnitude moderada a baixa, variando de 0,27 a 0,38 sugerindo que a seleção para peso e P305 possa ser realizada de forma simultânea nos mesmos animais. As análises de componentes principais indicaram a mesma tendência observada pelas correlações genéticas. As análises de agrupamento mostraram que a raça Guzerá possui touros com diferentes perfis genéticos, sendo possível realizar a seleção para corte, leite ou duplo propósito. As correlações genéticas entre os pesos e perímetro escrotal foram positivas e favoráveis, variando de 0,31 a 0,47, indicando que a seleção para aumento do peso poderá resultar em animais com maior perímetro escrotal. As correlações entre peso e idade ao primeiro parto variaram de -0,56 a -0,38 e perímetro escrotal e idade ao primeiro parto variaram de -0,55 a 0,08, sugerindo que a redução da idade ao primeiro parto poderá ocorrer, a longo prazo, quando peso e perímetro escrotal forem objetivos de seleção. A eficiência relativa de seleção indicou maior resposta pela seleção indireta para idade ao primeiro parto, quando realizada a seleção para perímetro escrotal a partir dos 615 dias de idade, quando comparada com o ganho genético direto para idade ao primeiro parto. / The objectives of this study were to estimate the genetic associations between growth and milk production traits in Guzerat cattle using two-trait analysis and between growth traits, scrotal circumference and age at first calving using random regression models. For two-trait analysis, 252,257 weight records of males and females obtained at 120 days of age (W120), weaning (WW), yearling (YW), post-weaning (PWW) and 24 months of age (W24), as well as 6,493 complete lactation records (W305) of 4,723 cows, were used. The models included direct additive genetic, maternal permanent environmental and residual effects as random effects, and the contemporary groups and age of cow at calving (linear and quadratic effect) as fixed effects. For the random regression models, 159,366 observations of weight and 23,780 observations of scrotal circumference, obtained at 335 and 724 days of age of the animals and divided into classes at 10-day intervals, as well as 63,596 observations of age at first calving, were used. Random direct additive genetic, permanent environmental and residual effects and the fixed effects of contemporary group and age of cow at calving (linear and quadratic effect) were considered. A fixed curve was used to model the average trend of the population (quadratic) on the age classes. Four possible degrees of Legendre polynomials (zero, linear, quadratic and cubic) were tested and the quadratic polynomial was the most appropriate to describe the variances in the traits analyzed. Principal component and cluster analyses were performed to determine the existence of different growth patterns and to group bulls based on their breeding values for meat, milk and dual-purpose production. The estimated heritabilities were 0.23, 0.14, 0.16, 0.17, 0.21 and 0.22 for W305, W120, WW, YW, PWW and W24, respectively, suggesting that, for the growth traits, heritabilities increased with increasing age of the animals. The same trend was observed when random regression analysis was performed, with heritabilities ranging from 0.17 to 0.31. The genetic correlations between weights at different ages and milk yield were positive and of moderate to low magnitude, ranging from 0.27 to 0.38. These estimates suggest that selection for weight and W305 can be performed simultaneously in the same animals. Principal component analysis indicated the same trend as observed by the genetic correlations. Cluster analysis showed the presence of bulls with different genetic profiles in the Guzerat breed, thus permitting selection for meat, milk or dual purpose. The genetic correlations between weights and scrotal circumference were positive and favorable (0.31 to 0.47), indicating that selection for increased weight will result in animals with greater scrotal circumference. The correlations between weights and age at first calving ranged from -0.56 to -0.38 and between scrotal circumference and age at first calving from -0.55 to 0.08, suggesting that the use of weight and scrotal circumference as selection objectives will result in the long-term reduction of age at first calving. The relative efficiency of selection indicated a greater response to indirect selection for age at first calving when selecting for scrotal circumference after 615 days of age, compared to the genetic gain obtained by direct selection for age at first calving.

Orientador: Sérgio Alberto Rupp de Paiva / Resumo: A Doença Inflamatória Intestinal (DII) apresenta curso variável. O tratamento adequado da fase aguda pode levar à remissão clínica da doença, cujo seguimento ocorre ambulatorialmente. Nesta condição, os pacientes mantêm hábito de vida normal e alguns ainda permanecem com inflamação. Esta situação de doença e estilo de vida pode interferir na composição corporal e no estado nutricional dos pacientes. Doença de Crohn (DC) e Retocolite Ulcerativa (RCU) são doenças heterogêneas em diversos aspectos, dentre eles na composição corporal e no estado nutricional. O objetivo do estudo foi avaliar clusters relacionados à variação do estado nutricional na DIl. Foi realizado estudo transversal com pacientes com DII, submetidos a avaliação clínica (Crohn’s Disease Activity Index (CDAI), escore de Mayo e uso de medicações), nutricional (recordatório de 24 horas, International Physical Activity Questionnaire (IPAQ), peso, estatura, Índice de Massa Corporal (IMC), absorciometria por raios-X de dupla energia (DEXA), análise de bioimpedância elétrica (BIA), força de preensão manual, teste de caminhada de 6 minutos) e laboratorial (hemoglobina (Hb), hematócrito (Ht), Proteína C Reativa (PCR), velocidade de hemossedimentação (VHS), albumina). Com base nestes parâmetros, foram diagnosticados com Desnutrição (Global Leadership Initiative on Malnutrition, GLIM) e Sarcopenia (European Working Group on Sacopenia in Older People 2, EWGSOP2). Foram realizados testes estatísticos descritivos por meio do ... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: Inflammatory Bowel Disease (IBD) presents a variable course. Adequate treatment of the acute phase may lead to clinical remission of the disease, which is followed in the outpatient clinic. In this condition, patients maintain normal life habit and some still remain with inflammation. Both disease and lifestyle situation may interfere with the body composition and nutritional status of the patients. Crohn's disease (CD) and ulcerative colitis (UC) are heterogeneous diseases in several aspects, including body composition and nutritional status. The aim of the study was to evaluate clusters related to the variation of the nutritional status in IBD. A cross-sectional study was performed with IBD patients, by clinical (Crohn's Disease Activity Index (CDAI), Mayo score and medications), nutritional (24-hour recall, International Physical Activity Questionnaire (IPAQ), weight, stature, Body Mass Index (BMI), dual energy X-ray absorptiometry (DEXA), electrical bioimpedance (BIA), handgrip force, 6-minute walk test) and laboratorial evaluation (hemoglobin (Hb), hematocrit (Ht), C-Reactive Protein (CRP), erythrocyte sedimentation rate (ESR), albumin). Based on these parameters, were diagnosed Malnutrition (Global Leadership Initiative on Malnutrition (GLIM) and Sarcopenia (European Working Group on Sacopenia in Older People 2, EWGSOP2). Descriptive statistical tests were performed by mean ± standard deviation for numerical variables with normal or median distribution and quartiles (Q1... (Complete abstract click electronic access below) / Doutor

Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico / This work aimed to analyze floristic and structure variations in a Montane Mixed Ombrophylous Forest remnant, in the county of Nova Prata, RS. It was inventoried 71 parcels with dimensions of 10 x 100 m, using the process of systematic sampling in Two Stages. It were identified and measured all individuals with circumference at breast height ≥ 30,0 cm. The dissertation was divided into two chapters, with specific objectives to analyze the presence of floristic groups (Chapter I) and diagnostic and diagnose structural variations between clusters (Chapter II). The plots were classified by cluster analysis, using the Ward connection method. The plots were classified into four distinct floristic groups that present differences in specific diversity, composition and floristic similarity. The group 3 included the largest area of forest remaining and it had the highest diversity values and species number between groups, and greater floristic similarity with the forest in general. It was observed that different species dominate ecological groups in relation to the structure, favoring the development of specific populations. The aggregate (clustered) distribution pattern was the main pattern of spatial distribution of species obtained in the groups, indicating that the species forming denser spots in the vegetation. The diameter and hypsometric structures proved to be different between groups indicating they have good capacity for renewal and a denser canopy bottom. In summary, the floristic groups of the Montane Mixed Ombrophylous Forest remnant had floristic and structural variations. These variations evidence the need to consider different arboreous communities in the case of an intervention. / O presente trabalho teve como objetivo geral analisar as variações florísticas e estruturais de um remanescente de Floresta Ombrófila Mista Montana, localizado no município de Nova Prata, RS. Para isso, foram inventariadas 71 parcelas, com dimensões de 10 x 100 m, pelo processo de Amostragem Sistemática em Dois Estágios. Foram identificados e mensurados todos os indivíduos com circunferência à altura do peito ≥ 30,0 cm. A dissertação foi dividida em dois capítulos, com os objetivos específicos de analisar a presença de grupos florísticos (Capítulo I) e diagnosticar variações estruturais entre os agrupamentos (Capítulo II). Por meio da análise de agrupamento, utilizando o método de ligação Ward, as parcelas foram classificadas em quatro grupos florísticos distintos, que apresentam diferenças de diversidade específica, composição e similaridade florística. O Grupo 3, que englobou a maior área do remanescente florestal, possui os maiores valores de diversidade e número de espécies entre os grupos, e a maior similaridade florística com a floresta em geral. Em relação à estrutura, constatou-se que diferentes espécies dominam ecologicamente os grupos, favorecendo o desenvolvimento de populações específicas. O principal padrão de distribuição espacial das espécies nos grupos obtidos foi o agregado (agrupado), indicando que as espécies ocorrem formando manchas mais densas na vegetação. As estruturas diamétrica e hipsométrica mostraram-se distintas entre os grupos, e indicam que estes possuem boa capacidade de renovação e um dossel inferior mais denso. Em síntese, os grupos florísticos do remanescente de Floresta Ombrófila Mista Montana apresentam variações florísticas e estruturais, as quais evidenciam a necessidade de se considerar as diferentes comunidades arbóreas no caso de uma intervenção.