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Indicadores de qualidade do sistema de preparo do solo para a cultura de citros /Vidal, Diego Onofre. January 2013 (has links)
Orientador: Rouverson Pereira da Silva / Banca: Teresa Cristina Tarlé Pissarra / Banca: Jorge Wilson Cortez / Resumo: O preparo do solo para o transplantio das mudas de citros do viveiro para o campo afeta diretamente a longevidade, produtividade, saúde fitossanitária e também as operações mecanizadas que deverão ser executadas para garantir o manejo da cultura.O presente trabalho foi desenvolvido com o objetivo avaliar dois sistemas de preparo do solo para o transplantio de citros, por meio da avaliação de indicadores de qualidade e do estudo de tempos e movimentos. O experimento foi conduzido no município de Matão - São Paulo, o delineamento experimental inteiramente casualizado, sendo avaliados dois sistemas mecanizados para o preparo do solo (convencional e conjugado) para o transplantio de citros, com 66 repetições para cada tratamento. Foram avaliados como indicadores de qualidade a patinagem dos rodados do trator, a velocidade de deslocamento e a acurácia do receptor GPS. Também foi realizado um estudo de tempos e movimentos das operações. O sistema de preparo do solo conjugado apresentou o melhor desempenho operacional / Abstract: The soil preparation for planting the seedlings of citrus nursery to the field directly affects longevity, productivity, health and phytosanitary also mechanized operations that must be performed to ensure the crop management. This study was developed to evaluate two systems of soil preparation for transplanting citrus, through the evaluation of quality indicators and the study of time and motion. The experiment was conducted in the municipality of Matão - São Paulo, completely randomized, and evaluated two mechanized systems for soil tillage (conventional and conjugate) for transplanting citrus, with 66 replicates for each treatment. Were evaluated as indicators of quality skating wheels of the tractor, the scroll speed and accuracy of GPS. Also a study of time and motion operations. The system of tillage conjugate showed the best operational performance / Mestre
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Desenvolvimento de laranjeira valência e caracterização de atributos do solo sob aplicação de cinza do bagaço de cana /Yamane, Danilo Ricardo. January 2013 (has links)
Orientador: José Eduardo Corá / Coorientador: Dirceu de Mattos Junior / Banca: Antonio Baldo Geraldo Martins / Banca: Simone Rodrigues da Silva / Resumo: Grande quantidade de cinza do bagaço de cana-de-açúcar é produzida no estado de São Paulo. Seu destino final tem sido o solo, contudo, sem a consideração de critérios técnicos estabelecidos com base em estudos para o reaproveitamento e uso para a produção agrícola. O presente trabalho teve como objetivos avaliar os efeitos da aplicação de cinza do bagaço de cana-de-açúcar nos atributos químicos do solo, na emissão de CO2 do solo, e no estado nutricional, atividade fisiológica e desenvolvimento de plantas jovens de laranjeira Valência. O delineamento experimental utilizado foi o de blocos ao acaso com 5 tratamentos e 5 repetições, que consistiram na aplicação da cinza na superfície do solo e sem incorporação (0, 5, 10, 20 e 40 t ha-1 em base seca). O solo foi amostrado para determinação de características químicas aos 6 e 12 meses após a aplicação dos tratamentos. O estado nutricional das plantas foi avaliado após 12 meses, e o seu desenvolvimento após 8, 10 e 12 meses. As determinações da emissão de CO2 do solo e das trocas gasosas nas folhas das laranjeiras foram realizadas em dois períodos distintos, referente a uma época úmida e outra seca. A cinza do bagaço de cana-de-açúcar foi caracterizada principalmente como uma fonte de potássio. Os teores de potássio no solo aumentaram linearmente em função do incremento das doses da cinza. A máxima concentração estimada de potássio nas folhas, equivalente a 17,4 g kg-1, foi obtida na dose de 22,4 t ha-1. O incremento no teor foliar de potássio foi acompanhado por decréscimos nas concentrações de cálcio e boro nas folhas. As doses de cinza não influenciaram a concentração de metais pesados (As, Cr e Ni) no solo, folhas e frutos. Não houve efeitos da aplicação da cinza na emissão do CO2 do solo. A condutância estomática, transpiração e taxa de fotossíntese nas folhas das laranjeiras ... / Abstract: Large amount of sugarcane bagasse ash is produced in São Paulo state. Its final destination has been on the soil, however, without consideration of technical criteria based on the studies for the reutilization and use for agricultural production. The objectives of this work were to evaluate the effects of the application of sugarcane bagasse ash on soil chemical attributes, emissions of CO2 from the soil, and nutritional status, physiological activity and development of young Valencia orange trees. The experimental design used was a randomized block with five treatments and five replicates, which consisted of application of ash on the soil surface, without incorporation (0, 5, 10, 20, and 40 t ha-1 on a dry basis). The soil was sampled to determine chemical characteristics at 6 and 12 months after treatment application. The nutritional status of the plants was evaluated after 12 months, and its development after 8, 10 and 12 months. Determinations of CO2 emissions from the soil and leaf gas exchange of the orange trees were carried out in two distinct periods, referring to a wet and a dry season. The sugarcane bagasse ash was characterized mainly as a source of potassium. The K concentration on the soil increased linearly with increasing rates of ash. The maximum estimated concentration of potassium in the leaves, equivalent to 17.4 g kg-1, was obtained at the dose of 22.4 t ha-1. The increase of foliar potassium concentration was accompanied by decreases in the concentration of calcium and boron in the leaves. The doses of ash did not influence the concentration of heavy metals (As, Cr and Ni) on soil, leaves and fruits. There were no effects of application of ash on soil CO2 emission. The stomatal conductance, transpiration and photosynthesis in the leaves of orange trees increased linearly with increasing doses of the residue in the dry season (winter). The development of the orange trees ... / Mestre
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Consumo e custo de energia elétrica na cultura de citros irrigada por gotejamento e microaspersão, com três lâminas de águaVescove, Humberto Vinicius [UNESP] 06 February 2009 (has links) (PDF)
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vescove_hv_dr_jabo.pdf: 630243 bytes, checksum: b66c2dbcbb17475abf180fe7521ce34a (MD5) / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) / O objetivo deste trabalho foi analisar o consumo, o custo de energia elétrica e resultado econômico em citros (Citrus sinensis) irrigado. Os tratamentos constaram de sistemas de irrigação do tipo gotejamento, com uma e duas linhas laterais de distribuição de água, microaspersão e um tratamento sem irrigação. Para cada sistema foram utilizadas três lâminas de água; 100%, 75% e 50% da Etc (evapotranspiração da cultura). Foi estudado o custo da energia elétrica para dois grupos tarifários, Grupo A e Grupo B. No grupo A foram determinados os dispêndios com a energia para tarifas Estrutura Binômia Convencional e Horo-Sazonal (verde e azul), além, da tarifa especial para irrigante noturno. Os preços de demanda e kWh dos sistemas tarifários foram obtidos no site CPFL (Companhia Paulista de Força e Luz). A menor relação entre o consumo de energia elétrica por ha (kWh.ha-1) e a produtividade (t) foi obtida nos tratamentos irrigados com 50% da Etc. O sistema tarifário horosazonal verde/azul Grupo A irrigante noturno teve o menor custo de energia. Os tratamentos irrigados com lâmina de 50% apresentaram maiores produtividade em relação à lâmina de 100% da Etc. O maior retorno econômico ocorreu nos tratamentos irrigados com 50% da Etc. / The objective of this work is to analyze the consumption, the electric energy cost, and the economic results in irrigated citros (Citrus sinensis). The procedures used consisted of a dripping equipment, with one and two lateral lines of water distribution, a micro sprinkler as well as a treatment without irrigation. For each system of irrigation, three water depths have been used; 100%, 75% and 50% of Etc (citrus evapotranspiration). The electric energy cost was studied for two tariff groups, Group A and Group B. For the Group A it was determined the expenses with the energy for the tariffs Binômia Structure Convencional and Horo-Sazonal (green and blue), besides the special tariff for nocturnal irrigation. The prices of the kWh tariff were obtained from the CPFL site ( power company of Sao Paulo, Brazil). The best relation between the consumption of electric energy (kWh.ha-1) and the productivity (t.ha-1) occurred when the irrigation is done with 50% of the Etc. The tariff system Horo-Sazonal green and blue of the Group A, with nocturnal irrigation, showed the smaller energy cost. The irrigated treatments with depth of 50% have presented higher productivity than those of 100% of Etc. Higher economical returns are achieved when the treatments irrigated with 50% of the Etc are chosen.
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Consumo e custo de energia elétrica na cultura de citros irrigada por gotejamento e microaspersão, com três lâminas de água /Vescove, Humberto Vinicius. January 2009 (has links)
Orientador: José Eduardo Pitelli Turco / Banca: Luiz Antonio Rossi / Banca: Odivaldo José Seraphim / Banca: José Carlos Barbosa / Banca: João Antonio Galbiatti / Resumo: O objetivo deste trabalho foi analisar o consumo, o custo de energia elétrica e resultado econômico em citros (Citrus sinensis) irrigado. Os tratamentos constaram de sistemas de irrigação do tipo gotejamento, com uma e duas linhas laterais de distribuição de água, microaspersão e um tratamento sem irrigação. Para cada sistema foram utilizadas três lâminas de água; 100%, 75% e 50% da Etc (evapotranspiração da cultura). Foi estudado o custo da energia elétrica para dois grupos tarifários, Grupo A e Grupo B. No grupo A foram determinados os dispêndios com a energia para tarifas Estrutura Binômia Convencional e Horo-Sazonal (verde e azul), além, da tarifa especial para irrigante noturno. Os preços de demanda e kWh dos sistemas tarifários foram obtidos no site CPFL (Companhia Paulista de Força e Luz). A menor relação entre o consumo de energia elétrica por ha (kWh.ha-1) e a produtividade (t) foi obtida nos tratamentos irrigados com 50% da Etc. O sistema tarifário horosazonal verde/azul Grupo A irrigante noturno teve o menor custo de energia. Os tratamentos irrigados com lâmina de 50% apresentaram maiores produtividade em relação à lâmina de 100% da Etc. O maior retorno econômico ocorreu nos tratamentos irrigados com 50% da Etc. / Abstract: The objective of this work is to analyze the consumption, the electric energy cost, and the economic results in irrigated citros (Citrus sinensis). The procedures used consisted of a dripping equipment, with one and two lateral lines of water distribution, a micro sprinkler as well as a treatment without irrigation. For each system of irrigation, three water depths have been used; 100%, 75% and 50% of Etc (citrus evapotranspiration). The electric energy cost was studied for two tariff groups, Group A and Group B. For the Group A it was determined the expenses with the energy for the tariffs Binômia Structure Convencional and Horo-Sazonal (green and blue), besides the special tariff for nocturnal irrigation. The prices of the kWh tariff were obtained from the CPFL site ( power company of Sao Paulo, Brazil). The best relation between the consumption of electric energy (kWh.ha-1) and the productivity (t.ha-1) occurred when the irrigation is done with 50% of the Etc. The tariff system Horo-Sazonal green and blue of the Group A, with nocturnal irrigation, showed the smaller energy cost. The irrigated treatments with depth of 50% have presented higher productivity than those of 100% of Etc. Higher economical returns are achieved when the treatments irrigated with 50% of the Etc are chosen. / Doutor
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Transmissibilidade da leprose das cercas-vivas, quebra-ventos e plantas daninhas para citros através de Brevipalpus phoenicis (Geijskes, 1939) (Acari: Tenuipalpidae) /Maia, Ozana Maria de Andrade. January 2002 (has links)
Orientador: Carlos Amadeu Leite de Oliveira / Banca: Francisco Jorge Cividanes / Banca: Wilson Badiali Crocomo / Resumo: No Brasil, Brevipalpus phoenicis (Geijskes, 1939) é vetor da leprose na cultura dos citros, doença responsável por significativa redução na produtividade. Objetivou-se avaliar, a capacidade de colonização de B. phoenicis sobre cercas-vivas, quebra-ventos e plantas daninhas, e a potencialidade destas como hospedeiras do vírus da leprose. Realizou-se a colonização das plantas com ácaros procedentes de uma criação-estoque sobre frutos de citros Pêra-rio, para as seguintes plantas hospedeiras intermediárias: Hibiscus sp., Malvaviscus mollis, Grevillea robusta, Mimosa caesalpiniaefolia, Bixa orellana, Euphorbia splendens, Bidens pilosa, Commelina benghalensis, Sida cordifolia, Ageratum conyzoides e Citrus sinensis. Constatou-se que a exceção de E. splendens, todas comportaram-se como hospedeiras do ácaro. Ácaros contaminados, procedentes da criação-estoque, após serem transferidos e confinados em arenas delimitadas nas plantas hospedeiras intermediárias, por um período de 7 dias, não perderam a capacidade de transmitir o vírus para mudas cítricas de Valência e Natal. Ácaros não contaminados que tiveram acesso alimentar por 3 dias nessas mesmas arenas, somente se contaminaram e transmitiram o vírus para mudas de citros, aqueles que se alimentaram sobre: C. benghalensis, S. cordifolia, A. conyzoides, B. pilosa, B. orellana e C. sinensis. Resultados semelhantes foram conseguidos com ácaros criados, por um período de 90 dias, sobre as mesmas plantas hospedeiras intermediárias, inicialmente infestadas com ácaros contaminados também procedentes da criação-estoque. / Abstract: In Brazil, Brevipalpus phoenicis (Geijskes, 1939) is a vector of the leprosis in the culture of citrus, a disease that causes significant reduction in the productivity. In this work it was evaluated the B. phoenicis capacity of settling on common fence-lives, windbreaks and weeds, and their potentiality as hosts to the leprosis virus. The colonization of the plants was carried out with mites coming from a stock creation on fruits of "Pêra-rio" citrus, for the following intermediate host plants: Hibiscus sp., Malvaviscus mollis, Grevillea robust, Mimosa caesalpiniaefolia, Bixa orellana, Euphorbia splendens, Bidens pilosa, Commelina benghalensis, Sida cordifolia, Ageratum conyzoides and Citrus sinensis. It was verified that, except for the E. splendens, all species showed to be favorable to the B. phoenicis population growth. Infected mites, coming from the stock creation, that were transferred and confined in delimited arenas in the intermediate host plants for a period of 7 days, did not lose their capacity to transmit the virus for citric seedlings of "Valência" and "Natal". Non infected mites, that had access to feed for 3 days in the same arenas, became only infected and transmitted the virus for citrus seedlings that fed on: C. benghalensis, S. cordifolia, A. conyzoides, B. pilosa, B. orellana and C. sinensis. Similar results were obtained using mites created, for a period of 90 days, on the same intermediate host plants that were initially infested with infected mites coming from the same stock creation. / Mestre
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Parâmetros fisiológicos de laranjeiras com Huanglongbing /Saccini, Vanessa Aparecida Villanova. January 2013 (has links)
Orientador: Durvalina Maria Mathias dos Santos / Coorientador: Camilo Lázaro Medina / Banca: Antonio Baldo Geraldo Martins / Banca: Dirceu de Mattos Júnior / Resumo: O huanglongbing (HLB) é considerada a mais severa doença em citros, foi constatada no Brasil em 2004 e desde então tem causado sérios danos à citricultura do país, podendo colocar em risco esse importante setor do agronegócio brasileiro. A doença é causada por bactérias limitadas ao floema. Os sintomas típicos das plantas são mosqueamento, ramos amarelos, frutos deformados e pequenos. Obstruções no floema, comuns no processo infeccioso também podem afetar a fotossíntese e as relações hídricas. Os sintomas do HLB podem ser mascarados por outros sintomas gerados a partir de algumas doenças, além do mais, tais sintomas podem ser confundidos com algumas deficiências minerais. O trabalho teve como objetivo verificar os efeitos do HLB no processo fotossintético, condutância estomática, transpiração, potencial hídrico e no conteúdo mineral das flores, folhas e ramos, em plantas de laranja 'Valência', visando conhecer as respostas fisiológicas nas plantas infectadas pela doença. Os tratamentos consistiram em plantas sadias; plantas doentes assintomáticas e plantas doentes sintomáticas. As trocas gasosas e relações hídricas foram medidas em dez/2011 e mar/2012. Para a estimativa da taxa de assimilação de carbono (A), condutância estomática (gs) e transpiração (E) foram selecionadas folhas de 8 a 9 meses de idade, porém evitou-se folhas com sintomas severos nas plantas sintomáticas, essas medidas foram realizadas às 8:00, 12:00 e 15:00 h. O potencial da água das folhas (Ψf) foi medido às 6:00 e 14:00 h, foram selecionados ramos com três folhas cada. Foram realizadas seis avaliações nutricionais para folhas e ramos, com intervalos de 30 dias cada, e as flores foram avaliadas apenas em Nov/2011. Os resultados evidenciaram que, A não foi alterada pela doença, mas a gs e a E apresentaram redução em plantas doentes, sintomáticas e assintomáticas, na ... / Abstract: The huanglongbing (HLB) is considered one of the most severe diseases of citrus. Since its discovery in Brazil in 2004, it has caused serious damage to the citrus production and industry in the country, making vulnerable this important sector of the Brazilian agribusiness. This disease is caused by phloemrestricted bacteria. Typical symptoms of plants are mottled, yellow branches, and small deformed fruits. Infected trees show phloem obstructions, which can also affect photosynthesis and water relations. The symptoms of HLB may be masked by other symptoms generated from some diseases, moreover, such symptoms can be confused with some mineral deficiencies. The objective of this study was to investigate the effects of HLB in the photosynthetic process, stomatal conductance, transpiration, water potential and mineral content of the flowers, leaves and branches on orange trees [Citrus sinensis (L.) Osbeck, 'Valencia'], to determine the physiological responses in plants infected by the disease. The treatments consisted of healthy plants, plants asymptomatic patients and symptomatic diseased plants. Gas exchange and water relations were measured in December/2011 and March/2012. To estimate the rate of carbon assimilation (A), stomatal conductance (gs) and transpiration (E) were selected leaves 8-9 months old, but was avoided leaves with severe symptoms in symptomatic plants, these measurements were performed 8:00 a.m., 12:00 a.m. and 3:00 p.m. The leaf water potential (Ψf) was observed during two day periods, at 6:00 a.m. and 2:00 p.m. Nutritional assessments were carried out for six leaves and branches, with intervals of 30 days each, and the flowers were evaluated only in November/2011. The results showed that A was not affected by the disease, but gs and E decreased in symptomatic and asymptomatic diseased plants, in the second evaluation. There was a reduction in Ψf at 2:00 p.m. Once ... / Mestre
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Determinación experimental del balance hídrico del suelo y evaluación de la contaminación asociada a las prácticas agrícolasTuñón Colom, Juan 30 March 2000 (has links)
En este trabajo se aborda la problemática de la afección de la actividad agrícola sobre los recursos hídricos del acuífero de la Plana de Castellón, con énfasis en algunos aspectos que presentaban lagunas de conocimiento, bien porque no se les había prestado la atención necesaria o bien porque constituían nuevos escenarios hasta ahora no contemplados.El estudio hidrogeoquímico general del aquífero ha permitido conocer dos hechos de indudable transcendencia: el control estructural ejercido sobre la alimentación lateral subterránea, que es bicarbonatada-cálcica en el sector septentrional y sulfatada cálcico-magnésicas en el sector meridional, y el proceso incipiente de intrusión marina en el sector de la desembocadura del río Mijares.La aplicación de diversos métodos para el cálculo de la evapotranspiración y su comparación son los resultados obtenidos experimentalmente en la estación lisimétrica han puesto de manifiesto que las cifras tradicionalmente admitidas, que estaban basadas en estimaciones o en cálculos empíricos poco consistentes, no son realistas y que tanto la evapotranspiración real como el retorno del riego son sensiblemente diferentes a los aceptados. Es necesario, por consiguiente, replantear esta cuestión y realizar nuevas estimaciones del balance hídrico del acuífero si se quieren cuantificar fiablemente los recursos disponibles.La aplicación de fertilizantes nitrogenados es, sin duda, la principal causa de las elevadas concentraciones de nitratos en las aguas subterráneas, pero la lixiviación afecta a un porcentaje muy inferior al estimado anteriormente.Independientemente de los sulfatos procedentes de flujos regionales, que pueden afectar localmente al acuífero, las mayores entradas corresponden a la lixiviación de los fertilizantes sulfatados que se aplican en cantidades muy superiores a las necesarias.El riego con agua residual depurada presenta serios problemas de salinización y sodificación del suelo, e incrementa la mineralización del agua recirculada con el consiguiente deterioro de la calidad del agua subterránea.
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Parâmetros fisiológicos de laranjeiras com HuanglongbingSaccini, Vanessa Aparecida Villanova [UNESP] 04 July 2013 (has links) (PDF)
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000739232.pdf: 443929 bytes, checksum: 011f20c2432046f54d111a2b0c66aab5 (MD5) / O huanglongbing (HLB) é considerada a mais severa doença em citros, foi constatada no Brasil em 2004 e desde então tem causado sérios danos à citricultura do país, podendo colocar em risco esse importante setor do agronegócio brasileiro. A doença é causada por bactérias limitadas ao floema. Os sintomas típicos das plantas são mosqueamento, ramos amarelos, frutos deformados e pequenos. Obstruções no floema, comuns no processo infeccioso também podem afetar a fotossíntese e as relações hídricas. Os sintomas do HLB podem ser mascarados por outros sintomas gerados a partir de algumas doenças, além do mais, tais sintomas podem ser confundidos com algumas deficiências minerais. O trabalho teve como objetivo verificar os efeitos do HLB no processo fotossintético, condutância estomática, transpiração, potencial hídrico e no conteúdo mineral das flores, folhas e ramos, em plantas de laranja ‘Valência’, visando conhecer as respostas fisiológicas nas plantas infectadas pela doença. Os tratamentos consistiram em plantas sadias; plantas doentes assintomáticas e plantas doentes sintomáticas. As trocas gasosas e relações hídricas foram medidas em dez/2011 e mar/2012. Para a estimativa da taxa de assimilação de carbono (A), condutância estomática (gs) e transpiração (E) foram selecionadas folhas de 8 a 9 meses de idade, porém evitou-se folhas com sintomas severos nas plantas sintomáticas, essas medidas foram realizadas às 8:00, 12:00 e 15:00 h. O potencial da água das folhas (Ψf) foi medido às 6:00 e 14:00 h, foram selecionados ramos com três folhas cada. Foram realizadas seis avaliações nutricionais para folhas e ramos, com intervalos de 30 dias cada, e as flores foram avaliadas apenas em Nov/2011. Os resultados evidenciaram que, A não foi alterada pela doença, mas a gs e a E apresentaram redução em plantas doentes, sintomáticas e assintomáticas, na ... / The huanglongbing (HLB) is considered one of the most severe diseases of citrus. Since its discovery in Brazil in 2004, it has caused serious damage to the citrus production and industry in the country, making vulnerable this important sector of the Brazilian agribusiness. This disease is caused by phloemrestricted bacteria. Typical symptoms of plants are mottled, yellow branches, and small deformed fruits. Infected trees show phloem obstructions, which can also affect photosynthesis and water relations. The symptoms of HLB may be masked by other symptoms generated from some diseases, moreover, such symptoms can be confused with some mineral deficiencies. The objective of this study was to investigate the effects of HLB in the photosynthetic process, stomatal conductance, transpiration, water potential and mineral content of the flowers, leaves and branches on orange trees [Citrus sinensis (L.) Osbeck, 'Valencia'], to determine the physiological responses in plants infected by the disease. The treatments consisted of healthy plants, plants asymptomatic patients and symptomatic diseased plants. Gas exchange and water relations were measured in December/2011 and March/2012. To estimate the rate of carbon assimilation (A), stomatal conductance (gs) and transpiration (E) were selected leaves 8-9 months old, but was avoided leaves with severe symptoms in symptomatic plants, these measurements were performed 8:00 a.m., 12:00 a.m. and 3:00 p.m. The leaf water potential (Ψf) was observed during two day periods, at 6:00 a.m. and 2:00 p.m. Nutritional assessments were carried out for six leaves and branches, with intervals of 30 days each, and the flowers were evaluated only in November/2011. The results showed that A was not affected by the disease, but gs and E decreased in symptomatic and asymptomatic diseased plants, in the second evaluation. There was a reduction in Ψf at 2:00 p.m. Once ...
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Análise da expressão gênica global da bactéria Xylella fastidiosa em laranja doce por microarranjos de DNAFederici Rodriguez, María Teresa [UNESP] 25 February 2011 (has links) (PDF)
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federicirodriguez_mt_dr_jabo.pdf: 2411830 bytes, checksum: 75b14273eb9f16da6c18c46ba363a68d (MD5) / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) / Foi construído um microarranjo com as 2600 ORFs identificadas no projeto de sequenciamento da bactéria Xylella fastidiosa estirpe 9a5c, e utilizado para analisar diferenças na expressão gênica global da bactéria dentro de uma laranja doce suscetível (Pera) e uma tolerante (cultivar Navelina ISA 315). Foram achados mais genes diferencialmente expressos envolvidos na degradação, reguladores, componentes de membrana, adesinas tipo fímbrias, transportadores, elementos genéticos móveis e genes de patogenicidade na variedade sintomática. Assim, na cultivar Navelina ISA 315, foram diferencialmente expressos mais genes relacionados com a resposta ao estresse, seja detoxificação de espécies reativas do oxigênio ou proteínas chaperonas, assim como uma adesina do tipo hemaglutinina. Isso sugere diferenças na agregação celular e composição do biofilme assim como um maior estresse da bactéria na cultivar tolerante, provocado pelas próprias defesas da planta ou por microrganismos endofíticos que estão competindo com a X. fastidiosa. A técnica de microarranjos foi validada pela RT-qPCR, e apresentou-se como uma ferramenta poderosa na análise das mudanças na expressão gênica da bactéria X. fastidiosa em plantas de laranja doce in vivo, apresentando uma visão mais real da natureza do que os sistemas in vitro, que não a conseguem imitar completamente. Foram levantadas neste trabalho algumas hipóteses sobre os mecanismos de patogenicidade mas no entanto, mais pesquisas ainda são necessárias para lograr melhor compreensão dos mecanismos de patogenicidade e das interações patógeno-hospedeiro / A DNA microarray was constructed containing 2600 ORFs identified by the Genome sequencing project of Xylella fastidiosa 9a5c strain, and used to check global gene expression differences in the bacteria within a susceptible and a tolerant sweet orange plant, the variety Pera and the cultivar Navelina ISA 315, respectively. More genes related to degradation, regulation, membrane components, fimbrial adhesins, transport, genetic mobile elements and patogenicity genes were differentially expressed in Pera variety. On the other hand, in the cultivar Navelina ISA 315, more genes related to stress response, detoxification of oxygen reactive species or other substances, “heat shock” proteins, as well as an adhesin of the hemagglutinin type, suggesting differences in cellular aggregation and biofilm composition, as well as a higher estress of the bacteria in tolerant cultivar, produced either by plant defenses or by endophitic microorganisms which are competing with X. fastidiosa. This “handmade” DNA microchip was validated by RT-qPCR, and has revealed as a powerful technique for the analysis of global changes in gene expression of X. fastidiosa in sweet orange plants in vivo, generating a more real image of what is happening in nature than in vitro systems which would never reproduce nature conditions exactly. Some hypotheses were raised in this study about patogenicity mechanisms, therefore, more research is still necessary to achieve a better understanding of pathogenicity mechanisms and host-pathogen interactions
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Transcriptoma da interação de tangerina satsuma (Citrus unshiu) e laranja doce Hamlin (Citrus sinensis) infectadas com Xanthomonas citri subsp. citri, agente causal do cancro cítricoMurata, Mayara Mari [UNESP] 19 July 2013 (has links) (PDF)
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000819205.pdf: 7820938 bytes, checksum: b4045f963c89f07ea3405904f9001074 (MD5) / O cancro cítrico, causado pela bactéria Xanthomonas citri subsp. citri (Xac), é uma das principais doenças que acometem a citricultura mundial e ataca uma ampla gama de espécies comerciais de citros, causando perdas significativas nos países produtores. A espécie de laranja doce Hamlin (Citrus sinensis) é suscetível ao cancro cítrico, enquanto a espécie de tangerina Satsuma (Citrus unshiu) é resistente. Para compreender os mecanismos moleculares relacionados aos sistemas de defesa ativados pela planta é importante identificar as alterações transcricionais de cada espécie vegetal sob estresse fitopatogênico, a fim de desvendar os elementos moleculares que são específicos de cada espécie. O objetivo do presente trabalho foi realizar uma análise comparativa temporal do transcriptoma de duas espécies cítricas contrastantes em resposta à Xac, pela técnica do RNA-Seq (Illumina). Um total de 5.673 e 6.231 transcritos diferencialmente expressos foi induzido nos tempos 24, 48 e 72 horas após a inoculação de Xac em Satsuma e Hamlin, respectivamente, enquanto 3.982 e 7.944 transcritos foram reprimidos. Deste total, 52 transcritos foram induzidos em comum, nas duas espécies, em todos os tempos de inoculação. Estes genes estão relacionados com a defesa basal da planta contra o ataque de Xac, pois apresentam genes que participam na percepção e reconhecimento do patógeno, genes que codificam fatores de transcrição e genes que participam na defesa da planta, como glucanases e proteinases. Entre os genes induzidos exclusivamente na espécie resistente Satsuma destacou-se uma proteinase aspártica. Esta proteína apresentou a maior expressão gênica no tempo 24 horas e pode estar envolvida na resistência desta espécie, visto que na espécie suscetível Hamlin, a expressão desta proteína foi menos expressiva e tardia, no tempo 48 horas. Outra resposta oposta entre as espécie foi na expressão de genes relacionados à ... / Citrus canker, caused by Xanthomonas citri subsp. citri (Xac), is a one of the most important disease affecting citrus production worldwide and attacks a wide range of commercial species of citrus trees, causing significant losses in producing countries. Hamlin sweet orange (Citrus sinensis) is canker-sensitive, while Satsuma mandarin (Citrus unshiu) is canker-resistant. To understand the molecular mechanisms underlying the differences in responses to Xac, transcriptional profiles of these two genotypes following Xac attack were compared by RNA-Seq (Illumina). The purpose of this study was to examine simultaneous changes in gene expression profile during the early stages (24, 48 and 72 hpi) of citrus canker infection in Satsuma and Hamlin. A total of 5673 and 6231 up-regulated transcripts were identified at 24, 48 and 72 hpi in Satsuma and Hamlin, respectively, while 3982 and 7944 were down-regulated. Of these, 52 transcripts were up-regulated in common between both genotypes. These genes in common are related to basic defense against Xac, because there are genes involved in patogen perception and recognition, transcription factors and genes related to plant defense, such as glucanases and proteinases. Among up-regulated genes expressed only in Satsuma, aspartic proteinase was highlighted. This protein presented the highest gene expression 24 hpi and it can be involved in Satsuma resistance, since the expression of this protein was less pronounced and delayed in Hamlin. Another opposite response between these two genotypes was the expression of genes related to cell wall. Such genes were pectato lyase, extensin, cellulose sinthase, and xiloglucano endotransglycosilase. The genes were up-regulated in Satsuma, while in Hamlin, they were down-regulated. For genes related to plant defense, both genotypes up- regulated pathogenesis-related proteins, especially 72 hpi. However, the expression of these genes did not prevent the symptoms in ...
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