Dissertação (mestrado) - Universidade Federal de Santa Catarina, Centro de Ciências Biológicas, Programa de Pós-Graduação em Ecologia, Florianópolis, 2013. / Made available in DSpace on 2013-12-05T23:59:09Z (GMT). No. of bitstreams: 1 319157.pdf: 5870530 bytes, checksum: 46e063329cf5aafd8405179b2a0f1f08 (MD5) Previous issue date: 2013 / O declínio populacional de anfíbios levou o status desse grupo a um dos mais ameaçados de extinção mundialmente. No Brasil, grande parte das espécies ameaçadas de extinção ocorrem na Floresta Atlântica, onde nenhum estudo sobre anuros avaliou o risco de extinção das espécies e relacionou com as características ecológicas. O objetivo desse estudo é identificar características ecológicas dos anuros da região subtropical da Floresta Atlântica do Brasil que as indiquem como susceptíveis à extinção. Para cada espécie foram coletadas informações sobre endemismo, altitude, frequência de ocorrência, tendência de crescimento populacional, índice de vida aquática, período de atividade do adulto, tamanho corporal e tamanho da desova. Os dados das variáveis ecológicas foram obtidos em artigos científicos, guias de campo e material depositado em coleções herpetológicas. As espécies foram agrupadas de acordo com suas características ecológicas através da Análise de Agrupamento pela similaridade de Gower. A relação de cada variável com o risco de extinção foi testada com regressões logísticas. A região em estudo compreende 238 espécies conhecidas, das quais 24 possuem desenvolvimento direto e 214 possuem desenvolvimento indireto, dentre essas, 116 foram analisadas por terem informações ecológicas conhecidas. As espécies ameaçadas ocorreram em seis dos sete grupos ecológicos formados, indicando que o risco de extinção não esteve relacionado a um determinado grupo de anuros, com características ecológicas específicas. As espécies mais ameaçadas são as de ocorrência em baixas altitudes, onde a perda e degradação de hábitat representam a maior causa de declínio, diferindo das espécies ameaçadas em outras florestas pluviais que tendem a ser de topos de morros. Outras características como endemismo, dependência aos ambientes de riacho, tamanho, hábitat e período de atividade não estiveram relacionadas ao risco de extinção. Com este estudo buscou-se contribuir para o entendimento do risco de extinção dos anfíbios no país, comparando com outras florestas pluviais no mundo. Para a conservação dos anfíbios no Brasil, é necessário proteger as espécies por meio de Unidades de Conservação, além de continuar e melhorar as pesquisas acerca do risco de extinção, sobretudo a nível populacional. <br> / Abstract : The worldwide decline of amphibian populations led this group to one of the most endangered vertebrates. In Brazil, most endangered species occur in the Atlantic Forest, where there is no study evaluating ecological traits and extinction risk. The objective of the present study is to identify the ecological characteristics of frogs from subtropical Atlantic Forest in Brazil that would indicate them as susceptible to extinction. For each species were collected information about endemism, altitude, frequency of occurrence, population trend, aquatic life index, activity period, body and clutch size. These data were obtained from literature, field guides and specimens held by herpetological collections. The species were classified according to their ecological characteristics using a Cluster Analysis based on the similarity of Gower. The relationship between each variable and the extinction risk was tested using logistic regressions. The study area comprises 238 species, of which 24 have direct development and 214 have indirect development. 116 species were considered in the analysis for having reliable information. Endangered species have occurred in six of the seven ecological groups formed, indicating that the extinction risk was not related to a particular group of frogs with specific ecological traits. The most threatened species occur at low altitudes, where the habitat loss and degradation represent the major cause of decline, differing from endangered species in another rain forests that occur in uplands areas. Other features such as endemism, dependence on stream environments, small size, habitat and activity period were not related to extinction risk. This study contributes to the understanding the extinction risk of amphibians in the country, comparing to other rain forests in the world. For the conservation of amphibians in Brazil, it is necessary to protect the species through Conservation Units, in addition to continuing and improving researchs on extinction risk, especially at the population level.

Made available in DSpace on 2016-02-05T18:29:52Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2015-03-30. Added 1 bitstream(s) on 2016-02-05T18:33:56Z : No. of bitstreams: 1 000856906_20200330.pdf: 252372 bytes, checksum: 02c2741a36d6004e8b4bc263260ac6f2 (MD5) / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP) / O gênero Adenomera é composto por 16 espécies, das quais seis possuem distribuição restrita à Mata Atlântica. O grupo apresenta uma taxonomia complicada por apresentar espécies crípticas, com alto grau de polimorfismo intraespecífico e interespecífico. Recentemente, uma análise filogenética extensa, abrangendo grande parte da distribuição das espécies do gênero, 35 espécies candidatas foram propostas; 16 na Mata Atlântica. No presente trabalho, propomos testar se as espécies candidatas distribuídas na Mata Atlântica compõem um grupo monofilético. Usando uma abordagem interativa com dados diretos de morfologia externa e bioacústica, pudemos delimitar espécies dentro dos clados Thomei e Marmorata. A maior amostragem dados fenotípicos e de um fragmento do gene 16S de indivíduos da Mata Atlântica na análise, permitiu inferir com maior confiança que as espécies distribuídas na Mata Atlântica compõem um grupo monofilético (clados Thomei + Marmorata), irmão do clado Hylaedactyla + Martinezi. O material adicional nos permitiu delimitar e redescrever duas espécies previamente consideradas como um complexo de espécies (Adenomera marmorata e A. bokermanni). Das 16 espécies candidatas do clado Mata Atlântica previamente sugeridas, pudemos delimitar apenas 10 espécies sendo sete já conhecidas e três novas para a Ciência. / The genus Adenomera has 16 species, six of which are Atlantic Forest dwellers. The genus has a difficult taxonomy, mostly due to the high levels of intra and interspecific polymorphism. Recently, a phylogenetic analysis using samples collected through the whole geographic distribution of the genus (roughly tropical and temperate cis-Andean South America) suggested the existence of 35 candidate species; 16 of which being Atlantic Forest dwellers.The present contribution intends to test whatever the Atlantic Forest dwellers are a monophyletic unit. An integrative approach with directly observed data on morphology and bioacoustics allowed species delimitation within the Thomei and Marmorata Clades. Based on a denser sampling of phenotipic and 16S rRNA fragments, we recovered the Atlantic Forest dwellers are a monophyletic unit, with two major clades (Thomei + Marmorata) and sister to the Hylaedactyla + Martinezi clade. The additional material allowed the delimitation and redescritpion of two species previously understood as species complexes (Adenomera marmorata and A. bokermanni). Of the 16 Atlantic Forest dwellers candidate species, we could delimit only 10; seven of those assignable to previously described species / FAPESP: 10/515606-8

Orientador : Dr. Carlos Eduardo Conte / Dissertação (mestrado) - Universidade Federal do Paraná, Setor de Ciências Biológicas, Programa de Pós-Graduação em Zoologia. Defesa: Curitiba, 17/02/2016 / Inclui referências : f. 61-68;154-159;178-182 / Resumo: A principal ameaça aos anfíbios é a destruição e alteração do hábitat, realidade no Brasil, onde fitofisionomias como a Floresta Estacional Semidecidual (FES) e Floresta Ombrófila Mista (FOM) foram quase dizimadas. Como agravante, estas fitofisionomias apresentam uma carência de conhecimento de aspectos relacionados à estruturação das taxocenoses de anfíbios. Desta forma, estudos que buscam conhecer os fatores que regulam e distribuem as taxocenoses de anfíbios em áreas que abrigam remanescentes destas formações são urgentes e necessários. Neste sentido, o presente estudo teve como objetivos: i) realizar o levantamento da anurofauna do Parque Nacional do Iguaçu (PNI), apresentando dados sobre o uso do hábitat das espécies registradas (local onde foram registrados os machos em atividade de vocalização), apresentando a distribuição das espécies no estado e informando dados sobre a história natural das espécies, ii) avaliar a estruturação das taxocenoses de anuros nas distintas formações vegetacionais do PNI, a FES e a FOM e iii) determinar a riqueza de modos reprodutivos das espécies de anuros encontradas nestes remanescentes, analisando quais fatores climáticos (temperatura e umidade relativa ar) influenciam na atividade de vocalização das taxocenoses destes e apresentar a temporada de vocalização dos machos de anuros em corpos da água inseridos destas fitofisionomias. Dentro dos objetivos, foram analisadas as seguintes hipóteses: Modos reprodutivos generalizados são encontrados em maior abundancia em FES; A temporada de vocalização das espécies são relacionadas ao clima, em FES a relação se da com a umidade e FOM com temperatura mínima. O estudo foi desenvolvido em doze fases de campo mensais entre setembro de 2014 a agosto de 2015. Foram utilizados três métodos coleta: i) busca em sitio de reprodução, ii) busca aural em transecções e iii) armadilhas de interceptação e queda. Ao todo foram registradas 31 espécies de anfíbios anuros distribuídas em nove famílias. De acordo com a extrapolação da curva de acumulação de espécies, a assíntota seria encontrada na vigésima primeira amostra, com registro de aproximadamente 32 espécies. Em relação ao uso de hábitat aproximadamente 39% das espécies foram consideradas generalistas, 29% foram classificadas como exclusiva de mata, 23% foram classificadas como exclusiva de área aberta e 9% foram classificadas como área aberta e borda. Das espécies registradas 35% apresentam distribuição ampla no Paraná, 35% apresentam distribuição média, 16% distribuição baixa e outras 14% não foram categorizadas por não terem sido identificadas a nível especifico. Para a diversidade alfa, não foi observado diferenças nas taxocenoses. Já em relação à diversidade beta, foi possível observar que as fitofisionomias são distintas, com dissimilaridade de 90%. Dez modos reprodutivos foram registrados na área, sendo que a FES apresentou maior variedade de modos reprodutivos generalizados (n=4) e a FOM maior variedade de modos reprodutivos especializados (n=3). Foi observado que em FES há maior registro e abundância de espécies nos períodos mais quentes e úmidos do ano, ao passo que em FOM há menor registro e abundância de espécies nos períodos mais frios. Quatro padrões temporais foram encontrados: anuais; de inicio de estação chuvosa; de estação chuvosa; e esporádicas. Mediante aos resultados, foi possível observar que as diferenças estruturais e climáticas das fitofisionomias formam composições de espécies singulares devido à presença de espécies distintas, associadas a cada fitofisionomia. Ainda, foi possível constatar, que as características especificas das fitofisionomias, atuam na diversidade e especificidade de modos reprodutivos e na distribuição temporal das espécies, onde as espécies podem adequar suas temporadas de vocalizações conforme as variáveis climáticas destas. Frente ao grande declínio que os anfíbios vêm sofrendo, nossos resultados evidenciam a importância do PNI e de grandes remanescentes formados por diferentes fitofisionomias para a conservação das taxocenoses de anfíbios. Palavras-chave: Riqueza, Diversidade, Taxocenoses de Anfíbios, Fitofisionomias, Floresta Estacional Semidecidual, Floresta Ombrófila Mista, Modos Reprodutivos, Fatores Climáticos. / Abstract: The main threat to amphibians is destruction and alteration of their habitat, a reality in Brazil, where phytophysiognomies such as the Mesophytic Semideciduous Forest (FES) and the Mixed Ombrophylous Forest (FOM) were almost decimated. As an aggravating factor, these phytophysiognomies present a lack of knowledge of aspects related to the structure of amphibian taxocenoses. In this way, studies that seek to know the factors that regulate and distribute amphibian taxocenoses in areas formed by these formations are urgent and necessary. In this sense, the present study had as objectives: i) inventory the anurofauna the Iguaçu National Park (PNI), presenting data on the habitat use of the registered species (where males were recorded in calling activity), presenting the distribution of the species in the state and reporting data on the natural history of the species, ii) evaluate the structure of anuran taxocenoses in the different vegetation formations of the PNI, FES and FOM and iii) determine the richness of reproductive modes of anuran species found in these remnants, analyzing which climatic factors (temperature and relative air humidity) influence the activity of vocalization of the taxocenoses and present the vocalization season of the anurans males in water bodies inserted in these phytophysiognomies. In addition to these objectives, the following hypotheses were tested: generalists reproductive modes are found in greater abundance in FES; The season of vocalization of the species is related to the climate: in FES its related to the moisture, and FOM its related to the minimum temperature. The study was developed in twelve monthly field phases between September 2014 and August 2015. Three collection methods were used: i) search on site of reproduction, ii) aural search in transections, and iii) pitfall traps. It was recorded 31 species of amphibians distributed in nine families. According to the extrapolation of species curve, the asymptote would be found in the twenty-first sample with, approximately, 32 species recorded. In relation to habitat use, 39% of the recorded species were considered generalists, 29% were classified as exclusive woods, 23% were classified as exclusive open area, 9% were classified as open area and edge. Of the species registered, 35% have a wide distribution in Paraná state, 35% have a medium distribution, 16% have a low distribution and another 14% were not categorized because they were not identified at a specific level. For alpha diversity, was not observed differences in taxocenoses. Regarding the beta diversity, it observed that the vegetation types are different, with average dissimilarity of 90%. Ten reproductive modes were recorded in the area, with the FES presenting a greater variety of generalists reproductive modes (n = 4) and FOM a greater variety of specialists reproductive modes (n = 3). It was observed that in FES there is more record and abundance of species in the hotter and wetter periods of the year, whereas in FOM there is less record and abundance of species in colder periods. Four temporal patterns were found: annually; in the beginning of the rainy season; in the rainy season; and sporadic. Through the results, it was possible to observe that the structural and climatic differences of phytophysiognomies form compositions of singular species due to the presence of distinct species, associated to each phytophysiognomy. It was also possible to verify that the specific characteristics of the phytophysiognomies affect the diversity and specificity of the reproductive modes and the temporal distribution of the species, where the species can adapt their seasons of vocalizations according to their climatic variables. In the face of the great decline that amphibians are suffering, our results highlight the importance of PNI and large remnants formed by different phytophysiognomies for the conservation of amphibian taxocenoses. Palavras-chave: Wealth, Diversity, Amphibian Taxocenoses, Phytophysiognomies, Mesophytic Semideciduous Forest, Mixed Ombrophilous Forest, Reproductive Modes, Climatic Factors.

Made available in DSpace on 2015-09-17T15:25:08Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2015-02-12. Added 1 bitstream(s) on 2015-09-17T15:49:14Z : No. of bitstreams: 1 000846292_20151231.pdf: 244618 bytes, checksum: 655a88451632934f130b9e81b38c2d0f (MD5) Bitstreams deleted on 2016-01-04T10:26:34Z: 000846292_20151231.pdf,. Added 1 bitstream(s) on 2016-01-04T10:28:27Z : No. of bitstreams: 1 000846292.pdf: 2231174 bytes, checksum: e74394346c5c7f94491371a44e3ab7a6 (MD5) / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) / Os objetivos deste estudo foram descrever os caracteres morfométricos, morfológicos e bioacústicos de Scinax hayii da localidade tipo e de três Unidades taxonômicas operacionais (UTO) e comparar as localidades entre si registrando variações encontradas nos caracteres analisados. Foram mensurados 18 caracteres morfométricos em exemplares coletados em campo e exemplares de coleções científicas. A análise morfológica consistiu na comparação qualitativa de caracteres e verificação de presença de faixas e manchas em aspecto dorsal. A análise bioacústica foi realizada através de vocalizações obtidas de exemplares gravados em condições naturais de campo em todas as UTOs. Scinax hayii de Petrópolis apresenta caracteres morfométricos semelhantes a espécimes da UTO Serra do Mar. Os exemplares das UTOs Planície Litorânea e Serra da Mantiqueira apresentam menor tamanho corporal (CRC: 34,2 - 41,5 mm; 31,5 - 42,2 mm; respectivamente). Scinax hayii de Petrópolis, Serra do Mar e Planície Litorânea são desprovidos de faixas ou manchas em padrão dorsal. Exemplares da UTO Serra da Mantiqueira diferem das demais localidades por apresentar coloração dorsal possuindo faixas e manchas. As vocalizações de S. hayii de Petrópolis mostram-se semelhantes aos cantos de exemplares da UTO Serra do Mar. As vocalizações dos espécimes registrados nas UTOs Planície Litorânea e Serra da Mantiqueira diferem das demais localidades e entre si. Indivíduos de Petrópolis e UTO Serra do Mar por possuir caracteres morfológicos e bioacústicos semelhantes indicam ser a mesma espécie. Os exemplares registrados na UTO Planície litorânea possuem caracteres morfológicos e bioacústicos diferente das demais localidades, indicando ser uma nova espécie. Exemplares da UTO Serra da Mantiqueira por possuírem caracteres morfológicos e bioacústicos diferindo das demais localidades indicam ser uma nova... / This study aims were to describe the morphometric, morphological and bioacoustic of Scinax hayii characters from the type locality and from three Operational Taxonomic Units to compare the localities with each other and registering founds variations at the characters analyzed. Were measured 18 morphometric characters in collected specimens on field and specimens provided of scientific collections. Morphological analysis was performed by the characters qualitative comparison and checking for the stripes and spots presence on the dorsal aspect. The bioacoustics analysis was performed with obtained recordings of recorded specimens in natural field conditions at all OTUs. Scinax hayii from Petrópolis has similar morphometric characters to OTU Serra do Mar. Specimens of OTU Planície Litorânea and Serra da Mantiqueira have smaller size (CRC: 34,2 - 41,5 mm; 31,5 - 42,2 mm; respectively). Scinax hayii from Petrópolis, Serra do Mar and Planície Litorânea are devoided stripes and spots on dorsal pattern. OTU Serra da Mantiqueira specimens differ from other locations by present dorsal coloration having stripes and spots. The S. hayii from Petrópolis vocalizations are shown like the OTU Serra do Mar call specimens. The recorded specimens vocalizations at OTUs Planície Litorânea and Serra da Mantiqueira differ from another locations and each other. Petrópolis and OTU Serra do Mar specimens by having similar morphological and bioacoustics characters indicate to be of the same species. The registered specimens at UTO Planície Litorânea have different morphological and bioacoustics characters from another locations, indicating that is a new specie. The UTO Serra da Mantiqueira specimens by having different morphological and bioacoustics characters from other locations indicate to be a new specie or the currently revalued specie as S. dolloi. In view of the morphological and bioacoustics analysis...

Tese (doutorado)—Universidade de Brasília, Departamento de Biologia Celular, Instituto de Ciências Biológicas, Programa de Pós-Graduação em Biologia Molecular, 2017. / Submitted by Raquel Almeida (raquel.df13@gmail.com) on 2018-01-03T19:19:15Z No. of bitstreams: 1 2017_DanielCarneiroMoreira.pdf: 28270419 bytes, checksum: 288382f17284ab7af5847bcf746c9df1 (MD5) / Approved for entry into archive by Raquel Viana (raquelviana@bce.unb.br) on 2018-03-12T13:44:23Z (GMT) No. of bitstreams: 1 2017_DanielCarneiroMoreira.pdf: 28270419 bytes, checksum: 288382f17284ab7af5847bcf746c9df1 (MD5) / Made available in DSpace on 2018-03-12T13:44:23Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2017_DanielCarneiroMoreira.pdf: 28270419 bytes, checksum: 288382f17284ab7af5847bcf746c9df1 (MD5) Previous issue date: 2018-03-12 / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq); Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES). / A evolução selecionou um conjunto de adaptações fisiológicas e bioquímicas comuns em animais que toleram amplas variações de parâmetros ambientais em suas histórias de vida. Devido à dependência para produção de energia e a relação com a produção de espécies reativas de oxigênio (ROS), situações de flutuação dos níveis de O2 são condições potencialmente deletérias para animais. Ambientes extremos que afetam a disponibilidade e consumo de O2 incluem eventos de anóxia, hipóxia, congelamento, desidratação severa, exposição aérea de organismo de respiração aquática e estivação. Uma estratégia comum de animais submetidos a tais situações é a elevação dos níveis de antioxidantes endógenos. Esta estratégia foi batizada de “Preparo para o Estresse Oxidativo” (POS). Os objetivos deste trabalho foram: (i) propor um mecanismo molecular detalhado de ativação do POS em condições de baixa de oxigênio; (ii) desenvolver critérios de classificação e classificar espécies, determinando a prevalência do POS no reino animal; e (iii) verificar a ocorrência do POS em duas espécies de anuros da Caatinga durante a estivação na natureza. A compilação de dados fragmentados na literatura indica um acionamento do POS via aumento da produção de ROS durante a hipóxia. Segundo este modelo, durante a hipóxia haveria um aumento da produção mitocondrial de ROS, ativando fatores de transcrição sensíveis a alterações redox (Nrf2, FoxO, HIF-1 e NF-κB), que, por sua vez, promoveriam a expressão de antioxidantes endógenos. A classificação de animais usando diferentes critérios revelou que o POS é, de fato, uma estratégia amplamente utilizada por animais de 8 filos diferentes. A proporção de animais que apresentam o POS (POS-positivas) durante a privação de O2 depende do estresse ao qual o animal é submetido. O percentual de espécies POS-positivas foi de 54-77%, 64-77% e 75-86% nos casos de exposição aérea, anoxia e congelamento respectivamente. Dentre animais expostos à estivação e a desidratação a prevalência foi maior, atingindo valores de 91-100%. No caso da hipóxia, a prevalência de animais POS-positivos foi de 37,5-53%, dependendo do critério usado. A alta prevalência do POS no reino animal reforça a importância da modulação de antioxidantes em situações de privação de O2. Considerando que resultados de animais do campo podem ser mais ecologicamente relevantes que aqueles de animais em condições artificiais de laboratório, investigamos a modulação de antioxidantes no músculo de duas espécies de anuros da Caatinga, Pleurodema diplolistris e Proceratophrys cristiceps, durante a estivação sem intervenção experimental. Para tanto, foram analisadas as atividades de enzimas antioxidantes, enzimas metabólicas e a concentração de glutationa (nas formas reduzida e dissulfeto). Em ambas espécies, houve queda de 36% da atividade de citrato sintase muscular em animais estivando coletados durante a estação seca comparados com animais ativos. As atividades de catalase, glutationa peroxidase (total) e glutationa peroxidase (H2O2) aumentaram em ambas as espécies durante a estivação. Em P. diplolistris os aumentos foram de 74%, 74% e 73% respectivamente. Já em P. cristiceps os aumentos foram de 48%, 57% e 78% respectivamente. O aumento da capacidade antioxidante de ambas as espécies é o primeiro registro da ocorrência do POS em animais estivando livremente na natureza. / Evolution has selected a set of biochemical and physiological adaptations in animals that tolerate wide variations of environmental parameters. Due to its roles in energy metabolism and in reactive oxygen species (ROS) generation, fluctuations in O2 availability are potentially deleterious to animals. Extreme environments in which oxygen availability and consumption are strongly affected include events of hypoxia, anoxia, freezing, severe dehydration, aerial exposure of aquatic organisms, and estivation. The increase in endogenous antioxidants levels is a common strategy of animals submitted to such situations. This strategy was coined “Preparation for Oxidative Stress” (POS). The aim of this study was: (i) to propose a detailed molecular mechanism for the activation of POS under low oxygen stresses; (ii) to design classification criteria and classify species, determining the prevalence of POS in animals; and (iii) to verify the occurrence of POS in two anurans from the Caatinga during estivation in their natural environment. Published data indicates that POS could be activated by a surge in ROS production during hypoxia. According to this model, the rise in ROS generation would activate redox-sensitive transcription factors (Nrf2, FoxO, HIF-1 e NF-κB), leading to enhanced antioxidant defenses. The proportion of POSpositive species in the animal kingdom depends on the nature of the low oxygen stress. The prevalence of POS-positive species was 54-77%, 64-77% and 75-86% for aerial exposure, anoxia and freezing respectively. In the case of estivation and dehydration the prevalence was higher, reaching 91-100%. For hypoxia, the prevalence of POS-positive animals was 37.5-53%, depending on the criteria. The high prevalence of POS-positive species highlights the important role of antioxidant modulation during low oxygen stresses. Considering that results from field-collected animals might be more ecologically relevant than those from laboratory experiments, we investigated the modulation of antioxidants in the muscle of two anuran species from the Caatinga, Pleurodema diplolistris and Proceratophrys cristiceps, during estivation without experimental intervention. To do so, we measured the activities of metabolic and antioxidant enzymes, as well as the concentration of reduced and disulfide glutathione. In both species, the activity of citrate synthase decreased by 36% in the muscle of estivating animals collected in the dry season compared to active animals collected in the rainy season. The activities of catalase, glutathione peroxidase (total) and glutathione peroxidase (H2O2) increased in both species during estivation. In P. diploslistris, they increased by 74%, 74% and 73% respectively. While they increased by 48%, 57% and 78% respectively in P. cristiceps. Such enhanced antioxidant capacity in both species is the first report of POS occurrence in animals estivating under natural conditions.

Tese (doutorado)—Universidade de Brasília, Instituto de Ciências Biológicas, Programa de Pós-Graduação em Biologia Animal, 2016. / Submitted by Camila Duarte (camiladias@bce.unb.br) on 2017-01-13T14:54:38Z No. of bitstreams: 1 2016_CésarAugustoPríasMárquez.pdf: 13896752 bytes, checksum: 0f77b4787c74c9521a4b65abcfbac820 (MD5) / Approved for entry into archive by Raquel Viana(raquelviana@bce.unb.br) on 2017-02-13T16:37:37Z (GMT) No. of bitstreams: 1 2016_CésarAugustoPríasMárquez.pdf: 13896752 bytes, checksum: 0f77b4787c74c9521a4b65abcfbac820 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-02-13T16:37:37Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2016_CésarAugustoPríasMárquez.pdf: 13896752 bytes, checksum: 0f77b4787c74c9521a4b65abcfbac820 (MD5) / No presente trabalho foi avaliado pela primera vez o potencial anticâncer da secreção cutânea do anuro sul-americano Hypsiboas crepitans (Wied-Neuwied, 1824). O fracionamento por RP-HPLC de secreções de indivíduos coletados na Colômbia e no Brasil permitiu a caracterização dos perfis cromatográficos das duas populações, obtendo-se registros das massas moleculares monoisotópicas de vários peptídeos presentes nessas secreções. Testes de atividade antimicrobiana realizados com a secreção de indivíduos da Colômbia levaram ao isolamento e à caracterização química e biológica de dois novos peptídeos da família das hilinas. Estes peptídeos, denominados de HCC76 e HCC77 apresentam cadeia polipeptídica curta, são altamente hidrofóbicos, possuem baixa cationicidade e são propensos a formarem estruturas em α-hélice anfipática. Versões sintéticas dos dois peptídeos (HCC76 e HCC77(K)) foram usadas para a determinação das suas concentrações inibitórias mínimas (MICs) em bactérias e fungos e da concentração hemolítica 50 % (HC50) em hemácias humanas. Os peptídeos HCC76, HCC77(K) e dois análogos deste último, denominados HCC77(K)1 e HCC77(K)2, tiveram seus efeitos antiproliferativos avaliados sobre células aderentes de mamíferos. Adicionalmente foram utilizados nesses ensaios dois peptídeos sintéticos da família das ocelatinas (ocelatina-F1 e G16OCP1), isolados previamente de secreções de anuros do gênero Leptodactylus. Os resultados mostram que os peptídeos HCC76 e HCC77(K) possuem grandes diferenças quanto à sua atividade biológica em bactérias e células de mamíferos, enquanto os dois análogos do peptídeo HCC77(K) conservaram a atividade em células aderentes de mamífero e tiveram melhora na potência, com relação a este. De forma similar, os peptídeos G16OCP1 e ocelatina-F1 mostraram diferenças quanto à sua atividade em células cancerosas e normais de mamíferos. Ensaios utilizando citometria de fluxo e microscopia de contraste de fase mostram que os peptídeos HCC77(K) e ocelatina-F1 induzem morte celular em uma linhagem de melanoma murino por um processo que envolve apoptose, com evidência de fragmentação de DNA e alteração do potencial de membrana mitocondrial e, no caso do peptídeo HCC77(K), efeitos na membrana plasmática e no ciclo celular. / The present study assessed, for the first time, the anticancer potential of the skin secretion of the South American anuran Hypsiboas crepitans (Wied-Neuwied, 1824). Fractionation of skin secretions of Colombian and Brazilian specimens by RP-HPLC allowed the characterization of chromatographic profiles of those two populations, while obtaining records of the monoisotopic molecular masses of several peptides present in these secretions. Antimicrobial activity assays performed using the secretion obtained from specimens collected in Colombia led to the isolation and chemical and biological characterization two new peptides belonging to hylins family. These peptides, named HCC76 and HCC77, are short-chain, highly hydrophobic, lowly cationic, and exhibit propension to adopt amphipatic α-helix structures. Synthetic forms of these two peptides (HCC76 and HCC77(K)) were used for determination of minimum inibitory concentrations (MICs) on bacteria and fungi, and also for determination of hemolytic concentration 50 % (HC50) on human erythrocytes. The peptides HCC76, HCC77(K) and two analogs of the last one, were used in assays assessing their antiproliferative effects on adherent mammalian cells. Additionally, two synthetic peptides (ocellatin-F1 and G16OCP1) belonging to the ocellatin family, previously isolated from the skin secretions of Leptodactylus spp. were used in the same tests. The results show that HCC76 and HCC77(K) have great differences regarding their biological activity on bacteria and mammalian cells, while the two HCC77(K)-derived analogs maintained activity on mammalian adherent cells and had a better potency compared to HCC77(K). Similarly, the peptides G16OCP1 and ocellatin-F1 showed differences regarding their biological activity on normal and cancerous mammalian cells. Assays using flow cytometry and phase-contrast microscopy show that the peptides HCC77(K) and ocellatin-F1 lead to cell death on a murine melanoma cell line through a process involving apoptosis, with evidence of DNA fragmentation and disruption of mitochondrial membrane potential; and also, in the case of HCC77(K), effects on the plasma membrane and cell cycle. / En este trabajo se evaluó por primera vez el potencial antitumoral de la secreción cutánea del anuro suramericano Hypsiboas crepitans (Wied-Neuwied, 1824). El fraccionamiento por RP-HPLC de secreciones de individuos colectados en Colombia y Brasil permitió la caracterización de los perfiles cromatográficos de las dos poblaciones, obteniéndose registros de las masas moleculares monoisotópicas de varios péptidos presentes en estas secreciones. Ensayos de actividad antimicrobiana, realizados con la secreción de individuos colombianos, condujeron al aislamiento y a la caracterización química y biológica de dos nuevos péptidos de la familia de las hilinas. Estos péptidos, denominados HCC76 y HCC77, presentan cadena polipeptídica corta, son altamente hidrofóbicos, poseen baja cationicidad y son propensos a formar estructuras en α-hélice anfipática. Versiones sintéticas de los dos péptidos (HCC76 y HCC77(K)) fueron usadas para la determinación de sus concentraciones inhibitorias mínimas (MICs) en bacterias y hongos, así como de sus concentraciones hemolíticas 50 % (HC50) en eritrocitos humanos. Los péptidos HCC76 y HCC77(K), así como dos análogos de este último, denominados HCC77(K)1 y HCC77(K)2, fueron usados para evaluar su efecto antiproliferativo en células adherentes de mamíferos. Adicionalmente fueron utilizados en esos ensayos, dos péptidos sintéticos de la familia de las ocelatinas (ocelatina-F1 y G16OCP1), aislados previamente de secreciones de anuros del género Leptodactylus. Los resultados muestran que los péptidos HCC76 y HCC77(K) poseen grandes diferencias con relación a su actividad biológica en bacterias y células de mamífero, mientras los dos análogos del péptido HCC77(K) conservan su actividad en células adherentes de mamífero, mejorando su potencia respecto a este. Ensayos usando citometría de flujo y microscopía de contraste de fase muestran que los péptidos HCC77(K) y ocelatina-F1 inducen muerte celular en un linaje de melanoma murino através de un proceso que involucra apoptosis, con evidencia de fragmentación de DNA y alteración del potencial de membrana mitocondrial y, en el caso del péptido HCC77(K), efectos sobre la membrana plasmática y el ciclo celular.

Tese (doutorado)—Universidade de Brasília, Instituto de Ciências Biológicas, Programa de Pós-Graduação em Biologia Animal, 2015. / Submitted by Fernanda Percia França (fernandafranca@bce.unb.br) on 2015-12-17T19:33:21Z No. of bitstreams: 1 2015_FabianoJoséQueirozCosta.pdf: 3573477 bytes, checksum: 03e447fd00fe16402cfa8f66c347ca59 (MD5) / Approved for entry into archive by Raquel Viana(raquelviana@bce.unb.br) on 2015-12-21T19:20:49Z (GMT) No. of bitstreams: 1 2015_FabianoJoséQueirozCosta.pdf: 3573477 bytes, checksum: 03e447fd00fe16402cfa8f66c347ca59 (MD5) / Made available in DSpace on 2015-12-21T19:20:49Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2015_FabianoJoséQueirozCosta.pdf: 3573477 bytes, checksum: 03e447fd00fe16402cfa8f66c347ca59 (MD5) / Esse projeto de tese de doutorado tem o apoio financeiro do CNPq, da FAPDF, da FINEP e da FUB-UnB. / Os peptídeos antimicrobianos, compostos encontrados em plantas, insetos e vertebrados, dentre outros, surgem como fortes candidatos na desafiadora busca por novas drogas capazes de combater a diversificada maquinaria bacteriana, principalmente pelo fato da maioria deles apresentarem um mecanismo de ação independente da interação com receptores. Nos últimos anos, o número de novos antimicrobianos licenciados para uso no homem tem sido bem menor que em um passado recente. As indústrias farmacêuticas e o governo não estão dispendendo recursos para a geração de novos antimicrobianos eficazes e seguros, deixando a população suscetível a infecções bacterianas multi-droga-resistentes (MDR), um fenômeno que tem se tornado um dos maiores problemas de saúde pública do século 21. O desenho racional e a síntese química permitem a produção de análogos de peptídeos antimicrobianos com atividade citotóxica diminuída e melhora na potência antimicrobiana, fornecendo drogas eficazes no combate a disseminação da resistência bacteriana. No presente estudo, foram sintetizados dois análogos de peptídeos antimicrobianos de anuros. Os dois análogos, denominados AH_1 e AH_2, foram produzidos por síntese química em fase sólida e purificados por meio de cromatografia líquida de alta eficiência em coluna de fase reversa (RP-HPLC). Seu grau de homogeneidade e pureza foram avaliados por espectrometria de massas do tipo MALDI-TOF. Após confirmação da pureza, estes análogos foram utilizados em ensaios in vitro buscando avaliar suas atividades antibacteriana, fungicida, micobactericida e hemolítica. Os dois análogos apresentaram atividade antimicrobiana contra bactérias Gram positivas e Gram-negativas, inclusive frente a cepas multirresistentes de Staphylococcus aureus meticilina-resistente (MRSA), Klebsiella pneumoniae carbapenemase (KPC) e Pseudomonas aeruginosa. Também apresentaram atividade contra as espécies de Candida albicans, Candida krusei e Candida parapsilosis, além de atividade micobactericida contra cepas de Mycobacterium tuberculosis H37Rv. O efeito sinérgico entre estes análogos e a polimixina B foi avaliado através do ensaio Checkerboard. Uma cepa de Pseudomonas aeruginosa multirresistente com CIM igual a 8 g/mL para polimixina B, caracterizada como resistente de acordo com breakpoints estabelecidos pelo CLSI 2014 foi utilizada neste ensaio. Os dois peptídeos AH_1 e AH_2 apresentaram ICIF < 0,5 demonstrando assim sinergismo de ação com a polimixina B. Houve uma redução da CIM inicial de 8 g/mL quando a polimixina foi testada sozinha, para 0,0625 g/mL e 0,25 g/mL quando testada em combinação aos dois análogos AH_1 e AH_2, respectivamente. Nestas baixas concentrações ativas exibidas no ensaio Checkerboard, as atividades hemolíticas dos dois análogos foram desprezíveis. Tais resultados confirmam o potencial dos análogos AH_1 e AH_2 como agentes antimicrobianos de interesse para a indústria farmacêutica. O análogo AH_1, apesar de seu maior potencial hemolítico em altas concentrações, exibiu excelente atividade principalmente sobre bactérias gram negativas, responsáveis hoje por grande parte dos casos de infecções hospitalares. ______________________________________________________________________________________________ ABSTRACT / Antimicrobial peptides, compounds found in plants, insects and vertebrates, emerge as strong candidates in the challenging search for new drugs. They are able to combat the bacterial machinery, mainly because most of them present a mechanism of action independent of the interaction with receptors. In recent years, the number of new antimicrobial drugs licensed for human use has been smaller than in the recent past. The pharmaceutical industries and government are not expending resources for the generation of new effective and safe antimicrobial agents, leaving the population susceptible to multi-drug-resistant (MDR) bacterial infections, a phenomenon that has become one of the greatest public health problems of the 21st century. Rational design and chemical synthesis allow production of antimicrobial peptides analogues with reduced cytotoxic activity and improved antimicrobial potency, providing effective drugs in combating the spread of bacterial resistance. In this study, two analogues of anurans antimicrobial peptides were synthesized. Both analogues, named AH_1 and AH_2 were produced by chemical solid-phase synthesis and purified by high performance liquid chromatography on reversed-phase column (RP-HPLC).Their degree of homogeneity and purity were assessed by mass spectrometry analysis using MALDI TOF. After confirming their purity, these analogs were tested in vitro to evaluate their antibacterial, fungicidal, mycobactericidal and hemolytic properties. The two analogues showed antimicrobial activity against Gram-positive and Gram negative bacteria, including multidrug resistant strains such as methicillin resistant Staphylococcus aureus (MRSA), Klebsiella pneumoniae carbapenemase (KPC), and Pseudomonas aeruginosa. Also showed activity against species of Candida albicans, C. krusei and C. parapsilosis, in addition mycobactericidal activity against Mycobacterium tuberculosis H37Rv. The synergistic effect between these analogs and polymyxin B was tested by checkerboard assay. A strain of multidrug-resistant Pseudomonas aeruginosa with MIC equal to 8 g/mL for polymyxin B, characterized as resistant in accordance with breakpoints established by the CLSI 2014 was used in this test. Both AH_1 and AH_2 peptides presented ICIF <0.5 thus demonstrating synergistic action with polymyxin B. There was a reduction of the initial MIC of 8 g/mL when the polymyxin was tested alone to 0.0625 g/mL and 0.25 g/mL when tested in combination to the two analogs AH_1 and AH_2, respectively. In this low active concentrations in Checkboard assay.

Dissertação (mestrado)—Universidade de Brasília, Instituto de Ciências Biológicas, Programa de Pós-Graduação em Ecologia, 2015. / Submitted by Fernanda Percia França (fernandafranca@bce.unb.br) on 2016-01-28T11:26:05Z No. of bitstreams: 1 2015_MarianaGarcezStein.pdf: 14262578 bytes, checksum: e78acb50d466bd267f079a5b032b4c9d (MD5) / Approved for entry into archive by Raquel Viana(raquelviana@bce.unb.br) on 2016-02-04T17:07:20Z (GMT) No. of bitstreams: 1 2015_MarianaGarcezStein.pdf: 14262578 bytes, checksum: e78acb50d466bd267f079a5b032b4c9d (MD5) / Made available in DSpace on 2016-02-04T17:07:20Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2015_MarianaGarcezStein.pdf: 14262578 bytes, checksum: e78acb50d466bd267f079a5b032b4c9d (MD5) / A busca por padrões de distribuição dos organismos é uma das questões centrais da biologia. A Biogeografia é a ciência que busca identificar esses padrões assim como os processos que levaram a formação dos mesmos. A Caatinga é único bioma exclusivamente brasileiro e embora historicamente descrito como homogêneo e sem biota própria, atualmente sabe-se que é um bioma heterogêneo e que apresenta regiões de elevado endemismo. Apesar disso, trata-se do bioma menos estudado e conservado do país. Este trabalho teve como objetivo identificar e compreender os padrões de distribuição dos anuros na Caatinga, utilizando ferramentas de modelagem de distribuição de espécies, análise de endemicidade e análise de agrupamento. Os resultados mostraram que há uma de escassez de informações sobre a distribuição geográfica dos organismos. Apesar disso, elevadas áreas de riqueza foram encontradas e se localizaram principalmente na região leste do bioma e na Chapada Diamantina. Entre as áreas de endemismo obtidas no estudo destacam-se a área referente a Caatinga e outra localizada na Chapada Diamantina. A Caatinga mostra-se ainda como um bioma heterogêneo, dividido em seis grupos pela análise de agrupamento. Os grupos obtidos se mostraram distintos da divisão da Caatinga em ecorregiões. Assim, estudos de conservação de anfíbios no bioma não devem ser baseados na divisão do bioma em ecorregiões, pois as mesmas não representam a distribuição dos anfíbios no bioma. ______________________________________________________________________________________________ ABSTRACT / The search for organism distribution patterns is one of the central questions in biology studies. The science that seeks to identify these patterns, as well as the processes that led to them, is called Biogeography. Caatinga is the only exclusively Brazilian biome and, although historically described as homogeneous and without unique biota, it is now considered a heterogeneous biome, with high endemism regions. Nevertheless, it is the least studied and conserved biome in the country. This study aimed to identify and understand the distribution patterns of anurans in Caatinga, using species distribution modeling, endemicity, and cluster analysis. The results showed that there is a scarcity of information on the geographical distribution of organisms. However, we found high richness areas, located mainly in the eastern part of the biome and in Chapada Diamantina region. Among the endemism areas observed in this study, both the area regarding the entire biome and the one located in Chapada Diamantina stood out. We also perceived that Caatinga is a heterogeneous biome, divided into six groups by cluster analysis. The obtained groups were distinct from the ecoregions suggested as a division of Caatinga. Therefore, amphibian studies and actions for their conservation in the biome should not be based on classical division in ecoregions, because they do not represent the real distribution of amphibians in the biome.

Orientador: Denise de Cerqueira Rossa Feres / Banca: Lilian Casatti / Banca: Marcio Martins / Resumo: A composição da paisagem tem um papel fundamental na estrutura e organização de comunidades. A vegetação da região noroeste do Estado de São Paulo, caracterizada como Floresta Estacional Semidecidual e Savana, se restringe hoje a 4% de sua área original, tendo sido substituída por pastagens, culturas diversas ou áreas urbanas. Desta maneira, o objetivo geral do presente estudo foi verificar a importância dos fragmentos florestais para anuros de área aberta em Icém, região noroeste do Estado de São Paulo, procurando responder as seguintes perguntas: i) fragmentos florestais funcionam como áreas de refúgio para espécies de anuros de área aberta? ii) os padrões de riqueza, abundância e distribuição temporal de anuros em corpos d'água vizinhos a fragmentos florestais diferem dos registrados em corpos d'água distantes dos fragmentos? Além disso, investigamos, ao longo de um ano de amostragens, a dieta de anuros capturados em armadilhas de queda instaladas em três fragmentos florestais. Para isso, foram selecionados quatro fragmentos florestais, distanciados entre si de 1 a 4 km, e os seguintes conjuntos de corpos d'água: a) nove brejos, sendo três localizados no interior, três na borda e três distantes (distância mínima de 200 m) dos fragmentos florestais; b) seis açudes, sendo três vizinhos a fragmentos florestais (distância máxima de 50 m da borda dos fragmentos) e três distantes (distância mínima de 300 m) de qualquer fragmento florestal. Foram registradas 25 espécies de anuros, 12 espécies nas armadilhas instaladas no interior dos fragmentos florestais. Destas, três, Eupemphix nattereri, Leptodactylus podicipinus e Physalaemus cuvieri, apresentaram alta abundância (n > 50 exemplares)...(Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: Landscape arrangement plays a key role in community structure and composition. The northwestern São Paulo State's vegetation, characterized as Semideciduous Seasonal Forest and Savanna, is restricted to 4% of its original area, having been replaced by grazing, plantations or urban areas. Thus, the present study's aim was to verify forest fragments' importance for open-area anurans in Icem, northwestern São Paulo State, looking for answers to these questions: Do forest fragments work as shelter areas for open-area anurans species? Do patterns of richness, abundance and temporal distribution of anurans in water bodies next to forest fragments differ from those registered in water bodies far from the fragments? Furthermore, we investigated, throughout one year of samples, the diet of anurans captured in pitfalls installed in three forest fragments. In order to do so, four forest fragments, 1 to 4km apart from each other, were selected, together with the following groups of water bodies: a) nine swamps, three located in the interior, three in the edge and three distant (minimum distance of 200m) from the forest fragments; b) six ponds, three of them next to the forest fragments (maximum distance of 50 m from the fragment’s edge) and three distant (minimum distance 300m). Twenty-five species of anurans were registered, twelve species in pitfalls installed in the interior of the forest fragments. Three of these, Eupemphix nattereri, Leptodactylus podicipinus e Physalaemus cuvieri, showed high abundance (n>50 individuals). In pitfalls, 228 individuals, belonging to 10 anuran species, were captured. The high richness and abundance of specimens captured mean that the forest fragments are important components for anuran communities. Water bodies distant from forest fragment showed higher richness (24 species) than those near the fragments (19 species). The opposite occurred with abundance of species...(Complete abstract click eletronic access below) / Mestre

Orientador: Classius de Oliveira / Banca: Marta Verardino de Stéfani / Banca: Selma Maria Almeida Santos / Resumo: O sistema pigmentar extracutâneo é composto por células pigmentares sendo a mais conhecida denominada melanócito, são células grandes e irregulares e no seu conteúdo citoplasmático é que estão os pigmentos (melanina) armazenados em grânulos denominados melanossomos, sendo a própria célula que sintetiza esses pigmentosos. Os melanócitos são encontradas em diversos órgãos como rins, baço, testículos, fígado, porções do intestino, encéfalo, ouvido, peritônio e ainda em volta de vasos sanguíneos e nervos. Com esta pesquisa foi descrita a pigmentação visceral padrão de três espécies de anuros: Physalaemus cuvieri, Dendropsophus nanus e Rhinella schneideri e observado se existe alguma alteração no sistema pigmentar extracutâneo das espécies submetidas a variações no fotoperíodo (longo-20 horas claro e curto-4 horas claro) e temperatura (alta-35ºC e baixa-10ºC). Esses parâmetros foram avaliados separadamente utilizando-se para cada um deles 9 animais de cada espécie capturados na região de São José do Rio Preto - SP. Dos 9 animais capturados 3 foram em seguida analisados (grupo controle). Os outros 6 animais foram colocados em uma estufa tipo B.O.D., separados em terrários individuais onde, após 3 dias, 3 deles foram sacrificados e analisados, os outros 3 animais foram sacrificados após 8 dias do início do experimento para suas análises. Nas analises os animais tinham os órgãos expostos para identificar os órgãos que possuíam pigmentação, bem como seu padrão de intensidade que seguiu uma escala de 4 categorias sendo que a categoria número 0 referente à órgãos sem nenhum pigmento e a número 3 órgãos intensamente pigmentados, com 2 estágios intermediários progressivamente mais pigmentados. Os órgãos analisados foram: coração, pericárdio e vasos da base, fígado, baço, peritônio, estômago, intestino e mesentério, reto... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: The present investigation examined the extracutaneous pigmentation pattern of three species of anuran amphibians, Dendropsophus nanus, Physalaemus cuvieri, and Rhinella schneideri, during the course of their breeding seasons. Pigmentation intensity in the different organs was graded on a 4-category scale, in which category 0 refers to organs without pigment and category 3 refers to intensely pigmented organs, with 2 intermediate stages of progressively stronger pigmentation. Rhinella schneideri showed testicular pigmentation, with intra-specific variation (categories 0 and 1). In P. cuvieri there was variation in the presence of pigmentation in the lungs: all the animals showed pigmentation (category 1) at the beginning of the breeding season, and as the season progressed the absence of pigments became the most common pattern. In the liver of the first animals collected, the pigment intensity was high (category 2) with many iridophores present, but in the last specimens collected no iridophores were found. The variation in D. nanus occurred in the kidneys, where animals collected at the beginning of the season did not show pigmentation. Renal veins displayed few melanocytes (category 1); animals collected at the end of the season showed more pigmentation in the kidney (category 2), whereas in the renal veins the intensity remained the same. The changes observed in the extracutaneous pigment system in some organs, during the reproductive period, may be due to physiological alterations or may represent a speciesspecific characteristic. / Mestre