Made available in DSpace on 2014-06-11T19:23:05Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2009-07-24Bitstream added on 2014-06-13T18:09:16Z : No. of bitstreams: 1 vicente_ef_me_araiq.pdf: 1240368 bytes, checksum: 4c158f3620376ae0b43bb4349588c93c (MD5) / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) / Nas últimas décadas, um grande número de peptídeos antimicrobianos tem sido isolado de várias espécies de seres vivos, fazendo parte da sua imunidade inata. Estes peptídeos possuem algumas características em comum: 1) apresentam carga positiva (grande ocorrência de aminoácidos básicos); 2) possuem um porcentual considerável de aminoácidos hidrofóbicos e 3) apresentam grande tendência de adotarem estruturas secundárias anfipáticas. Devido à sua propriedade de permeabilizar e destruir membranas bacterianas, levando-as à morte, estes peptídeos são um foco de interesse no desenvolvimento de novos antibióticos. Um modo de estudo destas moléculas é por meio da adição de marcadores na seqüência peptídica, permitindo relacionar as propriedades conformacionais com a atividade biológica envolvida. Desta forma, este trabalho teve como objetivo sintetizar e avaliar 3 análogos de um novo peptídeo antimicrobiano extraído da pele da rã Hypsiboas albopunctatus de seqüência GWLDVAKKIGKAAFNVAKNF( I/L), denominado de hilina C (hyC), a fim de obter informações a respeito do seu mecanismo de ação e estruturação frente a miméticos de membrana. Os análogos possuem o composto paramagnético ácido 2,2,6,6-tetrametilpiperidina-N-oxil-4- amino-4-carboxílico (TOAC) substituindo os aminoácidos alanina na posição 13 e triptofano na posição 2, ou adicionado na extremidade N-terminal do peptídeo. Os peptídeos foram sintetizados por Síntese Peptídica em Fase Sólida (SPFS) utilizando a estratégia química Fmoc. As propriedades conformacionais dos peptídeos e as suas dinâmicas foram investigadas por dicroísmo circular (CD) e ressonância paramagnética eletrônica (RPE) em água, trifluoretanol (agente indutor de estrutura secundária), micelas zwitteriônicas (lisofosfatidilcolina - LPC) e em dois tipos de lipossomas de composições lipídicas diferentes:... / In recent decades, a large number of antimicrobial peptides have been isolated from several species of microorganisms as part of their innate immunity. These peptides have some particular features: 1) positive charges (high occurrence of basic amino acids), 2) a considerable percentage of hydrophobic amino acids and 3) greater tendency to adopt amphipatic secondary structures. Due to the property of permeabilizing and destroying bacterial membranes, causing cell death, these peptides are interesting regarding the development of new antibiotics. To study these molecules, markers were added in the peptide sequence, allowing conformational properties to relate with the biological activity involved. Thus, this work aimed to synthesize and evaluate 3 analogues of a new antimicrobial peptide extracted from the skin secretion of the frog Hypsiboas albopunctatus, whose sequence is GWLDVAKKIGKAAFNVAKNFI/L, called Hilina C (hyC) in order to obtain information of the mechanism of action and structure of this peptide, using membrane mimetics. The analogues have the compound paramagnetic amino acid 2,2,6,6-tetramethylpiperidine-1-oxyl-4-amino-4-carboxylic acid (TOAC) replacing the alanine at position 13 and triptofan in position 2, or added to the end of the Nterminal peptide. The peptides were synthesized by Solid Phase Peptide Synthesis (SPPS) using the Fmoc chemistry strategy. The conformational properties of peptides and their dynamics were investigated by electronic paramagnetic resonance (EPR) and circular dichroism (CD) in water, trifluorethanol (TFE) (secondary structure inducer agent), zwitterionics micelles (lysophosphatidylcholine - LPC) and two types of liposomes in different lipid compositions: PE:PA:PC and SM:PA:PC. The biological activities were examined by determining the minimal inhibitory concentration (MIC) in bacteria (two Gram-positive and two Gram-negative) and the minimal... (Complete abstract click electronic access below)

Made available in DSpace on 2014-06-11T19:23:06Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2006-04-28Bitstream added on 2014-06-13T20:10:35Z : No. of bitstreams: 1 cruscajunior_e_me_araiq.pdf: 1168682 bytes, checksum: e68054a6af1b3d4f9d9235d07ed0ef75 (MD5) / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) / Este trabalho descreve a sintese, a relacao estrutura-funcao, a interacao com membranas e a atividade biologica de um peptideo proveniente da regiao amino-terminal da proteina Esticolisina II (St II). Esta proteina e uma citolisina pertencente a familia das actinoporinas, obtida da anemona marinha Stichodactyla heliantus. Estudos estruturais e biologicos da proteina nativa indicam que a regiao amino-terminal da St II participa do processo de formacao de poros em membranas. Deste modo, visando compreender o comportamento e a importancia dessa regiao para a atividade biologica da St II, 3 analogos contendo os 30 primeiros residuos que compoem a extremidade amino-terminal da St II foram sintetizados e analisados. Os peptideos foram obtidos mediante sintese em fase solida modificando-se um residuo de leucina ou isoleucina por triptofano nas posicoes 2, 7 ou 24. Os estudos conformacionais foram realizados atraves das tecnicas de fluorescencia e dicroismo circular. Para avaliar o comportamento estrutural dos peptideos em solucao, foram realizados estudos de variacao de pH, forca ionica e titulacao com um agente indutor de estrutura, o trifluoroetanol (TFE). Na interacao com mimeticos de membranas, os peptideos foram titulados por tres tipos de detergentes: dodecil-sulfato de sodio (SDS), HPS (N-hexadecil-N,N-dimetil-3-amonio-1-propano-sulfonato) e LPC (1-palmitoil-2-hidroxi-sn-glicero-3- fosfocolina). Complementando o estudo acima, tambem foram realizados experimentos utilizando acrilamida como agente supressor de fluorescencia. Os resultados obtidos demonstram que a estrategia de sintese de peptideos em fase solida atraves do protocolo Fmoc/tBu, utilizada na sintese dos peptideos deste trabalho, foi viavel. O processo de purificacao dos peptideos atraves de HPLC tambem se mostrou eficiente e viabilizou a obtencao do material com alto indice de pureza. / In this study, we describe the synthesis, the relation function-structure, the interaction with membranes and the biological activity of the N-terminus region of the protein Sticholysin II (St II). This protein is a citolisin, which belongs to the family of the actinoporins, purified from the sea anemone Stichodactyla heliantus. According to biological and structural studies of the native protein, the N-terminus region of St II is involved on the pore formation process in membranes. In order to elucidate the function and the importance of this region to the biological activity of St II, three analogs containing the first 30 residues of the N-terminus region of St II were synthesized and analyzed. The peptides were obtained by solid phase synthesis and altered through the substitution of a leucine or isoleucine for a tryptophan on the positions 2, 7 and 24. Circular dichroism (CD) and tryptophan fluorescence studies have been carried out to investigate conformational properties of the peptides. In order to evaluate the structural modification on aqueous solution, studies were performed in order to evaluate the pH, ionic strength and addition of the secondary structural-inducing solvent TFE. The interaction studies with micelles were performed using three different surfactants: sodium dodecil-sulfate (SDS), N-hexadecyl-N,N-dimethyl-3-ammoniumpropanesulfonate (HPS) and lysophosphatidylcholine (LPC), and using acrylamide as a fluorescence suppression agent. We have demonstrated that on solid phase peptides synthesis using the Fmoc/tBu strategy is a success. The purification process of peptides through HPLC, has also revealed to be efficient, once the material was obtained with high purity level above 95%. The experiments of hemolytic activity showed that the three peptides have activities in æM concentration, this results reinforce the idea that the 30 residues of the N-terminus region have an important role on pore formation in membranes.

Essa dissertação analisará uma abordagem investigativa de ensino de funções trigonométricas que prioriza a compreensão da relação entre movimentos circulares em diferentes velocidades com a formação gráfica gerada por esses movimentos. Com o auxílio do software Geogebra, diferentes movimentos foram criados, o que proporcionou a investigação gráfica por parte dos alunos. A atividade foi realizada no laboratório de informática onde, constantemente, houve investigação por parte dos alunos e intervenções significativas por parte do professor. Escolheu-se para essa pesquisa uma análise qualitativa embasada no processo descritivo das ações ocorridas em sala de aula. Para conhecer as características dessa abordagem, foi utilizado um estudo de casos. Após a atividade, os alunos conseguiram interpretar os principais movimentos gerados na circunferência e traduzi-los na sua forma gráfica. A análise mostra que os alunos não somente conseguiram desenvolver significados aos movimentos circulares, como também interpretaram corretamente situações cotidianas estabelecidas pelo professor ao fim do trabalho / This dissertation will analyze an investigative approach to the teaching of trigonometric functions that prioritizes the understanding of the relation between circular movements at different speeds with the graphical formation generated by these movements. With the help of the software Geogebra, different movements were created, which provided the graphic investigation by the students. The activity was carried out in the computer lab where, constantly, there was investigation by the students and significant interventions by the teacher. For this research, a qualitative analysis based on the descriptive process of the actions taken in the classroom was chosen. To know the characteristics of this approach, a case study was used. After the activity, the students were able to interpret the main movements generated on the circumference and translate them into their graphic form. The analysis shows that the students not only managed to develop meanings to the circular movements, but also correctly interpreted daily situations established by the teacher at the end of the work

Esta dissertação trata do tema desenho técnico do vestuário. O objetivo deste trabalho foi sistematizar diretrizes para a representação gráfica técnica de acabamentos, detalhes, linhas e cotas em produtos do vestuário do segmento de malharia circular com vistas à sua normalização. A pesquisa foi classificada como aplicada, qualitativa e exploratória. A coleta de dados ocorreu por meio de entrevistas semiestruturadas e coleta documental realizadas de forma presencial e por meio eletrônico (e-mail). Os participantes foram sete docentes de disciplinas de desenho técnico que atuam em instituições de ensino superior que possuem cursos de moda em nível bacharelado e, oito profissionais do desenvolvimento de produto de empresas de confecção do vestuário que trabalham com malha circular. Com isso, foi possível diagnosticar como é feita a representação de desenhos técnicos do vestuário nestes dois ambientes, o acadêmico e o industrial, localizados em diferentes regiões brasileiras. Os resultados das entrevistas foram apresentados através de quadros comparativos com cruzamento dos dados coletados. Como resultado, apresentam-se diretrizes para a construção do desenho e representação de cores, linhas, cotas/medidas. Outro produto deste trabalho é um catálogo dos principais acabamentos e detalhes utilizados em malha circular com descrições, imagens e representações técnicas dos mesmos. / This dissertation deals with the theme of technical drawing of clothing. The aim of this study was to propose guidelines for graphical representation technique of finishing, details, lines and quotas on clothing products of circular knitting segment to achieve its normalization. The research was classified as applied, exploratory and qualitative. Data collection occurred through semi-structured interviews and documentary collection both conducted face-to-face form and by electronic means (e-mail). Participants consisted of seven professors of technical drawing disciplines who work in institutions of higher education that have fashion courses in the Bachelor level. In addition to the professors, eight product development professionals of knitting clothing companies who work with circular mesh also participated. With this, it was possible to diagnose how is the representation of technical drawings of clothing in these two environments, the academic and the industrial, located in different regions of Brazil. The interview responses were presented through comparative tables including the collected data. As a result, guidelines are presented for the construction of the drawing and representation of colors, lines, dimensions/measurements. Another product of this work is a catalogue of the main finishing and details used in circular knit with descriptions, images and representations of the referred techniques.

Polydimethylsiloxane (PDMS) microfluidic channels, fabricated using low cost and simple soft lithography methods, conventionally have rectangular cross-sections. Despite being often used for organs-on-a-chip and cardiovascular research, these devices do not mimic the circular cross-sections of blood vessels in the human body, creating potential inaccuracies in observed flow conditions and cell behaviours. The purpose of this thesis is to (i) compare and optimize fabrication techniques for microchannels with circular cross-sections, (ii) assess biocompatibility of different surface functionalization approaches for Human Umbilical Vein Endothelial Cell (HUVEC) adhesion and growth, (iii) culture HUVECs within circular microchannels to mimic blood vessel features, and (iv) compare gene expression of HUVECs cultured in 3D circular microchannels to those cultured on 2D surfaces. We show that wire molding is superior to the gas stream technique for producing circular cross-section microchannels with high aspect ratios, circularity, and channel geometry precision. Fibronectin (FN) and polydopamine (PD) surface coatings on PDMS, as well as alternative collagen substrates, were tested for biocompatibility with HUVECs in 2D cultures; fibronectin coated PDMS (PDMS-FN) substrates facilitated cell attachment, spreading and growth. We demonstrate the capability of growing HUVECs on the inner surface of circular PDMS microchannels created using the wire-mold method and treated with fibronectin. A syringe pump was used to induce shear stress on the HUVECs grown in circular microchannels. Relative to static growth conditions, longer cell culture growth periods were more feasible under flow and altered cell morphology was observed. Finally, Microarray analysis revealed significantly different gene expression profiles for HUVECs cultured within PDMS-FN circular cross-section microchannels as compared to HUVECs cultured on PDMS-FN in a 2D environment, thereby highlighting the critical importance of in vitro conditions for mimicking the in vivo reality.

Neste trabalho é descrito um software denominado Scanc implementado no ambiente Windows, para a identificação de formas circulares em imagens digitais do tipo BMP. Dois métodos foram implementados para esse fim: a Transformada de Hough e Template Matching. Incluídos neste software encontram-se recursos para detecção de bordas e binarização da imagem, entre outros. O software tem aplicação nas mais diversas áreas, que requeiram a identificação de formas circulares. / The present work describes a software named Scanc, developed for circular pattern identification in digital bitmap images (BMP). Scanc was developed for Microsoft Windows environment and it takes advantage of two methods: Hough Transform and Template Matching. Image tools such as border detection and binarization are also available among other resources. The software finds several applications wherever circular forms identification is requered.

Esta dissertação trata do tema desenho técnico do vestuário. O objetivo deste trabalho foi sistematizar diretrizes para a representação gráfica técnica de acabamentos, detalhes, linhas e cotas em produtos do vestuário do segmento de malharia circular com vistas à sua normalização. A pesquisa foi classificada como aplicada, qualitativa e exploratória. A coleta de dados ocorreu por meio de entrevistas semiestruturadas e coleta documental realizadas de forma presencial e por meio eletrônico (e-mail). Os participantes foram sete docentes de disciplinas de desenho técnico que atuam em instituições de ensino superior que possuem cursos de moda em nível bacharelado e, oito profissionais do desenvolvimento de produto de empresas de confecção do vestuário que trabalham com malha circular. Com isso, foi possível diagnosticar como é feita a representação de desenhos técnicos do vestuário nestes dois ambientes, o acadêmico e o industrial, localizados em diferentes regiões brasileiras. Os resultados das entrevistas foram apresentados através de quadros comparativos com cruzamento dos dados coletados. Como resultado, apresentam-se diretrizes para a construção do desenho e representação de cores, linhas, cotas/medidas. Outro produto deste trabalho é um catálogo dos principais acabamentos e detalhes utilizados em malha circular com descrições, imagens e representações técnicas dos mesmos. / This dissertation deals with the theme of technical drawing of clothing. The aim of this study was to propose guidelines for graphical representation technique of finishing, details, lines and quotas on clothing products of circular knitting segment to achieve its normalization. The research was classified as applied, exploratory and qualitative. Data collection occurred through semi-structured interviews and documentary collection both conducted face-to-face form and by electronic means (e-mail). Participants consisted of seven professors of technical drawing disciplines who work in institutions of higher education that have fashion courses in the Bachelor level. In addition to the professors, eight product development professionals of knitting clothing companies who work with circular mesh also participated. With this, it was possible to diagnose how is the representation of technical drawings of clothing in these two environments, the academic and the industrial, located in different regions of Brazil. The interview responses were presented through comparative tables including the collected data. As a result, guidelines are presented for the construction of the drawing and representation of colors, lines, dimensions/measurements. Another product of this work is a catalogue of the main finishing and details used in circular knit with descriptions, images and representations of the referred techniques.

Submitted by Marco Antônio de Ramos Chagas (mchagas@ufv.br) on 2018-08-29T18:54:49Z No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 947486 bytes, checksum: 6d7e934deec08032d3a902d1d879ef0a (MD5) / Made available in DSpace on 2018-08-29T18:54:49Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 947486 bytes, checksum: 6d7e934deec08032d3a902d1d879ef0a (MD5) Previous issue date: 2017-02-24 / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de Minas Gerais / Vírus que possuem genoma constituído por DNA fita simples circular são amplamente distribuídos na natureza. As constantes descobertas aliadas à grande diversidade genética desses vírus têm ampliado a compreensão sobre a trajetória evolutiva desse grupo. A partir de 2010 um grupo divergente de vírus com genoma de DNA fita simples circular, denominado genomovírus, passou a ser identificado em diversos ambientes (fezes e esgoto) e associados a diferentes organismos (plantas, fungos, humanos, mamíferos, moluscos e insetos). Neste trabalho foram caracterizados dois genomovírus denominados Momordica charantia associated gemycircularvirus (MorGemy) e Euphorbia heterophylla associated gemycircularvirus (EupGemy) encontrados associados às plantas silvestres Momordica charantia e Euphorbia heterophylla respectivamente. Ambos os vírus possuem organização genômica típica dos genomovírus. Ambos os vírus apresentam stem-loop com nanonucleotídeo conservado em todos os genomovírus, sendo a sequência TAATRTTAT (N pode ser A ou G). Entretanto, no isolado MorGemy foi observado uma estrutura em stem-loop extra na possível origem de replicação não presente em outros genomovírus já descritos. Em ambos os vírus foi observada a presença de um íntron, no interior da ORF que codifica a proteína Rep sendo que o íntron observado em EupGemy é maior que o observado em MorGemy. Na proteína Rep foram observados os motivos I, II e III, e os domínios Walker A, B, C e GRS, elementos encontrados tipicamente na proteína Rep dos geminivírus. O SDT (Sequence Demarcation Tool) revelou que MorGemy tem 72% de identidade com Pteropus associated gemycircularvirus 3 e Hypericum associated gemycircularvirus 1. Além disso, o EupGemy mostra 66% de identidade com Odonata asssociated gemycircularvirus 1. A taxa de identidade de nucleotídeos do genoma completo dos vírus isolados neste trabalho com outros genomovírus já descritos, permite classificar esses novos isolados como duas novas espécies. / Viruses that have genomes consisting of simple circular DNA are widely distributed in nature. The constant discoveries allied to the great genetic diversity of these viruses have broadened the understanding of the evolutionary trajectory of this group. In 2010 a divergent group of viruses with a circular ssDNA genome called Genomovírus was identified in several environments (feces and sewage) and associated with different organisms (plants, fungi, humans, mammals, mollusks and insects). In this work, two Genomovíruses found associated with wild plants were characterized. Both virus shows a structure Genomovírus-like. However two interesting facts were observed. The first, a presence a second structure on stem-loop in the MorGemy no related in other Genomovírus. Both virus presents stem-loop with nanonucleotide conserved in all Genomovírus. Being that the sequence TAATRTTAT (N could be A or G). We also observed the presence of a íntron in both genome, inside the ORF’s Rep. The íntron of EufGmey is greater than MorGemy. In the Rep protein were observed the motif I, II and III. Interestingly, also were observed the presence of Motifs Walker A to C and GRS domain. These elementes are found on protein Rep’s Geminivírus. The SDT releaved that MorGemy shows 72% of identity with Pteropus associated gemycircularvirus 3 and Hypericum associated gemycircularvirus 1. In addition EupGemy shows 66% of identity with Odonata associated gemycircularvirus 1. The rate of identity of MorGemy and EupGemy with Genomovírus associate with plants combined with analysis phylogeny are an indicative that these virus can have a possible host-virus relation with plants.

Made available in DSpace on 2014-06-12T15:04:39Z (GMT). No. of bitstreams: 2 arquivo5592_1.pdf: 1336072 bytes, checksum: aa2ee859ba5f223df40489595225179a (MD5) license.txt: 1748 bytes, checksum: 8a4605be74aa9ea9d79846c1fba20a33 (MD5) Previous issue date: 2011 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / O objetivo deste trabalho foi avaliar a fenologia das espécies ocorrentes em um ambiente de Restinga no Nordeste do Maranhão, Brasil, verificando como os padrões fenológicos variam entre hábitos e como as fenofases se correlacionam com os fatores climáticos. Foram estudados 1167 indivíduos, de 88 espécies vegetais, distribuídos em quatro hábitos (árvores, arbustos, ervas e trepadeiras), durante dois anos (2008-2010) em uma Reserva Legal próxima ao Parque Nacional dos Lençóis Maranhenses (2°43 22,5 S; 42°49 50 W). Todas as fenofases avaliadas, com exceção da frutificação, apresentaram sazonalidade. A floração de Ribeiro, E. K. M. D. Fenologia e Atributos Reprodutivos de espécies ocorrentes em restinga no Maranhão árvores e arbustos ocorreu na estação seca, enquanto a de ervas ocorreu na estação chuvosa. A frutificação das espécies arbóreas ocorreu, em sua maioria, na estação seca, bem como os maiores picos de frutificação de ervas e trepadeiras. Durante a estação chuvosa houve maior atividade de frutificação de arbustos. Queda e brotamento de folhas ocorreram na estação seca para todos os hábitos, exceto o herbáceo, no qual a queda de folhas ocorreu na estação chuvosa. As datas médias dos picos de atividade das fenofases floração, frutificação e brotamento mostraram diferenças para cada hábito, sugerindo que a presença destes diferentes hábitos proporciona melhor distribuição temporal de recursos vegetais (folhas, flores e frutos) na comunidade

O objetivo desta dissertação é estudar a dinâmica de uma partícula sujeita ao potencial de um fio circular homogêneo de uma massa unitária. Estudamos o problema no ponto de vista analítico, mas com principal objetivo o estudo de vista numérico. Numa primeira etapa, identificamos as propriedades do Potencial ao fio circular em casos particulares. No caso geral estudamos a dinâmica, determinando as Secções de Poincaré, determinada através do hamiltoniano associado do problema, obtidas por rotinas numéricas e com a implementação de um integrador. Através da análise das Secções de Poincaré determinamos numericamente as famílias de órbitas periódicas como também a bifurcação das mesmas. Por fim provamos algumas propriedades da dinâmica.