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Estudo da origem e evolução dos cromossomos sexuais do gênero Megaleporinus a partir de sequências repetitivas /

Crepaldi, Carolina. January 2019 (has links)
Título original: Estudo da origem e evolução dos cromossomos sexuais do gênero Leporinus a partir de sequências repetitivas / Orientador: Patricia Pasquali Parise-Maltempi / Banca: Luciana Bolsoni Lourenço / Banca: Marcelo Ricardo Vicardi / Resumo: Cromossomos sexuais se apresentam como entidades dinâmicas dentro de um genoma, com evolução, morfologia e conteúdo genético únicos, e tendo evoluído de maneiras independentes dentro dos grupos de vertebrados. No caso dos peixes, apesar da maioria das espécies não apresentarem cromossomos sexuais diferenciados, existe uma enorme diversidade de mecanismos cromossômicos para a determinação do sexo, incluindo fêmeas ou machos heterogaméticos e sistemas simples ou múltiplos. Na maioria dos casos, a diferença entre os homólogos sexuais envolve blocos heterocromáticos, sendo bem estabelecidos em sistemas do tipo ZZ/ZW em que perda ou ganho de heterocromatina são as principais causas de diferenciação entre estes cromossomos. O gênero Megaleporinus, pertencente à família Anostomidae e com cromossomo heteromórfico W, é um modelo interessante para estudo da evolução e seleção desta heterogametia, especialmente pela alta quantidade de sequências repetitivas presente em seus cromossomos sexuais e a possível implicação na diferenciação destes. Assim, no presente trabalho, a análise feita de elementos repetitivos pelo RepeatExplorer na fêmea de Megaleporinus elongatus mostrou que esta possuiu 22.2% dos reads aleatórios de seu genoma constituídos por DNAs repetitivos, sendo 5.6% correspondentes a DNAs satélites. Foram isolados 69 variantes de DNAs satélites da fêmea, com tamanhos entre 20pb e 245pb, que foram caracterizados e validados experimentalmente. Por fim, estes foram mapeados atravé... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: Sex chromosomes are dynamic entities inside a genome, presenting unique evolution, morphology and genetic content and having evolved independently within vertebrates. In fish, although most species do not present differentiated sex chromosomes, there is an enormous diversity of chromosomic mechanisms for sexual determination that may include female or male heterogamety and simple or multiple sexual systems. In most cases, the difference between sexual homologues involve heterochromatic blocks and this fact is well established in species with the ZZ/ZW system, in which the gain or loss of heterochromatin is the main cause for chromosome differentiation. The genus Megaleporinus, from the Anostomidae family and with a ZZ/ZW sexual system, is an interesting model for studies of evolution and selection of sex chromosomes in fish, especially because the presence of heteromorphic sex chromosomes is restricted to just a few species of the genus and there is a high quantity of repetitive sequences in their chromosomes. In the present work, the analysis of Megaleporinus elongatus female genome repetitive content by RepeatExplorer returned 22.2% of its analysed reads constituted of repetitive DNA. From this, 5.6% correspondes to satellite DNA, and 69 satDNA variants were isolated and manually annotated, with sizes ranging from 20bp to 245bp, and validated through PCR. These variants were mapped through fluorescence in situ hybridisation on the species' chromosomes. The 16 satellites tha... (Complete abstract click electronic access below) / Mestre
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Aplicação das técnicas de microscopia eletrônica de transmissão e histologia para análise de mixozoários parasitos de peixes do Rio Batalha, médio Rio Tietê, São Paulo, Brasil

Vieira, Diego Henrique Mirandola Dias. January 2016 (has links)
Orientador: Rodney Kozlowiski de Azevedo / Resumo: Mixozoários são metazoários parasitos obrigatórios principalmente de peixes, sendo alguns dos mais importantes patógenos desses hospedeiros. Existem cerca de 2200 espécies descritas para a classe Myxosporea, porém no Brasil os estudos ainda continuam escassos. Nesse estudo foram coletados peixes de diferentes espécies entre março de 2014 e agosto de 2015, para ser verificado a presença de mixozoários parasitos. Foram encontrados mixozoários do gênero Henneguya e Myxobolus parasitando peixes das ordens Characiformes e Siluriformes. Os parasitos coletados foram processados visando uma análise morfológica através de microscopia de luz, histopatologia e análise ultraestrutural, observando-se ainda a relação parasito-hospedeiro. Henneguya sp. 1 foi encontrado parasitando as brânquias de Astyanax altiparanae e Henneguya sp. 2 parasitando as brânquias de Leporinus friderici. Myxobolus prochilodus, Henneguya sp. 3 e Myxobolus sp. 1 foram encontrados parasitando as brânquias de Prochilodus lineatus causando deformações nas lamelas primárias dos peixes. Henneguya sp. 4 foi encontrada parasitando as brânquias de Cyphocharax modestus, causando uma junção das lamelas secundárias e diminuindo a área de respiração útil do peixe. A análise ultraestrutural permitiu a compreensão da interface parasito-hospedeiro. Também foram observados Henneguya guanduensis parasitando o intestino de Hoplosternum litoralle e Myxobolus sp. 2 parasitando o intestino de Rhamdia quelen. Myxobolus aureus foi enc... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: Myxozoans are metazoan parasites mainly on fish, with some of the most important pathogens of these hosts. There are about 2,200 described species for Myxosporea class, but in Brazil the studies are still scarce. In this study fish of different species were collected between March 2014 and August 2015 to be verified the presence of myxozoans parasites. The genera of myxozoans found were Henneguya and Myxobolus parasitizing fish of Characiformes and Siluriformes orders. The parasites collected were processed aiming a morphological analysis by light microscopy, histopathology and ultrastructural analysis, observing the host-parasite relationship. Henneguya sp. 1 was found parasitizing the gills of Astyanax altiparanae and Henneguya sp. 2 parasitizing the gills of Leporinus friderici. Myxobolus lomi (Myxobolus prochilodus), Henneguya sp. 3 and Myxobolus sp. 1 were found parasitizing the gills of Prochilodus lineatus causing deformities in fish primary lamellae. Henneguya sp. 4 was found parasitizing the gills of Cyphocharax Modestus, causing a junction of secondary lamellae and decreasing the useful breathing area of the fish. The ultrastructural analysis allowed the understanding of parasite-host interface. Also were observed Henneguya guanduensis parasitizing the intestine of Hoplosternum litoralle and Myxobolus sp. 2 parasitizing the intestine of Rhamdia quelen. Myxobolus aureus was found parasitizing the gonads and liver of Salminus hilarii. Histopathological analysis indic... (Complete abstract click electronic access below) / Mestre
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Desenvolvimento gonadal e clonagem molecular de Dmrt1 (doublesex and mab-3-related transcription factor-1) e Sox9 em teleósteos sul-americanos. / Gonadal development and molecular cloning of Dmrt1 (doublesex and mab-3-related transcription factor-1) and Sox9 in South American teleosts.

Adolfi, Mateus Contar 09 December 2011 (has links)
As sequências dos genes dmrt1 e sox9 em pirarucu (Arapaima gigas), lambari (Astyanax altiparanae) e piapara (Leporinus elongatus) foram analisadas por técnicas de clonagem molecular. Fragmentos do gene dmrt1 foram clonados nas três espécies citadas, e do gene sox9 em lambari e piapara. A análise filogenética destes genes mostrou concordância com os dados morfológicos da filogenia destas espécies. Pelo acompanhamento do desenvolvimento gonadal de lambari por microscopia de luz, foi constatada a presença de células germinativas na região da futura gônada já no período de 5 dias após eclosão (dae), sendo também observado que a formação de ovário ocorre primeiro do que a formação de testículo. As expressões dos genes dmrt1 e sox9 por qRT-PCR em lambari mostraram maior especificidade para testículo do que para ovário, indicando que possivelmente estes genes ainda possuem função macho-específica nos adultos. Em lambari, os genes foram expressos em todos os períodos larvais, tendo uma diminuição no estágio de 12 dae, e aumentando sua expressão no estágio de 33 dae. / The sequences of dmrt1 and sox9 genes were analyzed in pirarucu (Arapaima gigas), lambari (Astyanax altiparanae) and piapara (Leporinus elongatus) using molecular cloning techniques. Fragments of dmrt1 gene were cloned in these three species, and sox9 gene fragments have been acquired only for lambari and piapara. Phylogenetic analysis of the genes was shown to be consistent with the morphological phylogeny of these species. The analysis of the gonadal development in lambari was followed by light microscopy, where it was found the presence of germ cells in the region of the future gonad in 5 days after hatching (dah), and that the formation of ovaries occurs first comparing to the formation of testis. The gene expression of dmrt1 and sox9 by qRT-PCR method show specificity for testis comparing to ovary, which indicates that these genes also have a male-specific role in the adult. In lambari, the genes were expressed in all larval periods, with a decrease of expression levels in 12 dah, and increasing its expression at stage of 33 dah.
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Estudo taxonômico das espécies de Acestrorhynchus do grupo lacustris, e atualização dos dados de distribuição geográfica de todas as espécies do gênero, para os rios brasileiros / Taxonomic revision of the species of Acestrorhrynchus of the lacustris group and update of the distribution records of all species of the genus in Brazilian drainages

Gonzalez, Maria Del Carmen Paradeda 09 October 2015 (has links)
Acestrorhynchus Eigenmann& Kennedy, 1903 é um gênero de peixes de água doce, cujas espécies estão distribuídas principalmente na região da América do Sul cis-andina. Conhecidas popularmente como peixe-cachorro, cachorrinho, care´perro ou picuá em Brasil, Venezuela, Colombia e Peru. Caracterizadas por apresentar dentes cônicos e caninos, focinho alongado. São de habito alimentar piscívoro. Algumas espécies são de porte pequeno e outras raramente ultrapassando 40 cm de comprimento. Estão associadas a ambientes lenticos, principalmente lagoas e áreas próximas a margens dos rios. Algumas espécies do gênero realizam migrações reprodutivas de curta distancia, não apresenta cuidado parental. As espécies do gênero Acestrorhynchus têm sido agrupadas principalmente com base no padrão de colorido. Até o presente estudo têm sido reconhecidas 14 espécies válidas: Acestrorhynchus abbreviatus (Cope, 1878); Acestrorhynchus altus Menezes, 1969; Acestrorhynchus britskii Menezes, 1969; Acestrorhynchus falcatus (Bloch, 1794); Acestrorhynchus falcirostris (Cuvier, 1819); Acestrorhynchus grandoculis Menezes & Géry, 1983; Acestrorhynchus heterolepis (Cope, 1878); Acestrorhynchus isalineae Menezes & Géry, 1983; Acestrorhynchus lacustris (Lütken, 1875a); Acestrorhynchus maculipinna Menezes &n Géry, 1983; Acestrorhynchus microlepis (Schomburgk, 1841); Acestrorhynchus minimus Menezes, 1969; Acestrorhynchus nasutus (Eigenmann, 1912); Acestrorhynchus pantaneiro Menezes, 1992. Das quais quatro espécies têm sido reconhecidas no grupo lacustris: Acestrorhynchus abbreviatus (Cope, 1878) da bacia do alto Amazonas e drenagens do rio Madeira; Acestrorhynchus lacustris (Lütken, 1875a) das bacias do alto rio Paraná e rio São Francisco; Acestrorhynchus altus (Menezes, 1969) da bacia do médio e baixo Amazonas e Ilha do Marajó e Acestrorhynchus pantaneiro Menezes, 1992 da bacia do rio Paraguai e da bacia do Prata (rio da Prata, rio Uruguai e baixo Paraná). Estudo de um maior número de exemplares, muitos provenientes de localidades não abrangidas no estudo de Menezes (1992), revelou um aumento da amplitude de variação de dados merísticos e morfométricos das espécies do grupo. Além disso, exemplares depositados recentemente nas coleções revelaram que as distribuições geográficas das outras especies de Acestrorhynchus são mais amplas do que conhecida. Foram analisados 630 exemplares do grupo lacustris, dos quais 508 tiveram dados merísticos e morfométricos enquanto que para a atualização de informação geográfica das demais espécies do gênero foram analisados 3048 exemplares. Exemplares analisados neste estudo, incluindo exemplares de localidades não amostradas na ultima revisão do grupo, mostrou que as características utilizadas como diagnosticas para as espécies do grupo lacustris: escamas ao redor do pedúnculo caudal, escamas acima da linha lateral, escamas abaixo da linha lateral, comprimento da nadadeira peitoral, passando ou quase sempre ultrapassando a origem da pélvica e a relação de tamanho da mancha caudal, apresentam sobreposição nas amplitudes de variação dessas contagens por tanto não foram corroboradas neste estudo. São reconhecidas duas espécies válidas para o grupo lacustris: Acestrorhynchus abbreviatus (Cope, 1878) e Acestrorhynchus lacustris (Lükten, 1875a), sendo Acestrorhynchus altus e Acestrorhynchus pantaneiro, sinônimos junior de Acestrorhynchus abbreviatus com novas localidades de ocorrência. / Acestrorhynchus Eigenmann & Kennedy, 1903 is a genus of fresh water fishes geographically distributed through South America, specially east from the Andes. The species from this genus are commonly known as \"peixe-cachorro\", \"cachorrinho\", \"care´perro\" or \"picuá\" in Brazil, Venezuela, Colombia and Peru. Species in this genus are characterized by conic and canine teeth and prolonged snout. The food habit is piscivorous. Some species have small bodies and other rarely grow over 40 cm in length. They are associated with lentic habitats, mainly lagoons and areas close to river margins. Some species of the genus migrate short distances in order to reproduce and do not exibit parental care. The color pattern has been the main character to group species from the Acestrorhynchus genus. Until the present study, there were 14 valid species: Acestrorhynchus abbreviates (Cope, 1878); Acestrorhynchus altus Menezes, 1969; Acestrorhynchus britskii Menezes, 1969; Acestrorhynchus falcatus (Bloch, 1794); Acestrorhynchus falcirostris (Cuvier, 1819); Acestrorhynchus grandoculis Menezes & Géry, 1983; Acestrorhynchus heterolepis (Cope, 1878); Acestrorhynchus isalineae Menezes & Géry, 1983; Acestrorhynchus lacustris (Lütken, 1875a); Acestrorhynchus maculipinna Menezes &n Géry, 1983; Acestrorhynchus microlepis (Schomburgk, 1841); Acestrorhynchus minimus Menezes, 1969; Acestrorhynchus nasutus (Eigenmann, 1912); Acestrorhynchus pantaneiro Menezes, 1992. Of these species, four have been recognized in the lacustris group: Acestrorhynchus abbreviates (Cope, 1878) from the upper Amazon basin and Madeira river drainages; Acestrorhynchus lacustris (Lütken, 1875a) from basins of upper Paraná river and São Francisco river; Acestrorhynchus altus (Menezes, 1969) from middle and lower Amazon basins and the Marajó island and Acestrorhynchus pantaneiro Menezes, 1992 from Paraguay and the Prata river basins (Prata river, Uruguay river and lower Paraná river). The number of specimens studied in this work is greater than what was studied in Menezes (1992) and most of the examined specimes come from localities not available to this later work. The analysis of these data revealed greater amplitudes in meristic and morphometric characteristics in the lacustris species. Besides that, the new studied specimens also revealed a wider geographic distribution for Acestrorhynchus species, even for those not in the lacustris group. In this work 630 lacustris specimens were examined, of which, 508 had meristic and morphometric data recorded and analyzed. In order to update the geographic distribution of other species from Acestrorhynchus genus, locations from 3048 specimens were studied. The analysis of the specimens in this study, including individuals from localities not sampled in the last taxonomic revision of the species of Acestrorhrynchus of the lacustris group, revealed that the characteristics that are used as diagnostic for the species of the lacustris group: a) number of scales around the caudal peduncle, b) number of scales above the lateral line, c) number of scales below the lateral line, d) length of pectoral fin almost always going beyond the origin of the pelvic fin and e) the size of the caudal spot, display overlap between the species of the lacustris group. The result of this study recognize two valid species for lacustris group: Acestrorhynchus abbreviates (Cope, 1878) and Acestrorhynchus lacustris (Lükten, 1875a), being Acestrorhynchus altus and Acestrorhynchus pantaneiro, junior synonyms of Acestrorhynchus abbreviates in new occurrence localities.
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Relações suprafamiliares em Erythrinoidea (Teleostei: Characiformes) com base em caracteres moleculares e da morfologia das células espermáticas = Suprafamilial relationships of the Erythrinoidea (Teleostei: Characiformes) based on molecular and spermatic cell data / Suprafamilial relationships of the Erythrinoidea (Teleostei: Characiformes) based on molecular and spermatic cell data

Santana, Júlio César de Oliveira, 1985- 25 August 2018 (has links)
Orientadores: Irani Quagio Grassiotto, Daniela Calcagnotto / Tese (doutorado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Biologia / Made available in DSpace on 2018-08-25T14:34:56Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Santana_JulioCesardeOliveira_D.pdf: 22975611 bytes, checksum: d02baacf927c5c48bc5cc9f97db90deb (MD5) Previous issue date: 2014 / Resumo: A superfamília Erythrinoidea é uma das oito famílias que compõem a ordem Characiformes e foi proposta como um grupo monofilético para abrigar as famílias neotropicais Ctenoluciidae, Erythrinidae e Lebiasinidae, e a família africana Hepsetidae. Após a proposição da superfamília, estudos filogenéticos recentes com base em caracteres morfológicos, como osteologia e morfologia de partes moles, e caracteres moleculares tem refutado a ideia de monofiletismo do grupo. Além disso, diferentes autores divergem quanto às relações suprafamiliares de Erythrinoidea. Além dos caracteres tradicionais, o emprego dos caracteres oriundos da análise da ultraestrutura da ontogenia dos espermatozoides e sua forma final tem sido uma importante fonte na complementação dos estudos filogenéticos. O estudo apresentado teve como objetivo realizar uma análise filogenética para testar a monofiletismo de Erythrinoidea e verificar os padrões de relacionamento suprafamiliares em Characiformes, e testar o posicionamento filogenético da família Crenuchidae, supostamente relacionada à superfamília. As análises filogenéticas foram realizadas com base em dados moleculares e dados morfológicos independentemente, e de maneira conjunta (evidência total) através do método de Parcimônia. A ultraestrutura da espermiogênese e dos espermatozoides dos gêneros incluídos em Erythrinoidea, mais a família Crenuchidae e outras possivelmente relacionadas, foram descritos e codificados em uma matriz de dados. Nas três análises realizadas a superfamília Erythrinoidea não é recuperada como monofilética. A família Crenuchidae posiciona-se na base da subordem Characoidei e não está estreitamente relacionada à Erythrinoidea. As análises com dados moleculares e de evidência total apresentaram uma topologia muito semelhante ao nível mais inclusivo e os valores de suporte dos principais clados apresentaram-se maiores na evidência total, mostrando a influência positiva da inserção dos caracteres da morfologia das células espermáticas nas análises filogenéticas / Abstract: The superfamily Erythrinoidea is one of eight superfamilies within the order Characiformes and was proposed to include a monophyletic group composed of the Neotropical fish families Ctenoluciidae, Erythrinidae and Lebiasinidae, and African family Hepsetidae. Current phylogenetic studies based on morphological data, such as osteology and morphology of soft structures, and molecular data have refuted the hypothesis of monophyly of this group. In addition, the suprafamilial relationships in Erythrinoidea have diverged among the authors. In combination with more traditional characters, the analyses of the ultrastructure of sperm ontogeny and its final shape have become an interesting source of characters to complement phylogenetic studies. The goal of this study was to perform a phylogenetic analysis to test the monophyly of the Erythrinoidea and to assess the phylogenetic position of the family Crenuchidae, a group supposed to be closely related to the superfamily. The phylogenetic analyses were performed using molecular and morphological data separately, and in a combined approach (total evidence) through the Parsimony method. The ultrastructure of the spermiogenesis and the sperm shape of Erythrinoidea genera, plus the family Crenuchidae and other species possibly related to the superfamily were described and coded in a matrix data. In all three analyses Erythrinoidea was not recovered as monophyletic. The family Crenuchidae was placed in a basal position within the suborder Characoidei in molecular and total evidence analysis, and was not closely related to the Erythrinoidea. The analyses using only molecular data and total evidence showed a very similar topology for the more inclusive relationship levels. The support values were higher for the total evidence tree when compared to the one resulting of only molecular data possibly pointing to a positive influence of the combination of the spermatic cell data in phylogenetic analyses / Doutorado / Biologia Celular / Doutor em Biologia Celular e Estrutural
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Desenvolvimento gonadal e clonagem molecular de Dmrt1 (doublesex and mab-3-related transcription factor-1) e Sox9 em teleósteos sul-americanos. / Gonadal development and molecular cloning of Dmrt1 (doublesex and mab-3-related transcription factor-1) and Sox9 in South American teleosts.

Mateus Contar Adolfi 09 December 2011 (has links)
As sequências dos genes dmrt1 e sox9 em pirarucu (Arapaima gigas), lambari (Astyanax altiparanae) e piapara (Leporinus elongatus) foram analisadas por técnicas de clonagem molecular. Fragmentos do gene dmrt1 foram clonados nas três espécies citadas, e do gene sox9 em lambari e piapara. A análise filogenética destes genes mostrou concordância com os dados morfológicos da filogenia destas espécies. Pelo acompanhamento do desenvolvimento gonadal de lambari por microscopia de luz, foi constatada a presença de células germinativas na região da futura gônada já no período de 5 dias após eclosão (dae), sendo também observado que a formação de ovário ocorre primeiro do que a formação de testículo. As expressões dos genes dmrt1 e sox9 por qRT-PCR em lambari mostraram maior especificidade para testículo do que para ovário, indicando que possivelmente estes genes ainda possuem função macho-específica nos adultos. Em lambari, os genes foram expressos em todos os períodos larvais, tendo uma diminuição no estágio de 12 dae, e aumentando sua expressão no estágio de 33 dae. / The sequences of dmrt1 and sox9 genes were analyzed in pirarucu (Arapaima gigas), lambari (Astyanax altiparanae) and piapara (Leporinus elongatus) using molecular cloning techniques. Fragments of dmrt1 gene were cloned in these three species, and sox9 gene fragments have been acquired only for lambari and piapara. Phylogenetic analysis of the genes was shown to be consistent with the morphological phylogeny of these species. The analysis of the gonadal development in lambari was followed by light microscopy, where it was found the presence of germ cells in the region of the future gonad in 5 days after hatching (dah), and that the formation of ovaries occurs first comparing to the formation of testis. The gene expression of dmrt1 and sox9 by qRT-PCR method show specificity for testis comparing to ovary, which indicates that these genes also have a male-specific role in the adult. In lambari, the genes were expressed in all larval periods, with a decrease of expression levels in 12 dah, and increasing its expression at stage of 33 dah.
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Análise filogenética das espécies de Hemigrammus Gill, 1858 (Characiformes, Characidae)

Serra, Jane Piton [UNESP] 08 April 2010 (has links) (PDF)
Made available in DSpace on 2014-06-11T19:30:55Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2010-04-08Bitstream added on 2014-06-13T20:01:05Z : No. of bitstreams: 1 serra_jp_dr_sjrp.pdf: 3153770 bytes, checksum: 728398b4424d8a7553192af8e41e3af7 (MD5) / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq) / Hemigrammus Gill, (1858) é um dos gêneros mais especiosos dentro da família Characidae, com 51 espécies distribuídas nas Américas do Sul e Central; porém, pouco se sabia sobre suas relações com outros táxons de Characidae, sendo considerado por muitos autores como um grupo não natural (Ellis in Eigenmann,1918; Böhlke, 1955; Weitzman & Palmer, 1997a; Marinho et al., 2008; Britski & Lima, 2008; Lima & Souza, 2009; Lima et al., 2009). As poucas propostas disponíveis de relacionamento para o gênero, apresentavam Hemigrammus como mais proximamente relacionado à Hyphessobrycon, Parapristella, Bryconella, Thayeria e Hasemania (Géry, 1977; Serra, 2003; Benine, 2004; Mirande, 2009), porém, a maioria desses trabalhos analisaram poucas (1-3) espécies do gênero e nenhum deles teve como objetivo principal testar o monofiletismo de Hemigrammus. Sendo assim, os objetivos do presente trabalho foram: redescrever e descrever osteologicamente H. unilineatus, espécie-tipo do gênero, avaliar o monofiletismo de Hemigrammus com a utilização do maior número possível de suas espécies válidas e avaliar o relacionamento de suas espécies entre si e com outras de Characidae. Foram analisados 95 táxons e 165 caracteres osteológicos, de morfologia externa e de colorido; a matriz de caracteres foi analisada pelo programa PAUP (4.0b 10 2001), com busca heurística, algoritmo tree-bisection-reconnection para o branch-swapping, random taxon addition sequence, 1000 réplicas e otimização acctran, com repesagens sucessivas. A análise filogenética resultou em seis árvores igualmente parcimoniosas; após repesagens uma única árvore mais parcimoniosa foi gerada, com IC. 0,35 e IR. 0,61. Hemigrammus em seu sensu atual não aparece formando um grupo monofilético. De acordo com os resultados obtidos o gênero fica restrito a sua espécie-tipo e espécies de outros gêneros de Characidae... / Hemigrammus Gill, (1858) is one of the most specious genera within the family Characidae, with 51 valid species distributed in South and Central America. The phylogenetic relationships of the genus with other Characidae are poorly known, and many authors consider that Hemigrammus does not constitute a monophyletic assemblage (Ellis in Eigenmann, 1918, Böhlke, 1955; Weitzman & Palmer, 1997a; Marinho et al., 2008; Britski & Lima, 2008, Souza & Lima, 2009, Lima et al., 2009). The few hypotheses available concerning relationships of Hemigrammus, presented the genus as closely related to Hyphessobrycon, Parapristella, Bryconella, Thayeria, and Hasemania (Géry, 1977; Serra, 2003, Benine, 2004; Mirande, 2009), however, all these studies analyzed only few species (1-3) of the genus, and none aimed to test the monophyly of Hemigrammus. Therefore, the objectives of this study were: redefining and describing osteologically H. unilineatus, type species of the genus; evaluate the monophyly of Hemigrammus using the largest possible number of its valid species; and assess the relationships of its species among themselves and with other Characidae. Were analyzed 95 taxa and 165 characters concerning osteology, external morphology and color pattern. Phylogenetic analysis was performed using PAUP (4.0b 10 2001) with heuristic search algorithm, tree-bisection-reconnection for branch-swapping, random taxon addition sequence, 1000 replicates and optimization acctran, with successive reweighting. The phylogenetic analysis resulted in six most parsimonious trees; after reweighting, resulted in a single most parsimonious tree, with IC. 0.35 and IR. 0.61. Hemigrammus in its current sense does not form a monophyletic group. According to the results, the genus Hemigrammus is restricted to its type species and species of other genera of Characidae (Hyphessobrycon, Moenkhausia and Pristella)... (Complete abstract click electronic access below)
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Caracterização da biodiversidade dos mixozoários (Cnidaria:Myxosporea) parasitos de peixes do rio Batalha, médio rio Tietê, São Paulo

Tagliavini, Vinícius Panciera January 2018 (has links)
Orientador: Rodney Kozlowiski de Azevedo / Resumo: Os parasitos do filo Myxozoa são endoparasitas obrigatórios que infectam peixes, anfíbios, répteis, mamíferos, aves aquáticas em diversas regiões do mundo, com mais de 2180 espécies descritas, estando entre os mais importantes patógenos de peixes, porém, pouco se conhece deste parasito em peixes do Brasil. Neste estudo foram realizadas coletas entre março e setembro de 2016, na qual foram coletados 30 exemplares de curimba (Prochilodus lineatus) e dezessete exemplares de lambari (Astyanax altiaparanae), oriundos do rio Batalha, em dois locais de coleta, um ponto de coleta no município de Reginópolis e outro ponto no município de Agudos, estado de São Paulo. Foram utilizadas análises morfológicas (microscopia de luz, histologia e análise ultraestrutural), técnicas de biologia molecular (PCR e sequenciamento) na descrição de duas espécies de Henneguya Duas espécies foram documentadas neste estudo, uma delas foi encontrada infectando o filamento primário da brânquia de P. lineatus e é descrita neste estudo como Henneguya prochilodus e outra espécie encontrada infectando o filamento secundário da brânquia de A. altiparanae, a qual foi proposto uma descrição expandida da Henneguya chydadea Barassa et al. (2003), previamente descrita utilizando análises morfológicas e histopatologia. Análise filogenética do gene 18S rDNA foi realizada para avaliar a relação filogenética dessas duas espécies de Henneguya com outras espécies de mixosporídeos da América do Sul e de outras regiões do m... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: The Myxozoa parasites are obligate endoparasites that infect fish, amphibians, reptiles, mammals, waterfowl in several regions of the world, with more than 2180 described species, being among the most important fish pathogens, but little is known of this parasite in fish from Brazil. In this study were collected from March to September 2016, where 30 specimens of Curimba (Prochilodus lineatus) and seventeen specimens of lambari (Astyanax altiaparanae) from the Batalha River, in two collection sites, a collection point in the municipality of Reginópolis and another point in the municipality of Agudos, state of São Paulo. Morphological analyzes (light microscopy, histology and ultrastructural analysis), molecular biology techniques (PCR and sequencing) were used to describe two species of Henneguya. Two species were documented in this study, one of which was found infecting the primary filament of the gill of P. lineatus and is described in this study as Henneguya prochilodus and another species found infecting the secondary filament of the gill of A. altiparanae, which has been proposed an expanded description of Henneguya chydadea Barassa et al. (2003), previously described using morphological analysis and histopathology. Phylogenetic analysis of the 18S rDNA gene was performed to evaluate the phylogenetic relationship of these two species of Henneguya with other species of myxosporids from South America and other regions of the world. / Mestre
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Sistemática, filogenia e biogeografia do grupo Characidium lauroi Travassos, 1949 (Characiformes, Crenuchidae)

Melo , Marcelo Roberto Souto de 29 June 2001 (has links)
Submitted by Alberto Vieira (martins_vieira@ibest.com.br) on 2018-01-18T20:28:29Z No. of bitstreams: 1 542771.pdf: 11497250 bytes, checksum: a473c9719ac5165bb0ee4a8bbf6129e2 (MD5) / Made available in DSpace on 2018-01-18T20:28:29Z (GMT). No. of bitstreams: 1 542771.pdf: 11497250 bytes, checksum: a473c9719ac5165bb0ee4a8bbf6129e2 (MD5) Previous issue date: 2001-06-29 / CAPES / O "grupo Characidium lauroi" é formado por seis espécies que habitam pequenos riachos de montanha, tributários do rio Iguaçu, Paranapanema, Tietê, Paraíba do Sul, além dos rios costeiros entre a baía da Ilha Grande e a Ribeira de Iguape. Quatro dessas espécies foram descridas por Haroldo Travassos entre as décadas de 40 e 60, Characidium lauroi, C. japuhybense, C. schubarti e C. oiticicai, e duas são novas para a ciência, Characidium sp. "piabanha" e Characidium sp. "iguaçu". Três sinapomorfias corroboram a monofilia do grupo: a ausência do ramo parietal do canal látero-sensorial da cabeça; barras tranversais com poucos cromatóforos; e presença de pequenas máculas arredondadas ao longo do flanco. As relações filogenéticas entre essas espécies sugerem que os eventos de separação das cabeceiras dos rios do sudeste foram importantes nos processos de especiação e diversificação do grupo. Characidium japuhybense, que ocorre apenas nos riachos costeiros, é a espécie mais basal do grupo. Characidium lauroi e C. sp. "piabanha" estão mais relacionadas com as espécies da bacia do Paraná do que com a anterior; entretanto, formam um clado monofilético endêmico das tributários do alto e médio rio Paraíba do Sul. As relações entre C. schubarti, C. oiticicai e Characidium sp. "iguaçu", formam uma politomia, que demonstra uma suposta separação tardia entre e complexa as cabeceiras do Iguaçu, Tietê, Paranapanema e Ribeira de Iguape. / The "Characidium lauroi" group is composed by five species, that inhabit small mountains streams, such as the tributaries of the Iguaçu, Paranapanema, Tietê and Paraíba do Sul rivers, and coastal streams between Ilha Grande bay and Ribeira de Iguape. Four of these species were described by Haroldo Travassos between the 1940's and 1960's, Characidium lauroi, C. japuhybense, C. schubarti e C. oiticicai, and two of them are new to the science, Characidium sp. "piabanha" e Characidium sp. "iguaçu". Three sinapomorphies corroborate the monophily of the group: absence of parietal branch in the head laterossensorial system; small number of cromatophores in the transversal bars; and small rounded spots along the side of the body. The phylogenetic relationships among these species suggest that the history of isolating events among of the headwaters of southeastern Brazil was important for the species diversification process. Characidium japuhybense, which occurs only in coastal rivers, is the most basal species. Characidium lauroi and Characidium sp. "piabanha" form a monophyletic clade that is endemic to upper and middle Paraíba do Sul river drainages. The sister group of this clade is comprised of species that occur in the Parana drainage. The relationships among C. schubarti, C. oiticicai and Characidium. sp. "iguaçu" clade are poorly resolved, thus suggesting a putative recent and complex separation between the headwaters of the rivers Iguaçu, Tietê, Paranapanema and Ribeira de Iguape.
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Um novo Characidae (Ostariophysi: Characiformes) e suas relações dentro do clado A (Malabarba & Weitzman, 2003)

Simiele, Daiane [UNESP] 28 April 2008 (has links) (PDF)
Made available in DSpace on 2014-06-11T19:22:55Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2008-04-28Bitstream added on 2014-06-13T20:49:32Z : No. of bitstreams: 1 simiele_d_me_sjrp.pdf: 1013538 bytes, checksum: 385884f8bd78a072e78616facfd6a25f (MD5) / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq) / O novo gênero é descrito com base em exemplares provenientes do Rio Quente (nascente), afluente do rio Corumbá, afluente do rio Paranaíba, sistema do alto rio Paraná e está inserido no “clado A” (Malabarba & Weitzman, 2003) pela presença de ii, 8 raios na nadadeira dorsal e quatro dentes na série interna do pré-maxilar. No presente trabalho, o novo gênero aparece como grupo irmão de Piabina + Creagrutus por compartilhar com aqueles gêneros a presença não ambígua de um processo medial dorsolateral no hiomandibular. O novo gênero é monotípico e se distingue de todos os demais Characidae por apresentar coracóide com um entalhe reto e oblíquo postero-ventral e palatino triangular. / A new genus is described from Rio Quente, affluent of rio Corumbá, rio Paranaíba, upper rio Paraná system, and belongs to Clado A (Malabaraba & Weitzman, 2003) by the presence of ii, 8 dorsal-fin rays and four teeth in the inner row of premaxilla. In this study, the new genus is shown as a sister group of Piabina + Creagrutus, sharing with them the presence not ambiguous of one dorsolateral buttress in the hiomandibular. The new genus is monotypic and is distinguished from all Characidae by having the coracoid postero-ventral incision straight and obliquious and a triangular palatine.

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