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Estudo citogenetico e das relações filogeneticas de Engystomops petersi e Engystomops sp. (Anura, Leiuperidae) / Cytogenetics and phylogenetics studies of Engystomops petersi and Engystomops sp. (Anura, Leiuperidae)

Targueta, Cíntia Pelegrineti, 1983- 13 August 2018 (has links)
Orientador: Luciana Bolsoni Lourenço Morandini / Dissertação (mestrado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Biologia / Made available in DSpace on 2018-08-13T04:27:41Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Targueta_CintiaPelegrineti_M.pdf: 5224061 bytes, checksum: 8bdf78a0b206d3bdf666436bc2d077b5 (MD5) Previous issue date: 2009 / Resumo: O anuro Engystomops petersi está amplamente distribuído na bacia Amazônia, compreendendo países como o Brasil, Equador, Peru e Bolívia. Estudos prévios já descreveram variações no canto e também variações genéticas nesse anuro. Nós apresentamos aqui uma análise citogenética da população de Puyo (Equador), um sítio que inclui a região descrita como sendo a localidade-tipo dessa espécie, duas outras populações Equatorianas que apresentam isolamento pré-zigótico (Yasuní e La Selva), e uma população Brasileira do Estado do Acre. Todos os espécimes analisados citogeneticamente foram também incluídos em estudos filogenéticos utilizando seqüências de DNA mitocondrial. A sequência de parte de um gene nuclear (rodopsina) também foi utilizada neste trabalho. Uma enorme variação citogenética foi encontrada e muitos padrões cariotípicos puderam ser observados, mesmo entre populações que não apresentam isolamento pré-zigótico. Este resultado nos permite sugerir que dados cariotípicos podem ter participado no processo de especiação de Engystomops. Populações de Puyo e do Acre apresentaram cromossomos sexuais heteromórficos compondo o sistema XX/XY, o que não foi identificado nas outras populações Equatorianas. Já que as populações Equatorianas estão localizadas em um clado separado das populações do Acre, nós sugerimos a hipótese de que a presença dos cromossomos sexuais X e Y seja um caráter plesiomórfico neste grupo. A análise do gene nuclear permitiu ainda identificar seis SNPs (Polimorfismos de simples nucleotídeos) e alguns espécimes heterozigotos para esses sítios. As variações cariotípicos e moleculares aqui apresentados, em conjunto com os dados previamente descritos, corroboram a hipótese de que Engystomops petersi seja um complexo de espécies e sugerem que eventos de hibridação e introgressão possam ter ocorrido entre as populações desse grupo. / Abstract: The frog Engystomops petersi is widely distributed in the Amazon basin. Genetic divergence and speciation mechanisms of E. petersi populations have been inferred mainly from mitochondria DNA (mtDNA) and microsatellite polymorphisms, male advertisement call and sexual selection. In spite of the significant progress resulting from these studies, many cytogenetic, taxonomic and evolutionary aspects of E. petersi populations remain unclear. In the present study, cytogenetic analysis and nucleotide divergence in mtDNA and in the rhodopsin nuclear gene of E. petersi populations are described in an attempt to contribute to the understanding of this anuran. High cytogenetic variation distinguished karyotypic patterns, which included two populations with no prezygotic isolation. The Puyo and Acre populations showed heteromorphic sexual chromosomes (XX/XY), which were not identified in the other Equatorial populations. Since all the Equatorial populations were placed in a clade separated from the Acre populations, we hypothesize that the sex chromosomes X and Y is a plesiomorphic condition in this group. The results from mtDNA found here were very similar to those found in previous studies. In the rhodopsine nucleotide sequences, 6 SNPs (Single Nucleotide Polymorphism) were identified and various specimens were heterozygous for these nucleotide sites. The karyotypic and molecular data presented herein, in conjunction with previously reported data, corroborate the hypothesis that Engystomops petersi is a complex of distinct species and suggested hybridization and introgression events between populations. Moreover, tha data indicated that karyotypic evolution patterns may have played a substantial role in the Engystomops speciation. / Mestrado / Biologia Celular / Mestre em Biologia Celular e Estrutural
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Revisão taxonômica e distribuição geográfica do complexo Amazophrynella minuta (Amphibia: Anura: Bufonidae) da região Amazônica

Zamora, Rommel Roberto Rojas 24 February 2014 (has links)
Submitted by Geyciane Santos (geyciane_thamires@hotmail.com) on 2015-08-24T13:47:26Z No. of bitstreams: 1 Dissertaçao - Rommel Roberto Rojas Zamora.pdf: 13957441 bytes, checksum: 0166fb38e9a1d74cba0a955065ad3480 (MD5) / Approved for entry into archive by Divisão de Documentação/BC Biblioteca Central (ddbc@ufam.edu.br) on 2015-08-28T15:03:34Z (GMT) No. of bitstreams: 1 Dissertaçao - Rommel Roberto Rojas Zamora.pdf: 13957441 bytes, checksum: 0166fb38e9a1d74cba0a955065ad3480 (MD5) / Approved for entry into archive by Divisão de Documentação/BC Biblioteca Central (ddbc@ufam.edu.br) on 2015-08-28T15:09:04Z (GMT) No. of bitstreams: 1 Dissertaçao - Rommel Roberto Rojas Zamora.pdf: 13957441 bytes, checksum: 0166fb38e9a1d74cba0a955065ad3480 (MD5) / Made available in DSpace on 2015-08-28T15:09:04Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Dissertaçao - Rommel Roberto Rojas Zamora.pdf: 13957441 bytes, checksum: 0166fb38e9a1d74cba0a955065ad3480 (MD5) Previous issue date: 2014-02-24 / CAPES - Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / Amazophrynella is a genus of the family Bufonidae. Actually the genus remains problematic taxonomically; the difficulty lays principally in the lack of diagnostic characters in the original description of A. minuta, the lack of molecular data and refined taxonomic comparison of individuals through its wide distribution. In this study a partial taxonomic revision of the genus Amazophrynella was performed; especially trying to reveal the evolutionary and biological diversity hidden in the A. minuta complex. The study was conducted integrating several sources of data: (1) phylogenetic, using the 16S rRNA; (2) morphometric, through the principal component analysis measures of organisms; (3) bioacoustics, by comparison of the advisement calls, and (4) morphological, by comparing meristic characters. Our results showed the existence of eight linages of Amazophrynella, four of which are known nominal species and the other four strains represent potential new species. The genetic distances showed a high divergence between all strains (higher than 4%). The comparison of the bioacustic data showed differences in frequency, note size, and number of pulses, while the principal component analysis indicated differences in size and shape between some phylogenetic lineages found. With the need to improve the taxonomy of the genus, A. minuta was redescribed based on topotypes collected at the type locality, generating new diagnostic characters and a more complete description of the species. Two phylogenetic linages of the genus found in this study were described morphologically; observing profound morphological differences between them. Based on our results, we suggest continuing studies of this genus. / Amazophrynella é um gênero da família Bufonidae que durante muito tempo não recebeu um tratamento taxonômico adequado; como por exemplo a espécie A. minuta; que provavelmente representa um complexo de espécies. No presente estudo foi realizada uma revisão da taxonômica e sistemática do gênero Amazophrynella; especialmente tentando revelar a diversidade biológica e evolutiva críptica no complexo A. minuta. O estudo foi realizado integrando dados filogenéticos, utilizando o gene 16S rRNA, morfométricos, através dos análises de componentes principais das medidas dos organismos, bioacústicos, pelo análises e comparação dos cantos de anúncio, e morfológicos, através da comparação de caracteres merísticos de todas as quatro espécies conhecidas do gênero. Nossos resultados filogenéticos mostraram a existência de oito linhagens de Amazophrynella; quatro dos quais são espécies nominais conhecidas e as outras quatro linhagens representam potenciais espécies novas. As distâncias genéticas mostraram uma alta divergência entre todas as linhagens (maior que 4%). A comparação dos cantos de anúncio mostraram diferenças nas frequências, tamanho da nota, e número de pulsos e as análises de componentes principais indicaram divergências na forma e tamanho entre algumas linhagens filogenéticas encontradas. Com a necessidade de melhorar a taxonomia do gênero, A. minuta foi redescrita com base em topótipos coletados na localidade tipo, gerando novos caracteres diagnósticos e uma descrição mais completa da espécie. Duas linhagens do gênero encontradas neste trabalho foram descritas morfologicamente; observando-se profundas diferenças morfológicas entre elas. Baseado em nossos resultados, sugerimos a continuidade dos estudos integrativos deste gênero.
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Analise de especies brasileiras de Terrarana (Amphibia : Anura) utilizando estudos cromossomicos e da ultra-estrutura do espermatozoide / Chromosomal and sperm ultrastructure studies of brazilian species of Terrarana (Amphibia : Anura)

Siqueira Junior, Sergio 12 August 2018 (has links)
Orientador: Shirlei Maria Recco-Pimentel / Tese (doutorado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Biologia / Made available in DSpace on 2018-08-12T09:25:47Z (GMT). No. of bitstreams: 1 SiqueiraJunior_Sergio_D.pdf: 45553042 bytes, checksum: e8a175ee3eabcc8492c6fdbca5adf69a (MD5) Previous issue date: 2008 / Resumo: Terrarana é atualmente o maior táxon da ordem Anura, possuindo cerca de 900 espécies. Recentemente, esse grupo de anuros foi alvo de uma série de modificações taxonômicas. Primeiramente essas espécies foram removidas da família Leptodactylidae e colocadas na sinonímia de Brachycephalidae, e mais tarde alocadas em um novo táxon chamado Terrarana. Atualmente as espécies deste grupo estão distribuídas nas famílias, Eleutherodactylidae, Craugastoridae, Strabomantidae e Brachycephalidae. Embora tenha sido bastante estudado, alguns dos relacionamentos inter- e intragenéricos permanecem não esclarecidos. Devido ao baixo número de espécies amostradas nos estudos filogenéticos, os clados da América do Sul, Strabomantidae e Brachycephalidae, são os grupos que têm as relações filogenéticas menos desvendadas. Neste trabalho foram realizados estudos citogenéticos e da ultra-estrutura dos espermatozóides de algumas espécies de Terrarana dos gêneros, Pristimantis, Ischnocnema, Barycholos, Haddadus e Brachycephalus. As metáfases foram obtidas por suspensão do epitélio intestinal e coradas com Giemsa ou submetidas a técnicas de impregnação por prata (Ag-NOR) e hibridação in situ (FISH) para a detecção das regiões organizadoras do nucléolo e bndamento-C, para a localização da heterocromatina. Os dados da ultra-estrutura dos espermatozóides foram analisados ao microscópio eletrônico de transmissão. As espécies estudadas foram Pristimantis fenestratus (Borba e Manaus, Reserva Florestal Adolfo Ducke, Amazonas e Rio Branco, Acre), P. dundeei (Chapada dos Guimarães, Rondonópolis e Aripuanã, Mato Grosso), P. crepitans (Chapada dos Guimarães e São Vicente, Cuiabá, Mato Grosso), Ischnocnema paulodutrai (Ilhéus, Bahia); I. juipoca (Atibaia e Campos do Jordão, São Paulo), I. guentheri e I. parva (Mogi das Cruzes, São Paulo), Brachycephalus ephippium (Mogi das Cruzes e Atibaia, São Paulo, Barycholos ternetzi (Uberlândia, Minas Gerais e Porto Nacional, Tocantins), e Haddadus binotatus (Mogi das Cruzes e Ilhabela, São Paulo). Os dados citogenéticos foram importantes na caracterização cromossômica das espécies P. fenestratus 2n=34 cromossomos, P. crepitans 2n=22, P. dundeei 2n=28 e I. paulodutrai 2n=30 e ainda B. ternetzi e I. juipoca 2n=22. Os dados citogenéticos revelaram diferenças no bandamento-C e Ag-NOR, sugerindo a existência de espécies ainda não descritas de Pristimantis nas localidades de Manaus, Rio Branco, e Aripuanã, e de Barycholos (Tocantins) identificadas incorretamente como P. fenestratus, P. dundeei e B. ternetzi. A análise citogenética indicou ainda que o baixo número cromossômico em P. crepitans é único dentro do gênero e sugere que esta a mesma não seja proximamente relacionada a espécies congenéricas. As similaridades cariotípicas entre I. paulodutrai e P. dundeei indicam que estas espécies podem ser proximamente relacionadas. Além disso, foi encontrado um caso incomum de variação intra-individual cromossômica no número fundamental de células somáticas de P. fenestratus, que pode estar relacionada com a segregação anômala de cromatides irmãs durante a mitose. A ultra-estrutura dos espermatozóides das espécies brasileiras de P. fenestratus, P. dundeei, P. crepitans, B. ternetzi, B. ephippiun, I. guentheri, I. parva, I. juipoca e H. binotatus revealaram diferenças na estrutura básica do acrossomo, peça intermediária e flagelo, apresentando características distintas dentro da família Brachycephalidae e subfamília trabomantinae, assim como dentro do gênero Pristimantis. Como característica marcante da ultra estrutura dos espermatozóides, observou-se a presença de um bastão paraxonemal em H. binotatus, B. ephippium, B. ternetzi e P. crepitans e a ausência desta estrutura em P. fenestratus, P. dundeei e todos os Ischnocnema amostrados. A divergência ultra-estrutural no bastão paraxonemal é coerente com dados recentes de filogenia molecular, que suportam transferência de H. binotatus do gênero Ischnocnema para um novo táxon e também agrupa as espécies I. guentheri, I. parva e I. juipoca em um mesmo clado. Além disso, a ultra-estructura dos espermatozóides indicou que B. ephippium não é proximamente relacionado as espécies de Ischnocnema, e que a taxonomia das espécie de Brachycephalidae deve ser reexaminada. As análises da ultra-estructura dos espermatozóides também corroboram os dados cromossômicos que indicam que P. crepitans estão erroneamente alocados no gênero Pristimantis e que as espécies I. paulodutrai e P. dundeei são proximamente relacionadas. Apesar do pequeno número de espécies amostradas, os dados citogenéticos e da ultra-estrutura dos espermatozóides de espécies das três famílias dos Terrarana do Brazil, apresentaram características inter- e intragenéricas não conservadas, levantamento de novos questionamentos e fortes evitências da existência de novas espécies. / Abstract: The Terrarana is the largest taxon of the Anura order, comprising 900 species. Recently this anuran group has undergone a series of taxonomical rearrangements. At first, these species were removed from the Leptodactylidae family and transferred to the synonymy of Brachycephalidae, and lately they were placed into a new taxon named Terrarana. Currently, the Terrarana species are distributed in the families, Eleutherodactylidae, Craugastoridae, Strabomantidae and Brachycephalidae. Despite being intensively studied, many aspects of their inter- and intrageneric relationships remain unclear. The South American Strabomantidae and Brachycephalidae are the least known clades regarding molecular phylogeny. In the present work, Brazilian Terrarana species of Pristimantis, Ischnocnema, Barycholos, Haddadus and Brachycephalus were studied by means of cytogenetical and sperm ultrastructural characteristics. Metaphases obtained from suspensions of intestinal epithelium were stained with Giemsa or submitted to silver staining (Ag- NOR) and fluorescence in situ hybridization (FISH) techniques, in order to detect the nucleolus organizing region, and to C-banding for heterochromatin localization. Sperm ultrastructure was analyzed by transmission electron microscopy. The studied species were P. fenestratus (Borba and Manaus at Reserva Florestal Adolfo Ducke, Amazonas, and Rio Branco, Acre), P. dundeei (Chapada dos Guimarães, Rondonópolis, and Aripuanã, Mato Grosso), P. crepitans (Chapada dos Guimarães and São Vicente, Cuiabá, Mato Grosso), Ischnocnema paulodutrai (Ilhéus, Bahia), I. juipoca (Atibaia and Campos do Jordão, São Paulo), I. guentheri and I. parva (Mogi das Cruzes, São Paulo), B. ephippium (Mogi das Cruzes and Atibaia, São Paulo), Barycholos ternetzi (Uberlândia, Minas Gerais, and Porto Nacional, Tocantins), and Haddadus binotatus (Mogi das Cruzes and Ilhabela, São Paulo). The cytogenetical analyses allowed chromosomal characterization of the species P. fenestratus 2n=34 chromosomes, P. crepitans 2n=22, P. dundeei 2n=28 and I. paulodutrai 2n=30, which have not been previously analyzed in phylogenetical studies, in addition to B. ternetzi and I. juipoca 2n=22. The data revealed differences in C-banding and Ag-NOR, which indicated the existence of not yet described Pristimantis species in the Manaus, Rio Branco, and Aripuanã localities, and of Barycholos (from Tocantins) uncorrectly identified as P. fenestratus, P. dundeei and B. ternetzi. The cytogenetical analysis also indicates that the low chromosome number in P. crepitans is unique within this genus and suggests that this species is not closely related to its congeneric species. The karyotypical similarities between I. paulodutrai and P. dundeei indicate that these species could be close relatives. Moreover, an unusual case of intra-individual chromosomal variation in the fundamental number of several somatic cells was found in the P. fenestratus species, which may be a consequence of anomalous segregation of sister chromatids during mitosis. The sperm ultrastructure of the Brazilian species P. fenestratus, P. dundeei, P. crepitans, B. ternetzi, B. ephippiun, I. guentheri, I. parva, I. juipoca and H. binotatus revealed differences in the basic structures of the acrosome, midpiece and flagellum, showing distinct characteristics within the family Brachycephalidae and subfamily Strabomantinae, as well as within the genus Pristimantis. The most remarkable sperm characteristic was an axonemal fiber in H. binotatus, B. ephippium, B. ternetzi and P. crepitans, which has not been observed in P. fenestratus, P. dundeei and in all of the analyzed Ischnocnema specimens. The ultrastructural divergence in the axonemal fiber is in accordance with recent molecular data, which supported the transfer of H. binotatus from the Ischnocnema genus to a new taxon and also grouped the species I. guentheri, I. parva and I. juipoca in a same clade. In addition, the sperm ultrastructure showed that B. ephippium is not closely related to the Ischnocnema species, and that the taxonomy of the Brachycephalidae species should be reexamined. Furthermore, the sperm ultrastructure analysis corroborated chromosomal data indicating that P. crepitans is misallocated in the Pristimantis genus and that the I. paulodutrai and P. dundeei species are close relatives. Despite the small number of studied species, the cytogenetical and ultrastructural data on sperm ultrastructure of the three Brazilian Terrarana families revealed inter- and intrageneric non-conservative characteristics that generate new taxonomic questions within this anuran group and provide strong evidence of the existence of undescribed species in this taxon. / Doutorado / Biologia Celular / Doutor em Biologia Celular e Estrutural
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Citogenética comparativa do gênero Engystomops = uma abordagem clássica e molecular = Comparative cytogenetics of the genus Engystomops: classical and molecular approaches / Comparative cytogenetics of the genus Engystomops : classical and molecular approaches

Targueta, Cíntia Pelegrineti, 1983- 03 May 2013 (has links)
Orientador: Luciana Bolsoni Lourenço Morandini / Tese (doutorado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Biologia / Made available in DSpace on 2018-08-23T15:06:51Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Targueta_CintiaPelegrineti_D.pdf: 14058240 bytes, checksum: 609267a5b0419113c3e1035f998113c6 (MD5) Previous issue date: 2013 / Resumo: Dentre as espécies do gênero Engystomops, somente as três espécies do clado Edentulus (E. freibergi, E. petersi e E. pustulosus) e duas das seis espécies do clado Duovox (E. pustulatus e E. puyango) tinham o número diploide descrito, e a localização cariotípica das NORs (regiões organizadores de nucléolo) e das regiões heterocromáticas era conhecida apenas para E. freibergi, E. petersi e E. puyango. Os dados disponíveis mostravam que as espécies do clado Duovox já cariotipadas apresentavam 2n=20, enquanto o número cromossômico diploide de todas as espécies do clado Edentulus era 2n=22, assim como o das espécies de Physalaemus e Edalorhina, gêneros mais proximamente relacionados a Engystomops. Dessa forma, uma redução do número diploide de 2n=22 para 2n=20 era considerada na história de Engystomops, mas não era possível inferir se essa era uma sinapomorfia de E. puyango e E. pustulatus ou de todo o clado Duovox. Em relação ao clado Edentulus, algumas dúvidas também persistiam. Recentes estudos propunham a presença de um complexo de espécies amazônicas sendo confundidas com E. petersi. Citogeneticamente puderam ser reconhecidos três grupos nesse complexo, que corresponderam a populações de Puyo (Equador), Yasuní (Equador) e La Selva (Equador), diferentes ainda daquele de E. freibergi (Brasil). Nem sempre é possível a identificação de homeologias cromossômicas entre esses grupos, o que dificulta o reconhecimento dos possíveis rearranjos cromossômicos envolvidos na divergência cariotípica no gênero em questão. Também permanecia pouco explorada a diferenciação entre os cromossomos sexuais heteromórficos reconhecidos em populações de E. petersi e em E. freibergi. Os objetivos do presente trabalho foram estudar citogeneticamente as espécies de Engystomops do clado Duovox, melhor caracterizar os cromossomos sexuais de E. freibergi por meio de pintura cromossômica e buscar novos marcadores citogenéticos para auxiliar na identificação de homeologias cromossômicas nesse gênero. A análise cariotípica mostrou que as espécies E. randi, E. guayaco, E. montubio, E. pustulatus e E. coloradorum apresentaram 2n=20, assim como as espécies E. puyango e E. pustulatus, previamente cariotipadas, corroborando a hipótese de essa característica provavelmente seja uma sinapomorfia do grupo Duovox. Em E. coloradorum, foi encontrada uma fêmea triploide, que consistiu no primeiro relato de poliploidia para Engystomops. Em todas e somente nas fêmeas dessa espécie foi encontrado um heteromorfismo referente à presença de NOR dentre os cromossomos 10 homólogos o que sugere que esses sejam cromossomos sexuais e que o sistema de determinação do sexo em E. coloradorum seja ZZ/ZW. Quanto à análise dos cromossomos sexuais de E. freibergi, foi possível isolar por microdissecção os cromossomos X e Y e produzir sondas a partir da amplificação de segmentos desses cromossomos. A utilização da técnica de pintura cromossômica com tais sondas permitiu inferir que as regiões proximais do cromossomo X e do cromossomo Y de E. freibergi apresentam similaridade molecular, o que sugere a possibilidade de se tratarem de regiões pseudo-autossômicas. As sondas dos cromossomos sexuais de E. freibergi não detectaram os cromossomos X e Y de E. petersi de Puyo nem os cromossomos do par 11 homomórfico de E. petersi de Yasuní, não evidenciando, portanto, grande similaridade entre eles. O isolamento, a caracterização e a localização cariotípica do DNAr 5S das espécies pertencentes ao grupo Duovox permitiram inferir a possível homeologia do par cromossômico 6 dessas espécies entre si e com o par 6 das espécies do grupo Edentulus. Ainda, o uso de sondas PcP190EcoRI, referentes a uma família de DNA repetitivo derivada de DNAr 5S, permitiu identificar os cromossomos 5 de E. randi, E. guayaco e E. coloradorum e diferenciá-los dos cromossomos 6 dessas espécies, portadores do sítio de DNAr 5S do tipo II. Além disso, essa mesma sonda identificou a região pericentromérica do braço curto do cromossomo 3 (e do cromossomo 5 de E. petersi de Yasuní) de todas as espécies do gênero, com excessão de E. coloradorum, sugerindo outra possível homeologia entre esses cromossomos. Dessa forma, com o emprego de técnicas citogenéticas clássicas e moleculares foi possível fornecer importante contribuição para o estudo da evolução do gênero Engystomops / Abstract: Of the species in the genus Engystomops, only three species of the Edentulus clade (E. freibergi, E. petersi and E. pustulosus) and two species of the Duovox clade (E. pustulatus and E. puyango) have had their diploid number described, while the NOR (nucleolus organizer region) and the heterochromatic sites were known only for E. freibergi, E. petersi and E. puyango karyotypes. The species of Duovox clade had 2n=20, while the diploid chromosome number of all species of Edentulus clade was 2n=22, which is the same diploid number of species of Physalaemus and Edalohina, genera closely related to Engystomops. Thus, the diploid number reduction from 2n=22 to 2n=20 was supposed, but it was not possible to infer if this was a synapomorphy of E. puyango and E. pustulatus or a synapomorphy of the entire Duovox clade. With regards to the Edentulus clade, some doubts also persisted. Recent studies proposed a complex of Amazonian species misidentified as E. petersi and it was possible to cytogenetically recognize three groups in this complex that corresponded to populations from Puyo (Ecuador), Yasuní (Ecuador) and La Selva (Ecuador). All of these karyotypes also differed from the E. freibergi (Brazil) karyotype. Chromosome homologies are not easily recognized between these groups, a fact that makes difficult the identification of chromosome rearrangements involved in karyotypic divergence in this genus. Additionally, the differentiation of the heteromorphic sex chromosomes found in the E. petersi and E. freibergi karyotypes remained unexplored. The goals of the present work are (1) to cytogenetically study the species of Duovox clade, (2) to better characterize the sex chromosomes of E. freibergi by means of chromosome painting and (3) to find new cytogenetic markers to identify potential chromosome homologies in this genus. The karyotypic analysis showed that the species E. randi, E. guayaco, E. montubio, E. pustulatus and E. coloradorum had 2n=20, as previously described in E. pustulatus and E. puyango. This corroborates the hypothesis that the diploid number 2n=20 is likely a synapomorphy of the Duovox clade. Among the specimens of E. coloradorum, a triploid female was found, which is the first report of polyploidy for the genus Engystomops. In all the females of this species, there was a NOR heteromorphism in the homologous chromosomes 10, suggesting that these may be ZZ/ZW sex chromosomes. Regarding the sex chromosomes of E. freibergi, it was possible to isolate the X and Y chromosomes by microdissection and to produce probes by amplifying segments of the microdissected chromosomes. The hybridization of these probes in E. freibergi metaphases showed that the proximal regions of the X and Y chromosomes of this species had molecular similarity, thus suggesting that they may be pseudoautosomal regions. The sex chromosome probes from E. freibergi detected neither the X nor the Y chromosome of E. petersi from Puyo nor the chromosomes of homomorphic pair 11 of E. petersi from Yasuní. This implies no significant similarity between them and the E. freibergi sex chromosomes. The isolation, characterization and karyotypic localization of the rDNA 5S from the species of the Duovox clade made it possible to infer the homeology of chromosome pair 6 of those species, as well as their homeology with chromosome pair 6 of the species of the Edentulus clade. Further, the probes PcP190EcoRI, which are related to a family of satellite DNA derived from rDNA 5S, made it possible to identify chromosome 5 of E. randi, E. guayaco and E. coloradorum and to differentiate them from chromosome 6, which carry type II rDNA 5S. In conclusion, both classical and molecular cytogenetic techniques provided important contributions for the study of the evolution of the genus Engystomops / Doutorado / Biologia Celular / Doutora em Biologia Celular e Estrutural
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Organização espacial e temporal na reprodução e vida larvaria em uma comunidade de hilideos no sudeste do Brasil (amphibia, anura)

Cardoso, Adão Jose, 1951-1997 14 July 2018 (has links)
Orientador : Ivan Sazima / Dissertação (mestrado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Biologia / Made available in DSpace on 2018-07-14T06:52:35Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Cardoso_AdaoJose_M.pdf: 8304717 bytes, checksum: 057fdbd9d08a0c53544687f49722241b (MD5) Previous issue date: 1981 / Resumo: Foi estudada uma comunidade de hilídeos constituída pelas seguintes espécies: hyla albopunctata Spix, 1824; Hyga fuscamarginata A . Lutz, 1925; Hyla fuscovaria A . Lutz, 1925; Hyla sanborni Schmidt, 1944 e Hyla velata Cope, 1887. Esta comunidade ocorre em área de formação aberta e alterada por atividade humana, no município de Campinas, Estado de São Paulo (22º53'S ; 47º05'W), onde havia ambientes com água permanente e ambientes que mantinham água somente na época chuvosa.O objetivo deste trabalho foi estudar a biologia das espécies que constituem uma comunidade de hilídeos, com ênfase aos aspectos que permitem a ocorrência destas espécies em simpatria e a sua manutenção como unidades distintas. Na organização funcional da comunidade, foram constatados aspectos de ordem espacial e de ordem temporal. Com relação à organização espacial, foram constatadas características comportamentais e físicas que permitem a utilização de diferentes recursos do ambiente e, conseqüentemente, a co-existência das espécies em simpatria.Na fase adulta, as principais diferenças se referem à ocupação de sítios de corte diversos, à emissão de vocalização com diferentes características físicas e à seleção de locais diversos para oviposição. Na fase larvária, foram constatadas diferenças na ocupação de micro-ambientes diversos para cada espécie e no tipo de alimentação encontrada no conteúdo intestinal. ...Observação: O resumo, na íntegra, poderá ser visualizado no texto completo da tese digital / Abstract: The present work was carried out with the purpose of studying the biology of the species in a single community of Hylidae. It concentrates on those aspects wihich favor the occurrence of these species in sympatry as well as their maintenance as discret units.The community studied was composed of Hyla albopunctata Spix, 1824; Hyla fuscomarginata A. Lutz, 1925; Hyla fuscovaria A. Lutz, 1925; Hyla sonborni Schmidt, 1944 and Hyla velata Cope, 1887. This community occurs in an open area, altered by human activity, in the municipality of Campinas, State of São Paulo (22º53'S; 47º05'W), where there were permanent and temporary environments. Temporal and spatial patterns of functional organization were detected in the community. In relation to the spatial organization, there were ethological and physical characteristics which promote the use of different environmental resources and, cosequently, favor the co-existence of the species in sympatry. In adults, the main differences referred to vocalizations with different physical attributes, use of distinct calling sites, and the preference for different oviposition sites. During larval development, there were differences in the micro-habitat occupied by each species as well as in the larval food, as verified in the gut contents. During the congregation for reproduction, social interactions were observed, ...Note: The complete abstract is available with the full electronic digital thesis or dissertations / Mestrado / Mestre em Ciências Biológicas
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Influência da predação e de aspectos geoclimáticos sobre a coloração das espécies de Brachycephalidae na Mata Atlântica / Influence of predation and geoclimatic aspects on the coloration of the species of Brachycephalidae in the Atlantic Forest

Rocha Lima, Ana Beatriz Carollo, 1981- 24 August 2018 (has links)
Orientador: Luís Felipe de Toledo Ramos Pereira / Dissertação (mestrado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Biologia / Made available in DSpace on 2018-08-24T04:49:15Z (GMT). No. of bitstreams: 1 RochaLima_AnaBeatrizCarollo_M.pdf: 4483469 bytes, checksum: 075bff58acd826eaa3ec36949ad8f85c (MD5) Previous issue date: 2013 / Resumo: A família Brachycephalidae compreende dois gêneros e 52 espécies. O gênero Brachycephalus apresenta, em sua maioria, espécies tóxicas e de coloração conspícua, enquanto o gênero Ischnocnema possui muitas espécies polimórficas e crípticas quanto a sua coloração dorsal. No primeiro capítulo foi realizado um experimento com modelos de plasticina para testar se os padrões coloridos e brilhantes do gênero Brachycephalus estão relacionados com aposematismo. Além disso, foi testada a hipótese alóctone/autóctone, que prediz que os predadores vão responder mais fortemente a um padrão autóctone do que a um alóctone, dado que eles supostamente são ingênuos ao padrão introduzido e/ou experientes quanto ao padrão autóctone. O experimento foi realizado em duas localidades de Mata Atlântica no estado de São Paulo, Brasil, onde ocorrem tanto espécies camufladas quanto conspícuas de Brachycephalidae. Foram encontradas diferenças na intensidade de ataque entre os modelos crípticos e vistosos, suportando a hipótese de que a coloração conspícua de Brachycephalus é sinal de sua toxicidade. No segundo capítulo foi investigado como fatores ambientais e espaciais afetam os padrões de coloração de espécies do complexo de Ischnocnema guentheri-henselii e I. parva, comparando populações em diferentes latitudes depositadas no acervo de quatro coleções científicas. Os diferentes padrões foram plotados em mapas e, através de análises de agrupamento, foram detectadas diferenças na proporção da frequência dos padrões nas populações situadas no limite meridional da ocorrência das espécies. A segregação de populações abaixo da latitude -24º é coincidente com variações morfológicas observadas em outras espécies, ou mesmo com limites de distribuição de espécies irmãs de anuros. Assim, é evidente que esta região caracteriza-se por forte promotora de diversificação e o clima pode ser uma das explicações para nossos resultados. Desta forma os resultados desta dissertação sugerem que a predação pode estar exercendo pressão no gênero Brachycephalus e que fatores climáticos e geológicos podem estar influenciando a coloração no gênero Ischnocnema / Abstract: Brachycephalidae family comprises two genera and 52 species. Brachycephalus genus presents mostly toxic species with conspicuous coloration, while Ischnocnema genus has many polymorphic and cryptic species as their dorsal coloration. In the first chapter we conducted an experimental essay, with plasticine frog simulacra to test if the bright colorful patterns of Brachycephalus species are related to aposematism. Furthermore, we tested the allochthonous/autochthonous hypothesis, which predicts that predators will respond strongly to an autochthonous pattern than to an allochthonous one, as they supposedly are naïve to this introduced pattern and/or experienced to the autochthonous pattern. The experiment was made in two Atlantic forest sites in the state of São Paulo, Brazil, where both cryptic and conspicuous Brachycephalidae species occur. We found differences in predation attack between cryptic and conspicuous simulacra, supporting that the conspicuous coloration of Brachycephalus is a sign of their toxicity. In the second chapter we investigated how environmental and spatial factors affect color patterns of species complex Ischnocnema guentheri-henselii and I. parva comparing populations at different latitudes deposited in four scientific collections. Different patterns were plotted on maps and, through cluster analysis, differences were detected in the ratio of the frequency of patterns in populations located in the southern limit of species occurrences. The segregation of populations below -24 º latitude coincides with morphological variations observed in other species, or even distribution limits sister species of frogs. Thus, it is clear that this region is characterized by a strong promoter of diversification and the weather can be one of the explanations for our study. Thus, the results of this dissertation suggest that predation may be exerting pressure on the Brachycephalus genus and geological and climatic factors may be influencing the coloration in the Ischnocnema genus / Mestrado / Biodiversidade Animal / Mestra em Biologia Animal
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Utilização de recursos e potencial reprodutivo dos leptodactilideos (Amphibia-Anura) de uma floresta semidecidua de altitude no sudeste do Brasil

Giaretta, Ariovaldo Antonio 19 July 2018 (has links)
Orientador : Adão Jose Cardoso / Dissertação (mestrado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Biologia / Made available in DSpace on 2018-07-19T01:29:42Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Giaretta_AriovaldoAntonio_M.pdf: 7645363 bytes, checksum: 4a48b25524c3f6d3a402af1676b17353 (MD5) Previous issue date: 1994 / Resumo: Desenvolvi a parte de campo deste estudo no Parque Florestal do Itapetinga (46º25'W; 23º10'S, 900-1100 metros acima do nível do mar, aprox. 1600 mm de chuvas por ano), Município de Atibaia, Estado de São Paulo, Brasil. Esta localidade, incrustada nos contrafortes da Serra da Mantiqueira, abriga cerca de 1800 ha de Floresta Semidecídua de Altitude relativamente bem conservada. O clima local é caracterizado por duas estações bem definidas, uma quente e úmida, de setembro a março e outra fria e seca, de abril a agosto. Os principais corpos d'água naturais são pequenos riachos de serra e poças formadas em braço morto de rio. Efetuei viagens semanais regulares durante um ano, de 25/6/1992 a 29/6/1993, e considerei também dados coletados em 10 viagens preliminares e mais 17 complementares ao referido período. Trabalhei no campo principalmente à tarde e à noite e, em algumas viagens, cheguei ao local antes do nascer do sol. Estudei as espécies de anuros pertencentes à família Leptodactylidae quanto às seguintes dimensões de recursos reprodutivos: Macrohabitat, microhabitat, turno diário e sazonalidade. Crossodactylus sp. E Hylodes sp. foram também estudados quanto a fidelidade ao sítio de canto e capacidade de domiciliação. Utilizando Análise Multivariada comparei as espécies quanto às seguintes características eco1ógico-reprodutivas: dimensões de recurso produtivo; comportamento; potencial reprodutivo (fecundidade) . Treze espécies de Leptodactilideos foram identificadas e estudadas, as quais são: Crossodactylus sp. , Eleutherodactylus guentheri, Eleutherodactylus gr. guentheri, E. juipoca, E. parvus, E. randorum, Hylodes sp., Leptodactylus cf. ocellatus, Megaelosia sp., Odontophrynus americanus, Physalaemus cuvieri, P. olfersii e Procexatophrys boiei. As três espécies de Hylodinae ainda não têm nome científico disponível. Considerei a espécie de Megaelosia do Parque em perigo de extinção devido às suas especializações biológicas, seu provável endemismo e às ameaças de degradação ambiental na área. A sazonalidade climática local teve grande influência na temporada de reprodução das espécies, com uma maior concentração de atividade na época quente e chuvosa (out-jan.). Reconheci 4 modos reprodutivos entre as treze espécies de leptodactilídeos do Parque. A Análise de agrupamento sugeriu pares de espécies (como Crossodactylus sp. X Hylodes sp.), semelhantes na forma de utilização de recursos e características reprodutivas. A Análise de Ordenação sugeriu a existência de 3 guildas, as quais são: 1) Espécies de Riacho de Interior de Mata (composta pelos Hylodinae), 2) Espécies de Corpos D'água Temporários (Leptodactilinae e Odontophrynini) e 3) Espécies com Desenvolvimento Larvário Direto (Eleutherodactylus spp). Alguns atributos gerais das guildas acima são: 1 - Hábitos diurnos, elementos comportamentais de defesa territorial, fidelidade ao sítio de canto, fecundidade média/baixa e ovos relativamente grandes; 2 - Relação com área aberta ou borda de mata, fecundidade média/alta, ovos pigmentados (exceto Physalaemus spp.), agregação entre machos formando coros, ausência de canto agressivo em resposta ao "playback" do canto de anúncio; 3 - Sítio de vocalização distante de corpos d'água, poleiros como sítio de vocalização (exceto E. parvus), fecundidade baixa, ovos grandes despigmentados e postos em terra. Indivíduos de duas espécies de Hylodinae (Crossodactylus sp. e Hylodes sp.) mostraram, em testes de campo, fidelidade ao seu sítio de canto e capacidade de domiciliação. Além do levantamento de informações biológicas básicas este trabalho permitiu o reconhecimento de guildas reprodutivas, dentro das quais fenômenos de interação interespecíficas (eg. hibridação) teriam maiores chances de poderiam ocorrer / Abstract: The field work of this study was done at the "Parque Florestal do Itapetinga (PFI)" (46º25'W; 23º10'S; between 900-1100m above the sea level; about 1600mm of annual rainfall), Municipality of Atibaia, São Paulo State, Southeastern Brazil. The PFI is lied in Serra da Mantiqueira and has about 1800 ha. of "Altitudinal Semideciduous Forest", relatively well apreserved. This environment is characterized by two defined seasons, one warm and wet (September-March) and another cold and dry (April-August). Natural water bodies are oxbow ponds and small clear water streams. I visited the area weekly from 25/6/1992 to 29/6/1993, and also worked on data collected during 10 preliminary and 17 complementary journeys. The species of Leptodactylidae were studied in regard too four resource dimensions: Macrohabitat; Microhabitat; Daily turn and Seasonality. Crossodactylus sp. And Hylodes sp. were also investigate in their abilities on homing behavior and site fidelity. I used Multivariate Analysis to compare the species in relation to their ecological and reproductive characters, such as reproductive resource dimension, behaviour, reproductive potential (fecundity). Thirteen species of Leptodactylids were identified and studied, namelly: Crossodactylus sp. , Eleutherodactylus guentheri, Eleutherodactylus gr. guentheri, E. juipoca, E. parvus, E. randorum, Hylodes sp., Leptodactylus cf. ocellatus, Megaelosia sp. , Odontophrynus americanus, Physalaemus cuvieri, P. olfersii and Proceratophrys boiei. The three species of Hylodinae have not been described yet. I considered the species of Megaelosia endangered due to its biological specializations, probablebly endemism and local forest degradation. The seasonality had high influence in breeding patterns, with the majority of species in reproductive activity from September to March (during the warm and wet station). Four reproductive modes were found among the 13 leptodactilid species from PFI. The cluster analysis suggested "Pairs of Species", such as Crossodactylus sp. And Hylodes sp., similar in resource utilization and reproductive characters. The Principal Coordenate Analysis suggested the existence of three reproductive guilds: 1) Stream Species (Hylodinae); 2) Temporary pond species (Leptodactylinae and Odontophrynini) and 3 ) Species With Direct Development (Eleutherodactylus spp. ) . Some general features of guilds mentioned are: 1) Diurnal habits, territoriality, site fidelity, homing behavior, medium/low fecundity, large and unpigminted eggs; 2). Lack of vocal aggressive response to playback, medium/high fecundity, pigmented eggs (except Physalaemus spp.), aggregation between males to vocalization, related to open areas and forest edges; 3) Vocalization site distant from water, call perched on leaves or branches on low vegetation (20-130cm) (except E. parvus), low fecundity, large and pigment-less eggs, deposited on the soil. Individuals of two species of Hylodinae (Crossodactylus sp. and Hylodes sp.) showed site fidelity and homing behavior in field tests. This work provide basic data about the leptodactylid frogs of the PFI as well as allowed me recognize three reproductive guilds among which interespecific interactions (e.g. hybridization) are more likely to occur / Mestrado / Ciencias Biologicas
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A ultraestrutura dos espermatozoides de algumas espécies da família Leptodactylidae (Amphibia: Anura) / The ultrastructure of spermatozoa in some species of the Leptodactylidae family (Amphibia: Anura)

Santos, Julio Sergio dos, 1979- 29 January 2015 (has links)
Orientadores: Shirlei Maria Recco Pimentel , Gisele Orlandi Introíni / Tese (doutorado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Biologia / Made available in DSpace on 2018-08-27T14:18:00Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Santos_JulioSergiodos_D.pdf: 6299599 bytes, checksum: 7b5ca57cc296e80450e00cfd661976ad (MD5) Previous issue date: 2015 / Resumo: Os anuros da família Leptodactylidae estão alocados em três subfamílias: Leiuperinae, Leptodactylinae e Paratelmatobiinae. Com o auxílio da microscopia eletrônica, foram observados os espermatozoides de 23 espécies de leptodactilídeos buscando-se contribuir com elementos para o entendimento de incertezas filogenéticas. Em Pseudopaludicola, gênero alocado em Leiuperinae, é comparado o espermatozoide de representantes do grupo P. pusilla e de espécies dos quatro clados recuperados na filogenia molecular, os quais correspondem aos grupos cromossômicos 2n=22, 20, 18 e 16. A análise das espécies de Pseudopaludicola mostrou que as cabeças dos espermatozoides são semelhantes e contém a vesícula acrossomal cobrindo o cone subacrossomal. Já as caudas dos espermatozoides de Pseudopaludicola apresentam diferenças marcantes. Nas espécies com número cromossômico 2n=22, Pseudopaludicola sp. 1 (grupo P. pusilla), P. saltica, P. falcipes e P. mineira, as caudas exibem fibras acessórias (justa-axonemal, membrana ondulante e a fibra axial). Essas fibras também são observadas em P. ternetzi e P. ameghini, ambas do clado com 2n=20, mas nas suas caudas a fibra axial é mais desenvolvida. Nos indivíduos do clado com número cromossômico 2n=18, P. canga, P. facureae, P. giarettai, P. atragula e Pseudopaludicola sp. 2 e com 2n=16, P. mystacalis, a cauda apresenta a membrana ondulante espessa, caracterizando um bastão para-axonemal, o qual é mais curto do que a membrana ondulante da cauda dos Pseudopaludicola com número cromossômico 2n=22 e 20. As diferenças morfológicas ultraestruturais observadas nas caudas dos espermatozoides indicam que esses caracteres podem ser filogeneticamente informativos, quando mapeados na filogenia molecular, pois os perfis ultraestruturais da cauda coincidem parcialmente com a formação dos quatro clados filogenéticos e possibilitam levantar a hipótese de uma progressiva simplificação do espermatozoide durante a evolução do gênero Pseudopaludicola. A análise comparativa de espécies entre os gêneros de leiuperíneos mostra que as caudas dos espermatozoides de Physalaemus (P. albifrons, P. centralis, P. cicada e P. cuvieri), também exibem fibras acessórias, como a fibra justa-axonemal e a membrana ondulante, contudo, a membrana ondulante nesse gênero é mais longa que aquela encontrada em Pseudopaludicola. Além disso, as caudas dos espermatozoides de Physalaemus não mostram fibra axial. Do gênero Engystomops, grupo irmão de Physalaemus, foram analisadas E. petersi, E. freibergi e E. puyango, cujas caudas apresentam fibra justa-axonemal, membrana ondulante e fibra axial. Esses gêneros diferem ainda pela membrana ondulante mais curta em Engystomops, corroborando a revalidação do gênero Engystomops. A cauda de Engystomops puyango difere de E. petersi e E. freibergi, clado Duovox, e é igual a E. pustulosus, do clado Edentulus, indicando a necessidade de ampliar os estudos desse gênero. A espécie Pleurodema diplolister, do gênero próximo a Physalaemus e Engystomops, apresenta na cauda do espermatozoide a fibra justa-axonemal e a membrana ondulante, as quais são semelhantes àquelas observadas nas espécies de Physalaemus, entretanto, a membrana ondulante de P. diplolister é menor que a observada em Physalaemus. A comparação dos espermatozoides de representantes das outras subfamílias de Leptodactylidae mostrou que Paratelmatobiinae, representada por P. poecilogaster, apresenta estruturas iguais àquelas observadas nos Pseudopaludicola do clado com número cromossômico 2n=22. Por outro lado, a espécie analisada, Leptodactylus natalensis, Leptodactylinae, apresenta fibra axial bem desenvolvida, diferente daquela exibida nos espermatozoides de Engystomops, Pseudopaludicola e P. poecilogaster. A outra espécie de Leptoctylinae, Adenomera marmorata, a qual era alocada em Leptodactylus, apresenta apenas o axonema na cauda do espermatozoide. Essa diferença ultraestrutural das caudas de A. marmorata e L. natalensis, corrobora com a re-alocação de A. marmorata como espécie válida e diferente de Leptodactylus. A descrição ultraestrutural dos gametas masculinos leptodactilídeos mostra caracteres filogenéticos informativos, principalmente aqueles das caudas dessas células, que podem ser usados para o entendimento dos relacionamentos intragenérico e intergenérico. / Abstract: The anurans of the family Leptodactylidae are distributed in three subfamilies ¿Leiuperinae, Leptodactylinae and Paratelmatobiinae. The spermatozoa of 23 leptodactylid species were analyzed under an electron microscope in order to provide evidence for the better understanding of a number of phylogenetic uncertainties. In the case of the leiuperine genus Pseudopaludicola, the sperm of the representative of the P. pusilla group and those of four clades identified in the molecular phylogeny, which correspond to well-defined chromosomal groups with 2n=22, 20, 18, and 16, were compared. The analysis of the different Pseudopaludicola species found spermatozoa with heads of similar shape, which contain an acrosomal vesicle covering the subacrosomal cone. However, the tails present marked differences. In the species with 2n=22, that is, Pseudopaludicola sp. 1 (P. pusilla group), P. saltica, P. falcipes and P. mineira the tails present accessory fibers (juxtaxonemal fiber, undulating membrane and axial fiber). Fibers of this type are also observed in P. ternetzi and P. ameghini (representatives of the 2n=20 clade), although the axial fiber is more developed. In the specimens of the 2n = 18 clade (P. canga, P. facureae, P. giarettai, P. atragula and Pseudopaludicola sp. 2) and the 2n=16 clade (P. mystacalis), the tail has a thick undulating membrane, characterized by a paraxonemal rod, which is shorter than the undulating membrane of the tail of Pseudopaludicola (2n=22 and 20). The ultrastructural morphological differences observed in the tails of the spermatozoa indicates that these traits are phylogenetically informative, given their partial correspondence to the four clades identified in the molecular studies, and provide evidence of a progressive simplification of the spermatozoa during the evolution of the genus Pseudopaludicola. The comparative analysis of the leiuperine genera indicates that in Physalaemus (P. albifrons, P. centralis, P. cicada and P. cuvieri), the tail of the spermatozoon also shows accessory fibers, such as the juxtaxonemal and the undulating membrane, although in this genus, the membrane is longer than that observed in Pseudopaludicola. In addition, there is no axial fiber on the tail of the spermatozoon in Physalaemus. In the case of Engystomops, sister group of Physalaemus, the species E. petersi, E. freibergi, and E. puyango the sperm tail presents all three types of fiber (juxtaxonemal, undulating membrane and axial fiber). The tail of these two genera also differ each other for the shorter undulating membrane in Engystomops, corroborating the revalidation of the genus Engystomops. Additionaly, the tail of E.puyango differs from E. petersi and E. freibergi, Duovox clade, and it is similar to E. pustulosus, Edentulus clade, indicating the need of more studies in this genus. In Pleurodema diplolister, representing the genus closest to Physalaemus and Engystomops, the sperm tail has a juxtaxonemal fiber and undulating membrane, which are similar to those found in Physalaemus, although the membrane observed in Pleurodema diplolister is shorter than that observed in Physalaemus. Comparisons with other leptodactylid subfamilies indicated that the Paratelmatobiinae, represented by P. poecilogaster, has the same structures as those observed in the 2n = 22 clade of Pseudopaludicola. On the other hand, the leptodactyline species analyzed, Leptodactylus natalensis, has a well-developed axial fiber, distinct from that found in the sperm of Engystomops, Pseudopaludicola and P. poecilogaster. However, in the other leptodactyline species analyzed, Adenomera marmorata, previously allocated to Leptodactylus, the sperm tail has only an axoneme. This ultrastructural difference in the tails of A. marmorata and L. natalensis supports the status of A. marmorata as a valid taxon distinct from Leptodactylus. Overall, then, the ultrastructural description of the male gametes of a selection of leptodactylid species provided informative phylogenetic characters, especially with regard to the morphology of the sperm tails, which can be used for understanding of the intrageneric and intergeneric relationships / Doutorado / Biologia Celular / Doutor em Biologia Celular e Estrutural
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Relação entre tamanho corporal e estrutura de comunidade em anfíbios anuros do município de Botucatu/SP /

Teixeira, Maria Gorete. January 2013 (has links)
Orientador: Virgínia Sanches Uieda / Coorientador: Fernando Ribeiro Gomes / Banca: Geise Valentina Melo / Banca: Reginaldo Donatelli / Banca: Renata Cristina Batista Fonseca / Banca: Silvio César de Almeida / Resumo: A coexistência de espécies em uma determinada comunidade é possibilitada, entre diversos fatores, pela partilha dos recursos disponíveis. As pressões seletivas que determinam o padrão de ocupação pelas espécies podem estar diretamente relacionadas à morfologia das mesmas. No presente trabalho foi investigada a relação do tamanho corporal e da morfologia na distribuição espacial e temporal de 42 espécies de anfíbios anuros. A hipótese do estudo é que o tamanho influencia na ocupação do habitat e no hábito das espécies. Características morfológicas foram analisadas em relação à distribuição temporal e a índices ecológicos (distribuição espacial) utilizando abordagens convencionais e filogenéticas. Os resultados indicam que espécies menores são mais abundantes do que espécies de grande porte e que não houve variação expressiva dos valores de massa total (biomassa) dentro das classes de tamanho ao longo do período de estudo. Houve restrição na distribuição das espécies em relação ao tamanho. A análise de componentes principais evidenciou relações morfológicas de comprimento e largura que remetem às formas corporais típicas de anuros de determinados hábitos e hábitats. A análise de Morisita-Horn indicou alta sobreposição quanto à ocupação temporal do ambiente entre as classes de tamanho. Análises descritivas indicaram diferenças na ocupação de hábitat e no hábito entre anuros de tamanhos diferentes. O teste de Kruskal-Wallis não indicou relação entre o comprimento rostro-cloacal e o hábito dos anuros. No entanto, os resultados indicaram que espécies com diferentes massas apresentam hábitos e abundâncias distintas. Foi detectado sinal filogenético para três dos quatro componentes principais testados, como também para quatro dos sete índices ecológicos testados. Os resultados indicam que os índices ecológicos estão relacionados com a morfologia dos anuros, sugerindo que ... / Abstract: The species coexistence in a given community is possible in function of species resources partitioning, among many other factors. The selective pressures which determine the pattern of occupation by species may be directly related to their morphology. In the present study, we investigated the relationship of body size and morphology of 42 species of anurans with their spatial and temporal distribution. The study hypothesis is that body size influences their habitat and behavior. Morphological characters were analyzed regarding to temporal distribution and to ecological indexes (spatial distribution) using conventional and phylogenetic approaches. The results indicate that smaller species are more abundant than large ones, and that there was no significant variation in of total mass (biomass) when analyzed per size classes. There were constraints in species distribution regarding to size. The principal components analyses revealed morphological relations of length and width that refer to typical anurans body shapes of certain habits and habitats. The analysis of Morisita-Horn showed high temporal overlap on the environment occupation between size classes. Descriptive analyses indicated differences in habitat occupation and habit among frogs of different sizes. The Kruskal-Wallis test indicated no relationship between snout-vent length and the habit of anurans. However, the results indicated that species with different body masses have different habits and abundances. Phylogenetic signal was detected in three of four principal components tested, as well as in four of seven ecological indexes tested. The results indicate that environmental indexes are related to anurans morphology, suggesting that environment type and how it is occupied are good predictors to infer body shape. The results indicated that size, duration and regime of water bodies do not influence size and morphology of adult anurans. These ecological factors may be more ... / Doutor
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Diversidade e evolução do gênero Adenomera Steindachner, 1867 (Anura, Leptodactylidae) /

Cassini, Carla Santana. January 2015 (has links)
Orientador: Célio Fernando Baptista Haddad / Banca: Maria Laura Ponssa / Banca: Hélio Ricardo da Silva / Banca: Boris Leonardo Blotto Acuna / Banca: Paulo Christiano de Anchietta Garcia / Resumo: O gênero Adenomera é composto por 16 espécies, das quais seis possuem distribuição restrita à Mata Atlântica. O grupo apresenta uma taxonomia complicada por apresentar espécies crípticas, com alto grau de polimorfismo intraespecífico e interespecífico. Recentemente, uma análise filogenética extensa, abrangendo grande parte da distribuição das espécies do gênero, 35 espécies candidatas foram propostas; 16 na Mata Atlântica. No presente trabalho, propomos testar se as espécies candidatas distribuídas na Mata Atlântica compõem um grupo monofilético. Usando uma abordagem interativa com dados diretos de morfologia externa e bioacústica, pudemos delimitar espécies dentro dos clados Thomei e Marmorata. A maior amostragem dados fenotípicos e de um fragmento do gene 16S de indivíduos da Mata Atlântica na análise, permitiu inferir com maior confiança que as espécies distribuídas na Mata Atlântica compõem um grupo monofilético (clados Thomei + Marmorata), irmão do clado Hylaedactyla + Martinezi. O material adicional nos permitiu delimitar e redescrever duas espécies previamente consideradas como um complexo de espécies (Adenomera marmorata e A. bokermanni). Das 16 espécies candidatas do clado Mata Atlântica previamente sugeridas, pudemos delimitar apenas 10 espécies sendo sete já conhecidas e três novas para a Ciência. / Abstract: The genus Adenomera has 16 species, six of which are Atlantic Forest dwellers. The genus has a difficult taxonomy, mostly due to the high levels of intra and interspecific polymorphism. Recently, a phylogenetic analysis using samples collected through the whole geographic distribution of the genus (roughly tropical and temperate cis-Andean South America) suggested the existence of 35 candidate species; 16 of which being Atlantic Forest dwellers.The present contribution intends to test whatever the Atlantic Forest dwellers are a monophyletic unit. An integrative approach with directly observed data on morphology and bioacoustics allowed species delimitation within the Thomei and Marmorata Clades. Based on a denser sampling of phenotipic and 16S rRNA fragments, we recovered the Atlantic Forest dwellers are a monophyletic unit, with two major clades (Thomei + Marmorata) and sister to the Hylaedactyla + Martinezi clade. The additional material allowed the delimitation and redescritpion of two species previously understood as species complexes (Adenomera marmorata and A. bokermanni). Of the 16 Atlantic Forest dwellers candidate species, we could delimit only 10; seven of those assignable to previously described species / Doutor

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