La République de Chine et la République de Corée sont aujourd’hui des nations démocratiques prospères et pacifiques, mais il n’en a pas toujours été ainsi. Pendant la Guerre froide, ces États étaient en effet contrôlés par des régimes autoritaires où les forces armées jouaient un rôle prépondérant. La fin de ce grand conflit idéologique en 1990 a ouvert la voie à un assouplissement progressif de ces régimes autoritaires et à l’abolition du rôle politique des forces armées. Plusieurs explications ont été avancées pour expliquer ces phénomènes, notamment à travers l’hypothèse constructiviste d’un transfert de normes à partir d’une influence extérieure exercée par des entrepreneurs de normes comme l’hégémon et les institutions internationales. Cette thèse cherche plutôt à nuancer cette affirmation en examinant plutôt le rôle des communautés épistémiques dans la démocratisation progressive des régimes civilo-militaires taïwanais et sud-coréen.

Dans un rentier des terres arables des îles Shetland, écrit au début des années 1770, l’expression suivante apparut : « Les habitants des villages d’un même scattald sont appelés frères de scatt ». Ces quelques mots déclenchèrent une série de questions : qu’est-ce qu’un scattald ? Qu’est-ce que le scatt ? Qui sont ces frères de scatt ? Des recherches aux Archives Nationales d’Écosse et aux archives des îles Shetland ainsi que la lecture de travaux universitaires sur les questions des communautés, des communs, des coutumes, des systèmes de justice locale et sur la vie rurale à l’époque moderne conduisirent à l’écriture de cette thèse sur les communautés des îles Shetland au XVIIIe siècle. Ces communautés vivaient dans un contexte géographique particulier. Sans sous estimer le rôle de l’environnement local dans la vie des Shetlandais, cette thèse montre que celui-ci était plus un espace de possibilités que de restrictions ; il apportait des contraintes, mais tout autre environnement dans l’Europe moderne avait aussi ses limites. La vie dans les îles Shetland était, comme n’importe où en Écosse à la même époque, fondée sur les ressources locales et le développement de l’économie de marché apporta ses avantages et ses inconvénients aux habitants. Dans les îles Shetland, l’économie de marché entraîna le développement des tenures à poissons avec leurs contrats particuliers de métayage.Pour comprendre ces communautés, la thèse s’ouvre sur la manière dont elles étaient régulées. Les lois, les cours et le personnel judiciaire avaient tous un rôle à jouer dans le contrôle social des membres des communautés. Cette thèse explore aussi les activités des membres des communautés dans leur environnement. Les îles Shetland comme de nombreuses régions du nord-ouest de l’Europe à la même époque, étaient un espace de pluriactivité. À travers la pluriactivité et l’accès aux communs, les communautés shetlandaises des scattalds gardèrent un certain niveau d’indépendance même à une époque où existait la servitude pour dettes. Cette relation particulière fut rendue possible par un accès presque illimité aux communs pendant tout le XVIIIe siècle, époque pendant laquelle les déplacements sur les communs étaient possibles et où la transmission de la mémoire de ses frontières restait vivante. Des changements eurent cependant lieu sur les îles Shetland à cette époque. Les tenures à poissons ne furent qu’un élément de ces changements : les femmes commencèrent à être plus nombreuses que les hommes, la taille des terres arables cultivées par foyer diminua, les communs protégés furent lentement grignotés, et la cour de justice régionale offrit plus de possibilités de justice aux plus hauts rangs qu’aux tenanciers… Finalement, cette thèse soutient qu’au XVIIIe siècle, les communautés locales shetlandaises offraient une protection aux femmes et aux hommes qui à travers elles avaient un système de soutien organisé. / In a rental of the arable land of Shetland, written in the early 1770s, the following expression appeared: “The inhabitants of the Towns within the same Scattald are called scatt brethren.” These few words triggered a series of questions. What is a scattald? What is the scatt? Who are these ‘scatt brothers’? Research at the National Records of Scotland and at the Shetland Archives as well as the reading of academic literature on the questions of communities, commons, custom, local judicial systems and rural life in the early modern period led to the writing of a thesis on communities in the 18th century. These communities lived in a peculiar geographical context: the Shetland Islands. Without underestimating the role of the local environment in the life of the Shetlanders, this thesis shows that the surroundings of the Shetlanders were more a place of possibilities than a place of restrictions; it brought constraints, but any other surroundings in early modern Europe had its limitations. The life on the islands of Shetland was as anywhere else on mainland Scotland at the same period a life based on local resources and which saw the development of a market economy with its advantages and disadvantages for the inhabitants. In Shetland the market economy took the form of the fishing tenures with their specific share-cropping contracts.In order to understand these communities the thesis starts with how they were regulated. The regulations, the courts and their personnel all had a role to play in the social control of the members of the communities. This thesis also explores the activities of the communities’ members in their environment. Shetland as well as several regions in Northwest Europe at the same time was a place of pluriactivité, multi-tasking. Through multi-tasking and access to the commons, the scattald communities of Shetland kept a certain level of independence even in time of debt-bondage. This paradoxical relationship was rendered possible by an almost unlimited access to the commons throughout the 18th century, a time during which the movement on the commons were possible and the transmission of the memory of their boundaries stayed alive. Changes, however, happened on the islands during these times. The fishing tenures were only one element of these changes: women started to outnumber men, the size of the arable land cultivated by one household diminished, the protected commons were slowly nibbled, and a regional court offered more possibilities for justice to the higher ranks than to the tenants... Eventually, this thesis argues that local communities in 18th-century Shetland offered protection to women and men who through them had an organised support system

Equipes et communautés virtuelles deviennent un mode relationnel collectif largement généralisé. Elles possèdent des caractéristiques spécifiques : distances géographiques, rencontres physiques rares voire inexistantes, aptitude à inclure des grands nombres, facilité d’entrée-sortie, communication écrite dominante, ou effacement du statut social. Elles disposent d’un important bouquet d’outils web 2.0 collaboratifs avec des capacités propres, telles que la mémorisation des échanges, la possibilité du synchrone et de l’asynchrone, le dialogue multiple simultané, l’anonymat éventuel. La collaboration à distance réclame l’acquisition d’un nouveau savoir-faire devenu impératif, que nous appelons le management virtuel. Basée sur l’Analyse Systémique et l’Adaptive Structuration Theory, cette recherche propose un modèle, une mesure et une méthode d’aide au management virtuel. Le modèle est une représentation d’une entité virtuelle en trois dimensions fonctionnelles : la valeur ajoutée collective, la satisfaction des membres, et la flexibilité des frontières. Il s’appuie sur le concept d’adjacence, qui ajoute aux deux rôles d’un individu – l’agent, membre agissant pour la collectivité et l’acteur, stratège agissant pour lui - celui de personne connectée à d’autres individus ou communautés de même domaine d’intérêt. Toute entité virtuelle possède des individus adjacents et communautés adjacentes, en dehors d’elle, et intéressant le management virtuel. La mesure de la e-collaboration comprend celles de l’usage et de l’intérêt pour 18 outils collaboratifs. Elle a été réalisée auprès d’un échantillon de 199 entreprises pendant trois ans. The traitement de cette base de données a permis la création du modèle. Elle révèle des sous-groupes hostiles ou en faveur de la e-collaboration et indique sous quelles conditions elle est envisageable. Elle donne des tendances. Ainsi, les pratiques de community management commencent à être exploitées en interne dans le management d’équipes virtuelles. L’échantillon de grandes entreprises a montré aussi que la e-collaboration est en avance dans un pays émergent, le Vietnam, par rapport à la France. La recherche propose enfin une méthode, dénommée VEMS, Virtual Entities Management Support. Elle part d’une analyse de l’environnement et de la définition d’une stratégie en trois dimensions, puis détermine les fonctions de l’équipe ou de la communauté, les attitudes et les outils adéquats. Elle offre un choix de 18 fonctions et 79 attitudes déduites des recommandations de la littérature et enrichies des observations de l’échantillon. Cette méthode a été appliquée à cinq entités virtuelles de nature très différentes : internes chez un industriel et une banque, externes chez un réseau social, une communauté de fans de web séries, et une autre de fans de cuisine. Ces communautés possèdent de 160.000 à 40 membres. Pour chacune, une stratégie a pu être déployée, avec une série précise d’attitudes et d’outils, point de départ d’un programme opérationnel. Cinq fonctions et 22 attitudes sont communes à toutes les entités étudiées, dont six concernent les adjacences. Elles peuvent être considérées comme le fondement du management virtuel. La méthode a été également déployée auprès de quatre communautés de marques d’un même secteur à faible engagement. Quatre scénarios ont été déduits, dont la participation dans une communauté adjacente, préférable à celui de la création d’une communauté propre. / Virtual teams and communities become a widely spread collective relational mode. They have specific characteristics: geographical distances, physical meetings rare or nonexistent, ability to include large numbers, ease of input-output, dominant written communication, erasure of social status. They can benefit from a large number of web 2.0 collaborative tools with their own capacities, such as the storage of communications, the possibility of synchronous and asynchronous dialogue, multiple simultaneous exchanges, eventual anonymity. The e-collaboration requires the acquisition of a new imperative skill that we call virtual management. Based on the Systemic Analysis and Adaptive Structuration Theory, this research proposes a model, a measurement and a method, the Virtual Entities Management Support. The model is a representation of a virtual entity in three functional dimensions: the collective value, member satisfaction, and flexible frontiers. It is based on the concept of adjacency, which adds to the two roles of the individual - the agent acting for the community, and the actor acting for himself - the person connected to other individuals or communities with the same area of interest. Any virtual entity is connected to adjacent individuals and communities, an area of interest of the virtual management. The proposed measurement of e-collaboration includes the use and the interest for 18 collaborative tools. It was conducted with a sample of 199 companies for three years. This database processing has enabled the creation of the model. It reveals subgroups hostile or for e-collaboration and under what conditions it is interesting. It provides trends. Thus, the practice of community management begins to be used internally in the management of virtual teams. The sample of large firms also showed that e-collaboration is ahead in an emerging country, Vietnam, compared with France. The research also proposes a Virtual Entities Management Support method, called VEMS. It starts with an analysis of the environment, the definition of a strategy in three dimensions, and then determines the functions of the team or community, the attitudes and its appropriate tools. It offers a choice of 18 functions and 79 attitudes derived from the literature recommendations and enriched with the sample observations. This method has been applied to five virtual entities of different kinds: internal to an industrial manufacturer and a large bank, external to a social network, a community of fans of web series, and another community of fans of cookery. This entities include from 40 up to 160,000 members. For each, a strategy has been defined, with a specific set of attitudes and tools, the starting point of an operational program. Five functions and 22 attitudes are common to all the entities studied, six of which relate to adjacencies. They can be considered as the foundation of virtual management. The method has also been deployed to four brand communities of a sector with low consumer engagement. Four scenarios were deducted, including the participation to an adjacent community, preferable to the creation of a brand community.

L'analyse de réseaux (représentés par des graphes) est une composante importante dans la compréhension de systèmes complexes issus de nombreuses disciplines telles que la biologie, la géographie ou la sociologie. Nous nous intéressons dans cette thèse aux décompositions de ces réseaux. Ces décompositions sont utiles pour la compression des données, la détection de communautés ou la visualisation de graphes. Une décomposition possible est un partitionnement hiérarchique des sommets du graphe. Nous traitons de l'évaluation de la qualité de telles structures (leur capacité à bien capturer la topologie du graphe) par le biais de mesures de qualité. Nous discutons ensuite l'utilisation de ces mesures en tant que fonctions objectives à maximiser dans le cadre d'algorithmes de partitionnement. Enfin, nous nous intéressons à la définition de métaphores visuelles efficaces permettant de représenter différentes décompositions de graphes. / Network analysis is an important step in the understanding of complex systems studied in various areas such as biology, geography or sociology. This thesis focuses on the problems related to the decomposition of those networks when they are modeled by graphs. Graph decomposition methods are useful for data compression, community detection or network visualisation. One possible decomposition is a hierarchical partition of the set of vertices. We propose a method to evaluate the quality of such structures using quality measures and algorithms to maximise those measures. We also discuss the design of effective visual metaphors to represent various graph decompositions.

Les données présentées dans ce manuscrit de thèse sont principalement basées sur l'analyse de séquences d'ADN extraites directement de l'environnement (et en particulier du sol) en les comparant aux données cumulées au fil des siècles sur les microorganismes cultivés en laboratoire. Les objectifs, difficultés, résultats et perspectives de cette approche, que l'on nomme « métagénomique », sont décrits. Un métagénome représente la diversité génétique d'un habitat défini (par exemple un sol du champ agricole) dans sa globalité. Ainsi, générer un métagénome a notamment pour but d’accéder à la diversité génétique de la majorité d'espèces récalcitrantes à la culture. Elle permet aussi d'estimer le potentiel fonctionnel d'un jeu de données métagénomiques représentant un écosystème, puis de le comparer à d'autres jeux de données, représentant quant à eux d'autres environnements. Enfin, un autre intérêt de cette approche est la possibilité, dans certains cas, d'assembler partiellement ou entièrement un métagénome, et ainsi de permettre la reconstruction de structures génétiques complexes, qu'elles représentent des plasmides ou des génomes, circulaires ou non. Ce manuscrit de thèse présente ces aspects de la métagénomique (extraction, séquençage, annotation, comparaison, assemblage) sur l'environnement sol, en se basant sur une prairie anglaise (Park Grass, Rothamsted Research) étudiée depuis plus de 150 ans. Les communautés microbiennes prédominantes ont été partiellement caractérisées, leur potentiel fonctionnel comparé à d'autre environnements majeurs de notre planète (océans, sédiments, neige, etc.). Parce que l'assemblage de ces données est très limité dû à une trop grande diversité, des expérimentations ont été faites en microcosmes afin de stimuler une partie de la communauté avant de générer de nouveaux jeux de données, hautement simplifiés. Cette approche a permis l'assemblage et l'étude structurelle de génomes correspondant à des espèces résistant à des conditions extrêmes (par exemple un apport considérable de mercure, ou de métaux lourds).Lorsque l'on regarde la métagénomique dans sa globalité, les perspectives apparaissent clairement : usant d'outils de plus en plus performants (séquençage, annotation, assemblage, etc.), les microbiologistes peuvent d'ores et déjà récolter le fruit de plus de trois milliards d'années d'évolution et d'adaptation microbienne. / Microbial ecology is beginning to interact with metagenomics and many microbiologists are attracted to metagenomics in the hope of discovering novel relationships between microorganisms and/or confirming that work done on isolates applies to the remaining uncultured members of the different ecosystems. With a growing number of available metagenomic datasets, metagenomes can be intensively mined by microbial ecologists in search of previously undetected correlations (both structural and functional). Here, we provide a preliminary exploration of 77 publically available metagenomes corresponding to DNA samples extracted from oceans, atoll corals, deep oceans, Antarctic aquatic environments, Arctic snows, terrestrial environments (sediments, soils, sludges, microbial fuel cell anode biofilms, acid mine drainage biofilms), polluted air, and animal and human microbiomes (human feces, mouse and chicken cecum, and cow rumen). Results show well-defined environmental specificities that emphasize microbial adaptation and evolution capabilities. Unexpected observations were also made for several ecosystems, thus providing new hypotheses about the life style of their microbial communities. Available metagenomes are a gold mine of underexploited information that could be used to explore specific microbial structural and functional relationships. The statistical analysis provided here depends in part on replicates from the different ecosystems. With the continued emphasis on metagenomic sequencing, future analyses should support rigorous statistical treatment. This preliminary metagenomic decryption could represent a pilot-scale test for a future Earth microbiome global comparison

Ce projet de recherche porte sur les stratégies d’adaptation chez les jeunes d’origine autochtone âgés entre 9 et 12 ans habitant une communauté innue au nord du Québec, selon qu’ils se soient ou non initiés à la cigarette, l’alcool ou le cannabis. La présente étude vise à décrire puis comparer les styles d’adaptation (productif, non-productif, référence aux autres) chez des préadolescents (9 - 12 ans) autochtones (innus), garçons et filles, selon qu’ils se soient ou non initiés précocement à l’un ou l’autre des psychotropes (cigarette, alcool, cannabis).

Le travail réalisé dans le cadre de cette thèse a pour but de fournir de nouvelles approches méthodologiques pour caractériser les communautés microbiennes en milieu océanique profond et de mesurer leurs activités. Dans le cadre de cette thèse, nous avons tout d'abord amélioré une technique d'hybridation in situ (CARD-FISH) pour dénombrer les groupes phylogénétiques majeurs en milieu marin profond. En Mer Tyrrhénienne, le pourcentage des Bacteria est toujours plus élevé que celui des Crenarchaea et des Euryarchaea. Alors que le pourcentage des Crenarchaea augmente avec la profondeur, celui des Euryarchaea est relativement homogène le long de la colonne d’eau. Dans le cadre d'une collaboration avec le Centre de Physique des Particules de Marseille sur le programme ANTARES (télescope sous-marin à neutrino), nous avons étudié quel pouvait être le rôle des bactéries luminescentes dans le bruit lumineux détecté quelquefois par le télescope. Une première étape a été de développer une approche quantitative par la méthode CARD-FISH sur les ARNm des gènes lux qui n'a été qu'en partie concluante mais donne des résultats préliminaires encourageants. Notre attention s'est portée sur l'identification puis la caractérisation d'une souche isolée à 2200 m de profondeur à proximité du site ANTARES (nommée Photobacterium phosphoreum ANT-2200). Pour mieux comprendre le rôle des bactéries bioluminescentes en milieu profond, nous avons développé un système hyperbare spécifique pour évaluer l’effet de la pression hydrostatique sur cette souche. Alors que cette souche a été caractérisée comme piezotolérante (croissance non sensible à des variations de pression), la lumière produite est plus élevée à la pression de 22 MPa (2200 m simulée) qu'à 0.1 MPa (pression atmosphérique). Enfin, une étude complémentaire m'a conduit à étudier l'effet de la pression hydrostatique sur une souche hydrocarbonoclaste Marinobacter aquaeolei #5. Là encore, nous montrons que la modification de la pression hydrostatique n’influence pas le taux de croissance (souche piezotolérante), mais peut fortement modifier les voies métaboliques, notamment la quantité et la nature des cires produites. Les cires intracellulaires s’accumulent sous formes de corps lipidiques avec une proportion moins importante à 35 MPa alors que le rapport d'insaturation des acides gras membranaires et la quantité de cires di-insaturées augmentent à la pression 35 MPa. Par ces études, nous suggérons que la pression hydrostatique joue un rôle important au niveau de la physiologie des bactéries marines et la distribution des procaryotes dans les écosystèmes marins profonds. / The purpose of this work is to provide new methodological approaches to characterize the microbial communities in deep-sea waters and to measure their activities. Within the framework of this thesis, first of all we improved the technique of in situ hybridization (CARD-FISH) to count the major phylogenetic groups in deep-sea zones. At the Tyrrhenian Sea, the percentage of Bacteria was always higher than Crenarchaea and Euryarchaea. Whereas the percentage of Crenarchaea increases with depth, while Euryarchaea is relatively homogeneous along the water column. A second step, within the framework of the ANTARES program in collaboration with the Centre de Physique des Particules de Marseille, we have studied the role of the luminescent bacteria in the luminous background detected sometimes by the telescope. We first developed a quantitative approach using CARD-FISH on mRNA of the Lux genes which was only partly conclusive but gave encouraging preliminary results. Then, we characterized a luminous strain isolated at 2200 m-depth close to the ANTARES site (named Photobacterium phosphoreum ANT-2200). For better understanding the role of the bioluminescent bacteria in deep-sea, we developed a specific hyperbaric system to evaluate the effect of the hydrostatic pressure on this strain. Whereas this strain was characterized as piezotolerante (growth non sensible to variations of pressure), bioluminescence was always higher at 22 MPa (2200 m simulated) than at 0.1 MPa (atmospheric pressure). Finally, a complementary study was done to study the effect of the hydrostatic pressure on a hydrocarbonoclastic bacteria Marinobacter aquaeolei #5. We have showed that the modification of the hydrostatic pressure does not influence growth rate (piezotolerante strain), but can strongly modify the metabolic ways, in particular the quantity and the nature of produced waxes. The intracellular waxes accumulated in the cells were proportionally less important at 35 MPa than at O.1 MPa. At the contrary, the unsaturation ratio of the membrane fatty acids and the quantity of diunsaturated waxes esters increased at 35 MPa. By these studies, we demonstrated that the hydrostatic pressure plays an important role on the physiological level of the marine bacteria and the distribution of the procaryotes in the deep sea ecosystems.

Les effets de la mobilité sur l’appartenance et l’engagement au sein des communautés francophones en situation minoritaire au Canada sont examinés grâce aux données de l’Enquête sur la vitalité des minorités de langue officielle. Ces phénomènes sont étudiés dans le contexte des communautés dans lesquelles habitent ces individus franco-mobiles en s’attardant à l’effet du milieu défini en fonction de la proportion de francophones vivant dans la municipalité. Ces données sont analysées à travers une série de tableaux croisés. Les analyses révèlent que l’incidence de la mobilité sur l’appartenance et l’engagement est moins grande que postulée. Toutefois, elle a des conséquences plus importantes au niveau de l’engagement que de l’appartenance. Le milieu tempère puisque les effets de la mobilité diffèrent de façon notable, selon le type de communauté. C’est dans les milieux où les francophones représentent moins de 10% de la population que s’observe l’influence la plus marquée de la mobilité.

Dans cette étude, nous avons cherché à comprendre pourquoi les lecteurs de romans, et plus particulièrement de romans pour jeunes adultes (tels que Twilight, Hunger Games, Divergent, etc.), décident de se joindre à des communautés virtuelles et d'y participer activement. Pour ce faire, nous nous sommes appuyés sur la théorie des usages et gratifications ainsi que sur les fan studies, c'est-à-dire le courant d'études réalisées sur des fans. Afin de répondre à notre question de recherche, nous avons effectué des entrevues qualitatives semi-dirigées. Les résultats de notre recherche indiquent que nos participantes ont joint les communautés virtuelles de fans pour répondre à des besoins non-comblés dans leur vie quotidienne, et y sont toujours actives car leurs interactions en ligne continuent de répondre à ce besoin ainsi qu'à d'autres encore.

La République de Chine et la République de Corée sont aujourd’hui des nations démocratiques prospères et pacifiques, mais il n’en a pas toujours été ainsi. Pendant la Guerre froide, ces États étaient en effet contrôlés par des régimes autoritaires où les forces armées jouaient un rôle prépondérant. La fin de ce grand conflit idéologique en 1990 a ouvert la voie à un assouplissement progressif de ces régimes autoritaires et à l’abolition du rôle politique des forces armées. Plusieurs explications ont été avancées pour expliquer ces phénomènes, notamment à travers l’hypothèse constructiviste d’un transfert de normes à partir d’une influence extérieure exercée par des entrepreneurs de normes comme l’hégémon et les institutions internationales. Cette thèse cherche plutôt à nuancer cette affirmation en examinant plutôt le rôle des communautés épistémiques dans la démocratisation progressive des régimes civilo-militaires taïwanais et sud-coréen.