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Modelos preditivos como ferramentas para estimar a quantidade de protozoários parasitos em peixes

Gonçalves, Eduardo Luiz Tavares January 2011 (has links)
Dissertação (mestrado) - Universidade Federal de Santa Catarina, Centro de Ciências Agrárias, Programa de Pós-Graduação em Aquicultura, Florianópolis, 2011 / Made available in DSpace on 2012-10-26T01:35:50Z (GMT). No. of bitstreams: 1 295284.pdf: 2311004 bytes, checksum: fab22f50694af27ca1997dff869c32c4 (MD5) / Protozoários parasitos são causadores de mortalidade em peixes cultivados, porém existe um número muito pequeno de trabalhos com análises quantitativas sobre o assunto no Brasil. Uma gama de métodos para quantificar parasitos é conhecida, entretanto eles geralmente requerem equipamentos caros e mão de obra especializada. Neste estudo foi desenvolvido um modelo preditivo e, a partir dele, um software, com o objetivo de auxiliar na quantificação de protozoários parasitos nas brânquias de peixe, tornando-a mais precisa e confiável, levando em consideração a realidade brasileira. Tilápias do Nilo (n=129) foram coletadas e tiveram um total de oito variáveis aferidas e testadas no processo de desenvolvimento do modelo preditivo. Os protocolos de coleta e aferição das variáveis, juntamente com a modelagem por meio de MARSplines, provaram ser eficientes e resultaram em um modelo preditivo bastante preciso e robusto. Esses resultados subsidiaram o desenvolvimento de um software, batizado de ProtoCount, que é capaz de estimar a quantidade total de protozoários nas brânquias, a partir dos valores de peso e comprimento do peixe e da média de protozoários observados em amostras de 1,5 ml, retiradas de 200 ml de solução formalina contendo raspado das brânquias do peixe amostrado e contadas em câmara de McMaster. ProtoCount demonstrou ser prático e confiável, assim, espera-se que sua utilização possa contribuir com a expansão, padronização, precisão e confiabilidade das análises quantitativas feitas por laboratórios nacionais de parasitologia de peixes. / Protozoan parasites are a major cause of cultured fish mortality, but there are surprisingly few data with quantitative measurements in Brazil. There are few reliable methods for quantifying parasite protozoa, but either they require expensive equipments or highly specialized professionals. This study has developed a predictive model and a software, with the objective of providing more precise and reliable quantifications of protozoan parasites on fish gills more, considering Brazilian reality. Nile tilapia (n = 129) were collected and a total of eight variables were measured and tested for the predictive model development. Colleting and measurement procedures, along with MARSplines modeling, were efficient and resulted in a very precise and robust predicting model. Resulting data helped in developing a software, called ProtoCount, that manages to estimate the total protozoa burned on fish gills, based on fish#s weight, length and mean protozoa count on a 1,5 ml sample. Each 1,5 ml corresponds to 10 homogenized samples, taken from 200 ml formalin solution, containing scraped gills from sample fish, and counted using McMaster#s chamber. ProtoCount proved itself to be simples and reliable, therefore capable of increasing the number, standardization, precision and reliability of quantitative analysis performed in national fish parasitology laboratories.
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Patógenos na ostra Crassostrea rhizophorae de estuários da costa setentrional do Nordeste Brasileiro

Dantas Neto, Maximiano Pinheiro January 2015 (has links)
DANTAS NETO, M.P. Patógenos na ostra Crassostrea rhizophorae de estuários da costa setentrional do Nordeste Brasileiro. Fortaleza, 2015. 115 f. Tese (Doutorado em Ciências Marinhas Tropicais) - Instituto de Ciências do Mar, Universidade Federal do Ceará, Fortaleza 2015. / Submitted by Geovane Uchoa (geovane@ufc.br) on 2016-05-11T13:53:34Z No. of bitstreams: 1 2015_tese_mpdantasneto.pdf: 1775467 bytes, checksum: f86d0072bf76b81a183fbcbaeb691e67 (MD5) / Approved for entry into archive by Nadsa Cid (nadsa@ufc.br) on 2016-06-10T15:08:22Z (GMT) No. of bitstreams: 1 2015_tese_mpdantasneto.pdf: 1775467 bytes, checksum: f86d0072bf76b81a183fbcbaeb691e67 (MD5) / Made available in DSpace on 2016-06-10T15:08:22Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2015_tese_mpdantasneto.pdf: 1775467 bytes, checksum: f86d0072bf76b81a183fbcbaeb691e67 (MD5) Previous issue date: 2015 / Bivalve mollusks, including oysters, can be affected by a wide variety of pathogens which may be causative agents of diseases. Among these etiological agents are viruses, bacteria, protozoa and metazoa. In Northeastern Brazil, the oyster Crassostrea rhizophorae is an estuarine resource often exploited by coastal communities and therefore studies that evaluate the health status of this mollusk are important. This study aimed to investigate the occurrence of parasites in three significant estuaries of Northeastern Brazil: Jaguaribe (Ceará), Camurupim (Piauí) and Carnaubeiras (Maranhão). The collections of C. rhizophorae in each estuary were held in August and September of 2011 (dry season; N= 450); March, April (rainy season; N= 450), October and November (dry season; N= 450) of 2012 and May and June (rainy season; N= 450) of 2013, totaling 1800 animals. The techniques used for pathogens detection were culture in Ray’s fluid thioglycollate medium (RFTM), polymerase chain reaction, (PCR), sequencing and histology. The first analyses were held with oysters collected in 2011. The RFTM assays revealed Perkinsus with the follow prevalences: Jaguaribe= 17.3%, Camurupim= 5.3%, Carnaubeiras= 10.6%. The intensity of infection ranged from very light to severe in the three estuaries. PCR analyzes confirmed Perkinsus sp. in 6 oysters and histology confirmed 21 cases. Histological analyses of oysters in all collection periods (2011, 2012 and 2013) evidenced hypertrophy of male gametes, Rickettsia-type bacteria and protozoa of genera Sphenophrya, Ancistrocoma, Steinhausia and Nematopsis and metazoa of genera Urastoma, Tylocephalum and Bucephalus, and yet an unidentified metazoa. Hypertrophy of gametes occurred in Carnaubeiras (3.3%). Bacteria Rickettsia were present in the three estuaries (rainy and dry season) with prevalences ranging from 30 to 80%. The prevalences of Sphenophrya sp., Ancistrocoma sp., and Steinhausia sp. were generally low. Two oysters presented cellular hypertrophy (xenoma) caused by Sphenophrya sp. Nematopsis sp. prevalences were high (up to 100%) and low in metazoa (3.3 to 10%). The intensities of infection were low to all found pathogens. In oysters collected in 2012 and 2013, the highest prevalence observed in RFTM was 34% in the estuary of Carnaubeiras River during the rainy season of 2013. PCR assays confirmed 29.89% (87/291) of positive results in RFTM. The sequencing of the amplified fragments from the ITS region of Perkinsus confirmed the presence of three species infecting C. rhizophorae in the region: P. beihaiensis, P. marinus and P. chesapeaki. Phylogenetic analyzes place the species P. chesapeaki identified in this study in a well-defined grouping with other isolates from the USA and the Mediterranean. This is the first record of P. chesapeaki infecting C. rhizophorae in South America. Considering these findings, it is recommended a constant monitoring of the health status of populations of oysters from this and other regions of Northeastern Brazil. / Os moluscos bivalves, incluindo as ostras, podem ser afetados por uma grande diversidade de patógenos, os quais podem vir a causar enfermidades. Entre estes agentes etiológicos, estão os vírus, bactérias, protozoários e metazoários. Na região nordeste do Brasil, a ostra Crassostrea rhizophorae é um recurso estuarino bastante explotado pelas comunidades ribeirinhas e, portanto, estudos que avaliem o estado de saúde desse molusco são importantes. Este trabalho teve como objetivo investigar a ocorrência de parasitas em três importantes estuários do nordeste brasileiro: Jaguaribe (Ceará), Camurupim (Piauí) e Carnaubeiras (Maranhão). As coletas de C. rhizophorae em cada estuário foram realizadas nos meses de agosto e setembro de 2011 (período seco; N=450); março, abril (período chuvoso; N=450), outubro e novembro (período seco; N=450) de 2012 e maio e junho (período chuvoso; N= 450) de 2013, totalizando 1.800 animais. As técnicas utilizadas para a detecção dos patógenos foram: cultivo em meio fluido de tioglicolato de Ray (RFTM), reação em cadeia da polimerase (PCR), sequenciamento e histologia. As primeiras análises foram realizadas com as ostras coletadas em 2011. Os ensaios de RFTM revelaram Perkinsus sp. com as seguintes prevalências: Jaguaribe = 17,3%, Camurupim = 5,3% e Carnaubeiras = 10,6%. A intensidade de infecção variou de muito leve a severa nos três estuários. As análises de PCR confirmaram Perkinsus sp. em 6 ostras e a histologia confirmou 21 casos. As análises histológicas das ostras de todo o período de coletas (2011, 2012 e 2013) evidenciaram hipertrofia dos gametas masculinos, bactérias do tipo Rickettsia, protozoários dos gêneros Sphenophrya, Ancistrocoma, Steinhausia e Nematopsis e metazoários dos gêneros Urastoma, Tylocephalum e Bucephalus, além de um metazoário não identificado. A hipertrofia de gametas ocorreu em Carnaubeiras (3,3%). Bactérias Rickettsia estiveram presentes nos três estuários (período chuvoso e seco), com prevalências variando de 30 a 80%. As prevalências de Sphenophrya sp., Ancistrocoma sp. e Steinhausia sp. foram geralmente baixas. Duas ostras apresentaram hipertrofia celular (xenoma), causada por Sphenophrya sp. As prevalências de Nematopsis sp. foram elevadas (até 100%) e dos metazoários baixas (3,3% a 10%). As intensidades de infecção foram baixas para todos os patógenos encontrados. Nas ostras coletadas em 2012 e 2013, a maior prevalência de Perkinsus spp. observada em RFTM foi de 34%, no estuário do Rio Carnaubeiras, durante o período chuvoso de 2013. Os ensaios por PCR confirmaram 29,89% (87/291) dos resultados positivos em RFTM. O sequenciamento dos fragmentos amplificados da região ITS de Perkinsus confirmou a presença de três espécies do patógeno infectando C. rhizophorae na região: P. beihaiensis, P. marinus e P. chesapeaki. Análises filogenéticas colocam a espécie P. chesapeaki identificada neste estudo em um grupamento bem definido com outros isolados dos EUA e do Mediterrâneo. Este é o primeiro registro de P. chesapeaki infectando C. rhizophorae na América do Sul. Considerando os resultados obtidos, é aconselhável um monitoramento constante sobre o estado de saúde de populações de ostras desta e de outras regiões do Nordeste brasileiro.
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Avaliação do potencial tripanocida dos óleos essenciais de Melampodium divaricatum e Hedychium coronarium e dos extratos de Polygonum ferrugineum em cepas de Trypanosoma brucei

Rodrigues, Danilo Fernando [UNESP] 05 July 2013 (has links) (PDF)
Made available in DSpace on 2014-06-11T19:23:05Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2013-07-05Bitstream added on 2014-06-13T19:29:00Z : No. of bitstreams: 1 rodrigues_df_me_araiq_parcial.pdf: 287985 bytes, checksum: 745e0d74baf9b8af73dcadbcf68303c8 (MD5) Bitstreams deleted on 2015-06-03T11:42:47Z: rodrigues_df_me_araiq_parcial.pdf,. Added 1 bitstream(s) on 2015-06-03T11:44:11Z : No. of bitstreams: 1 000721789_20150705.pdf: 273804 bytes, checksum: 6b0dcf84e23f604b58d132de43270cc2 (MD5) Bitstreams deleted on 2015-07-06T11:21:03Z: 000721789_20150705.pdf,. Added 1 bitstream(s) on 2015-07-06T11:21:36Z : No. of bitstreams: 1 000721789.pdf: 662258 bytes, checksum: 70171a16c9156e988c31ced996731fd6 (MD5) / Protozoários como Trypanosoma brucei são causadores de importantes doenças que acometem os seres humanos e animais, como a doença do sono. A distribuição desses tripanosomas é exclusiva da África (região central, oeste e leste), sendo transmitidos por moscas do gênero Glossina, mais conhecidas como moscas tsé-tsé. Cerca de 60 milhões de pessoas estão sob risco de contrair a doença, e muitos casos novos ocorrem a cada ano. Atualmente, os fármacos disponíveis apresentam um número elevado de efeitos colaterais, tornando indispensável à busca pelo desenvolvimento de novos medicamentos. Nesse contexto, a prospecção por substâncias tripanocidas a partir de plantas é uma estratégia válida e importante. Melampodium divaricatum é uma planta nativa da América do Sul, conhecida popularmente como falsa-calêndula e por apresentar atividade antimalárica. Hedychium coronarium conhecida como lírio-do-brejo; é uma planta bem adaptada no Brasil e apresenta atividade anti-helmíntica. A planta Polygonum ferrugineum também encontrada na América do Sul apresenta atividades antibióticas e antifúngicas, e é popularmente conhecida como fumo-bravo. No presente trabalho, avaliou-se a atividade tripanocida dos óleos essenciais obtidos das partes aéreas de M. divaricatum, dos rizomas e folhas de H. coronarium e os seus compostos majoritários 8 (1,8 cineol/eucaliptol) e 9 (óxido de cariofileno), respectivamente; dos extratos e substâncias isoladas de Polygonum ferrugineum frente a duas cepas de T. brucei (método colorimétrico de MTT). Também, utilizando a técnica de RT-PCR (transcriptase reversa), foram avaliados se alguns dos compostos selecionados apresentariam interferência no processamento de RNA mensageiro (mRNA) do parasito, uma vez que, diferente de outros eucariotos... / Protozoa such as Trypanosoma brucei are causative important diseases affecting humans and animals, such as sleeping sickness. The distribution of these trypanosomes is unique to Africa (central, west and east), being transmitted by flies of the genus Glossina, better known as tsetse flies. About 60 million people are at risk of contracting the disease, and many new cases occur each year. Currently, available drugs have a high number of side effects, making it essential to search for new drug development. In this context, the prospect for trypanocidal substances from plants is an important and valid strategy. Melampodium divaricatum is a plant native to South America, popularly known as “falsa-calêndula” and display antimalarial activity. Hedychium coronarium known as “lírio-do-brejo”; is a plant well adapted in Brazil and has anthelmintic activity. The plant Polygonum ferrugineum also found in South America has antibiotic and antifungal activities, and is popularly known as “fumo-bravo” In the present work, evaluated the trypanocidal activity of essential oils obtained from aerial parts of M. divaricatum, rhizomes and leaves of H. coronarium and its major compounds 8 (1.8 cineole / eucalyptol) and 9 (caryophyllene oxide), respectively; of extracts and substances of Polygonum ferrugineum against two strains of T. brucei were evaluated (MTT colorimetric method). Also, using the technique of RT-PCR (reverse transcription), were evaluated if any of the selected compounds would show interference in the processing of messenger RNA (mRNA) of the parasite, since, unlike other eukaryotes, mRNA processing which is carried out by a mechanism cis-splicing called the trypanosomatids using the trans-splicing. The results for the cytotoxic assays demonstrated varying degrees of cytotoxicity in the parasite, and one extract... (Complete abstract click electronic access below)
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Hepatozoon spp. em carnívoros neotropicais presentes em vida livre no Parque Nacional das Emas, em Goiás, Brasil

Metzger, Betina [UNESP] 02 August 2013 (has links) (PDF)
Made available in DSpace on 2014-08-13T14:50:35Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2013-08-02Bitstream added on 2014-08-13T18:01:12Z : No. of bitstreams: 1 000735058_20140816.pdf: 115330 bytes, checksum: c7e25fd67eb0c46c76b07e5426255ce6 (MD5) / O trabalho teve como objetivo investigar a ocorrência de Hepatozoon spp. em carnívoros neotropicais de vida livre no Brasil. Foram analisadas 158 amostras sanguíneas de Canidae, Procyonidae e Mephitidae presentes no Parque Nacional das Emas, em Goiás. Do total amostral, 75 foram obtidas de Chrysocyon brachyurus (lobo-guará), 65 de Cerdocyon thous (cachorro do mato), 10 de Conepatus semistriatus (jaratataca), 06 de Lycalopex vetulus (raposinha do campo) e dois de Nasua nasua (quati). O diagnóstico de Hepatozoon spp. foi feito através da Reação em Cadeia de Polimerase (PCR) após a extração de DNA. Do total analisado, 63,92% das amostras estavam parasitadas por Hepatozoon, sendo que deste total, 41,14% eram provenientes de C. brachyurus, 18,35% de C. thous, 3,79% de L. vetulus e 0,63% de N. nasua. A maioria da população de C. brachyurus (86,66%) apresentou-se infectada, assim como 44,61% dos exemplares de C. thous e 100% dos L. vetulus estudados. A caracterização molecular dos isolados obtidos foi feita após o sequenciamento e a análise filogenética. Essa última demonstrou que isolados sequenciados de C. thous e a maioria dos de C. Brachyurus apresentaram alta similaridade com Hepatozoon sp. isolado de C. thous no Espirito Santo e também com Hepatozoon americanum. O isolado de N. nasua apresentou similaridade com H. felis e os de L. vetulus com Hepatozoon canis em cão doméstico. A identificação molecular de Hepatozoon sp. em N. nasua e os relatos das infecções por este hematozoário em C. brachyurus e em L. vetulus de vida livre são inéditos no mundo / The aim of this study was to investigate the occurrence of Hepatozoon spp. in free ranging neotropical carnivores from Brazil. 158 blood samples were analyzed from Canidae, Procyonidae and Mephitidae from Emas National Park, in the State of Goias, Brazil. From the sampling total, 75 were obtained from Chrysocyon brachyurus (maned wolf), 65 from Cerdocyon thous (crab-eating dog), 10 from Conepatus semistriatus (striped hog-nosed skunk), 06 from Lycalopex vetulus (hoary fox) and two from Nasua nasua (South American coati). Hepatozoon spp. were diagnosed by Polymerase Chain Reaction (PCR) after DNA was extracted. From the total analyzed, 63.92% samples were parasitized by Hepatozoon; and from the positive samples 41.14% were collected from C. brachyurus, 18.35% from C. thous, 3.79% from L. vetulus and 0.63% from N. nasua. The majority of C. brachyurus population (86.66%) was infected and also 44.61% of C. thous and 100% of L. vetulus studied. Molecular characterization of the isolates was performed after sequencing and phylogenetic analyses. These demonstrated that the isolates from C. thous and the majority of the ones from C. Brachyurus showed high similarity with Hepatozoon sp. from C. thous from the State of Espirito Santo and also with Hepatozoon americanum. The isolate of N. nasua showed similarity with H. felis; and the ones from L. vetulus with H. canis from domestic dog. The molecular identification of Hepatozoon sp. from N. nasua as well as the infection by this hematozoa in free ranging C. brachyurus and L. vetulus are novelties in the world
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Patógenos em ostras na Ilha de Santa Catarina-SC e no Estuário do Rio Pacoti-CE, com ênfase no protozoário Perkinsus

Sabry, Rachel Costa 25 October 2012 (has links)
Tese (doutorado) - Universidade Federal de Santa Catarina, Centro de Ciências Agrárias, Programa de Pós-Graduação em Aqüicultura, Florianópolis, 2010 / Made available in DSpace on 2012-10-25T04:26:52Z (GMT). No. of bitstreams: 1 289377.pdf: 3090473 bytes, checksum: e375bc1608223df3e1009d9660efa57f (MD5) / A perkinsiose, enfermidade causada pelo protozoário Perkinsus sp., é responsável por mortalidades de moluscos marinhos em todo o mundo. O presente estudo objetivou verificar a presença de patógenos com ênfase em Perkinsus em ostras de Santa Catarina/SC e do Ceará/CE, Brasil. Em SC, as ostras Crassostrea rhizophorae (costão) e Crassostrea gigas (cultivo) foram coletadas no Sambaqui e Ribeirão da Ilha, em março/2008 e abril/2009 (N= 1200). No CE, as ostras C. rhizophorae foram coletadas em 3 pontos do Estuário do Rio Pacoti, em agosto/2008 e dezembro/2009 (N= 900). As técnicas utilizadas foram análise macroscópica, histologia, cultivo em meio líquido de tioglicolato, reação em cadeia da polimerase (PCR), clonagem e sequenciamento de uma região identificada de Perkinsus. Os resultados nas ostras estudadas mostraram: hipertrofia gamética, a presença de bactérias do tipo rickettsia; protozoários: Perkinsus, Nematopsis, Trichodina, Sphenophrya, Ancistrocoma e Steinhausia. As hipertrofias e bactérias foram detectadas nas ostras de SC e Perkinsus somente nas ostras do CE. Os metazoários observados foram poliquetas Polydora, Urastoma, Tylocephalum, copépode possivelmente do gênero Pseudomyicola e, nas ostras do Ceará, larvas de digenéticos. Os patógenos não foram associados a danos significativos nos tecidos das ostras, em SC e CE. As ostras do CE foram diagnosticadas com Perkinsus sp. (5,8% em 2008 e 5,1% em 2009). A PCR com iniciadores específicos seguida do sequenciamento confirmou se tratar do gênero Perkinsus, porém ainda não foi possível confirmar a espécie.
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Detecção e identificação de Cryptosporidium spp. Tyzzer, 1907 em fezes de animais e em água do Zoológico Municipal de Curitiba, Paraná Brasil

Bosa, Cláudia Regina January 2014 (has links)
Orientadora : Profª Drª Edilene Alcântara de Castro / Co-orientadora : Profª Drª Adriana Oliveira Costa / Tese (doutorado) - Universidade Federal do Paraná, Setor de Ciências Biológicas, Programa de Pós-Graduação em Ciencias Biológicas (Microbiologia, Parasitologia e Patologia Básica). Defesa: Curitiba, 30/09/2014 / Inclui referências / Resumo: O protozoário Cryptosporidium pertence ao filo Apicomplexa. Possui capacidade de infectar todas as classes de vertebrados (aquáticos, aéreos, terrestres), inclusive o ser humano. Atualmente, são reconhecidas vinte e uma espécies de Cryptosporidium e aproximadamente 40 genótipos foram identificados. A infecção ocorre por meio da ingestão de oocistos liberados infectantes nas fezes dos hospedeiros. Algumas espécies apresentam potencial zoonótico, como C. parvum e C. meleagridis. Cryptosporidium causa diarreia, normalmente com cura espontânea, sendo mais grave em indivíduos imunodeprimidos ou portadores de doenças autoimunes. As coleções de água potável e de recreação são as principais fontes de infecção. Em países desenvolvidos faz-se o monitoramento da água, para consumo, distribuída à população, porém naqueles em desenvolvimento o mesmo não ocorre e a doença é considerada negligenciada. No mundo poucos trabalhos são encontrados tratando da prevalência e dinâmica da transmissão da criptosporidiose em zoológicos, os quais apresentam singularidades que facilitam este tipo de estudo, apesar do fato de os animais não estarem em seus habitats naturais. No Brasil, não existem estudos em zoológicos contemplando a detecção de Cryptosporidium em fezes de animais e nas águas dos lagos presentes nestes ambientes. O objetivo do presente trabalho foi verificar a presença de Cryptosporidium em fezes de aves e mamíferos e nas águas dos recintos e lagos do Zoológico Municipal de Curitiba. No período de março/2011 a dezembro/2011, 249 amostras fecais (121 de aves e 128 de mamíferos) foram coletadas e processadas para detecção, identificação morfológica e molecular. As fezes foram filtradas, sedimentadas e submetidas ao protocolo de purificação em solução saturada de NaCl. O material foi analisado por meio da técnica de Ziehl-Neelsen modificada e processado para extração de DNA e detecção por PCR e Nested PCR. Amostras de seis coleções aquáticas (três em cada coleção, N=18) também foram coletadas para análise. A água foi filtrada em membrana de acetato-celulose e o eluato obtido foi processado para a realização da técnica de coloração de Ziehl-Neelsen modificada, e detecção molecular do parasito por PCR e nested PCR, usando iniciadores para a região hiper-variada do gene 18SSU rDNA. Das amostras fecais analisadas, duas foram positivas para a coloração de Ziehl-Neelsen modificada sendo uma de ararajuba (Guaruba guarouba) e outra de papapagaio-de-cara-roxa (Amazona brasiliensis). A Nested PCR foi positiva nas duas amostras anteriores e em uma terceira, proveniente de outro papagaio-da-cara-roxa. O material de um quarto animal, um papagaio-de-peito-roxo (Amazona vinacea), também foi positivo na PCR de primeira etapa. Das coleções aquáticas amostradas uma apresentou positividade em duas das três amostras coletadas. O registro de Cryptosporidium nestas aves é o primeiro na literatura mundial. Os isolados obtidos foram sequenciados. A espécie C. galli foi identificada nas amostras provenientes de aves e C. parvum nas amostras provenientes de coleções aquáticas e para o controle de referência. Uma árvore filogenética utilizando análise Bayesiana foi construída e nela os isolados identificados ficaram em um mesmo ramo, com um bom suporte, já o controle ficou no mesmo grupo da sequência de C. parvum do GenBank. Estes resultados indicam similaridade dos isolados encontrados. Conclui-se que o presente trabalho poderá servir como subsídio para a ambientação dos recintos e para o manejo dos animais, principalmente no que se refere ao contato com as águas do ambiente para a saúde dos animais, dos trabalhadores e visitantes do zoológico, devido à identificação de uma espécie de potencial zoonótico C. parvum. Palavras-chave: Zoonoses; Saúde Pública; Animais Silvestres; protozoários. / Abstract: The Cryptosporidium protozoan belongs to the phylum Apicomplexa. It is capable of infecting all vertebrate classes (aquatic, aerial, and terrestrial), including humans. Currently, twenty one species of the genus Cryptosporidium are recognized, and approximately 40 genotypes were identified. Infection occurs through the ingestion of infected oocysts released in the feces of the hosts. Some species have zoonotic potential, such as C. parvum and C. meleagridis. Cryptosporidium causes diarrhea, usually with spontaneous cure, being more worrisome in immunocompromised individuals or patients with autoimmune diseases. The collections of drinking water and recreation are the main sources of infection. In developed countries the drinking water supplied to the population is monitored for this pathogen, however the same does not occur in developing countries where the disease is considered neglected. In the world few studies dealing with the prevalence and transmission dynamics of cryptosporidiosis in zoos are found. These spaces have singularities that facilitate this type of study, despite the fact that animals are not in their natural habitats. In Brazil, there are no studies in these environments contemplating cryptosporidiosis. This work aims to verify Cryptosporidium infection in captive birds and mammals, and also in the water bodies and pounds in the enclosures of the Municipal Zoo of Curitiba. From March 2011 to December 2011, 249 fecal samples, 121 birds and 128 mammals were collected and processed for morphological and molecular identification of Cryptosporidium. Feces were filtered, pelleted and subjected to the purification protocol in saturated NaCl solution. Samples were analyzed following Ziehl-Neelsen modified technique, and processed for DNA extraction and detection by PCR and Nested PCR. Water samples from six sites (three in each site, N=18) were also collected for analysis. The water was filtered through a cellulose-acetate membrane and the eluate obtained was processed by Ziehl-Neelsen modified technique, followed by the molecular detection through PCR and Nested PCR, using primers for the hyper-diverse region of the rDNA gene 18SSU. Two fecal samples were positive on microscopy for Cryptosporidium: one from Golden Parakeet (Guaruba guarouba) and other from Red-tailed Amazon (Amazona brasiliensis). The Nested PCR was positive for the two previous samples and also in a third from another Red-tailed Amazon. The material of a fourth animal, Vinaceous Amazon (Amazona vinacea), was also positive in PCR first step. For the water collection, one was positive in two of the three samples. The record of Cryptosporidium in these birds is the first in the world literature. The isolates obtained were sequenced. The species C. galli was identified for isolates from birds and C. parvum isolate derived for the collection of water and the control reference. A phylogenetic tree was constructed using Bayesian analysis, where the isolates identified in this study clustered in the same branch, with good support, since the control group was the same sequence of C. parvum from GenBank. These results indicate similarity of isolates found. We conclude that this study can serve as input to the ambiance of the grounds and for the handling of animals, especially with regard to contact with the waters of the environment for the animals' health, workers and visitors to the zoo, due to identifying a kind of C. parvum zoonotic potential. Keywords: Zoonoses, Public Health; Wild Animals; Protozoa.
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Avaliação de duas técnicas coproparasitológicas convencionais e de um kit comercial na investigação da epidemiologia de parasitas gastrintestinais de cães no Estado de São Paulo

Katagiri, Satie [UNESP] 20 February 2006 (has links) (PDF)
Made available in DSpace on 2014-06-11T19:24:00Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2006-02-20Bitstream added on 2014-06-13T19:30:26Z : No. of bitstreams: 1 katagiri_s_me_botfmvz.pdf: 167133 bytes, checksum: ef0b4cbbb690eba49ecb859a6ee7a778 (MD5) / Universidade Estadual Paulista (UNESP) / As técnicas coproparasitológicas de concentração por sedimentação e por flutuação e o kit TF-Test® foram utilizadas na investigação da epidemiologia dos parasitas gastrintestinais de cães no Estado de São Paulo. Amostras de fezes de 129 cães errantes e de 125 domiciliados foram colhidas de outubro de 2004 a setembro de 2005 e processadas de acordo com os protocolos do kit TF Test® e dos métodos de centrífugo-sedimentação e centrífugo-flutuação. Os seguintes parasitas e suas respectivas freqüências foram detectados: Ancylostoma spp. (38,2%), Giardia sp. (16,9%), Toxocara canis (8,7%), Tnchuns vulpis (7,1%), Isospora spp. (3,5%), Sarcocystís spp. (2,7%) e Dipy!idium caninum (2,4%). Dos 132 animais parasitados, 79 apresentaram parasitismo único e 53 estavam parasitados por dois ou mais gêneros e/ou espécies. Em cães errantes a prevalência de Ancylostoma spp., T. canis e Giardia sp. e a ocorrência de poliparasitismo foi maior (P < 0,01) que em animais domiciliados. Não houve diferença na freqüência de parasitas intestinais relacionada ao sexo, raça ou ao tratamento anti-helmíntico dos animais (P > 0,05), no entanto a freqüência de T. canis foi maior (P < 0,05) em cães jovens. Com relação à sazonalidade, a detecção de cistos de Giardia sp. foi mais freqüente nos meses de outubro a março. A sensibilidade diagnóstica do método de centrífugo-flutuação foi maior para todos os parasitas intestinais diagnosticados, porém somente no caso de Ancylostoma spp. essa diferença (P <0,05) se expressou em termos de uma maior freqüência de detecção de cães infectados. O elenco de parasitas diagnosticados na região estudada faz com que a técnica de centrifugo-flutuação com sulfato de zinco seja a mais apropriada tanto para os estudos epidemiológicos como para o diagnóstico individual, especialmente nas infecções subclínicas. / The sedimentation and flotation procedures for concentration of fecal specimens and the commercial device TF were used, in an epidemiological investigation of gastrointestinal parasites of dogs in São Paulo state. Fecal samples from 129 stray dogs and 125 dogs with an owner were collected from October 2004 to September 2005. AlI samples were concentrated by the sedimentation and flotation methods and by TF-Test® device. The following parasites, and their respective frequency were diagnosed in fecal samples : Ancylostoma spp. (38,2%), Giardia sp. (16,9%), Toxocara canis (8,7%), Tnchuris vulpis (7,1%), Isospora spp. (3,5%), Sarcocystis spp. (2,7%) and Dipylidium caninum (2,4%). Fifty-three out of 132 infected animais had mixed infection with two or more parasite genera. The prevalence of Ancy!ostoma spp., 1 canis and Giardia sp. as well as the occurrence of mixed infections were significantly higher in stray dogs (P <0,01) than in dogs with an owner. No effect of gender, breed and anti-helminthic treatment (P> 0,05) on the parasite frequency was observed, but the frequency of T. canis was higher (P < 0,05) in young animais. Giardia sp. cysts were more frequently detected from October to March. The centrifugation-flotation method was generally more accurate in the diagnosis of ali intestinal parasites of dogs, but only for Ancylostoma spp. this difference was observed in terms of prevalence. The species of parasites found in the studied region make the zinc sulfate flotation the most appropriate method not only to epidemiological studies, but also to individual diagnosis, speciaily in subciinical infections.
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Resposta imune-humoral e proteinogramas séricos de bovinos naturalmente infectados pelo Trypanosoma vivax

Sampaio, Paulo Henrique [UNESP] 18 February 2013 (has links) (PDF)
Made available in DSpace on 2014-06-11T19:23:46Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2013-02-18Bitstream added on 2014-06-13T18:19:58Z : No. of bitstreams: 1 sampaio_ph_me_jabo.pdf: 692117 bytes, checksum: 3c437fb5bb356c636b004d7e3732942b (MD5) / Em bovinos o protozoário Trypanosoma vivax causa enfermidade que pode levar à redução dos índices produtivos ou a morte do animal. O diagnóstico deste protozoário pode ser realizado por testes parasitológicos, sorológicos e moleculares. Entretanto estes testes não são capazes de fornecer prognóstico, indicar a fase da infecção e a responsividade ao tratamento instituído. Por outro lado, o proteinograma sérico pode fornecer tais informações. O objetivo do estudo foi determinar o perfil eletroforético de proteínas de fase aguda de bovinos Girolando naturalmente infectados com T. vivax (NIF), utilizando-se como matriz gel de acrilamida contendo dodecil sulfato de sódio (SDS-PAGE). Foram estudados dois grupos de animais, NIF (n=507) e grupo de bovinos não infectados (NI; n=50). Amostras de soros de ambos os grupos foram submetidas à reação de imunofluorescência indireta (RIFI) e Ensaio de Imunoadsorção Enzimática (ELISA) para detecção de anticorpos anti-T. vivax e realização do fracionamento eletroforético. A porcentagem de soros positivos pela RIFI foi de 89,74% e pelo ELISA 93,09%, sendo que este método mostrou-se capaz de detectar mais amostras positivas do que a RIFI para detecção de anticorpos anti-T. vivax em fases iniciais da infecção. No fracionamento proteico foram consideradas 12 proteínas; sendo elas IgA, ceruloplasmina, proteínas de 95 KDa, 88 KDa, transferrina, albumina, antitripsina, IgG, haptoglobina, glicoproteína ácida e proteínas de 23 KDa e 20,5 KDa. No grupo NIF observou-se aumento de proteína total, IgA, proteína de 88 KDa, albumina, antitripsina, IgG, haptoglobina, 20,5 KDa e diminuição de ceruloplasmina, proteína de 95 KDa e 23 KDa e transferrina. Glicoproteina ácida não apresentou diferença significativa entre os grupos NIF e NI. A antitripsina pode ser utilizada como indicador da... / The protozoan T. vivax can cause an important disease in cattle, which is responsible for death or low index productive. The diagnosis is based on parasitologic, molecular and sorological tests. However, these tests are not able to provide prognostic, infection phase and response of treatment. On the other hand, serum proteinograms can accomplish these features. The present work aimed to assess the acute phase proteins eletrophoretic profile in Girolando cattle naturally infected by T. vivax (NIF) by SDS-Page. For this purpose, two groups of animals were utilized: one naturally infected by T. vivax (NIF; n=507) and another one by noninfected cattle (NI; n=50). Serum samples were submitted to IFA and ELISA for detecting IgG antibody to T. vivax. SDS-Page was only performed in samples which showed positive results in serological testes. The percentage of positive samples by IFA and ELISA were 89,74% and 93,09%, respectively. ELISA showed a higher number of seropositive samples when compared to IFA. In eletrophoretic fractioning 12 proteins were evaluated, including IgA, ceruloplasmin, 95 KDa and 88 KDa proteins, transferrin, albumin, antitrypsin, IgG, haptoglobin, acidic glycoprotein, and 23 KDa and 20,5 KDa proteins. NIF animals showed an increase of serum concentration of IgA, 88 KDa, albumin, antitrypsin, IgG, haptoglobin, 20,5 KDa when compared to NI animals; on the other hand, serum concentration of ceruloplasmin, 95 KDa and 23 KDa proteins, and transferrin were lower in NIF animals when compared to NI animals. Acidic glycoprotein serum concentration did not shown differences when both groups of sampled animais were compared. Since Antitrypsin was only detected in NIF animals, this protein may be used as a marker of T. vivaxinfection in cattle. More studies should be performed aiming to clarify the identity of 95, 88, 23, 20,5 KDa... (Complete abstract click electronic access below)
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Genotipagem dos isolados de Giardia duodenalis de humanos e de cães na colônia de pescadores de Porto Said, Botucatu, São Paulo

David, Érica Boarato [UNESP] 26 February 2015 (has links) (PDF)
Made available in DSpace on 2016-08-12T18:48:41Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2015-02-26. Added 1 bitstream(s) on 2016-08-12T18:50:55Z : No. of bitstreams: 1 000865143.pdf: 1222502 bytes, checksum: 6d7d7cfc6cf6e5880416ce873a338cad (MD5) / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP) / Muitas espécies de protozoários podem causar gastroenterite aguda ou crônica em seres humanos e são altamente prevalentes nas populações residentes nos países em desenvolvimento, onde a transmissão é favorecida devido a condições precárias de higiene e escassa disponibilidade de água potável. No entanto, a infecção assintomática e o poliparasitismo também são comumente observados nessas populações. Neste trabalho, investigou-se a prevalência de protozoários intestinais em duas colônias de pescadores, Porto Said (PS) e Santa Maria da Serra (SM), situadas ao longo do rio Tietê, no Estado de São Paulo. As colônias não dispõem de serviços públicos básicos como: vias públicas, fornecimento de água e luz e saneamento básico. Todos os colonos (n = 88 em PS, e n = 38 em SM) coletaram três amostras de fezes, e todos eram assintomáticos no momento da coleta. Para obter informações sobre as possíveis vias de transmissão, amostras fecais de 49 cães (38 de PS e 11 de SM) e 28 amostras de água do rio foram coletadas (16 de PS e 12 de SM). As amostras fecais humanas e caninas foram analisadas por microscopia e PCR para detectar e caracterizar os protozoários Giardia duodenalis, Blastocystis spp., Dientamoeba fragilis e Cryptosporidium spp. Diante dos resultados obtidos, Blastocystis spp. foi o parasita mais prevalente nas amostras humanas (45,4% em PS e 71% em SM), seguido por D. fragilis (13,6% em PS e 18,4% em SM) e G. duodenalis (18,2% em PS e 7,9% em SM), já Cryptosporidium spp. não foi detectado na população humana. Além disso, G. duodenalis foi detectado em quatro cães (10,5%) em PS e dois cães (18,2%) em SM, enquanto que um único cão foi detectado com Cryptosporidium canis. Nas 28 amostras de água previamente processadas pelos métodos de filtração e separação imunomagnética e examinadas por microscopia de fluorescência, oocistos de Cryptosporidium e cistos de Giardia não foram... / Several species of protozoa cause acute or chronic gastroenteritis in humans, worldwide. The burden of disease is particularly high among children living in developing areas of the world, where transmission is favored by lower hygienic standards and scarce availability of safe water. However, asymptomatic infection and polyparasitism are also commonly observed in poor settings. Here, we investigated the prevalence of intestinal protozoa in two small fishermen villages, Porto Said (PS) and Santa Maria da Serra (SM), situated along the river Tietê in the State of São Paulo, Brazil. The villages lack basic public infrastructures and services, such as roads, public water supply, electricity and public health services. Multiple fecal samples were collected from 88 individuals in PS and from 38 individuals in SM, who were asymptomatic at the time of sampling and had no recent history of diarrheal disease. To gain insights into potential transmission routes, 49 dog fecal samples (38 from PS and 11 from SM) and 28 river water samples were also collected. All samples were tested by microscopy and PCR was used to genotype isolates of Giardia duodenalis, Blastocystis spp., Dientamoeba fragilis and Cryptosporidium spp. By molecular methods, the most common human parasite was Blastocystis spp. (prevalence, 45% in PS and 71% in SM), followed by D. fragilis (13.6% in PS, and 18.4% in SM) and G. duodenalis (18.2% in PS and 7.9% in SM); Cryptosporidium spp. were not detected. Further, G. duodenalis was found in 4 dogs (10.5%) in PS and 2 dogs (18.2%) in SM, whereas a single dog was found infected with Cryptosporidium canis. River water samples processed by filtration and immunomagnetic separation and examined by fluorescent microscopy, were negative for Cryptosporidium oocysts and Giardia cysts. Sequencing of the barcoding region of the small subunit ribosomal gene revealed large genetic variation among Blastocystis isolates, with subtypes (STs) that ... / FAPESP: 11/52100-3
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Enteroparasitoses caninas

Táparo, Cilene Vidovix [UNESP] 24 April 2006 (has links) (PDF)
Made available in DSpace on 2014-06-11T19:27:18Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2006-04-24Bitstream added on 2014-06-13T20:16:25Z : No. of bitstreams: 1 taparo_cv_me_araca.pdf: 677501 bytes, checksum: cb871034a8580ee800d34d6d183f9ac3 (MD5) / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP) / As enteroparasitoses comumente afetam o equilíbrio orgânico dos animais de estimação, sendo isto particularmente preocupante em relação aos cães, devido ao intimo contato destes com o homem. As técnicas coproparasitológicas usualmente utilizadas na rotina laboratorial para detecção de parasitoses gastrintestinais são indispensáveis para o diagnóstico e por conseqüência para determinar a necessidade de tratamento dos animais infectados. Neste estudo objetivou-se avaliar a ocorrência de helmintoses e protozooses em cães domiciliados e sua associação com faixa etária, sexo e raça, bem como a eficiência dos Métodos Willis- Mollay, Faust, Sedimentação e Exame Direto quanto a recuperação de ovos e oocistos de parasitos gastrintestinais da espécie canina. Foram processadas 401 amostras fecais, sendo que em 300 foi efetuada a Técnica de Kinyoun para pesquisa de Cryptosporidium spp. Os parasitos encontrados foram Ancylostoma spp. em 53,1%, Toxocara canis em 20,7%, Cystoisospora ohioensis em 15,7%, Trichuris vulpis em 3,7%, Dipylidium caninum em 2,5%, Cryptosporidium spp. em 1,33% e Taenia spp. em 1,0% das amostras. A positividade para Ancylostoma spp. não foi influenciada pelas variáveis raça, sexo e idade. Houve diferença estatisticamente significativa para T. canis e C. ohioensis nos cães com até seis meses de idade quando comparados a animais acima de seis meses (P<0,0001). Quanto a variável sexo houve associação apenas com o ascarídeo T. canis com maior ocorrência nos machos quando comparado as fêmeas (P = 0,0243). A associação da presença das formas evolutivas dos parasitos com raça dos cães não foi estatisticamente significativa. / The enteroparasitoses generally affect the organic equilibrium of pets, being particularly worrying referring to dogs, due to intimate contact with the human being. The techniques coproparasitologics usually used in laboratorial routines for detection of gastroenteric parasitoses are indispensable for the diagnosis and consequence to determine the necessary of infected animals treatment. In this study we evaluated the occurrence of helminthoses and protozooses in dogs and its association with age, sex and race, as well as the efficiency of Willis-Mollay, Faust, Sedimentation and exam Direct methods. It was processed 401 fecal samples, being accomplished in 300 parts, the technique of Kinyoun for directed research of Cryptosporidium spp. The parasite found were Ancylostoma spp. (53.1%), Toxocara canis (20.7%), Cystoisospora ohioensis (15.7%), Trichuris vulpis (3.7%), Dipylidium caninum (2.5%), Cryptosporidium spp. (1.33%) and Taenia spp. (1.0%). There was a statistically significant difference for T. canis and C. ohioensis in dogs up to six months old (P<0,0001). The occurrence of T. canis was statistically bigger in males when compared to females (P=0,0243). The association of parasites with race was not statistically significant. Of the four dogs (1.33%) positives for Cryptosporidium spp., only one presented a semi liquid consistence faeces and light dehydration (5 to 7%), having this animal age superior to six months old, with simultaneous infection for Ancylostoma spp. The Willis-Mollay was more efficient in the diagnosis of Ancylostoma spp. and T. canis eggs. The Direct method was least efficient. The techniques were statistically the same as the occurrence of the C. ohioensis oocysts.

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