Submitted by Walter Bertequini Nagata null (walter.bn@hotmail.com) on 2017-01-04T19:05:41Z No. of bitstreams: 1 DISSERTAÇÃO DE MESTRADO - Walter Bertequini Nagata.pdf: 726100 bytes, checksum: 44016cb83ccb52d2853fbd5e43a37790 (MD5) / Approved for entry into archive by Juliano Benedito Ferreira (julianoferreira@reitoria.unesp.br) on 2017-01-06T13:34:43Z (GMT) No. of bitstreams: 1 nagata_wb_me_araca.pdf: 726100 bytes, checksum: 44016cb83ccb52d2853fbd5e43a37790 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-01-06T13:34:43Z (GMT). No. of bitstreams: 1 nagata_wb_me_araca.pdf: 726100 bytes, checksum: 44016cb83ccb52d2853fbd5e43a37790 (MD5) Previous issue date: 2017-01-03 / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP) / O objetivo do presente estudo foi investigar, por métodos estatísticos, a ocorrência de reações cruzadas entre Leishmania spp. e Ehrlichia spp. com o uso de técnicas sorológicas e moleculares. Um total de 100 amostras sanguíneas de cães foram colhidas e processadas por meio do ELISA (Ensaio Imunoenzimático Indireto) e PCR (Reação em Cadeia da Polimerase). A análise estatística consistiu nos testes de McNemar e Coeficiente de concordância Kappa. As estatísticas foram consideradas significativas quando p<0,05. A sensibilidade e especificidade dos testes foram determinadas pela curva ROC (Receiver Operator Characteristic), considerando o PCR como teste padrão ouro. A partir das análises pode-se verificar que 48,0% dos animais foram reativos na ELISA e 58,0% foram positivos na PCR, no caso da Leishmania spp. Para Ehrlichia spp., a ocorrência de anticorpos pelo ELISA foi de 54,0% e, pela PCR, 48,0% dos cães foram positivos. Nota-se, também, que 37,0% dos animais foram positivos para os dois patógenos por meio do teste molecular, e quatro cães foram reativos no teste ELISA para ambas as doenças e tiveram resultado negativo apenas no teste molecular de Ehrlichia spp. Estes resultados, na sorologia, podem sugerir possíveis casos de reatividade cruzada entre a Leishmania spp. e Ehrlichia spp.. Entretanto, é mais provável que estes resultados estejam relacionados com a coinfecção desses agentes. Por meio dos resultados obtidos, há mais evidências de coinfecção por estes dois agentes patogênicos no cão, do que reatividade cruzada entre eles. / The aim of this study is to investigate, by statistical methods, the occurrence of cross-reactivity between Leishmania spp. and Ehrlichia spp. using serological and molecular techniques. A total of 100 blood samples from dogs were collected and processed by ELISA (indirect Enzyme-Linked Immunosorbent Assay) and PCR (polymerase chain reaction). Statistical analysis consists of McNemar tests and agreement coefficient Kappa. The statistics were considered significant when p <0.05. The sensitivity and specificity of the tests were determined by ROC curve (Receiver Operator Characteristic), considering the PCR as gold standard. From the analysis it can be seen that 48,0% of the animals were reactive in ELISA and 58,0% were positive in PCR in the case of Leishmania spp. For Ehrlichia spp., the occurrence of antibodies by ELISA was 54,0% and, by PCR, 48,0% of the dogs were positive. It can be noted also that 37,0% of the animals were positive for both parasites through molecular test and four dogs were reactive in the ELISA test for both diseases and were negative only in molecular test for Ehrlichia spp. These results in serology can suggest possible cases of cross-reactivity between Leishmania spp. and Ehrlichia spp.. However, it is more likely that these results are related to coinfection of these agents. Through the results obtained, there are more evidences of coinfection by these two pathogens in dogs than cross-reactivity between them. / FAPESP: 2014/26413-2

A complexidade do mercado competitivo e globalizado impulsiona as empresas na busca de otimização dos processos, redução de custos e obtenção de ganhos de escala, não somente na produção, mas também nas áreas de apoio como Compras e Logística. A gestão da cadeia de suprimentos se insere no centro das atenções destas organizações, por representar um diferencial competitivo e fator de oportunidade de crescimento eficiente, no mercado de produtos e serviços local e global. Neste contexto, é importante desencadear relações duradouras entre clientes e fornecedores e, portanto, a gestão de suprimentos deve ser priorizada como um sistema capaz de agregar valor às organizações. Aliado a este enfoque, esta dissertação teve como objetivo analisar os critérios na decisão de suprir globalmente ou desenvolver cadeia local de suprimento, no Grupo Marcopolo. Para tal, foi desenvolvido um estudo de caso qualitativo em três empresas de diferentes países, Brasil, México e Colômbia, tendo como referencial a Matriz de Kraljic. Os critérios mais impactantes identificados como competitividade, disponibilidade interna, qualidade dos produtos, risco de suprimento e impacto na lucratividade. Os desafios mais contundentes são as diferenças culturais, conhecimento dos mercados e poder de negociação restrito perante os grandes fornecedores. A classificação dos materiais comprados está em fase de aperfeiçoamento, porém a segregação de decisão por Criticidade (de aparência, segurança, funcional e de qualidade), Complexidade, Variabilidade, Padronização e Design próprio pode ser constatada. As empresas pesquisadas têm autonomia de compra, mas as estratégias corporativas interferem de maneira efetiva nestas decisões. Os resultados desta pesquisa servirão de direcionador para as empresas analisarem as deficiências, explorarem as oportunidades emergentes e dar suporte e embasamento às decisões das empresas, que se aventurarem ao global sourcing ou buscarem novas fontes de suprimento, na obtenção de vantagens competitivas e fazer frente aos concorrentes mundiais. / Submitted by Ana Guimarães Pereira (agpereir@ucs.br) on 2016-02-19T16:44:42Z No. of bitstreams: 1 Dissertacao Rosa Maria Sartor.pdf: 119651 bytes, checksum: 04b3b5a95ccc462fe212ac8fc692b41f (MD5) / Made available in DSpace on 2016-02-19T16:44:42Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Dissertacao Rosa Maria Sartor.pdf: 119651 bytes, checksum: 04b3b5a95ccc462fe212ac8fc692b41f (MD5) / The complexity of the globalized and competitive market leads the companies to the search for the optimization of processes, costs reduction and achievement of economies of scale, not only in production but also in support areas, such as Purchasing and Logistics. The supply chain management, therefore, is in the center of attention of these organizations, for representing a competitive advantage and efficient growth opportunity factor, both in local and global market of products and services. In this context, it is important to develop longterm relationships between customers and suppliers and, for this purpose, supply management should be prioritized as a system capable of adding value to organizations. Allied to this approach, this project aimed on analyzing the criteria in the decision of supplying globally or developing a local supply chain at Marcopolo Group. For this reason, it was developed a study of a qualitative case in three companies of different countries, Brazil, Mexico and Colombia, having the Kraljic Matrix, as a reference. In order to achieve this goal, the most relevant criteria, such as competitivity, internal availability, quality of products, supply risk and impacts on lucrativity, were developed. The most significant challenges are the cultural differences, knowledge of markets and restrict negotiation power with big suppliers. The classification of the material purchased is under improvement, but the segregation of decision by Criticity (appearance, safety, functional and quality), Complexity, Variability, Standardization and Customized Design can be already noticed. The researched companies have autonomy for purchasing, but the corporate strategies have an effective impact on these decisions. The findings of this project might be used to guide the companies on the analysis of their deficiencies, exploitation of emergent opportunities and for support to the decisions of the companies that might venture into global sourcing or seek new supply sources, obtaining competitive advantages and, in this way, being prepared to face global competitors.

Estudos recentes de Cadeias de Suprimentos sugerem que as empresas devem gerenciar de forma dinâmica os variados tipos de cadeias de suprimentos para responder aos diferentes tipos de comportamento de compra dos seus clientes. Enquanto algumas cadeias requerem fluxos ágeis, adaptáveis e distribuídos, outras necessitam estruturas estáveis e centralizadas. Neste sentido a problemática está na existência do alinhamento entre as dimensões propostas por Gattorna em cadeias de suprimentos e em que tipos de combinação de estratégias proporcionam melhor desempenho. Para a realização do estudo foram analisadas as Cadeias de Suprimentos das empresas automotivas no Brasil, na figura daquelas que exercem a governança da cadeia. Este estudo apresenta relevância, uma vez que a abordagem proposta é inovadora e denota a importância que as empresas devem dar ao atendimento das diferentes necessidades dos clientes, alinhando as cadeias de suprimentos aos perfis de compra e ao dinamismo do mercado. Por meio de uma survey, sustentada por informações de caráter quantitativo, com questionário composto por oito blocos de perguntas, este estudo propõe a realização da análise de associação com múltiplas variáveis, para verificar a existência de relação entre as dimensões apresentadas pela abordagem das Cadeias de Suprimentos Genéricas (Gattorna, 2009; 2010) e cinco indicadores de desempenho. O trabalho tem por objetivo verificar quais dimensões da abordagem de Gattorna proporcionam melhor desempenho às empresas, inseridas em cadeias de suprimentos, por meio das dimensões do alinhamento dinâmico: mercado, estratégias de negócios, cultura organizacional e estilo de liderança. Como resultados, o estudo apresenta uma matriz conceitual relacionando as estratégias em CS com indicadores de desempenho; identifica os posicionamentos das empresas; e quais posicionamentos estão associados com o melhor desempenho das empresas configuradas em CS. / Submitted by Ana Guimarães Pereira (agpereir@ucs.br) on 2016-08-09T17:47:35Z No. of bitstreams: 1 Dissertacao Isaias Ricardo Carraro.pdf: 1895269 bytes, checksum: 7201e42c308d013d759c4b3d9fcd6de0 (MD5) / Made available in DSpace on 2016-08-09T17:47:35Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Dissertacao Isaias Ricardo Carraro.pdf: 1895269 bytes, checksum: 7201e42c308d013d759c4b3d9fcd6de0 (MD5) Previous issue date: 2016-08-09 / Recent studies carried out on Supply Chains suggest that companies should manage, in a dynamic manner, the various types of supply chains in order to meet the different types of buying behavior of their customers. While some chains require quick, adaptable and distributed flows, others need steady and centralized frameworks. In this sense, the issue lies in the existence of an alignment between the framework proposed by Gattona in supply chains and which types of strategy combination provide better performance in supply chains. To carry out the study, supply chains of automotive companies in Brazil – representing those engaged in the chain governance - have been analyzed. The study is relevant, since the proposed approach is innovative and demonstrates how important it is for companies to meet the different needs of their clients by aligning supply chains to purchase profiles and to the dynamism of the market. By means of a survey, backed by quantitative information – through a questionnaire consisting of eight blocks of questions - this study proposes to examine the connection with multiple variables in order to examine if there is a relationship between the framework presented by the Generic Supply Chains` approach (Gattoma, 2009;2010) and five performance indicators. The study aims to examine which dimensions of Gattoma`s approach provide better performance to companies engaged in supply chains, by means of the dynamic alignment framework: market, business strategies, organizational culture and leadership style. As a result, the study presents a conceptual matrix relating strategies in the Supply Chain with performance indicators; identifies companies` positions and which positions are related to better performance by companies ranked as Supply chains.

Made available in DSpace on 2014-06-11T19:29:15Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2004-02-19Bitstream added on 2014-06-13T20:19:16Z : No. of bitstreams: 1 resende_mv_me_jabo.pdf: 500037 bytes, checksum: dcdabb9ddd0a9d7b7a657398caa401ff (MD5) / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq) / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) / Anticorpos anti H-Y foram produzidos em ratas da linhagem isogênica Wistar Furth, e utilizados no sistema de cultivo in vitro de embriões bovinos, com o objetivo de desviar a proporção sexual. As ratas foram imunizadas com leucócitos do baço de machos de mesma linhagem, e a atividade biológica dos anticorpos verificada por ELISA. Cento e trinta e quatro embriões foram produzidos in vitro e quando atingiram o estádio de mórula foram incubados em meio de cultivo contendo 5% de anticorpos anti H-Y a 38,5 °C com 5% de CO2, 5% de O2 e 90% de N2 , por um período de 24 horas. Os embriões do grupo controle foram cultivados nas mesmas condições, sem adição de anticorpos anti H-Y. Após o cultivo com anticorpos anti H-Y, os embriões foram classificados em dois grupos: 1) embriões inibidos que permaneceram no estádio de mórula (classificados como machos) e 2) embriões que se desenvolveram e houve a formação de blastocele (classificados como fêmeas). Conseguimos produzir anticorpos anti H-Y com títulos de até 1:2048. Dos 134 embriões produzidos, 79 embriões (58,96%) tiveram o desenvolvimento inibido, e 55 embriões (41,04%) não sofreram inibição. O sexo de 124 embriões pode ser verificado com a PCR para confirmação dos resultados. Das 78 mórulas, 49 (62,82%) eram do sexo masculino e dos 46 blastocistos, 22 (47,83%) eram do sexo feminino. No grupo controle a proporção sexual foi de 55,57% de embriões fêmeas e 44,43% de embriões machos, totalizando 70 embriões. O teste do Qui-quadrado indicou que somente na sexagem de mórulas obteve-se desvio da proporção sexual (P<0,05) em relação ao grupo controle. Os resultados da sexagem foram diferentes dos apresentados na literatura o que pode ser devido à qualidade morfológica inferior dos embriões produzidos in vitro comparada aos embriões produzidos in vivo, ou também, a influência do meio de cultivo. / Anti-H-Y antibodies were produced in female rats of the isogenic strain Wistar Furth, immunized with spleen leukocytes of males of the same strain, and the biological activity of the antibody was verified by ELISA. One hundred and thirty four embryos were produced in vitro and when they reached the morula stage they were incubated with anti-H-Y antibodies at 38.5°C under 5% CO2, 5% O2 and 90% N2 , for a period 24 hours. The embryos in the control group were cultured under same conditions, without addition of the anti-H-Y antibodies. After culture of the embryos in the medium containing anti H-Y antibodies, they were classified in two groups: 1) arrested embryos that remained in morula stage (classified as male) and 2) embryos that developed and formaed a blastocoele (classified as female). With the isogenic rats used, had been antibodies were obtained with titers up to 1:2048. Of the 124 embryos, 79 of them (58.96%) were arrested, and 55 embryos (41.04%) were not. The sex of 124 embryos was identified by PCR. Of the 78 morulas, 49 (62.82%) were confirmed as being male sex and of the 46 blastocysts, 22 (47.83%) were confirmed as being of the female sex. In the control group the sexual ratio was of 55.57% of femle embryos and 44.43% of male embryos, totalizing 70 embryos. Using the Chi-Square Test it was possible to observe that in the sexing of morulas it was obtained only statistical difference (P<0.05) in relation to the sexual ratio of the control group, while for sexed blastocysts no statistical difference was detected. The different results found compared with those reported in the literature could be due to the poor morphogical quality of the in vitro produced embryos when compared with the in vivo produced ones, or also, to the influence of the culture medium used during the in vitro production of embryos with anti-H-Y antibodies.

Orientadora: Vera Fernanda Martins Hossepian de Lima / Banca: Joaquim Mansano Garcia / Banca: Claudia Lima Verde Leal / Resumo: Anticorpos anti H-Y foram produzidos em ratas da linhagem isogênica Wistar Furth, e utilizados no sistema de cultivo in vitro de embriões bovinos, com o objetivo de desviar a proporção sexual. As ratas foram imunizadas com leucócitos do baço de machos de mesma linhagem, e a atividade biológica dos anticorpos verificada por ELISA. Cento e trinta e quatro embriões foram produzidos in vitro e quando atingiram o estádio de mórula foram incubados em meio de cultivo contendo 5% de anticorpos anti H-Y a 38,5 °C com 5% de CO2, 5% de O2 e 90% de N2 , por um período de 24 horas. Os embriões do grupo controle foram cultivados nas mesmas condições, sem adição de anticorpos anti H-Y. Após o cultivo com anticorpos anti H-Y, os embriões foram classificados em dois grupos: 1) embriões inibidos que permaneceram no estádio de mórula (classificados como machos) e 2) embriões que se desenvolveram e houve a formação de blastocele (classificados como fêmeas). Conseguimos produzir anticorpos anti H-Y com títulos de até 1:2048. Dos 134 embriões produzidos, 79 embriões (58,96%) tiveram o desenvolvimento inibido, e 55 embriões (41,04%) não sofreram inibição. O sexo de 124 embriões pode ser verificado com a PCR para confirmação dos resultados. Das 78 mórulas, 49 (62,82%) eram do sexo masculino e dos 46 blastocistos, 22 (47,83%) eram do sexo feminino. No grupo controle a proporção sexual foi de 55,57% de embriões fêmeas e 44,43% de embriões machos, totalizando 70 embriões. O teste do Qui-quadrado indicou que somente na sexagem de mórulas obteve-se desvio da proporção sexual (P<0,05) em relação ao grupo controle. Os resultados da sexagem foram diferentes dos apresentados na literatura o que pode ser devido à qualidade morfológica inferior dos embriões produzidos in vitro comparada aos embriões produzidos in vivo, ou também, a influência do meio de cultivo. / Abstract: Anti-H-Y antibodies were produced in female rats of the isogenic strain Wistar Furth, immunized with spleen leukocytes of males of the same strain, and the biological activity of the antibody was verified by ELISA. One hundred and thirty four embryos were produced in vitro and when they reached the morula stage they were incubated with anti-H-Y antibodies at 38.5°C under 5% CO2, 5% O2 and 90% N2 , for a period 24 hours. The embryos in the control group were cultured under same conditions, without addition of the anti-H-Y antibodies. After culture of the embryos in the medium containing anti H-Y antibodies, they were classified in two groups: 1) arrested embryos that remained in morula stage (classified as male) and 2) embryos that developed and formaed a blastocoele (classified as female). With the isogenic rats used, had been antibodies were obtained with titers up to 1:2048. Of the 124 embryos, 79 of them (58.96%) were arrested, and 55 embryos (41.04%) were not. The sex of 124 embryos was identified by PCR. Of the 78 morulas, 49 (62.82%) were confirmed as being male sex and of the 46 blastocysts, 22 (47.83%) were confirmed as being of the female sex. In the control group the sexual ratio was of 55.57% of femle embryos and 44.43% of male embryos, totalizing 70 embryos. Using the Chi-Square Test it was possible to observe that in the sexing of morulas it was obtained only statistical difference (P<0.05) in relation to the sexual ratio of the control group, while for sexed blastocysts no statistical difference was detected. The different results found compared with those reported in the literature could be due to the poor morphogical quality of the in vitro produced embryos when compared with the in vivo produced ones, or also, to the influence of the culture medium used during the in vitro production of embryos with anti-H-Y antibodies. / Mestre

Orientador: Aramis Augusto Pinto / Banca: José Antonio Jerez / Banca: Ricardo Luiz Moro de Sousa / Banca: Rosangela Zacarias Machado / Banca: Rosemeri de Oliveira Vasconcelos / Resumo: O presente trabalho teve o objetivo de realizar o diagnóstico sorológico de Chlamydophila felis utilizando duas técnicas sorológicas: imunofluorescência indireta, nas modalidades de kit comercial (RIFI COMERCIAL), e ensaio in house (RIFI OVO), e ELISA, sendo estes testes de RIFI OVO e ELISA preparados com antígeno de Chlamydophila abortus produzidos em ovos embrionados SPF de galinha. Adicionalmente, objetivou-se a realização do diagnóstico molecular de C. felis e estabelecimento do diagnóstico diferencial da clamidiose felina em relação à infecção pelo herpesvírus felino tipo 1 (HVF-1), vírus da Imunodeficiência felina (FIV) e vírus da leucemia felina (FeLV). Anticorpos anti-Chlamydiaceae foram detectados pela RIFI COMERCIAL em 81% dos animais (162/201), pela RIFI OVO em 55% (111/201) e pelo ELISA em 31% (69/201) das amostras. Verificou-se que o antígeno de Chlamydophila abortus inoculado em ovos embrionados não é indicado para utilização em técnicas imunológicas, devido à baixa sensibilidade, especificidade e correlação entre os testes estudados. Das amostras de suabes de conjuntiva submetidas à PCR, em 5,1% (12/235) foi amplificado o gene MOMP de C. felis e três amostras (1,3%) foi detectado DNA de herpesvírus. Houve coinfecção para os dois agentes em 0,4% (1/235) das amostras analisadas. Ademais, 150 amostras de soro foram avaliadas, sendo anticorpos anti-FIV detectados em 8 amostras (5,3%) e o antígeno de FeLV detectado em 11 amostras (7,3%). Não houve coinfecção por C. felis e HVF-1 com os vírus imunossupressores, demonstrando não haver correlação entre a infecção de FIV e/ou FeLV e o complexo respiratório felino / Abstract: This study aimed at perfoming the serological diagnosis of Chlamydophila felis by three serological approaches, using a commercial kit for Indirect Fluorescent Antibody Test (IFAT COMMERCIAL), and Indirect Fluorescent Antibody Test (IFAT EGG) and ELISA prepared with Chlamydophila abortus with antigen produced in SPF embryonated chicken eggs. Additionally, our study aimed at performing the molecular diagnosis of C. felis and establishing the differential diagnosis of feline chlamydiosis in relation to Feline Herpesvirus type-1 (HVF-1) in cat conjunctival swab samples, as well as investigate the presence of antibodies to Feline Immunodeficiency Virus (FIV) and presence of Feline Leukemia Virus (FeLV) antigen in cat serum samples. IgG antibodies to Chlamydophila sp. were detected by in 81% (162/201), 55% (111/201), and 31% (69/201) of serum samples, by IFA Chlamydiaceae COMMERCIAL, IFA EGG and ELISA, respectively. The use of Chlamydophila spp antigen produced in embryonated eggs is not indicated for serological tests due to its low sensitivity, specificity and correlation with other serological tests. Twelve (5.1%) out of 235 conjunctival swab samples were positive to C. felis- MOMP gene PCR; three samples (1.3%) were positive to herpesvirus PCR. Co-infection for both agents (C. felis and Herpesvirus) was found in 1 cat (0.4%). Furthermore, 150 serum samples were evaluated by commercial ELISA kit-Snap ® Combo FeLV-FIV. IgG antibodies to FIV were detected in 8 samples (5.3%), and FeLV antigen was detected in 11 samples (7.3%). The presence of co-infection for C. felis and HVF-1 with immunosuppressive viruses was not observed, showing no correlation between FIV infection and / or FeLV and upper respiratory tract disease / Doutor

Resumo: O presente trabalho teve como objetivos a) desenvolver um método eficiente, rápido e de fácil aplicação na detecção e na identificação de Diaporthe phaseolorum var. meridionalis (Dphm), em sementes de soja utilizando-se a técnica de reação de polimerase em cadeia (PCR); b) comparar PCR com os métodos rotineiros de patologia de sementes. Os resultados sugerem que pode haver uma identificação equivocada, quando se utiliza este parâmetro na diferenciação do agente causal do cancro da haste da soja, com outras espécies de Diaporthe presentes em sementes; b) pela coloração das colônias nos meios de cultura BDA e Czapeck, os isolados de Dphm e Dph foram agrupados em 9 classes. Em meio Czapeck, todas as colônias identificadas como Dphm, foram agrupadas nas classes 8 e 9, apresentando um padrão micelial lanoso (tipo feltro), exceto o isolado 46; c) pelo crescimento micelial não foi possível distinguir Dphm de Dph. Comparando-se os métodos do papel de filtro modificado com 2,4D, plaqueamento em BDA e sementes em papel de filtro com 2,4D, associado a PCR, para detecção e identificação de Dphm, visando distinguí-lo de outras espécies presentes nas sementes, conclui-se que o método mais confiável foi o de incubação das sementes em papel de filtro com 2,4D associado a PCR. Em relação ao melhor método de extração de DNA, em sementes colonizadas por Dph., foi o da lavagem das sementes com STE e purificação do DNA com a resina de sílica gel da Wizard (Promega). / Abstract: The objective of this research was to develop, an easy, quick and efficient method for detection and identification of Diaporthe phaseolorum var. meridionalis (Dphm), in soybean seeds, using the polimerase chain reaction (PCR) technique and methods routinely used in seed pathology. The results suggest that there can be a mistake when using this parameter to distinguish the causal agent of the stem canker from other species of Diaporthe; b)color of the colonies in PDA and Czapeck medium, Dphm and the of Diaporthe spp. (Dph) isolates were grouped in 9 classes. In Czapeck medium, all isolates identified as Dphm, were grouped in classes 8 and 9, showing wooled micelial pattern (like felt), except isolate 46; c) basead on the micelial growth it was not possible to distinguish Dphm from Dph. For detection and identification of Dphm of other Dph species in the seeds, the most reliable method was the modified blotter test with 2,4D associated with PCR. In Dph colonized seeds, the best method of DNA extraction was seed washing with STE and DNA purification using Wizard (Promega) silica gel resin. / Orientador: Antonio Carlos Maringoni / Coorientador: Elza Maria Frias Martins / Doutor

Resumo: O subtipo Anemia Refrataria com Excesso de Blastos (AREB) representa cerca de 30% dos casos de Síndromes Mielodisplásicas (SMD). Os pacientes apresentam uma sobrevida media de poucos meses e risco alto de progressão para Leucemia Mielóide Aguda. As bases moleculares da doença não estão elucidadas. O objetivo do presente trabalho foi investigar a expressão gênica das células da medula óssea (MO) de pacientes com AREB. Foi gerada a primeira biblioteca SAGE de AREB, ao diagnostico, a partir de amostras de MO de seis pacientes. A comparação entre as bibliotecas AREB e normal evidenciou genes diferencialmente expressos. Cinco genes hipo-expressos, TXNIP, SGPL1, NUMB, FOXO e MSH2, e outros cinco hiper-expressos, MIF, RHOG, ICAM3, CHI3L1 e NOTCH1 foram selecionados para validação nas amostras coletadas ao diagnostico e dos mesmos pacientes após seis meses do diagnóstico, por PCR em tempo real. O padrão de expressão dos cinco genes hipo-expressos e dois hiper-expressos, MIF e RHOG foi confirmado, ao diagnostico, em 60% dos pacientes. Os genes NUMB e RHOG mostraram o mesmo padrão de expressão após seis meses de evoluçlão da doença, enquanto o gene. NOTCH1 apresentou hiper-expressão em duas amostras. Os dados aqui obtidos mostram que a criação da biblioteca SAGE de AREB permite o estudo de genes possivelemente envolvidos na origem e evolução da doença. As células da MO de pacientes com AREB apresentam um perfil de expressão gênica diferente das celulas de MO normal. Os genes TXNIP, SGPL1, NUM e, FOXO3, e MSH2, MIF e RHOG, estão hipo e hiper-expressos, respectivamente, ao diagnóstico. NUMB e RHOG mantêm seu padrão de expressão após seis meses, mas NOTCH1 parece aumentar sua expressão após este período.,Estes resultados devem ser confirmados em um número maior de amostras, no entanto, demonstram que a expressão alterada dos genes FOXO3, NUMB, SGPL1, TXNIP, MSH2... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: The refractory anemia with excess blast (RAEB) subtype represents approximately 30% of Myelodysplastic Syndrome (MDS) cases. Patients with RABE have survival rates of a few months and a high risk for progression to acute myeloid leukemia. The molecular basis of the disease is not elucidated yet. This study aimed at analyzing the gene expression profile of bone marrow (BM) cells in patients with RAEB. We created the first SAGE library of RAEB at diagnosis using the BM cells of six patients. A comparison between RAEB and normal SAGE libraries show differentially expressed genes. Five under-expressed genes, TXNIP, SGPL1, NUMB, FOXO3 and MSH2 and five over-expressed genes, MIF, RHOG, ICAM3, CHI3L1 and NOTCH1, were selected for validation using real time PCR with samples collected at diagnosis and samples from the same patients collected six months after diagnosis. The pattern of expression of the five under-expressed genes and two overexpressed genes (MIF and RHOG) was validated at diagnosis in 60% of the patients. The NUMB and RHOG genes show the same expression pattern six months after diagnosis. NOTCH1 continued over-expressed in two samples six months after diagnosis. Our results show that the creation of the RAEB SAGE library allowed an analysis of genes passively involved in the genesis and progression of disease. BM cells from patients with REAB show a different gene expression profile to normal BM. The TXNIP, SGPL1, NUMB, FOXO3, and MSH2 genes are under-expressed and MIF and RHOG are over-expressed at diagnosis. NUMB and RHOG conserved their expression pattern six months after diagnosis and NOTHC1 gene increase its expression in this period. However, the results should be confirmed in studies with a larger number of cases with abnormal expressions for the FOXO3, NUMB, SGPL1, TXNIP, MSH2, MIF, RHOG and NOTCH1 genes. As these genes may play a role in the pathogenesis and progression... (Complete abstract click electronic access below) / Orientador: Agnes Cristina Fett Conte / Coorientador: Wilson Araújo da Silva Júnior / Banca: Octávio Ricci Júnior / Banca: Andréia Machado Leopoldino / Banca: Andréa Regina Baptista Rossit / Banca: Luis Carlos de Mattos / Doutor

Orientador: Jane Megid / Banca: Sony Dimas Bicudo / Banca: José Buratini Junior / Banca: Luis Antonio Mathias / Banca: Lara Borges Keid / Resumo: Mundialmente a brucelose continua sendo um problema econômico e de saúde pública. A brucelose ovina é reconhecida como a mais importante causa de epididimite, sendo uma das principais causadoras de infertilidade em ovinos. Os mecanismos imunes envolvidos na defesa e eventualmente na persistência e manutenção do agente são desconhecidos. Brucellas spp. geram somente uma resposta inflamatória moderada e os estudos da patogenia da brucelose ovina são escassos. Recentes avanços demonstram que a resposta inflamatória induzida pelas Brucellas spp. representam provavelmente o resultado de uma tentativa de evasão e supressão da resposta imune hospedeira. Utilizando as tecnologias de RT-PCR em tempo real (q) e microarranjos este trabalho avaliou a expressão gênica da resposta imune e inflamatória na brucelose experimental ovina. O estudo apresenta a primeira análise do perfil de expressão gênica de citocinas através de RT-qPCR em tecidos reprodutivos e não reprodutivos de carneiros experimentalmente infectados com cepa de B. ovis PA até 240 dias pós infecção (dpi). O estudo também demonstra a primeira análise geral da expressão gênica por meio de microarranjos em tecidos reprodutivos e pool de linfonodos de carneiros experimentalmente infectados com cepa de B. ovis PA até 240 dpi. Neste trabalho demonstrou a persistência da B. ovis e o perfil inflamatório da resposta imune gerado pela infecção. Com este estudo espera-se aumentar o conhecimento da patogênese da B. ovis em carneiros infectados / Abstract:Globally, brucellosis remains an economic problem and public health threat. The ovine brucellosis is recognized as the most important cause of epididymitis, one of the main causes of infertility in sheep. The mechanisms involved in immune defense and possibly the persistence and maintenance of the agent are unknown. Brucellas spp. generate only a moderate inflammatory response, and studies of the pathogenesis of ovine brucellosis are scarce. Recent developments have shown that Brucella spp. induces a moderate inflammatory response probably the result of an attempt to escape and to suppress the host immune response. Through real time (q) RT-PCR and microarrays the purpose this study evaluated the gene expression of immune and inflammatory response in experimental ovine brucellosis. The study demonstrated for the first time the gene expression profile of cytokines by RT-qPCR in reproductive and non reproductive tissues of rams experimentally infected with B. ovis PA strain up to 240 days post infection (dpi). The research also showed the first overall analysis of gene expression using microarrays in reproductive tissues and pool of lymph nodes of rams experimentally infected with B. ovis PA strain up to 240 dpi. The study demonstrated the persistence of B. ovis and the inflammatory profile of immune response occasioned due the infection. These results are expected to increase the knowledge of the pathogenesis of B. ovis in sheep / Doutor

Resumo: O papilomavírus humano (HPV) está associado à um amplo espectro de lesões em humanos e tem sido associado à carcinogênese oral. Uma das metodologias mais sensíveis e especifica para sua detecção é a reação em cadeia de polimerase (PCR). O objetivo deste estudo foi investigar a presença do DNA do HPV em carcinoma epidermóide de lábio e correlacioná-la com fatores de risco, características clínicas, anatomopatológicas e sobrevida dos pacientes estudados. A presença do DNA do HPV foi investigada através da nested PCR em 30 amostras parafinadas de carcinoma epidermóide de lábio. O DNA viral foi detectado em 43,33% (13/30) das amostras. A presença do DNA do vírus foi relacionada com: idade, sexo, etnia, graduação histológica, etilismo, tabagismo, exposição freqüente à radiação solar, estadiamento clínico e sobrevida livre de doença e nenhuma correlação entre a presença do DNA viral e os parâmetros avaliados foi observada. Estes resultados sugerem que HPV não teve participação no processo de carcinogênese dos carcinomas epidermóides de lábio estudados. / Abstract: Human papillomavirus (HPV) is associated with a wide spectrum of lesions in humans and has been related to the oral carcinogenesis. The most sensitive and specific methodology for its detection is the polymerase chain reaction (PCR). The aim of this study was to investigate HPV DNA presence in lip squamous cell carcinoma and to correlate it with demographic, clinicalpathologic characteristics and survival data. HPV DNA was investigated by nested PCR in 30 paraffin-embedded tissues of lip squamous cell carcinomas. HPV DNA was detected in 43,33% (13/30) of samples. Presence of viral DNA was not associated with the following factors: age, sex, race, histologic grade, etilism, tabagism, history of solar radiation exposition, clinical staging and survival of the patients. This results suggest that HPV is not related to the lip squamous cell carcinomas carcinogenesis. / Orientador: Glauco Issamu Miyahara / Coorientador: José Fernando Garcia / Banca: Cáris Maroni Nunes / Banca: Ricardo Della Coletta / Mestre