FERREIRA, Davi Morais. Integração de bibliotecas científicas de propósito especial em uma plataforma de componentes paralelos. 2010. 145 f. : Dissertação (mestrado) - Universidade Federal do Ceará, Centro de Ciências, Departamento de Computação, Fortaleza-CE, 2010. / Submitted by guaracy araujo (guaraa3355@gmail.com) on 2016-06-16T17:50:44Z No. of bitstreams: 1 2010_dis_dmf.pdf: 1977126 bytes, checksum: 8f6276f7e40d8f3dbdca5deb5a0a8447 (MD5) / Approved for entry into archive by guaracy araujo (guaraa3355@gmail.com) on 2016-06-16T17:51:57Z (GMT) No. of bitstreams: 1 2010_dis_dmf.pdf: 1977126 bytes, checksum: 8f6276f7e40d8f3dbdca5deb5a0a8447 (MD5) / Made available in DSpace on 2016-06-16T17:51:57Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2010_dis_dmf.pdf: 1977126 bytes, checksum: 8f6276f7e40d8f3dbdca5deb5a0a8447 (MD5) Previous issue date: 2010 / The contribution of traditional scienti c libraries shows to be consolidated in the construction of high-performance applications. However, such an artifact of development possesses some limitations in integration, productivity in large-scale applications, and exibility for changes in the context of the problem. On the other hand, the development technology based on components recently proposed a viable alternative for the architecture of High-Performance Computing (HPC) applications, which has provided a means to overcome these challenges. Thus we see that the scienti c libraries and programming orientated at components are complementary techniques in the improvement of the development process of modern HPC applications. Accordingly, this work aims to propose a systematic method for the integration of scienti c libraries on a platform of parallel components, HPE (Hash Programming Environment), to o er additional advantageous aspects for the use of components and scienti c libraries to developers of parallel programs that implement high-performance applications. The purpose of this work goes beyond the construction of a simple encapsulation of the library in a component; it aims to provide the bene ts in integration, productivity in large-scale applications, and the exibility for changes in the context of a problem in the use of scienti c libraries. As a way to illustrate and validate the method, we have incorporated the libraries of linear systems solvers to HPE, electing three signi cant representatives: PETSc, Hypre, e SuperLU. / A contribuição das tradicionais bibliotecas cientí cas mostra-se consolidada na construção de aplicações de alto desempenho. No entanto, tal artefato de desenvolvimento possui algumas limitações de integração, de produtividade em aplicações de larga escala e de exibilidade para mudanças no contexto do problema. Por outro lado, a tecnologia de desenvolvimento baseada em componentes, recentemente proposta como alternativa viável para a arquitetura de aplicações de Computação de Alto Desempenho (CAD), tem fornecido meios para superar esses desa os. Vemos assim, que as bibliotecas cientí cas e a programação orientada a componentes são técnicas complementares na melhoria do processo de desenvolvimento de aplicações modernas de CAD. Dessa forma, este trabalho tem por objetivo propor um método sistemático para integração de bibliotecas cientí cas sobre a plataforma de componentes paralelos HPE (Hash Programming Environment ), buscando oferecer os aspectos vantajosos complementares do uso de componentes e de bibliotecas cientí cas aos desenvolvedores de programas paralelos que implementam aplicações de alto desempenho. A proposta deste trabalho vai além da construção de um simples encapsulamento da biblioteca em um componente, visa proporcionar ao uso das bibliotecas cientí cas os benefícios de integração, de produtividade em aplicações de larga escala e da exibilidade para mudanças no contexto do problema. Como forma de exempli car e validar o método, temos incorporado bibliotecas de resolução de sistemas lineares ao HPE, elegendo três representantes significativos: PETSc, Hypre e SuperLU.

Made available in DSpace on 2010-04-20T20:14:35Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 1986-03-17T00:00:00Z / Apresenta um Roteiro Metodológico para desenvolvimento de Campanhas de Propaganda. Em paralelo, o trabalho traz uma retrospectiva da Propaganda, com sua história, evolução, fronteiras, e seu papel no Marketing MIX, além de discutir os mais modernos enfoques e conceitos na Moderna: Propaganda. Ainda, o trabalho discute o conceito de Propaganda, revelando suas 2 componentes fundamentais: a científica e a artística.

The pain affective- motivational component refers to the effects of the pain experience on emotions and behavior. Studies shown that social contact induces changes in nociceptive responses, as well as in emotional responses including anxiety in individuals with pain. Our objective was to evaluate how pain affects the social contact and how this contact interferes in nociception and behaviour anxious-like of rats with inflammatory pain and its contactantes. Wistar rats were used (n=75), with 2 to 3 months old. For that they were conducted three experiments. The first experiment evaluated the resident rats behavior during contact with control (CTRL) or rats with inflammatory pain (FORM), n =8 animals for group. Therefore, we measured the latency for the first contact and the contact during 20 min. Residents had a lower latency of the first contact (p=0,013) and longer duration of contact (p=0,0004) with animals FORM group. These responses were higher in the intervals of 0 -5 (p< 0,01) and 15 - 20 min (p< 0,001). Experiment II evaluated the effect of social contact in painful behavior of rats in formalin test. The animals were divided into 02 groups (n= 8/group): Formalin isolated (FI) receiving formalin and were isolated and Formalin contact (FC) receiving formalin and had contact with cohabitants animals. After 20 min of contact or isolation, the animals were placed in the observation box and nociceptive responses were evaluated by 40 min. Animals FC group showed lower number of shaken paw in the first 5 min test (p=0,0019). In Experiment III were evaluated the anxiety- like responses with help of perforated plate using as parameter the total distance traveled, duration and number of dives on the board; and open field, the parameters time spent in the central area of the field and total distance traveled as locomotor response. Thus, the rats were divided into 5 groups (n= 8/group): Formalin-isolated (FORM-ISO) animals were injected with formalin and were isolated by 20 min; Formalin-contact (FORM-CON): animals were injected with formalin and returned to the social contact for 20 minutes; Control-isolated (ISOL): the animals were isolated and after 20 minutes; Resident (RESID): the animals which had contact with the FORM-CON group were tested and; Control (CTRL): the animals were submitted directly to the test. Residents animals had higher total distance (p = 0,036) in the test of perforated plate. The number of dives (p = 0,158) and dive time (p = 0,056) were not changed. In the open field was no significant difference in the total distance (p = 0,043), but no difference in time spent in the central zone (p = 0,253) between the groups. The results suggest that rats identify inflammatory pain conditions in other rats and adopt active behavior directed to the animal in pain. Moreover, the social contact between animals of the same colony reduces inflammatory pain, but did not change the behavior anxious-like of rats with inflammatory pain and cohabitants. / O componente afetivo-motivacional da dor refere-se aos efeitos da vivência da dor sobre emoções e comportamento. Estudos sugerem que o contato social induz alterações nas respostas nociceptivas e afetivas, incluindo ansiedade, em indivíduos com dor. O nosso objetivo foi avaliar como a dor afeta o contato social e como este contato interfere na nocicepção e comportamento tipo-ansioso de ratos com dor inflamatória e em seus contactantes. Foram utilizados 75 ratos Wistar, com 2 a 3 meses de idade. Para isso foram realizados três experimentos. No experimento I foi avaliado o comportamento do rato residente durante o contato com animais controle (CTRL) ou dor inflamatória (FORM), n= 8 animais por grupo. Para tanto, foram medidos o tempo de latência para o primeiro contato e a duração do contato ao longo de 20 min. Os residentes apresentaram uma menor latência do primeiro contato (p=0,013) e maior duração do contato (p=0,0004) com animais do grupo FORM. Essas respostas foram maiores, nos intervalos de 0-5 (p< 0,01) e 15-20 min (p< 0,001). No experimento II foi avaliado o efeito do contato social na resposta nociceptiva de ratos no teste de formalina. Os animais foram divididos em dois grupos (n= 8/grupo): Formalina Isolado (FI) que recebeu formalina e em seguida foi isolado e Formalina Contato (FC) que recebeu formalina e teve contato com o animal da caixa onde residia. Após 20 min de contato ou isolamento, os animais foram colocados na caixa de observação e as respostas nociceptivas foram avaliadas por 40 min. Os animais do grupo FC apresentaram menor número de sacudidas nos 5 min iniciais de experimento (p=0,0019). No experimento III foram avaliadas as respostas tipo-ansiedade com auxílio da placa perfurada, utilizando como parâmetro a distância total percorrida, duração e número de mergulhos na placa; e do campo aberto, os parâmetros tempo de permanência na zona central do campo e a distância total percorrida (como resposta locomotora). Assim, os ratos foram divididos em cinco grupos (n=7/grupo): Formalina-Isolado: animais receberam injeções de formalina e foram isolados por 20 min; Formalina-contato: animais receberam injeções de formalina retornaram ao contato por 20 min; Controle-isolado: os animais foram isolados por 20 min; Residente: os animais que tiveram contato com o animal do grupo Formalina-contato, foram submetidos aos testes e; Controle: os animais foram submetidos diretamente aos testes. Os animais Residentes apresentaram maior distância total percorrida (p= 0,036) no teste da placa perfurada. O número de mergulhos (p= 0,158) e tempo de mergulho (p= 0,056) não foram alterados. No campo aberto houve diferença significativa na distância total percorrida (p= 0,043), mas não houve diferença no tempo de permanência na zona central (p= 0,253) entre os grupos. Os resultados sugerem que ratos são capazes de identificar condições de dor inflamatória em outros ratos e adotar comportamentos ativos direcionados ao animal com dor. Além disso, o contato social entre animais da mesma colônia foi capaz de reduzir a dor inflamatória, mas não alterou o comportamento tipo-ansioso de ratos com dor inflamatória e coabitantes.

A odontologia reabilitadora moderna preconiza cada vez mais o uso de implantes dentais para a substituição de dentes ausentes. É sabido que micro-organismos presentes na cavidade oral, em especial os relacionados à doença periodontal, são responsáveis pelos maiores índices de insucesso dos implantes. Este trabalho estudou a ocorrência de infiltração bacteriana através da interface implante-conector protético de implantes Cone Morse (CM) e Hexágono Interno (HI) após a associação com uma pasta antimicrobiana ou a adição de sais de prata nos pilares. Foram utilizados 72 implantes odontológicos de titânio (PROSS® - Sistema de Implantes, Dabi-Atlante, Ribeirão Preto, Brasil), 36 com conexão do tipo hexágono interno e 36 com conexão do tipo cone-morse, divididos em grupos, da seguinte forma: Grupo Pasta Antimicrobiana- 12 conjuntos implantes HI/conectores protéticos e 12 conjuntos implantes CM/conectores protéticos, Grupo Íons de Prata- 12 conjuntos implantes HI/conectores protéticos e 12 conjuntos implantes CM/conectores protéticos e Grupo Controle- 12 conjuntos implantes HI/conectores protéticos e 12 conjuntos implantes CM/conectores protéticos. Os implantes e os conectores protéticos foram retirados de suas embalagens para aplicação do torque final (20N/cm). Antes disso, em um dos grupos experimentais, uma camada da pasta antimicrobiana foi aplicada sobre a superfície interna dos implantes e conectores protéticos e seus respectivos parafusos. Os conjuntos implantes-conectores foram parcialmente imersos na solução de saliva humana em tubos de ensaio e incubados em estufa bacteriológica a 37°C durante 7 dias. Após esse período, amostras do conteúdo interno dos conjuntos implantes-conectores protéticos dos 3 grupos foram colhidas com o objetivo de detectar e quantificar os micro-organismos presentes, utilizando para isto, a técnica de hibridização com sondas de DNA genômico DNA Checkerboard. Os implantes de conexão do tipo cone morse apresentaram menores valores de contagem de bactérias quando comparados aos implantes hexágono interno no grupo Controle (p<0,001), já para o grupo Íons de prata e Pasta antimicrobiana, foi observado comportamento inverso, maiores valores de contagem de bactérias para os implantes Cone Morse. Comparando-se os implantes de mesma conexão, entre os 03 grupos examinados, as amostras dos implantes Cone Morse dos grupos Controle, Íons de prata e Pasta antimicrobiana apresentaram valor de contagens de micro-organismos em ordem crescente. Os implantes de conexão hexágonal interna dos grupos Controle apresentaram maiores valores de contagens de micro-organismos seguidos pelos implantes do grupo Pasta antimicrobiana e Íons de prata, respectivamente. A partir dos resultados obtidos pode-se concluir que houve a passagem dos 43 micro-organismos analisados in vitro através da interface implante/componente protético em ambos os sistemas avaliados. Para ambos os tratamentos (adição de sais de prata às paredes dos pilares protéticos e aplicação da pasta antimicrobiana no interior dos implantes) houve diminução da infiltração microbiana no interior daqueles sistemas de conexão do tipo Hexágono Interno. / The contemporary and modern dentistry has been preconized the use of dental implants for replacement of missing teeth. The micro-organisms presents in oral environment, particularly those related to periodontal disease, are responsible for the highest failure rates of dental implants. This study evaluated the occurrence of bacterial leakage through the abutmentimplant interface in Morse Taped (CM) and Hexagon Internal (HI) dental implants after the association with antimicrobial paste or addition of silver salts on the abutments. 72 titanium dental implants (Pross ® - Implant System, Dabi-Atlante, Ribeirão Preto, Brazil), 36 with internal hexagon connection type and 36 with cone-morse connection type, divided into groups as follows: group Antimicrobial Paste -12 implants HI / prosthetic connectors and 12 implants CM / prosthetic connectors, group Ion Silver-12 implants HI / prosthetic connectors and 12 implants CM / prosthetic connectors and Control Group-12 implants HI / prosthetic connectors and 12 implants CM / prosthetic connectors. The implants and prosthetic connectors have been removed from their packaging for applying of final torque (20N/cm). Previously, in one experimental group, a layer of antimicrobial paste was applied on the inner surface of implants and prosthetic connectors. The sets connector/implants were partially immersed in human saliva solution in test tubes and incubated in bacteriological oven at 37°C for 7 days. Subsequently, samples of the contents of internal prosthetic sets implantconnectors of the 3 groups were collected to detect and quantify micro-organisms, through the DNA Checkerboard Hybridization Technique. The morse taper implants had significantly lower bacterial count compared to internal hexagon implants in the control group (p <0.001), while for the group of Silver Ion and antimicrobial Paste, we observed an inverse behavior, higher counts of micro-organisms for Morse taper implants. Comparing the same connection implants, among the 03 groups examined, samples of implants Morse Taper Control groups, Antimicrobial Paste and Silver ions exhibited values of counts of micro-organisms in ascending order. The internal hexagon implants of the Control group showed higher counts of microorganisms followed by Antimicrobial Paste and Silver Ions groups, respectively. The 43 species analyzed in vitro infiltrated through the interface implant / abutment in both systems evaluated; For both the treatments (adding silver salts in the abutments walls and applying of the antimicrobial paste within the implants) there was decreased microbial leakage through the interface connection for the internal hexagon dental implants

The pain affective- motivational component refers to the effects of the pain experience on emotions and behavior. Studies shown that social contact induces changes in nociceptive responses, as well as in emotional responses including anxiety in individuals with pain. Our objective was to evaluate how pain affects the social contact and how this contact interferes in nociception and behaviour anxious-like of rats with inflammatory pain and its contactantes. Wistar rats were used (n=75), with 2 to 3 months old. For that they were conducted three experiments. The first experiment evaluated the resident rats behavior during contact with control (CTRL) or rats with inflammatory pain (FORM), n =8 animals for group. Therefore, we measured the latency for the first contact and the contact during 20 min. Residents had a lower latency of the first contact (p=0,013) and longer duration of contact (p=0,0004) with animals FORM group. These responses were higher in the intervals of 0 -5 (p< 0,01) and 15 - 20 min (p< 0,001). Experiment II evaluated the effect of social contact in painful behavior of rats in formalin test. The animals were divided into 02 groups (n= 8/group): Formalin isolated (FI) receiving formalin and were isolated and Formalin contact (FC) receiving formalin and had contact with cohabitants animals. After 20 min of contact or isolation, the animals were placed in the observation box and nociceptive responses were evaluated by 40 min. Animals FC group showed lower number of shaken paw in the first 5 min test (p=0,0019). In Experiment III were evaluated the anxiety- like responses with help of perforated plate using as parameter the total distance traveled, duration and number of dives on the board; and open field, the parameters time spent in the central area of the field and total distance traveled as locomotor response. Thus, the rats were divided into 5 groups (n= 8/group): Formalin-isolated (FORM-ISO) animals were injected with formalin and were isolated by 20 min; Formalin-contact (FORM-CON): animals were injected with formalin and returned to the social contact for 20 minutes; Control-isolated (ISOL): the animals were isolated and after 20 minutes; Resident (RESID): the animals which had contact with the FORM-CON group were tested and; Control (CTRL): the animals were submitted directly to the test. Residents animals had higher total distance (p = 0,036) in the test of perforated plate. The number of dives (p = 0,158) and dive time (p = 0,056) were not changed. In the open field was no significant difference in the total distance (p = 0,043), but no difference in time spent in the central zone (p = 0,253) between the groups. The results suggest that rats identify inflammatory pain conditions in other rats and adopt active behavior directed to the animal in pain. Moreover, the social contact between animals of the same colony reduces inflammatory pain, but did not change the behavior anxious-like of rats with inflammatory pain and cohabitants. / O componente afetivo-motivacional da dor refere-se aos efeitos da vivência da dor sobre emoções e comportamento. Estudos sugerem que o contato social induz alterações nas respostas nociceptivas e afetivas, incluindo ansiedade, em indivíduos com dor. O nosso objetivo foi avaliar como a dor afeta o contato social e como este contato interfere na nocicepção e comportamento tipo-ansioso de ratos com dor inflamatória e em seus contactantes. Foram utilizados 75 ratos Wistar, com 2 a 3 meses de idade. Para isso foram realizados três experimentos. No experimento I foi avaliado o comportamento do rato residente durante o contato com animais controle (CTRL) ou dor inflamatória (FORM), n= 8 animais por grupo. Para tanto, foram medidos o tempo de latência para o primeiro contato e a duração do contato ao longo de 20 min. Os residentes apresentaram uma menor latência do primeiro contato (p=0,013) e maior duração do contato (p=0,0004) com animais do grupo FORM. Essas respostas foram maiores, nos intervalos de 0-5 (p< 0,01) e 15-20 min (p< 0,001). No experimento II foi avaliado o efeito do contato social na resposta nociceptiva de ratos no teste de formalina. Os animais foram divididos em dois grupos (n= 8/grupo): Formalina Isolado (FI) que recebeu formalina e em seguida foi isolado e Formalina Contato (FC) que recebeu formalina e teve contato com o animal da caixa onde residia. Após 20 min de contato ou isolamento, os animais foram colocados na caixa de observação e as respostas nociceptivas foram avaliadas por 40 min. Os animais do grupo FC apresentaram menor número de sacudidas nos 5 min iniciais de experimento (p=0,0019). No experimento III foram avaliadas as respostas tipo-ansiedade com auxílio da placa perfurada, utilizando como parâmetro a distância total percorrida, duração e número de mergulhos na placa; e do campo aberto, os parâmetros tempo de permanência na zona central do campo e a distância total percorrida (como resposta locomotora). Assim, os ratos foram divididos em cinco grupos (n=7/grupo): Formalina-Isolado: animais receberam injeções de formalina e foram isolados por 20 min; Formalina-contato: animais receberam injeções de formalina retornaram ao contato por 20 min; Controle-isolado: os animais foram isolados por 20 min; Residente: os animais que tiveram contato com o animal do grupo Formalina-contato, foram submetidos aos testes e; Controle: os animais foram submetidos diretamente aos testes. Os animais Residentes apresentaram maior distância total percorrida (p= 0,036) no teste da placa perfurada. O número de mergulhos (p= 0,158) e tempo de mergulho (p= 0,056) não foram alterados. No campo aberto houve diferença significativa na distância total percorrida (p= 0,043), mas não houve diferença no tempo de permanência na zona central (p= 0,253) entre os grupos. Os resultados sugerem que ratos são capazes de identificar condições de dor inflamatória em outros ratos e adotar comportamentos ativos direcionados ao animal com dor. Além disso, o contato social entre animais da mesma colônia foi capaz de reduzir a dor inflamatória, mas não alterou o comportamento tipo-ansioso de ratos com dor inflamatória e coabitantes.

Orientador: Claudia Bauer Medeiros / Tese (doutorado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Computação / Made available in DSpace on 2018-08-07T03:38:23Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Santanche_Andre_D.pdf: 5630081 bytes, checksum: a9ac93609b33f3525c7597c3bbc398b9 (MD5) Previous issue date: 2006 / Resumo: A Web está evoluindo de um espaço para publicação/consumo de documentos para um ambiente para trabalho colaborativo, onde o conteúdo digital pode viajar e ser replicado, adaptado, decomposto, fundido e transformado. Designamos esta perspectiva por Fluid Web. Esta visão requer uma reformulação geral da abordagem típica orientada a docu­mentos que permeia o gerenciamento de conteúdo na Web. Esta tese apresenta nossa solução para a Fluid Web, que permite nos deslocarmos de uma perspectiva orientada a documentos para outra orientada a conteúdo, onde "conteúdo" pode ser qualquer objeto digital. A solução é baseada em dois eixos: (i) uma unidade auto-descritiva que encap­sula qualquer tipo de artefato de conteúdo - o Componente de Conteúdo Digital (Digital Content Component - DCC); e (ii) uma infraestrutura para a Fluid Web que permite o gerenciamento e distribuição de DCCs na Web, cujo objetivo é dar suporte à colaboração na Web. Concebidos para serem reusados e adaptados, os DCCs encapsulam dados e software usando uma única estrutura, permitindo deste modo composição homogênea e proces­samento de qualquer conteúdo digital, seja este executável ou não. Estas propriedades são exploradas pela nossa infraestrutura para a Fluid Web, que engloba mecanismos de descoberta e de anotação de DCCs em múltiplos níveis, gerenciamento de configurações e controle de versões. Nosso trabalho explora padrões de Web Semântica e ontologias ta­xonômicas, que servem como uma ponte semântica, unificando vocabulários para gerenci­amento de DCCs e facilitando as tarefas de descrição/indexação/descoberta de conteúdo. Os DCCs e sua infraestrura foram implementados e são ilustrados por meio de exemplos práticos, para aplicações científicas. As principais contribuições desta tese são: o modelo de Digital Content Component; o projeto da infraestrutura para a Fluid Web baseada em DCCs, com suporte para armaze­namento baseado em repositórios, compartilhamento, controle de versões e gerenciamento de configurações distribuídas; um algoritmo para a descoberta de conteúdo digital que explora a semântica associada aos DCCs; e a validação prática dos principais conceitos desta pesquisa, com a implementação de protótipos / Abstract: The Web is evolving from a space for publicationj consumption of documents to an en­vironment for collaborative work, where digital content can traveI and be replicated, adapted, decomposed, fusioned and transformed. We call this the Fluid Web perspective. This view requires a thorough revision of the typical document-oriented approach that permeates content management on the Web. This thesis presents our solution for the Fluid Web, which allows moving from the document-oriented to a content-oriented pers­pective, where "content" can be any digital object. The solution is based on two axes: a self-descriptive unit to encapsulate any kind of content artifact - the Digital Content Component (DCC); and a Fluid Web infrastructure that provides management and de­ployment of DCCs through the Web, and whose goal is to support collaboration on the Web. Designed to be reused and adapted, DCCs encapsulate data and software using a single structure, thus allowing homogeneous composition and processing of any digital content, be it executable or noto These properties are exploited by our Fluid Web infrastructure, which supports DCC multilevel annotation and discovery mechanisms, configuration ma­nagement and version controI. Our work extensively explores Semantic Web standards and taxonomic ontologies, which serve as a semantic bridge, unifying DCC management vo­cabularies and improving DCC descriptionjindexingjdiscovery. DCCs and infrastructure have been implemented and are illustrated by means of examples, for scientific applicati­ons. The main contributions of this thesis are: the model of Digital Content Component; the design of the Fluid Web infrastructure based on DCCs, with support for repository­based storage, distributed sharing, version control and configuration management; an algorithm for digital content discovery that explores DCe semantics; and a practical validation of the main concepts in this research through implementation of prototypes / Doutorado / Banco de Dados / Mestre em Ciência da Computação

O objetivo principal deste trabalho é introduzir os modelos log-Birnbaum-Saunders mistos (log-BS mistos) e estender os resultados para os modelos log-Birnbaum-Saunders t-Student mistos (log-BS-t mistos). Os modelos log-BS são bastante conhecidos desde o trabalho de Rieck e Nedelman (1991) e particularmente receberam uma grande atenção nos últimos 10 anos com vários trabalhos publicados em periódicos internacionais. Contudo, o enfoque desses trabalhos tem sido em modelos log-BS ou log-BS generalizados com efeitos fixos, não havendo muita atenção para modelos com efeitos aleatórios. Inicialmente, apresentamos no trabalho uma revisão das distribuições Birnbaum-Saunders e Birnbaum-Saunders generalizada (BSG) e em seguida discutimos os modelos log-BS e log-BS-t com efeitos fixos, para os quais revisamos alguns resultados de estimação e diagnóstico. Os modelos log-BS mistos são então apresentados precedidos de uma revisão dos métodos de quadratura de Gauss Hermite (QGH). Embora a estimação dos parâmetros nos modelos log-BS mistos seja efetuada através do procedimento Proc NLMIXED do SAS (Littell et al, 1996), aplicamos o método de quadratura não adaptativa a fim de obtermos aproximações para o logaritmo da função de verossimilhança do modelo log-BS de intercepto aleatório. Com essas aproximações derivamos as funções escore e a matriz hessiana, além das curvaturas normais de influência local (Cook, 1986) para alguns esquemas de perturbação usuais. Os mesmos procedimentos são aplicados para os modelos log-BS-t de intercepto aleatório. Discussões sobre a predição dos efeitos aleatórios, teste para o componente de variância dos modelos com intercepto aleatório e análises de resíduos são também apresentados. Finalmente, comparamos os ajustes de modelos log-BS e log-BS mistos a um conjunto de dados reais. Métodos de diagnóstico são utilizados na comparação dos modelos ajustados. / The aim of this work is to introduce the log-Birnbaum-Saunders mixed models (log-BS mixed models) and to extend the results to log-Birnbaum-Saunders Student-t mixed models (log-BS-t mixed models). The log-BS models are well-known since the work by Rieck and Nedelman (1991) and particularly have received great attention in the last 10 years with various published papers in international journals. However, the emphasis given in such works has been in fixed-effects models with few attention given to random-effects models. Firstly, we present in this work a review on Birnbaum-Saunders and generalized Birnbaum-Saunders distributions and so we discuss log-BS and log-BS-t fixed-effects models for which some results on estimation and diagnostic are presented. Then, we introduce the log-BS mixed models preceded by a review on Gauss-Hermite quadrature. Although the parameter estimation of the marginal log-BS and log-BS-t mixed models are performed in the procedure NLMIXED of SAS (Littell et al., 1996), we apply the quadrature methods in order to obtain approximations for the likelihood function of the log-BS and log-BS-t random intercept models. These approximations are used to derive the respective score functions, observed information matrices as well as the normal curvature of local influence (Cook, 1986) under some usual perturbation schemes. Discussions on the prediction of the random effects, variance component tests and residual analysis are also given. Finally, we compare the fits of log-BS and log-BS-t mixed models to a real data set. Diagnostic methods are used in the comparisons.

Made available in DSpace on 2017-07-10T19:23:53Z (GMT). No. of bitstreams: 1 protegidoJacqueline_dissertacao.pdf: 3012964 bytes, checksum: 337f371fa8c665bb4fdfdc22709938da (MD5) Previous issue date: 2015-02-02 / The soil spatial variability s studies are based in geostatistics which appears as a method whose data comes from natural phenomena and consider the geographical location of the phenomenon. If in an area under study the researcher has interest in searching the variability of variables and has evidence that the steps which describe the spatial structure of this variables aren t independent a geostatistical bivariate model study can be proposed. This work concentrates on evaluating the variation s influence of the bivariate Gaussian common component model (BGCCM) parameters in calculating the Pearson correlation coefficient and analyzing the influence that sizes and sampling settings may present at the BGCCM s estimation and at spatial prediction variables in non-sampled locations. Moreover, for co-placed samples, crossed semivariograms were built and compared with univariate model and BGCCM, in relation to estimates of the model and the sizes associated with the spatial prediction. In order to do it, these methodologies were applied in simulated data sets and experimental data, from an agricultural property. The simulation study of the parameters variation influence s analysis of the bivariate model BGCCM in calculating the Pearson correlation coefficient between described variables of bivariate model BGCCM revealed that the Pearson s linear correlation coefficient can t be considered in decision-making about the presence of joint spatial dependence between pairs of variables. In the study with simulations, it was observed that the biggest differences of accuracy measures and the square sum of the spatial prediction s difference occurred when the univariate models and crossed semivariogram were compared to the BGCCM. Moreover, the simulation s study observed that for balanced data the regular and irregular meshes showed better efficiency as the spatial prediction. The study with real data showed that under the BGCCM approach, spatial dependence was observed, mainly between pH and Mn for co-placed and balanced data of the agriculture year 2010/2011; and between the variable inside of the next pairs: (Prod, RSP0-10), (Prod, RSP11-20), (Prod, RSP21-30) and (Prod, Mn) for co-placed and balanced data of the agriculture year 2013/2014; and (Prod, RSP11-20) and (Prod, RSP21-30) for co-placed and unbalanced data of the agriculture year 2013/2014. Still considering the real data study comparing the univariated models, crossed semivariogram and BGCCM, differences could be observed in the square sum of prediction s difference and in the accuracy measures, both for balanced and unbalanced data. However, considering the real data and the control sample, the spatial prediction s quality using the BGCCM model was inefficient when compared to the quality resulted from the spatial prediction using the univariate model. Nevertheless, this result may have been influenced by the choice of sample configuration. / Estudos da variabilidade espacial do solo estão baseados na geoestatística, que se apresenta como um método cujos dados provêm de fenômenos naturais e que consideram a localização geográfica do fenômeno. Se numa área em estudo o pesquisador tem interesse em pesquisar a variabilidade das variáveis e se há evidências que os passos que descrevem a estrutura espacial dessas variáveis não são independentes pode-se propor o estudo de um modelo geoestatístico bivariado. Este trabalho concentrou-se em avaliar a influência da variação dos parâmetros do modelo bivariado com componente de correlação parcialmente comum (bivariate Gaussian common component model BGCCM) no cálculo do coeficiente de correlação linear de Pearson e analisar a influência que tamanhos e configurações amostrais podem apresentar na estimação do modelo BGCCM e na predição espacial de variáveis em localizações não amostradas. Além disso, para amostras co-locadas, construíram-se os semivariogramas cruzados e comparou-se com o modelo univariado e BGCCM, em relação às estimativas do modelo e as medidas associadas à predição espacial. Para isso, essas metodologias foram aplicadas em conjuntos de dados simulados e dados experimentais, provenientes de uma propriedade agrícola. O estudo de simulação da análise da influência da variação dos parâmetros do modelo bivariado BGCCM no cálculo do coeficiente de correlação linear de Pearson entre as variáveis descritas do modelo bivariado BGCCM revelou que o coeficiente de correlação linear de Pearson não pode ser considerado na tomada de decisão quanto à presença de dependência espacial conjunta entre pares de variáveis. No estudo com simulações observou-se que as maiores diferenças das medidas de acurácia e da soma quadrada da diferença entre as predições espaciais ocorreram quando se comparou os modelos univariado e semivariograma cruzado com o BGCCM. Ainda no estudo de simulação observou-se que para os dados balanceados as malhas regular e irregular apresentaram melhor eficiência quanto à predição espacial. O estudo com dados reais mostrou que, sob a abordagem do modelo BGCCM, observou-se a presença de dependência espacial principalmente entre pH e Mn para dados co-locados e balanceados do ano agrícola 2010/2011; e entre as variáveis dentro dos seguintes pares: (Prod, RSP0-10), (Prod, RSP11-20), (Prod, RSP21-30) e (Prod, Mn) para dados co-locados e balanceados do ano agrícola 2013/2014; e (Prod, RSP11-20) e (Prod, RSP21-30) para dados co-locados e desbalanceados do ano agrícola 2013/2014. Ainda considerando o estudo com dados reais comparando os modelos univariado, semivariograma cruzado e BGCCM, mostraram diferenças na soma quadrada da diferença da predição e nas medidas acurácia, tanto para dados balanceados como para os desbalanceados. No entanto, considerando os dados reais e a amostra controle, a qualidade da predição espacial usando o modelo BGCCM se mostrou ineficiente quando comparada com a qualidade obtida na predição espacial usando o modelo univariado. Porém, esse resultado pode ter sido influenciado pela escolha da configuração amostral utilizada.

Este estudo foi desenvolvido a partir de informações das avaliações genéticas de touros pertencentes a rebanhos participantes do Programa de Melhoramento Genético da Raça Nelore (PMGRN-Nelore Brasil), que desenvolve, desde 1995, um teste de progênie denominado Reprodução Programada (RP), o qual tem como finalidade principal de disponibilizar animais com valores genéticos mais confiáveis no mercado de reprodutores. Assim, as Diferenças Esperadas nas Progênies (DEPs) de 234 touros participantes da RP no período de 1996 a 2003 foram analisadas com os seguintes objetivos: 1- Avaliar o mérito genético dos touros ao longo dos anos, utilizando regressão linear entre a DEP e ano de participação do touro na RP para as características, peso aos 120 e 210 dias, efeitos direto e materno (DDPP120, DDPP210, DMPP120 e DMPP210); peso e perímetro escrotal aos 365 e 450 dias, efeito direto (DDP365, DDP450, DDPE365 e DDPE450) e idade ao primeiro parto (DDIPP); 2- Identificar, por meio de abordagens multivariadas, grupos de animais cujas DEPs apresentem padrões de semelhança, assim como discriminar as variáveis que mais influenciam na divisão dos grupos, numa tentativa de auxiliar a tomada de decisão nos sistemas de produção de bovinos de corte, com vistas a maximizar a produtividade. Os procedimentos multivariados de análises de agrupamento e componentes principais foram aplicados às DEPs de sete características (DMPP120, DMPP210, DDPP365, DDPP450, DDPE365, DDPE450 e DDIPP). As análises foram processadas com o auxílio do software Statistica (STATSOFT, 2004). As tendências genéticas das DEPs relacionadas com as características de fertilidade, DDPE365, DDPE450 e DDIPP, mostraram progressos genéticos de 0,051 e 0,061 cm e -0,026 mês por ano respectivamente, enquanto que DDPP450 foi à característica que obteve maior ganho genético dentre as DEPs de crescimento, 1,467 kg/ano. Com referência às abordagens multivariadas, a análise de agrupamento k-médias foi aplicada e o resultado envolvendo três grupos foi o melhor obtido, dos quais dois se destacaram quanto aos valores médios das DEPs. A importância desses dois grupos de touros foi confirmada pela análise de componentes principais que associou a eles valores superiores de DEPs diretas de peso e perímetro escrotal. A quantidade de variabilidade original retida pelos dois primeiros componentes principais foi de 70,22%. Foram observados progressos genéticos nos touros da Reprodução Programada para todas as características durante o período estudado, indicando que a estratégia de seleção praticada vem sendo efetiva e evidenciando a importância da contribuição dos touros da RP para o melhoramento das características reprodutivas e de crescimento da raça Nelore. Neste estudo pode-se verificar o poder classificatório e discriminatório das análises de agrupamentos e componentes principais, o que muito pode contribuir na classificação de touros, facilitando a seleção de animais em Programas de Melhoramento Genético. / This research was developed with genetic information of sires that belong to herds of the ?Programa de Melhoramento Genético da Raça Nelore? (PMGRN-Nelore Brasil), witch has been carried on, since 1995, a progeny test denominated ?Reprodução Programada? (RP), whose the main aim is to obtain reliable genetic values for sires market. Therefore, the Expected Progeny Difference (EPD) of 243 sires taking part of the RP from 1996 to 2003 were used with the following objectives of: 1- Evaluating the genetic merit over the years applying linear regression between the EPD and the year of the sires RP participation, for the following traits: weight at 120 and 210 days of age, direct and maternal effects (DDPP120, DDPP210, DMPP120 and DMPP210) weight and scrotal circumference at 365 and 450 days of age, direct effect (DDPP365, DDPP450, DDPE365 and DDPE450) and age at first calving (DDIPP); 2- Identifying groups of animals, whose, EPDs show similarity patterns, as well as, verifying which were the variable that showed greater power in discriminating group formations, trying to help the decisions making support in the beef cattle production system by multivariate approaches, in order to maximizing the productivity. The multivariate procedures of clusters analysis and principal components were applied in the EPDs from seven traits (DMPP120, DMPP210, DDPP365, DDPP450, DDPE365, DDPE450 and DDIPP). The analyses were performed by software Statistica (STATSOFT, 2004). The genetic trends of the EPD related to the fertility traits, DDDPE365, DDPE450 e DDIPP, showed some genetic progress of 0.051 and 0.061 cm and ? 0.026 month per year respectively, while, the DDPP450 was the trait that obtained the highest genetic gain in the growth EPDs, 1.467 kg/year. About the multivariate approaches, the k-means clustering analysis was applied and the results of three groups formation were the best option, two of them stood out in relation to values of the EPDs means. The importance of these two groups was confirmed by the analyses of principal components that associate the direct EPDs of weight and scrotal circumference values to them. The quantity of original variability kept in the first main components was 70.22%. It was observed genetic progress in the RP sires for every trait during the studied period, indicating that the selection has been effective and evidencing how important the contribution of the RP sires for the reproductive and growth traits for the Nelore breed improvement is. In this research, the classificatory and discriminatory power of cluster analyses and principal components could be verify, and certainly could contribute in the sire classification, helping the selection in the Animal Breeding Program.

Orientador: Cecília Mary Fischer Rubira / Dissertação (mestrado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Computação / Made available in DSpace on 2018-08-23T09:09:24Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Braz_Alan_M.pdf: 1903353 bytes, checksum: 9bff9aefdcc11d6d8fe46490302d6291 (MD5) Previous issue date: 2013 / Resumo: Os Métodos Ágeis, ou Desenvolvimento Ágil de Software (DAS), tem se popularizado, na última década, por meio de métodos como Extreme Programming (XP) e Scrum e isso fez com que fossem aplicadas no desenvolvimento de sistemas computacionais de diversos tamanhos, complexidades técnica e de domínio, e de rigor quanto à confiabilidade. Esse fato evidencia a necessidade de processos de desenvolvimento de software que sejam mais rigorosos e que possuam uma quantidade adequada de modelagem e documentação, em especial no que concerne ao projeto arquitetural, com o objetivo de garantir maior qualidade no seu resultado final. A confiabilidade pode ser alcançada adicionando elementos de tratamento de exceções às fases iniciais do processo de desenvolvimento e à reutilização de componentes. O tratamento de exceções tem sido uma técnica muito utilizada na verificação e na depuração de erros em sistemas de software. O MDCE+ é um método que auxilia a modelagem do comportamento excepcional de sistemas baseados em componentes que, por ser centrado na arquitetura, melhora a definição e a análise do fluxo de exceções entre os componentes do sistema. Este trabalho propõe uma solução para guiar o desenvolvimento de sistemas confiáveis baseados em componentes por meio da adição de práticas do MDCE+ ao Scrum, resultando no método Scrum+CE (Scrum com Comportamento Excepcional). Esse processo passa a expor os requisitos excepcionais em nível das Estórias de Usuário, adiciona testes de aceitação mais detalhados, obriga a criação do artefato de Arquitetura Inicial e adiciona um novo papel de Dono da Arquitetura. Como forma de avaliar esse método proposto, foi realizado um experimento controlado com três equipes, que desenvolveram um sistema com requisitos de confiabilidade, utilizando Scrum e Scrum+CE. Foram coletadas métricas para comparar a eficiência do novo processo e o resultado obtido, com a utilização do Scrum+CE, foi à produção de software com melhor qualidade, porém com menor número de funcionalidades / Abstract: Agile Software Development (ASD) has been on mainstream through methodologies such as Extreme Programming (XP) and Scrum in the last decade enabling them to be applied in the development of computer systems of various size, technical and domain complexity and degress of reliability. This fact highlights the need for software development processes that are accurate and have an adequate amount of modeling and documentation, especially regarding the architectural design, aiming to increase the quality of the end result. The reliability can be achieved by adding elements of exception handling at early stages of development and through components reuse. Exception handling has been a widely used technique in detecting and fixing errors in software systems. The MDCE+ is a method that assists exceptional behavior modeling at components based systems, which is architecture-centric what improves the definition and flow analysis of exceptions between system components. This paper proposes a solution to guide the development of reliable systems based on components by adding MDCE+ practices to Scrum, resulting in the Scrum+CE method (Scrum with Exceptional Behavior). This process exposes the exceptional requirements, at the User Stories level, documents acceptance tests with more details, requires the creation of a high-level architecture artifact and adds a new role of Architecture Owner. In order to evaluate this proposed method, a controlled experiment was conducted with three teams, who developed a system with reliability requirements using Scrum and Scrum+CE. We collected metrics to compare the efficiency of the new process and the result was the production of software with better quality but with less features using Scrum+CE / Mestrado / Ciência da Computação / Mestre em Ciência da Computação