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Aplicação de método Monte Carlo para cálculos de dose em folículos tiroideanos

SILVA, Frank Sinatra Gomes da 25 February 2008 (has links)
Submitted by (ana.araujo@ufrpe.br) on 2016-07-05T19:39:13Z No. of bitstreams: 1 Frank Sinatra Gomes da Silva.pdf: 1131089 bytes, checksum: 2c4bf5cf9af313b266e2630e4726c0c9 (MD5) / Made available in DSpace on 2016-07-05T19:39:13Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Frank Sinatra Gomes da Silva.pdf: 1131089 bytes, checksum: 2c4bf5cf9af313b266e2630e4726c0c9 (MD5) Previous issue date: 2008-02-25 / The Monte Carlo method is an important tool to simulate radioactive particles interaction with biologic medium. The principal advantage of the method when compared with deterministic methods is the ability to simulate a complex geometry. Several computational codes use the Monte Carlo method to simulate the particles transport and they have the capacity to simulate energy deposition in models of organs and/or tissues, as well models of cells of human body. Thus, the calculation of the absorbed dose to thyroid’s follicles (compound of colloid and follicles’ cells) have a fundamental importance to dosimetry, because these cells are radiosensitive due to ionizing radiation exposition, in particular, exposition due to radioisotopes of iodine, because a great amount of radioiodine may be released into the environment in case of a nuclear accidents. In this case, the goal of this work was use the code of particles transport MNCP4C to calculate absorbed doses in models of thyroid’s follicles, for Auger electrons, internal conversion electrons and beta particles, by iodine-131 and short-lived iodines (131, 132, 133, 134 e 135), with diameters varying from 30 to 500 μm. The results obtained from simulation with the MCNP4C code shown an average percentage of the 25% of total absorbed dose by colloid to iodine- 131 and 75% to short-lived iodine’s. For follicular cells, this percentage was of 13% toiodine-131 and 87% to short-lived iodine’s. The contributions from particles with low energies, like Auger and internal conversion electrons should not be neglected, to assessment the absorbed dose in cellular level. Agglomerative hierarchical clustering was used to compare doses obtained by codes MCNP4C, EPOTRAN, EGS4 and by deterministic methods. / O método Monte Carlo é uma poderosa ferramenta para simular a interação de partículas radioativas com a matéria biológica. A principal vantagem do método, quando comparado com métodos determinísticos, tem sido a habilidade de adequarse de forma precisa a qualquer geometria complexa. Vários códigos computacionais simulam o transporte de partículas via método Monte Carlo, com capacidade para simular o depósito de energia em modelos geométricos que vão desde órgãos e/ou tecidos do corpo, como em modelos de células pertencentes a órgãos do corpo humano. Nesse sentido, o cálculo da dose absorvida pelos folículos tiroideanos (composto de colóide e células foliculares) tem sido de fundamental importância na dosimetria, uma vez que essas células são bastante radiosensíveis à exposição pela radiação ionizante, em particular exposição essa devido aos radioisótopos de iodo, que são resultados de produtos de fissão em casos de acidentes nucleares. Dessa forma, o objetivo desse trabalho foi o de utilizar o código para transporte de partículas MCNP4C para calcular doses absorvidas em modelos de folículos tiroideanos, devido aos elétrons Auger, elétrons de conversão interna e partículas beta, do iodo-131 e dos isótopos de meia-vida curta (iodos 132, 133, 134 e 135),para folículos com diâmetros que variaram de 30 até 500 μm. Os resultados obtidos pela simulação com o MCNP4C apresentaram um percentual médio de 25% da dose total absorvida pelo colóide para o iodo-131 e de 75% para os iodos de meia-vida curta. Para as células foliculares, esse percentual foi em média de 13% para o iodo- 131 e de 87% para os iodos de meia-vida curta, ressaltando assim a importância de simular partículas de baixa energia, como os elétrons Auger e elétrons de conversão interna, para a avaliação da dose absorvida a nível celular. Técnicas hierárquicas de análise de agrupamento foram usadas para comparações entre doses obtidas pelos códigos MCNP4C, EPOTRAN, EGS4 e doses calculadas por métodos determinísticos.
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Utilização de técnicas multivariadas na classificação de fases de crescimento da leucena / The use of multivariate analysis on classification in leucena (Leucaena leucocephala (Lam.) de Wit.) growth fases

LIMA JÚNIOR, Leonardo Mendes de 30 May 2006 (has links)
Submitted by (ana.araujo@ufrpe.br) on 2016-08-02T14:44:31Z No. of bitstreams: 1 Leonardo Mendes de Lima Junior.pdf: 503116 bytes, checksum: b90ee3eab94955ade9a3cdf620bfdf26 (MD5) / Made available in DSpace on 2016-08-02T14:44:31Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Leonardo Mendes de Lima Junior.pdf: 503116 bytes, checksum: b90ee3eab94955ade9a3cdf620bfdf26 (MD5) Previous issue date: 2006-05-30 / The aim of this work was to identify the growth phases of leucena (Leucaena leucocephala (Lam.) of Wit.), as a function of time, by using of the multivariate analysis techniques. The data set was obtained through an experiment performed at the Experimental Station of Caruaru-PE of the Institute of Agricultural Research - IPA. Besides 20 actual measures of height along time, additional 17 values were used, obtained by interpolation of best fit curves to the Weibull Model, as well as by linear type interpolation, for two distinct treatments groups: according to presence or absence of organic compound residue. The factor analysis was used to reduce the dimensionality of measured data to three factors with eigenvalues higher than unity, explaining 94.60% and 94.30% of the total variation for the treatments with and without organic compound, respectively, using the varimax rotation. The resulting factor scores were subjected to k-means cluster analysis, using previously selected, number of groups k from 3 to 10. The discriminant analysis was then employed to verify the efficiency of clustering of the best classification groups, which was found to be 95.2% and 95.1% of correct classification for the two treatments. The study it showed that the leucena trees which has received with treatment with organic on average attained greater height. The graphical analysis allowed the comparison among the data treatment with and without organic compound treatment, according to groups, in growth phase. / O objetivo deste trabalho foi identificar as fases de crescimento da leucena (Leucaena leucocephala (Lam.) de Wit.), ao longo do tempo, por meio da utilização das técnicas multivariadas. Os dados foram obtidos de um experimento, localizado na Estação Experimental de Caruaru-PE, que pertence à Empresa Pernambucana de Pesquisa Agropecuária – IPA. Nesse estudo, consideraram-se além das 20 medições em altura (em m) ao longo do tempo, outras mais 17 medições, interpoladas através do Modelo de Weibull e também por interpolação do tipo linear, dividido em 2 grupos distintos de tratamentos: segundo a presença ou não de composto de resíduo orgânico. A análise fatorial permitiu a redução da dimensionalidade das medições, em função de 3 fatores, com autovalores superiores a uma unidade e percentual do total da variação explicada de 94,60% e 94,30%, nos tratamentos sem e com composto orgânico, respectivamente, usando a rotação varimax. Dos fatores retidos, foram obtidos os escores e submetidos à análise de agrupamento do tipo k-médias, sendo o número de grupos escolhidos previamente, para de k de 3 a 10. Os grupos de melhor classificação foram verificados na análise discriminante, que avaliou a eficiência destes agrupamentos, em 95,2% e 95,1% de percentual de classificação correta. O estudo mostrou que as plantas que receberam o composto orgânico tiveram as maiores alturas, em média. A análise gráfica permitiu a comparação entre os dados que tiveram tratamento com composto orgânico e sem composto orgânico, conforme os grupos, em sua fase de crescimento.
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Estabilidade em análise de agrupamento (cluster analysis) / Stability in cluster analysis

ALBUQUERQUE, Mácio Augusto de 23 February 2005 (has links)
Submitted by (ana.araujo@ufrpe.br) on 2016-08-03T17:35:12Z No. of bitstreams: 1 Macio Augusto de Albuquerque.pdf: 1005283 bytes, checksum: b9e55eee4b0b853629358e6b2158ba81 (MD5) / Made available in DSpace on 2016-08-03T17:35:12Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Macio Augusto de Albuquerque.pdf: 1005283 bytes, checksum: b9e55eee4b0b853629358e6b2158ba81 (MD5) Previous issue date: 2005-02-23 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - CAPES / The main objective of this research was to propose a systematic to the study and interpretation of the stability of methods in cluster analysis through many cluster algorithms in vegetation data. The data set used came from a survey in the Silviculture Forest at Federal University of Viçosa – MG. To perform the cluster analysis the matrices of Mahalanobis distance were estimated based on the original data and by “bootstrap” resampling. Also the methods of single linkageage, complete linkageage, the average of the distances, the centroid, the medium and the Ward were used. For the detection of the association among the methods it was applied the chi-square test. For the various methods of clustering it was obtained a cofenetical correlation. The results of the associations of methods were very similar, indicating, in principle, that any algorithm of cluster studied is stabilized and exist, in fact, groups among the individuals analyzed. However, it was concluded that themethods coincide with themselves, except the methods of centroid and Ward. Also the centroid methods and average when compared to the Ward, respectively, based on the matrices of Mahalanobis starting from the original data set and “bootstrap”. The methodology proposed is promising to the study and interpretation of the stabilityof methods concerning the cluster analysis in vegetation data. / Objetivou-se propor uma sistemática para o estudo e a interpretação da estabilidade dos métodos em análise de agrupamento, através de vários algoritmos de agrupamento em dados de vegetação. Utilizou-se dados provenientes de um levantamento na Mata da Silvicultura, da Universidade Federal de Viçosa-MG. Para análise de agrupamento foram estimadas as matrizes de distância de Mahalanobis com base nos dados originais e via reamostragem “bootstrap” e aplicados os métodos da ligação simples, ligação completa, médias das distâncias, do centróide, da mediana e do Ward. Para a detecção de associação entre os métodos foi aplicado o teste qui-quadrado. Para os diversos métodos de agrupamento foi obtida a correlação cofenética. Os resultados de associação dos métodos foram semelhantes, indicando em princípio que qualquer algoritmo de agrupamento estudado está estabilizado e existem, de fato, grupos entre os indivíduos observados. No entanto, observou-se que os métodos são coincidentes, exceto osmétodos do centróide e Ward e os métodos do centróide e mediana quando comparados com o de Ward, respectivamente, com base nas matrizes de Mahalanobis a partir dos dados originais e “bootstrap”. A sistemática proposta é promissora para o estudo e a interpretação da estabilidade dos métodos de análise de agrupamento em dados de vegetação.
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Finanças comportamentais : um estudo sobre o perfil do investidor, o senso de autocontrole e o grau de confiança nas decisões de investimentos no mercado de ações

Diniz, Fabrício Bernardes 29 August 2013 (has links)
Made available in DSpace on 2018-08-01T23:40:33Z (GMT). No. of bitstreams: 1 tese_6823_Finanças Comportamentais Um Estudo Sobre o Perfil do Investidor2013.pdf: 1832085 bytes, checksum: d0e659b02801917799cad972b20eacc2 (MD5) Previous issue date: 2013-08-29 / Nas mais diversas áreas de negócios, é comum que um gestor busque conhecer o perfil de seus clientes para oferecer produtos e serviços mais adequados às necessidades desses clientes. Os gestores que atuam no mercado financeiro utilizam um instrumento para identificar o perfil do investidor e ao mesmo tempo adequar a oferta de produtos e serviços financeiros em conformidade com a capacidade e a propensão de assumir riscos desse investidor, sobretudo daquele inserido no contexto do mercado de ações. Esse instrumento, apesar de não ser padrão, segue recomendações de órgãos reguladores e de associações de entidades do mercado de capitais (no Brasil, a Anbima - Associação Brasileira das Entidades dos Mercados Financeiro e de Capitais). Esses instrumentos utilizam, para a avaliação do perfil de risco, fatores como situação financeira do investidor, objetivo do investimento, horizonte de tempo para obtenção de resultados, tolerância ao risco e experiência em investimentos de risco. Não consideram fatores comportamentais que segundo a teoria, podem afetar a propensão a assumir riscos. Dentre esses fatores estão o senso de autocontrole, que ocasiona uma percepção distorcida de controle sobre os resultados esperados, e o grau de autoconfiança que no extremo pode levar ao excesso de confiança ou excesso de otimismo quanto a resultados esperados. Sendo assim, por meio de uma pesquisa realizada com 59 clientes de uma corretora de ações, o presente estudo se propôs a avaliar se o perfil de risco do investidor calculado segundo recomendações de órgãos reguladores do mercado financeiro, afeta o senso de autocontrole e o grau de confiança dos investidores em suas decisões de investimentos no mercado de ações. E avaliar se é possível segmentar os investidores de acordo com características pessoais e fatores que compõem o seu perfil de risco de forma a mais bem caracterizá-los quanto a riscos assumidos e retornos obtidos em seus investimentos em mercados de risco. Buscou identificar quais fatores que compõem a avaliação do perfil de risco são mais relevantes para discriminar os investidores segundo suas características pessoais e sua propensão a assumir riscos. A partir de uma análise de conglomerados (cluster analysis) o estudo identificou três grupos distintos de investidores com diferentes níveis de conhecimento e experiência de investimentos no mercado de ações e relacionou esses grupos a riscos assumidos e retornos alcançados em seus investimentos. / In several areas of business, it is common that a manager seeks to know the profile of their customers to offer products and services best suited to the needs of these customers. The managers who work in the financial market using a tool to identify the profile of the investor and at the same time adjust the supply of financial products and services in accordance with the capacity and willingness to take risks that investors, especially from that seen in the context of the stock market . This instrument, although not standard, following recommendations of regulatory bodies and associations of the capital market (in Brazil, Anbima - Brazilian Association of Financial and Capital). These instruments use for the evaluation of the risk profile, factors such as the investor's financial situation, investment objective, time horizon for achieving results, risk tolerance and investment experience of risk. Do not consider behavioral factors which according to theory, may affect the propensity to take risks. These factors include the sense of self, which leads to a distorted perception of control over outcomes, and the degree of confidence that in the end can lead to overconfidence or over-optimism about the expected results. Thus, through a survey of 59 customers of a stockbroker, the present study was to evaluate whether the risk profile of the investor calculated according to recommendations from regulatory agencies in the financial market, affects the sense of self and the degree of confidence of investors in their investment decisions in the stock market. And assess whether it is possible to target investors according to personal characteristics and factors that comprise its risk profile in order to better characterize them as the risks taken and returns from their investments in risky markets. Sought to identify factors that make up the assessment of the risk profile are most relevant for discriminating investors according to their personal characteristics and their propensity to take risks. From a cluster analysis (cluster analysis) the study identified three distinct groups of investors with different levels of knowledge and investment experience in the stock market and related groups such the risks assumed and achieved returns on their investments.
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Curva de crescimento de codornas ajustadas por modelos não lineares / Growth curve of quail setting for nonlinear models

Ribeiro, Marta Jeidjane Borges 25 February 2014 (has links)
This study aims to compare non-linear models fitted to the growth curves of quail in order to determine which model best describes the growth , to verify the similarity of the models by analyzing estimates of the parameters and to apply the model identity in different groups of strains and Treatments . We used the weight and age data from European quails (Coturnix coturnix coturnix) from three strains, in a 2x4 factorial design, housed in a completely randomized design with two levels of energy and four levels of crude protein, with six replications. Non-linear models were used: Brody, Von Bertalanffy, Richards, Logistic and Gompertz. To choose the best model we used the adjusted coefficient of determination, the percentage of convergence, the Mean Square Residue, the Durbin - Watson test, the Akaike information criteria and the Bayesian information criteria as evaluators of the quality of fit. We used cluster analysis to verify, based on average estimates of the parameters, the similarities between the models. We tested the identity of the models in order to verify whether the curve parameters for the eight treatments and for the three strains, would be equal. Among the models studied, the Logistic was the most appropriate to describe the growth curves. The Logistic and Richards models were similar in the analyzes irrespective of strain, so the analysis of Lineage 1, 2 and 3. There was no significant difference for the chosen parameters between treatments within each strain, however, there was significant difference, except for treatment 5, for the parameters of strains within each treatment, caused by the adult weight. / Objetivaram-se, neste estudo, comparar modelos não lineares ajustados às curvas de crescimento de codornas para determinar qual modelo que melhor descreve o crescimento, verificar a similaridade dos modelos analisando as estimativas dos parâmetros e, aplicar a identidade de modelos em diferentes grupos de Linhagens e Tratamentos. Para a análise, foram utilizados os dados peso e idade de codornas européias de corte (Coturnix coturnix coturnix) proveniente de três linhagens, em um esquema fatorial 2x4, instalado em um delineamento inteiramente casualizado, com dois níveis de energia metabolizável e quatro níveis de proteína bruta, com seis repetições. Os modelos não lineares utilizados foram: Brody, Von Bertalanffy, Richards, Logístico e Gompertz. Para a escolha do melhor modelo utilizou-se o coeficiente de determinação ajustado, o Percentual de convergência, o Quadrado Médio do Resíduo, o Teste de Durbin-Watson, o Critério de informação Akaike e o Critério de informação Bayesiano como avaliadores da qualidade do ajuste. Utilizou-se a análise de agrupamento para verificar, baseado nas estimativas médias dos parâmetros, a similaridades entre os modelos. Testou-se a identidade de modelos para verificar se os parâmetros das curvas, para os oito tratamentos e para as três linhagens, seriam iguais. Entre os modelos estudados, o Logístico foi o mais adequado para descrever as curvas de crescimento. Os modelos Logístico e Richards foram considerados similares nas análises sem distinção de linhagem, assim também nas análises das Linhagem 1, 2 e 3. Não houve diferença significativa para os parâmetros do modelo escolhido entre tratamentos dentro de cada linhagem, contudo, houve diferença significativa, exceto para o Tratamento 5, para os parâmetros entre linhagens dentro de cada tratamento, ocasionada pelo peso adulto.
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Algoritmo genético híbrido aplicado ao problema de agrupamento de dados

Alckmin, Danusa Prado de Faria 31 August 2009 (has links)
Made available in DSpace on 2016-12-23T14:33:44Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Dissertacao de Danuza Prada de Faria Alckmin.pdf: 676333 bytes, checksum: 0f5968628437ef878dc7f703ce48b8bf (MD5) Previous issue date: 2009-08-31 / Agrupamento de dados é uma tarefa que divide um conjunto de dados em subconjuntos de forma que elementos associados a um mesmo grupo sejam mais similares entre si do que em relação a elementos de outros grupos. Ao organizar os dados em grupos é possível identificar similaridades e diferenças entre eles, extrair informações relevantes e inferir conclusões úteis a respeito das características dos dados. O problema de agrupamento de dados pode ser considerado como uma tarefa de otimização, uma vez que se pretende encontrar a melhor combinação de partições dentre todas as combinações possíveis. Uma abordagem que pode ser aplicada para resolver o problema de agrupamento é o uso de metaheurísticas, que são procedimentos capazes de escapar de ótimos locais, pois o uso de métodos exatos se torna computacionalmente inviável. Entretanto, a maioria das metaheurísticas aplicadas ao problema de agrupamento não são escalonáveis para bases reais e comerciais, são mais efetivas nos casos em que a instância do problema é menor. O custo computacional necessário para calcular as soluções se torna maior em instâncias maiores do problema. Por esse motivo, procedimentos híbridos que exploram a combinação de metaheurísticas representam uma abordagem promissora para a resolução do problema de agrupamento. Este trabalho apresenta uma proposta de Algoritmo Genético Híbrido de Agrupamento que associa ao processo de busca global uma heurística de busca local e cuja população inicial é gerada por técnicas de agrupamento. Tais melhorias têm como objetivo direcionar a busca para soluções mais próximas do ótimo global. É realizada uma avaliação experimental em bases de dados reais e sintéticas com o objetivo de verificar se a abordagem proposta apresenta uma melhoria em relação aos algoritmos avaliados. O resultado dessa análise mostra que o algoritmo proposto apresenta um desempenho melhor do que quatro entre os seis algoritmos avaliados. Para complementar a análise é realizada uma avaliação do tempo de execução, cujo objetivo é quantificar a diferença entre a abordagem proposta e os demais algoritmos avaliados. O resultado mostra que o tempo de execução da abordagem proposta é viável, porém é consideravelmente maior do que os tempos de execução dos algoritmos considerados de rápida convergência / Clustering is a task that divides a data set in subgroups aiming that elements associated to one exactly group are more similar between themselves than elements of other groups. Organizing data in groups make it possible to identify similarities and differences between them, to extract useful information and conclusions regarding the data features. Clustering may be considered an optimization problem because it is intended to find the best combination of partitions among all possible combinations. An approach that can be applied to solve the clustering problem is the use of metaheuristics, which are procedures capable of escaping from local optima, once the use of exact methods is computationally infeasible. However, the majority of the metaheurísticas applied to clustering problem is not scalable for real or commercial bases. They are more effective for smaller instances of the problem trated. The computational cost necessary to calculate the solutions becomes greater in larger instances of the problem. For this reason, hybrid procedures that explore the combination of metaheuristics represent a promising approach for solving the clustering problem. This work shows a proposal of a Hybrid Genetic Clustering Algorithm that associates the process of global search to a local search heuristic and also initializes the population by different grouping techniques. Such improvements aim to direct the search for solutions next to the global optimal one. An experimental evaluation with real and synthetic databases is performed aiming to verify if the proposed approach presents an improvement in relation to the other evaluated algorithms. The result of this analysis shows that the proposed algorithm presents a better performance in four among the six evaluated algorithms. In addition, an analysis of the execution time shows that the execution time of our proposal is feasible, even though it is considerably longer than the execution times of the fast convergence algorithms
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Estimação e analise das perdas tecnicas na distribuição de energia eletrica / Estimation and analysis of technical losses in power distribution systems

Queiroz, Leonardo Mendonça Oliveira de 15 August 2018 (has links)
Orientadores: Christiano Lyra Filho, Celso Cavellucci / Tese (doutorado) - Universidade Estadual de Campinas, Faculdade de Engenharia Eletrica e de Computação / Made available in DSpace on 2018-08-15T22:07:38Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Queiroz_LeonardoMendoncaOliveirade_D.pdf: 3480667 bytes, checksum: 8aad553487af6ac62325d7f0f0893d60 (MD5) Previous issue date: 2010 / Resumo: Este trabalho estuda a estimação de perdas técnicas na distribuição de energia elétrica e apresenta uma análise para a definição dos níveis adequados dessas perdas. Ambas as abordagens são focadas na regulação. É apresentada uma metodologia de estimação das perdas técnicas de energia baseada no valor médio e na variância dos pontos da curva de carga. Essa metodologia pode ser aplicada alternativamente aos métodos baseados na perda de potência máxima, que inserem imprecisões desnecessárias para a estimativa das perdas de energia. Foram desenvolvidos modelos de regressão para a estimação das perdas técnicas em redes de distribuição de média e baixa tensão, objetivando utilizar o mínimo de informações possíveis para uma precisão adequada. Uma metodologia de geração de redes foi desenvolvida para o estudo desses modelos, de forma a disponibilizar redes com características semelhantes às redes reais. Também são propostos aprimoramentos na estimativa das perdas em transformadores e ramais de ligação. Adicionalmente, é apresentada uma análise dos níveis adequados de perdas técnicas na distribuição, utilizando-se técnicas de engenharia e benchmarking. As propostas deste trabalho sugerem aprimoramentos na regulação das perdas técnicas, tornando o método de estimação das perdas mais preciso e introduzindo a análise de eficiência das distribuidoras. / Abstract: This work studies technical losses estimation in power distribution systems and analyses the adequacy of the losses. Both approaches are carried in a regulatory perspective. It is presented a methodology to estimate energy losses from the mean and the variance of the load curve points. This methodology can be applied in substitution of methods based on maximum power losses, which inserts unnecessary inaccuracy to the procedure. Regression models were developed to estimate technical losses in medium and low voltage distribution networks, aiming to require less information as possible to meet an appropriate accuracy. A methodology of networks generation was developed to make available networks with characteristics similar to the ones presented by real networks. Improvements in transformers and service conductors losses estimation were also proposed. Engineering and benchmarking techniques were applied to analyze technical losses adequacy. The proposals presented in this work may improve technical losses regulation, making the estimation of losses more accurate and introducing efficiency analysis of power distribution companies. / Doutorado / Automação / Doutor em Engenharia Elétrica
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Interação genótipo-ambiente em bovinos de corte compostos / Genotype-environment interaction in composite beef cattle

Mário Luiz Santana Júnior 29 July 2011 (has links)
Objetivou-se com o presente estudo foram caracterizar e definir ambientes homogêneos de produção de bovinos de corte compostos no Brasil com relação às variáveis climáticas e geográficas, utilizando técnicas exploratórias multivariadas. Verificar a presença de interação genótipo-ambiente (GxE) nas características peso ao nascimento (PN), peso a desmama (PD), ganho de peso da desmama ao sobreano (GP), perímetro escrotal (PE) e musculosidade (MUS). Pela análise de agrupamento não-hierárquico foram agrupadas as regiões similares com relação às variáveis ambientais. Foram formados seis grupos de fazendas. A inclusão do efeito de interação touro-grupo foi avaliada em análises uni-característica. Comparou-se um modelo com o efeito de interação touro-grupo com outro sem esse efeito. Incluir o efeito de interação touro-GEO no modelo de avaliação genética do PN, PD e PE não resultou melhor ajuste aos dados, no entanto não deve ser descartada a hipótese de se considerar outros tipos de efeitos de GxE. Foram estimados parâmetros genéticos por meio de análises multi-característica, considerando-se a mesma característica como diferente em cada grupo de fazendas. Foi verificada heterogeneidade de variância para todas as características. Os coeficientes de herdabilidade nos grupos de fazendas para PN, PD, GP, PE e MUS variaram de 0,15 a 0,25; 0,16 a 0,25; 0,10 a 0,20; 0,17 a 0,31 e 0,17 a 0,24, respectivamente. As correlações genéticas variaram de 0,19 a 0,90 para PN, -0,02 a 0,92 para PD, 0,31 a 0,93 para GP, 0,64 a 0,89 para PE e de 0,18 a 0,80 para MUS nos grupos fazendas. As diferentes estimativas de herdabilidade obtidas entre grupos de fazendas implicam resposta à seleção diferenciada conforme o ambiente em que os animais são criados e selecionados. Pelas correlações genéticas entre as características nas diversas regiões, constatou-se GxE, indicando que os melhores reprodutores para uma determinada região não são sempre os mesmos para as demais. Um modelo hierárquico de norma de reação sob abordagem Bayesiana também foi utilizado para estimação dos componentes de variância, parâmetros genéticos e verificação da existência de GxE. Os gradientes ambientais baseados nas soluções para o efeito de grupo de contemporâneos para PN, PD, GP e PE foram -6,45 a +4,75 kg, -65 a +65 kg, -72 a +112 kg e -6.5 a +5.5 cm, respectivamente. As estimativas de herdabilidade foram crescentes no gradiente ambiental, PN (0,04 a 0,55), PD (0,39 a 0,47), GP (0,01 a 0,43) e PE (0,21 a 0,23). A correlação entre o nível e a inclinação da norma de reação para PN e GP foi de alta magnitude, indicando que os animais de maior valor genético médio foram os que apresentaram maior resposta à melhoria das condições ambientais, caracterizando o efeito de escala da GxE. Para PD e PE, a correlação entre intercepto e inclinação foi baixa implicando reclassificação dos animais em ambientes diferentes. O modelo hierárquico de normas de reação foi útil para descrever alterações nos componentes de variância decorrentes do ambiente e para descrever a presença de GxE nas características estudadas de bovinos compostos. Existe variação genética com respeito à sensibilidade dos animais, o que possibilita a seleção de genótipos mais plásticos ou mais robustos. / The objectives of this study were to characterize and define homogenous production environments of composite beef cattle in Brazil in terms of climatic and geographic variables using multivariate exploratory techniques; to evaluate the presence of genotype by environment interaction (GxE) for birth weight (BW), weaning weight (WW), postweaning gain (PWG), scrotal circumference (SC) and muscling. Nonhierarchical cluster analysis was used to group farms located in regions with similar environmental variables into clusters. Six clusters of farms were formed. The effect of sire-cluster interaction was tested by single-trait analysis. The inclusion of sire-cluster interaction in the genetic evaluation model may not result in better fit to the data for BW, WW and SC. Genetic parameters were estimated by multiple-trait analysis considering the same trait to be different in each cluster. The heritability coefficient in the clusters for BW, WW, PWG, SC and muscling ranged from 0.15 to 0.25; 0.16 to 0.25; 0.10 to 0.20; 0.17 to 0.31 and 0.17 to 0.24, respectively. The genetic correlations ranged from 0.19 to 0.90 for BW, -0.02 to 0.92 for WW, 0.31 to 0.93 for PWG, 0.64 a 0.89 for SC and 0.18 to 0.80 for muscling in the clusters of farms. The different heritability estimates between groups of farms indicates that the response to selection varies with the environment in which animals are selected. The low genetic correlations between traits in the different regions demonstrated the presence of GxE, indicating that the best sires in a certain region are not the same for the other regions. A reaction norm hierarchical model using Bayesian approach was also used for estimation of variance components, genetic parameters and to verify the existence of GxE. Environmental gradients based in solutions for the effect of contemporary groups for BW, WW, PWG and SC were -6.45 to +4.75 kg, -65 kg to +65, -72 to +112 kg and -6.5 to +5.5 cm, respectively. Heritability estimates were increasing in the environmental gradient, BW (0.04 to 0.55), WW (0.39 to 0.47), PWG (0.01 to 0.43) and SC (0.21 to 0.23). The correlation between the level and slope of reaction norm for BW and PWG was of high magnitude, indicating that animals of higher average breeding value were the ones which presented a best response to environmental improvement, characterizing a scale effect on GxE. For WW and SC, the correlation between intercept and slope was low implying reranking of animals in different environments. The reaction norm hierarchical model has been useful to describe changes in the variance components due to the environment and to describe the presence of GxE traits in composite beef cattle. There is genetic variation with respect to the sensitivity of the animals, which enables the selection of genotypes most plastics or more robust.
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Alternativas para seleção de touros da raça Nelore considerando características múltiplas de interesse econômico / Alternatives for election of bulls of the nelore race considering characteristic multiple of economic interest

José Eduardo do Val 25 May 2006 (has links)
Este estudo foi desenvolvido a partir de informações das avaliações genéticas de touros pertencentes a rebanhos participantes do Programa de Melhoramento Genético da Raça Nelore (PMGRN-Nelore Brasil), que desenvolve, desde 1995, um teste de progênie denominado Reprodução Programada (RP), o qual tem como finalidade principal de disponibilizar animais com valores genéticos mais confiáveis no mercado de reprodutores. Assim, as Diferenças Esperadas nas Progênies (DEPs) de 234 touros participantes da RP no período de 1996 a 2003 foram analisadas com os seguintes objetivos: 1- Avaliar o mérito genético dos touros ao longo dos anos, utilizando regressão linear entre a DEP e ano de participação do touro na RP para as características, peso aos 120 e 210 dias, efeitos direto e materno (DDPP120, DDPP210, DMPP120 e DMPP210); peso e perímetro escrotal aos 365 e 450 dias, efeito direto (DDP365, DDP450, DDPE365 e DDPE450) e idade ao primeiro parto (DDIPP); 2- Identificar, por meio de abordagens multivariadas, grupos de animais cujas DEPs apresentem padrões de semelhança, assim como discriminar as variáveis que mais influenciam na divisão dos grupos, numa tentativa de auxiliar a tomada de decisão nos sistemas de produção de bovinos de corte, com vistas a maximizar a produtividade. Os procedimentos multivariados de análises de agrupamento e componentes principais foram aplicados às DEPs de sete características (DMPP120, DMPP210, DDPP365, DDPP450, DDPE365, DDPE450 e DDIPP). As análises foram processadas com o auxílio do software Statistica (STATSOFT, 2004). As tendências genéticas das DEPs relacionadas com as características de fertilidade, DDPE365, DDPE450 e DDIPP, mostraram progressos genéticos de 0,051 e 0,061 cm e -0,026 mês por ano respectivamente, enquanto que DDPP450 foi à característica que obteve maior ganho genético dentre as DEPs de crescimento, 1,467 kg/ano. Com referência às abordagens multivariadas, a análise de agrupamento k-médias foi aplicada e o resultado envolvendo três grupos foi o melhor obtido, dos quais dois se destacaram quanto aos valores médios das DEPs. A importância desses dois grupos de touros foi confirmada pela análise de componentes principais que associou a eles valores superiores de DEPs diretas de peso e perímetro escrotal. A quantidade de variabilidade original retida pelos dois primeiros componentes principais foi de 70,22%. Foram observados progressos genéticos nos touros da Reprodução Programada para todas as características durante o período estudado, indicando que a estratégia de seleção praticada vem sendo efetiva e evidenciando a importância da contribuição dos touros da RP para o melhoramento das características reprodutivas e de crescimento da raça Nelore. Neste estudo pode-se verificar o poder classificatório e discriminatório das análises de agrupamentos e componentes principais, o que muito pode contribuir na classificação de touros, facilitando a seleção de animais em Programas de Melhoramento Genético. / This research was developed with genetic information of sires that belong to herds of the ?Programa de Melhoramento Genético da Raça Nelore? (PMGRN-Nelore Brasil), witch has been carried on, since 1995, a progeny test denominated ?Reprodução Programada? (RP), whose the main aim is to obtain reliable genetic values for sires market. Therefore, the Expected Progeny Difference (EPD) of 243 sires taking part of the RP from 1996 to 2003 were used with the following objectives of: 1- Evaluating the genetic merit over the years applying linear regression between the EPD and the year of the sires RP participation, for the following traits: weight at 120 and 210 days of age, direct and maternal effects (DDPP120, DDPP210, DMPP120 and DMPP210) weight and scrotal circumference at 365 and 450 days of age, direct effect (DDPP365, DDPP450, DDPE365 and DDPE450) and age at first calving (DDIPP); 2- Identifying groups of animals, whose, EPDs show similarity patterns, as well as, verifying which were the variable that showed greater power in discriminating group formations, trying to help the decisions making support in the beef cattle production system by multivariate approaches, in order to maximizing the productivity. The multivariate procedures of clusters analysis and principal components were applied in the EPDs from seven traits (DMPP120, DMPP210, DDPP365, DDPP450, DDPE365, DDPE450 and DDIPP). The analyses were performed by software Statistica (STATSOFT, 2004). The genetic trends of the EPD related to the fertility traits, DDDPE365, DDPE450 e DDIPP, showed some genetic progress of 0.051 and 0.061 cm and ? 0.026 month per year respectively, while, the DDPP450 was the trait that obtained the highest genetic gain in the growth EPDs, 1.467 kg/year. About the multivariate approaches, the k-means clustering analysis was applied and the results of three groups formation were the best option, two of them stood out in relation to values of the EPDs means. The importance of these two groups was confirmed by the analyses of principal components that associate the direct EPDs of weight and scrotal circumference values to them. The quantity of original variability kept in the first main components was 70.22%. It was observed genetic progress in the RP sires for every trait during the studied period, indicating that the selection has been effective and evidencing how important the contribution of the RP sires for the reproductive and growth traits for the Nelore breed improvement is. In this research, the classificatory and discriminatory power of cluster analyses and principal components could be verify, and certainly could contribute in the sire classification, helping the selection in the Animal Breeding Program.
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Associações genéticas entre características reprodutivas, de crescimento e produção de leite em animais Guzerá utilizando modelos de dimensão finita e infinita / Genetic associations between reproductive, growth and milk production traits in Guzerat cattle using finite and infinite dimensional models

Manuela Pires Monteiro da Gama 19 January 2018 (has links)
Os objetivos deste trabalho foram estimar as associações genéticas entre características de crescimento e produção de leite, utilizando análises bicaracterísticas, e entre características de crescimento, perímetro escrotal e idade ao primeiro parto utilizando modelos de regressão aleatória, de animais da raça Guzerá. Para as análises bicaracterísticas foram utilizadas 252.257 informações de pesos de machos e fêmeas aos 120 dias (P120), ao desmame (PD), ao ano (P365), ao sobreano (PSOBRE) aos 24 meses de idade (P24) e 6.493 lactações encerradas (P305), pertencentes a 4.723 vacas, e os modelos incluíram como os efeitos aleatórios o genético aditivo direto, de ambiente permanente materno e residual, e como efeitos fixos os grupos de contemporâneos e a idade da vaca ao parto (efeito linear e quadrático). Para as análises com os modelos de regressão aleatória foram utilizadas 159.366 observações de pesos e 23.780 de perímetro escrotal, realizadas entre 335 e 724 dias de idade dos animais e agrupadas em classes com intervalo de 10 dias, e 63.596 observações de idade ao primeiro parto. Os efeitos aleatórios considerados foram o genético aditivo direto, de ambiente permanente e residual e como efeitos fixos os grupos de contemporâneos, a idade da vaca ao parto (efeito linear e quadrático) e a curva fixa para modelar a tendência média da população (quadrática) sobre as classes de idade. Foram testados quatro possíveis graus de polinômios de Legendre (zero, linear, quadrático e cúbico), sendo o quadrático mais adequado para descrever as variâncias das características analisadas. Para verificar a existência de diferentes padrões de crescimento e agrupar os touros com base nos seus valores genéticos para produção de carne, leite e duplo propósito, foram realizadas análises de componentes principais e de agrupamento. As herdabilidades estimadas foram 0,23; 0,14; 0,16; 0,17; 021 e 0,22 para P305, P120, PD, P365, PSOBRE e P24, respectivamente, sugerindo que para as características de pesos, as herdabilidades aumentam com o aumento da idade dos animais. Mesma tendência foi observada pelas análises de regressão aleatória, cujas herdabilidades variaram de 0,17 a 0,31. As correlações genéticas entre os pesos em diferentes idades e a produção de leite foram positivas e de magnitude moderada a baixa, variando de 0,27 a 0,38 sugerindo que a seleção para peso e P305 possa ser realizada de forma simultânea nos mesmos animais. As análises de componentes principais indicaram a mesma tendência observada pelas correlações genéticas. As análises de agrupamento mostraram que a raça Guzerá possui touros com diferentes perfis genéticos, sendo possível realizar a seleção para corte, leite ou duplo propósito. As correlações genéticas entre os pesos e perímetro escrotal foram positivas e favoráveis, variando de 0,31 a 0,47, indicando que a seleção para aumento do peso poderá resultar em animais com maior perímetro escrotal. As correlações entre peso e idade ao primeiro parto variaram de -0,56 a -0,38 e perímetro escrotal e idade ao primeiro parto variaram de -0,55 a 0,08, sugerindo que a redução da idade ao primeiro parto poderá ocorrer, a longo prazo, quando peso e perímetro escrotal forem objetivos de seleção. A eficiência relativa de seleção indicou maior resposta pela seleção indireta para idade ao primeiro parto, quando realizada a seleção para perímetro escrotal a partir dos 615 dias de idade, quando comparada com o ganho genético direto para idade ao primeiro parto. / The objectives of this study were to estimate the genetic associations between growth and milk production traits in Guzerat cattle using two-trait analysis and between growth traits, scrotal circumference and age at first calving using random regression models. For two-trait analysis, 252,257 weight records of males and females obtained at 120 days of age (W120), weaning (WW), yearling (YW), post-weaning (PWW) and 24 months of age (W24), as well as 6,493 complete lactation records (W305) of 4,723 cows, were used. The models included direct additive genetic, maternal permanent environmental and residual effects as random effects, and the contemporary groups and age of cow at calving (linear and quadratic effect) as fixed effects. For the random regression models, 159,366 observations of weight and 23,780 observations of scrotal circumference, obtained at 335 and 724 days of age of the animals and divided into classes at 10-day intervals, as well as 63,596 observations of age at first calving, were used. Random direct additive genetic, permanent environmental and residual effects and the fixed effects of contemporary group and age of cow at calving (linear and quadratic effect) were considered. A fixed curve was used to model the average trend of the population (quadratic) on the age classes. Four possible degrees of Legendre polynomials (zero, linear, quadratic and cubic) were tested and the quadratic polynomial was the most appropriate to describe the variances in the traits analyzed. Principal component and cluster analyses were performed to determine the existence of different growth patterns and to group bulls based on their breeding values for meat, milk and dual-purpose production. The estimated heritabilities were 0.23, 0.14, 0.16, 0.17, 0.21 and 0.22 for W305, W120, WW, YW, PWW and W24, respectively, suggesting that, for the growth traits, heritabilities increased with increasing age of the animals. The same trend was observed when random regression analysis was performed, with heritabilities ranging from 0.17 to 0.31. The genetic correlations between weights at different ages and milk yield were positive and of moderate to low magnitude, ranging from 0.27 to 0.38. These estimates suggest that selection for weight and W305 can be performed simultaneously in the same animals. Principal component analysis indicated the same trend as observed by the genetic correlations. Cluster analysis showed the presence of bulls with different genetic profiles in the Guzerat breed, thus permitting selection for meat, milk or dual purpose. The genetic correlations between weights and scrotal circumference were positive and favorable (0.31 to 0.47), indicating that selection for increased weight will result in animals with greater scrotal circumference. The correlations between weights and age at first calving ranged from -0.56 to -0.38 and between scrotal circumference and age at first calving from -0.55 to 0.08, suggesting that the use of weight and scrotal circumference as selection objectives will result in the long-term reduction of age at first calving. The relative efficiency of selection indicated a greater response to indirect selection for age at first calving when selecting for scrotal circumference after 615 days of age, compared to the genetic gain obtained by direct selection for age at first calving.

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