Orientador: Rosangela Zacarias Machado / Banca: Marcos Rogério André / Banca: Alessandro de Mello Varani / Banca: Itabajara da Silva Vaz Junior / Banca: Mucio Flavio Barbosa Ribeiro / Resumo: Anaplasma marginale é o mais prevalente patógeno transmitido por carrapatos em bovinos nas regiões tropicais e subtropicais do mundo. A Proteína Principal de Superfície 1 alpha (MSP1a) do A. marginale contém um número variável de sequências repetidas na região animo-terminal e tem sido utilizada para a caracterização da diversidade genética desse patógeno. Nós realizamos um estudo longitudinal para averiguar a diversidade genética do A. marginale em um rebanho bovino leiteiro de Seropédica no estado do Rio de Janeiro e Taiaçu no estado de São Paulo, Brasil. Vinte bezerras foram avaliadas a cada três meses durante o primeiro ano de vida por esfregaço sanguíneo, Ensaio de Imunoadsorção Enzimático Indireto (ELISA), Reação de Imunofluorescência Indireta (RIFI) e Reação em Cadeia da Polimerase (nPCR/qPCR). Adicionalmente, as amostras positivas para o gene msp1a usando nPCR foram sequenciadas. A frequência do A. marginale variou de 10 - 90% no esfregaço sanguíneo, 20 - 80% no ELISA/RIFI e 15 - 100% na qPCR. O número de copias da msp1a por mL de sangue variou de 1,04 x 101 a 6.76 x 1012 (Seropédica RJ) e 1.20 x 101 a 5.17 x 106 (Taiaçu SP). Os resultados mostraram que a diversidade genética do A. marginale, em um grupo de bezerras até 1 ano de idade em Taiaçu (SP) foi baixa, com apenas três diferentes estirpes identificadas, mostrando o genótipo E. No entanto, os resultados mostraram que o diversidade genética do A. marginale, em um grupo de bezerras até 1 ano de idade em Seropédica (RJ) foi elevada, com dezenove diferentes estirpes identificadas, mostrando o genótipo E e G. As estirpes 4-63-27 (27.4%) e α-β3-Γ (77.8%) foram as mais comumente observadas em bezerras do estado do Rio de Janeiro e São Paulo, respectivamente. O novo conjunto de repetição da MSP1a 190 foi descrito em bezerras de Taiaçu e vinte e uma repetições em tandem da MSP1a resultou em novas sequências com alterações de... / Abstract: Anaplasma marginale is the most prevalent tick-borne pathogen in cattle in tropical and subtropical regions of the world. The A. marginale major surface protein 1 alpha (MSP1a) contains a variable number of tandem repeats in the amino terminal region and has been used for the characterization of pathogen genetic diversity. We conducted a longitudinal study to ascertain the genetic diversity of A. marginale in in a dairy cattle herd in Seropédica state of Rio de Janeiro and Taiaçu state of São Paulo, Brazil. Twenty calves were evaluated every three months during the first year of life by blood smear, Enzyme-linked Immunosorbent Assay (ELISA), Indirect Fluorescent Antibody Test (IFAT) and Polymerase Chain Reaction (nPCR/qPCR). Additionally, samples positive for the msp1a gene using nPCR were sequenced. The prevalence of A. marginale ranged from 10 to 90% according to blood smears, 20-80% using ELISA/IFAT and 15-100% using qPCR. The number of msp1a copies per mL of blood ranged from 1,04x101 to 6.76x1012 (Seropédica RJ) and 1.20 x 101 to 5.17 x 106 (Taiaçu SP). The results showed that the genetic diversity of A. marginale in a group of calves up to 1 year of age from Taiaçu (SP) was low, with only three different strains identified, showing the microsatellite genotype E. However, the results showed that the genetic diversity of A. marginale in a group of calves up to 1 year of age from Seropédica (RJ) was high, with nineteen different strains identified, showing the microsatellite genotype E and G. The strains 4-63-27 (27.4%) and α-β3-Γ (77.8%) were the most commonly observed in calves of Seropédica RJ and Taiaçu SP, respectively. The new MSP1a tandem repeat 190 was described in calves from Taiaçu and twenty-two MSP1a tandem repeats resulted in new sequences with amino acid changes, which were labeled as 165-186 in calves from Seropédica. In Seropedica, three animals were born infected, with strains 4-63-27, 78-242-25-31 and ... / Doutor

Magíster en Ciencias de la Ingeniería, Mención Química. Ingeniera Civil en Biotecnología / La nutrición es un tema muy importante en la sociedad, ya que muchos alimentos consumidos por el ser humano difieren en su aporte nutricional, y se ve reflejado en aspectos físicos, fisiológicos y neurológicos. A partir de esto, se formuló la pregunta ¿cuáles son los efectos sistémicos de la dieta en C. elegans? Para responder a esta interrogante se utilizó como modelo de estudio biológico al nematodo bacterívoro Caenorhabditis elegans que, con una anatomía simple, posee 6 neuronas responsables de la respuesta al tacto. En el laboratorio, C elegans puede ser alimentado con una series de cepas y especies de bacterias. Alterando la dieta de C. elegans se puede afectar a un número de rasgos, incluyendo esperanza de vida, fecundidad y la tasa de bombeo faríngeo. El presente trabajo de investigación tuvo por objetivo evaluar la actividad in vivo de diferentes dietas bacterianas suplementadas con azúcares sobre el desarrollo, la fertilidad y la integridad neuronal del gusano. Para lograr lo anterior se utilizan dos mutantes de C. elegans: un modelo de degeneración neuronal (mec-4d), que corresponde a un gusano que lleva una mutación en el canal MEC-4, que se expresa sólo en las neuronas del tacto y es responsable de regular el ingreso de sodio. Esta mutación provoca que el canal se abra constitutivamente provocando la muerte progresiva en esas neuronas; y un modelo de C. elegans asociado a la vía de señalización de la insulina. En este mutante a 25°C se bloquea el receptor de insulina DAF-2/IGF-1 evitando las fosforilaciones y por tanto, permitiendo la entrada del factor de transcripción DAF-16/FOXO al núcleo incrementando la capacidad celular antioxidativa. Con los mutantes antes mencionados se hicieron ensayos de fecundidad, de crecimiento y para observar la morfología neuronal en presencia de bacterias con diferente calidad nutricional y de azúcares. Los resultados muestras que los azúcares no alteran los rasgos estudiados, ya que los efectos de las dietas en sí y las mutaciones en C. elegans tiene un impacto mayor que no se ve alterado por la presencia de monosacáridos. Por otro lado, se observa que el mutante mec-4d en presencia de dietas bacterianas de mejor calidad, la protección contra la degeneración neuronal es mayor, la tasa de desarrollo se ve acelerada y la fertilidad se ve favorecida con el aumento en la deposición de huevos. En cuanto al mutante daf-2(ts);mec-4d, se observa que la degeneración neuronal es casi completamente evitada, independiente de la calidad de la alimentación. Pero, la tasa de desarrollo no se ve influenciada, y la fertilidad se ve disminuida con esta mutación. Finalmente, C. elegans permitió estudiar con éxito los rasgos de historia de vida del nematodo influenciados por dietas bacterianas de diferente calidad nutricional. Sin embargo, es necesaria la identificación de los compuestos que hacen la diferencia.

Os elementos genéticos móveis encontrados no genoma da bactéria Xylella fastidiosa (Xf) são representados principalmente por bacteriófagos (na forma de profagos inseridos no genoma) e ilhas genômicas. As integrases são responsáveis pelo processo de mobilização (integração e/ou excisão) destes elementos, através do mecanismo de recombinação sítio-específica. Bacteriófagos e ilhas genômicas estão associados a eventos de rearranjos genômicos e à aquisição e ou interrupção de genes importantes para bactéria, tendo implicação direta na diversidade e organização genômica e, por conseqüência, na diferenciação entre linhagens. A extensão e o impacto desses eventos é o foco deste trabalho, através da análise in-silico das integrases e sua associação com regiões de profagos e ilhas genômicas, no genoma de quatro linhagens de Xf. Os dados aqui apresentados corroboram o papel das integrases e seus elementos genéticos móveis associados como agentes chaves no processo de diversidade e evolução da organização genômica entre as quatro linhagens de Xf. / The mobile genetic elements found in the genome of the bacterium Xylella fastidiosa (Xf) are mainly represented by bacteriophages (as prophages inserted into the genome) and genomic islands. The integrases are responsible for the process of mobilization (integration and / or excision) of these elements through the mechanism of site-specific recombination. Bacteriophages and genomic islands are associated with events of genomic rearrangements and the acquisition and or interruption of important genes for bacteria, with direct involvement in diversity and genomic organization and, consequently, the differentiation between strains. The extent and impact of these events are the focus of this work, through in-silico analysis of integrase and association with regions of prophages and genomic islands in the genome of four strains of Xf. The data presented here support the role of integrases and their mobile genetic elements associated as key players in the process of evolution and diversity of genomic organization between the four strains of Xf.

Orientador: Ana Lúcia Barretto Penna / Banca: Katia Sivieri / Banca: Juliano De Dea Lindner / Banca: Ana Carolina Conti e Silva / Banca: Eleni Gomes / Resumo: No Brasil, o queijo Muçarela de búfala tem uma boa aceitação pelos consumidores e mercado em expansão. Entretanto, há escassez de dados científicos em âmbito nacional sobre as bactérias acido láticas (BAL) autóctones envolvidas nos processos tradicionais de fabricação deste produto. Assim, este estudo teve o objetivo de identificar e caracterizar as BAL autóctones isoladas durante as etapas do processo de produção e período de estocagem do queijo Muçarela de búfala, assim como avaliar a dinâmica e a evolução da microbiota lática, suas características tecnológicas e o potencial de aplicação industrial. Para isso, em um primeiro momento, cento e cinquenta e duas culturas láticas isoladas das amostras de leite in natura, coalhada, massa filada, queijo Muçarela de búfala e soro de conservação recém processados e durante o período de estocagem foram caracterizadas pela capacidade de crescer em diferentes temperaturas (15, 30 e 45 °C), pH (4,5 e 9,6), concentrações de NaCl (4,0, 6,5 e 10,0%) e pela capacidade de produzir CO2 a partir do uso da glicose. A biodiversidade e a evolução das BAL foram avaliadas pelo sequenciamento do gene 16S rRNA e pelas técnicas de RAPD-PCR e RFLP-PCR. Quanto à viabilidade nas diferentes condições, a maioria das cepas analisadas cresceu a 30 °C e na presença de 6,5% de NaCl, e em geral, cresceram bem em pH 9,6. As BAL isoladas foram identificadas como: Enterocccus faecalis, Lactococcus garvieae, Lactobacillus helveticus, Lactococcus lactis, Streptococcus thermophilus, Leuconostoc citreum, Lactobacillus delbrueckii subsp. bulgaricus, Enterococcus sp., Lactobacillus fermentum, Lactobacillus casei e Leuconostoc mesenteroides. A técnica de RAPD-PCR permitiu avaliar a dinâmica das BAL representativas nas diferentes etapas de processamento e no período de estocagem do queijo Muçarela. Sessenta clusters foram obtidos pela técnica de RAPD-PCR... / Abstract: In Brazil, buffalo Mozzarella cheese has good acceptance by its consumers and growing market. However, there are few scientific data about autochthonous lactic acid bacteria (LAB) involved in traditional manufacturing processes of this product nationally. Thus, this study aimed to identify the autochthonous LAB isolated during the buffalo Mozzarella cheese manufacture and storage period, as well as to evaluate the evolution and dynamic of lactic microbiota and their technological characteristics and potential of industrial application. First, isolated one hundred fifty-two lactic cultures isolated from raw milk, curd, stretched curd, mozzarella cheese, and solution of maintenance after being produced and during storage were characterized by the ability to grow in different temperatures (15, 30 and 45 °C), pH (4.5 and 9.6) and concentrations of NaCl (4.0, 6.5 and 10.0%), as well as the ability to produce CO2 from glucose. The biodiversity and evolution of LAB were evaluated by 16S rRNA gene sequencing, RAPD-PCR, and RFLP-PCR techniques. Regarding the growth under different conditions, most of the strains grow well at 30 °C, are feasible in the presence of 6.5% NaCl, and in general, presented best growing in pH 9.6. The isolated LAB were identified as: Enterocccus faecalis, Lactococcus. garvieae, Lactobacillus helveticus, Lactococcus lactis, Streptococcus thermophilus, Leuconostoc citreum, Lactobacillus delbrueckii subsp. bulgaricus, Enterococcus sp., Lactobacillus fermentum, Lactobacillus casei and Leuconostoc mesenteroides. The RAPD-PCR technique allowed evaluating the dynamics of representative LAB in the different steps of Mozzarella production and storage period. Sixty clusters were obtained by RAPD-PCR. All cultures grouped by RAPD-PCR, which presented more than 85% of similarity (114 cultures), were assessed by RFLP-PCR. Most of the LAB was clustered with 100% similarity by RFLP-PCR technique... / Doutor

Orientador: Lucia Maria Aparecida Carareto Alves / Banca: Manoel Victor Franco Lemos / Banca: Janaina Conrado Lyra da Fonseca / Resumo: O processo de compostagem de resíduos animais com mortalidade cotidiana ou de surtos tem sido identificado como o método ideal para a disposição final de carcaças, entretanto o risco potencial de transmissão de microrganismos patogênicos limita severamente seu uso. Neste estudo foi avaliada a qualidade química e segurança microbiológica de um composto produzido com carcaças animais e resíduos vegetais, em uma unidade experimental de compostagem na Universidade Estadual Paulista (UNESP), Brasil. Em uma amostra do composto maduro, foi determinada a presença das bactérias patogênicas E. coli (STEC), E. coli enteropatogenica (EPEC) E. coli enterohemorrágica (EHEC) mediante uso de técnicas moleculares; número de coliformes, Salmonella spp. e a existência dos fungos fitopatogênicos, segundo instrução normativa SDA/MAPA # 27 de 2006. A avaliação microbiológica e determinação de numero de células foi feita usando meios de cultura seletivos e diferenciais. A presença de STEC, EPEC,EHEC, Salmonella spp. e fungos fitopatogênicos foram negativos. Os níveis de coliformes foram de 1160 UFC/g. O índice de germinação (IG) que surge da germinação relativa e da elongação de radículas esteve acima 100%, indicando que o composto contem uma baixa concentração ou não contem sustâncias fitotóxicas. As determinações químicas obtidas apresentaram valores inferiores aos limites definidos pelas diretrizes brasileiras MAPA-SDA 25/09, CONAMA 375/06, e CETESB 195/05. Os resultados mostram que o método de compostagem de carcaças é eficaz para reduzir os microrganismos patogênicos. Entretanto para que o produto possa ser aplicado sobre as culturas usadas para consumo humano e animal, devem ser realizados testes que avaliem a presença de agentes patogênicos virais, tais como vírus da gripe aviária e Newcastle, e de bactérias formadoras de endósporos como Bacillus anthracis. E ... / Abstract: Daily and outbreaks mortality composting have been identified as the best method for final disposal of carcasses, but the potential risk of pathogens transmission seriously limits its use. In this study we assessed the microbiological quality and biosafety of a compost produced in experimental unit composting daily mortality at the university in the state of Sao Paulo, Brazil. Mature compost sample was evaluated to determine the presence of pathogenic bacteria E. coli (STEC) E. coli (EPEC) and E. coli (EHEC) using molecular techniques, the presence and counting of coliforms and Salmonella sp. and several soilborne phytopathogenic fungi was also estimated, the evaluation was conducted using selective and differential microbiological culture media. The presence of STEC, EPEC, Salmonella and phytopathogenic fungi were negative. Coliform levels were 1160 UFC/kg. The results show that daily mortality composting method is effective to reduce pathogenic microorganisms, but so the product can be applied on crops or plants such as vegetables that are for direct human consumption, additional tests must be performed to assess the presence of viral pathogens such as viruses avian influenza and Newcastle, endospores forming bacteria like Bacillus anthracis, should not be included dead animals by neurological diseases confirmed or probable / Mestre

Made available in DSpace on 2014-06-11T19:22:22Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2012-07-27Bitstream added on 2014-06-13T19:07:48Z : No. of bitstreams: 1 honda_sn_me_jabo.pdf: 403807 bytes, checksum: 950b92aa2bbff78a4822b22028a73cd6 (MD5) / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq) / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP) / A carcinicultura é uma atividade que vem se expandindo, assim como o consumo do camarão, considerado um alimento saudável por sua qualidade nutricional. Nesse contexto é importante garantir a oferta de um produto de qualidade microbiológica, que atenda às exigências do mercado alimentício e não ofereça riscos à saúde do consumidor. Assim, objetivou-se verificar a relação entre a contaminação do camarão Macrobrachium amazonicum e o ambiente de criação, além de comparar os resultados obtidos com a legislação vigente. Para tanto, foi verificada a qualidade microbiológica do camarão, sedimento e água do viveiro onde estes foram cultivados, enumerando coliformes totais e termotolerantes e Staphylococcus coagulase positiva, e verificando a presença de Escherichia coli patogênica e Salmonella spp. Os resultados evidenciaram que as amostras de água encontraram-se em conformidade com os limites estabelecidos pela legislação, enquanto que para camarão uma amostra estava fora do limite exigido para Staphylococcus coagulase positiva e para Salmonella spp. as demais apresentavam-se de acordo com a legislação. As amostras de camarão apresentaram correlação com a água e sedimento do viveiro, demonstrando que a contaminação microbiológica do viveiro reflete na qualidade do camarão. O monitoramento da qualidade da água e a adoção do manejo correto na carcinicultura assumem grande importância para garantir a produção de camarões de boa qualidade, atendendo às exigências do mercado para comercialização e a segurança na saúde do consumidor / Shrimp farming is an activity that is expanding, as well as the consumption of shrimp, considered a healthy food due to your nutritional quality. In this context, it is important to ensure the supply of a product of microbiological quality, which meets the requirements of the food market and does not offer risks to consumer health. Thus, this study aim to verify the relationship between contamination of shrimp Macrobrachium amazonicum and culture environment and to compare the results obtained with the Brazilian legislation for water and shrimp. Thereunto, we investigated the microbiological quality of the shrimp, sediment and water of the pond where they were grown, enumerating total and thermotolerant coliforms and Staphylococcus coagulase positive, and investigating the presence of pathogenic Escherichia coli and Salmonella. The water samples were obeying the limits established by legislation, while a sample of shrimp was out of range required for Staphylococcus coagulase positive and for Salmonella all samples were in accordance with the law. Samples of shrimp were correlated with the water and sediment of the pond, showing that the microbiological contamination of the pond reflects the quality of shrimp. The monitoring of water quality and the adoption of the correct management in shrimp farming are very important to ensure that shrimp production of good quality, acordding the market requirements and consumer health safety

Made available in DSpace on 2014-06-11T19:31:00Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2006-04-28Bitstream added on 2014-06-13T20:21:38Z : No. of bitstreams: 1 teixeira_ec_dr_araiq.pdf: 2441746 bytes, checksum: 6a8b98becf92d1426314457c9b30825c (MD5) / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP) / O presente trabalho teve como principal objetivo realizar estudos funcionais na bactéria Xac, estudando o possível envolvimento dos genes copA, copB e cutC no mecanismo de resistência a cobre nesta bactéria. Estes estudos funcionais envolveram: análise da expressão dos genes durante o crescimento na presença de cobre por Northern e Western blots e por eletroforese bi-dimensional, produção e purificação das proteínas recombinantes e produção de anticorpos, inativação de um dos genes (copA) para avaliar a participação da proteína CopA no mecanismo de resistência a cobre e análise da interação das proteínas de resistência a cobre com outras proteínas de Xac através do ensaio de duplo híbrido de leveduras. Os resultados obtidos mostraram que a linhagem mutante infecta a planta, mas os sintomas são mais retardados na presença do metal, quando comparada à linhagem selvagem. O crescimento das células mutantes na ausência e presença de cobre in planta indicou maior sensibilidade ao cobre pelas células mutantes. Na tentativa de verificar se as proteínas CopA, CopB e CutC interagem com outras proteínas de Xac, um ensaio de duplo híbrido de leveduras foi realizado. Através deste ensaio, algumas proteínas foram identificadas, as quais necessitam de estudos de caracterização adicionais. / Xanthomonas axonopodis pv. citri (Xac) is the causal agent of the citrus canker, a serious disease that affects the most commercial citrus cultivars causing serious economic impacts. Symptoms include canker lesions, leading to abscission of fruit and leaves and general tree decline. By sequencing the genome of this bacterium (ONSA Network, FAPESP, Brazil), a better knowledge of this microorganism and its molecular interactions with the host might be elucidated. For this, we analyzed the gene expression during growth in the presence of copper by Northern and Western blots, 2D-electrophoresis, production and purification of the CopA, CopB, and CutC recombinant proteins, inactivation of the copA gene to evaluate the participation of CopA protein in the copper resistance mechanism, and protein-protein interactions assays by the yeast two-hybrid assay. Results showed that the mutant strain infects the plant, but the lesions formation was retarded in the presence of copper. The mutant strain showed more sensitivity to copper than the wild type strain during growth in planta. In order to verify whether the CopA, CopB, and CutC proteins interact with other proteins of Xac, a yeast two-hybrid assay was performed. By this assay, some proteins were identified, which need further characterizations.

Orientador: Saulo Santesso Garrido / Resumo: As leucocinas são peptídeos antimicrobianos, sintetizados no ribossomo de bactérias láticas do gênero Leuconostoc spp que são capazes de inibir microrganismos patogênicos e indicadores higiênico sanitários. Este trabalho tem como objetivo central, testar a atividade antimicrobiana de peptídeos derivados leucocinas em diferentes espécies de microrganismos de interesse na área de contaminação alimentar. Para atingir os objetivos, foram projetados peptídeos com base na estrutura secundária de Leucocinas A- e B-TA33a, os quais foram posteriormente sintetizados pelo método de síntese em fase sólida. As purificações dos peptídeos foram realizadas por cromatografia líquida de alta eficiência e a caracterização das moléculas por meio de espectrometria de massas. O análogo nativo LeuB, apresentou maior porcentagem de inibição de crescimento de Salmonella sorovar Typhimurium (71%) e Escherichia coli O157:H7 (69%). O análogo LeuA1 apresentou maior inibição contra as bactérias Listeria monocytogenes (79%) e Staphylococcus aureus (96%) e o análogo LeuAB2 para Pseudomonas aeruginosa (91%). Neste trabalho, evidencia-se ação bacteriostática para todos os peptídeos e ação parcialmente sinérgica entre os peptídeos LeuB e LeuA1, pelo ensaio de Cherckerboard (ΣCIF ≤ 0,75) contra Listeria monocytogenes. No ensaio de inibição enzimática o peptídeo LeuB, foi capaz de inibir a atividade da enzima DNA Girase e Topoisomerase IV a partir de 100 μg/mL e o LeuA1 inibiu a atividade de relaxamento da Topoi... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: Leucocins are antimicrobial peptides, synthesized on the ribosome of lactic acid bacteria of the genus Leuconostoc that ar e capable of inhibiting pathogenic and / or deteriorating microorganisms. This work aims to test the antimicrobial activity of peptides derived from leucocins in different species of microorganisms of interest in food contamination scenario. Peptides were d esigned based on the secondary structure of Leucocin A - and B - TA33a, which were later synthesized by the solid - phase synthesis method. Peptide purifications were performed by high performance liquid chromatography and the characterization of the molecules was performed by mass spectrometry. The native analog LeuB showed a higher percentage of growth inhibition against Salmonella sorovar Typhimurium (71%) and Escherichia coli O157: H7 (69%). The LeuA1 analog showed the highest inhibition against the bacteria Listeria monocytogenes (79%) and Staphylococcus aureus (96%) while the LeuAB2 analogue presented highest inhibition against Pseudomonas aeruginosa (91%). In this work, the bacteriostatic action for all peptides and partially synergistic action between the LeuB and LeuA1 peptides were evidenced by the Cherckerboard test ( Σ CIF ≤ 0.75) against Listeria monocytogenes . In the enzymatic inhibition assay the LeuB peptide was able to inhibit the activity of the DNA Girase enzyme from 100 μg / ml and inhibit Topoisomerase IV from 100 μg / ml. LeuA1 inhibited the relaxation activit y of Topoisomerase ... (Complete abstract click electronic access below) / Doutor

Resumo: Recentemente, em dois campos comerciais de tomateiro dos tipos Salada e Italiano, localizados respectivamente em Bragança Paulista e Mogi Guaçú, SP, foram observados sintomas de queima generalizada nas folhas. Em observações ao microscópio óptico de tecidos infectados foi constatada a presença de exsudação bacteriana. Isolamentos realizados em meio de cultura permitiram obter bactérias com formato bastonete, Gramnegativas, com colônias de coloração branca e produtoras de pigmento fluorescente em meio B de King. Isolados bacterianos foram submetidos a testes bioquímicos e fisiológicos, entre eles, LOPAT, sendo enquadrados no grupo III de LOPAT (- + - - +) e, portanto, identificados como sendo Pseudomonas cichorii. Esses resultados foram corroborados por testes serológicos de imunofluorescência indireta, com antissoros produzidos para isolado tipo de P. cichorii. Esta bactéria causa doença em várias culturas de importância econômica e ainda não havia sido constatada em nosso país, na cultura do tomateiro. Isolados bacterianos encontramse depositados na Coleção de Culturas de Fitobactérias do Instituto Biológico, sob os números de acesso IBSBF 2309 e IBSBF 2323. Foram desenvolvidos também estudos visando a determinação da gama de hospedeiras e a reação de 28 genótipos de tomateiro aos isolados de P. cichorii. Plantas de abobrinha, alface, beldroega, berinjela, beterraba, cenoura, couvebrócolo, datura, fumo, girassol, jiló, melão, pepino, petúnia, pimentão, rabanete, repolho, rúcula, salsa e tomateiro, no estágio de um par de folhas verdadeiras, foram inoculadas por pulverização com os isolados IBSBF 2309 e IBSBF 2323 e um isolado de P. cichorii de girassol (GIR-1). Os isolados IBSBF 2309 e IBSBF 2323 mostraram-se patogênicos à beldroega, à datura, ao girassol, ao pimentão e ao tomateiro, enquanto que o isolado de girassol foi... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: Recently, generalized blight symptoms were observed in tomato leaves of the Salada and Italiano types, in two commercial fields located, respectively, in Bragança Paulista and Mogi Guaçú, SP, Brazil. The presence of bacterial exudation was verified in observations of infected tissues under the optical microscope. Rod-shaped, Gram-negative bacteria were obtained from isolations in culture medium; the colonies were white and produced fluorescent pigment in King's B medium. Bacterial isolates were submitted to biochemical and physiological tests, including LOPAT, and were classified into LOPAT group III (- + - - +); consequently, they were identified as Pseudomonas cichorii. These results were corroborated by indirect immunofluorescence tests, using antisera produced for the type isolate of P. cichorii. This bacterium causes diseases in several crops of economic importance and had not yet been observed in tomato in Brasil. Bacterial isolates were deposited in Phytobacteria Culture Collection of Instituto Biológico, under accession numbers IBSBF 2309 and IBSBF 2323. Studies were also carried out in order to determine the host range and reaction of 28 tomato genotypes to P. cichorii isolates. Caserta pumpkin, lettuce, purslane, eggplant, beet, broccoli, carrot, Jimson weed, sunflower, tobacco, scarlet eggplant, melon, cucumber, petunia, green pepper, radish, cabbage, arugula, parsley, and tomato plants, all with one pair of true leaves, were spray-inoculated with isolates IBSBF 2309 and IBSBF 2323 and one P. cichorii isolate from sunflower (GIR-1). Isolates IBSBF 2309 and IBSBF 2323 were pathogenic to purslane, Jimson weed, sunflower, green pepper, and tomatoe, while the sunflower isolate was only pathogenic to purslane, Jimson weed, and sunflower, but not to green pepper or... (Complete abstract click electronic access below) / Orientador: Antonio Carlos Maringoni / Coorientador: Luís Otávio Saggion Beriam / Banca: Margarida Fumiko Ito / Banca: Ricardo Gioria / Mestre

Orientador: Alexandre Secorun Borges / Banca: Marcio Garcia Ribeiro / Banca: Carla Bargi Belli / Resumo: A diarreia é um grave problema em potros até seis meses de vida, acarretando em prejuízos na equideocultura. Sendo assim os objetivos desta pesquisa foram realizar o estudo clínico e a identificação dos principais enteropatógenos e fatores de virulência, responsáveis pela diarreia em potros. Foram avaliados 56 potros com diarreia (GD) e 60 sem diarreia (GC) até 90 dias de vida. Foram realizados hemogasometria e hemograma dos animais do GD. Amostras fecais dos potros do GD e GC foram utilizadas para a identificação dos enteropatógenos. As principais alterações clínicas nos animais GD foram aumento da peristalse e da frequência de defecação (100,0%) e desidratação (67,8%). A hiperfibrinogenemia (26,8%), leucocitose (12,5%), linfocitose (37,5%) e neutrofilia (17,8), acidose metabólica (16%) e diminuição de bicarbonato (16%) foram os principais achados hematológicos. Ao menos um dos enteropatógenos pesquisados foi detectado no GD (50/56) e GC (48/60). Em 32% (16/50) das amostras positivas foi identificado um único enteropatógeno, enquanto que dois ou mais enteropatógenos foram detectados em 68% (34/50) das amostras. E. coli apresentou a maior frequência nos isolamentos dos potros com diarreia (62,5%), seguida da Salmonella spp. (25%); Strongyloides (25%); estrongilídeos (10,7%); Clostridium perfringens (10,7%); Rhodococcus equi (7,1%); Cryptosporidium spp. (5,4%); Clostridium difficile (1,8%); coronavírus (1,8%); Giardia sp. (1,8%). Conclui-se que a identificação dos animais desidratados e com graves alterações hidroeletrolíticas, bem como a necessidade de se detectar os agentes etiológicos e seus fatores de virulência, são importantes para direcionar o médico veterinário a definir medidas de controle e terapêutica adequados / Abstract: Diarrhea is a serious problem in foals up to six months old, resulting in losses in equine business. The aims of this research were to perform the clinical study and the identification of main pathogens and virulence factors responsible for diarrhea in foals. A total of 56 foals with diarrhea (DG) and and 60 without diarrhea (CG) up to 90 days old were evaluated. Fecal samples of a (DG) and 60 without diarrhea (GC) up to 90 days old were evaluated. Hemogram and hemogasometry were performed in the animals of DG. Fecal samples of DG and GC were used to identify the enteropathogens. The main clinical findings in animals of GD were increased peristalsis and defecation frequency (100,%) and dehydration (67.8%). Hyperfibrinogenemia (26.8%), leukocytosis (12.5%), lymphocytosis (37.5%) and neutrophilia (17.8%), metabolic acidosis (16%) and decreased bicarbonate (16%) were the main hematologic findings. At least one of the enteropathogens studied was detected in DG (50/56) and in CG (48/60). In 32% (16/50) of positive samples was identified a single enteropathogen, while two or more enteropathogens were detected in 68% (34/50) of samples. E. coli showed the highest frequency in the isolations of foals with diarrhea (62.5%), followed by Salmonella spp. (25%); Strongyloides (25%); Strongyles (10.7%); C. perfringens (10.7%), Rhodococcus equi (7.1%); Cryptosporidium spp. (5.4%); C. difficile (1.8%), coronavirus (1.8), Giardia sp. (1.8%). In conclusion the identification of dehydrated animals and animals with severe electrolyte alterations as well as the need to detect the etiologic agents and their virulence factors are important to conduct the veterinarian to define control measures and appropriate therapy / Mestre