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Mechanical spectroscopy of polymers with reduced dimensions and increasing cross-linking degree / Mechanische Spektroskopie an Polymeren mit reduzierten Dimensionen und zunehmendem VernetzungsgradHaramina, Tatjana 27 June 2006 (has links)
Der Einfluss von reduzierten Dimensionen und zunehmendem Vernetzungsgrad auf die Polymerkettendynamik in der Nähe der Glassübergangstemperatur, Tg, wird mittels der Vibrating Reed Technik untersucht. Die mechanische Dämpfung der unterstützten Polymerfilme, wird am System Polymerfilm/Substrat gemessen. Mechanische Spektroskopie liefert nicht nur die Information über Tg, es können auch die ganzen Relaxationsspektren untersucht werden.Der Effekt der reduzierten Dimensionen wird an PS Filmen untersucht. Für Filmdicken unterhalb 100 nm, wird der α Relaxationspeak, der mit dem Glassübergang verknüpft ist, zu kleineren Temperaturen hin verschoben und verbreitert. Dieser Effekt wird nur bis zu 44 nm Filmdicke beobachtet. Ein Model, das dises Verhalten beschreibt, wird vorgeschlagen. An der Grenzfläche Vakuum/Film existiert eine flüssigskeitsähnliche Schicht, die eine erhöhte Kettenbeweglichkeit zeigt, was zu dem Abfall von Tg führt. Bei der mechanischen Spektroskopie ist das Verhalten der Schicht viskos und zeigt keinen Glassübergang in dem gemessenen Temperaturbereich. Folglich, würde sich im Falle, dass die Filmdicke gleich der Dicke der flüssigkeitsänlichen Schicht ist, Tg gegen 0 annähren. Der Gegeneffekt wird durch die erhöhte Dichte an der Film/Substrat Grenzfläche untersucht, die durch die bevorzugte out of plane Orientierung den Phenylringe entsteht.Der Einfluss der Vernetzung auf die Dynamik bei Bulkfilmen wird an dem Beispiel von Poly(vinyl cinnamate) (PVCN) untersucht. Das Material ist vernetzbar durch die Bestrahlung mit UV Licht. Der Vernetzungsgrad wird durch die IR Spektroskopie untersucht. Die Beweglichkeit in der vernetzten Struktur ist behindert, deshalb wird der α Relaxationspeak zu größeren Temperaturen verschoben und die Relaxationsstärke nimmt ab. Die Linienbreite ist beeinflusst durch die Verbreiterung der Relaxationszeitdistribution, die im Folge der neuen heterogenen Struktur auftritt. Der Anteil der Vernetzungsknoten für PVCN beträgt etwa 75%.
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Studium interakce lektinových receptorů přirozených zabíječů s jejich proteinovými ligandy. / Studies on interactions between natural killer cell lectin receptors and their protein ligands.Hernychová, Lucie January 2014 (has links)
NK cells are innate lymphocytes which constitute the first line of organism's defence against infections through their receptor system. These cells represent an important part of antiviral and antitumor immunity, they also play a role in transplant immunity, autoimmunity and reproduction. This diploma thesis inquires into the structure of the transmembrane receptor NKR-P1B of mouse NK cells and the interaction with its ligand Clr-b. The aim was to prepare the expression vector coding the ligand-binding and whole extracellular region of the receptor NKR-P1B and to optimize its production and refolding in vitro. Purified protein samples were analyzed by size-exclusion chromatography, electrophoresis and mass spectrometry. Interaction between NKR-P1B and Clr-b proteins was tested using biophysical (size-exclusion chromatography and surface plasmon resonance) and biological methods (labelling of cellular sample with NKR-P1B proteins marked with fluorescent dye). In vitro binding experiments have not confirmed mutual interaction between NKR-P1B and Clr-b despite the prepared proteins binding to the bone marrow cells.
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Enzymatisch vernetzte Caseine – Struktur und AnwendungspotentialHeber, Alexander 25 March 2014 (has links)
Im Rahmen dieser Arbeit ist es durch die kombinierte Anwendung von P-31 Flüssigkeits (HR)- NMR-Spektroskopie sowie dynamischer Lichtstreuung (DLS) gelungen, die supramolekulare Struktur von mizellarem Casein aus ultrahocherhitzter (UHT) Milch unter dem Einfluss einer enzymatischen Vernetzung mittels mikrobieller Transglutaminase (mTG) zu charakterisieren. Die P-31 HR NMR-Spektroskopie erweist sich dabei als hervorragende Methode, um sowohl den Einbau von Casein aus dem Milchserum in die mizellaren Aggregate durch die enzymatische Reaktion als auch die bevorzugte mTG Vernetzung des beta-Caseins nachzuweisen. Durch die Kombination von P-31 HR NMR-Spektroskopie und Messungen der dynamischen Lichtstreuung war es weiterhin möglich, das Vorliegen vernetzter Caseinaggregate in Dispersionen mTG-behandelter Caseine zu belegen und besonders den Anteil an nicht vernetztem Casein „sichtbar“ zu machen, der durch EDTA-Zugabe aus den mTG-vernetzten Caseinnetzwerken freigesetzt wird.
Es zeigt sich, dass die Caseinnetzwerke nach der EDTA-Behandlung eine geringere Proteindichte als mizellares Casein aufweisen, da sie nur ca. 20 % des Serinphosphats des mizellaren Caseins enthalten. P-31 Festkörper-NMR-spektroskopische Messungen legen außerdem nahe, dass die Beweglichkeit des phosphorylierten Ser149-Restes des kappa-Caseins in der äußeren Schicht der mizellaren Caseinaggregate durch die mTG-Behandlung nicht wesentlich verändert wird.
Um die erhaltenen Caseinnetzwerke im Hinblick auf ihr Anwendungspotential zu untersuchen, wurden sie als Proteinkomponente bei der biomimetischen Calciumphosphatfällung sowie als Trägerstrukturen für bioaktives Lysozym verwendet. Durch den Einsatz von Caseinnetzwerken als Fällungsmedium während der Präzipitation von Calciumphosphat (CaP) ist es gelungen, eine hydratisierte, apatitische Phase zu stabilisieren, die sowohl ungeordnete als auch kristalline Bereiche enthält und damit strukturelle Ähnlichkeit zu biologisch und besonders biomimetisch gebildetem Apatit besitzt. Die in den Präzipitaten ebenfalls vorhandenen Phosphoratome in einer relativ ungeordneten OCP (Octacalciumphosphat)-ähnlichen Umgebung stehen höchstwahrscheinlich mit der apatitischen Phase in räumlich engem Kontakt und sind damit entweder Bestandteil dieser Phase oder befinden sich in einer getrennten Phase, die jedoch mit der apatitischen Phase in Form eines Nanokomposits mit sehr kleinen, eng benachbarten Kristalliten vorliegt.
Bei der Fällung des Caseinnetzwerk/CaP-Präzipitats wird ebenfalls eine Dicalciumphosphat-Dihydrat (DCPD)-Phase gebildet. Diese ist separiert von den anderen CaP-Phasen und tritt in wesentlich geringerem Maße auf als in einem reinen CaP-Präzipitat, das ohne Proteinkomponente gefällt wurde. Damit konnte gezeigt werden, dass unter Bedingungen, bei denen ohne Proteinkomponente größtenteils DCPD entsteht, die Caseinnetzwerke eine apatitische Phase stabilisieren, die strukturelle Ähnlichkeit zu biologisch und biomimetisch gebildetem Apatit aufweist.
Die qualitativ gleichen Ergebnisse konnten für vergleichsweise untersuchtes unvernetztes Casein gefunden werden. Die Caseinnetzwerke zeigen jedoch in Bezug auf die apatitische Phase einen stärkeren Stabilisierungseffekt als unvernetztes Casein. Es ist denkbar, dass dies unter anderem darauf zurückzuführen ist, dass die Phosphatzentren in den Caseinnetzwerken im Gegensatz zu Casein frei von CaP-Brücken sind, da diese durch die EDTA-Behandlung entfernt wurden. Da die Caseinnetzwerke zudem eine geringere Proteindichte und damit eine höhere „Porosität“ als die mizellaren Caseinaggregate aufweisen, kann sich die apatitische Phase möglicherweise auch innerhalb der Netzwerke bilden, während dies für die mizellaren Caseinaggregate wahrscheinlich nur begrenzt möglich ist.
In der vorliegenden Arbeit konnte ebenfalls gezeigt werden, dass sich Caseinnetzwerke grundsätzlich als Transportsysteme für Lysozym eignen, da sie eine hohe Stabilität aufweisen und erfolgreich mit Lysozym beladen werden können. Während die Assoziation von Lysozym mit mizellaren Caseinaggregaten, die aus UHT-Milch gewonnenen wurden, zu einem fast vollständigen Verlust der Lysozymaktivität führt, bleibt die Aktivität des Enzyms bei der Bindung an Caseinnetzwerke erhalten.
Das Anwendungspotential der Caseinnetzwerk/Lysozym-Assoziate wurde im Rahmen von zahnmedizinischen Versuchen in vitro und in situ untersucht. Es konnte nachgewiesen werden, dass die Caseinnetzwerk/Lysozym-Assoziate in vitro eine dauerhafte Immobilisierung des Lysozyms in der in situ gebildeten Pellikel bewirken. Eine deutliche Anreicherung des Enzyms in situ wird mithilfe der Caseinnetzwerke allerdings nicht beobachtet. Dies könnte darin begründet sein, dass die im Vergleich zu den in vitro vorgefundenen Verhältnissen deutlich komplexeren Bedingungen in situ zu einem selektiveren Anreicherungsprozess von Enzymen in der Pellikel führen.
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Užití biologických materiálů k náhradě tkání v plastické chirurgii / Use of biological materials for tissue substitution in plastic surgeryMěšťák, Ondřej January 2014 (has links)
Užití biologických materiálů k náhradě tkání v plastické chirurgii ! Abstrakt v angličtině Background: Biological meshes are biomaterials consisted of extracellular matrix and used in surgery particularly for hernia treatment or thoracic wall reconstruction. They are capable of vascularization, that decreases risk of infection, expecially when used in contaminated fields. This study compared the strength of incorporation and biocompatibility of two porcine-derived grafts (cross-linked and non-cross-linked) in a rat hernia model. In addition, we hypothesized that combination of extracellular matrices with autologous mesenchymal stem cells used for hernia repair would result in increased vascularization and increased strength of incorporation. Methods: Standardized 2 x 4 cm fascial defect was created in 42 Wistar rats and repaired with a cross-linked or a non-cross-linked graft either enriched or non-enriched with stem cells. The rats were sacrificed 3, 6 and 12 months later. The strength of incorporation, vascularization, cellular invasion, foreign body reaction and capsule formation were evaluated. Results: Comparison of stem cell enriched and non-enriched groups showed no significant differences in the capsule thickness, foreign body reaction, cellularization or vascularization. In the non-cross-linked...
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Mass Spectrometry Methods For Macromolecules: Polymer Architectures, Cross-Linking, and Surface ImagingEndres, Kevin J. 20 June 2019 (has links)
No description available.
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Statistical Evaluation of Correlated Measurement Data in Longitudinal Setting Based on Bilateral Corneal Cross-LinkingHerber, Robert, Graehlert, Xina, Raiskup, Frederik, Veselá, Martina, Pillunat, Lutz E., Spoerl, Eberhard 13 April 2023 (has links)
Purpose
In ophthalmology, data from both eyes of a person are frequently included in the statistical evaluation. This violates the requirement of data independence for classical statistical tests (e.g. t-Test or analysis of variance (ANOVA)) because it is correlated data. Linear mixed models (LMM) were used as a possibility to include the data of both eyes in the statistical evaluation.
Methods
The LMM is available for a variety of statistical software such as SPSS or R. The application was applied to a retrospective longitudinal analysis of an accelerated corneal cross-linking (ACXL (9*10)) treatment in progressive keratoconus (KC) with a follow-up period of 36 months. Forty eyes of 20 patients were included, whereas sequential bilateral CXL treatment was performed within 12 months. LMM and ANOVA for repeated measurements were used for statistical evaluation of topographical and tomographical data measured by Pentacam (Oculus, Wetzlar, Germany).
Results
Both eyes were classified into a worse and better eye concerning corneal topography. Visual acuity, keratometric values and minimal corneal thickness were statistically significant between them at baseline (p < 0.05). A significant correlation between worse and better eye was shown (p < 0.05). Therefore, analyzing the data at each follow-up visit using ANOVA partially led to an overestimation of the statistical effect that could be avoided by using LMM. After 36 months, ACXL has significantly improved BCVA and flattened the cornea.
Conclusion
The evaluation of data of both eyes without considering their correlation using classical statistical tests leads to an overestimation of the statistical effect, which can be avoided by using the LMM.
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Macromolecular Engineering and Applications of Advanced Dynamic Polymers and their NanocompositesDodo, Obed J. 13 July 2023 (has links)
No description available.
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Sulfonated polyphenylenes based on Armstrong’s acid as proton conducting membranes for fuel cell applicationsKünzel-Tenner, Andy 12 September 2024 (has links)
Proton conducting membranes are a key component in fuel cell designs. Properties like proton conductivity, water uptake, ion exchange capacity and physiochemical stability dictate the performance and longevity of the complete fuel cell system. Designing a proton conductiting membrane takes several factors, such as monomer choice and their respective functionalization into account. Besides that, economically favourable reactions as well as environmental compability have to be considered. This work demonstrates the development of a fuel cell membrane material starting from broadly available, cost-efficient educts. Few reaction steps, also including cost-efficient reagents, have been employed in order to obtain a doubly sulfonated monomer based on naphthalene-1,5-disulfonic acid (Armstrong´s acid) suitable for polymerizations. Suzuki polycondensation of the given monomer partly yielded processable films for further investigation. A cost-efficient, atom-economic deprotection stategy was developed for sulfonated polyphenylenes, yielding proton conducting membranes. Further modification of the backbone structure, by incorporating an excess of hydrophobic meta,meta,meta-terphenylene units, led towards balanced properties of the material. The impact of polymer constitution, was investigated and discussed via the implementation of para,meta,para-substituted instead of meta,meta,meta-substituted terphenylene. Alternating and statistical copolymers including para,meta,para-substituted terphenylene were developed and investigated. The reported proton conducting membranes pose suitable and promising candidates for fuel cell applications.
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The Development and Application of Mass Spectrometry-based Structural Proteomic Approaches to Study Protein Structure and InteractionsMakepeace, Karl A.T. 26 August 2022 (has links)
Proteins and their intricate network of interactions are fundamental to many molecular processes that govern life. Mass spectrometry-based structural proteomics represents a powerful set of techniques for characterizing protein structures and interactions. The last decade has witnessed a large-scale adoption in the application of these techniques toward solving a variety of biological questions. Addressing these questions has often been coincident with the further development of these techniques.
Insight into the structures of individual proteins and their interactions with other proteins in a proteome-wide context has been made possible by recent developments in the relatively new field of chemical crosslinking combined with mass spectrometry. In these experiments crosslinking reagents are used to capture protein-protein interactions by forming covalent linkages between proximal amino acid residues. The crosslinked proteins are then enzymatically digested into peptides, and the covalently-coupled crosslinked peptides are identified by mass spectrometry. These identified crosslinked peptides thus provide evidence of interacting regions within or between proteins.
In this dissertation the development of tools and methods that facilitate this powerful technique are described. The primary arc of this work follows the development and application of mass spectrometry-based approaches for the identification of protein crosslinks ranging from those which exist endogenously to those which are introduced synthetically. Firstly, the development of a novel strategy for comprehensive determination of naturally occurring protein crosslinks in the form of disulfide bonds is described. Secondly, the application of crosslinking reagents to create synthetic crosslinks in proteins coupled with molecular dynamics simulations is explored in order to structurally characterize the intrinsically disordered tau protein. Thirdly, improvements to a crosslinking-mass spectrometry method for defining a protein-protein interactome in a complex sample is developed. Altogether, these described approaches represent a toolset to allow researchers to access information about protein structure and interactions. / Graduate
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Soft Intelligence : Liquids Matter in Compliant MicrosystemsJeong, Seung Hee January 2016 (has links)
Soft matter, here, liquids and polymers, have adaptability to a surrounding geometry. They intrinsically have advantageous characteristics from a mechanical perspective, such as flowing and wetting on surrounding surfaces, giving compliant, conformal and deformable behavior. From the behavior of soft matter for heterogeneous surfaces, compliant structures can be engineered as embedded liquid microstructures or patterned liquid microsystems for emerging compliant microsystems. Recently, skin electronics and soft robotics have been initiated as potential applications that can provide soft interfaces and interactions for a human-machine interface. To meet the design parameters, developing soft material engineering aimed at tuning material properties and smart processing techniques proper to them are to be highly encouraged. As promising candidates, Ga-based liquid alloys and silicone-based elastomers have been widely applied to proof-of-concept compliant structures. In this thesis, the liquid alloy was employed as a soft and stretchable electrical and thermal conductor (resistor), interconnect and filler in an elastomer structure. Printing-based liquid alloy patterning techniques have been developed with a batch-type, parallel processing scheme. As a simple solution, tape transfer masking was combined with a liquid alloy spraying technique, which provides robust processability. Silicone elastomers could be tunable for multi-functional building blocks by liquid or liquid-like soft solid inclusions. The liquid alloy and a polymer additive were introduced to the silicone elastomer by a simple mixing process. Heterogeneous material microstructures in elastomer networks successfully changed mechanical, thermal and surface properties. To realize a compliant microsystem, these ideas have in practice been useful in designing and fabricating soft and stretchable systems. Many different designs of the microsystems have been fabricated with the developed techniques and materials, and successfully evaluated under dynamic conditions. The compliant microsystems work as basic components to build up a whole system with soft materials and a processing technology for our emerging society.
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