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La christologie transcendantale de Karl Rahner : pour un dialogue avec les religions non chrétiennes

Doucet, Jean-Philippe January 2004 (has links)
Mémoire numérisé par la Direction des bibliothèques de l'Université de Montréal.
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De la pertinence du comprehensive income : approche par la value relevance / Value relevance of comprehensive income

Mesri, Leila 15 June 2018 (has links)
Au regard des exigences de transparence et de comparabilité des états financiers, l’évaluation traditionnelle du résultat ne satisfait plus ; elle se voit amendée d’autres composantes estimées essentiellement en valeur de marché pour obtenir le comprehensive income (CI). Le CI, « état de la performance globale » de l’IAS 1 révisée (IAS 1R), fait apparaitre distinctement le résultat net et les other comprehensive income afin de mieux répondre aux besoins d'information financière et aider les groupes d’utilisateurs dans leur prise de décision. Dans ce contexte, la présente recherche se propose d’étudier la valorisation boursière du CI, rendu obligatoire pour les entreprises présentant leurs comptes en IFRS depuis 2009. Les tests empiriques ont porté sur un échantillon d’entreprises françaises cotées au SBF 120 observées sur la période pré IAS 1R (2004-2009) et post IAS 1R (2009-2013) en utilisant les régressions de panel. Les résultats indiquent que les deux mesures de résultats (traditionnel et CI) sont value relevant et donc apportent de l'information pertinente pour apprécier les cours et les rentabilités boursiers. Par ailleurs, les other comprehensive income agrégés semblent valorisés par le marché et fournissent des informations additionnelles par rapport au résultat net. Enfin il semble que la value relevance du CI s’est améliorée de manière significative après l’application de la norme IAS 1R. Ces résultats suggèrent que les éléments de la performance financière sont pris en compte positivement par les utilisateurs de l’information financière lorsqu’ils sont clairement publiés et confortent le normalisateur dans son exigence de transparence dans la diffusion du CI. / From the perspective of the transparency and comparability of financial statements requirements, the traditional evaluation of the outcome is no longer satisfying. It is amended through other components which are mainly estimated at market value to obtain the comprehensive income (CI). The CI, Statement of Financial Performance of the revised IAS 1(IAS 1R) requires the disclosure of both income and other comprehensive income to cater for the needs of users of accounting information and help them in making better financial decisions. The purpose of this study is to investigate the value relevance of CI which became compulsory for companies presenting their financial statements in IFRS since 2009. Empirical tests have focused on a sample of French listed companies over the pre (2004-2008) and post (2009-2013) IAS 1R periods, using panel data. We found that two summary income measures (CI and net income) are significantly associated with price and market returns. We also found that other aggregated comprehensive income provide incremental price-relevant information beyond net income. Finally, it appears that the adoption of IAS 1R had a positive effect on the value relevance of CI. These findings reveal that mandating CI in IFRS regulation improves transparency and enhances the usefulness and quality of the reported CI information thus, likely to be more useful in terms of requirements for transparency.
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What Can Philosophical Literature Do? The Contribution of Simone de Beauvoir

Scheu, Ashley King January 2011 (has links)
<p>"What Can Philosophical Literature Do? The Contribution of Simone de Beauvoir" examines Simone de Beauvoir's existentialist aesthetic theory of the philosophical novel alongside two fictional works, L'invitée (1943) and Le sang des autres (1945), which constitute Beauvoir's first experiments in writing works of this hybrid genre. Throughout this dissertation, I mobilize Beauvoir's theoretical and literary writing to challenge implied notions that literature somehow acts as a supplement to philosophy and that philosophical literature does not offer distinct advantages to the philosophical system.</p><p>In her theoretical writings on philosophical literature - including "Littérature et métaphysique" (1945), her auto-analysis of her novels in La Force de l'âge (1960), her contribution to the forum, Que peut la littérature? (1965), and her lecture, "Mon expérience d'écrivain" (1966) - Beauvoir confronts a potential impasse in the conception of the philosophical novel, which risks devolving into being either a roman à thèse or a concrete example of a pre-existing philosophical system. This aesthetic impasse becomes particularly acute when Beauvoir begins to write ethical fiction after WWII. This dissertation catalogs Beauvoir's unique philosophical solutions to this aesthetic problem, and in turning to L'invitée and Le sang des autres, demonstrates that Beauvoir's aesthetic innovations open up readings of her novels to new insights about her contributions to twentieth-century literary and philosophical thought, including her thought on separation from the other - solipsism and skepticism - and on connection to the other - love, Mitsein, and reciprocal recognition. </p><p>In chapter one, I point to Beauvoir's formulation of the philosophical-literary impasse in "Littérature et métaphysique" and enumerate how this impasse has worked its way into the critical reception of L'invitée. Beauvoir resolves this aesthetic problem through her concept of the philosophical-literary work as a particularly strong appeal to the reader's freedom. In chapter two, I read L'invitée with Beauvoir's aesthetic insights in mind, which has the effect of freeing Beauvoir's novel from the philosophical binds of Sartre's theory of the Look in L'être et le néant. In L'invitée, Beauvoir accounts for and also goes beyond conflict and domination by building a multiplicity of looks through her theme of spectacle in her novel (dance, theater). In chapter three, I show how Beauvoir's turn to ethics and engaged literature after WWII once again raises the specter of the roman à thèse. I thus delineate the differences between engaged literature and the roman à thèse, differences which rely upon the existentialist notion of engaged literature as a dévoilement or unveiling of ethical issues. Finally, in chapter four I show the ways in which Le sang des autres both falls into the traps of the roman à thèse on the one hand and on the other resists that trap through its unveiling of her characters' world as Mitsein and the ambiguous ethical problem of empathy within Mitsein.</p> / Dissertation
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Effet des cellules stromales mésenchymateuses (CSM) sur l'hypersensibilité viscérale chronique dans un modèle d'ulcération colique radio-induite chez le rat

Durand, Christelle 19 June 2014 (has links) (PDF)
Les douleurs viscérales chroniques font partie des effets secondaires des patients traités pour des cancers de la zone pelvienne. Ces douleurs peuvent affecter grandement la qualité de vie de ces patients. Dans les cas les plus graves, il n'existe pas de traitement analgésique efficace. Ainsi le développement de nouvelles stratégies thérapeutiques efficaces constitue un enjeu majeur. Au sein de notre laboratoire, le potentiel réparateur et immuno-modulateur des cellules stromales mésenchymateuses (CSM) a déjà été démontré dans un modèle d'ulcération colorectale radio-induite chez le rat. Dans ce contexte, l'objectif de ma thèse était d'évaluer d'abord la pertinence de l'utilisation de ce modèle pour l'étude de l'hypersensibilité viscérale persistante radio-induite, puis, le bénéfice thérapeutique de l'utilisation des CSM comme agent antinociceptif. Nous avons dans un premier temps démontré, dans ce modèle, le maintien au cours du temps d'une hypersensibilité viscérale associée à une sensibilisation centrale persistante après irradiation, validant ainsi le modèle. Nous avons ensuite montré l'implication des mastocytes (MC) et suggéré l'implication du neuromédiateur NO dans les mécanismes de la sensibilisation périphérique sous-tendant une telle hypersensibilité. Nous avons enfin mis en évidence que le traitement par des CSM permettait la réduction de l'hypersensibilité viscérale radio-induite persistante. La capacité des CSM à moduler l'activation des MC et/ou leurs interactions avec les fibres nerveuses pourrait être impliquée dans leur action antinociceptive. En conclusion, ce travail a permis d'élargir le spectre d'action thérapeutique des CSM dans notre modèle d'étude.
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Un essai d'utilisation d'information écologique à l'aide d'un sig dans une perspective d'aménagement intégré d'un territoire forestier : le cas de Girardville

Boucher, Brigitte January 1996 (has links) (PDF)
Cette recherche propose de mettre au point une méthode d'analyse des données écologiques pour répondre aux besoins d'utilisation judicieuse du milieu et pour favoriser l'aménagement intégré des ressources en secteur forestier. Le territoire ciblé couvre une superficie de 207 km2 au nord de la région du Saguenay?Lac-Saint-Jean et il est géré notamment par la coopérative forestière de Girardville. Le cadre écologique de référence mis au point pour ce secteur forme la base cartographique et écologique sur laquelle s'appuient les thématiques abordées. Les modèles alors créés traduisent les propriétés intrinsèques du territoire sous forme de potentiels, d'aptitudes ou de risques. A ce propos, nous avons fait appel au système d'information géographique Maplnfo dont le rôle a été de saisir, manipuler, analyser les données recueillies et d'en faire des modèles cartographiques. Parallèlement à cette démarche, la télédétection a été utilisée pour obtenir une mise à jour du couvert forestier. Une image Landsat-TM a permis de décrire le territoire de Girardville en 11 classes d'utilisation du sol. Pour réaliser un modèle intégré des potentiels dans le territoire, quatre volets ont été étudiés: forêt, faune, agriculture et non-intervention. Le volet "forêt" regroupe des interprétations exprimant les possibilités d'exploitation forestière, le choix des essences de reboisement et les possibilités de croissance du peuplier faux-tremble. Il ressort de l'analyse que le territoire de Girardville bénéficie de bonnes possibilités pour l'exploitation forestière, exception faite de quelques secteurs à fort risque d'érosion après déboisement ou à potentiel limité pour la traficabilité. De plus, chaque unité cartographique est associée à un choix d'essence de reboisement parmi l'épinette noire, l'épinette blanche et le pin gris. Le modèle du potentiel de croissance pour le peuplier faux-tremble suggère que le territoire offre de bonnes possibilités pour cette essence. Un second volet propose un exemple de potentiel agricole, par une évaluation des possibilités de culture du bleuet nain. Bien que le territoire affiche en majeure partie un potentiel faible à modéré pour cette activité, il possède quelques unités à fort potentiel. Un volet "faune" est également illustré au moyen d'un exemple, soit celui de la martre d'Amérique. Une première évaluation qui porte sur le potentiel actuel d'habitat pour l'espèce remet en perspective la présence de nombreuses coupes forestières. Les quelques peuplements de résineux matures qui occupent notamment le nord du territoire sont au nombre des sites à potentiel fort. Par contre, il a été possible de démontrer qu'un grand nombre d'unités possèdent les atouts pour soutenir un habitat favorable à la martre d'Amérique. En dernier lieu, un volet "non-intervention" regroupe les unités ayant un potentiel limité pour tout aménagement. L'ensemble de ces thématiques a été développé à partir de grilles d'interprétation et de pondération des composantes écologiques. Ces modèles ont mené à un découpage du territoire en 12 grandes zones d'aménagements potentiels. On retrouve également des indications quant aux possibilités de vocations prioritaires et secondaires qui y prévalent La création de ces divers modèles a également mené à la réalisation d'une base de données regroupant les valeurs des interprétations pour chaque topo-système du territoire. Par ailleurs, les documents produits guident les gestionnaires vers une prise de décision stratégique plus éclairée pour un aménagement plus adéquat du milieu.
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Un essai d'utilisation d'information écologique à l'aide d'un sig dans une perspective d'aménagement intégré d'un territoire forestier : le cas de Girardville

Boucher, Brigitte January 1996 (has links) (PDF)
Cette recherche propose de mettre au point une méthode d'analyse des données écologiques pour répondre aux besoins d'utilisation judicieuse du milieu et pour favoriser l'aménagement intégré des ressources en secteur forestier. Le territoire ciblé couvre une superficie de 207 km2 au nord de la région du Saguenay?Lac-Saint-Jean et il est géré notamment par la coopérative forestière de Girardville. Le cadre écologique de référence mis au point pour ce secteur forme la base cartographique et écologique sur laquelle s'appuient les thématiques abordées. Les modèles alors créés traduisent les propriétés intrinsèques du territoire sous forme de potentiels, d'aptitudes ou de risques. A ce propos, nous avons fait appel au système d'information géographique Maplnfo dont le rôle a été de saisir, manipuler, analyser les données recueillies et d'en faire des modèles cartographiques. Parallèlement à cette démarche, la télédétection a été utilisée pour obtenir une mise à jour du couvert forestier. Une image Landsat-TM a permis de décrire le territoire de Girardville en 11 classes d'utilisation du sol. Pour réaliser un modèle intégré des potentiels dans le territoire, quatre volets ont été étudiés: forêt, faune, agriculture et non-intervention. Le volet "forêt" regroupe des interprétations exprimant les possibilités d'exploitation forestière, le choix des essences de reboisement et les possibilités de croissance du peuplier faux-tremble. Il ressort de l'analyse que le territoire de Girardville bénéficie de bonnes possibilités pour l'exploitation forestière, exception faite de quelques secteurs à fort risque d'érosion après déboisement ou à potentiel limité pour la traficabilité. De plus, chaque unité cartographique est associée à un choix d'essence de reboisement parmi l'épinette noire, l'épinette blanche et le pin gris. Le modèle du potentiel de croissance pour le peuplier faux-tremble suggère que le territoire offre de bonnes possibilités pour cette essence. Un second volet propose un exemple de potentiel agricole, par une évaluation des possibilités de culture du bleuet nain. Bien que le territoire affiche en majeure partie un potentiel faible à modéré pour cette activité, il possède quelques unités à fort potentiel. Un volet "faune" est également illustré au moyen d'un exemple, soit celui de la martre d'Amérique. Une première évaluation qui porte sur le potentiel actuel d'habitat pour l'espèce remet en perspective la présence de nombreuses coupes forestières. Les quelques peuplements de résineux matures qui occupent notamment le nord du territoire sont au nombre des sites à potentiel fort. Par contre, il a été possible de démontrer qu'un grand nombre d'unités possèdent les atouts pour soutenir un habitat favorable à la martre d'Amérique. En dernier lieu, un volet "non-intervention" regroupe les unités ayant un potentiel limité pour tout aménagement. L'ensemble de ces thématiques a été développé à partir de grilles d'interprétation et de pondération des composantes écologiques. Ces modèles ont mené à un découpage du territoire en 12 grandes zones d'aménagements potentiels. On retrouve également des indications quant aux possibilités de vocations prioritaires et secondaires qui y prévalent La création de ces divers modèles a également mené à la réalisation d'une base de données regroupant les valeurs des interprétations pour chaque topo-système du territoire. Par ailleurs, les documents produits guident les gestionnaires vers une prise de décision stratégique plus éclairée pour un aménagement plus adéquat du milieu.
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A parametric level set method for the design of distributed piezoelectric modal sensors

Hoffmann, Sandra 04 May 2016 (has links) (PDF)
Distributed modal filters based on piezoelectric polymer have especially become popular in the field of active vibration control to reduce the problem of spillover. While distributed modal filters for one-dimensional structures can be found analytically based on the orthogonality between the mode shapes, the design for two-dimensional structures is not straightforward. It requires a continuous gain variation in two dimensions, which is not realizable from the current manufacturing point of view. In this thesis, a structural optimization problem is considered to approximate distributed modal sensors for two-dimensional plate structures, where the thickness is constant but the polarization can switch between positive and negative. The problem is solved through an explicit parametric level set method. In this framework, the boundary of a domain is represented implicitly by the zero isoline of a level set function. This allows simultaneous shape and topology changes. The level set function is approximated by a linear combination of Gaussian radial basis functions. As a result, the structural optimization problem can be directly posed in terms of the parameters of the approximation. This allows to apply standard optimization methods and bypasses the numerical drawbacks, such as reinitialization, velocity extension and regularization, which are associated with the numerical solution of the Hamilton-Jacobi equation in conventional methods.Since the level set method based on the shape derivative formally only allows shape but not topology transformation, the optimization problem is firstly tackled with a derivative-free optimization algorithm. It is shown that the approach is able to find approximate modal sensor designs with only few design variables. However, this approach becomes unsuitable as soon as the number of optimization variables is growing. Therefore, a sensitivity-based optimization approach is being applied, based on the parametric shape derivative which is with respect to the parameters of the radial basis functions. Although the shape derivatives does not exist at points where the topology changes, it is demonstrated that an optimization routine based on a SQP solver is able to perform topological changes during the optimization and finds optimal designs even from poor initial designs. In order to include the sensors' distribution as design variable, the parametric level set approach is extended to multiple level sets. It turns out that, despite the increased design space, optimal solutions always converge to full-material polarization designs. Numerical examples are provided for a simply supported as well as a cantilever square plate. / Doctorat en Sciences de l'ingénieur et technologie / info:eu-repo/semantics/nonPublished
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Drug-Related Problems in Belgium: From community pharmacies to hospital: State of the situation and Impact

Koubaity, Majda 17 October 2019 (has links) (PDF)
IntroductionDepuis plusieurs décennies, la pratique et les soins pharmaceutiques sont soumis à plusieurs changements en partie en raison de l’évolution de la société, des progrès de la recherche et de la mise sur le marché de nouveaux médicaments. La pratique du pharmacien a passée d’une délivrance centrée sur le médicament vers la délivrance centrée sur le patient notamment par la détection, l’intervention et la résolution des Problèmes Liés aux Médicaments (PLM).Certains patients atteints d’une condition médicale particulière, tels que les patients cancéreux, peuvent être soumis à des traitements lourds qui leurs sont nécessaires mais qui peuvent les rendre plus vulnérable à l’apparition d’un PLMObjectifsL'objectif de cette thèse était de mettre en évidence la proportion des PLM dans les pharmacies d’officines ainsi qu’à l'hôpital et d’évaluer les potentielles conséquences en milieu hospitalier.La première partie était composée de deux projets ;1) Traduction et adaptation de la classification du PCNE V6.2 à la pratique et au cadre juridique pharmaceutique belge en intégrant la validation du contenu et la fiabilité inter-évaluateur de la classification adaptée. 2) Étude pilote visant à évaluer la proportion de PLM des antidouleurs les plus utilisés en Belgique.La deuxième partie de cette thèse était composée de trois projets. 1) Quantification et classification des réadmissions des PLM des patients cancéreux réadmis dans les 30 jours et mise en évidence des facteurs de risque liés à ces réadmissions ;2) Évaluation des coûts liés aux réadmissions dues aux PLM et les potentielles économies de PLM évitables ;3) Détection des interactions médicamenteuses à partir de différentes sources disponibles au sein de la population cancéreuse réadmise lors du premier projet et évaluation de l’impact de ces interactions sur la survie des patients.MéthodeLa classification du PCNE V6.2 a été adaptée et traduite pour le contexte belge. Afin d’évaluer la validité du contenu, les pharmaciens académiques et d’officines ont évalué six critères, deux qui ciblaient le mode d’emploi (compréhensibilité, utilité) et quatre le formulaire d’encodage (pertinence, logique d’agencement, exhaustivité et redondance). Lors de leur pratique quotidienne, les pharmaciens ont appliqué l'outil adapté du PCNE afin d’évaluer si les instructions avaient été respectées et de quantifier le temps nécessaire pour résoudre un PLM. Par la suite, l’analyse des encodages des pharmaciens a permis d’estimer la fiabilité inter-évaluateurs. Le second projet était une étude pilote qui a permis aux étudiants de Master 2 d’encoder avec l’outil adapté du PCNE V6.2 les PLM détectés en officine par leur maître de stage. Les PLM impliquant les antidouleurs ont été extraits de la base de données initiale et ont été analysés.La deuxième partie s’est basée sur une étude rétrospective observationnelle de six mois dans deux établissements de soins Bruxellois :un hôpital général universitaire et un centre de référence en oncologie. Afin d’évaluer les PLM, une revue de médication de type 2b a été appliquée pour chaque patient réadmis aux urgences ou suite à une consultation médicale. La probabilité d’implication d’un PLM dans la réadmission a été évaluée à l’aide du système du Centre de surveillance de l'organisation mondiale de la santé d'Uppsala (OMS-UMC). La réception de la base de données des différents coûts liés à ces réadmissions a permis une estimation des coûts de réadmission de ces PLM pour chacun des deux établissements impliqués. Le caractère évitable d’un PLM a pu être évalué par l’utilisation du questionnaire de Schumock et al. Le dernier projet à évaluer les potentielles interactions médicamenteuses à l'aide des bases de données en ligne Lexicomp® et Epocrates®. Une analyse de survie de Kaplan-Meier et une analyse de Cox ont été effectuées pour évaluer le lien entre les variables interaction et survenue du décès.RésultatsL'adaptation de l’outil a permis l'ajout de 16 items. Une bonne validation du contenue a été obtenue suite à l’évaluation des pharmaciens académiques et des pharmaciens d’officine. Un total de 109 PLM a été encodé, avec un temps de résolution moyen de 5 min. Concernant la fiabilité inter-évaluateur, 74 items sur un ensemble de 83 ont montré une fiabilité élevée. L’étude pilote a permis de recueillir 15 952 PLM, dont 1 832 pour les antidouleurs, 3 200 interventions ont été produites afin de résoudre les PLM. La majorité des PLM ont été totalement ou partiellement résolus (77,2%).Lors de la seconde partie de la thèse, l’analyse des dossiers de patients cancéreux réadmis dans les 30 jours a révélé que 123 patients avaient été réadmis pour un PLM certain (4,9%), probable (49,6%) ou possible (45,5%). Les facteurs de risque mis en évidence étaient un faible score de Charlson, la polymédication et certaines chimiothérapies (préparations à base de Platine, les anthracyclines ou les vinca-alcaloides). Un montant total de 495 869,10 € a été mis en évidence pour les réadmissions dues aux PLM, avec une durée médiane d’hospitalisation de 7 jours. Les cancers prédominants liés à ces réadmissions étaient le poumon (19,5%) et le sein (17,9%). En se basant sur les diagnostiques des médecins, une part importante (71,5%) des réadmissions du aux PLM était liée aux effets indésirables de la chimiothérapie.Le troisième projet de la seconde partie de ce travail a inclus une population finale de 299 patients réadmis 30 jours après la sortie de l'hôpital en raison d’un PLM. Selon les bases de données en ligne, entre 78,9% et 80,9% des patients étaient réadmis avec au moins une interaction. En moyenne entre 1,6 et 2,3 interactions par patient ont été détectés pour Lexicomp® et Epocrates®. Les opioïdes (29,9%) suivis des anxiolytiques (15,8%) étaient les médicaments les plus souvent impliqués. Les effets indésirables les plus prédominants étaient les dépressions du système nerveux central (SNC) et les dépressions respiratoires. Des analyses de Kaplan-Meier ont montré une différence statistiquement significative sur la survenue du décès, entre les patients avec et sans interactions. Néanmoins, le décès ne semble pas être directement lié à la présence d'une interaction.ConclusionLa première partie a pu montrer que l’adaptation de l’outil au contexte francophone belge était fiable et avait une validité suffisante pour une utilisation quotidienne. La participation de 6 facultés belges a permis une implication nationale permettant d’obtenir une grande proportion de PLM (15 952) ;parmi eux, plus de 10% concernaient les antidouleurs dont la quasi-totalité ont été complètement résolus.Concernant la deuxième partie, environ 10% des réadmissions de patients cancéreux dans les 30 jours suivant leur dernier soin étaient liées à un PLM, parmi ces réadmissions 71,5% étaient liées à un effet indésirable. Le coût médian par réadmission était de 2 406,10 €. Les PLM évitables représentaient 7,3% dont le coût s’élevait à un total 27 938,61 €. L’évaluation des interactions a pu mettre en évidence une forte proportion de potentielles interactions liées aux traitements de patients cancéreux, néanmoins cela ne semble pas être lié à la survenue du décès.Ce travail a pu mettre en évidence la présence importante de PLM en officine et la volonté des pharmaciens d’officines belges à améliorer leur pratique. Néanmoins l’intégration d’un outil plus spécifique à la pratique officinale sur le terrain permettrait une adhésion plus complète et potentiellement une meilleure détection. La deuxième partie de ce travail a montré quelques facteurs de risque intéressants et l’importante présence d'interactions, qui demandent une potentielle vigilance chez les patients cancéreux afin de réduire les risques de réadmission dues aux PLM et les coûts associés. Cependant, une meilleure communication entre les professionnels de santé au sein de l’hôpital mais également avec les prestataires extérieurs tels que les médecins de famille et les pharmaciens d’officine, pourrait permettre un meilleur suivi et une diminution de ces réadmissions avec pour objectif d'améliorer la qualité de vie des patients. / Doctorat en Sciences biomédicales et pharmaceutiques (Pharmacie) / info:eu-repo/semantics/nonPublished
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Dynamical analysis of nutrient-explicit models for small microbial communties

Vet, Stefan 08 July 2020 (has links) (PDF)
Microbes form complex communities on Earth. They are crucial for global nutrient recycling in soil and oceans. Inside our body, our intestinal microbiome contributes to our metabolism and protects us against diseases. The dynamics of these microbial communities and their response to environmental changes depend on intra- and inter-species interactions. Computational models are useful to simulate the behavior of such systems and to predict their response to prebiotics or to antibiotics for example. However, due to the multiple, nutrient-dependent interactions, modeling the behavior of such communities remains a real challenge. Mathematical modeling allows for an understanding of the general principles underlying the nonlinear dynamics of microbial communities. Population-based models are based on the abundances of each species but typically do not incorporate the interaction mechanism. Interactions can be mediated by the metabolism of microbes. Therefore, explicit modeling of nutrients is required for a mechanistic understanding of the dynamical behavior of interacting communities. In this thesis we developed and analyzed models accounting for the nutrient-mediated microbial interactions, focusing on competition and mutualistic cross-feeding. In the first part of the thesis, we constructed a nutrient-explicit model that reproduced experimental time series of a small synthetic microbial community, consisting of three species that interact via cross-feeding and competition. The comparison of mono-culture and co-culture dynamics reveals emergent behaviors in co-cultures and highlights the influence of key factors on the population dynamics. In the second part of the thesis, we showed how nutrient-explicit models for mutualistic cross-feeding are related to population-based models, such as the Lotka-Volterra equations. This allows to predict the occurrence of bistability and the presence of a survival threshold. Finally, we extended these results by considering the spatial dimension, and studied how diffusion and advection influence the survival of the community. Our results demonstrate that nutrient-explicit models are able to reproduce experimental time series of microbial communities and to predict the factors determining survival or extinction. By providing a mechanistic understanding of the nonlinear behavior related to microbial interactions, we take a step forward towards the development of predictive models of microbial communities. / Doctorat en Sciences / info:eu-repo/semantics/nonPublished
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Isolation et caractérisation des cellules stromales mésenchymateuses multipotentes du tissu adipeux: Étude des sous-populations et comparaison avec la moelle osseuse. / Isolation and characterization of multipotent mesenchymal stromal cells from adipose tissue: study of sub-populations and comparison with bone marrow.

Busser, Hélène 14 December 2015 (has links)
Multipotent mesenchymal stromal cells (MSC) were first discovered in bone marrow and can be isolated from “virtually all organs”. They could participate in tissue maintenance and self-renewing process. They are able to adhere to plastic surfaces and acquire a fibroblastic shape when isolated. They are characterized by a particular phenotype and are able to differentiate into several cell types if cultivated in a specific induction medium. These characteristics were defined on MSC in culture and do not represent how they may be in situ.MSC present particular properties. They can secrete growth factors and several cytokines that give them a trophic activity on one hand and the ability to modulate the immune system on the other hand. They are also able to differentiate. These different properties make them an attractive candidate for cell therapy.MSC are already the focus of several pre-clinical and clinical studies. Nevertheless, the results of these studies are difficult to interpret due to limited understanding of their basic biology. MSC are poorly defined in situ and are heterogeneous. Their heterogeneity is dictated by their tissue of origin and cell preparation. To date, there is no standard protocol for MSC isolation and culture. This leads to numerous questions regarding patient safety, and these questions require answers.The first part of the work deals with the methods used to optimize the extraction of MSC and purification from adipose tissue, one of the main sources of autologous MSC with bone marrow. Classical methods require an enzymatic digestion step. The enzyme used and the duration of adipose tissue digestion time can induce cellular alterations and modify cell functions. Moreover, the addition of a xenobiotic increases the risk of contamination and complicates the monitoring of good manufacturing practices (GMP). We propose a method that does not require this enzymatic digestion step while being easier, safer, faster, gentler and less expensive. Compared to the classical enzymatic method, our method yields an equivalent number of MSC from adipose tissue while preserving their properties.The second part of this work focuses on the characterization of the MSC subpopulations from adipose tissue and compares them to those from bone marrow, which are the historical gold standard. The study made it possible to deepen the knowledge of MSC surface markers in situ from these 2 sources. It also evaluated the various properties of the isolated subpopulations thanks to the cell surface markers CD271, SUSD2, MSCA-1, CD44 and CD34. We showed that MSC from bone marrow express MSCA-1, CD271 and SUSD2 markers in situ. We also found that a population clearly positive for the CD34 does exist in situ with different properties compared to those of the unselected populations or the negative counterpart. 2 populations that are negative and positive for CD44 also exist with similar properties.In contrast to bone marrow MSC, only one selection was able to effectively isolate MSC from adipose tissue by a positive selection based on the expression of CD34. We also isolated a CD271+ population but only from lipoaspirate samples and not from abdominoplasty samples. Collectively, our results suggest that MSCA-1 seems to be the best marker through which to isolate MSC from bone marrow and that CD34 is the only marker able to positively isolate cells from adipose tissue. Thus, we show that the MSC from the different sources share similar properties although they have specific characteristics. The choice of the source and of the marker with which to isolate a particular subpopulation is important depending on their intended clinical use. / Les cellules stromales mésenchymateuses multipotentes (CSM) ont été mises en évidence dans la moelle osseuse et peuvent être isolées de « virtuellement tous les organes ». Elles participeraient à la maintenance et au renouvellement des tissus. Une fois isolées, elles sont capables d’adhérer à des surfaces en plastique en prenant une forme fibroblastique. Elles sont caractérisées par un phénotype particulier et peuvent se différencier en divers types cellulaires lorsque cultivées dans un milieu d’induction spécifique. Ces caractéristiques ont été définies sur les CSM en culture et ne reflètent pas forcément ce qui se passe in situ.Les CSM présentent des propriétés particulières. Elles peuvent sécréter des facteurs de croissance ainsi que de nombreuses cytokines qui leur permettent d’une part d’avoir une activité trophique et d’autre part de moduler le système immunitaire. Elles sont aussi capables de se différencier. Ces différentes propriétés les rendent particulièrement attractives pour la thérapie cellulaire.Les CSM font déjà l’objet de nombreuses études pré-cliniques et cliniques dont les résultats sont difficilement interprétables car nous n’avons à l’heure actuelle qu’une compréhension limitée de leur biologie de base. Les CSM sont encore mal définies in situ et sont hétérogènes. Cette hétérogénéité provient de leur différence d’origine et de leur préparation cellulaire :il n’existe aucune standardisation des protocoles d’isolation et de culture. Cette hétérogénéité entraine de nombreuses questions relatives à la sécurité du patient qui doivent être élucidées.La première partie de ce travail cherche à optimiser les méthodes d’extraction et de purification des CSM du tissu adipeux humain, la principale source de CSM autologues avec la moelle osseuse. Les méthodes classiques requièrent une étape de digestion enzymatique dont l’enzyme utilisée et le temps de digestion du tissu adipeux peuvent induire des altérations cellulaires et modifier leurs fonctions. De plus, l’adjonction de xénobiotiques augmente le risque de contamination et complique le suivi des bonnes pratiques de fabrication (BPF). Nous proposons une méthode qui s’affranchit de cette étape de digestion enzymatique tout en étant plus facile, plus sûre, plus rapide, moins chère et moins traumatisante pour les cellules. Elle permet d’obtenir un nombre tout aussi important de CSM du tissu adipeux que la méthode enzymatique classique en préservant leurs propriétés.La deuxième partie de ce travail vise à caractériser les sous populations de CSM du tissu adipeux humain en les comparant à celles de la moelle osseuse, source de référence historique. Cette étude a permis d’approfondir la connaissance des marqueurs de surface des CSM de ces 2 sources in situ, tout en évaluant les différentes propriétés des sous-populations isolées grâce aux marqueurs de surface CD271, SUSD2, MSCA-1, CD44 et CD34. Nous avons montré que les CSM de la moelle osseuse expriment les marqueurs MSCA-1, CD271 et SUSD2 in situ et qu’il existait une sous-population clairement positive pour le CD34 avec des propriétés différentes de celles de la population non sélectionnée ou négative pour ce marqueur. Il existe aussi 2 sous-populations positive et négative pour le CD44 avec des propriétés similaires.Contrairement aux CSM de la moelle osseuse, une seule sélection a permis d’isoler efficacement les CSM du tissu adipeux par une sélection positive sur base de l’expression du CD34. Nous avons pu aussi isoler une population CD271+ mais seulement des prélèvements de lipoaspirations et non des abdominoplasties.Au vu de nos résultats, MSCA-1 semble le meilleur marqueur pour isoler les CSM de la moelle osseuse tandis que le CD34 est le seul marqueur capable d’isoler positivement celles du tissu adipeux. Ainsi, nous montrons que les CSM issues de différentes sources partagent des propriétés similaires avec cependant des caractéristiques propres. Le choix de la source et du marqueur pour isoler une sous-population sont donc importants en fonction de leur utilité clinique envisagée. / Doctorat en Sciences biomédicales et pharmaceutiques (Médecine) / info:eu-repo/semantics/nonPublished

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