Made available in DSpace on 2014-06-11T19:27:17Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2010-03-05Bitstream added on 2014-06-13T20:35:36Z : No. of bitstreams: 1 quintal_apn_me_araca.pdf: 401169 bytes, checksum: c4d85e9662eaed7da449d96a3642f06c (MD5) / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP) / As leishmanioses são mantidas na natureza com a participação de várias espécies animais. Este trabalho avaliou a presença de Leishmania spp. em amostras de pele de marsupiais de vida livre Micoureus paraguayanus (n=95) e Didelphis albiventris (n=191) capturados no Parque Estadual Morro do Diabo, e em fragmentos de mata do seu entorno, na região do Pontal do Paranapanema-SP, Brasil. As amostras foram avaliadas para a presença de DNA de Leishmania spp. por meio da reação em cadeia pela polimerase (PCR) convencional e em tempo real (qPCR). Todas as amostras de D. albiventris avaliadas por PCR convencional foram negativas para a presença de kDNA de Leishmania spp., entretanto, quando avaliadas por qPCR, a positividade foi de 1,6%. Para M. paraguayanus, foi observada positividade de 7,4% e 11,6% por PCR convencional e qPCR, respectivamente. A maioria dos animais positivos estava restrita ao mesmo fragmento de mata. Apesar de D. albiventris ser a espécie marsupial mais estudada por seus hábitos mais urbanos, outras espécies marsupiais como M. paraguayanus podem ser potenciais reservatórios das leishmanioses e devem ser estudados / Leishmaniasis is maintained in nature with the participation of several animal species. This research evaluated the presence of Leishmania spp. in skin samples of free-living marsupials Micoureus paraguayanus (n=95) and Didelphis albiventris (n=191) captured at the Parque Estadual Morro do Diabo and forest fragments of its surroundings, in the region of “Pontal do Paranapanema”, São Paulo, Brazil. Skin samples were evaluated for the presence of Leishmania spp. DNA by conventional polymerase chain reaction (PCR) and real-time PCR (qPCR). All samples of D. albiventris evaluated by conventional PCR were negatives for the presence of Leishmania spp. kDNA however, when assessed by qPCR, the positivity was 1.6%. For M. paraguayanus positivity was observed in 7.4% and 11.6% by conventional PCR and qPCR, respectively. Most of the positive animals were restricted to the same forest fragment. Although D. albiventris is the most studied marsupial specie, others species as M. paraguayanus can be potential leishmaniasis reservoirs and should be studied

Made available in DSpace on 2014-06-11T19:27:23Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2002-07-10Bitstream added on 2014-06-13T20:56:23Z : No. of bitstreams: 1 pereira_kc_me_jabo.pdf: 880298 bytes, checksum: 6f1b49f3fda1902ce4ffb8ddd0e81555 (MD5) / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP) / Este trabalho objetivou avaliar as diferenças microbiológicas, moleculares e a composição de exopolissacarídeos entre as estirpes que foram classificadas como Bradyrhizobium recomendadas para a inoculação de leguminosas arbóreas, mas que através de ensaios isoenzimáticos da superóxido dismutase apresentaram perfis de Rhizobium. As estirpes foram crescidas em meio de cultura RDM e avaliadas em curvas de crescimento, morfologia de colônias, produção de ácido/base. A análise dos açúcares presentes nos EPS foi feita em CLAE (cromatografia líquida de alta eficiência) e a análise molecular foi realizada através da metodologia de PCR-RFLP utilizando-se oligonucleotídeos iniciadores específicos para a região do DNA correspondente ao 16S rDNA , para as restrições utilizou-se as endonucleases Taq I, Msp I, Hae III e Dde I. Os fragmentos foram visualizados em gel de agarose e analisados pelo programa Quantity One (BIORAD) que utiliza para a comparação dos dados o coeficiente de Dice e para o agrupamento o método UPGAMA(Unweighted pair group method with arithmetic means). De acordo com os resultados obtidos pode-se verificar que as estirpes SEMIA 5080, 6160 e 6159 e SEMIA 4077 e 6070 apresentaram todas as características avaliadas como sendo dos gêneros Bradyrhizobium e Rhizobium, respectivamente, entretanto pode-se observar que existe uma mistura de características entre as outras estirpes. O grupo formado pelas estirpes SEMIA 6159, 6192 e 6164 apresentou predominância das características de Bradyrhizobium, enquanto que aquele formado pelas estirpes SEMIA 6162 e 6168 mostrou-se preponderantemente com características de bactérias do gênero Rhizobium. Por outro lado, o grupo formado pelas estirpes 6169, 6161 e 6165 apresenta uma equivalência entre as características dos gêneros Bradyrhizobium e Rhizobium. / This research aimed to evaluate strains of Bradyrhizobium recommended for inoculation of legume trees according to their microbiological, molecular and, exopolysaccharides contents characteristics. Although these strains were supplied as Bradyrhizobium, their isoenzymatic profile for superoxid dismutase was similar to Rhizobium profile. The strains were grown in RDM culture medium for determination of their growth curve, the colony morphology and the production of acids/bases. The analysis of sugar content of exopolysaccharides was done using HPLC (HIGH PERFORMANCE LIQUID CHROMATOGRAPHY) and the molecular analysis was done by PCR-RFLP using specific primers for 16S rDNA. The restrictions used the endonucleases Taq I, Msp I, Hae III and Dde, the fragments were observed on EBAGE and analysed by Quantity One Software. This program uses the Dice coeficient for the comparation of the data and the methodology of UPGAMA for the grouping. The results obtained showed strains SEMIA 5080, 6160, 6159 and SEMIA 4077, 6070 presented all characteristics as belonying to the genera Bradyrhizobium and Rhizobium, respectively. Besides either, the results showed that there are a mix of characteristics on the other strains. The group formed by SEMIA 6192 and 6164 presented predominance of characteristics from Bradyrhizobium, by the way the group constituted by SEMIA 6069, 6162 and 6168 showed more characteristics from Rhizobium. Another group, formed by the strains SEMIA 6169, 6161 and 6165 showed similar numbers of charactheristics from Rhizobium and Bradyrhizobium.

Made available in DSpace on 2014-06-11T19:27:28Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2007-04-23Bitstream added on 2014-06-13T19:35:40Z : No. of bitstreams: 1 oliveira_j_me_arafcf.pdf: 352998 bytes, checksum: 997166e2dffc2b5acc213ed4bfd5d252 (MD5) / Universidade Estadual Paulista (UNESP) / O linfedema de Membro Superior (MS) e a principal complicacao decorrente da cirurgia e tratamento do cancer (CA) de mama e e causado pela destruicao dos canais de drenagem axilar em virtude da cirurgia, radioterapia ou pela progressao regional da doenca. Esta pesquisa teve o intuito de verificar a influencia da ingestao de triglicerideos de cadeia media (TCM) associada ao tratamento fisioterapeutico em mulheres portadoras de linfedema de MS pos-cirurgia de CA de mama. Para tanto, teve a participacao de 14 mulheres mastectomizadas que apresentavam linfedema de MS homolateral a cirurgia, com idade media de 64}12 anos e Indice de Massa Corporea (IMC) de 27}4,1 kg/m2. Apos avaliacao nutricional foram divididas, aleatoriamente, em dois grupos: Grupo Controle (n=7), submetido ao tratamento fisioterapeutico constando da terapia complexa descongestiva (massagem classica, drenagem linfatica manual, bandagem compressiva e cuidados com a pele), 3 vezes na semana, durante 8 semanas e automassagem nas 2 semanas seguintes; Grupo TCM (n=7), submetido ao mesmo protocolo fisioterapeutico somado ao tratamento dietetico diario com ingestao de TCM, por 10 semanas. O linfedema foi avaliado atraves da cirtometria, da volumetria, das pregas cutaneas e pela quantidade de agua corporal total. As sensacoes de desconforto, peso e dor no MS acometido foram coletadas por escalas visuais analogas (EVA). Ao final da intervencao, a cirtometria, a volumetria e as pregas cutaneas tricipital e bicipital mostraram diferencas significativas entre os grupos (p.0,05), com uma maior reducao do linfedema no grupo TCM. As sensacoes de desconforto e peso no membro foram significativamente menores na comparacao inicial e final no grupo TCM. Nao houve diferencas na quantidade de agua corporal total. / The lymphedema of upper-extremity (UE) is the main complication due to the surgery and treatment of the breast cancer and it is caused by the destruction of the channels of axillary drainage because of the surgery, radiation therapy or by the local progression of the disease. This research had the intention of verifying the influence of the intakes of medium chain triglycerides (MCT) associated to the physiotherapeutic treatment in the lymphedema of the upper-extremity of postmastectomy women. For this research, it counted with the participation of 14 postmastectomy women who presented lymphedema of upper-extremity at the same side to the surgery, with medium age 64}12 years old and Body Mass Index (BMI) of 27}4,1 kg/m2. After nutritional evaluation they were divided, at ramdom, in two groups: Control Group (n=7), submitted to the physiotherapeutic treatment consisting of the complex decongestive therapy (classic massage, manual lymphatic drainage, compression bandage and cares with the skin), three times a week, during eight weeks and self-massage in the two following weeks; MCT Group (n=7), submitted to the same physiotherapeutic protocol in addition to the daily dietotherapy with intakes of MCT, during ten weeks. The lymphedema was evaluated by the circumferential and volumetric measures, by skin folds of arm with lymphedema and by the amount of total body water. The sensations of discomfort, pain and weight in the UE were collected by visual analogue scales (VAS). At the end of the intervention, the circumferential and volumetric measures, and the tricipital and bicipital skin folds showed significant differences among the groups (p.0,05), with a larger reduction of the lymphedema in the MCT Group. The sensations of discomfort and weight in the UE were significantly smaller in the final comparison related to the initial in the MCT Group.

Made available in DSpace on 2014-06-11T19:27:58Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2008-02-18Bitstream added on 2014-06-13T18:56:55Z : No. of bitstreams: 1 freitasneto_oc_me_jabo.pdf: 351713 bytes, checksum: 82c0d6bd573bc832444c3d0fe2427852 (MD5) / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP) / As criações de avestruzes vêm se desenvolvendo no Brasil e em outros países. De acordo com a literatura, Salmonella sp está envolvida na mortalidade de filhotes de avestruzes, sendo também importantes causadoras de toxinfecção alimentar em seres humanos. Apesar disso, existem poucos estudos envolvendo a pesquisa de Salmonella sp nesta espécie. Desse modo, elaborou-se o presente trabalho com o objetivo de pesquisar Salmonella sp em avestruzes de uma propriedade da região sudeste do Brasil. Para isso, foram realizados exames bacteriológicos, em 80 amostras de fezes de avestruzes (colhidas nas varias fases da criação), 90 ovos não eclodidos, 30 amostras de ração e em 30 amostras de fezes de roedores presentes na propriedade. Em seguida, investigou-se Salmonella sp em fezes, conteúdo cecal, fígado, baço e carcaça de 90 avestruzes abatidos. Aliado a isso, colheu-se o soro sanguíneo destes animais para a realização do “teste da Pulorose”. Os exames microbiológicos demonstraram ausência de Salmonella sp em amostras de fezes de roedores e em fezes, ovos, conteúdo cecal, fígado, baço e carcaça dos avestruzes analisados. Por outro lado, Salmonella enterica subespécie enterica 4, 12: i:- foi isolada de uma amostra de ração e Salmonella Javiana de outras duas. O teste sorológico foi negativo nas 90 amostras. O sistema de criação, o bom manejo sanitário adotado na propriedade e a adoção dos programas de Boas Práticas de Fabricação (BPF) e Análise de Perigos e Pontos Críticos de Controle (APPCC) no abatedouro contribuíram para a ausência de Salmonella sp nas amostras examinadas. / In recent years, the ostrich farming has expanded considerably in Brazil and all over the world. According to literature, Salmonella sp causes mortality in ostrich chicks, being also responsible for human food borne diseases. Even though, little research has focused on Salmonella in ostriches. This study was elaborated with the purpose to search for Salmonella sp in ostriches of a farm located on Brazilian southwest region. By conventional microbiological method, Salmonella sp was researched in 80 samples of ostrich’s droppings, 90 eggs, 30 samples of feed and 30 samples of droppings from resident rodent population. In sequence, this bacterium was searched in droppings, caecal content, spleen, liver and carcass from 90 slaughtered ostriches. Also, blood serum of those animals were harvested and submitted to test for Pullorum Disease (Rapid Serum Blood Agglutination Test). No Salmonella sp was detected in eggs, caecal content, liver, spleen, carcass and droppings from ostriches, nor in droppings from rodents. On the other hand, Salmonella Javiana was isolated from two samples of feed and Salmonella enterica enterica 4, 12: i:- from another one. The serologic test was negative for all samples. The management of ostrich farming, the good sanitary management adopted on farm and the application of Hazard Analysis and Critical Control Point (HACCP) principles and Good Manufacturing Practices (GMP) during the slaughter process contributed for absence of Salmonella sp on samples assayed.

Made available in DSpace on 2016-06-02T19:51:35Z (GMT). No. of bitstreams: 1 1738.pdf: 1163746 bytes, checksum: 0c067a99b1d2a0a5d64395a7c477d3ab (MD5) Previous issue date: 2008-01-25 / Financiadora de Estudos e Projetos / The fruit certification in Brazil is a strategy adopted by the supply chain as a means of generating value and reduction of informational asymmetries between buyers and sellers. This strategy comes as a demand result from consumers for safer products and products of superior quality. It is also influenced by the possibility of paying higher prices and conquer of the increasingly competed markets as a result of globalization. The adoption of this strategy creates the need for greater interaction between the players of the chains, influencing the coordination and management of them, through the adoption of governance structures that allow reduction of transaction costs involved in such chains. The main objective of the study was to identify whether these governance structures are influenced by the agent of regulatory certifications, analyzing cases of private initiatives (GO Carrefour, EurepGap, TNC), of public and private initiative (PIF) and initiative of NGOs (Organic and Fair Trade). The study was executed through multi-case studies with producers, distributors and agents directly involved in the fruit certification process, faced with the theories of New Institutional Economics and Supply Chain Management. The conclusion to which it comes from the study is that coordination and management of the chains are not necessarily influenced by the initiative of the regulatory agent, but are a result of the market to which the certificate is intended and the institutional environment in which each certification is inserted. / A certificação de frutas no Brasil é uma estratégia adotada pela cadeia como instrumento de geração de valor e redução de assimetrias informacionais entre compradores e vendedores. Essa estratégia surge como conseqüência da demanda de consumidores por produtos mais seguros e de qualidade superior, pela possibilidade de pagamento de preços superiores e conquista de mercados cada vez mais concorridos em decorrência da globalização. A adoção dessa estratégia gera a necessidade de maior interação entre os agentes das cadeias, influenciando na coordenação e gerenciamento das mesmas, por meio da adoção de estruturas de governança que permitam redução dos custos de transação envolvidos nessas cadeias. O objetivo central do trabalho foi identificar se essas estruturas de governança são influenciadas pelo agente regulamentador das certificações, analisando casos de iniciativas privadas (GO Carrefour, EurepGap, TNC), de iniciativa pública e privada (PIF) e iniciativa de ONGs (Orgânicos e Fair Trade). O estudo foi feito por meio de estudos multicasos com produtores, distribuidores e agentes diretamente envolvidos no processo de certificação de frutas, confrontados com as teorias de Nova Economia Institucional e de Gestão das Cadeias de Suprimentos. A conclusão a que se chega a partir do estudo é que coordenação e gerenciamento das cadeias não são necessariamente influenciados pela iniciativa do agente regulamentador, mas são conseqüência do mercado ao qual o certificado se destina e ao ambiente institucional no qual cada certificação está inserido.

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Orientadora : Profa. Dra. Vanete Thomaz Soccol / Dissertação (mestrado) - Universidade Federal do Paraná, Setor de Tecnologia, Programa de Pós-Graduação em Engenharia de Bioprocessos e Biotecnologia. Defesa: Curitiba, 30/01/2015 / Inclui referências : f.101-137 / Área de concentração: Saúde humana e animal / Resumo: A Doença de Chagas é uma enfermidade causada por Trypanosoma cruzi (CHAGAS, 1909) que afeta milhões de pessoas na América Latina. No diagnóstico da doença, testes sorológicos, detecção direta do parasito ou PCR convencional são usados como testes confirmatórios. Porém, estes métodos apresentam restrições quanto à sensibilidade e especificidade. Além disso, microepidemias associadas a alimentos vem demonstrando a importância crescente na via de transmissão oral, a partir do ciclo silvestre. Assim, padronizar metodologias com melhor sensibilidade e especificidade, para detectar o parasito em humanos e em alimentos é necessária. O objetivo desse trabalho foi padronizar a técnica de Real Time PCR para avaliar pacientes chagásicos crônicos e contatos, assim como detectar T. cruzi em alimentos, favorecendo a implantação dessa metodologia em laboratórios, bancos de sangue e como ferramenta no monitoramento do parasito em sangue e alimentos. Para tal, foram desenhados seis iniciadores (Ep1F/Ep1R, Ep2F/Ep2R, Bp1F/Bp1R, Bp2F/Bp2R, Bp3F/Bp3R e Bp4F/Bp4R) usando as sequências das cepas referência de T. cruzi y152 e Esmeraldo obtidas no genebank. Além destes, primers conhecidos e validados pela literatura foram também incluídos a título de comparação (TCZ1/TCZ2 e S35/S36). Para a otimização da técnica (concentração de primers e de DNA e CT de amplificação), foram usadas cepas de T. cruzi, T. rangeli e de Leishmania sp. Após a padronização a melhor especificidade analítica foi observada para o primer Bp1F/Bp1R (detectou apenas T. cruzi). O primer Ep1F/Ep1R permitiu detectar 0,0001 ng/?L do parasito e para TCZ1/TCZ2 a detecção mínima foi de 0,00001 ng/?L de DNA do parasito pela análise da curva padrão. Para validar a metodologia padronizada foram avaliadas 66 amostras de pacientes com doença de Chagas de regiões endêmicas (Paraná, São Paulo, Rio Grande do Sul), 11 amostras de indivíduos com relação de parentesco com os pacientes (contatos), e 30 indivíduos que não possuíam nenhum histórico ou diagnóstico para presença do parasito. Essas amostras foram submetidas à técnica de Real Time PCR aqui padronizada com os primers TCZ1/TCZ2 e Ep1F/Ep1R. A análise da curva ROC usando os primers TCZ1/TCZ2 mostrou uma sensibilidade de 79,2% e especificidade 69,8% (AUC = 69,2%). Para os primers Ep1F/Ep1R a sensibilidade foi 71,7% e especificidade 76,7% (AUC = 77,4%). O teste de McNemar demonstrou que ambos os iniciadores apresentaram maior discordância de resultados com a reação de imunofluorescência (RIFI) em pacientes chagásicos. Em indivíduos contatos o primer Ep1F/Ep1R apresentou maior discordância com a RIFI e ensaio imunoenzimático (ELISA). TCZ1/TCZ2 não apresentou discordância relevante. Ep1F/Ep1R demonstrou maior positividade (72,72%) para esse grupo. Portanto, o primer Ep1F/Ep1R assumiu melhor desempenho quanto à especificidade na determinação de T. cruzi em amostras de sangue que TCZ1/TCZ2. Em amostras de açaí, quando avaliado o açaí in natura (sem tratamento prévio) foi obtido 33% de sensibilidade para cepa de T. cruzi isolada de humanos (HC27) e 76% para a cepa isolada de Panstrongylus megistus (CUR98). Para amostras de açaí autoclavada verificou-se 71% de resultados positivos para ambas as cepas referidas acima. Além disso, em amostras contaminadas artificialmente com T. cruzi (cepa HC27) o limite de detecção foi de 0,75 parasito (p)/mL e com a cepa CUR98 a detecção mínima foi de 0,000019 p/mL. Dentre os primers desenhados Ep1F/Ep1R apresentou bons resultados na determinação de T. cruzi em sangue e açaí, o que encoraja a utilização da técnica de Real Time PCR para o monitoramento de amostras de açaí. Palavras-chave: Trypanosoma cruzi. Real Time PCR. Sangue. Açaí. Primers. Sensibilidade. Especificidade. / Abstract: Chagas disease is caused by Trypanosoma cruzi CHAGAS, 1909, and affects millions of people in Latin America. Diagnostic tests to confirm the disease include indirect tests (antibody in serum), direct detection of the parasite in blood and conventional PCR (DNA detection). However, these methods have limitations because the serological tests detect antibodies and not the parasite, or have low sensitivity (e.g., the parasite is in the internal organs or the chronic phase). In addition, microepidemics associated with foods have shifted the emphasis to the oral route of transmission during the silvatic cycle. Therefore, standardized methodologies with improved sensitivity and specificity are needed to detect the parasite in blood and foods. The aim of this study was to standardize the real-time PCR technique for assessing chronic Chagas patients and contacted individuals, as well as for detecting T. cruzi in foods. To accomplish these objectives, six primers were improved (Ep1F/Ep1R, Ep2F/Ep2R, Bp1F/Bp1R, Bp2F/Bp2R, Bp3F/Bp3R and Bp4F/Bp4R) using the sequences of references strains (T. cruzi y152 and Emerald) obtained from GenBank. Known primers validated in the literature were also included (TCZ1/TCZ2 and S35/S36). Trypanosoma cruzi, T. rangeli and Leishmania sp. strains were employed for optimization (concentration of primers, DNA and CT amplification). The best analytical specificity was observed for the Bp1F/Bp1R primer. The Ep1F/Ep1R primer had minimum detection of 0.0001 ng/?L, while TCZ1/TCZ2 had minimum detection of 0.00001 ng/?L of DNA from the parasite, based on an analysis of the standard curve. To validate the standardized methodology, 66 samples from chronic patients in endemic regions (Paraná, São Paulo and Rio Grande do Sul) were assessed, along with 11 samples from patients' relatives (contacts) and 30 individuals with no history or diagnosis for the presence of the parasite. The samples were submitted to the standardized real-time PCR technique with the TCZ1/TCZ2 and Ep1F/Ep1R primers. On analysis of the ROC curve, Ep1F/Ep1R had 71.7% sensitivity and 76.7% specificity (AUC = 77.4%), while TCZ1/TCZ2 exhibited 79.2% sensitivity and 69.8% specificity (AUC = 69.2%). McNemar's test showed that both primers had greater discordance in their results with the immunofluorescence reaction (IFR) in Chagas patients. Ep1F/Ep1R performed better than the TCZ1/TCZ2 primer, in terms of specificity for the determination of T. cruzi in blood samples. In açaí samples, an assessment of açai in natura (without previous treatment) revealed 33% sensitivity for the T. cruzi when HC27 strain isolated from humans was used and 76% for the CUR98 strain isolated from Panstrongylus megistus. In autoclaved açai samples, 71% positivity was detected for both strains. In addition, for artificially samples infected with HC27 strain, the limit of detection was 0.75 parasites (p)/mL, whereas the minimum detection for the CUR98 strain was 0.000019 p/mL. Ep1F/Ep1R showed good results in determining T. cruzi in blood and açai, favoring the use of the real-time PCR technique for screening blood and açai samples. Key-words: Trypanosoma cruzi. Real Time PCR. Blood. Açaí. Primers. Sensitivity. Specificity.

Orientador : Prof. Dr. Antonio F. P. de F. Wouk / Dissertação (mestrado) - Universidade Federal do Paraná, Setor de Ciências Agrárias, Programa de Pós-Graduação em Ciências Veterinárias. Defesa: Curitiba, 24/03/2009 / Inclui referências ao final de cada capítulo / Área de concentração : Patologia veterinária / Resumo: Os micoplasmas hemotrópicos são bactérias gram negativas, em forma de cocos, anéis ou bacilos, que parasitam eritrócitos de uma grande variedade de mamíferos, entre eles os cães. A hemoplasmose nos cães é geralmente um achado laboratorial. Raramente cães sem comprometimento imunológico ou não esplenectomizados desenvolvem a infecção. Os sinais da doença incluem febre, anorexia, mucosas pálidas e a anemia, quando presente, é discreta a moderada. A hemoplasmose nos cães é causada pelas bactérias Mycoplasma haemocanis (Mhc) e "Candidatus Mycoplasma haematoparvum" (CMhp). A transmissão ocorre pelo repasto do carrapato Rhipicephalus sanguineus, transfusão sanguínea, transmissão vertical de cadela para filhotes foi reportada, porém não há certeza se é transmitido por via placentária ou no momento do parto. O diagnóstico é feito pela visualização do agente infeccioso sobre a membrana eritrocitária ao exame do esfregaço sanguíneo, sem identificação da espécie de micoplasma. O diagnóstico pela reação em cadeia da polimerase (PCR) é considerado padrão ouro por ter maior sensibilidade e especificidade que a citologia. O PCR para hemoplasmas é feito com a amplificação dos genes 16SrRNA e rnpB. O sequenciamento destes genes permite a identificação entre as espécies de hemoplasmas caninos e felinos. Foram realizados testes em 99 amostras de sangue de cães provenientes de um laboratório comercial da cidade de Curitiba. Foi realizada a extração do DNA e PCR para os genes GAPDH, gene constitutivos que garantem a qualidade de extração, 16SrRNA para Mycoplasma haemofelis (Mhf) "Candidatus Mycoplasma haemominutum" (CMhm) e "Candidatus Mycoplasma turicensis" (CMtc). Das 94 amostras positivas para o GAPDH, 16 (17,02%) geraram amplicons para pelo menos uma das três espécies testadas, nenhuma amostra apresentou co-infecção com mais de uma espécie. Do total de amostras, 9/94 (9,57%) foram positivos para Mhc, 4/94 (4,26%) para CMhp e 3/94 (3,19%) para CMTC, num total de 16 amostras positivas. Destas, 13 pertenciam ao grupo de 64 anêmicos (20,31%) e as outras 3 ao grupo de 30 não anêmicos (10,0%), com o dobro de risco de animais anêmicos possuírem a infecção. Um total de 10/46 (21,74%) machos foram positivos e 6/48 (12,5%) fêmeas foram positivas para hemoplasmas, indicando maior probabilidade de machos serem positivos. Um total de 2/18 animais com até 12 meses (11,12%) foram positivos, e 14/76 com mais de 12 meses (18,42%) foram positivos, mostrando maiores chances de cães com mais de 12 meses serem positivos. Não houve diferença significativa entre as idades dos animais positivos e negativos, e entre os hematócritos dos cães anêmicos e cães não anêmicos. Porém houve diferença significativa entre a presença de hemoplasmas e anemia, indicando que os hemoplasmas podem causar anemia em cães. Relata-se pela primeira vez a presença de "Candidatus Mycoplasma turicensis" em cães em Curitiba, Brasil. Palavras-chave: Cão, micoplasmas hemotrópicos, PCR, anemia / Abstract: Hemotropic mycoplasmas are gram negative, coccoid, ring or rod shaped bacteria,which parasite erythrocytes of a wide variety of mammals, including dogs. Hemoplasmosis in dogs is often a laboratory finding. Dogs without immunological restrain or non-splenectomized rarely develop the infection. Signs of disease include fever, anorexia, pale mucous membranes and anemia, when present, is mild to moderate. Hemoplasmosis in dogs is caused by bacteria Mycoplasma haemocanis (Mhc) and "Candidatus Mycoplasma haematoparvum" (CMhp). Transmission occurs by Rhipicephalus sanguineus tick feeding, blood transfusion, vertical transmission from bitch to offspring has been reported, however transplacental or at birth transmission has not been elucidated yet. Diagnosis is made by visualization of infectious agent on the erythrocyte membrane over blood smear examination, with no species identification. Diagnosis of polymerase chain reaction (PCR) is considered the gold standard due to higher sensitivity and specificity than cytology. Hemoplasma PCR is performed by 16SrRNA and rnpB gene amplification. Sequencing of these genes may allow to species identification between canine and feline hemoplasmas. A total of 99 samples were tested in dogs from a commercial laboratory in Curitiba, Brazil. DNA extraction and PCR for GAPDH housekeeping gene, which insures quality control of extraction, 16SrRNA for Mycoplasma haemofelis (Mhf) "Candidatus Mycoplasma haemominutum" (CMhm) and "Candidatus Mycoplasma turicensis" (CMtc). Out of 94 positive samples for GAPDH, 16/94 (17.02%) produced amplicons of at least one of three tested species, and no sample presented co-infection with more than one species. A total of 9/94 (9.57%) were positive for Mhc, 4/94 (4.26%) for CMhp and 3/94 (3.19%) for CMtc. Out of 16 positive samples, 13 were from the 64 anemic group (20.31%) and other 3 were from the 30 non-anemic group (10.0%), showing a double likelihood of anemic dogs to have the infection. A total of 10/46 dogs (21.74%) were positive, and 6/48 (12.5%) were positive for hemoplasmas, showing higher chances of males to be positive. According to age, 2/18 animals younger than 12 months of age (11.12%) were positives and 14/76 older than 12 months (18.42%) were positive, showing higher chances of older dogs to be positive. No significant differences were found between ages and positive/negative animals, and between packed cell volume of anemic and non-anemic dogs. However a significant difference was found between presence of hemoplasma and anemia, showing that hemoplasmas may cause anemia in dogs. "Candidatus Mycoplasma turicensis" has been reported for the first time infecting dogs in Curitiba, Brazil. Palavras-chave: dog, hemotropic hemoplasma, PCR, anemia

Made available in DSpace on 2016-08-12T18:48:41Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2015-02-26. Added 1 bitstream(s) on 2016-08-12T18:50:55Z : No. of bitstreams: 1 000865143.pdf: 1222502 bytes, checksum: 6d7d7cfc6cf6e5880416ce873a338cad (MD5) / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP) / Muitas espécies de protozoários podem causar gastroenterite aguda ou crônica em seres humanos e são altamente prevalentes nas populações residentes nos países em desenvolvimento, onde a transmissão é favorecida devido a condições precárias de higiene e escassa disponibilidade de água potável. No entanto, a infecção assintomática e o poliparasitismo também são comumente observados nessas populações. Neste trabalho, investigou-se a prevalência de protozoários intestinais em duas colônias de pescadores, Porto Said (PS) e Santa Maria da Serra (SM), situadas ao longo do rio Tietê, no Estado de São Paulo. As colônias não dispõem de serviços públicos básicos como: vias públicas, fornecimento de água e luz e saneamento básico. Todos os colonos (n = 88 em PS, e n = 38 em SM) coletaram três amostras de fezes, e todos eram assintomáticos no momento da coleta. Para obter informações sobre as possíveis vias de transmissão, amostras fecais de 49 cães (38 de PS e 11 de SM) e 28 amostras de água do rio foram coletadas (16 de PS e 12 de SM). As amostras fecais humanas e caninas foram analisadas por microscopia e PCR para detectar e caracterizar os protozoários Giardia duodenalis, Blastocystis spp., Dientamoeba fragilis e Cryptosporidium spp. Diante dos resultados obtidos, Blastocystis spp. foi o parasita mais prevalente nas amostras humanas (45,4% em PS e 71% em SM), seguido por D. fragilis (13,6% em PS e 18,4% em SM) e G. duodenalis (18,2% em PS e 7,9% em SM), já Cryptosporidium spp. não foi detectado na população humana. Além disso, G. duodenalis foi detectado em quatro cães (10,5%) em PS e dois cães (18,2%) em SM, enquanto que um único cão foi detectado com Cryptosporidium canis. Nas 28 amostras de água previamente processadas pelos métodos de filtração e separação imunomagnética e examinadas por microscopia de fluorescência, oocistos de Cryptosporidium e cistos de Giardia não foram... / Several species of protozoa cause acute or chronic gastroenteritis in humans, worldwide. The burden of disease is particularly high among children living in developing areas of the world, where transmission is favored by lower hygienic standards and scarce availability of safe water. However, asymptomatic infection and polyparasitism are also commonly observed in poor settings. Here, we investigated the prevalence of intestinal protozoa in two small fishermen villages, Porto Said (PS) and Santa Maria da Serra (SM), situated along the river Tietê in the State of São Paulo, Brazil. The villages lack basic public infrastructures and services, such as roads, public water supply, electricity and public health services. Multiple fecal samples were collected from 88 individuals in PS and from 38 individuals in SM, who were asymptomatic at the time of sampling and had no recent history of diarrheal disease. To gain insights into potential transmission routes, 49 dog fecal samples (38 from PS and 11 from SM) and 28 river water samples were also collected. All samples were tested by microscopy and PCR was used to genotype isolates of Giardia duodenalis, Blastocystis spp., Dientamoeba fragilis and Cryptosporidium spp. By molecular methods, the most common human parasite was Blastocystis spp. (prevalence, 45% in PS and 71% in SM), followed by D. fragilis (13.6% in PS, and 18.4% in SM) and G. duodenalis (18.2% in PS and 7.9% in SM); Cryptosporidium spp. were not detected. Further, G. duodenalis was found in 4 dogs (10.5%) in PS and 2 dogs (18.2%) in SM, whereas a single dog was found infected with Cryptosporidium canis. River water samples processed by filtration and immunomagnetic separation and examined by fluorescent microscopy, were negative for Cryptosporidium oocysts and Giardia cysts. Sequencing of the barcoding region of the small subunit ribosomal gene revealed large genetic variation among Blastocystis isolates, with subtypes (STs) that ... / FAPESP: 11/52100-3

Submitted by ÉRIKA TIEMI SUZUKI null (eri.suzuki@hotmail.com) on 2016-09-09T20:44:09Z No. of bitstreams: 1 TeseFinal.pdf: 1934994 bytes, checksum: 624877cb05cd3504cc3dfdb84b970b56 (MD5) / Approved for entry into archive by Juliano Benedito Ferreira (julianoferreira@reitoria.unesp.br) on 2016-09-13T13:53:01Z (GMT) No. of bitstreams: 1 suzuki_et_dr_bot.pdf: 1934994 bytes, checksum: 624877cb05cd3504cc3dfdb84b970b56 (MD5) / Made available in DSpace on 2016-09-13T13:53:01Z (GMT). No. of bitstreams: 1 suzuki_et_dr_bot.pdf: 1934994 bytes, checksum: 624877cb05cd3504cc3dfdb84b970b56 (MD5) Previous issue date: 2016-08-29 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) / A romã (Punica granatum L.) é uma frutífera exótica bastante antiga, havendo descrições de seu uso na bíblia e em escritos da mitologia grega e persa. O presente trabalho teve por objetivo estudar a fenologia; avaliar o custo de produção e a rentabilidade da cultura; e delimitar a cadeia produtiva de romã na região oeste do estado de São Paulo, pontuando a ocorrência de produção, quanto aos aspectos agronômicos e tecnologias utilizadas em seu cultivo, bem como fornecer informações aos integrantes desta cadeia produtiva e possíveis interessados em investir no ramo. O conhecimento das fases fenológicas e a possibilidade de produção durante todo o ano viabilizam o escalonamento de acordo com as atividades da propriedade, manutenção de renda diluída ao longo do ano e negociação de acordo com o melhor preço; da gema reprodutiva até a maturação completa, a romã leva 111 dias no inverno e 105 dias no verão. Há, porém na cadeia produtiva, forte intermediação e comercialização difusa com logística prejudicada pelo distanciamento dos centros de produção e consumo. O principal fornecedor de romã ao Ceagesp é o estado de São Paulo com participação de 53,48% e preço médio de R$10,52.kg-1, destacando os municípios de São Paulo e Taquaritinga; por esta mesma via, tem sido introduzido novos cultivares, como o caso da romã ‘Wonderful’, importada dos Estados Unidos ao qual é considerada referência de qualidade e repercutido em forte concorrência ao produto paulista. Novembro a janeiro são os meses de maior oferta de romã, enquanto que de junho a setembro há os melhores preços. Tamanho, coloração e sanidade são citados por intermediários e consumidores como aspectos a serem considerados para a compra, sendo requeridos frutos sem manchas, avermelhados e graúdos; além disto, a principal sugestão por parte dos consumidores é o fornecimento de informações referentes aos componentes nutraceuticos, seus efeitos e benefícios. / The pomegranate (Punica granatum L.) is an old exotic fruit, with descriptions of its use in the Bible and in the writings of Greek and Persian mythology. Therefore, this paper aims to study the phenology, assess the cost of production and profitability of the crop, delimit the production chain of pomegranate in the western region of São Paulo, pointing out the occurrence of pomegranate production, agronomic aspects and technologies used in its cultivation, as well as provide information to members of this production chain and possible interested in investing in the business. The possibility of production throughout the year makes it viable to staggering according to the activities of the property, diluted income maintenance throughout the year and trading in accordance with the best price; reproductive bud to full maturity, the pomegranate takes 111 days in winter and 105 days in the summer. There is however the production chain, strong intermediation and diffuse with marketing logistics harmed distanced from the production and consumption centers. The main pomegranate supplier to Ceagesp is the state of São Paulo with a share of 53.48% and average price R$10,52.kg-1, of particular note being the municipalities of São Paulo and Taquaritinga; the same path, it has been introduced new cultivars, as the case of the United States imported pomegranate which is considered a quality reference and reflected in strong competition to the Paulista product. November to January are the months of greater supply of pomegranate, while June to September there are the best prices. Size, color and health are cited by intermediaries and consumers as aspects to be considered for purchase, being required fruits without stains reddish and adults; Furthermore, the main suggestion by consumers is the supply of information concerning the nutraceutical components, effects and benefits.